单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 1461 - 1480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1461 | 2024-08-05 |
Identification of drug candidates targeting monocyte reprogramming in people living with HIV
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1275136
PMID:38077315
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研究论文 | 本文探讨了针对HIV感染者单核细胞重编程的药物候选物的识别 | 利用单细胞RNA测序技术识别用于逆转HIV感染者单核细胞转录表型的药物候选物 | 样本数量较小，仅限于200-HIV队列研究的部分参与者 | 评估组学技术在HIV感染者大规模队列中的应用可行性 | HIV感染者和健康对照者中的免疫细胞 | 数字病理学 | HIV | 单细胞RNA-seq、流式细胞术、蛋白质组学、ATAC-seq | NA | 血液样本 | 少量血液样本来自HIV感染者及健康对照者 |
| 1462 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of mitophagy-related genes in NSCLC diagnosis and immune scenery: based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1276074
PMID:38155968
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研究论文 | 本研究系统分析了线粒体自噬与非小细胞肺癌（NSCLC）之间的关系 | 通过机器学习选择六个与线粒体自噬相关的特征基因并构建了NSCLC的诊断模型 | NA | 探索线粒体自噬在NSCLC中的潜在机制以及其与免疫微环境的关系 | 非小细胞肺癌患者的线粒体自噬相关基因 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞数据与大规模RNA测序数据 | NA |
| 1463 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of necroptosis-related genes in renal ischemia-reperfusion injury
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1279603
PMID:37965311
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研究论文 | 本研究对肾移植中缺血再灌注损伤相关的坏死性凋亡基因进行了综合分析，并探讨了其在延迟移植物功能中的作用。 | 研究首次系统地分析了坏死性凋亡相关基因在肾缺血再灌注损伤中的表达和功能，并开发了一个预测延迟移植物功能的模型。 | 研究主要基于基因表达数据和单细胞RNA测序数据，可能需要更多的临床数据来进一步验证和优化模型。 | 旨在识别和功能表征肾移植中与坏死性凋亡相关的基因，并探讨其在免疫反应和缺血再灌注损伤进展中的作用。 | 肾移植中的缺血再灌注损伤及其相关的坏死性凋亡基因。 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括预处理和再灌注后的肾活检样本，以及IRI小鼠模型 |
| 1464 | 2024-08-07 |
Elaboration and validation of a prognostic signature associated with disulfidoptosis in lung adenocarcinoma, consolidated with integration of single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing techniques
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1278496
PMID:37965333
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序技术，详细阐述并验证了与硫化物凋亡相关的肺腺癌预后标志物 | 首次将单细胞RNA测序与批量RNA测序技术结合，探索与硫化物凋亡相关的基因，并构建预后风险标志物 | NA | 旨在通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序技术，揭示与硫化物凋亡相关的基因，并预测肺腺癌患者的临床预后 | 肺腺癌（LUAD）及其与硫化物凋亡相关的基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq） | LASSO-Cox回归模型 | RNA序列数据 | 使用GSE149655数据集的肺腺癌和正常样本，具体样本数量未详述 |
| 1465 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic atlas throughout anti-BCMA CAR-T therapy in patients with multiple myeloma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1278749
PMID:38035111
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了多发性骨髓瘤患者在接受抗BCMA CAR-T治疗过程中骨髓和外周血样本的转录组图谱 | 揭示了复发患者肿瘤细胞中HSP90B1和HSPA5的高表达以及内质网应激和未折叠蛋白反应途径的显著富集 | NA | 探究多发性骨髓瘤患者在接受抗BCMA CAR-T治疗后的免疫细胞变化及其与复发的关系 | 多发性骨髓瘤患者在接受抗BCMA CAR-T治疗过程中的骨髓和外周血细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 24个骨髓或外周血样本，共分析了59,725个骨髓细胞和72,479个外周血细胞 |
| 1466 | 2024-08-07 |
Single cell transcriptome analyses reveal the roles of B cells in fructose-induced hypertension
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1279439
PMID:38045685
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了B细胞在果糖诱导的高血压中的作用 | 首次揭示了B细胞在果糖诱导的高血压中的重要作用，并发现了B细胞与Tfh细胞及干扰素途径的激活之间的关联 | 研究仅限于Dahl盐敏感性雄性大鼠，结果的普遍性有待进一步验证 | 探讨B细胞在果糖诱导的高血压发展中的作用 | Dahl盐敏感性雄性大鼠的肠黏膜细胞和外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 8周龄Dahl盐敏感性雄性大鼠，分为两组，每组给予不同处理，共进行4周的实验 |
| 1467 | 2024-08-07 |
Profiling cellular heterogeneity and fructose transporter expression in the rat nephron by integrating single-cell and microdissected tubule segment transcriptomes
2023-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.20.572656
PMID:38187558
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和微切割的肾小管片段转录组数据，分析了大鼠肾单位中的细胞异质性和果糖转运蛋白表达。 | 首次揭示了肾小管近端不同亚段细胞中果糖转运蛋白的复杂异质性表达模式，并发现S3段是果糖重吸收的主要部位。 | 研究主要基于公开数据库的数据，未进行实验验证。 | 探究大鼠肾单位中细胞异质性和果糖转运蛋白表达模式。 | 大鼠肾单位中的细胞和果糖转运蛋白。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了公开数据库中的大鼠和人类肾脏转录组和蛋白质组数据。 |
| 1468 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of Rohon-Beard neurons implicates Fgf signaling in axon maintenance and cell survival
2023-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.26.554953
PMID:37693470
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了斑马鱼幼体阶段的Rohon-Beard感觉神经元，揭示了其分子特征及Fgf信号通路在轴突维持和细胞存活中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细定义了斑马鱼Rohon-Beard神经元的亚型，并发现Fgf信号通路在其轴突维持和细胞存活中的关键作用 | 研究主要集中在斑马鱼模型，未来研究需进一步验证在哺乳动物中的适用性 | 探究Rohon-Beard神经元的分子特征及其在轴突维持和细胞存活中的调控机制 | 斑马鱼幼体阶段的Rohon-Beard感觉神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个斑马鱼幼体阶段的Rohon-Beard感觉神经元样本 |
| 1469 | 2024-08-05 |
Long-read single-cell sequencing reveals expressions of hypermutation clusters of isoforms in human liver cancer cells
2023-Aug-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.532991
PMID:36993628
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研究论文 | 本研究开发了一种基于 LOOPseq 技术的合成长读单细胞测序技术，分析了人类肝癌细胞中的超突变亚型表达 | 提出了 LOOPseq 单细胞测序技术，识别出特异性强的肝细胞癌突变 mRNA 亚型及新融合转录本 | 没有提到具体的限制 | 旨在揭示人类肝癌细胞中蛋白质表达的复杂性与多样性 | 分析了来自个体的 447 份肝细胞癌与良性肝组织的转录组 | 数字病理学 | 肝癌 | 长读单细胞测序 | NA | 转录组 | 447 份转录组样本 |
| 1470 | 2024-08-05 |
Intercellular communication atlas reveals Oprm1 as a neuroprotective factor for retinal ganglion cells
2023-Aug-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3193738/v1
PMID:37645816
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研究论文 | 本文探讨了细胞间通信如何影响视网膜神经节细胞的存活 | 首次揭示了μ阿片受体(Oprm1)作为视网膜神经节细胞的神经保护因子的作用 | 未提及具体的临床应用或人类数据 | 研究细胞间信号在视网膜神经节细胞存活中的贡献 | 视网膜神经节细胞及其与其他视网膜细胞的相互作用 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1471 | 2024-08-05 |
Intercellular communication atlas reveals Oprm1 as a neuroprotective factor for retinal ganglion cells
2023-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.14.549118
PMID:37502873
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研究论文 | 本研究探讨了细胞间通信如何促进视网膜神经节细胞的生存 | 发现Oprm1作为一种神经保护因子并通过细胞间相互作用促进高生存率视网膜神经节细胞的存活 | 研究的局限性在于可能未能完全揭示所有相关的细胞间相互作用 | 研究细胞间通信在神经元存活中的作用 | 研究对象为视网膜神经节细胞和其他视网膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了多种视网膜细胞亚群体的样本，通过细胞间交互分析来归纳 |
| 1472 | 2024-08-05 |
Immunologic barriers in liver transplantation: a single-cell analysis of the role of mesenchymal stem cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1274982
PMID:38143768
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研究论文 | 本研究分析了可能指示肝移植排斥或耐受的生物标志物及其机制 | 首次探讨了免疫抑制剂与间充质干细胞联合治疗对肝移植耐受性的影响 | 研究仅在特定的动物模型中进行，可能无法完全外推至临床 | 研究肝移植耐受的生物标志物和相关机制 | Lewis-Lewis和F344-Lewis大鼠模型 | 数字病理 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | Lewis-Lewis和F344-Lewis大鼠 |
| 1473 | 2024-08-07 |
Comprehensive analyses for the coagulation and macrophage-related genes to reveal their joint roles in the prognosis and immunotherapy of lung adenocarcinoma patients
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1273422
PMID:38022584
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研究论文 | 本研究通过综合分析凝血和巨噬细胞相关基因，揭示它们在肺腺癌患者预后和免疫治疗中的联合作用 | 构建了一个风险评分模型，用于预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗临床结果 | NA | 探索与凝血过程和肿瘤相关巨噬细胞浸润相关的肺腺癌新型生物标志物 | 肺腺癌患者的凝血和巨噬细胞相关基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 风险评分模型 | RNA-seq数据 | 涉及33个凝血和巨噬细胞相关基因，其中19个用于构建风险评分模型，最终包含10个与生存相关的基因 |
| 1474 | 2024-08-07 |
Distinct regulatory machineries underlying divergent chromatin landscapes distinguish innate lymphoid cells from T helper cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1271879
PMID:38106414
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研究论文 | 本研究通过综合分析294个批量RNA测序结果，利用scRNA-seq算法，探讨了先天淋巴细胞（ILCs）与T辅助细胞（Th细胞）在染色质景观和转录调控机制上的差异 | 发现了区分ILCs和Th细胞的两个基因集，以及区分不同免疫反应的三个基因集；通过染色质可及性分析，揭示了ILCs和Th细胞在转录调控上的差异 | NA | 探讨先天淋巴细胞与T辅助细胞在转录调控和染色质景观上的主要区别 | 先天淋巴细胞（ILCs）和T辅助细胞（Th细胞） | 免疫学 | NA | RNA测序（RNA-seq） | scRNA-seq算法 | RNA序列 | 294个批量RNA测序结果 |
| 1475 | 2024-08-07 |
The mosquito effect: regulatory and effector T cells acquire cytoplasmic material from tumor cells through intercellular transfer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1272918
PMID:38179041
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研究论文 | 本文介绍了一种新的肿瘤小鼠模型，其中肿瘤细胞表达可溶性超亮荧光蛋白ZsGreen，用于检测和测量肿瘤细胞向浸润免疫细胞的细胞质转移 | 首次提出并命名了肿瘤浸润T细胞的“蚊子效应”，即T细胞通过细胞间转移从肿瘤细胞获取细胞质材料的现象 | 由于缺乏强有力的模型，免疫系统中这种转移的功能影响和分子机制仍大多未知 | 研究肿瘤细胞与免疫细胞间的细胞质转移现象及其对T细胞功能的影响 | 肿瘤细胞、T调节细胞、效应CD8 T细胞及髓系细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | scRNA-seq | NA | 荧光蛋白ZsGreen | 小鼠模型 |
| 1476 | 2024-08-07 |
IL-7 receptor signaling drives human B-cell progenitor differentiation and expansion
2023-09-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023019721
PMID:37369082
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序分析健康对照组和IL-7Rα缺陷患者的骨髓样本，结合体外人B细胞分化模型，证明IL-7R信号在人B淋巴生成中起关键作用 | 揭示了IL-7信号在促进B淋巴细胞命运和扩展早期人B细胞前体中的先前未知作用，并指出了人与小鼠之间的差异 | NA | 探讨IL-7R信号在人B淋巴生成中的作用及其在血液干细胞移植和白血病发生中的意义 | IL-7R信号在人B淋巴生成中的作用 | 免疫学 | 免疫缺陷病 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 健康对照组和IL-7Rα缺陷患者的骨髓样本 |
| 1477 | 2024-08-07 |
Prolonged response after TPO-RA discontinuation in primary ITP: results of a prospective multicenter study
2023-06-08, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022018665
PMID:36893453
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研究论文 | 本研究探讨了在停止使用血小板生成素受体激动剂（TPO-RA）后，原发性免疫性血小板减少症（ITP）患者持续无治疗的反应情况 | 发现单细胞RNA测序揭示了在TPO-RA停药后无持续反应的患者中，CD8+ T细胞中肿瘤坏死因子α信号通过NF-κB途径的富集，以及CD69在基线时在这些患者中的过度表达 | 未发现显著的临床预测因子来预测第24周的无治疗持续反应 | 评估原发性ITP患者在TPO-RA停药后的持续无治疗反应 | 持续或慢性原发性ITP成年患者，且在TPO-RAs治疗下完全反应 | NA | 免疫性血小板减少症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 48名患者 |
| 1478 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas identifies pretreatment features of primary imatinib resistance in chronic myeloid leukemia
2023-06-01, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022017295
PMID:36857629
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，识别了慢性髓性白血病中伊马替尼原发性耐药的前治疗特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了慢性髓性白血病中伊马替尼耐药的关键细胞特征和基因表达模式 | 研究主要集中在伊马替尼耐药的预后特征，未涉及其他治疗方案的耐药机制 | 探讨慢性髓性白血病中伊马替尼原发性耐药的分子机制 | 慢性髓性白血病患者的骨髓样本，特别是白血病干细胞和自然杀伤细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 多个慢性髓性白血病患者的骨髓样本 |
| 1479 | 2024-08-04 |
Spatial and molecular profiling of the mononuclear phagocyte network in classic Hodgkin lymphoma
2023-05-11, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022015575
PMID:36758207
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研究论文 | 本研究定义了经典霍奇金淋巴瘤及非淋巴瘤淋巴结的全球免疫细胞组成 | 首次高分辨率探讨了单核吞噬细胞网络的组织和与霍奇金-里德-斯坦伯格细胞的相互作用 | 仅通过少量经典标记识别的单核吞噬细胞可能限制了对其真正功能的全面理解 | 探讨经典霍奇金淋巴瘤中的免疫细胞组成及其在肿瘤微环境中的作用 | 聚焦于经典霍奇金淋巴瘤中的单核吞噬细胞及其全局组成 | 数字病理学 | 霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光 | NA | 免疫细胞组成数据 | 诊断活检样本 |
| 1480 | 2024-08-07 |
Cardiomyocyte Pdk4 response is associated with metabolic maladaptation in aging
2023-04, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13800
PMID:36797808
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，探讨了老年和年轻小鼠心脏细胞在缺血/再灌注条件下转录差异，特别是心肌细胞中Pdk4基因的表达变化及其对葡萄糖代谢的影响 | 首次揭示了Pdk4在年轻和老年小鼠心肌细胞中的差异表达，及其对葡萄糖代谢的调控作用 | 研究仅限于小鼠模型，未来需在人类样本中验证这些发现 | 探索衰老如何增加心脏对缺血损伤的脆弱性 | 老年和年轻小鼠的心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 老年和年轻小鼠的心脏样本 |