单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5350 篇文献，本页显示第 1521 - 1540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1521 | 2024-08-05 |
Functional characterization of age-dependent p16 epimutation reveals biological drivers and therapeutic targets for colorectal cancer
2023-May-04, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02689-y
PMID:37143122
|
研究论文 | 本文探讨了与年龄相关的p16表观突变在结直肠癌中的角色及其潜在的治疗靶点 | 本研究首次揭示了年龄依赖的p16表观突变在肠道肿瘤发生中的生物驱动因素和治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，临床适用性需要进一步验证 | 改善结直肠癌患者的临床治疗 | 对携带Apc突变和p16表观突变的小鼠进行肿瘤发展与进展的研究 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 小鼠肿瘤和结肠上皮细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1522 | 2024-08-04 |
Transcriptomic signature, bioactivity and safety of a non-hepatoxic analgesic generating AM404 in the mid-brain PAG region
2023-May-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2883310/v1
PMID:37205420
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研究论文 | 这篇文章探讨了一种新型非肝毒性的镇痛药SRP-001的转录组特征、生物活性和安全性 | SRP-001作为一种小分子药物，具有非肝毒性并能够在中脑PAG区域生成AM404，展现出与传统镇痛药相比的创新效果 | 研究主要集中在转录组学的分析上，未提供大规模的临床验证数据 | 本研究旨在开发一种安全有效的非opioid镇痛药以替代现有的药物 | 主要研究对象是SRP-001及其在中脑PAG区域的生物作用及安全性 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 生物样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1523 | 2024-08-05 |
Dedifferentiation maintains melanocyte stem cells in a dynamic niche
2023-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-05960-6
PMID:37076619
|
研究论文 | 该文章研究了黑色素干细胞在动态微环境中的去分化现象 | 文章提出黑色素干细胞在发育和成熟过程中在不同状态间转变的机制，挑战了现有理论 | 研究未详细探讨外部因素如何影响黑色素干细胞的迁移和去分化 | 探索黑色素干细胞如何在动态微环境中维持 | 黑色素干细胞及其在毛囊中的行为 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，活体成像 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1524 | 2024-08-04 |
Proteomic Profiling of Fallopian Tube-Derived Extracellular Vesicles Using a Microfluidic Tissue-on-Chip System
2023-Mar-27, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering10040423
PMID:37106610
|
研究论文 | 本研究建立了一种微流控平台来培养人类输卵管上皮以收集细胞外囊泡，并首次报告了295种常见的输卵管衍生小细胞外囊泡蛋白 | 首次描述了由人类输卵管衍生的小细胞外囊泡蛋白质组成及其与腺癌转录组的关联 | 目前对hFTE衍生的小细胞外囊泡的内容和功能理解有限 | 旨在揭示输卵管来源的小细胞外囊泡的基线蛋白质谱以及其在卵巢癌发生中的潜在作用 | 研究对象是人类输卵管上皮和其衍生的小细胞外囊泡 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 质谱分析 | 微流控组织芯片 | 蛋白质 | 295种小细胞外囊泡蛋白 | NA | NA | NA | NA |
| 1525 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveal extracellular vesicles secretion with a cardiomyocyte proteostasis signature during pathological remodeling
2023-01-21, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04402-9
PMID:36681760
|
研究论文 | 该文章揭示了在病理重塑过程中，心肌细胞分泌具有蛋白质稳态特征的外泌体 | 首次通过单细胞转录组分析揭示心肌细胞在病理重塑中的外泌体分泌机制以及相关的蛋白质特征 | 该研究主要集中在小鼠模型，临床相关性尚需进一步验证 | 研究心肌细胞在病理重塑过程中外泌体的分泌与蛋白质稳态特征的关系 | 包含诱导性心肌特异性Wnt激活的小鼠模型及人源诱导多能干细胞衍生的心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用了β-cat小鼠模型和来自人源诱导多能干细胞的心肌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1526 | 2024-08-05 |
Spatial-temporal proliferation of hepatocytes during pregnancy revealed by genetic lineage tracing
2023-11-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.09.002
PMID:37794588
|
研究论文 | 本研究揭示了妊娠期间肝细胞的时空增殖模式及其来源 | 发现妊娠期肝细胞增殖的独特时空模式，主要来源于zone 2的Ccnd1肝细胞 | 研究主要集中在小鼠模型，临床应用效果尚未测试 | 研究妊娠期间母体肝脏细胞来源和增殖机制 | 妊娠过程中肝细胞的增殖及其来源 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，双重重组酶介导的遗传谱系追踪 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1527 | 2024-08-04 |
Cardiac splicing as a diagnostic and therapeutic target
2023-08, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-022-00828-0
PMID:36653465
|
综述 | 本文讨论了心脏替代剪接在心肌健康和疾病中的重要性及其作为诊断和治疗靶点的潜力 | 强调了心脏剪接调节因子作为治疗靶点的识别以及在临床试验中评估剪接调节剂的转化管道的开发 | 可能缺乏对所有类型心脏病患者的广泛适应性和细节深入的分析 | 识别心脏剪接在心肌疾病中的作用，以改善诊断和治疗 | 心脏病患者及其心肌替代剪接机制的研究 | 数字病理学 | 心肌病 | 多组学技术和长读取及单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1528 | 2024-08-07 |
Identifying leukocyte phenotypes by scRNA-seq to predict cardiovascular risk
2023-07, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-023-00891-1
PMID:37217590
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1529 | 2024-08-04 |
Differentiation of IL-26+ TH17 intermediates into IL-17A producers via epithelial crosstalk in psoriasis
2023-06-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39484-4
PMID:37391412
|
研究论文 | 本研究识别出IL-26+ T17中间细胞通过上皮细胞间的相互作用分化为IL-17A产生细胞的机制 | 首次揭示IL-26在银屑病T17细胞应答中的作用，及其通过调节基底角质细胞的TGF-β1产生促进自身分化的过程 | 未详细探讨IL-26在其他免疫环境中的作用及其是否适用于其他疾病 | 研究IL-26在银屑病中作为T17细胞前体的分化作用 | IL-26+ T17中间细胞及其在银屑病皮肤中的作用 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序，TCR测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1530 | 2024-08-05 |
MICROGLIA AND INFILTRATING T-CELLS ADOPT LONG-TERM, AGE-SPECIFIC, TRANSCRIPTIONAL CHANGES AFTER TRAUMATIC BRAIN INJURY IN MICE
2023-02-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002027
PMID:36730818
|
研究论文 | 本研究探讨了老年小鼠在创伤性脑损伤后的微胶质细胞和浸润T细胞的长期转录变化 | 研究发现老年小鼠的微胶质细胞和T细胞在创伤后表现出独特的基因特征，提供了有关年龄相关脑损伤反应的新见解 | 研究仅基于小鼠模型，可能无法完全推广到人类 | 研究创伤性脑损伤后，不同年龄小鼠的免疫反应及其机制 | 年轻和老年的C57BL/6小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠各组（具体样本数未提供） | NA | NA | NA | NA |
| 1531 | 2024-08-04 |
The Functional Roles of MDSCs in Severe COVID-19 Pathogenesis
2023-12-23, Viruses
DOI:10.3390/v16010027
PMID:38257728
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评论 | 本文总结了骨髓来源抑制细胞(MDSCs)在严重COVID-19发病机制中的功能角色 | 文章提出MDSCs的早期扩展可能是严重COVID-19进展的关键特征，并探讨其作为潜在预后生物标志物的作用 | 缺乏对严重COVID-19进展的全面分子决定因素的阐明 | 探讨骨髓来源抑制细胞在严重COVID-19发病机制中的作用 | 严重COVID-19患者的MDSCs及其功能 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序, 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 通过转录组RNA-seq和单细胞测序数据的荟萃分析得出的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1532 | 2024-08-05 |
Anatomical Diversity of the Adult Corticospinal Tract Revealed by Single-Cell Transcriptional Profiling
2023-11-22, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0811-22.2023
PMID:37748862
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研究论文 | 文章通过单细胞转录组分析揭示了成人皮质脊髓束的解剖多样性 | 首次通过结合脊髓逆行追踪与单细胞RNA测序的方式，详细索引了不同类型的皮质脊髓神经元 | 当前对皮质脊髓束的修复策略仍不理想，部分原因是对分子异质性了解不够全面 | 研究皮质脊髓神经元的亚型及其在运动皮层中的分布模式 | 成年小鼠的皮质脊髓神经元亚型 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 成年小鼠（男女各一） | NA | NA | NA | NA |
| 1533 | 2024-08-05 |
IL-1β inhibition partially negates the beneficial effects of diet-induced lipid lowering
2023-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.13.562255
PMID:37873280
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研究论文 | 本研究探讨了IL-1β抑制对饮食诱导的脂质降低效果的部分抵消作用 | 研究揭示了IL-1β在饮食诱导的斑块负担减少和斑块稳定性提高中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全适用于人类 | 探讨饮食改变对动脉粥样硬化病变的影响及其机制 | 采用Apoe-/-小鼠作为研究对象，以分析饮食对动脉粥样硬化病变的影响 | 医学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, CyTOF, 免疫染色, 高分辨率共聚焦显微镜z堆叠分析 | NA | 组织样本 | Apoe-/-小鼠，18周喂养西方饮食后切换到低脂饮食 | NA | NA | NA | NA |
| 1534 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics identify a macrophage population associated with skeletal muscle fibrosis
2023-07-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add9984
PMID:37418531
|
研究论文 | 该文章研究了与骨骼肌纤维化相关的巨噬细胞群体 | 通过单细胞转录组分析，揭示了骨骼肌巨噬细胞的新型转录程序和其在肌肉病中的作用 | 未详细讨论巨噬细胞在不同类型肌病中的具体功能 | 探讨巨噬细胞在肌肉疾病发展中作用机制 | 骨骼肌中的健康和病变的巨噬细胞 | 数字病理学 | 肌肉萎缩症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 发现六个巨噬细胞群体，涉及不同的肌肉病变样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1535 | 2024-08-04 |
Nextflow Pipeline for Visium and H&E Data from Patient-Derived Xenograft Samples
2023-Jul-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.27.550727
PMID:37546876
|
研究论文 | 我们开发了一个自动化数据处理流程，以量化来自患者衍生异种移植样本的鼠和人数据 | 该文章的创新点在于设计了一个基于Nextflow DSL2的流程，首次组合了空间转录组学数据和对应的H&E染色全序列图像的数据处理 | 文章未提及具体的局限性 | 本研究旨在优化对患者衍生异种移植癌症标本的空间转录组学数据和H&E图像的同时处理 | 研究对象为来自四个黑色素瘤患者衍生异种移植样本的数据集 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学和H&E染色成像 | NA | 图像和基因表达数据 | 四个黑色素瘤患者衍生异种移植样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1536 | 2024-08-05 |
Probe-based bacterial single-cell RNA sequencing predicts toxin regulation
2023-05, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-023-01348-4
PMID:37012420
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于探针的细菌单细胞RNA测序方法，以研究细菌的转录变异性 | 创新点在于开发了ProBac-seq方法，利用DNA探针库和现有的商业微流体平台进行细菌单细胞RNA测序 | 尚未提及具体的局限性 | 研究细菌在单细胞水平的转录变异性和相关性 | 研究对象包括拟杆菌和大肠杆菌，以及在病原过程中应用于梭状芽孢杆菌 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 每次实验测序数千个个体细菌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1537 | 2024-08-05 |
Preparation of Drosophila Ovarioles for Single-Cell RNA Sequencing
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2970-3_17
PMID:36715913
|
研究论文 | 本文描述了为单细胞RNA测序准备果蝇卵巢的过程 | 提出了一种新的孤立和准备果蝇卵巢以进行单细胞RNA测序的协议 | 研究主要集中在建立方法上，未涉及具体的生物学发现 | 旨在提高果蝇卵巢单细胞RNA测序的准备效率 | 果蝇卵巢细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1538 | 2024-08-04 |
TIMP1 is an early biomarker for detection and prognosis of lung cancer
2023-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1391
PMID:37759102
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研究论文 | 本文研究了TIMP1作为肺癌早期生物标志物的潜力 | 首次将TIMP1确定为肺癌早期生物标志物，并验证其在临床样本中的有效性 | 研究主要依赖于小鼠模型和已公开的数据，可能需要更大范围的人类临床验证 | 确定TIMP1在肺癌早期检测和预后中的作用 | KrasG12D/+; Lkb1f/f小鼠模型及肺癌患者的血浆样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组织化学(IHC)、单细胞RNA测序和大规模RNA测序 | 小鼠模型 | 血浆、肿瘤组织 | 包含小鼠模型与临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1539 | 2024-08-05 |
ScRNA-seq revealed an immunosuppression state and tumor microenvironment heterogeneity related to lymph node metastasis in prostate cancer
2023-May-23, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-023-00407-0
PMID:37221625
|
研究论文 | 本研究使用scRNA-seq分析前列腺癌的肿瘤微环境异质性与淋巴结转移相关的免疫抑制状态 | 本研究揭示了MYC途径在前列腺癌进展和肿瘤微环境免疫抑制中的作用 | 样本数量较少，可能影响研究结果的普遍性 | 探索前列腺癌淋巴结转移的机制 | 前列腺癌组织样本中的细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 32,766个细胞来自四个前列腺癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1540 | 2024-08-04 |
Spatial mapping of the total transcriptome by in situ polyadenylation
2023-04, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01517-6
PMID:36329320
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研究论文 | 本文展示了一种酶促原位多腺苷酸化RNA的方法，以便检测全范围的RNA。 | 文章首次扩展了基于测序的空间转录组学，能够捕获所有类型的RNA，包括编码RNA、非编码RNA和病毒RNA。 | NA | 研究空间转录组学方法，以捕捉全转录组信息。 | 本文应用空间总RNA测序方法研究骨骼肌再生和病毒诱导的心肌炎。 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |