单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 1601 - 1620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1601 | 2024-08-07 |
Correction to: Implanted Tissue-Engineered Vascular Graft Cell Isolation with Single-Cell RNA Sequencing Analysis, by Mirhaidari et al. Tissue Engineering Part C: Methods 2023;29(2):72-84; doi: 10.1089/ten.tec.2022.0189
2023-Oct, Tissue engineering. Part C, Methods
DOI:10.1089/ten.tec.2022.0189.correx
PMID:37672627
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1602 | 2024-08-05 |
Systemic Alterations in Type-2 Conventional Dendritic Cells Lead to Impaired Tumor Immunity in Pancreatic Cancer
2023-08-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0946
PMID:37229629
|
研究论文 | 本研究分析了胰腺癌患者的外周血和骨髓中常规树突状细胞（cDC2）的变化 | 揭示了胰腺癌对系统性cDC2发育和功能的影响 | 未充分研究PDAC对系统性cDC1的影响 | 探讨胰腺癌对树突状细胞功能的影响及其对肿瘤免疫的影响 | 胰腺癌患者的外周血和骨髓样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液和骨髓样本 | 106个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1603 | 2024-08-04 |
Dissection and Integration of Bursty Transcriptional Dynamics for Complex Systems
2023-Jun-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.13.544828
PMID:37398022
|
研究论文 | 本文提出了一种新方法，通过概率主题模型解构并整合单细胞RNA-seq数据中的转录动力学 | 采用概率主题模型来推断与个别过程相关的细胞和基因，以准确估计过程特定的速度 | 缺乏先进的代谢标记技术，可能影响RNA速度估计的准确性 | 研究单细胞RNA-seq数据中转录变化的方向性 | 聚焦于与过程相关的细胞和基因 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 概率主题模型 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1604 | 2024-08-05 |
Prognostic subtypes of thyroid cancer was constructed based on single cell and bulk-RNA sequencing data and verified its authenticity
2023-Mar-18, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01027-x
PMID:36933059
|
研究论文 | 通过单细胞和大规模RNA测序数据构建了甲状腺癌的预后亚型并验证其真实性 | 创新性地结合了单细胞RNA测序和全局RNA测序数据，构建了有效的预后模型并揭示了甲状腺癌的细胞微环境及肿瘤异质性 | 研究主要基于样本数据，对于临床广泛应用的验证仍需进一步研究 | 研究甲状腺癌的预后因素及其细胞微环境 | 23个甲状腺癌肿瘤样本的细胞类型及其微环境 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序(Sc-RNAseq) | NA | RNA数据 | 23个甲状腺癌肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1605 | 2024-08-04 |
Presence of immunogenic alternatively spliced insulin gene product in human pancreatic delta cells
2023-05, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-05882-y
PMID:36884057
|
研究论文 | 本文研究人类胰腺δ细胞中免疫原性替代剪接胰岛素基因产物的表达 | 首次指出胰腺δ细胞中存在一种由替代剪接产生的胰岛素变体，并揭示其可能在胰岛素自身免疫和病理中发挥作用 | 未全面阐明这种替代剪接INS产物在其他细胞类型中的潜在作用 | 探讨人类胰腺内胰岛素基因的替代剪接及其在β细胞和其他内分泌细胞中的表达 | 人类胰腺中各种内分泌细胞（特别是δ细胞） | 数字病理学 | 糖尿病 | PCR分析、单细胞RNA-seq分析、免疫组化 | NA | RNA、蛋白序列 | 人类胰腺样本，具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 1606 | 2024-08-05 |
Sortilin enhances fibrosis and calcification in aortic valve disease by inducing interstitial cell heterogeneity
2023-03-07, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehac818
PMID:36660854
|
研究论文 | 本研究探讨了sortilin在钙化性主动脉瓣病（CAVD）病理生理中的作用及其对瓣膜间质细胞（VICs）转变的影响 | 首次识别sortilin作为钙化性主动脉瓣病中关键因素，并发现了一种新型的炎症肌成纤维细胞-成骨细胞混合表型（IMO-VIC） | 研究主要集中于小鼠模型，可能无法完全反映人类的疾病机制 | 阐明sortilin在主动脉瓣钙化中的作用及其潜在的治疗靶点 | 研究对象为主动脉瓣间质细胞（VICs）及其在钙化性主动脉瓣病中的转变 | 数字病理学 | 主动脉瓣疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 小鼠模型 | 生物样本（VICs） | 使用sortilin缺陷的小鼠模型和人类初级VIC样本，样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 1607 | 2024-08-05 |
Hepatocyte Smoothened Activity Controls Susceptibility to Insulin Resistance and Nonalcoholic Fatty Liver Disease
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.12.008
PMID:36535507
|
研究论文 | 本研究旨在探讨Smoothened (Smo) 在肝细胞代谢稳态及其对非酒精性脂肪肝病 (NASH) 易感性中的作用 | 发现肝细胞Smo的缺失通过激活mTORC1-SREBP1c信号通路，促进了脂肪生成并抑制了肝脏胰岛素信号 | 研究主要基于小鼠模型和已有的人类RNA-seq数据，可能无法完全反映所有人群的情况 | 明确Smoothened在肝细胞代谢调节和NASH易感性中的作用 | 健康饮食的小鼠肝细胞及两大人类队列的肝脏RNA-seq数据 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 在小鼠模型中进行了条件性Smo缺失，以及分析了两大人类队列的RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1608 | 2024-08-05 |
Single-cell genomics reveals new rozellid lineages and supports their sister relationship to Microsporidia
2023-12, Biology letters
IF:2.8Q2
DOI:10.1098/rsbl.2023.0398
PMID:38087939
|
研究论文 | 本研究揭示了新发现的rozellid谱系，并支持其与微孢子虫的姐妹关系 | 首次通过单细胞测序提供三种新的rozellid谱系的基因组数据 | 目前尚未完全理解rozellids与微孢子虫之间的系统发育关系 | 探讨rozellid谱系的系统发育及其与微孢子虫的关系 | 新发现的三种rozellid谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 来自环境样本的三个新rozellid谱系 | NA | NA | NA | NA |
| 1609 | 2024-08-05 |
Speed and navigation control of thymocyte development by the fetal T-cell gene regulatory network
2023-05, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13190
PMID:36722494
|
review | 本文回顾了胎儿和成人小鼠胸腺中 T 细胞分化相关的转录因子网络 | 探讨了胎儿 T 细胞发育与成人的不同之处，并强调了转录因子网络的独特性 | 主要基于小鼠模型，可能无法完全转化到人类的机制理解 | 研究胎儿 T 细胞发育过程中的转录因子网络 | 胎儿和成人小鼠的 T 细胞和胸腺发育 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1610 | 2024-08-04 |
Deep Crypt Secretory Cell Differentiation in the Colonic Epithelium Is Regulated by Sprouty2 and Interleukin 13
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.11.004
PMID:36414210
|
研究论文 | 深隐窝分泌（DCS）细胞的分化受到Sprouty2和白细胞介素13的调控 | 本研究揭示了Sprouty2如何通过抑制IL13信号通路来限制结肠DCS细胞分化的机制 | 尚未探讨DCS细胞数量和功能调控的所有可能机制 | 研究Sprouty2与IL13在结肠DCS细胞分化中的作用 | 小鼠肠上皮特异性Sprouty2缺失模型与对照组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、免疫染色、bulk RNA测序、定量聚合酶链反应 | NA | RNA | 小鼠结肠组织 | NA | NA | NA | NA |
| 1611 | 2024-08-04 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and chipset data unravels PANoptosis-related genes in sepsis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1247131
PMID:38239341
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和芯片数据，揭示了败血症中PANoptosis相关基因 | 开发了一种基于Boruta算法的机器学习模型，用于识别PANoptosis相关亚组并预测败血症的生存和临床特征 | 尚未全面阐明PANoptosis在败血症中的角色 | 研究PANoptosis相关基因在败血症中的作用及其预后潜力 | 败血症样本和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 败血症 | 单细胞RNA-seq | Boruta算法 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的败血症样本和单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1612 | 2024-08-05 |
Impaired Reorganization of Centrosome Structure Underlies Human Infantile Dilated Cardiomyopathy
2023-04-25, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究揭示了中心粒缺陷导致的人类婴儿扩张型心肌病的机制 | 首次将中心粒缺陷与非综合征型扩张型心肌病相关联，并发现RTTN在心脏发育中的新角色 | 该研究仅基于一名患者，可能无法广泛适用 | 探讨中心粒结构重组的障碍如何影响心肌细胞生物学及其与人类心脏疾病的关系 | 一名罕见的婴儿扩张型心肌病(I-DCM)患者 | 心血管疾病 | 扩张型心肌病 | CRISPR/Cas9基因敲除和校正、单细胞RNA测序 | 斑马鱼和果蝇 | 基因组数据、细胞数据 | 单个患者样本及其父母的全外显子组 | NA | NA | NA | NA |
| 1613 | 2024-08-05 |
Integrative single-cell RNA sequencing and metabolomics decipher the imbalanced lipid-metabolism in maladaptive immune responses during sepsis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1181697
PMID:37180171
|
研究论文 | 本文旨在识别与脓毒症免疫功能障碍相关的差异表达脂质代谢基因。 | 通过机器学习算法筛选出关键的脂质代谢相关中心基因，揭示了脓毒症中的免疫抑制微环境。 | 未提及具体的样本来源和大小，可能限制结果的普遍适用性。 | 探讨脓毒症中脂质代谢失衡与免疫反应的关系。 | 脓毒症患者与健康对照者的脂质代谢相关基因及相关免疫功能。 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | 支持向量机-递归特征消除(SVM-RFE) | 基因数据 | 508个差异表达脂质代谢相关基因 | NA | NA | NA | NA |
| 1614 | 2024-08-05 |
Cerebrospinal fluid immune cells appear similar across neuropathic and non-neuropathic pain conditions
2023, Wellcome open research
DOI:10.12688/wellcomeopenres.20153.1
PMID:38707493
|
研究论文 | 该研究调查了在神经性疼痛和非神经性疼痛情况下，脑脊液中的免疫细胞是否相似 | 结果表明，无论疼痛的病因如何，免疫细胞的数量和表型并没有明显差异，挑战了脑脊液作为微胶质细胞活化的生物标志物的有效性 | 该研究未能确定脑脊液中蛋白质的确切来源，是否直接来自于循环脑脊液单核细胞或源于脊髓微胶质细胞 | 本研究旨在探讨脑脊液是否可以用作人类微胶质细胞活化的代理测量 | 分析来自遭受神经性特征疼痛的个体的脑脊液免疫细胞群体 | 数字病理学 | 神经性疼痛 | RNA测序，CITE测序 | NA | 生物样本（脑脊液免疫细胞） | 分析了忍受神经性疼痛的个体的免疫细胞群体，样本大小未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 1615 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics uncovers a non-autonomous Tbx1-dependent genetic program controlling cardiac neural crest cell development
2023-03-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37015-9
PMID:36941249
|
研究论文 | 这篇文章揭示了一个非自主的Tbx1依赖的基因程序，该程序控制心脏神经嵴细胞的发展 | 首次使用单细胞RNA测序揭示了心脏神经嵴细胞的动态转变及其在Tbx1缺失下的非自主变化 | 未提及研究的限制 | 探讨心脏神经嵴细胞在发育过程中的命运动态 | 对照小鼠胚胎和Tbx1失活小鼠的神经嵴细胞进行单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 来自对照小鼠和Tbx1失活小鼠的神经嵴细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1616 | 2024-08-05 |
BOMA, a machine-learning framework for comparative gene expression analysis across brains and organoids
2023-02-27, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100409
PMID:36936070
|
研究论文 | 本研究提出了一种机器学习框架BOMA，用于比较大脑和类器官之间的基因表达分析 | 开发了一种全球对齐和局部细化的机器学习框架，能够揭示大脑和类器官间保护的和特定的发育轨迹 | 没有提到具体的局限性 | 旨在比较和分析大脑与类器官之间的基因表达差异 | 研究对象为人类大脑和人类类器官，以及非人灵长类动物的大脑 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用多个人类大脑和类器官的样本，具体数量未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 1617 | 2024-08-04 |
ProtoCell4P: an explainable prototype-based neural network for patient classification using single-cell RNA-seq
2023-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad493
PMID:37540223
|
研究论文 | 本文提出了一种名为ProtoCell4P的原型基础神经网络，用于基于单细胞RNA测序进行患者分类并提供可解释性 | 该模型通过利用细胞知识和细胞的代表（称为原型）来缓解样本稀缺和细胞数量多样性的问题，具备良好的可解释性 | 样本数量通常较小，单细胞表达轮廓较嘈杂，并且高维性可能限制了一些分析 | 旨在设计深度学习模型对患者表型进行精准分类 | 研究对象为通过单细胞RNA测序数据获得的患者样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 原型基础神经网络 | 单细胞表达数据 | 样本数量通常较小，具体数字未给出 | NA | NA | NA | NA |
| 1618 | 2024-08-05 |
Generation of ventralized human thalamic organoids with thalamic reticular nucleus
2023-05-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.03.007
PMID:37019105
|
研究论文 | 本研究报告了一种将人类胚胎干细胞转化为具有不同核身份的腹侧丘脑类器官的方法 | 实现了以前未能达到的丘脑模式，展现了丘脑网状核的特征 | 未影响整体丘脑谱系发育的神经功能变化可能限定了结果的适用性 | 探索人类丘脑中核特异性发育与病理的机制 | 使用腹侧丘脑类器官研究TRN特异性与病相关基因的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1619 | 2024-08-05 |
The 'omics of obesity in B-cell acute lymphoblastic leukemia
2023-05-04, Journal of the National Cancer Institute. Monographs
DOI:10.1093/jncimonographs/lgad014
PMID:37139973
|
研究论文 | 本研究探讨了肥胖如何影响人类B细胞急性淋巴细胞白血病的功能 | 使用多组学方法揭示了肥胖相关的B细胞特异性标志与生存结果之间的关联，提供了新的见解 | 研究未提及样本的多样性和肥胖机制的广泛性 | 理解脂肪细胞如何影响B细胞急性淋巴细胞白血病中的代谢和耐药性 | 正常和恶性B细胞，特别是B细胞急性淋巴细胞白血病细胞 | 数字病理学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | RNA测序，质谱 | NA | 血清和血浆样本 | 健康供体和B-ALL患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1620 | 2024-08-05 |
PD-1 Mediated Regulation of Unique Activated CD8 + T Cells by NK Cells in the Submandibular Gland
2023-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.15.557930
PMID:37745414
|
研究论文 | 本文研究了NK细胞如何通过PD-1/PD-L1轴在下颌下腺调控CD8 T细胞的稳态 | 发现PD-1缺乏小鼠的下颌下腺中存在独特的CD8 T细胞群，以及NK细胞在该部位的免疫调节作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，缺乏在人体中的验证 | 探讨NK细胞在下颌下腺对CD8 T细胞稳态的调控作用 | PD-1缺乏小鼠及NK细胞缺乏的小鼠模型 | 数字病理学 | 干燥综合症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 涉及PD-1缺乏和NK细胞缺乏的小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |