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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-03-02 |
p53 governs an AT1 differentiation programme in lung cancer suppression
2023-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06253-8
PMID:37468633
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研究论文 | 本研究揭示了p53通过调控肺泡上皮细胞分化状态来抑制肺腺癌发展的新机制 | 首次发现p53通过促进肺泡I型细胞分化程序来抑制肺癌，并揭示其在组织损伤修复中的基础作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证有限 | 探究p53抑制肺腺癌发展的分子机制 | 表达致癌Kras和不同Trp53等位基因的小鼠模型中的肺腺癌细胞 | 癌症生物学 | 肺癌 | RNA测序, ATAC测序, 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 单细胞转录组数据 | 使用Trp53野生型、缺失型和超形态等位基因的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, bulk ATAC-seq | NA | NA |
| 142 | 2026-03-02 |
CX3CR1+ Macrophage Facilitates the Resolution of Allergic Lung Inflammation via Interacting CCL26
2023-06-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202209-1670OC
PMID:36790376
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研究论文 | 本研究揭示了CX3CR1+巨噬细胞通过与CCL26相互作用，在解决过敏性肺部嗜酸性粒细胞炎症中的关键作用 | 首次阐明了气道来源的CCL26通过激活CX3CR1+巨噬细胞分泌C1q，从而促进嗜酸性粒细胞清除的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究组织驻留巨噬细胞在嗜酸性过敏性肺部炎症消退过程中的细胞机制 | 人类和小鼠的肺泡巨噬细胞亚群、嗜酸性粒细胞、气道上皮细胞 | 免疫学 | 过敏性肺部疾病 | 质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、生物物理和免疫学分析 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 | 人类过敏原激发样本、小鼠过敏性肺部炎症模型、条件性CCL26敲除转基因小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 143 | 2026-03-02 |
Matrix stiffness enhances cancer-macrophage interactions and M2-like macrophage accumulation in the breast tumor microenvironment
2023-06, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2022.04.031
PMID:35483629
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探究了基质硬度对乳腺癌肿瘤微环境中细胞异质性和细胞间通讯的影响 | 首次在体内外结合单细胞RNA测序和生物材料平台，系统揭示了基质硬度通过调节CSF-1表达影响肿瘤相关巨噬细胞招募和M2表型极化的新机制 | 研究基于MMTV-PyMT小鼠模型，结论在人类乳腺癌中的普适性有待验证；未深入探究硬度影响CSF-1表达的具体信号通路 | 探究肿瘤基质硬度对肿瘤内异质性、细胞间通讯及巨噬细胞表型的影响 | MMTV-PyMT小鼠乳腺肿瘤模型、乳腺癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 144 | 2026-03-02 |
Massively parallel base editing to map variant effects in human hematopoiesis
2023-05-25, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.03.035
PMID:37137305
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研究论文 | 本文开发了一种大规模并行碱基编辑筛选方法，应用于人类造血干细胞和祖细胞，以系统性评估遗传变异在造血过程中的功能影响 | 首次在人类造血干细胞和祖细胞中实现大规模并行碱基编辑筛选，结合单细胞RNA测序和单细胞基因分型，实现跨造血分化状态的功能变异效应映射 | 方法主要针对造血系统，可能不适用于其他类型的原代细胞，且依赖于碱基编辑技术的特异性 | 系统性评估遗传变异对人类造血过程的影响，以研究疾病机制并开发治疗策略 | 人类造血干细胞和祖细胞 | 基因编辑与功能基因组学 | 血液疾病 | 碱基编辑，单细胞RNA测序，单细胞基因分型 | NA | 单细胞RNA测序数据，基因分型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 145 | 2026-03-02 |
Femtosecond laser microdissection for isolation of regenerating C. elegans neurons for single-cell RNA sequencing
2023-04, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01804-3
PMID:36928074
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研究论文 | 本文介绍了一种利用飞秒激光显微切割技术从活体组织中分离特定神经元的方法，用于单细胞RNA测序，以研究线虫神经再生的分子机制 | 开发了飞秒激光显微切割技术，首次实现了从活体线虫组织中精确分离具有特定再生表型的神经元，避免了组织解离引起的转录伪影 | 方法可能受限于激光切割的精度和效率，且在线虫以外的模型中的应用尚未验证 | 研究神经再生的分子机制，实现表型到基因型的映射 | 秀丽隐杆线虫的再生神经元 | 单细胞测序 | 神经再生 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 146 | 2026-03-02 |
Tumor Niche Network-Defined Subtypes Predict Immunotherapy Response of Esophageal Squamous Cell Cancer
2023-Feb-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.15.528539
PMID:36824935
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研究论文 | 本研究通过整合分析食管鳞状细胞癌（ESCC）患者肿瘤微环境的单细胞转录组数据，定义了基于T细胞耗竭、IFN a/b信号通路、TIGIT富集等特征的ESCC亚型，并预测了免疫检查点阻断（ICB）治疗的反应 | 利用单细胞转录组学数据，基于肿瘤微环境中T细胞、髓系细胞和成纤维细胞的细胞网络转录特征，首次定义了ESCC的亚型，并成功预测了ICB治疗反应，为精准免疫治疗提供了新策略 | 研究样本量相对较小（69例患者），且主要依赖转录组数据，缺乏蛋白质组或功能验证数据，可能限制了亚型定义的全面性和临床应用的普适性 | 旨在通过肿瘤微环境单细胞转录组分析，对ESCC进行亚型分类，并预测患者对免疫检查点阻断治疗的反应，以优化治疗选择 | 69例人类食管鳞状细胞癌（ESCC）患者的肿瘤微环境单细胞转录组数据集 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 69例ESCC患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 147 | 2026-03-02 |
Correspondence analysis for dimension reduction, batch integration, and visualization of single-cell RNA-seq data
2023-01-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-26434-1
PMID:36681709
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研究论文 | 本文提出了一种基于对应分析（CA）的维度降维方法，用于单细胞RNA-seq数据的处理，以替代常用的主成分分析（PCA），并展示了其在批次整合和可视化方面的优势 | 引入对应分析（CA）作为基于计数的PCA替代方法，避免了对数变换的扭曲，并提出了五种适应scRNAseq数据高稀疏性和过离散性的CA变体，提高了聚类准确性 | 在9个数据集中，CA变体在8个中表现优于或可比，但未在所有数据集中完全超越现有方法，且可能对特定数据分布敏感 | 开发更有效的维度降维方法，以改善单细胞RNA-seq数据的分析和可视化 | 单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 对应分析（CA）及其变体 | 基因表达计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 148 | 2026-03-02 |
HIV-1 activates oxidative phosphorylation in infected CD4 T cells in a human tonsil explant model
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1172938
PMID:37325659
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研究论文 | 本研究利用人扁桃体离体模型，通过单细胞RNA测序分析了HIV-1感染对不同细胞类型转录组的影响，发现感染CD4+ T细胞中氧化磷酸化基因上调，而暴露于病毒的巨噬细胞中NLRP3炎症小体通路基因表达增加 | 首次在人类扁桃体离体模型中，利用单细胞RNA测序技术揭示了HIV-1感染诱导的CD4+ T细胞中氧化磷酸化基因上调及巨噬细胞中NLRP3炎症小体通路激活的转录组变化 | 研究基于离体模型，可能无法完全模拟体内复杂环境；样本来源有限，仅使用健康捐赠者的扁桃体组织 | 探究HIV-1感染在淋巴组织不同细胞类型中诱导的转录组变化及其在慢性炎症机制中的作用 | 人类扁桃体离体组织中的CD4+ T细胞和巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自健康捐赠者的人扁桃体离体组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 149 | 2026-02-20 |
Perivascular cells induce microglial phagocytic states and synaptic engulfment via SPP1 in mouse models of Alzheimer's disease
2023-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01257-z
PMID:36747024
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研究论文 | 本研究揭示了在阿尔茨海默病小鼠模型中，血管周围细胞通过分泌SPP1诱导小胶质细胞的吞噬状态并促进突触吞噬的机制 | 首次发现血管周围细胞分泌的SPP1是驱动小胶质细胞异常吞噬突触的关键信号分子，并阐明了其在AD病理中的作用机制 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类AD患者中得到验证 | 探究阿尔茨海默病中驱动小胶质细胞异常吞噬突触的分子信号 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的血管周围细胞、小胶质细胞和突触 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、细胞间相互作用分析 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 150 | 2026-02-15 |
Tuning hyperparameters of doublet-detection methods for single-cell RNA sequencing data
2023-Sep, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.15302/J-QB-022-0324
PMID:41675246
|
研究论文 | 本研究探索了单细胞RNA测序数据中双联体检测方法scDblFinder的最优超参数设置 | 采用全因子设计、响应面模型和16个真实scRNA-seq数据集来优化双联体检测方法的超参数，提升了检测性能 | 研究仅针对scDblFinder方法，且基于有限的数据集，可能不适用于所有生物条件 | 优化单细胞RNA测序数据分析中双联体检测方法的超参数设置 | 单细胞RNA测序数据中的双联体检测方法scDblFinder | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 响应面模型 | 单细胞RNA测序数据 | 16个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 151 | 2026-02-15 |
A cell marker-based clustering strategy (cmCluster) for precise cell type identification of scRNA-seq data
2023-Jun, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.15302/J-QB-022-0311
PMID:41675663
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研究论文 | 本文提出了一种基于细胞标记的聚类策略（cmCluster），用于单细胞RNA测序数据的精确细胞类型识别 | cmCluster结合遗传算法和网格搜索优化Louvain聚类方法，平衡聚类准确性和生物学解释，即使在细胞类型信息不完整或多数据源情况下也能有效识别细胞群体 | 未明确说明策略在大型数据集上的计算效率或与其他先进方法的全面比较 | 开发一种精确且高效的单细胞转录组数据分析策略，以改善细胞聚类和注释的准确性 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Louvain聚类方法、遗传算法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 152 | 2026-02-14 |
Integrated multi-omics single cell atlas of the human retina
2023-Nov-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3471275/v1
PMID:38014002
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研究论文 | 本文构建了一个综合多模态的人类视网膜细胞图谱，整合了转录组和染色质可及性数据 | 首次整合了大规模多模态单细胞数据，揭示了超过110种细胞类型，并精细映射了GWAS和eQTL变异 | NA | 创建全面的人类视网膜细胞图谱以促进对视网膜功能和病理的理解 | 人类视网膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组和染色质可及性数据 | 约240万个细胞，来自55名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 153 | 2026-02-13 |
Deep learning in spatial transcriptomics: Learning from the next next-generation sequencing
2023-Mar, Biophysics reviews
IF:2.9Q2
DOI:10.1063/5.0091135
PMID:38505815
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综述 | 本文综述了空间转录组学中深度学习模型的应用，探讨了现有工具、挑战及未来方向 | 深入探讨深度学习在空间转录组学数据分析中的新兴应用，包括对齐、空间重建和空间聚类等前沿模型 | 深度学习模型在空间转录组学分析中仍处于早期阶段，应用范围有限且未充分探索 | 综述空间转录组学数据分析的现有工具，特别关注深度学习方法的进展与潜力 | 空间转录组学数据，包括基因表达谱和组织结构信息 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习 | 多模态数据（包括组织学图像、计数矩阵等） | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 154 | 2026-02-11 |
Olfactomedin-4 + neutrophils exacerbate intestinal epithelial damage and worsen host survival after Clostridioides difficile infection
2023-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.21.553751
PMID:37662327
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研究论文 | 本研究揭示了中性粒细胞在艰难梭菌感染（CDI）中加剧肠道上皮细胞损伤的作用，并首次通过单细胞转录组学图谱识别了OLFM4+中性粒细胞的致病角色 | 首次建立了CDI后骨髓、血液和结肠中性粒细胞的转录组学图谱，并发现OLFM4作为关键标志物与感染严重程度相关 | 研究主要基于动物模型和体外实验，人类样本验证有限，且OLFM4的具体作用机制尚未完全阐明 | 探究中性粒细胞在CDI中的功能角色及其对肠道上皮损伤的影响 | 中性粒细胞（特别是OLFM4+亚型）、肠道上皮细胞、CDI感染的小鼠模型和人类样本 | 数字病理学 | 肠道感染 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据、蛋白质表达数据 | 包括小鼠模型和人类样本，具体数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 155 | 2026-02-10 |
Marine Invertebrates One Cell at A Time: Insights from Single-Cell Analysis
2023-12-12, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icad034
PMID:37188638
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在海洋无脊椎动物研究中的应用、关键发现及未来挑战 | 首次系统性地综合了海洋无脊椎动物单细胞RNA测序研究的文献，提供了关于细胞类型组成、动态过程响应及细胞类型进化等方面的关键见解，并讨论了跨实验和跨物种数据比较的挑战 | 本文为综述性文章，不涉及原始数据分析，主要基于现有文献进行综合评述，未提出新的实验方法或模型 | 综述海洋无脊椎动物单细胞RNA测序研究的现状、关键发现、挑战及未来方向 | 海洋无脊椎动物 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 156 | 2026-02-10 |
The developmental hierarchy and scarcity of replicative slender trypanosomes in blood challenges their role in infection maintenance
2023-10-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2306848120
PMID:37824530
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研究论文 | 本文通过实验证明，在小鼠急性和慢性感染中，布氏锥虫的发育性细胞周期停滞是不可逆的，并揭示了细胞周期停滞和可逆性粗短样转录组出现的时间层次，同时发现感染建立后血液中增殖寄生虫异常稀少 | 首次实验证实布氏锥虫发育性细胞周期停滞在血液中不可逆，揭示细胞周期停滞与转录组变化的时间层次，并挑战了血液中增殖寄生虫在维持感染中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类或其他哺乳动物宿主中的情况；单细胞转录组分析可能受技术限制影响 | 探究布氏锥虫在哺乳动物宿主中的发育动态、细胞周期停滞的不可逆性及其在感染维持中的作用 | 布氏锥虫（Trypanosoma brucei）在血液中的不同形态阶段（细长型和粗短型） | 寄生虫学 | 锥虫病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠感染模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 157 | 2026-02-10 |
Profiling the bloodstream form and procyclic form Trypanosoma brucei cell cycle using single-cell transcriptomics
2023-05-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86325
PMID:37166108
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，对布氏锥虫的血液期和原循环期细胞周期进行了高分辨率转录组分析 | 首次在无需细胞分选或同步化的情况下，通过单细胞转录组学获得了两种生命形式的高分辨率细胞周期调控转录组；开发了适用于冷冻保存样本的高效冻融方案 | 研究主要基于转录组层面，蛋白质功能验证和调控机制研究有待深入 | 解析布氏锥虫不同生命阶段的细胞周期调控机制 | 布氏锥虫的血液期和原循环期细胞 | 单细胞组学 | 寄生虫感染（锥虫病） | 单细胞转录组学 | 周期性伪时间推断计算模型 | 单细胞转录组数据 | 未同步化的细胞群体（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 158 | 2026-02-06 |
Integrative multiomics analysis of neointima proliferation in human saphenous vein: implications for bypass graft disease
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.14.567053
PMID:38014255
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研究论文 | 本研究通过多组学分析，探讨了人类隐静脉在冠状动脉搭桥手术中因新内膜增生导致的移植失败机制 | 首次在人类隐静脉体外组织培养模型中整合RNA测序、蛋白质组学和空间转录组学，揭示了新内膜增生过程中的基因和蛋白质动态变化，并识别了新的细胞亚群 | 研究基于体外组织培养模型，可能无法完全模拟体内生理环境；样本量相对有限（73例患者），且未涉及长期临床随访数据 | 探究人类隐静脉新内膜增生的分子和细胞机制，以改善冠状动脉搭桥手术的移植成功率 | 人类隐静脉组织样本，取自冠状动脉搭桥手术患者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序, 蛋白质组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据, 空间转录组数据 | 73例患者的人类隐静脉组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 159 | 2026-02-05 |
Spatially distinct molecular patterns of gene expression in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-Nov-17, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-023-02572-6
PMID:37978501
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，揭示了特发性肺纤维化（IPF）肺部不同病理区域（如正常外观肺实质、过渡区和致密纤维化区）在基因表达上的空间特异性分子模式 | 首次在IPF中应用空间转录组学平台（GeoMx Nanostring Digital Spatial Profiling）对FFPE组织进行高分辨率空间分析，比较了不同病理区域的转录组差异，并发现了组织学正常外观区域已存在显著的转录组改变 | 研究样本量相对有限（32例IPF和12例对照），且为横断面研究，无法确定观察到的转录组变化与疾病进展的因果关系 | 阐明IPF肺部不同病理区域之间的转录组差异，以理解纤维化肺病的分布和程度，并识别潜在的治疗靶点 | 特发性肺纤维化（IPF）患者和对照者的福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）肺组织样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 32例IPF患者和12例对照者，共鉴定出231个感兴趣区域（ROIs） | Nanostring | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiling | GeoMx Nanostring Digital Spatial Profiling平台，用于FFPE组织的空间转录组分析 |
| 160 | 2026-02-05 |
Transfer learning in a biomaterial fibrosis model identifies in vivo senescence heterogeneity and contributions to vascularization and matrix production across species and diverse pathologies
2023-08, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-00785-7
PMID:37079217
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研究论文 | 本研究通过生物材料纤维化模型开发了体内衰老特征，并利用迁移学习识别了跨物种和多种病理中的衰老细胞异质性及其在血管化和基质生产中的作用 | 开发了体内来源的衰老特征（SenSig），并应用迁移学习在多种病理的单细胞RNA测序数据中识别衰老细胞，揭示了IL34-CSF1R-TGFβR信号轴介导的衰老细胞与髓系细胞间的串扰 | NA | 识别体内衰老细胞的表型异质性及其在组织修复和病理过程中的作用 | 小鼠和人类单细胞RNA测序数据集，涵盖多种病理状态 | 数字病理学 | 组织纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 迁移学习 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |