单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
141	2025-03-27	CTLA4 protects against maladaptive cytotoxicity during the differentiation of effector and follicular CD4+ T cells 2023-07, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1 DOI:10.1038/s41423-023-01027-8 PMID:37161048	研究论文	本文研究了CTLA4在效应性和滤泡性CD4+ T细胞分化过程中对细胞毒性的保护作用	揭示了CTLA4在调节CD4+ T细胞细胞毒性中的关键作用，并发现CD57标记的CD4 T细胞在不同组织中的表型差异	研究主要基于原发性抗体缺陷患者，结果在其他疾病中的普适性需要进一步验证	探讨CTLA4在CD4+ T细胞分化过程中的调控机制及其对细胞毒性的影响	CD57标记的CD4+ T细胞	免疫学	原发性抗体缺陷	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	来自血液和扁桃体样本的匹配CD57 CD4 T细胞
142	2025-03-27	Regulation of c-SMAC formation and AKT-mTOR signaling by the TSG101-IFT20 axis in CD4+ T cells 2023-05, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1 DOI:10.1038/s41423-023-01008-x PMID:37029318	research paper	本研究探讨了TSG101-IFT20轴在CD4+ T细胞中调控c-SMAC形成及AKT-mTOR信号通路的机制	发现IFT20与TSG101的相互作用促进SMAC形成，进而放大AKT-mTOR信号通路，揭示了CD4+ T细胞活化的新调控机制	研究主要基于体外实验和小鼠模型，人体内的相关机制仍需进一步验证	探究CD4+ T细胞中SMAC形成的分子机制及其在免疫应答中的作用	CD4+ T细胞	免疫学	过敏性疾病	单细胞RNA测序	小鼠模型	基因表达数据	未刺激和抗体刺激的CD4+ T细胞
143	2025-03-27	Dendritic cell subsets in cancer immunity and tumor antigen sensing 2023-05, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1 DOI:10.1038/s41423-023-00990-6 PMID:36949244	综述	本文综述了树突状细胞在癌症免疫和肿瘤抗原感知中的作用及其机制	利用scRNA-seq分析揭示了树突状细胞的表型获取、转录状态和功能程序	未提及具体实验样本量和数据来源的局限性	探讨树突状细胞在肿瘤抗原感知和抗肿瘤免疫中的作用	树突状细胞及其在肿瘤微环境中的功能	免疫学	癌症	scRNA-seq	NA	转录组数据	NA
144	2025-03-27	Type I interferon signaling facilitates resolution of acute liver injury by priming macrophage polarization 2023-02, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1 DOI:10.1038/s41423-022-00966-y PMID:36596875	研究论文	该研究揭示了I型干扰素信号在急性肝损伤恢复过程中通过调控巨噬细胞极化促进肝脏修复的机制	首次在单细胞水平解析了APAP诱导的急性肝损伤中肝脏髓系细胞的异质性，并发现IFN-I依赖的三方通讯通路在促进Trem2+修复性巨噬细胞成熟中的关键作用	研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证	阐明对乙酰氨基酚过量诱导的急性肝损伤(APAP-ALI)中髓系细胞的异质性和细胞间通讯机制	野生型和STAT2 T403A突变小鼠的肝脏CD11b+细胞	肝脏病理学	急性肝损伤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫荧光染色、bulk RNA-seq、体外和体内功能实验	小鼠疾病模型	单细胞转录组数据、免疫组化数据、功能实验数据	未明确说明样本数量，使用WT和STAT2 T403A两种基因型小鼠
145	2025-03-26	Dissection of Cellular Communication between Human Primary Osteoblasts and Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells in Osteoarthritis at Single-Cell Resolution 2023-Aug-30, International journal of stem cells IF:2.5Q3 DOI:10.15283/ijsc22101 PMID:37105556	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，解析了人类原发性成骨细胞与骨髓间充质干细胞在骨关节炎中的细胞间通讯	发现了一种新的前成骨细胞亚型，并揭示了成熟成骨细胞可能通过WIF1和sFRP4抑制骨髓间充质干细胞的成骨分化	研究仅基于单细胞RNA测序数据，缺乏实验验证	探究人类原发性成骨细胞与骨髓间充质干细胞之间的细胞通讯机制	人类原发性成骨细胞和骨髓间充质干细胞	单细胞生物学	骨关节炎	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	转录组数据	NA
146	2025-03-26	A comparative study of in vitro air-liquid interface culture models of the human airway epithelium evaluating cellular heterogeneity and gene expression at single cell resolution 2023-Aug-28, Respiratory research IF:4.7Q1 DOI:10.1186/s12931-023-02514-2 PMID:37635251	研究论文	比较研究体外气液界面培养模型在人类气道上皮细胞异质性和单细胞分辨率基因表达方面的表现	首次在单细胞水平上全面比较了BCi-NS1.1来源和原代来源的气道上皮培养模型在基因表达和先天免疫功能方面的差异	研究仅使用了3个独立分化的BCi-NS1.1样本和3个不同供体的原代样本，样本量相对有限	评估工程化基底细胞系BCi-NS1.1作为气道上皮研究模型的适用性	BCi-NS1.1来源和原代来源的人类气道上皮培养物	细胞生物学	呼吸道感染	免疫荧光染色、单细胞RNA测序(scRNA-Seq)	体外气液界面培养模型	基因表达数据、图像数据	3个独立分化的BCi-NS1.1样本和3个不同供体的原代样本
147	2025-03-26	Potential Molecular Mechanisms of Alzheimer's Disease from Genetic Studies 2023-04-15, Biology DOI:10.3390/biology12040602 PMID:37106802	综述	本文综述了阿尔茨海默病（AD）的潜在分子机制，特别关注了遗传学研究中的发现	通过单细胞测序（scRNA-seq）和空间基因组学技术，将AD的分子机制差异归纳为四个关键类别，并探讨了与先前研究结果的对比	研究基于已有文献的叙述性综合，未进行新的实验验证	识别AD中分子失衡的共同原因及其潜在机制，为后续研究提供方向	阿尔茨海默病（AD）的分子机制	遗传学	阿尔茨海默病	scRNA-seq, 空间基因组学	NA	基因组数据	NA
148	2025-03-26	Epigenetic and transcriptomic characterization reveals progression markers and essential pathways in clear cell renal cell carcinoma 2023-03-27, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-023-37211-7 PMID:36973268	research paper	该研究通过单核RNA测序和单核ATAC测序技术，结合大量蛋白质组学数据，揭示了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的肿瘤特异性标志物及其表观遗传调控机制	通过多组学分层方法鉴定了20个肿瘤特异性标志物，揭示了铜蓝蛋白（CP）表达与生存率降低的关联，并探讨了CP在调节透明细胞肾细胞癌间质和肿瘤-间质相互作用中的角色	样本量相对较小（34例snRNA-seq和28例snATAC-seq样本），可能限制了结果的普遍性	揭示透明细胞肾细胞癌的肿瘤特异性标志物及其表观遗传调控机制，以增进对该癌症发病机理的理解	人类透明细胞肾细胞癌（ccRCC）标本	digital pathology	renal cell carcinoma	snRNA-seq, snATAC-seq, bulk proteogenomics, spatial transcriptomics	NA	genomic, transcriptomic, proteomic, epigenomic data	34例snRNA-seq和28例snATAC-seq的人类ccRCC标本
149	2025-03-26	Single-cell RNA-seq identified novel genes involved in primordial follicle formation 2023, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fendo.2023.1285667 PMID:38149096	研究论文	通过单细胞RNA测序技术，识别了参与原始卵泡形成的新基因和新配体-受体相互作用	发现了ANXA7和GTF2F1在生殖细胞中促进原始卵泡形成的新功能，以及配体Mdk与受体Sdc1在原始卵泡形成中的关键作用	研究主要基于小鼠和人类卵巢的公共单细胞RNA测序数据，样本量有限	探索原始卵泡形成的分子机制及其与早发性卵巢功能不全的关系	小鼠和人类卵巢中的生殖细胞和颗粒细胞	生殖生物学	早发性卵巢功能不全	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、全外显子测序(WES)、全基因组测序(WGS)	NA	基因表达数据、测序数据	93例POI患者和465例对照的测序数据，25周人类胎儿卵巢样本
