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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-05 |
Mammary duct luminal epithelium controls adipocyte thermogenic programme
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06361-5
PMID:37495690
|
研究论文 | 本研究揭示了乳腺导管上皮细胞通过分泌因子调控脂肪细胞产热程序的新机制 | 首次发现乳腺导管上皮细胞通过分泌'乳腺因子'调控脂肪细胞UCP1表达,揭示了交感神经-乳腺导管接触点对脂肪产热的抑制作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类中的相关性需要进一步验证 | 探究乳腺导管上皮细胞在脂肪细胞产热调控中的作用机制 | 雌性小鼠皮下白色脂肪组织和乳腺导管上皮细胞 | 细胞生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序,3D全组织免疫荧光成像 | NA | 基因表达数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 142 | 2025-10-05 |
Mitochondrial integrated stress response controls lung epithelial cell fate
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06423-8
PMID:37558881
|
研究论文 | 本研究揭示了线粒体复合物I通过NAD再生调控肺上皮细胞命运的新机制 | 首次发现线粒体复合物I依赖的NAD再生在肺泡发育中通过抑制整合应激反应控制细胞命运 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需验证 | 探索肺上皮细胞命运的代谢调控机制 | 小鼠肺上皮细胞 | 细胞生物学 | 肺发育疾病 | 单细胞RNA测序, 基因敲除 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 143 | 2025-10-05 |
Diverse clonal fates emerge upon drug treatment of homogeneous cancer cells
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06342-8
PMID:37468627
|
研究论文 | 本研究开发了FateMap框架,通过DNA条形码和单细胞RNA测序技术揭示了癌细胞在抗癌治疗中的克隆命运多样性 | 开发了结合DNA条形码和单细胞RNA测序的FateMap框架,首次系统揭示了癌细胞耐药类型的多样性及其内在决定机制 | NA | 探究遗传相同癌细胞在药物治疗下产生不同耐药类型的机制 | 单细胞来源的癌细胞系和患者样本 | 单细胞生物学 | 癌症 | DNA条形码技术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 数十万个克隆 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 144 | 2025-10-05 |
Pharmacological targeting of netrin-1 inhibits EMT in cancer
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06372-2
PMID:37532929
|
研究论文 | 本研究通过药理学方法靶向netrin-1抑制癌症中的上皮间质转化 | 首次发现netrin-1在EMT中的关键作用,并开发了靶向netrin-1的单克隆抗体NP137作为新型治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类癌细胞系,需要更多临床验证 | 开发靶向上皮间质转化的癌症治疗新方法 | 皮肤鳞状细胞癌小鼠模型和A549人类癌细胞系 | 癌症生物学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,基因敲低 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 145 | 2025-10-05 |
A spatially resolved single cell genomic atlas of the adult human breast
2023-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.22.537946
PMID:37163043
|
研究论文 | 构建了首个成人正常乳腺组织的单细胞和空间分辨率综合图谱 | 首次在单细胞和空间分辨率层面系统揭示成人乳腺组织的细胞组成和空间分布特征,发现导管和小叶中丰富的组织驻留免疫细胞生态系统 | 样本数量相对有限(62名女性),主要关注正常组织,疾病状态研究较少 | 建立成人正常乳腺组织的综合细胞参考图谱 | 成人女性乳腺组织 | 单细胞基因组学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 535,941个细胞(来自62名女性),120,024个细胞核(来自20名女性) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | 使用了三种空间定位技术 |
| 146 | 2025-10-05 |
Predicting the Structural Impact of Human Alternative Splicing
2023-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.21.572928
PMID:38187531
|
研究论文 | 本研究使用AlphaFold2预测了超过11,000种人类剪接异构体的结构,系统分析了选择性剪接对蛋白质结构的影响 | 首次大规模预测人类剪接异构体的三维结构,并系统分析剪接变异对结构特征和功能的影响 | 仅基于计算预测,缺乏实验验证;分析范围限于已知的剪接异构体 | 探究选择性剪接对蛋白质结构的影响及其功能意义 | 人类蛋白质剪接异构体 | 计算生物学 | NA | 蛋白质结构预测,单细胞RNA测序 | AlphaFold2 | 蛋白质序列,单细胞RNA-seq数据 | 超过11,000种人类剪接异构体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Tabula Sapiens项目的单细胞RNA-seq数据 |
| 147 | 2025-10-05 |
Probabilistic cell/domain-type assignment of spatial transcriptomics data with SpatialAnno
2023-12-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1023
PMID:37941153
|
研究论文 | 提出一种名为SpatialAnno的空间转录组数据注释方法,能够有效利用非标记基因和标记基因的定性信息 | 通过因子模型估计非标记基因的低维嵌入,同时利用Potts模型促进相邻点间的空间平滑性,无需参考数据集 | NA | 开发空间转录组数据的细胞/区域类型注释方法 | 空间转录组数据中的细胞/点 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | 因子模型, Potts模型 | 空间转录组数据 | 模拟数据和4个真实数据集 | 10x Genomics, ST, Slide-seq, seqFISH | 空间转录组学 | 10x Visium, ST, Slide-seqV1/2, seqFISH | 10x Visium平台, ST平台, Slide-seqV1/2平台, seqFISH平台 |
| 148 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomics of the human heart
2023-08, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01918-1
PMID:37568021
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2025-10-05 |
p53 governs an AT1 differentiation programme in lung cancer suppression
2023-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06253-8
PMID:37468633
|
研究论文 | 本研究揭示了p53通过调控肺泡1型细胞分化程序抑制肺腺癌发展的新机制 | 首次发现p53通过促进AT1细胞分化程序来抑制肺癌,揭示了p53在肺泡损伤修复和肿瘤抑制中的双重作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究p53抑制肺腺癌发展的分子机制 | 肺腺癌细胞、肺泡2型细胞、肺泡1型细胞 | 癌症生物学 | 肺癌 | RNA测序, ATAC测序, 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 单细胞转录组数据 | 表达致癌Kras和不同Trp53等位基因的转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, bulk ATAC-seq | NA | NA |
| 150 | 2025-10-05 |
An atlas of healthy and injured cell states and niches in the human kidney
2023-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-05769-3
PMID:37468583
|
研究论文 | 构建了人类肾脏健康和损伤状态下的高分辨率细胞图谱 | 首次通过多组学方法系统描绘了人类肾脏51种主要细胞类型,包括罕见和未描述细胞群体,并定义了28种肾脏损伤相关的细胞状态 | 样本数量相对有限(45名健康供体和48名患者),且为观察性研究 | 理解肾脏疾病的细胞类型复杂性、分子特征和组织微环境相互作用 | 人类肾脏组织 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序,单核测序,空间成像技术,空间转录组学,3D成像分析 | NA | 单细胞数据,空间转录组数据,成像数据 | 45名健康肾脏供体和48名肾脏疾病患者,超过400,000个细胞/细胞核 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 151 | 2025-10-05 |
Spatially resolved multiomics of human cardiac niches
2023-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06311-1
PMID:37438528
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研究论文 | 本研究结合单细胞和空间转录组学数据,揭示了人类心脏八个区域的细胞生态位特征 | 首次在人类心脏中整合单细胞和空间转录组学数据,开发了drug2cell药物靶点预测工具,并发现了心脏传导系统的独特特征 | 研究仅针对人类心脏的八个特定区域,可能未涵盖所有心脏结构 | 探索人类心脏不同区域的细胞生态位和微环境特征 | 人类心脏八个区域的细胞和组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 人类心脏八个区域 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 152 | 2025-10-05 |
Heritable transcriptional defects from aberrations of nuclear architecture
2023-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06157-7
PMID:37286600
|
研究论文 | 本研究揭示了核结构异常(如微核和染色体桥)会导致可遗传的转录抑制 | 首次发现微核和染色体桥等核结构异常可引起可遗传的转录缺陷,并建立了核结构异常与表观遗传变化之间的直接联系 | 表观遗传变化的异质性渗透机制尚未完全阐明 | 探究癌症中表观遗传变异的机制及其与核结构异常的关系 | 癌细胞中的微核和染色体桥 | 表观遗传学 | 癌症 | 长期活细胞成像,单细胞RNA测序(Look-Seq2) | NA | 基因表达数据,染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 153 | 2025-10-05 |
Ultraviolet radiation shapes dendritic cell leukaemia transformation in the skin
2023-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06156-8
PMID:37286599
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研究论文 | 本研究通过肿瘤系统基因组学和单细胞转录组学分析,揭示了紫外线辐射在皮肤部位塑造树突状细胞白血病转化的机制 | 首次证明紫外线辐射可在远位解剖部位影响前恶性克隆的演化,发现Tet2功能缺失突变使浆细胞样树突状细胞对UV诱导的细胞死亡产生抗性 | 研究样本量有限,主要聚焦于BPDCN这一罕见疾病,机制研究仍需进一步验证 | 探究浆细胞样树突状细胞肿瘤(BPDCN)的发病机制和进化过程 | 浆细胞样树突状细胞肿瘤患者样本 | 数字病理学 | 白血病 | 肿瘤系统基因组学, 单细胞转录组学, 基因分型 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 154 | 2025-10-05 |
Protocol for multi-modal single-cell RNA sequencing on M. tuberculosis-infected mouse lungs
2023-03-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102102
PMID:36853694
|
研究论文 | 开发了一种用于结核分枝杆菌感染小鼠肺组织的多模态单细胞RNA测序方案 | 同时获取每个感染细胞的转录组、表面标志物表达和细菌表型信息 | NA | 阐明不同免疫细胞在控制或促进结核分枝杆菌感染中的作用 | 结核分枝杆菌感染的肺巨噬细胞 | 单细胞测序 | 结核病 | 多模态单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,CITE-seq | NA | NA |
| 155 | 2025-10-05 |
Deciphering the landscape of transcriptional heterogeneity across cancer
2023-09-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.07.008
PMID:37595585
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研究论文 | 通过整合77项研究和24种癌症类型的单细胞RNA测序数据,揭示癌症转录异质性的重复模式及其功能意义 | 首次大规模整合跨癌症类型的单细胞转录组数据,系统识别转录异质性的重复模式 | NA | 解析癌症转录异质性景观并探索其功能意义 | 24种癌症类型的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 77项研究整合数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 156 | 2025-10-05 |
Deterministic evolution and stringent selection during preneoplasia
2023-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06102-8
PMID:37258665
|
研究论文 | 通过人类胃类器官模型研究TP53双等位基因失活后的癌前病变演化过程 | 建立了人类胃类器官模型模拟早期肿瘤发生过程,揭示了TP53失活后染色体不稳定的演化规律和克隆选择机制 | 研究基于体外类器官模型,可能与体内真实肿瘤发生环境存在差异 | 探索人类肿瘤发生的最早期事件及其演化规律 | TP53双等位基因失活的人类胃类器官 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞测序, 高通量谱系追踪, 实验演化 | 类器官模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 多个克隆来源的培养物,历时2年的纵向研究 | NA | 单细胞测序, 谱系追踪 | NA | NA |
| 157 | 2025-10-05 |
Hallmarks of transcriptional intratumour heterogeneity across a thousand tumours
2023-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06130-4
PMID:37258682
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研究论文 | 通过整合77项研究的单细胞RNA测序数据,系统分析了24种肿瘤类型中1,163个肿瘤样本的转录组瘤内异质性模式 | 首次大规模整合跨研究单细胞数据,识别出41个保守元程序并归纳为11个瘤内异质性标志 | 基于已有研究的整合分析,可能受原始数据质量和批次效应影响 | 系统表征肿瘤转录组瘤内异质性模式 | 1,163个肿瘤样本涵盖24种肿瘤类型 | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序 | 整合分析 | 单细胞转录组数据 | 1,163个肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 158 | 2025-10-05 |
Treatment of HCC with claudin-1-specific antibodies suppresses carcinogenic signaling and reprograms the tumor microenvironment
2023-02, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.10.011
PMID:36309131
|
研究论文 | 本研究通过靶向非连接性Claudin-1的单克隆抗体治疗肝细胞癌,揭示了其抑制肿瘤生长和重塑肿瘤微环境的作用机制 | 首次探索非连接性Claudin-1作为肝细胞癌治疗靶点的潜力,并开发特异性靶向该蛋白的人源化单克隆抗体 | 目前仍处于临床前研究阶段,尚未进行人体临床试验 | 研究Claudin-1作为肝细胞癌治疗靶点的可行性和作用机制 | 肝细胞癌患者来源的细胞模型和动物模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大量患者来源的细胞系异种移植模型和患者来源的异种移植小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 159 | 2025-10-05 |
Anterior Pituitary Transcriptomics Following a High-Fat Diet: Impact of Oxidative Stress on Cell Metabolism
2023-12-23, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad191
PMID:38103263
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析高脂饮食对小鼠垂体转录组的影响,揭示性别差异在氧化应激反应中的作用 | 首次在热中性环境中结合高脂饮食和单细胞转录组学分析垂体细胞对肥胖应激的性别特异性反应 | 研究仅使用FVB.129P小鼠品系,结果可能不适用于其他遗传背景 | 探究肥胖引起的氧化应激对垂体细胞功能的性别特异性影响 | FVB.129P品系雄性和雌性小鼠 | 单细胞转录组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10-15周高脂饮食处理的雄性和雌性小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 160 | 2025-10-05 |
Unraveling Vulnerabilities in Endocrine Therapy-Resistant HER2+/ER+ Breast Cancer
2023-11-02, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad159
PMID:37897495
|
研究论文 | 本研究通过建立内分泌治疗耐药HER2+/ER+乳腺癌体外模型,揭示了脂质代谢改变和铁死亡重塑是该类型乳腺癌的治疗脆弱点 | 首次建立了两种不同表型的内分泌治疗耐药HER2+/ER+乳腺癌体外模型,并发现GPX4抑制剂与抗HER2药物联合可显著诱导细胞死亡 | 研究仅基于体外细胞模型,尚未进行体内动物实验验证 | 识别内分泌治疗耐药HER2+/ER+乳腺癌的治疗脆弱点 | BT-474和MDA-MB-361乳腺癌细胞系及其长期雌激素剥夺耐药变体 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 全基因组测序,单细胞RNA测序 | 体外细胞模型 | 基因组数据,转录组数据 | 2种乳腺癌细胞系及其耐药变体 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |