单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 5355 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-10-20 |
Role of mitochondria-bound HK2 in rheumatoid arthritis fibroblast-like synoviocytes
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1103231
PMID:37529037
|
研究论文 | 研究线粒体结合的HK2在类风湿性关节炎成纤维样滑膜细胞中的作用 | 首次提出线粒体结合的HK2是类风湿性关节炎成纤维样滑膜细胞表型的关键调控因子 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，尚未在人体中验证 | 探讨线粒体结合的HK2在类风湿性关节炎成纤维样滑膜细胞中的作用及其潜在治疗策略 | 类风湿性关节炎成纤维样滑膜细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 142 | 2024-10-20 |
A single-cell atlas reveals shared and distinct immune responses and metabolic profiles in SARS-CoV-2 and HIV-1 infections
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1105673
PMID:36992700
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据构建了SARS-CoV-2和HIV-1感染的免疫反应和代谢特征图谱，比较了两种病毒感染的免疫细胞群和清除途径的异同 | 本文提出了一种新的共识单细胞注释方法，整合了来自COVID-19和HIV-1患者的单细胞RNA测序数据，构建了一个统一的细胞图谱，详细比较了主要免疫细胞群的表型特征和调控途径 | 本文仅比较了COVID-19和HIV-1感染的免疫反应和代谢特征，未涉及其他病毒感染的情况 | 揭示SARS-CoV-2和HIV-1感染的免疫反应和代谢特征的异同，为理解疾病进展和开发有效疫苗和疗法提供依据 | SARS-CoV-2和HIV-1感染的免疫细胞群和清除途径 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 111,566个单个PBMCs样本，来自7名COVID-19患者、10名HIV-1患者和3名健康对照 |
| 143 | 2024-10-20 |
Single cell RNA-sequencing profiling to improve the translation between human IBD and in vivo models
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1291990
PMID:38179052
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在炎症性肠病（IBD）及其体内模型中的应用，探讨了如何通过scRNA-seq提高临床转化 | 首次广泛应用scRNA-seq技术于IBD的临床前模型，揭示了免疫系统、基质细胞和上皮细胞之间的复杂相互作用 | NA | 探讨如何通过单细胞RNA测序提高炎症性肠病临床前模型的临床转化率 | 炎症性肠病（IBD）及其体内模型 | 基因组学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 144 | 2024-10-19 |
Comprehensive analysis of the potential biological significance of cuproptosis-related gene LIPT2 in pan-cancer prognosis and immunotherapy
2023-12-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-50039-x
PMID:38129565
|
研究论文 | 本文分析了铜死亡相关基因LIPT2在泛癌预后和免疫治疗中的潜在生物学意义 | 首次全面评估了LIPT2基因在多种癌症中的表达水平及其对预后的影响，并探讨了其在免疫治疗中的潜在作用 | 研究主要基于生物信息学方法，缺乏实验验证 | 探讨LIPT2在泛癌中的生物学功能及其在预后和免疫治疗中的潜在意义 | LIPT2基因在多种癌症中的表达及其对预后和免疫治疗的影响 | NA | NA | 生物信息学方法，单细胞测序 | NA | 基因表达数据，突变数据，甲基化数据，免疫状态数据 | 涉及多种癌症类型的样本 |
| 145 | 2024-10-19 |
Mapping the landscape of lineage-specific dynamic regulation of gene expression using single-cell transcriptomics and application to genetics of complex disease
2023-Dec-14, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.10.24.23297476
PMID:37961453
|
研究论文 | 本文开发了一种遗传模型，用于量化中脑神经元在从诱导多能干细胞分化过程中基因表达的动态调控和细胞类型特异性 | 本文提出了一个新的框架，用于量化基因表达的遗传调控动态和细胞类型特异性，并应用于复杂疾病遗传学研究 | 本文面临的挑战包括人群规模研究中参考资源的有限性、单细胞RNA测序数据稀疏性以及个体细胞类型内表达模式的复杂性 | 研究基因表达的遗传调控动态和细胞类型特异性，并应用于复杂疾病遗传学研究 | 中脑神经元在从诱导多能干细胞分化过程中的基因表达 | 基因组学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | 遗传模型 | 基因表达数据 | 超过1500个表型数据来自UK Biobank |
| 146 | 2024-10-19 |
Assessing GPT-4 for cell type annotation in single-cell RNA-seq analysis
2023-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.16.537094
PMID:37131626
|
研究论文 | 评估GPT-4在单细胞RNA测序分析中进行细胞类型注释的性能 | 利用GPT-4这一强大的大型语言模型，自动且准确地通过标准单细胞RNA测序分析管道生成的标记基因信息进行细胞类型注释 | NA | 评估GPT-4在细胞类型注释中的应用潜力，并开发相应的开源软件包 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | GPT-4 | 基因表达数据 | 数百种组织类型和细胞类型 |
| 147 | 2024-10-19 |
Fishing Innate Immune System Properties through the Transcriptomic Single-Cell Data of Teleostei
2023-Dec-12, Biology
DOI:10.3390/biology12121516
PMID:38132342
|
研究论文 | 本文总结了与鱼类先天免疫系统（IIS）相关的单细胞RNA测序（scRNAseq）和空间转录组学实验数据 | 本文首次系统地总结了鱼类先天免疫系统的单细胞RNA测序数据，并提出了对非模式鱼类进行新实验的必要性 | 目前只有少数scRNAseq数据可用于其他鱼类，且缺乏对非模式鱼类的研究 | 研究鱼类先天免疫系统的特性和多样性 | 鱼类的先天免疫系统 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 涉及多种鱼类器官和发育阶段的多个scRNAseq实验数据 |
| 148 | 2024-10-19 |
Consensus scHPF Identifies Cell Type-Specific Drug Responses in Glioma by Integrating Large-Scale scRNA-seq
2023-Dec-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.05.570193
PMID:38105955
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为共识scHPF的贝叶斯矩阵分解算法，用于整合大规模单细胞RNA测序数据，以识别胶质瘤中特定细胞类型的药物反应 | 提出了共识scHPF算法，通过分析多个随机初始化的scHPF模型，识别最稳健的基因特征并自动确定给定数据集的因子数量 | NA | 开发一种新的算法来整合复杂的单细胞RNA测序数据，以识别特定细胞类型的药物反应 | 胶质瘤切片培养样本，包括19名患者、10种药物治疗条件和52个样本 | 单细胞RNA测序 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯矩阵分解 | 基因表达数据 | 19名患者，10种药物治疗条件，52个样本 |
| 149 | 2024-10-19 |
Single-cell DNA methylome and 3D multi-omic atlas of the adult mouse brain
2023-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06805-y
PMID:38092913
|
研究论文 | 本研究使用单核甲基化测序和多组学测序技术，构建了成年小鼠大脑的单细胞DNA甲基化和3D多组学图谱 | 首次在空间背景下全面解析了成年小鼠大脑的DNA甲基化多样性，并整合了转录组和染色质可及性数据，构建了基于甲基化的细胞分类和调控网络 | 研究仅限于成年小鼠大脑，未涵盖其他物种或发育阶段 | 理解大脑发育和神经疾病的DNA甲基化机制，构建全面的分子图谱 | 成年小鼠大脑的单细胞DNA甲基化和染色质构象 | 数字病理学 | NA | 单核甲基化测序（snmC-seq3）和多组学测序（snm3C-seq） | NA | 基因组数据 | 301,626个甲基化图谱和176,003个染色质构象-甲基化联合图谱，来自117个解剖区域 |
| 150 | 2024-10-19 |
Spatial transcriptomic analysis of the mouse brain following chronic social defeat stress
2023-Dec, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20220133
PMID:38264685
|
研究论文 | 研究使用空间转录组学分析慢性社会挫败应激对小鼠大脑的影响 | 首次全面比较了慢性社会挫败应激在多个脑区的转录变化，并揭示了不同脑区基因表达的空间差异 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 探讨慢性社会挫败应激对小鼠大脑多个脑区的转录变化 | 小鼠大脑在慢性社会挫败应激下的基因表达 | 空间转录组学 | 抑郁症 | 空间转录组学 (ST) | NA | 基因表达数据 | 控制组、抗压组 (RES) 和易感组 (SUS) 的小鼠大脑样本 |
| 151 | 2024-10-19 |
Bioinformatics and system biology analysis revealed the crosstalk between COVID-19 and osteoarthritis
2023-Dec, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.1123
PMID:38156385
|
研究论文 | 本文通过生物信息学和系统生物学分析揭示了COVID-19与骨关节炎之间的相互作用 | 本文首次通过生物信息学方法探讨了COVID-19与骨关节炎之间的共同病理机制，并验证了关键基因在诊断和治疗中的潜在价值 | 本文主要依赖于生物信息学分析和体外实验，缺乏临床试验数据支持 | 探讨COVID-19与骨关节炎之间的相互作用，寻找潜在的治疗靶点 | COVID-19与骨关节炎的共同病理机制及相关基因、药物和免疫浸润 | 系统生物学 | 骨关节炎 | 生物信息学分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、定量聚合酶链反应、Western Blot | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、miRNA数据 | 74个共同差异表达基因、84个miRNA、28个转录因子、10种潜在药物 |
| 152 | 2024-10-19 |
Identification of monocyte-associated pathways participated in the pathogenesis of pulmonary arterial hypertension based on omics-data
2023-Oct, Pulmonary circulation
IF:2.2Q3
DOI:10.1002/pul2.12319
PMID:38130888
|
研究论文 | 本研究基于组学数据，探讨了单核细胞相关通路在肺动脉高压发病机制中的作用 | 首次结合微阵列数据和单细胞RNA测序数据，分析了单核细胞在肺动脉高压中的浸润情况及其相关信号通路 | 研究主要基于现有数据库中的数据，缺乏体内实验验证 | 评估免疫细胞浸润在肺动脉高压发病机制中的作用 | 肺动脉高压患者中的单核细胞及其相关信号通路 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 微阵列数据分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基于GEO数据库中的微阵列数据集和单细胞RNA测序数据 |
| 153 | 2024-10-19 |
Amphiregulin couples IL1RL1+ regulatory T cells and cancer-associated fibroblasts to impede antitumor immunity
2023-08-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add7399
PMID:37611111
|
研究论文 | 研究揭示了IL1RL1+调节性T细胞和癌症相关成纤维细胞通过AREG/EGFR轴相互作用，阻碍抗肿瘤免疫 | 首次揭示了AREG/EGFR轴在调节性T细胞和癌症相关成纤维细胞之间的相互作用，控制成纤维细胞功能状态的分叉 | NA | 探讨调节性T细胞和癌症相关成纤维细胞在肿瘤微环境中的相互作用及其分子机制 | 调节性T细胞、癌症相关成纤维细胞、肿瘤微环境 | 肿瘤学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 154 | 2024-10-19 |
Synergism Between IL21 and Anti-PD-1 Combination Therapy is Underpinned by the Coordinated Reprogramming of the Immune Cellular Network in the Tumor Microenvironment
2023-08, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0012
PMID:37546701
|
研究论文 | 通过综合分析多个单细胞RNA测序数据集，研究了IL21与抗PD-1联合治疗在肿瘤微环境中通过协调重编程免疫细胞网络的协同机制 | 揭示了IL21在肿瘤微环境中通过增强CD4 T细胞的辅助功能，促进CD8 T细胞介导的免疫反应，并与抗PD-1阻断剂协同驱动肿瘤抗原特异性CD8 T细胞的克隆扩增和功能状态分化 | NA | 探讨IL21与抗PD-1联合治疗在肿瘤微环境中的协同机制 | 肿瘤微环境中的免疫细胞网络 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 多个单细胞RNA测序数据集 |
| 155 | 2024-10-19 |
Integrative in situ mapping of single-cell transcriptional states and tissue histopathology in a mouse model of Alzheimer's disease
2023-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01251-x
PMID:36732642
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为STARmap PLUS的方法，结合高分辨率空间转录组学和蛋白质检测，用于在小鼠阿尔茨海默病模型中进行单细胞转录状态和组织病理学的整合原位映射 | 本文创新性地将高分辨率空间转录组学与蛋白质检测结合，提供了疾病进展的综合细胞图谱 | NA | 揭示阿尔茨海默病在小鼠模型中的时空动态变化，理解疾病机制和进展 | 小鼠阿尔茨海默病模型的大脑组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 图像 | 8个月和13个月龄的小鼠阿尔茨海默病模型大脑组织样本 |
| 156 | 2024-10-19 |
Application of single-cell RNA sequencing methods to develop B cell targeted treatments for autoimmunity
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1103690
PMID:37520578
|
研究论文 | 本文探讨了利用单细胞RNA测序方法开发针对自身免疫病的B细胞靶向治疗 | 本文提出利用单细胞RNA测序技术识别自身免疫病中的致病性自身反应性B细胞，以开发更精确的靶向治疗 | NA | 开发针对自身免疫病的B细胞靶向治疗 | 自身反应性B细胞 | 数字病理学 | 自身免疫病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 157 | 2024-10-17 |
Transcription factors in fibroblast plasticity and CAF heterogeneity
2023-Dec-20, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02934-4
PMID:38124183
|
综述 | 本文综述了转录因子在癌症相关成纤维细胞（CAF）异质性和可塑性中的作用 | 强调了单细胞RNA测序技术在揭示转录因子在不同癌症类型中将正常成纤维细胞转化为不同CAF亚型中的作用 | 目前尚未形成统一的CAF亚群功能分类，这为临床上开发靶向CAF疗法带来了挑战 | 揭示CAF的异质性，并识别不同肿瘤中的共性，以更有效地靶向肿瘤微环境中的促肿瘤基质 | 癌症相关成纤维细胞（CAF）及其异质性和可塑性 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 158 | 2024-10-17 |
scNAT: a deep learning method for integrating paired single-cell RNA and T cell receptor sequencing profiles
2023-12-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03129-y
PMID:38111007
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scNAT的深度学习方法，用于整合配对的单细胞RNA和T细胞受体测序数据 | scNAT方法能够将配对的scRNA-seq和scTCR-seq数据整合到一个统一的潜在空间中，用于下游分析 | NA | 开发一种能够整合单细胞RNA和T细胞受体测序数据的深度学习方法 | 单细胞RNA测序数据和T细胞受体测序数据 | 机器学习 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq） | 深度学习 | 单细胞RNA和T细胞受体测序数据 | NA |
| 159 | 2024-10-17 |
Atypical B cells consist of subsets with distinct functional profiles
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108496
PMID:38098745
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了慢性暴露于疟疾寄生虫的个体中非典型B细胞的转录组、细胞表面标记和B细胞受体，发现了三种先前未被描述的非典型B细胞亚群，并揭示了它们在适应性免疫反应中的不同功能 | 发现了三种先前未被描述的非典型B细胞亚群，并揭示了它们在适应性免疫反应中的不同功能 | NA | 更好地定义非典型B细胞在人类适应性免疫反应中的作用 | 非典型B细胞的转录组、细胞表面标记和B细胞受体 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 慢性暴露于疟疾寄生虫的个体 |
| 160 | 2024-10-17 |
Challenges and opportunities to computationally deconvolve heterogeneous tissue with varying cell sizes using single-cell RNA-sequencing datasets
2023-12-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03123-4
PMID:38098055
|
研究论文 | 本文讨论了使用单细胞RNA测序数据进行异质组织解卷积的挑战和机遇 | 提出了使用正交的“黄金标准”数据集来评估解卷积方法 | 现有方法可能量化总mRNA而非细胞类型比例，缺乏细胞参考图谱和单细胞与空间转录组数据整合的标准 | 探讨如何解决使用单细胞RNA测序数据进行异质组织解卷积的关键挑战 | 异质组织中的细胞混合物 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |