单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 1561 - 1580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1561 | 2024-08-07 |
Exploration of a screening model for intrahepatic cholangiocarcinoma patients prone to cuproptosis and mechanisms of the susceptibility of CD274-knockdown intrahepatic cholangiocarcinoma cells to cuproptosis
2023-12, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-023-00673-4
PMID:37828105
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研究论文 | 本研究旨在探索易发生铜死亡的肝内胆管癌患者的筛查模型及CD274敲低肝内胆管癌细胞对铜死亡的易感性机制 | 首次系统全面地探索了肝内胆管癌中的铜死亡现象，构建了针对易发生铜死亡的肝内胆管癌患者的精确诊断和治疗策略 | 需要在大规模前瞻性队列中进一步验证这些结论 | 识别易发生铜死亡的肝内胆管癌患者的新诊断和治疗策略，并探索相关的细胞内和细胞外机制 | 肝内胆管癌患者及细胞 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单样本基因集富集分析、机器学习算法 | nomogram模型 | 转录组数据 | 训练数据集255例，验证数据集包括65例、104例、78例和14例 |
| 1562 | 2024-08-07 |
Blockage of EGFR/AKT and mevalonate pathways synergize the antitumor effect of temozolomide by reprogramming energy metabolism in glioblastoma
2023-12, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12502
PMID:37920878
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研究论文 | 本研究探讨了表皮生长因子受体（EGFR）途径在脂肪酸代谢重编程和能量生成中的功能角色，并通过临床GBM样本的单细胞RNA测序和非靶向代谢组学分析，验证了代谢相关RTK-脂肪酸-基因特征。 | 本研究揭示了EGFR激活的GBM中代谢重编程的机制，并提供了一种组合治疗策略用于临床GBM管理。 | NA | 研究EGFR途径在GBM中的代谢重编程和能量生成的作用。 | 临床GBM样本，包括单细胞RNA测序和代谢组学分析。 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序，非靶向代谢组学分析 | NA | RNA序列，代谢数据 | 临床GBM样本 |
| 1563 | 2024-08-07 |
Early clonal extinction in glioblastoma progression revealed by genetic barcoding
2023-08-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.07.001
PMID:37541243
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研究论文 | 本文通过在鼠脑中转移PDGFB和遗传条形码来启动胶质瘤发生，并直接追踪胶质母细胞瘤从最早可能阶段的演化，揭示了胶质母细胞瘤早期克隆消亡的现象。 | 本文首次观察到胶质母细胞瘤早期阶段的高频率克隆消亡事件和克隆大小的渐进性分歧，并通过计算模型和转录组分析揭示了这些动态变化的原因。 | NA | 研究胶质母细胞瘤在其早期阶段的进展和演化机制。 | 胶质母细胞瘤的早期克隆消亡和演化。 | NA | 脑肿瘤 | 遗传条形码 | 计算模型 | 转录组 | 鼠脑中的胶质瘤样本 |
| 1564 | 2024-08-07 |
Age-associated B cells predict impaired humoral immunity after COVID-19 vaccination in patients receiving immune checkpoint blockade
2023-06-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38810-0
PMID:37369658
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研究论文 | 研究探讨了年龄相关B细胞（ABC）在不同条件下的一致性及其对COVID-19疫苗反应的长期影响 | 通过单细胞RNA测序发现，不同病因的ABC具有共同的转录特征，并可根据免疫基因表达进行分类 | NA | 研究ABC在不同条件下的相似性及其对COVID-19疫苗反应的影响 | 年龄相关B细胞（ABC）及其在免疫检查点阻断治疗患者中的作用 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1565 | 2024-08-04 |
Spatial determination and prognostic impact of the fibroblast transcriptome in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-06-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86125
PMID:37350578
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研究论文 | 本研究结合空间转录组学和单细胞RNA测序，定义了胰腺导管腺癌中与肿瘤相关的成纤维细胞的转录组。 | 展示了与肿瘤相近和远端成纤维细胞的转录异质性，以及其与临床结果的关联 | NA | 阐明肿瘤微环境中成纤维细胞的转录组和其与临床结果的关系 | 胰腺导管腺癌中的与肿瘤相关的成纤维细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学和单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 1566 | 2024-08-07 |
Stricturing Crohn's disease single-cell RNA sequencing reveals fibroblast heterogeneity and intercellular interactions
2023-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.534781
PMID:37066202
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，首次揭示了克罗恩病狭窄部位的纤维母细胞异质性及其细胞间相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术构建了克罗恩病狭窄肠道的全面图谱，并验证了CDH11作为潜在治疗靶点 | NA | 旨在通过系统层面的研究揭示克罗恩病狭窄形成的病理机制，并发现新的治疗靶点 | 克罗恩病患者的全层肠组织，包括未受累、非狭窄炎症和狭窄段以及正常非克罗恩病肠段 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 99个组织样本和409,001个细胞 |
| 1567 | 2024-08-04 |
Transcriptomic analyses reveal neuronal specificity of Leigh syndrome associated genes
2023-03, Journal of inherited metabolic disease
IF:4.2Q2
DOI:10.1002/jimd.12578
PMID:36502462
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研究论文 | 本研究揭示了与Leigh综合征相关基因在神经元中的特异性表达 | 本研究首次通过转录组分析探讨了Leigh综合征相关基因在大脑不同细胞类型中的特异性和潜在的临床重叠性 | 当前仅针对已有的基因进行了分析，未探索新的可能的病因 | 目标是确定与Leigh综合征相关基因在大脑的细胞特异性及其与其他疾病的潜在相似性 | 与Leigh综合征相关的所有基因及其在大脑中的表达模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基于现有的英国大脑表达联盟数据进行的分析 |
| 1568 | 2024-08-04 |
An in vitro approach to understand contribution of kidney cells to human urinary extracellular vesicles
2023-02, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12304
PMID:36785873
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研究论文 | 本文探索了不同人类肾细胞对尿液外泌体成分的贡献 | 提出了一种体外模型，揭示了酗酒细胞类型特异的外泌体货物，可以作为肾脏疾病的生物标记物 | 未对尿液中所有细胞类型的外泌体成分进行详尽分析 | 旨在理解不同肾细胞分泌的外泌体成分及其在正常尿液中的表现 | 不同类型的人类肾细胞（足细胞、肾小管细胞、肾小球内皮细胞和系膜细胞） | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA测序、质谱分析、纳米颗粒跟踪分析等 | NA | 生物体液（尿液）、细胞培养的外泌体 | 从不同类型的条件性永生化人类肾细胞中提取的外泌体 |
| 1569 | 2024-08-07 |
Nuclear factor I-C overexpression promotes monocytic development and cell survival in acute myeloid leukemia
2023-02, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-022-01801-z
PMID:36572750
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研究论文 | 本文研究了核因子I-C（NFIC）在急性髓系白血病中的过表达及其对单核细胞发育和细胞存活的影响 | 首次展示了NFIC蛋白在急性髓系白血病患者中的显著过表达，并证明了其在单核细胞分化和细胞存活中的促进作用 | NA | 探讨NFIC在急性髓系白血病中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 急性髓系白血病患者的NFIC蛋白表达及其功能影响 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 69%的急性髓系白血病患者样本，以及AML细胞系和AML患者 blasts |
| 1570 | 2024-08-07 |
The immune-metabolic crosstalk between CD3+C1q+TAM and CD8+T cells associated with relapse-free survival in HCC
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1033497
PMID:36845133
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了肝细胞癌（HCC）中免疫细胞间的免疫代谢交叉对话，特别是CD3+C1q+肿瘤相关巨噬细胞（TAM）与CD8+ CCL4+T细胞之间的相互作用。 | 本研究首次鉴定了CD3+C1q+TAM这一新群体，并揭示了其通过C1q信号通路诱导的代谢和表观遗传重编程影响T细胞免疫，进而可能影响肿瘤预后。 | NA | 揭示肝细胞癌中免疫细胞间的免疫代谢交叉对话，并提供调控免疫抑制性肿瘤微环境的策略。 | 肝细胞癌（HCC）中的免疫细胞及其相互作用。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织 | 配对的肿瘤和肿瘤周围组织 |
| 1571 | 2024-08-05 |
Antigen-presenting autoreactive B cells activate regulatory T cells and suppress autoimmune arthritis in mice
2023-11-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230101
PMID:37695523
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研究论文 | 本研究探讨了自反应性B细胞如何激活调节性T细胞并抑制小鼠中的自身免疫性关节炎 | 揭示了自反应性B细胞通过诱导调节性T细胞扩展的新机制，并区分了它们与IL10分泌B细胞的不同 | 可能未探讨其他类型B细胞在自身免疫中角色的全面影响 | 研究自反应性B细胞在自身免疫性疾病中的作用 | 研究自反应性B细胞及其对T细胞的影响 | 免疫学 | 自身免疫性关节炎 | 单细胞测序 | NA | 生物样本 | 使用了小鼠作为样本 |
| 1572 | 2024-08-07 |
Characterization of the Limbal Epithelial Stem Cell Niche
2023-10-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.64.13.48
PMID:37906057
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研究论文 | 本文研究了角膜缘上皮干细胞微环境的主要成分，特别是透明质酸（HA）及其复合物在维持干细胞状态中的作用 | 首次详细描述了透明质酸/重链复合物在角膜缘上皮干细胞微环境中的存在及其表达情况 | 研究主要基于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 鉴定角膜缘上皮干细胞微环境的关键成分，特别是透明质酸特异性微环境的组成部分 | 角膜和角膜缘边缘的mRNA提取物 | NA | NA | 单细胞RNA测序、实时PCR、Western blotting、免疫组织化学 | NA | mRNA | 小鼠和人类的角膜样本 |
| 1573 | 2024-08-05 |
Cancer cell plasticity and MHC-II-mediated immune tolerance promote breast cancer metastasis to lymph nodes
2023-09-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221847
PMID:37341991
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤引流淋巴结中的癌细胞可塑性和MHC-II介导的免疫耐受如何促进乳腺癌转移。 | 通过跨物种单细胞RNA测序分析识别了乳腺癌进展和淋巴结转移过程中的癌细胞异质性、可塑性和免疫逃逸特征。 | 本研究未明确提到其局限性 | 研究肿瘤引流淋巴结中癌细胞特征与免疫逃逸和转移的关系。 | 乳腺癌细胞及其在淋巴结中的行为。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 包括小鼠和人类的癌细胞样本 |
| 1574 | 2024-08-07 |
CD4 T cells and toxicity from immune checkpoint blockade
2023-09, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13248
PMID:37491734
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研究论文 | 本文通过多种单细胞和批量测序技术，研究了免疫检查点抑制剂治疗后严重免疫相关不良事件（irAEs）的预处理决定因素。 | 首次发现循环中升高的激活CD4效应记忆T细胞丰度和TCR多样性与严重irAEs的发展相关。 | 研究样本量相对较小，且仅限于晚期黑色素瘤患者。 | 深入理解导致严重irAEs发展的因素，以改善irAEs的预测和预防。 | 晚期黑色素瘤患者在接受免疫检查点抑制剂治疗后的免疫相关不良事件。 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序，单细胞V(D)J测序，批量RNA测序，批量T细胞受体（TCR）测序 | NA | 细胞数据 | 71名晚期黑色素瘤患者 |
| 1575 | 2024-08-05 |
Immune dysfunction revealed by digital spatial profiling of immuno-oncology markers in progressive stages of renal cell carcinoma and in brain metastases
2023-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007240
PMID:37586773
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研究论文 | 本研究揭示了肾细胞癌进展阶段和脑转移中的免疫功能障碍 | 利用数字空间分析技术，首次对肾细胞癌不同进展阶段及脑转移进行详尽的免疫肿瘤标志物分析 | 样本量虽然相对较大，但仍可能存在选择偏差，并且结果需要进一步验证 | 探索肾细胞癌及其脑转移的肿瘤微环境对免疫反应的影响 | 76个原发肿瘤、27个相邻的正常肾样本和86个转移样本，包括24个脑转移样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 数字空间分析 | NA | 组织样本 | 76个原发肿瘤，27个正常肾样本，86个转移样本，包括24个脑转移样本 |
| 1576 | 2024-08-07 |
Assessment of Treatment-Relevant Immune Biomarkers in Psoriasis and Atopic Dermatitis: Toward Personalized Medicine in Dermatology
2023-08, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.04.005
PMID:37341663
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综述 | 本文综述了用于测量炎症性皮肤病中与治疗相关的免疫生物标志物的转化免疫学方法 | 介绍了胶带剥离分析、微针基生物标志物贴片、表皮刮除术的分子分析、RNA原位杂交组织染色和单细胞RNA测序等新技术 | 目前没有批准或广泛使用的皮肤科个性化治疗方法 | 探讨个性化医学在炎症性皮肤病中的应用前景 | 牛皮癣和特应性皮炎中的治疗相关免疫生物标志物 | NA | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1577 | 2024-08-07 |
Gene knockout inference with variational graph autoencoder learning single-cell gene regulatory networks
2023-07-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad450
PMID:37246643
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Gene Knockout Inference (GenKI)的虚拟敲除工具，用于在没有敲除样本的情况下，利用单细胞RNA测序数据预测基因功能 | GenKI通过变分图自编码器模型，在没有真实敲除样本信息的情况下，以无监督方式捕捉基因敲除扰动引起的基因调控模式变化 | NA | 开发一种新的工具，用于在没有敲除样本的情况下，利用单细胞RNA测序数据预测基因功能 | 基因敲除对基因调控模式的影响 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 变分图自编码器 (VGAE) | 基因调控网络 | 使用公开可用的单细胞RNA测序数据集 |
| 1578 | 2024-08-07 |
VISTA (PD-1H) Is a Crucial Immune Regulator to Limit Pulmonary Fibrosis
2023-Jul, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0219OC
PMID:36450109
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研究论文 | 研究探讨了VISTA（PD-1H）在限制特发性肺纤维化（IPF）中的作用及其治疗潜力 | 首次明确了VISTA在IPF中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 需要进一步研究以验证VISTA作为IPF治疗的新型靶点 | 确定VISTA在IPF中的作用及其治疗潜力 | VISTA在IPF中的表达及其对肺纤维化的影响 | NA | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 包括VISTA缺陷小鼠和野生型同窝小鼠的实验模型 |
| 1579 | 2024-08-05 |
Immune-interacting lymphatic endothelial subtype at capillary terminals drives lymphatic malformation
2023-04-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20220741
PMID:36688917
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研究论文 | 本研究揭示了一种新的免疫相互作用淋巴内皮亚型，该亚型在毛细血管末端促进淋巴管畸形 | 发现了一种新的Ptx3阳性皮肤淋巴毛细血管内皮细胞亚型，其能够招募促淋巴管生成的巨噬细胞 | 尚需进一步研究以深入理解该内皮细胞亚型的作用机制和临床应用 | 研究PIK3CA突变驱动的淋巴管畸形的致病机制 | 小鼠模型中的Pik3caH1047R驱动的血管畸形 | 数字病理学 | 淋巴管畸形 | 单细胞转录组学 | NA | 生物样本 | 使用了小鼠模型，具体样本数量未提及 |
| 1580 | 2024-08-07 |
scDEED: a statistical method for detecting dubious 2D single-cell embeddings and optimizing t-SNE and UMAP hyperparameters
2023-Sep-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.21.537839
PMID:37163087
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scDEED的统计方法，用于检测可疑的二维单细胞嵌入并优化t-SNE和UMAP的超参数 | 开发了scDEED方法，通过计算每个细胞嵌入的可靠性分数，识别低可靠性的可疑嵌入和高可靠性的可信嵌入，并提供优化嵌入方法超参数的直观指导 | NA | 开发一种统计方法以检测可疑的二维单细胞嵌入并优化相关方法的超参数 | 二维单细胞嵌入方法及其超参数优化 | 计算机视觉 | NA | t-SNE, UMAP | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个scRNA-seq数据集 |