单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 1541 - 1560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1541 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals a hierarchical transcriptional regulatory network of terpenoid biosynthesis in cotton secretory glandular cells
2023-12-04, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2023.10.008
PMID:37849250
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，全面分析了棉花叶片的转录组特征，并构建了一个层级转录调控网络，揭示了细胞特异性萜类化合物合成的调控机制 | 发现了两个新的转录因子GoHSFA4a和GoNAC42，它们在棉花色素腺体形成基因下游发挥作用，并能直接调控萜类化合物合成基因的表达 | NA | 揭示植物细胞水平上萜类化合物合成的特定调控机制 | 棉花分泌腺细胞中的萜类化合物合成 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1542 | 2024-08-07 |
HLA-I Evolutionary Divergence Confers Response to PD-1 Blockade plus Chemotherapy in Untreated Advanced Non-Small Cell Lung Cancer
2023-12-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-0604
PMID:37449971
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研究论文 | 本研究探讨了HLA-I进化分歧（HED）在未经治疗的晚期非小细胞肺癌（NSCLC）患者中对PD-1阻断联合化疗的预测和预后价值 | 首次揭示了HLA-I进化分歧（HED）作为预测PD-1阻断联合化疗疗效的生物标志物 | 研究样本量有限，需要在更大规模的研究中验证HED的预测价值 | 确定PD-1阻断联合化疗在未经治疗的晚期非小细胞肺癌患者中的预测生物标志物 | 427名接受一线PD-1阻断联合化疗或单纯化疗的晚期非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 427名患者，其中11名患者的58,977个细胞用于单细胞RNA测序 |
| 1543 | 2024-08-05 |
Tumor Niches: Perspectives for Targeted Therapies in Glioblastoma
2023-11, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2022.0187
PMID:37166370
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review | 本文讨论了胶质母细胞瘤中的五种肿瘤生态位及其相互作用 | 提出了针对胶质母细胞瘤不同肿瘤生态位的治疗策略 | 该研究主要集中在理论探讨，缺乏实验验证 | 阐明肿瘤异质性的机制，为患者开发更有效的治疗方案 | 胶质母细胞瘤及其相关的肿瘤生态位 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 1544 | 2024-08-07 |
Single cell RNA-sequencing of human precision-cut lung slices: A novel approach to study the effect of vaping and viral infection on lung health
2023-07, Innate immunity
IF:2.8Q3
DOI:10.1177/17534259231181029
PMID:37306239
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了人精确切割肺切片中电子烟和流感病毒感染对肺健康的影响 | 首次使用单细胞RNA测序技术在人精确切割肺切片模型中研究电子烟和流感病毒感染的影响 | 研究仅限于特定的电子烟提取物和流感病毒A感染，可能无法完全代表所有电子烟产品和病毒感染的影响 | 探讨电子烟和流感病毒感染对肺部抗病毒和促炎反应的影响 | 人精确切割肺切片中的结构细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 健康捐赠者的肺切片 |
| 1545 | 2024-08-07 |
Mesenchymal-epithelial transition in lymph node metastases of oral squamous cell carcinoma is accompanied by ZEB1 expression
2023-04-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04102-w
PMID:37076857
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量转录组测序，探讨了口腔鳞状细胞癌（OSCC）淋巴结转移中上皮-间质可塑性（EMP）的异质性及其对基质细胞的影响 | 首次揭示了在口腔鳞状细胞癌淋巴结转移中，间质-上皮转化（MET）过程中ZEB1的活性增加，表明ZEB1在MET中的复杂作用 | 研究样本量有限，且仅限于口腔鳞状细胞癌，可能限制了结果的普遍性 | 探讨口腔鳞状细胞癌淋巴结转移中上皮-间质可塑性的异质性及其对肿瘤微环境的影响 | 口腔鳞状细胞癌的肿瘤细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 23个口腔鳞状细胞癌病变样本，共7263个癌细胞的单细胞转录组数据 |
| 1546 | 2024-08-07 |
Single-Cell Kinetic Modeling of β-Lapachone Metabolism in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2023-Mar-17, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox12030741
PMID:36978989
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，模拟了β-拉帕醌在头颈鳞状细胞癌中的代谢过程，并分析了其在肿瘤和健康组织中的细胞反应异质性 | 首次利用单细胞RNA测序数据进行系统级模拟，揭示了β-拉帕醌治疗引起的氧化应激反应在健康和恶性细胞模型中的差异 | 研究仅基于10个HNSCC患者肿瘤的转录组数据，样本量较小 | 探究头颈鳞状细胞癌中β-拉帕醌代谢的细胞反应异质性 | 头颈鳞状细胞癌中的β-拉帕醌代谢 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10个HNSCC患者肿瘤样本 |
| 1547 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell and bulk characterization of cuproptosis key regulator PDHB and association with tumor microenvironment infiltration in clear cell renal cell carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1132661
PMID:37350959
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研究论文 | 本研究探讨了cuproptosis关键调节因子PDHB在透明细胞肾癌中的生物功能及其与肿瘤微环境浸润的关系 | 揭示了PDHB作为cuproptosis相关中心基因在ccRCC中的重要性，并探讨其在临床治疗中的潜在应用 | 研究可能未深入探讨cuproptosis与其他肿瘤类型的关系 | 旨在发现cuproptosis调节因子的生物学功能，以指导临床治疗 | 主要研究对象为透明细胞肾癌（ccRCC）患者中的PDHB基因 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序和大规模转录组数据 | NA | 基因表达数据 | 包括ccRCC组织和正常配对组织 |
| 1548 | 2024-08-04 |
Roles of immune microenvironment in the female reproductive maintenance and regulation: novel insights into the crosstalk of immune cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1109122
PMID:38223507
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研究论文 | 本文探讨了免疫微环境在女性生殖维持与调节中的作用 | 通过单细胞测序技术揭示了免疫细胞的分布图，为免疫细胞在女性生殖中的作用提供了新见解 | 本文未提及具体的实验数据与样本量 | 构建女性生殖过程中免疫微环境的全面描述 | 关注女性生殖过程中免疫细胞的动态作用 | 数字病理学 | 女性生殖健康 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 1549 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analysis identifies one subpopulation of endothelial cells that proliferates and another that undergoes the endothelial-mesenchymal transition in regenerating pig hearts
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1257669
PMID:38288246
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研究论文 | 本研究利用自编码器算法分析新生猪心脏中内皮细胞的单核RNA测序数据，识别出五种内皮细胞集群，其中VEC1集群表达增殖相关标记，而VEC3集群富集了调节细胞间连接和促进内皮间质转化的基因 | 首次在再生猪心脏中发现内皮细胞的两种不同响应机制：增殖和内皮间质转化，并揭示了这些过程在心肌再生中的潜在作用 | 研究仅限于新生猪模型，且样本量较小，需要进一步在更多种类的动物模型和更大样本量中验证 | 探讨内皮细胞在心肌再生中的作用及其分子机制 | 新生猪心脏中的内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序 | 自编码器 | RNA测序数据 | 新生猪心脏样本 |
| 1550 | 2024-08-07 |
CAR T-cell Design-dependent Remodeling of the Brain Tumor Immune Microenvironment Modulates Tumor-associated Macrophages and Anti-glioma Activity
2023-12-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0424
PMID:37971169
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研究论文 | 本研究探讨了脑肿瘤免疫微环境（TIME）和嵌合抗原受体（CAR）设计对B7-H3特异性CAR T细胞抗胶质瘤活性的影响 | 研究通过转基因表达41BBL在基于CD28的CAR T细胞中，增强了治疗效果和持久性，并揭示了CAR设计对TIME的调节作用 | 尽管在体外实验中CAR设计提高了抗胶质瘤疗效，但在体内实验中并未观察到类似改善 | 旨在理解转移性免疫细胞与脑肿瘤免疫微环境之间的复杂动态关系，以开发有效的基于T细胞的免疫疗法 | B7-H3特异性CAR T细胞及其在脑肿瘤免疫微环境中的作用 | 免疫学 | 脑肿瘤 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | CAR T细胞 | 细胞 | 使用了七种完全鼠源的B7-H3 CARs进行评估 |
| 1551 | 2024-08-04 |
Cancer-prone Phenotypes and Gene Expression Heterogeneity at Single-cell Resolution in Cigarette-smoking Lungs
2023-11-10, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0195
PMID:37910161
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研究论文 | 该文章通过单细胞RNA测序技术揭示了吸烟肺部的癌症易感性表型和基因表达异质性 | 提出了两种新的单细胞元分析方法VARIED和AGED，并建立了吸烟肺部图谱，揭示了与吸烟相关的基因表达多样性和衰老差异 | 未提及研究的样本来源和潜在的外部影响因素 | 建立吸烟肺部图谱，以探究吸烟对人类肺部细胞多样性的影响 | 104个肺部单细胞RNA测序样本和相关的临床病理信息 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 104个肺部单细胞RNA测序样本 |
| 1552 | 2024-08-07 |
Plasticity in airway smooth muscle differentiation during mouse lung development
2023-03-13, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.02.002
PMID:36868232
|
研究论文 | 研究探讨了在小鼠肺部发育过程中，平滑肌分化对气道上皮分支形态的影响 | 发现胚胎期气道平滑肌表现出可塑性，并证实合成型平滑肌层促进气道分支形态发生 | NA | 探究平滑肌分化在肺部发育中的作用及其机制 | 小鼠胚胎肺部平滑肌分化 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | Srf基因缺失的小鼠胚胎肺部样本 |
| 1553 | 2024-08-07 |
Endothelial and Leptin Receptor+ cells promote the maintenance of stem cells and hematopoiesis in early postnatal murine bone marrow
2023-03-13, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.02.003
PMID:36868235
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了出生后4天、14天和8周的小鼠骨髓基质细胞，探讨了早期新生小鼠骨髓中内皮细胞和瘦素受体阳性细胞在造血干细胞和造血维持中的作用。 | 首次详细描述了早期新生小鼠骨髓中瘦素受体阳性细胞和内皮细胞在造血干细胞和造血维持中的作用，并揭示了这些细胞表达的干细胞因子在不同造血阶段的作用。 | NA | 探究早期新生小鼠骨髓中内皮细胞和瘦素受体阳性细胞在造血干细胞和造血维持中的作用。 | 小鼠骨髓中的内皮细胞和瘦素受体阳性细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 出生后4天、14天和8周的小鼠骨髓基质细胞 |
| 1554 | 2024-08-07 |
Tumor PD-L1 engages myeloid PD-1 to suppress type I interferon to impair cytotoxic T lymphocyte recruitment
2023-03-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.02.005
PMID:36917954
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研究论文 | 研究揭示了肿瘤细胞PD-L1通过与骨髓细胞PD-1相互作用，抑制I型干扰素信号通路，从而影响细胞毒性T淋巴细胞在肺转移中的招募 | 首次报道了肿瘤细胞PD-L1通过与骨髓细胞PD-1结合，激活SHP2，抑制I型干扰素和STAT1信号通路，减少Cxcl9表达，从而影响细胞毒性T淋巴细胞在肺转移中的招募 | 研究主要在肿瘤小鼠模型中进行，尚未在人体中验证 | 探讨肿瘤细胞PD-L1在肿瘤免疫逃逸中的分子机制 | 肿瘤细胞PD-L1、骨髓细胞PD-1、细胞毒性T淋巴细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及肿瘤小鼠模型和人类癌症患者 |
| 1555 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq revealing the immune features of donor liver during liver transplantation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1096733
PMID:36845096
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研究论文 | 本研究揭示了肝移植过程中供体肝脏的免疫特征 | 使用单细胞RNA测序和TCR/BCR谱序列分析供体肝脏免疫细胞的表达和分布 | 样本数量较少，仅分析了三对供体肝脏的免疫特征 | 探讨肝移植过程中免疫细胞的变化及其与移植排斥反应的关联 | 三对供体肝脏的免疫细胞及其TCR/BCR谱 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和TCR/BCR谱序列 | NA | 转录组数据 | 三对供体肝脏样本 |
| 1556 | 2024-08-07 |
Shared immune metabolic reprogramming between COVID-19 patients in the intensive care unit and ischemic stroke: a pilot study
2023, Archives of medical science : AMS
IF:3.0Q1
DOI:10.5114/aoms/172161
PMID:38058697
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研究论文 | 本研究探讨了COVID-19和缺血性中风之间的共享基因特征 | 通过结合现有的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，更全面地理解了代谢失调的作用，并使用机器学习方法识别了潜在的诊断模型 | NA | 研究COVID-19和缺血性中风之间的共享基因特征 | COVID-19患者和缺血性中风患者 | NA | COVID-19, 缺血性中风 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习 | RNA测序数据 | 19个上调差异表达基因和24个下调基因 |
| 1557 | 2024-08-04 |
Avoiding false discoveries in single-cell RNA-seq by revisiting the first Alzheimer's disease dataset
2023-Dec-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.90214
PMID:38047913
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研究论文 | 本研究修正了首个阿尔茨海默病单细胞RNA测序的数据处理和分析问题 | 首次使用单细胞技术揭示阿尔茨海默病中细胞类型特异性差异表达基因的潜力 | 此前的数据处理和质量控制方法存在局限性 | 旨在提高阿尔茨海默病相关基因的可靠发现 | 集中于阿尔茨海默病患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 1558 | 2024-08-07 |
Charting the tumor microenvironment with spatial profiling technologies
2023-12, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2023.08.004
PMID:37673713
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综述 | 本文综述了空间分析技术在肿瘤微环境（TME）表征中的应用及其在临床上改善癌症患者诊断和预后的潜力 | 空间分析技术能够捕捉细胞在肿瘤微环境中的复杂空间背景及其密集的相互作用网络 | 传统的单细胞RNA测序（scRNA-seq）由于需要样本解离步骤，无法捕捉细胞的空间信息 | 探讨空间分析技术在肿瘤微环境表征中的应用及其在临床上的潜在价值 | 肿瘤微环境中的细胞组织和相互作用 | NA | NA | 空间分析技术 | NA | 细胞 | NA |
| 1559 | 2024-08-07 |
Integrative single-cell transcriptome analysis reveals immune suppressive landscape in the anaplastic thyroid cancer
2023-12, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-023-00663-6
PMID:37679527
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研究论文 | 本研究通过综合单细胞转录组分析，揭示了间变性甲状腺癌中的免疫抑制微环境 | 首次在单细胞水平上揭示了间变性甲状腺癌与甲状腺乳头状癌的肿瘤免疫微环境及其动态变化 | NA | 深入理解间变性甲状腺癌的肿瘤免疫微环境，以改善癌症治疗和预后 | 间变性甲状腺癌和甲状腺乳头状癌的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 间变性甲状腺癌和甲状腺乳头状癌的原发性肿瘤样本 |
| 1560 | 2024-08-07 |
Characterization of the long noncoding RNA transcriptome in human preimplantation embryo development
2023-Dec, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-023-02951-4
PMID:37770818
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研究论文 | 本研究通过scRNA-seq和SUPeR-seq数据分析了人类植入前胚胎发育过程中的长非编码RNA（lncRNA）表达谱 | 研究揭示了不同发育阶段特异性和共享的高表达lncRNA，并发现这些lncRNA及其相关的超级增强子和RNA结合蛋白在胚胎发育调控中的重要作用 | NA | 旨在深入了解发育事件的转录基础 | 人类植入前胚胎发育过程中的lncRNA | NA | 不孕症 | scRNA-seq, SUPeR-seq | NA | RNA | 涉及多个发育阶段的人类植入前胚胎样本 |