单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 1581 - 1600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1581 | 2024-08-07 |
Clinical-mediated discovery of pyroptosis in CD8+ T cell and NK cell reveals melanoma heterogeneity by single-cell and bulk sequence
2023-08-24, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06068-5
PMID:37620327
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量测序技术，分析了黑色素瘤中与细胞焦亡相关的基因表达，特别是在CD8 T细胞和NK细胞中的表达情况 | 首次综合分析了黑色素瘤中单细胞转录组景观中的细胞焦亡现象，并通过实验验证了免疫细胞簇和免疫基因模块 | 研究主要集中在CD8 T细胞和NK细胞，未涵盖所有类型的免疫细胞 | 探讨细胞焦亡在黑色素瘤中的作用及其对肿瘤微环境和免疫治疗的影响 | 黑色素瘤组织中的CD8 T细胞和NK细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 1582 | 2024-08-07 |
Single-cell atlas of the human neonatal small intestine affected by necrotizing enterocolitis
2023-05, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002124
PMID:37205711
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序、T细胞受体β分析、批量转录组学和成像技术，详细描述了坏死性小肠结肠炎（NEC）中细胞身份、相互作用和区域变化的情况 | 本研究首次建立了NEC相关肠道组织中异常上皮-间质-免疫相互作用的详细图谱，并强调了NEC相关肠道组织的细胞失调 | NA | 旨在填补对坏死性小肠结肠炎（NEC）中细胞变化和异常相互作用全面认识的空白 | 人类新生儿受坏死性小肠结肠炎影响的小肠细胞 | 数字病理学 | 新生儿疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1583 | 2024-08-04 |
Distinct roles for interleukin-23 receptor signaling in regulatory T cells in sporadic and inflammation-associated carcinogenesis
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1276743
PMID:38375204
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研究论文 | 本研究定义了调节性T细胞中IL-23受体信号在散发性和与炎症相关的结直肠癌中的贡献 | 揭示了IL-23R在调节性T细胞中对结直肠癌发展的细胞特异性影响，特别是在炎症相关和散发性癌症中的不同作用 | 研究主要在小鼠模型中进行，可能无法完全反映人类疾病的复杂性 | 阐明IL-23R信号在调节性T细胞中对结直肠癌的作用 | 小鼠中调节性T细胞的IL-23R信号及其在结肠炎相关癌症和散发性结直肠癌中的功能 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因组数据 | 小鼠模型中有多个样本，不同实验组之间的数量未具体说明 |
| 1584 | 2024-08-07 |
Single-cell expression profile of Drosophila ovarian follicle stem cells illuminates spatial differentiation in the germarium
2023-06-20, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01636-9
PMID:37340484
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了果蝇卵巢滤泡干细胞及其邻近细胞类型的基因表达模式，以研究干细胞群体内的异质性和与分化相关的变化 | 首次使用单细胞RNA测序技术对果蝇卵巢滤泡干细胞及其邻近细胞类型进行基因表达分析，揭示了干细胞群体的空间分化模式 | NA | 研究干细胞群体在成年组织中的组织和调控机制，以及这些机制如何影响癌症起源和细胞替代策略的开发 | 果蝇卵巢滤泡干细胞及其邻近细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括滤泡干细胞及其邻近细胞类型（护送细胞和滤泡细胞）的预分类细胞群体 |
| 1585 | 2024-08-07 |
Chi3l1 Is a Modulator of Glioma Stem Cell States and a Therapeutic Target in Glioblastoma
2023-06-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-3629
PMID:37101376
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研究论文 | 研究揭示了Chi3l1蛋白在胶质母细胞瘤中的作用，表明Chi3l1通过改变胶质瘤干细胞（GSC）的状态促进肿瘤生长，并提出了Chi3l1作为治疗靶点的可能性。 | 首次展示了Chi3l1与CD44的结合及其对GSC状态的调控作用，以及Chi3l1在体内外抑制肿瘤生长的潜力。 | NA | 探讨Chi3l1在胶质母细胞瘤中的作用及其作为治疗靶点的可能性。 | 胶质母细胞瘤、胶质瘤干细胞（GSC）、Chi3l1蛋白。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序、RNA速度分析、ATAC-seq | NA | RNA | 患者来源的胶质瘤干细胞（GSC） |
| 1586 | 2024-08-07 |
A mouse model of ZTTK syndrome reveals indispensable SON functions in organ development and hematopoiesis
2023-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.19.567732
PMID:38014320
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研究论文 | 本文开发了ZTTK综合征的小鼠模型，揭示了SON基因在器官发育和造血中的不可或缺的作用 | 首次建立了ZTTK综合征的小鼠模型，并详细研究了SON基因在器官发育和造血中的功能 | NA | 研究SON基因在ZTTK综合征中的作用及其在器官发育和造血中的功能 | ZTTK综合征的小鼠模型 | 遗传学 | 罕见病 | 单细胞转录组分析 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 1587 | 2024-08-07 |
Unraveling the activation process and core driver genes of HSCs during cirrhosis by single-cell transcriptome
2023-08, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.1177/15353702231191109
PMID:37674431
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了非肝硬化和肝硬化肝组织样本，深入探索了肝星状细胞（HSCs）的激活过程并发现了更好的治疗靶基因 | 通过单细胞RNA测序和伪时间分析，揭示了HSCs向肌成纤维细胞分化的关键基因，并识别了HSCs从静止到激活状态的主要调控因子 | NA | 深入探索肝星状细胞（HSCs）的激活过程并发现更好的治疗靶基因 | 肝星状细胞（HSCs）及其在肝硬化中的激活过程 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13个非肝硬化肝组织样本和10个肝硬化肝组织样本 |
| 1588 | 2024-08-07 |
Chronic chromosome instability induced by Plk1 results in immune suppression in breast cancer
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113266
PMID:37979172
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研究论文 | 本研究通过在Her2乳腺癌模型中过度表达Polo样激酶1（Plk1），探讨了染色体不稳定（CIN）相关的分子特征如何改变肿瘤进化过程中的免疫识别 | 发现高CIN肿瘤通过激活衰老相关分泌表型（SASP）、上调PD-L1和CD206以及诱导非细胞自主核因子κB（NF-κβ）信号，促进免疫逃逸 | NA | 理解CIN相关的分子特征如何影响肿瘤进化过程中的免疫识别 | Her2乳腺癌模型中过度表达Plk1的高CIN肿瘤 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自癌前乳腺组织的单细胞RNA测序数据 |
| 1589 | 2024-08-04 |
Division-Independent Differentiation of Muscle Stem Cells During a Growth Stimulus
2023-Dec-08, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxad091
PMID:38066665
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研究论文 | 这篇文章探讨了成体肌肉干细胞在生长刺激下是否与细胞分裂相关的分化过程 | 提出了一种新的小鼠模型，用于跟踪肌肉干细胞衍生的肌肉细胞核，发现了一种与细胞分裂无关的肌肉干细胞分化和融合 | 研究仅限于小鼠模型，可能无法完全适用于人类肌肉干细胞 | 研究成体肌肉干细胞对生长刺激的反应及其分化机制 | 成体肌肉干细胞的不同转录亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 在小鼠中进行了5天的生长刺激实验 |
| 1590 | 2024-08-07 |
Low-density lipoprotein receptor promotes crosstalk between cell stemness and tumor immune microenvironment in breast cancer: a large data-based multi-omics study
2023-11-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04699-y
PMID:38037058
|
研究论文 | 本研究通过大规模多组学数据分析，探讨了低密度脂蛋白受体（LDLR）在乳腺癌细胞干性和肿瘤免疫微环境交互作用中的作用 | 首次揭示了LDLR在乳腺癌细胞干性和肿瘤免疫微环境交互作用中的关键作用 | 主要依赖于公共数据库的数据，缺乏体内实验验证 | 识别破坏乳腺癌细胞干性和免疫微环境之间通信的潜在靶点 | 乳腺癌细胞的干性和肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序, 蛋白质组学分析, 单细胞RNA测序 | Lasso回归分析, Cox生存回归模型 | RNA序列数据, 蛋白质数据 | 3132名乳腺癌患者 |
| 1591 | 2024-08-07 |
The construction of a testis transcriptional cell atlas from embryo to adult reveals various somatic cells and their molecular roles
2023-11-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04722-2
PMID:38012716
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研究论文 | 本文构建了一个从胚胎到成年的睾丸转录细胞图谱，揭示了各种体细胞及其分子作用 | 通过整合单细胞RNA测序数据，构建了跨五个发育阶段的睾丸转录细胞图谱，并使用多种分析技术进行了全面分析 | NA | 更好地理解睾丸从胚胎到成年的发育变化 | 睾丸中的体细胞和生殖细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过26,000个细胞 |
| 1592 | 2024-08-04 |
Talniflumate abrogates mucin immune suppressive barrier improving efficacy of gemcitabine and nab-paclitaxel treatment in pancreatic cancer
2023-11-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04733-z
PMID:37996891
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研究论文 | 本研究探讨了talniflumate如何克服粘蛋白的免疫抑制屏障，从而增强吉西他滨和纳米紫杉醇在胰腺癌治疗中的疗效 | 本研究揭示了GCNT3作为粘蛋白表达的主要调节因子，并提出其作为talniflumate作用的可行靶点 | 研究中使用的样本量较小，仅分析了43个胰腺管内乳头状粘液瘤（IPMN），且主要集中于特定的粘蛋白通路 | 研究旨在识别肿瘤微环境中的免疫抑制机制，并提高对胰腺癌的治疗效果 | 研究对象包括低级和高级胰腺管内乳头状粘液瘤，胰腺癌类器官及T细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | 小鼠同种异体模型 | 基因表达数据 | 43个胰腺管内乳头状粘液瘤样本（12个低级，31个高级） |
| 1593 | 2024-08-07 |
Correction: iDESC: identifying differential expression in single-cell RNA sequencing data with multiple subjects
2023-Oct-19, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05523-6
PMID:37858060
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1594 | 2024-08-07 |
iDESC: identifying differential expression in single-cell RNA sequencing data with multiple subjects
2023-Aug-22, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05432-8
PMID:37608264
|
研究论文 | 本文开发了iDESC方法，用于在包含多个受试者的单细胞RNA测序数据中检测细胞类型特异性的差异表达基因 | iDESC采用零膨胀负二项混合模型，同时考虑了受试者效应和数据中的脱落事件，提高了差异表达分析的准确性和稳健性 | NA | 开发和评估一种新的方法，用于在单细胞RNA测序数据中进行差异表达分析，特别是在考虑多个受试者效应和数据脱落事件的情况下 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 零膨胀负二项混合模型 | RNA测序数据 | 多个受试者 |
| 1595 | 2024-08-04 |
Debiased personalized gene coexpression networks for population-scale scRNA-seq data
2023-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277363.122
PMID:37295843
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研究论文 | 本文提出了一种名为Dozer的方法，用于修正来自scRNA-seq数据集的基因-基因相关性估计。 | Dozer能够消除来自低稀疏表达基因的相关性估计偏差，并能准确量化个体间的网络级变异。 | 尽管Dozer在多种情况下表现出鲁棒性，但仍可能受到技术限制和数据噪声的影响。 | 本研究旨在估计个性化的基因共表达网络，以便在单细胞RNA-seq数据中量化表达变异。 | 研究对象包括来自不同个体的人诱导多能干细胞和阿尔茨海默病后人类组织提取的少突胶质细胞。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 普瓦松测量模型 | 基因表达数据 | 涉及不同个体的多条人诱导多能干细胞系和人类组织样本 |
| 1596 | 2024-08-07 |
Analysis of immunogenic cell death in atherosclerosis based on scRNA-seq and bulk RNA-seq data
2023-Jun, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110130
PMID:37075670
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研究论文 | 本文通过scRNA-seq和bulk RNA-seq数据分析了动脉粥样硬化中免疫原性细胞死亡的作用 | 首次系统研究了动脉粥样硬化中的免疫原性细胞死亡，并探讨了其相关基因作为治疗靶点的可能性 | NA | 探讨免疫原性细胞死亡在动脉粥样硬化中的作用及其相关基因的治疗潜力 | 动脉粥样硬化中的免疫原性细胞死亡及相关基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | 随机森林 | RNA序列数据 | 动脉粥样硬化斑块单细胞RNA序列数据及大量RNA序列数据 |
| 1597 | 2024-08-04 |
Evaluation of zero counts to better understand the discrepancies between bulk and single-cell RNA-Seq platforms
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.09.035
PMID:37841335
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研究论文 | 文章探讨了批量RNA测序与单细胞RNA测序之间的差异以及零计数的影响 | 发现RNA完整性、基因长度及转录本数量对零计数的影响，为跨平台表达偏移修正开发新方法提供了基础 | 仅通过四组配对数据分析，样本量或数据丰富性可能有限 | 旨在理解批量与单细胞RNA测序在表达测量上的差异 | 研究对象为测序平台的技术和生物因素以及基因和生物通路 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 四组配对数据集，每组含多个样本 |
| 1598 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing provides novel insights to pathologic pathways in abdominal aortic aneurysm
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1172080
PMID:37288252
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review | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在腹主动脉瘤发病机制研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术提供了无偏见的、全局性的转录组特征视图，有助于识别腹主动脉瘤形成的关键通路 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在腹主动脉瘤分析中的应用趋势和未来潜力 | 腹主动脉瘤的发病机制 | digital pathology | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
| 1599 | 2024-08-04 |
Identification of biomarkers of renal ischemia-reperfusion injury by bioinformatics analysis and single-cell sequencing analysis combined with in vivo validation
2023-12, Transplant immunology
IF:1.6Q3
DOI:10.1016/j.trim.2023.101928
PMID:37704087
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研究论文 | 本文研究了与肾缺血再灌注损伤相关的中心基因和通路 | 本研究识别了cyp1a1和pdk4作为肾缺血的潜在生物标志物，并展示了其良好的诊断价值 | 未提及该研究的局限性 | 探索肾缺血再灌注损伤的生物标志物 | 小鼠肾缺血样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞分析、qRT-PCR | NA | 转录组表达数据 | 小鼠肾缺血样本的转录组数据，共发现157个差异表达基因 |
| 1600 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals novel genes during the remodelling of the embryonic human arterial valves
2023-Nov, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1010777
PMID:38011284
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了人类胚胎动脉瓣重塑过程中发现的新基因 | 发现了一些在小鼠基因组中不存在的新基因，这些基因与瓣膜发育未曾关联过 | 研究主要集中在早期人类胚胎，可能不适用于其他发育阶段 | 探究人类胚胎动脉瓣的形成和重塑过程中的转录组特征 | 人类胚胎中的动脉瓣 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | CS16和CS19的动脉瓣 |