单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 1621 - 1640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1621 | 2024-08-07 |
Glioma epileptiform activity and progression are driven by IGSF3-mediated potassium dysregulation
2023-03-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.01.013
PMID:36787748
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研究论文 | 本研究探讨了恶性胶质瘤中癫痫样活动和进展的分子机制，发现IGSF3介导的钾失调是关键因素 | 首次揭示了IGSF3通过与Kir4.1相互作用抑制钾缓冲，导致肿瘤进展和癫痫样活动 | NA | 探究恶性胶质瘤中癫痫样活动和肿瘤进展的分子机制 | 恶性胶质瘤患者肿瘤中的基因表达和神经电路功能 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | scRNA-seq, ECoG记录 | NA | 基因表达数据, 电生理数据 | 人类和鼠类样本 |
| 1622 | 2024-08-07 |
Tubular Epithelial Cell HMGB1 Promotes AKI-CKD Transition by Sensitizing Cycling Tubular Cells to Oxidative Stress: A Rationale for Targeting HMGB1 during AKI Recovery
2023-03-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000024
PMID:36857499
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研究论文 | 本文研究了高迁移率族蛋白B1（HMGB1）在管状上皮细胞中通过使循环中的管状细胞对氧化应激敏感，从而促进急性肾损伤（AKI）向慢性肾脏病（CKD）的转变，并提出针对HMGB1在AKI恢复期间的治疗策略。 | 本文首次提出细胞内HMGB1通过降低管状细胞对长时间缺血应激的适应性，从而在AKI-CKD转变中发挥作用，并探讨了针对细胞内和细胞外HMGB1的治疗潜力。 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 探讨HMGB1在AKI向CKD转变中的作用，并寻找新的治疗策略。 | 研究对象包括人及小鼠的急性肾损伤和慢性肾脏病。 | NA | 肾脏病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及人及小鼠的AKI和CKD样本，具体数量未详细说明。 |
| 1623 | 2024-08-04 |
Dissecting cellular states of infiltrating microenvironment cells in melanoma by integrating single-cell and bulk transcriptome analysis
2023-12-12, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-023-00587-8
PMID:38082384
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA-seq数据解析黑色素瘤微环境细胞状态的组成 | 首次识别了三种不同的肿瘤微环境免疫表型，并揭示其与临床结果的关系 | 使用的样本仅限于463个黑色素瘤肿瘤样本，可能不具有广泛适用性 | 研究微环境细胞状态对黑色素瘤免疫活动的影响 | 463个皮肤黑色素瘤的肿瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA-seq | CIBERSORT | 基因表达数据 | 463个黑色素瘤样本 |
| 1624 | 2024-08-07 |
Integrated genomic and single-cell transcriptomic analyses reveal clonal evolution and immune signature in donor cell leukemia after haploidentical allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2023-10, Leukemia & lymphoma
IF:2.2Q3
DOI:10.1080/10428194.2023.2232493
PMID:37424322
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研究论文 | 本文报道了一例罕见的在同种异体造血干细胞移植后发生的供者细胞白血病病例，通过全基因组测序和单细胞RNA测序揭示了克隆进化和免疫特征。 | 首次通过全基因组测序和单细胞RNA测序技术，揭示了供者细胞白血病中的克隆进化和免疫特征，为理解其发病机制提供了新的视角。 | 研究基于单一病例，其普遍性和可重复性有待进一步验证。 | 探讨同种异体造血干细胞移植后供者细胞白血病的发病机制。 | 供者细胞白血病中的克隆进化和免疫特征。 | 数字病理学 | 白血病 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 单一病例 |
| 1625 | 2024-08-05 |
mRNA vaccination boosts S-specific T cell memory and promotes expansion of CD45RAint TEMRA-like CD8+ T cells in COVID-19 recovered individuals
2023-08-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101149
PMID:37552991
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研究论文 | 这篇文章研究了mRNA疫苗如何影响COVID-19感染者的T细胞记忆及CD8+ T细胞的扩增 | 本研究揭示了感染引发的S特异性CD8 T细胞记忆在疫苗接种后影响T细胞反应的程度和克隆组成 | 未提及具体的样本限制或实验设计的局限性 | 分析COVID-19感染者接种mRNA疫苗后的T细胞反应 | 之前感染的疫苗接种者与未感染的疫苗接种者的对比研究 | 免疫学 | COVID-19 | mRNA疫苗 | NA | T细胞反应数据 | NA |
| 1626 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals an Angpt4-initiated EPDC-EC-CM cellular coordination cascade during heart regeneration
2023-05-08, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwac010
PMID:37155312
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了斑马鱼心脏再生过程中由Angpt4启动的EPDC-EC-CM细胞协调级联反应 | 首次全面分析了不同细胞和信号如何相互作用和协调以调节心脏再生，并揭示了Angpt4在心脏再生中的关键作用 | NA | 探讨斑马鱼心脏再生过程中细胞和信号的相互作用机制 | 斑马鱼心脏细胞类型及其在发育和再生过程中的分子进展 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | 斑马鱼心脏细胞类型 |
| 1627 | 2024-08-05 |
Unveiling the hidden AP-1: revealing the crucial role of AP-1 in ccRCC at single-cell resolution
2023-12-19, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-023-01913-9
PMID:38114996
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研究论文 | 研究揭示了AP-1在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的重要角色 | 首次在单细胞分辨率下分析了AP-1在ccRCC中的作用 | 在普通肾脏和ccRCC样本中未检测到AP-1的差异表达可能受到bulk-RNA测序的混杂效应影响 | 探讨AP-1在ccRCC的肿瘤发生中的作用及其调控机制 | 通过分析单细胞多组学数据集来研究AP-1在透明细胞肾细胞癌细胞与肾小管细胞中的表达差异 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞数据 | 多个研究团队的多个单细胞多组学数据集 |
| 1628 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomics Reveal Pitfalls and Opportunities for the Detection of Rare High-Plasticity Breast Cancer Subtypes
2023-12, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2023.100258
PMID:37813278
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研究论文 | 该文章研究了高塑性乳腺癌亚型的检测方法及其面临的挑战。 | 提出使用高分辨率空间转录组学分析来识别特定的乳腺癌标记，并揭示了现有检测方法的局限性。 | 研究主要集中在三阴性乳腺肿瘤上，其他亚型的分析不足，可能限制了结果的普遍适用性。 | 探讨高塑性乳腺癌亚型的检测方法及其在临床治疗中的应用。 | 分析11个三阴性乳腺肿瘤，包括3个claudin-low亚型和4个MpBC亚型。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 表达数据 | 11个三阴性乳腺肿瘤样本 |
| 1629 | 2024-08-07 |
Plasma cells in human pancreatic ductal adenocarcinoma secrete antibodies against self-antigens
2023-Nov-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172449
PMID:37751306
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫球蛋白测序，探索了人类胰腺导管腺癌（PDAC）中肿瘤内B细胞反应的驱动抗原，并发现浆细胞产生的自身抗体与细胞内自身抗原反应。 | 首次揭示了PDAC中浆细胞产生的自身抗体与细胞内自身抗原反应，表明慢性炎症微环境支持适应性免疫反应。 | 研究样本量较小，仅包括7个原发性PDAC样本，可能影响结果的普遍性。 | 探索人类胰腺导管腺癌中肿瘤内B细胞反应的驱动抗原。 | 人类胰腺导管腺癌中的肿瘤内B细胞反应及其驱动抗原。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和免疫球蛋白（Ig）测序 | NA | RNA序列 | 7个原发性PDAC样本，包括235个浆细胞和12个B细胞 |
| 1630 | 2024-08-07 |
AP-1/c-Fos supports SIV and HIV-1 latency in CD4 T cells infected in vivo
2023-Oct-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108015
PMID:37860759
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了未治疗的SIV感染猕猴的CD4 T细胞中的病毒RNA，发现Activator protein 1 (AP-1)转录因子在病毒潜伏建立和维持中的作用，并提出其作为治疗HIV-1潜伏库的潜在靶点。 | 首次揭示了AP-1在HIV-1和SIV潜伏中的作用，并提出其作为治疗靶点的可能性。 | 文章未详细讨论实验的具体限制，如样本量、实验重复性等。 | 阐明宿主细胞基因表达模式如何调控病毒基因表达，并探索治疗HIV-1潜伏库的新策略。 | SIV感染的猕猴CD4 T细胞和HIV-1治疗患者的感染细胞。 | NA | HIV-1感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 1631 | 2024-08-04 |
Endogenous adenine mediates kidney injury in diabetic models and predicts diabetic kidney disease in patients
2023-10-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170341
PMID:37616058
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研究论文 | 内源性腺苷在糖尿病模型中介导肾损伤，并预测患者的糖尿病肾病 | 首次提出内源性腺苷可能是糖尿病肾病的致病因素，并找到其作为机制生物标志物的潜力 | 研究集中于特定患者群体，可能无法广泛适用于所有糖尿病患者 | 探索内源性腺苷在糖尿病肾病中的作用及其机制 | 糖尿病患者尿液样本及动物模型 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 空间代谢组学和单细胞转录组学 | 小鼠模型 | 尿液和组织样本 | 来自多个研究的多名糖尿病患者和糖尿病小鼠 |
| 1632 | 2024-08-07 |
Cell type-specific attenuation of brassinosteroid signaling precedes stomatal asymmetric cell division
2023-09-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2303758120
PMID:37639582
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研究论文 | 研究探讨了激素油菜素内酯（BR）信号传导与气孔发育之间的关系，特别是通过SHAGGY/GSK3样激酶BIN2的作用 | 揭示了BIN2在气孔不对称细胞分裂（ACD）中的双重角色，以及BR信号激活的两种模式如何产生时空上不同的转录反应 | NA | 阐明BR信号如何调控气孔发育 | 油菜素内酯信号传导和气孔发育 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1633 | 2024-08-05 |
Approaches for single-cell RNA sequencing across tissues and cell types
2023 Jun-Oct, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2023.2200721
PMID:37062951
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综述 | 本文回顾了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术及其方法。 | 提供了关于单细胞RNA测序技术的全面评述和实验室最佳实践的指导。 | 未详细描述特定技术的应用案例和实验数据。 | 旨在为单细胞RNA测序技术建立稳健的工作流程和最新的协议。 | 涵盖各类组织和细胞类型的单细胞RNA测序方法。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | NA |
| 1634 | 2024-08-05 |
Understanding spatiotemporal coupling of gene expression using single molecule RNA imaging technologies
2023 Jun-Oct, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2023.2199669
PMID:37050882
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研究论文 | 本文概述了使用单分子RNA成像技术定量理解基因表达的最新进展 | 提出了先进成像技术如何揭示从转录到降解的mRNA生命过程之间的协调关系 | 对未来挑战的讨论尚不够深入 | 提高对基因表达中转录和后转录事件的时空耦合的理解 | 主要关注mRNA在单细胞中的表达监测 | 数字病理学 | NA | 单分子RNA成像技术 | NA | 图像 | NA |
| 1635 | 2024-08-05 |
Impact of disulfidptosis-associated clusters on breast cancer survival rates and guiding personalized treatment
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1256132
PMID:38116315
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研究论文 | 本研究开发了一个与二硫化死亡相关的预后预测工具以指导乳腺癌患者的个性化治疗 | 首次将二硫化死亡及其相关基因与乳腺癌生存率关联，构建了预后模型 | 需要进一步研究以阐明不同风险组的免疫机制 | 研究乳腺癌与二硫化死亡的关系及其对生存率的影响 | 乳腺癌患者的样本数据及相关基因的表达情况 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序和转录组测序 | Cox和Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 基于单细胞分析识别的21个细胞簇，包含多种细胞类型 |
| 1636 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analysis of lung cells in COVID-19 patients with diabetes, hypertension, and comorbid diabetes-hypertension
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1258646
PMID:38144556
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析了COVID-19患者中糖尿病、高血压及其合并症患者的肺细胞状态 | 首次揭示了SARS-CoV-2感染下糖尿病和高血压患者肺部纤维母细胞亚群的上调现象，并发现了KREMEN1可能是纤维母细胞激活的受体 | 研究仅限于特定的疾病组合和药物治疗效果的初步评估 | 探讨SARS-CoV-2感染下糖尿病、高血压及其合并症患者的肺细胞状态和潜在治疗靶点 | COVID-19患者中糖尿病、高血压及其合并症患者的肺细胞 | 数字病理学 | 糖尿病, 高血压, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及糖尿病、高血压及其合并症的COVID-19患者肺样本 |
| 1637 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics analysis of proliferative diabetic retinopathy fibrovascular membranes reveals AEBP1 as fibrogenesis modulator
2023-Nov-02, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172062
PMID:37917183
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研究论文 | 该研究分析了增殖性糖尿病视网膜病变中的前视网膜纤维血管膜的单细胞转录组特征 | 首次发现AEBP1在人视网膜周细胞向肌成纤维细胞转变中的调节作用 | 未说明样本的具体数量和来源细节 | 识别潜在的治疗靶点以改善糖尿病视网膜病变的管理 | 来自患者的前视网膜纤维血管膜进行单细胞RNA测序分析 | 数字病理 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1638 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of human MAIT cell transcriptional, functional and clonal diversity
2023-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01575-1
PMID:37580605
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研究论文 | 本文研究了人类黏膜相关不变T细胞（MAIT细胞）的转录组、功能和克隆多样性 | 开发了功能性RNA测序方法，能够在单细胞分辨率下整合功能和TCR克隆型 | NA | 探讨人类MAIT细胞的功能和克隆多样性 | 血液和肝脏中的MAIT细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 血液和肝脏中的MAIT细胞 |
| 1639 | 2024-08-04 |
Location of CD39+ T cell subpopulations within tumors predict differential outcomes in non-small cell lung cancer
2023-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-006770
PMID:37648263
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研究论文 | 该研究调查了CD39和CD73在非小细胞肺癌（NSCLC）中的预后意义 | 提供了CD39+ T细胞亚群在肿瘤组织中的分布和功能特性的深入理解 | 未提及特定的局限性 | 理解免疫抑制途径在非小细胞肺癌中的作用，以开发新的诊断和治疗方法 | 162名早期未治疗的非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 多重免疫荧光、流式细胞仪、靶向RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 细胞、组织 | 162名早期未治疗的非小细胞肺癌患者 |
| 1640 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics stratifies psoriatic disease severity by emergent cellular ecosystems
2023-06-08, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abq7991
PMID:37267384
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析剖析了银屑病的严重程度与细胞生态系统的关系 | 首次通过空间转录组学揭示了健康皮肤和炎症皮肤之间免疫微环境的显著差异 | 尚未深入探讨银屑病对其他系统性疾病的影响 | 研究银屑病的细胞组学及其在不同严重程度下的差异 | 25个健康、活跃病变和临床未涉及的皮肤活检样本 | 数字病理学 | 银屑病 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 25个皮肤活检样本 |