单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5351 篇文献，本页显示第 1561 - 1580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1561 | 2024-08-04 |
A spatially resolved atlas of the human lung characterizes a gland-associated immune niche
2023-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01243-4
PMID:36543915
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研究论文 | 本研究通过多组学单细胞和空间转录组学深入分析了健康人类肺部的组织结构和免疫微环境 | 本文发现了新的与腺体相关的免疫细胞栖息地，并对其在呼吸健康中的重要性进行了验证 | 研究主要集中于健康人类肺部，可能不适用于肺病患者的分析 | 重新定义人类肺部和气道的组织结构 | 健康人类肺部的不同位置的单细胞类型及其空间背景 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA | 五个健康人类肺部近远区域的位置 |
| 1562 | 2024-08-04 |
Single-cell and bulk RNA sequencing analysis of B cell marker genes in TNBC TME landscape and immunotherapy
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1245514
PMID:38111587
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研究论文 | 本研究旨在通过分析三阴性乳腺癌（TNBC）患者的B细胞标记基因来调查其预后特征 | 建立了基于B细胞标记基因的肿瘤微环境预测模型，以预测TNBC患者的预后和免疫治疗反应 | 鉴于样本量仅限于四个TNBC患者，可能限制了结果的普遍适用性 | 探索三阴性乳腺癌患者的预后特征 | 四名TNBC患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | RNA测序 | NA | 细胞和基因表达数据 | 参与研究的样本量为四名TNBC患者的22,106个细胞和20,556个基因 |
| 1563 | 2024-08-04 |
A New Understanding, Guided by Single-Cell Sequencing, of the Establishment and Maintenance of the Ovarian Reserve in Mammals
2023, Sexual development : genetics, molecular biology, evolution, endocrinology, embryology, and pathology of sex determination and differentiation
IF:2.4Q2
DOI:10.1159/000526426
PMID:36122567
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review | 本综述详细介绍了卵巢储备的建立和维持的关键阶段 | 本文突出了几个重大的单细胞测序研究，这些研究显著推动了我们对卵巢储备新分子调节因子的知识 | NA | 探索与卵巢储备建立和维持相关的细胞和分子动态 | 卵巢中的原始卵泡及其相关阶段 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 1564 | 2024-08-07 |
Loss of CFTR function in macrophages alters the cell transcriptional program and delays lung resolution of inflammation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1242381
PMID:38035088
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研究论文 | 本文研究了囊性纤维化（CF）中CFTR基因功能丧失对巨噬细胞的影响及其对肺部炎症消退的延迟作用 | 首次报道了CFTR功能丧失在巨噬细胞中引起的细胞转录程序改变，以及这种改变对肺部炎症消退的影响 | NA | 探讨CFTR功能丧失与中性粒细胞性炎症之间的关系 | CFTR基因功能丧失对巨噬细胞和肺部炎症的影响 | NA | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 1565 | 2024-08-04 |
Unravelling spatial gene associations with SEAGAL: a Python package for spatial transcriptomics data analysis and visualization
2023-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad431
PMID:37436699
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研究论文 | 本文介绍了一个名为SEAGAL的Python包，用于分析和可视化空间转录组数据。 | SEAGAL包能够在单基因和基因集水平上检测和可视化空间基因相关性，突破了传统共表达分析的局限。 | 尚未提及具体局限性。 | 旨在通过空间转录组分析揭示基因的空间相关性。 | 对空间转录组数据集中的基因表达和空间坐标进行分析。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1566 | 2024-08-04 |
Single-cell profiling identifies ACE+ granuloma macrophages as a nonpermissive niche for intracellular bacteria during persistent Salmonella infection
2023-01-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add4333
PMID:36608122
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研究论文 | 本研究揭示了ACE+ granuloma巨噬细胞在持久性沙门氏菌感染中作为非允许性细胞生态位的作用 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了ACE巨噬细胞的功能多样性及其在细菌持久感染中的角色 | 研究仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类感染中的机制 | 探讨巨噬细胞在沙门氏菌持久感染中的功能及其异质性 | 沙门氏菌感染的小鼠模型中的巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 1567 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals peripheral immune responses in non-segmental vitiligo
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1221260
PMID:38077333
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研究论文 | 这项研究使用单细胞RNA测序揭示了非分段性白癜风患者的外周免疫反应 | 首次系统性研究了非分段性白癜风患者外周血液中循环免疫细胞的类型和功能 | 样本量较小，仅包括五个白癜风患者和三个健康对照组 | 研究白癜风患者外周免疫反应的机制 | 五个进展性非分段性白癜风患者和三个健康对照者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 白癜风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 五个白癜风患者，三个健康对照 |
| 1568 | 2024-08-07 |
A novel signature predicts prognosis and immunotherapy in lung adenocarcinoma based on cancer-associated fibroblasts
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1201573
PMID:37325647
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研究论文 | 本研究旨在探讨肺腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的特征，并开发一种风险标志物以预测肺腺癌患者的预后 | 本研究开发了一种新的风险标志物，结合临床病理特征的诺模图，用于预测肺腺癌的预后和免疫治疗反应 | 研究结果需要在体内实验中进一步验证 | 研究肺腺癌中CAFs的特征，并开发一种风险标志物以预测患者的预后 | 肺腺癌中的癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | Lasso回归 | RNA测序数据 | 1731个差异表达基因（DEGs）中的492个基因用于构建风险标志物 |
| 1569 | 2024-08-07 |
Identification of the immune-associated characteristics and predictive biomarkers of keratoconus based on single-cell RNA-sequencing and bulk RNA-sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1220646
PMID:37965330
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，探讨了圆锥角膜（KC）的免疫相关特征及其预测性生物标志物。 | 首次综合利用scRNA-seq和bulk RNA-seq技术，结合机器学习算法，识别出与KC进展相关的关键免疫细胞簇和预测性基因标志物。 | 研究依赖于现有的数据库和公开的测序数据，可能存在样本选择偏倚；机器学习模型的泛化能力需进一步验证。 | 旨在探讨圆锥角膜是否为炎症性疾病，并识别其免疫相关特征和预测性生物标志物。 | 圆锥角膜的免疫细胞簇和相关基因表达模式。 | 数字病理学 | 圆锥角膜 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | 随机森林（RF），支持向量机（SVM），最小绝对收缩和选择算子（LASSO）回归分析 | RNA序列数据 | 涉及多个细胞簇和1362个差异表达基因（DEGs） |
| 1570 | 2024-08-07 |
Differential in vivo labeling with barcoded antibodies allows for simultaneous transcriptomic profiling of airway, lung tissue and intravascular immune cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1227175
PMID:38094305
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研究论文 | 本文介绍了一种基于条形码抗体差异标记的方法，用于同时分析气道、肺组织和血管内免疫细胞的转录组特征 | 该方法不仅提供了基本的空间信息，还允许直接比较不同解剖部位的细胞，并且比传统的单细胞RNA测序方法更节省时间和成本 | NA | 开发一种新的方法来同时分析气道、肺组织和血管内免疫细胞的转录组特征 | 气道、肺组织和血管内免疫细胞的转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 在小鼠细菌性肺感染的临床前模型中进行了可行性验证 |
| 1571 | 2024-08-05 |
Central role of lung macrophages in SARS-CoV-2 physiopathology: a cross-model single-cell RNA-seq perspective
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1197588
PMID:37350967
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研究论文 | 本研究探讨了肺巨噬细胞在SARS-CoV-2生理病理学中的核心作用 | 通过跨物种单细胞RNA测序分析揭示了细胞因子产生的巨噬细胞与肺泡细胞在病毒转录本中的主要贡献 | 尚未深入理解细胞因子生产的触发和解决机制，以及其与感染细胞之间的关系 | 研究SARS-CoV-2感染中肺巨噬细胞的作用及其与COVID-19严重性之间的关系 | 主要研究Syrian hamsters和African green monkeys中的巨噬细胞和肺泡细胞 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | Syrian hamsters和African green monkeys的样本 |
| 1572 | 2024-08-07 |
A novel DNA damage repair-related gene signature predicting survival, immune infiltration and drug sensitivity in cervical cancer based on single cell sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1198391
PMID:37449209
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序数据，开发了一种与DNA损伤修复（DDR）相关的基因签名，用于预测宫颈癌（CC）的生存、免疫浸润和药物敏感性。 | 构建了一种新的DDR相关基因签名，该签名在预测宫颈癌预后方面表现优于其他临床特征。 | 需要进一步的实验验证ITGB1在宫颈癌细胞DDR能力中的作用机制。 | 开发一种DDR相关基因签名，用于评估宫颈癌的预后。 | 宫颈癌及其相关的DNA损伤修复机制。 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 使用了来自GSE168652和TCGA-CESC队列的数据，具体样本数量未在摘要中明确。 |
| 1573 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the lineage of malignant epithelial cells and upregulation of TAGLN2 promotes peritoneal metastasis in gastric cancer
2023-Dec, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-023-03194-6
PMID:37247132
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胃腺癌样本，揭示了恶性上皮细胞的分化轨迹及TAGLN2在胃癌腹膜转移中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了从正常黏膜到肿瘤组织再到腹膜转移的发展曲线，并验证了TAGLN2在胃癌腹膜转移中的关键作用 | 研究样本数量较少，仅基于单一患者的数据 | 探索胃癌腹膜转移的分子机制并寻找潜在的治疗靶点 | 胃腺癌样本，包括原发肿瘤、邻近非肿瘤组织、腹膜转移样本及正常腹膜样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 四个胃腺癌样本 |
| 1574 | 2024-08-05 |
Constructing a full, multiple-layer interactome for SARS-CoV-2 in the context of lung disease: Linking the virus with human genes and microbes
2023-Jul, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011222
PMID:37410793
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研究论文 | 该研究构建了SARS-CoV-2在肺病背景下的完整多层互动组，连接病毒与人类基因和微生物 | 创新性地使用MLCrosstalk模型整合多个来源的数据，以构建SARS-CoV-2感染的全互动组 | 此研究的局限性在于尚未完全验证所有的基因与微生物之间的互动关系 | 研究SARS-CoV-2如何通过人类基因和微生物影响肺部疾病 | 研究对象包括SARS-CoV-2病毒、人类蛋白编码基因、微小RNA以及外源微生物 | 数字病理学 | 肺癌 | 统计建模 | MLCrosstalk | 数据整合 | 涉及多个患者样本的多种数据来源 |
| 1575 | 2024-08-05 |
Single-Cell Discovery and Multiomic Characterization of Therapeutic Targets in Multiple Myeloma
2023-04-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1769
PMID:36779841
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研究论文 | 这项研究分析了多发性骨髓瘤患者的骨髓抽吸样本，以发现治疗靶标。 | 研究发现了38个多发性骨髓瘤标记基因，其中11个尚未被认识为治疗靶点。 | 样本量有限可能影响结果的广泛适用性，但结果仍然展示了较高的一致性。 | 旨在开发一种识别肿瘤标记的新策略，以促进靶向癌症治疗的进展。 | 研究对象为41名多发性骨髓瘤患者的53个骨髓抽吸样本。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 41名多发性骨髓瘤患者的53个骨髓抽吸样本 |
| 1576 | 2024-08-05 |
Ethylnitrosourea-induced gliomas: a song in the attic?
2023, Aging pathobiology and therapeutics
DOI:10.31491/apt.2023.06.111
PMID:38487310
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研究论文 | 这篇文章探讨了乙基亚硝脲诱导的胶质瘤及其相关的分子机制。 | 强调了乙基亚硝脲诱导的胶质瘤模型在理解胶质瘤的发展和干预方法方面的重要性，尽管近年来转基因小鼠模型更为流行。 | 关于乙基亚硝脲诱导的胶质瘤的科学价值相对被低估，可能导致其研究受到限制。 | 旨在揭示胶质瘤发生的分子机制并寻找干预措施以减少胶质瘤的发生和生长。 | 研究对象为乙基亚硝脲诱导的胶质瘤动物模型及其细胞过程。 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学 | 实验鼠胶质瘤模型 | NA | NA |
| 1577 | 2024-08-07 |
18F-FDG PET Visualizes Systemic STING Agonist-Induced Lymphocyte Activation in Preclinical Models
2023-01, Journal of nuclear medicine : official publication, Society of Nuclear Medicine
IF:9.1Q1
DOI:10.2967/jnumed.122.264121
PMID:35738905
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研究论文 | 本研究探讨了系统性STING激动剂激活后免疫细胞的代谢变化是否可以通过PET成像技术可视化 | 揭示了STING信号传导与免疫代谢之间先前未知的联系，并提出F-FDG PET可能是一种广泛适用的方法，用于测量系统性STING激动剂的药效学效应 | NA | 研究系统性STING激动剂激活后免疫细胞的代谢变化及其在肿瘤治疗中的应用 | C57BL/6小鼠及携带前列腺或胰腺癌肿瘤的小鼠 | 数字病理学 | 前列腺癌 | F-FDG PET成像 | NA | 单细胞RNA测序和流式细胞术数据 | C57BL/6小鼠及携带前列腺或胰腺癌肿瘤的小鼠 |
| 1578 | 2024-08-07 |
Acute irradiation causes a long-term disturbance in the heterogeneity and gene expression profile of medullary thymic epithelial cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1186154
PMID:38022666
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研究论文 | 研究急性辐射对髓质胸腺上皮细胞异质性和基因表达谱的长期影响 | 首次展示了急性全身辐射对髓质胸腺上皮细胞异质性和基因表达的长期影响 | 研究仅限于急性辐射后的短期观察，未涉及长期恢复过程的详细分析 | 探讨急性辐射后胸腺恢复过程中髓质胸腺上皮细胞亚群的频率和特性是否恢复 | 髓质胸腺上皮细胞及其在胸腺恢复中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个髓质胸腺上皮细胞样本 |
| 1579 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals a hierarchical transcriptional regulatory network of terpenoid biosynthesis in cotton secretory glandular cells
2023-12-04, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2023.10.008
PMID:37849250
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，全面分析了棉花叶片的转录组特征，并构建了一个层级转录调控网络，揭示了细胞特异性萜类化合物合成的调控机制 | 发现了两个新的转录因子GoHSFA4a和GoNAC42，它们在棉花色素腺体形成基因下游发挥作用，并能直接调控萜类化合物合成基因的表达 | NA | 揭示植物细胞水平上萜类化合物合成的特定调控机制 | 棉花分泌腺细胞中的萜类化合物合成 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1580 | 2024-08-07 |
HLA-I Evolutionary Divergence Confers Response to PD-1 Blockade plus Chemotherapy in Untreated Advanced Non-Small Cell Lung Cancer
2023-12-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-0604
PMID:37449971
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研究论文 | 本研究探讨了HLA-I进化分歧（HED）在未经治疗的晚期非小细胞肺癌（NSCLC）患者中对PD-1阻断联合化疗的预测和预后价值 | 首次揭示了HLA-I进化分歧（HED）作为预测PD-1阻断联合化疗疗效的生物标志物 | 研究样本量有限，需要在更大规模的研究中验证HED的预测价值 | 确定PD-1阻断联合化疗在未经治疗的晚期非小细胞肺癌患者中的预测生物标志物 | 427名接受一线PD-1阻断联合化疗或单纯化疗的晚期非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 427名患者，其中11名患者的58,977个细胞用于单细胞RNA测序 |