150	2025-03-24	Spatially resolved multiomics of human cardiac niches 2023-Jul, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-023-06311-1 PMID:37438528	研究论文	本文结合单细胞和空间转录组学数据，揭示了人类心脏八个区域内的细胞微环境，并绘制了细胞到微观解剖位置的图谱	结合单细胞和空间转录组学数据，揭示了心脏传导系统细胞的独特离子通道、G蛋白偶联受体和调控网络，并引入了新的药物靶点预测工具drug2cell	研究仅限于人类心脏的八个区域，可能无法全面反映整个心脏的复杂性	揭示人类心脏不同区域的细胞微环境及其功能	人类心脏的八个区域及其细胞微环境	数字病理学	心血管疾病	单细胞转录组学、空间转录组学	NA	单细胞数据、空间转录组数据	人类心脏的八个区域
151	2025-03-23	Clonally expanded memory CD8+ T cells accumulate in atherosclerotic plaques and are pro-atherogenic in aged mice 2023-Dec, Nature aging IF:17.0Q1 DOI:10.1038/s43587-023-00515-w PMID:37996758	研究论文	本研究探讨了老化对CD8 T细胞在动脉粥样硬化中的作用，发现老化小鼠中CD8 T细胞的耗竭能减轻动脉粥样硬化	首次发现老化相关的CD8 T细胞在动脉粥样硬化斑块中的克隆扩增及其转录组特征	研究仅使用雌性小鼠，未涉及人类样本	探讨老化对CD8 T细胞在动脉粥样硬化中的作用	老化小鼠和年轻小鼠的CD8 T细胞	免疫学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	雌性小鼠
152	2025-03-23	APOE deficiency impacts neural differentiation and cholesterol biosynthesis in human iPSC-derived cerebral organoids 2023-08-21, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-023-03444-y PMID:37605285	研究论文	本研究探讨了APOE基因缺失对人类iPSC来源的脑类器官中神经分化和胆固醇生物合成的影响	首次在人类iPSC来源的脑类器官中揭示了APOE缺失对脑脂质稳态的影响，并发现了APOE4与APOE3在神经发生和胆固醇代谢上的差异	研究仅限于体外模型，未涉及体内环境的影响	探讨APOE基因在脑稳态中的作用及其与阿尔茨海默病的关系	人类iPSC来源的脑类器官	神经科学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	人类iPSC来源的脑类器官，包括APOE缺失和未缺失的样本
153	2025-03-22	Early human lung immune cell development and its role in epithelial cell fate 2023-12-15, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adf9988 PMID:38100545	研究论文	本文研究了人类胚胎和胎儿肺免疫细胞的发育及其对上皮细胞命运的影响	首次系统性地描述了人类胚胎和胎儿肺免疫细胞的发育过程，并探讨了免疫细胞在肺上皮细胞成熟中的作用	研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序，体内实验的证据尚不充分	探讨人类肺发育过程中免疫细胞的作用及其对上皮细胞命运的影响	人类胚胎和胎儿肺免疫细胞及上皮细胞	发育生物学	NA	scRNA-seq, smFISH, 免疫组织化学	NA	单细胞RNA测序数据, 图像数据	人类胚胎和胎儿肺组织样本
154	2025-03-22	p53 governs an AT1 differentiation programme in lung cancer suppression 2023-Jul, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-023-06253-8 PMID:37468633	研究论文	本文探讨了p53在肺腺癌（LUAD）抑制中的作用，特别是通过调控肺泡1型（AT1）细胞分化来抑制LUAD的发展	揭示了p53通过调控细胞状态，特别是促进AT1细胞分化来抑制LUAD的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类LUAD中的具体机制仍需进一步验证	研究p53在肺腺癌（LUAD）抑制中的具体机制	肺腺癌（LUAD）细胞和小鼠模型	癌症研究	肺癌	RNA测序、ATAC测序、单细胞转录组分析	小鼠模型	基因表达数据、染色质重塑数据	使用表达致癌Kras和不同Trp53等位基因的小鼠模型
155	2025-03-20	FRC transplantation restores lymph node conduit defects in laminin α4-deficient mice 2023-04-24, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.167816 PMID:37092548	研究论文	本研究揭示了细胞外基质Lama4在调节淋巴结导管中的特定作用，并探讨了FRC移植对Lama4缺陷小鼠淋巴结导管缺陷的修复作用	首次揭示了FRC衍生的Lama4在维持导管纤维完整性中的关键作用，并展示了通过FRC移植修复Lama4缺陷小鼠的淋巴结导管结构和功能的创新方法	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨FRC衍生的Lama4在调节淋巴结导管结构和功能中的作用，并评估FRC移植对Lama4缺陷小鼠的修复效果	Lama4缺陷小鼠及其淋巴结导管	免疫学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	Lama4缺陷小鼠及其淋巴结组织
156	2025-03-20	LAL deficiency induced myeloid-derived suppressor cells as targets and biomarkers for lung cancer 2023-03, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2022-006272 PMID:36914206	研究论文	本文探讨了溶酶体酸性脂肪酶（LAL）缺乏诱导的髓系来源抑制细胞（MDSCs）在肺癌中的潜在作用及其作为抗癌免疫治疗靶点和生物标志物的可能性	揭示了LAL缺乏如何通过改变代谢途径诱导MDSCs的产生，并展示了这些细胞在肿瘤免疫抑制和促进肿瘤生长中的作用	研究主要基于小鼠模型和人类血液样本，缺乏直接的人体组织验证	探索LAL缺乏诱导的MDSCs在肺癌中的机制及其作为治疗靶点的潜力	小鼠骨髓来源的Ly6G+髓系细胞和非小细胞肺癌（NSCLC）患者的血液样本	肿瘤免疫学	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术	NA	基因表达数据，细胞表型数据	小鼠骨髓细胞和NSCLC患者的血液样本
157	2025-03-17	Brief literature review and comprehensive bioinformatics analytics unravel the potential mechanism of curcumin in the treatment of periodontitis 2023-07-08, BMC oral health IF:2.6Q1 DOI:10.1186/s12903-023-03181-x PMID:37422651	研究论文	本研究通过计算模拟揭示了姜黄素治疗牙周炎的潜在作用机制	通过单细胞分析和批量RNA测序数据的整合，结合分子对接和分子动力学模拟，揭示了姜黄素与CXCL1、FOS和CXCL8的结合模式	研究主要依赖于计算模拟，缺乏实验验证	揭示姜黄素治疗牙周炎的潜在机制	牙周炎	生物信息学	牙周炎	单细胞分析, 批量RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟	NA	基因表达数据	数据集GSE164241、GSE10334和GSE16134
158	2025-03-16	hdWGCNA identifies co-expression networks in high-dimensional transcriptomics data 2023-06-26, Cell reports methods IF:4.3Q2 DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100498 PMID:37426759	研究论文	本文介绍了hdWGCNA，一个用于分析高维转录组数据中共表达网络的综合框架	hdWGCNA支持系统级分析，能够进行异构体水平的网络分析，并兼容广泛使用的Seurat R包	NA	开发一个支持高维转录组数据系统级分析的工具	高维转录组数据，如单细胞和空间RNA测序数据	生物信息学	自闭症谱系障碍, 阿尔茨海默病	单细胞RNA测序, 空间RNA测序	NA	转录组数据	近100万个细胞的数据集
159	2025-03-16	Single-nucleus RNA sequencing of human pancreatic islets identifies novel gene sets and distinguishes β-cell subpopulations with dynamic transcriptome profiles 2023-05-01, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-023-01179-2 PMID:37127706	研究论文	本文通过单核RNA测序技术（snRNA-seq）研究了人类胰岛细胞的转录组特征，并识别了新的基因集和β细胞亚群	利用snRNA-seq技术，结合内含子序列信息，识别了人类胰岛细胞中非经典基因标记，并区分了β细胞的三个亚群	研究主要基于体外和体内实验，未涉及大规模临床样本验证	研究人类胰岛细胞的转录组特征及其动态变化	人类胰岛细胞	基因组学	糖尿病	单核RNA测序（snRNA-seq）	NA	RNA测序数据	来自同一供体的人类胰岛细胞
160	2025-03-16	APOE modulates microglial immunometabolism in response to age, amyloid pathology, and inflammatory challenge 2023-03-28, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2023.112196 PMID:36871219	研究论文	本文探讨了APOE基因型如何调控小胶质细胞的免疫代谢，特别是在衰老、神经炎症和阿尔茨海默病病理背景下	结合了批量、单细胞和空间转录组学，以及细胞特异性和空间分辨的代谢分析，系统性地研究了APOE在不同条件下的作用	研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类情况	研究APOE基因型对小胶质细胞免疫代谢的调控作用	表达人类APOE的小鼠	神经科学	阿尔茨海默病	RNA测序（RNA-seq）、空间转录组学、质谱成像	NA	转录组数据、代谢数据	NA