单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5351 篇文献，本页显示第 1541 - 1560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1541 | 2024-08-05 |
Tumor macrophage functional heterogeneity can inform the development of novel cancer therapies
2023-12, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2023.10.007
PMID:37995659
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研究论文 | 本文讨论了肿瘤相关巨噬细胞的功能异质性及其对癌症新疗法开发的影响 | 识别出巨噬细胞的分子亚型和功能，从而发现新的治疗靶点 | 传统治疗方法未能提供改变临床实践的突破性进展 | 提高对肿瘤微环境中巨噬细胞作用的理解，并推动新型靶向治疗的发展 | 聚焦于肿瘤微环境中的巨噬细胞功能及其潜在治疗靶点 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和空间转录组技术 | NA | NA | NA |
| 1542 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of immunocytes in the spleen of a mouse model of Wiskott-Aldrich syndrome
2023 Nov-Dec, Cellular immunology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cellimm.2023.104783
PMID:37944382
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对Wiskott-Aldrich综合征小鼠模型的脾脏免疫细胞进行了全面的转录组分析 | 首次在单细胞分辨率下揭示了WAS-KO小鼠脾脏免疫细胞的转录特征，并鉴定了与疾病病理相关的新基因 | NA | 探究Wiskott-Aldrich综合征小鼠模型脾脏免疫细胞的免疫缺陷机制 | WAS-KO小鼠脾脏的免疫细胞 | 数字病理学 | 免疫缺陷疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11,269个细胞 |
| 1543 | 2024-08-07 |
Spatial atlas of the mouse central nervous system at molecular resolution
2023-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06569-5
PMID:37758947
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研究论文 | 本文使用STARmap PLUS技术在单细胞分辨率下绘制了成年小鼠大脑和脊髓的1,022个基因的空间图谱 | 开发了计算流程来分割、聚类和注释分子细胞类型和分子组织区域，并整合了STARmap PLUS测量与单细胞RNA测序图谱，创建了一个转录组范围的空间图谱 | 未提及 | 绘制小鼠中枢神经系统的分子分辨率空间图谱，揭示脑解剖学和功能的分子基础 | 成年小鼠的大脑和脊髓 | 数字病理学 | NA | STARmap PLUS | NA | 基因表达数据 | 1.09百万个高质量细胞 |
| 1544 | 2024-08-07 |
Cell-type annotation with accurate unseen cell-type identification using multiple references
2023-06, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011261
PMID:37379341
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研究论文 | 本文提出了一种基于多参考的单细胞RNA测序数据自动注释方法mtANN，用于准确识别未见细胞类型 | mtANN方法整合了深度学习和集成学习以提高预测准确性，并引入了一种新的度量标准，考虑三个互补方面来区分未见细胞类型和共享细胞类型 | NA | 提高细胞类型注释的准确性并发现新的生物学现象 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 深度学习和集成学习 | 基因表达数据 | 涉及两个基准数据集集合和一个COVID-19数据集集合 |
| 1545 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals subtype-specific molecular profiles in Nrf2-deficient macrophages from murine atherosclerotic aortas
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1249379
PMID:37965327
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研究论文 | 本研究分析了小鼠动脉粥样硬化主动脉中缺乏Nrf2的巨噬细胞亚群的转录组 | 揭示了Nrf2缺乏导致的巨噬细胞亚型特异性转录组变化与炎症、铁稳态和细胞损伤或死亡途径之间的联系 | 仅使用了特定的小鼠模型，可能限制了结果的普遍适用性 | 研究Nrf2在小鼠动脉粥样硬化中的具体作用 | 来自小鼠动脉粥样硬化主动脉的不同Nrf2缺乏的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 实验中使用了Cdh5表达细胞中的Nrf2失活小鼠和适当的对照小鼠 |
| 1546 | 2024-08-07 |
HCG18, LEF1AS1 and lncCEACAM21 as biomarkers of disease severity in the peripheral blood mononuclear cells of COVID-19 patients
2023-10-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04497-6
PMID:37884975
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和qPCR验证，探索了长非编码RNA（LncRNAs）在COVID-19患者外周血单个核细胞（PBMCs）中的表达模式，并发现HCG18-242、HCG18-244、LEF1-AS1和lncCEACAM21与COVID-19的严重程度和死亡率相关 | 本研究首次发现HCG18-242、HCG18-244、LEF1-AS1和lncCEACAM21作为COVID-19严重程度和死亡率的潜在创新生物标志物 | NA | 探索COVID-19严重程度和死亡率的可靠和准确生物标志物 | COVID-19患者外周血单个核细胞中的长非编码RNA | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | RNA | 2906个长非编码RNA在COVID-19患者PBMCs中的表达模式，以及111名住院COVID-19患者的qPCR验证 |
| 1547 | 2024-08-04 |
mitoSplitter: A mitochondrial variants-based method for efficient demultiplexing of pooled single-cell RNA-seq
2023-09-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2307722120
PMID:37725654
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研究论文 | 本文开发了一种基于线粒体变体的方法‘mitoSplitter’，用于高效地解混合池化的单细胞RNA-seq数据 | 提出利用线粒体RNA变体进行解混合的新算法，从而克服传统方法的局限 | 在多样本和大规模细胞数据的情况下，仍可能存在一定的挑战与限制 | 旨在提高单细胞RNA-seq数据分析的效率，减少批次效应 | 研究五种非小细胞肺癌细胞系对BET化学降解的反应 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA数据 | 10个样本，60000个细胞 |
| 1548 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of murine hearts for studying the development of the cardiac conduction system
2023-09-04, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02333-6
PMID:37666871
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对小鼠心脏在不同发育阶段的约0.5百万个单细胞进行转录组分析，以研究心脏传导系统的发育 | 首次生成包含约0.5百万个单细胞的小鼠心脏转录组大数据集，为心脏传导系统及其他心脏组件的发育研究提供了强大的资源库 | NA | 研究心脏传导系统的发育及其在心脏功能中的作用 | 小鼠心脏在不同发育阶段的单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约0.5百万个单细胞 |
| 1549 | 2024-08-04 |
Human and murine fibroblast single-cell transcriptomics reveals fibroblast clusters are differentially affected by ageing and serum cholesterol
2023-07-04, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad016
PMID:36718802
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研究论文 | 本文探讨了人类和小鼠动脉中的成纤维细胞异质性及其在心血管疾病中的作用 | 文章提出了PDGFRA和DPEP1两种特异性成纤维细胞标记，并展示了成纤维细胞在健康和心血管疾病中的异质性 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚需进一步确认在人类中的具体应用 | 阐明成纤维细胞在心血管疾病及相关风险因素中的作用 | 人类和小鼠动脉中的成纤维细胞及其对心血管疾病的反应 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 包括多个小鼠和人类样本，具体数量未说明 |
| 1550 | 2024-08-07 |
Modelling capture efficiency of single-cell RNA-sequencing data improves inference of transcriptome-wide burst kinetics
2023-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad395
PMID:37354494
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研究论文 | 本文提出了一种新的数学理论来解释单细胞RNA测序数据中的变异性，并开发了基于似然和模拟的方法来推断转录组范围内的爆发动力学 | 本文引入了新的数学模型来捕捉细胞大小和捕获效率的爆发动力学和变异性 | NA | 研究基因表达的随机爆发动力学，并改进单细胞RNA测序数据中转录组范围爆发动力学的推断 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达爆发动力学 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 神经网络 (Neural Network) | RNA测序数据 | NA |
| 1551 | 2024-08-04 |
Positional influence on cellular transcriptional identity revealed through spatially segmented single-cell transcriptomics
2023-06-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.05.003
PMID:37348462
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研究论文 | 本文描述了一种通过空间分割的单细胞转录组技术揭示细胞转录身份的位置信息 | 提出了一种新的快速整合方法SEEP，将表面接近性和环境可达性与三维疾病模型中的转录身份关联起来 | 现有方法需要特定的技术和专业知识，本研究的适用范围可能受限于特定类型的肿瘤模型 | 研究细胞状态在肿瘤组织中的空间分布及其对转录身份的影响 | 高等级浆液性卵巢癌的球体、类器官以及体内肿瘤模型 | 数字病理 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 三维疾病模型 | 转录组数据 | NA |
| 1552 | 2024-08-04 |
Single-cell gene and isoform expression analysis reveals signatures of ageing in haematopoietic stem and progenitor cells
2023-05-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04936-6
PMID:37225862
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研究论文 | 本研究揭示了造血干细胞和祖细胞在衰老中的基因和亚型表达特征 | 通过整合短读和长读的单细胞RNA测序分析，提供了一个关于造血过程中的亚型多样性的新参考 | 衰老对亚型使用的影响有限 | 探讨衰老对造血干细胞和祖细胞的影响 | 造血干细胞和祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1553 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Conserved Regulatory Networks in Human and Mouse Interneuron Development
2023-May-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24098122
PMID:37175835
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了人类和小鼠抑制性神经元发育中的保守调控网络 | 识别出人类抑制性神经元分化的新候选转录调控因子 | 关于不同神经元群体发育的知识仍不完全 | 探讨人类和小鼠抑制性GABA能神经元的发育过程 | 人类胎儿的中脑中间隆起(MGE)单细胞数据 | 数字病理学 | 癫痫，自闭症，精神分裂症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 10至15周后的人类胎儿中脑中间隆起组织 |
| 1554 | 2024-08-07 |
Low-dose IL-2 enhances the generation of IL-10-producing immunoregulatory B cells
2023-04-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37424-w
PMID:37045832
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研究论文 | 本文研究了低剂量白细胞介素-2（IL-2）对IL-10产生调节性B细胞生成的增强作用 | 首次证明了低剂量IL-2可以增强人体内IL-10产生调节性B细胞的生成 | NA | 探讨低剂量IL-2是否能在人体内诱导产生调节性B细胞 | 人体外周血和脾脏B细胞以及接受低剂量IL-2治疗的患者 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自接受低剂量IL-2治疗患者的循环免疫细胞 |
| 1555 | 2024-08-07 |
A Refined Single Cell Landscape of Haematopoiesis in the Mouse Foetal Liver
2023-Mar-23, Journal of developmental biology
IF:2.2Q3
DOI:10.3390/jdb11020015
PMID:37092477
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对小鼠胎肝中的造血细胞进行了精细的细胞图谱构建 | 发现了小鼠胎肝中一种类似于人类已知的胎盘中等血红蛋白特征，以及一种先前未被识别的原始红细胞群 | NA | 获得胎肝中造血细胞的精细单细胞图谱 | 小鼠胎肝中的造血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括了比先前数据集更多的细胞的E12.5小鼠胎肝样本 |
| 1556 | 2024-08-07 |
Zinc Supplementation Induced Transcriptional Changes in Primary Human Retinal Pigment Epithelium: A Single-Cell RNA Sequencing Study to Understand Age-Related Macular Degeneration
2023-02-28, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12050773
PMID:36899910
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了锌补充剂对人类视网膜色素上皮细胞转录组变化的影响，以理解年龄相关性黄斑变性的分子机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术研究锌补充剂对视网膜色素上皮细胞转录组的影响，并揭示了锌处理后与年龄相关性黄斑变性相关的多个生物途径的基因表达变化 | 研究仅限于体外细胞培养，未涉及临床试验，且锌补充剂对视网膜色素上皮细胞的长期影响仍需进一步研究 | 探讨锌补充剂对年龄相关性黄斑变性进展的分子机制 | 人类视网膜色素上皮细胞 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及2周、9周和19周的细胞培养样本，以及1周和18周的锌补充处理样本 |
| 1557 | 2024-08-07 |
PD-1 and TIM-3 differentially regulate subsets of mouse IL-17A-producing γδ T cells
2023-02-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20211431
PMID:36480166
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研究论文 | 研究探讨了在小鼠中，PD-1和TIM-3如何不同地调节产生IL-17A的γδ T细胞亚群 | 首次展示了肺部Vγ4+和Vγ6+细胞在肿瘤和非肿瘤状态下表达不同的细胞表面分子和共抑制分子，并发现这些分子抑制其扩张 | NA | 研究γδ T细胞亚群在稳态和癌症中的调控机制 | 小鼠中产生IL-17A的γδ T细胞亚群 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 细胞表面分子表达数据 | 肿瘤和非肿瘤小鼠的肺部Vγ4+和Vγ6+细胞 |
| 1558 | 2024-08-04 |
LRRC15 mediates an accessory interaction with the SARS-CoV-2 spike protein
2023-02, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001959
PMID:36735681
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研究论文 | 本研究发现LRRC15是一种伴随因子，与SARS-CoV-2的刺突蛋白相互作用 | 本研究首次揭示了LRRC15作为SARS-CoV-2刺突蛋白的附加结合因子，与已知的结合机制不同 | LRRC15单独并不足以引发病毒进入，需要进一步研究其在感染中的作用 | 探讨SARS-CoV-2刺突蛋白与人类细胞之间的相互作用 | SARS-CoV-2刺突蛋白及其与人类细胞因子LRRC15的相互作用 | NA | COVID-19 | 蛋白组学与单细胞转录组学 | 细胞基因表达模型 | NA | 人类肺血管细胞和成纤维细胞的分析 |
| 1559 | 2024-08-07 |
Smoking induces shifts in cellular composition and transcriptome within the bronchial mucus barrier
2023-02, Respirology (Carlton, Vic.)
DOI:10.1111/resp.14401
PMID:36414410
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研究论文 | 本研究评估了吸烟对支气管黏液屏障细胞组成和基因表达的影响，并探讨了基于单细胞RNA测序的细胞解卷积方法在预测RNA测序数据中细胞类型组成的能力 | 研究首次使用细胞解卷积方法预测RNA测序数据中的细胞类型组成，并验证了该方法的有效性 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定的疾病和吸烟状态群体 | 理解吸烟暴露对支气管黏液屏障黏膜损伤的机制 | 支气管黏液屏障的细胞组成和基因表达 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 细胞解卷积 | RNA测序数据 | 共149名参与者，包括56名慢性阻塞性肺疾病患者，77名无慢性阻塞性肺疾病参与者，以及16名停止吸烟一年的参与者 |
| 1560 | 2024-08-07 |
Entropy sorting of single-cell RNA sequencing data reveals the inner cell mass in the human pre-implantation embryo
2023-01-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.09.007
PMID:36240776
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研究论文 | 本文介绍了一种名为熵排序（ES）的数学框架，用于从单细胞RNA测序数据中区分出指示细胞身份的基因，并在人类胚胎植入前阶段的单细胞RNA测序数据中成功识别出内细胞团（ICM）。 | ES方法无需用户定义的显著性阈值，通过量化特征间观察到的相关性是更可能由于随机机会还是依赖关系来区分基因，实现了无监督的细胞身份基因识别。 | NA | 解决单细胞基因表达分析中区分技术或生物噪声与有意义的细胞异质性的挑战。 | 人类胚胎植入前阶段的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |