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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1541 | 2024-08-05 |
Systematic dissection of coordinated stromal remodeling identifies Sox10+ glial cells as a therapeutic target in myelofibrosis
2023-06-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.05.002
PMID:37267917
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研究论文 | 该文章系统性地分析了骨髓微环境的重塑,识别出Sox10+神经胶质细胞作为骨髓纤维化的治疗靶点 | 研究首次确定骨髓内Sox10+神经胶质细胞在骨髓纤维化中的重要作用,并提出它们作为潜在的治疗靶点 | 研究未能深入探讨小胶质细胞在纤维化过程中具体的分子机制 | 探索骨髓微环境重塑在纤维化病理中的作用 | 以小鼠模型为研究对象,分析其骶髓细胞的来源和功能 | 数字病理学 | 骨髓纤维化 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞 | 多个小鼠模型的多样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1542 | 2024-08-05 |
Transcriptional and Clonal Characterization of Cytotoxic T Cells in Crescentic Glomerulonephritis
2023-06-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000116
PMID:36913357
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研究论文 | 本研究描述了在新月体肾小管炎中细胞毒性T细胞的转录和克隆特征。 | 本文首次揭示了新月体肾小管炎中克隆扩展的细胞毒性T细胞的致病功能,确定了GzmB作为潜在的治疗靶点。 | 该研究主要集中于T细胞的功能特征,可能未全面了解其他免疫细胞在新月体肾小管炎中的作用。 | 阐明新月体肾小管炎中T细胞的浸润及其对肾损伤的影响。 | 研究对象包括ANCA相关新月体肾小管炎患者及实验性新月体肾小管炎小鼠模型中的T细胞。 | 数字病理学 | 免疫介导的肾病 | 单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序 | NA | 组织样本 | 来自ANCA相关新月体肾小管炎患者的肾活检和血液样本,以及实验性小鼠的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1543 | 2024-08-04 |
Epigenetic landscape reveals MECOM as an endothelial lineage regulator
2023-04-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38002-w
PMID:37185814
|
研究论文 | 这篇文章系统地研究了内皮细胞谱系的表观遗传图谱,并确定MECOM作为内皮细胞谱系调节因子 | 文章创新性地识别了MECOM作为内皮细胞谱系的主要调节因子,并揭示了其在细胞身份基因调控中的作用 | 文章未提及具体的限制因素 | 研究内皮细胞谱系特化的表观遗传机制以促进心血管再生医学的进展 | 研究对象为来源于诱导多能干细胞的内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (Single-cell RNA-Seq), Hi-C, DNase-Seq, ChIP-Seq, RNA-Seq | NA | 基因组数据 | 使用了来自诱导多能干细胞的内皮细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 1544 | 2024-08-05 |
STREAK: A supervised cell surface receptor abundance estimation strategy for single cell RNA-sequencing data using feature selection and thresholded gene set scoring
2023-08, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011413
PMID:37603589
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研究论文 | 本研究介绍了一种新的监督细胞表面受体丰度估计方法STREAK,用于单细胞转录组数据。 | 提出了一种利用联合scRNA-seq/CITE-seq训练数据的监督受体丰度估计方法,并结合了一种阈值基因集评分机制。 | NA | 开发一种更准确的细胞表面受体丰度估计方法。 | 针对六个联合scRNA-seq/CITE-seq数据集进行的受体丰度估计评估。 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序数据 | 六个联合scRNA-seq/CITE-seq数据集,代表四种人类和小鼠组织类型 | NA | NA | NA | NA |
| 1545 | 2024-08-05 |
Growth Hormone Accelerates Recovery From Acetaminophen-Induced Murine Liver Injury
2023-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.17.537197
PMID:37131727
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研究论文 | 本研究探讨了生长激素在乙酰氨基酚诱导的小鼠肝损伤中的治疗作用 | 首次提出使用生长激素作为治疗乙酰氨基酚肝毒性的替代疗法,并探讨了性别对肝脏修复的影响 | 研究的局限性在于只在小鼠模型中进行,尚未验证在人类中的有效性 | 旨在建立生长激素作为治疗乙酰氨基酚肝毒性的替代疗法 | 研究重点是乙酰氨基酚诱导的小鼠肝损伤 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 涉及小鼠的实验,样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 1546 | 2024-08-05 |
SPECK: an unsupervised learning approach for cell surface receptor abundance estimation for single-cell RNA-sequencing data
2023, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbad073
PMID:37359727
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研究论文 | 本文提出了一种新的无监督方法SPECK,用于单细胞RNA测序数据的受体丰度估计 | 创新点在于提出了一种基于CKmeans聚类阈值的无监督算法来估计细胞表面受体的丰度 | 依赖于scRNA-seq数据进行受体丰度估计,无法直接测量表面蛋白,可能影响结果的准确性 | 旨在提高细胞表面蛋白丰度估计的准确性,以支持单细胞转录组学的研究 | 主要研究人类25种受体在多种组织类型中的丰度估计 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督算法 | RNA测序数据 | 涉及至少25个人类受体和多个组织类型 | NA | NA | NA | NA |
| 1547 | 2024-08-05 |
Genetic and Molecular Contributors in Eosinophilic Esophagitis
2023-05, Current allergy and asthma reports
IF:5.4Q1
DOI:10.1007/s11882-023-01075-0
PMID:37084008
|
综述 | 本文旨在提供关于嗜酸性食管炎的遗传和分子进展的历史和最新更新 | 文章总结了最近的遗传和分子进展,强调了多种发现对理解该疾病的影响 | 没有明确提及具体的限制 | 旨在深入理解嗜酸性食管炎的遗传和分子机制 | 研究嗜酸性食管炎的遗传和分子因素 | 数字病理学 | 嗜酸性食管炎 | 新一代测序技术,包括全基因组关联研究、全外显子测序和RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1548 | 2024-08-05 |
Isolation of human cutaneous immune cells for single-cell RNA sequencing
2023-Apr-28, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102239
PMID:37120815
|
研究论文 | 本研究展示了一种从人类皮肤中分离高活性免疫细胞以进行单细胞RNA测序的方案 | 提出了一种新的方案来有效分离人类皮肤中的免疫细胞,以克服其屏障特性带来的挑战 | 该研究未提供关于该协议在其它类型皮肤或疾病背景下的验证 | 研究旨在开发从人类皮肤中分离可用于单细胞RNA测序的免疫细胞的技术 | 本研究的对象为人类皮肤的免疫细胞 | 数字病理学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 皮肤活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1549 | 2024-08-05 |
Reprogramming the tumor microenvironment leverages CD8+ T cell responses to a shared tumor/self antigen in ovarian cancer
2023-Mar-16, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2023.02.002
PMID:36875325
|
研究论文 | 本文研究了CXCR4拮抗剂武装的溶瘤病毒疗法对卵巢癌微环境和抗肿瘤免疫的影响 | 提出CXCR4-A武装的溶瘤病毒疗法在耐受性的肿瘤微环境中增强CD8 T细胞反应的机制 | 研究主要集中在转基因小鼠模型上,临床应用效果尚未证实 | 探索增强卵巢癌免疫治疗效果的新策略 | 使用SV40 T抗原卵巢癌的小鼠模型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像,基因组数据 | 使用了抗原天真的野生型小鼠和转基因小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 1550 | 2024-08-04 |
Re-convolving the compositional landscape of primary and recurrent glioblastoma reveals prognostic and targetable tissue states
2023-05-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38186-1
PMID:37142563
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研究论文 | 本文研究了原发性和复发性胶质母细胞瘤中的细胞组成和转录状态 | 通过研究特定亚群体之间的共居模式识别了三种组成性组织状态,并提出了针对GBM微环境相互依赖性的治疗方案 | 未说明样本数量和研究范围的具体限制 | 本研究旨在确定原发性和复发性胶质母细胞瘤的细胞组成及其转录状态 | 研究对象为原发性和复发性胶质母细胞瘤中的细胞类型及其相互关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单核RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1551 | 2024-08-05 |
Esm-1 mediates transcriptional polarization associated with diabetic kidney disease
2023-Mar-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.01.530562
PMID:36993439
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研究论文 | 本研究探讨了Esm-1在糖尿病肾病中的转录极化机制 | 揭示了Esm-1在糖尿病肾病发病机制中的作用及其在肾脏内皮细胞中的表达模式 | 未详细研究Esm-1在所有成熟组织中的表达及其潜在的生物学效应 | 研究Esm-1在糖尿病肾病中的表达和功能 | 研究对象包括成年人和小鼠的肾脏内皮细胞 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 27,786个肾脏内皮细胞,及20名健康受试者和41名糖尿病肾病患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1552 | 2024-08-05 |
Spatial Single Cell Analysis of Proteins in 2D Human Gastruloids Using Iterative Immunofluorescence
2023-Oct, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.915
PMID:37882990
|
研究论文 | 本文描述了一种迭代免疫荧光协议和计算管道,用于在2D人类胚层模型中分析蛋白质的空间模式形成 | 提出的迭代免疫荧光协议实现了比标准免疫荧光技术更高的多重测量能力,并能够同时分析27种蛋白质 | 未详细讨论方法在实际生物样本中的应用限制 | 揭示细胞信号如何在时间和空间上共同指示细胞命运 | 主要研究2D人类胚层的细胞及其在不同信号通路下的蛋白质表达 | 数字病理学 | NA | 免疫荧光 | NA | 图像 | 超过27种蛋白质的单细胞表达聚类分析 | NA | NA | NA | NA |
| 1553 | 2024-08-05 |
Single-Cell Profiling of Tumor Immune Microenvironment Reveals Immune Irresponsiveness in Gastric Signet-Ring Cell Carcinoma
2023-07, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.03.008
PMID:36921674
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研究论文 | 本研究揭示了胃信号环细胞癌(GSRCC)肿瘤免疫微环境的特征及其临床意义 | 提供了GSRCC肿瘤免疫微环境特征的全面分子图谱,并指出CXCL13在适应性免疫无反应中的中介作用 | 样本量有限,仅包含32名晚期GC患者,可能影响结果的广泛适用性 | 探讨胃信号环细胞癌的肿瘤免疫微环境特征及其对临床结果的影响 | 纳入32名不同亚型的晚期胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 针对抗体面板的质量细胞计数 | NA | RNA, 蛋白质 | 32名晚期胃癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1554 | 2024-08-05 |
Functional characterization of age-dependent p16 epimutation reveals biological drivers and therapeutic targets for colorectal cancer
2023-May-04, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02689-y
PMID:37143122
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研究论文 | 本文探讨了与年龄相关的p16表观突变在结直肠癌中的角色及其潜在的治疗靶点 | 本研究首次揭示了年龄依赖的p16表观突变在肠道肿瘤发生中的生物驱动因素和治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型,临床适用性需要进一步验证 | 改善结直肠癌患者的临床治疗 | 对携带Apc突变和p16表观突变的小鼠进行肿瘤发展与进展的研究 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 小鼠肿瘤和结肠上皮细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1555 | 2024-08-04 |
Transcriptomic signature, bioactivity and safety of a non-hepatoxic analgesic generating AM404 in the mid-brain PAG region
2023-May-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2883310/v1
PMID:37205420
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研究论文 | 这篇文章探讨了一种新型非肝毒性的镇痛药SRP-001的转录组特征、生物活性和安全性 | SRP-001作为一种小分子药物,具有非肝毒性并能够在中脑PAG区域生成AM404,展现出与传统镇痛药相比的创新效果 | 研究主要集中在转录组学的分析上,未提供大规模的临床验证数据 | 本研究旨在开发一种安全有效的非opioid镇痛药以替代现有的药物 | 主要研究对象是SRP-001及其在中脑PAG区域的生物作用及安全性 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 生物样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1556 | 2024-08-05 |
Dedifferentiation maintains melanocyte stem cells in a dynamic niche
2023-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-05960-6
PMID:37076619
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研究论文 | 该文章研究了黑色素干细胞在动态微环境中的去分化现象 | 文章提出黑色素干细胞在发育和成熟过程中在不同状态间转变的机制,挑战了现有理论 | 研究未详细探讨外部因素如何影响黑色素干细胞的迁移和去分化 | 探索黑色素干细胞如何在动态微环境中维持 | 黑色素干细胞及其在毛囊中的行为 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,活体成像 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1557 | 2024-08-04 |
Proteomic Profiling of Fallopian Tube-Derived Extracellular Vesicles Using a Microfluidic Tissue-on-Chip System
2023-Mar-27, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering10040423
PMID:37106610
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研究论文 | 本研究建立了一种微流控平台来培养人类输卵管上皮以收集细胞外囊泡,并首次报告了295种常见的输卵管衍生小细胞外囊泡蛋白 | 首次描述了由人类输卵管衍生的小细胞外囊泡蛋白质组成及其与腺癌转录组的关联 | 目前对hFTE衍生的小细胞外囊泡的内容和功能理解有限 | 旨在揭示输卵管来源的小细胞外囊泡的基线蛋白质谱以及其在卵巢癌发生中的潜在作用 | 研究对象是人类输卵管上皮和其衍生的小细胞外囊泡 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 质谱分析 | 微流控组织芯片 | 蛋白质 | 295种小细胞外囊泡蛋白 | NA | NA | NA | NA |
| 1558 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveal extracellular vesicles secretion with a cardiomyocyte proteostasis signature during pathological remodeling
2023-01-21, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04402-9
PMID:36681760
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研究论文 | 该文章揭示了在病理重塑过程中,心肌细胞分泌具有蛋白质稳态特征的外泌体 | 首次通过单细胞转录组分析揭示心肌细胞在病理重塑中的外泌体分泌机制以及相关的蛋白质特征 | 该研究主要集中在小鼠模型,临床相关性尚需进一步验证 | 研究心肌细胞在病理重塑过程中外泌体的分泌与蛋白质稳态特征的关系 | 包含诱导性心肌特异性Wnt激活的小鼠模型及人源诱导多能干细胞衍生的心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用了β-cat小鼠模型和来自人源诱导多能干细胞的心肌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1559 | 2024-08-05 |
Spatial-temporal proliferation of hepatocytes during pregnancy revealed by genetic lineage tracing
2023-11-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.09.002
PMID:37794588
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研究论文 | 本研究揭示了妊娠期间肝细胞的时空增殖模式及其来源 | 发现妊娠期肝细胞增殖的独特时空模式,主要来源于zone 2的Ccnd1肝细胞 | 研究主要集中在小鼠模型,临床应用效果尚未测试 | 研究妊娠期间母体肝脏细胞来源和增殖机制 | 妊娠过程中肝细胞的增殖及其来源 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,双重重组酶介导的遗传谱系追踪 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1560 | 2024-08-04 |
Cardiac splicing as a diagnostic and therapeutic target
2023-08, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-022-00828-0
PMID:36653465
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综述 | 本文讨论了心脏替代剪接在心肌健康和疾病中的重要性及其作为诊断和治疗靶点的潜力 | 强调了心脏剪接调节因子作为治疗靶点的识别以及在临床试验中评估剪接调节剂的转化管道的开发 | 可能缺乏对所有类型心脏病患者的广泛适应性和细节深入的分析 | 识别心脏剪接在心肌疾病中的作用,以改善诊断和治疗 | 心脏病患者及其心肌替代剪接机制的研究 | 数字病理学 | 心肌病 | 多组学技术和长读取及单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |