单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 5353 篇文献,本页显示第 1501 - 1520 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1501 2024-08-05
GTAD: a graph-based approach for cell spatial composition inference from integrated scRNA-seq and ST-seq data
2023-11-22, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出GTAD方法,通过图注意力网络从整合的scRNA-seq和ST-seq数据中推断细胞空间组成 GTAD利用图结构和图注意力网络改善细胞空间关系和形态结构的捕捉 未提及具体的限制 旨在通过联合分析scRNA-seq和ST-seq数据,精确识别组织中的细胞空间组成 研究对象为小鼠大脑皮层、小脑、人类发育心脏和胰腺导管癌中的细胞 数字病理学 胰腺导管癌 scRNA-seq和ST-seq 图注意力网络 整合的基因表达数据 未提及具体的样本数量 NA NA NA NA
1502 2024-08-05
Unraveling Neuronal Identities Using SIMS: A Deep Learning Label Transfer Tool for Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种用于单细胞RNA测序分析的深度学习标签转移工具SIMS 提出了一种高效的数据驱动的机器学习管道SIMS,用于单细胞数据的离散分类,并在复杂数据集中展现出更好的性能 未提及具体的局限性 开发一种新方法来准确注释复杂的单细胞RNA数据集 主要研究成人大脑皮层、海马以及发育中的大脑细胞的分类 机器学习 NA RNA-seq NA 单细胞数据 涉及不同多能干细胞系来源的人类皮层类器官及复杂脑组织的单细胞数据集 NA NA NA NA
1503 2024-08-05
Inferring therapeutic vulnerability within tumors through integration of pan-cancer cell line and single-cell transcriptomic profiles
2023-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该文章提出了一种计算框架scIDUC,用于通过整合单细胞转录组数据和全癌种细胞系筛选数据来预测肿瘤内的治疗脆弱性 文章创新性地结合了单细胞转录组数据和丰富的细胞系筛选数据,以单细胞为基础预测治疗效果 该研究的局限性在于可能未涵盖所有肿瘤亚型和微环境影响的复杂性 研究旨在提升对肿瘤异质性的理解,进而改善针对性治疗策略 研究对象为不同肿瘤类型的单细胞和细胞系,包括横纹肌肉瘤、胰腺导管腺癌和去势抵抗前列腺癌 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 包含多个细胞亚群,以及特定疾病的细胞系 NA NA NA NA
1504 2024-08-05
Mapping pediatric brain tumors to their origins in the developing cerebellum
2023-10-03, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究揭示了三种最常见儿童脑肿瘤的细胞起源 通过使用人类发育小脑地图,揭示了儿童脑肿瘤的细胞起源,提供了新的治疗靶点 由于仅使用正常发育人类小脑作为参考,可能无法覆盖所有变异情况 理解儿童脑肿瘤的起源,以识别潜在的肿瘤特异性疗法 主要研究三种儿童脑肿瘤:室管膜瘤、毛细胞星形胶质瘤和小脑神经母细胞瘤 数字病理学 NA 基因组变异分析,相关性分析,单细胞匹配技术 NA 转录组数据 使用了4416个肿瘤数据集,包括批量和单细胞转录组数据 NA NA NA NA
1505 2024-08-05
An integrated genomic approach identifies follistatin as a target of the p63-epidermal growth factor receptor oncogenic network in head and neck squamous cell carcinoma
2023-Sep, NAR cancer IF:3.4Q2
研究论文 这篇文章通过整合基因组分析确定了follistatin作为头颈部鳞状细胞癌中p63-表皮生长因子受体肿瘤网络的靶点 揭示了follistatin作为p63的直接转录靶标,并且其表达还受到EGFR信号的驱动 尚未详细阐明这些致癌基因及其下游靶点介导肿瘤进展的具体机制 识别与头颈部鳞状细胞癌相关的p63肿瘤相关转录靶点 来自HNSCC患者的转录组数据以及代表性细胞系模型 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 数据集 多个转录组数据集,具体样本数未提供 NA NA NA NA
1506 2024-08-04
APOL1 kidney risk variants in glomerular diseases modeled in transgenic mice
2023-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文研究了携带APOL1肾脏风险变异的小鼠模型中肾小管病的特征 研究提出了两种小鼠模型,以展示APOL1-G1等位基因在肾小管疾病中的作用,并发现了潜在的新的肾小管损伤标记 缺乏在人类模型中的直接验证和对比 探讨APOL1基因变异对不同小鼠模型中肾脏疾病的影响 研究对象是HIV相关肾病(HIVAN)小鼠模型和接收到干扰素-γ的APOL1转基因小鼠 数字病理 肾脏疾病 RNA测序 转基因小鼠 RNA序列 不同类型的转基因小鼠样本(具体数量未提及) NA NA NA NA
1507 2024-08-04
Resveratrol attenuates staphylococcal enterotoxin B-activated immune cell metabolism via upregulation of miR-100 and suppression of mTOR signaling pathway
2023, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 该研究探讨了白藜芦醇如何通过上调miR-100和抑制mTOR信号通路减轻金黄色葡萄球菌肠毒素B激活的免疫细胞的代谢。 发现miR-100在RES处理的肺单核细胞中的上调以及其对mTOR的靶向作用。 该研究主要在小鼠模型中进行,可能不完全适用于人类。 研究白藜芦醇对金黄色葡萄球菌肠毒素B引发的急性呼吸窘迫综合征(ARDS)免疫细胞代谢的影响。 处理了小鼠模型以研究RES对金黄色葡萄球菌肠毒素B激活的免疫细胞的影响。 数字病理学 急性呼吸窘迫综合征 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 细胞 小鼠模型,样本数量未具体说明 NA NA NA NA
1508 2024-08-04
The activation of SIRT1 by resveratrol reduces breast cancer metastasis to lung through inhibiting neutrophil extracellular traps
2023-12, Journal of drug targeting IF:4.3Q1
研究论文 这项研究探讨了白藜芦醇对乳腺癌转移到肺部的影响。 该研究首次将白藜芦醇与抑制中性粒细胞外陷阱的作用联系起来,展示了其对乳腺癌转移的治疗潜力。 该研究在小鼠模型中进行,可能无法完全反映人类的生理条件。 研究白藜芦醇通过抑制中性粒细胞外陷阱来减少乳腺癌转移的机制。 主要研究对象为乳腺癌转移及中性粒细胞外陷阱。 数字病理学 乳腺癌 单细胞测序 小鼠正位4T1乳腺癌模型 血清样本 小鼠乳腺癌模型中的样本数量未具体提到 NA NA NA NA
1509 2024-08-05
Aerobic Exercise Alters the Melanoma Microenvironment and Modulates ERK5 S496 Phosphorylation
2023-09-01, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本文展示了运动如何改变黑色素瘤微环境以及调节ERK5 S496磷酸化 揭示了运动导致的肿瘤微环境变化中的肿瘤特异性免疫反应差异以及ERK5信号通路的重要性 研究仅使用了小鼠模型,可能无法完全代表人类的反应 探讨运动如何影响黑色素瘤的微环境及其机制 YUMMER 1.7 和 B16F10小鼠模型的黑色素瘤 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序和流式细胞术 NA NA 使用了YUMMER 1.7和B16F10小鼠模型 NA NA NA NA
1510 2024-08-05
Non-classical circulating monocytes expressing high levels of microsomal prostaglandin E2 synthase-1 tag an aberrant IFN-response in systemic sclerosis
2023-Nov, Journal of autoimmunity IF:7.9Q1
研究论文 该研究探讨了在系统性硬化症中,外周血单核细胞的组成和活化异变 首次揭示了非经典单核细胞在系统性硬化症患者中的过度表达及其异常IFN反应 样本数量较小,仅包括8名系统性硬化症患者和8名对照组 了解CD14外周血单核细胞在系统性硬化症中的作用 系统性硬化症患者与健康对照患者的外周血单核细胞 数字病理 系统性硬化症 单细胞转录组分析 (scRNA-seq) NA 血液样本 共16个样本,8名系统性硬化症患者和8名对照组 NA NA NA NA
1511 2024-08-05
Single-cell analysis of the nervous system at small and large scales with instant partitions
2023-Jul-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 这篇文章探讨了PIPseq在神经科学中进行单细胞RNA测序的应用。 引入PIPseq方法,能够在不同规模和神经科学实验中收集和序列化单细胞基因表达变化。 样本输入大小和初始资本投入的限制可能会排除一些研究者的应用。 研究PIPseq在单细胞RNA测序中的有效性和应用。 涉及多种样本和实验,包括小鼠模型和非传统模型物种的基因表达分析。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 数十个样本(每个样本1,000-100,000个细胞) NA NA NA NA
1512 2024-08-05
A targeted CRISPR-Cas9 mediated F0 screen identifies genes involved in establishment of the enteric nervous system
2023-Dec-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用CRISPR-Cas9介导的筛查识别参与肠神经系统建立的基因 使用高效的CRISPR筛查方法,发现新基因进而推动肠神经系统的研究 研究仅限于斑马鱼模型,可能不完全适用于其他脊椎动物 探讨和识别参与肠神经系统发育的基因 以斑马鱼为模型研究肠神经系统的形成与基因调控 数字病理学 Hirschsprung病 CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 NA NA NA NA NA NA NA
1513 2024-08-04
Combined near infrared photoacoustic imaging and ultrasound detects vulnerable atherosclerotic plaque
2023-11, Biomaterials IF:12.8Q1
研究论文 该研究显示近红外自发光声成像(NIRAPA)与超声联合可检测易损的动脉粥样硬化斑块 创新点在于首次将近红外自发光声成像与超声成像结合,用于区分稳定与易损斑块 研究的局限性在于仅在25名患者的切除斑块上进行的体外研究 研究旨在通过成像技术有效管理动脉粥样硬化疾病 研究对象为25例患者的切除动脉粥样硬化斑块 数字病理学 心血管疾病 近红外自发光声成像(NIRAPA)与超声成像 NA 图像 25个切除的动脉粥样硬化斑块样本 NA NA NA NA
1514 2024-08-05
Hypoxia-Inducible Factor-1α in SM22α-Expressing Cells Modulates Alveolarization
2023-10, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 本文研究了HIF-1α在SM22α表达细胞中的作用对肺泡化的影响 文章创新性地探讨了HIF-1α在特定间充质细胞亚群中调节出生后肺泡化的机制 研究仅在小鼠模型中进行,可能无法完全推及人类 研究HIF-1α在SM22α表达细胞中的功能及其对肺发育的影响 以SM22α-表达细胞为对象,分析其在肺泡化中的作用 数字病理学 慢性肺病 单细胞RNA测序 NA 生物样本 使用了小鼠模型和早产儿样本 NA NA NA NA
1515 2024-08-04
Cardiac pericytes mediate the remodeling response to myocardial infarction
2023-05-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 这篇文章探讨了心脏周细胞在心肌梗死后的重塑反应中的作用 首次揭示了心脏周细胞在急性缺血损伤后调控血管稳态和纤维化反应的关键角色 未详细探讨心脏周细胞的全部作用机制 旨在阐明心脏周细胞在缺血性重塑中的角色 心脏周细胞与心肌梗死后的纤维化及血管通透性变化 数字病理学 心脏病 单细胞RNA测序 小鼠模型 基因表达数据 多个来源的心脏周细胞样本 NA NA NA NA
1516 2024-08-04
Regulation of human salt-sensitivite hypertension by myeloid cell renin-angiotensin-aldosterone system
2023, Frontiers in physiology IF:3.2Q2
研究论文 本研究探讨了饮食盐对人类单核细胞免疫细胞中肾素-血管紧张素-醛固酮系统基因表达的影响及其在盐敏感性高血压中的作用 揭示了饮食盐摄入对人类单核细胞中RAAS表达的调控机制与系统性RAAS的不同 未探讨盐敏感高血压的长期影响和其他潜在的影响因素 研究盐敏感高血压中免疫细胞对饮食盐影响的机理 人类的单核细胞免疫细胞 数字病理学 心血管疾病 bulk和单细胞测序 NA 基因表达数据 使用了高盐处理的人类免疫细胞 NA NA NA NA
1517 2024-08-05
Single-Cell Multiomics
2023-08-10, Annual review of biomedical data science IF:7.0Q1
review 本综述讨论了单细胞多组学技术和计算集成方法,旨在结合不同生物数据以获得更深入的生物学见解 提出了新颖的单细胞技术以测量基因组、表观基因组、蛋白组和空间数据,并探索计算集成方法 NA 旨在通过集成不同模态的数据来加深对细胞生物学的理解 探讨不同单细胞技术和计算集成方法 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因组、表观基因组、蛋白组、空间数据 NA NA NA NA NA
1518 2024-08-05
The mitochondrial unfolded protein response regulates hippocampal neural stem cell aging
2023-06-06, Cell metabolism IF:27.7Q1
研究论文 这篇文章探讨了线粒体未折叠蛋白反应如何影响海马神经干细胞的衰老 创新点在于首次将线粒体蛋白折叠压力与神经干细胞衰老的关系建立起来 该研究可能仅限于小鼠模型,缺乏对人类的直接验证 研究线粒体蛋白折叠压力在神经干细胞衰老中的作用 年轻和老年小鼠的海马神经干细胞 数字病理学 神经退行性疾病 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 年轻和老年小鼠的单细胞样本 NA NA NA NA
1519 2024-08-04
IL-13-associated epithelial remodeling correlates with clinical severity in nasal polyposis
2023-05, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 这篇文章探讨了上皮细胞重塑与慢性鼻窦炎的炎症表型和疾病结果之间的关系 本研究首次通过单细胞测序和RNA测序分析,揭示了IL-13介导的上皮重塑与鼻息肉临床严重程度之间的相关性 研究的样本主要来自于慢性鼻窦炎患者,未涵盖所有潜在的鼻窦炎类型及其相应的临床数据 本研究旨在理解上皮细胞重塑与慢性鼻窦炎的炎症表型和疾病结果之间的关系 研究对象为慢性鼻窦炎患者,比较有鼻息肉和无鼻息肉患者的上皮细胞特征 数字病理学 NA RNA测序 NA 基因表达数据 参与研究的样本包括来自慢性鼻窦炎患者的筛查样本和健康对照样本 NA NA NA NA
1520 2024-08-04
Statistical Inference for High-Dimensional Generalized Linear Models with Binary Outcomes
2023, Journal of the American Statistical Association IF:3.0Q1
研究论文 本文提出了一种高维二元广义线性模型统计推断的统一框架 引入了新的下界技术,提供了自适应的最优置信区间分析,并展示了对回归向量稀疏性的适应性 关于已知与未知设计分布的情况的讨论较为有限 研究高维二元广义线性模型的统计推断方法 研究高维二元广义线性模型,及其置信区间和假设检验的构建 统计 NA 仿真研究,单细胞RNA序列分析 广义线性模型 RNA-seq数据 单细胞RNA-seq数据集中的样本 NA NA NA NA
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