单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5351 篇文献，本页显示第 1441 - 1460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1441 | 2024-08-07 |
Inhibition of anti-tumor immunity by melanoma cell-derived Activin-A depends on STING
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1335207
PMID:38304252
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研究论文 | 本文研究了黑色素瘤细胞分泌的Activin-A通过STING途径抑制抗肿瘤免疫的机制 | 发现Activin-A诱导的免疫逃避与多种细胞类型的促炎性干扰素特征相关，并揭示了STING在其中的关键作用 | NA | 探讨Activin-A在黑色素瘤中的作用及其对免疫疗法的影响 | 黑色素瘤细胞、CD8 T细胞及免疫微环境 | 肿瘤学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用突变型YUMM3.3小鼠黑色素瘤细胞进行同基因移植实验 |
| 1442 | 2024-08-04 |
Direct Male Development in Chromosomally ZZ Zebrafish
2023-Dec-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.27.573483
PMID:38234788
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研究论文 | 该文章研究了NA斑马鱼的性别决定和生殖腺发展机制 | 揭示了NA斑马鱼在生殖腺发育中直接形成睾丸而非经过幼年卵巢阶段的机制 | 未明确提及该研究的局限性 | 理解NA斑马鱼的性别决定和生殖腺发育机制 | ZZ和ZW斑马鱼的生殖腺发育过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 肝脏组织样本 | 涉及19天和30天后生殖腺的样本 |
| 1443 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals molecular dysfunction associated with Lewy pathology
2023-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.17.541144
PMID:37292685
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研究论文 | 本研究使用空间转录组学揭示与路易体病理相关的分子功能失调 | 首次识别出在皮质中易患路易体病的特定兴奋性神经元，并提出了路易体相关分子功能失调的基因特征 | 研究仅集中于那些有无病理的皮质神经元，可能未覆盖其他类型神经元的变化 | 探讨哪些神经元易于发展为路易体病，并识别相关的分子变化 | 路易体病的皮质神经元及其转录组特征 | 数字病理学 | 帕金森病 | 空间转录组学 | 小鼠模型 | 转录组数据 | 使用了来自人类及小鼠的多个皮质神经元样本 |
| 1444 | 2024-08-07 |
A vein wall cell atlas of murine venous thrombosis determined by single-cell RNA sequencing
2023-01-31, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04492-z
PMID:36721040
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了小鼠下腔静脉在血栓形成24小时后的细胞图谱 | 首次在单细胞水平上描述了急性静脉血栓形成期间静脉壁的转录组变化，为早期病理事件提供了新见解 | NA | 探讨深静脉血栓的细胞和分子机制 | 小鼠下腔静脉在血栓形成后的细胞类型和转录组变化 | 数字病理学 | 静脉血栓 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠下腔静脉样本 |
| 1445 | 2024-08-07 |
CD31 promotes diffuse large B-cell lymphoma metastasis by upregulating OPN through the AKT pathway and inhibiting CD8+ T cells through the mTOR pathway
2023, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:37193155
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研究论文 | 本研究探讨了CD31在弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）转移中的作用及其机制 | 首次揭示了CD31通过上调OPN和抑制CD8+ T细胞在DLBCL转移中的作用 | NA | 探究DLBCL侵袭机制及CD31在其中的作用 | DLBCL细胞、CD31、CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 实时聚合酶链反应、蛋白质印迹、免疫荧光、免疫组化染色、RNA测序 | NA | RNA | 40名新诊断的DLBCL患者 |
| 1446 | 2024-08-07 |
Dynamic states of cervical epithelia during pregnancy and epithelial barrier disruption
2023-Feb-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.105953
PMID:36718364
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和空间分析，识别了非孕期、孕期和分娩期小鼠宫颈上皮的亚型 | 发现了孕期中两种杯状细胞亚型在宫颈上皮最表层的分布，并揭示了它们表达的新保护因子和独特的黏膜网络 | NA | 探究宫颈上皮在孕期和分娩期间的动态变化及其对维持妊娠的重要性 | 宫颈上皮在不同妊娠阶段的亚型及其功能变化 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及非孕期、孕期和分娩期的小鼠宫颈上皮样本 |
| 1447 | 2024-08-04 |
It is better to light a candle than to curse the darkness: single-cell transcriptomics sheds new light on pancreas biology and disease
2023-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2022-329313
PMID:36997301
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综述 | 本文回顾了单细胞转录组学如何改变我们对胰腺生物学和疾病进展的理解 | 引入了单细胞转录组学，揭示了胰腺的细胞组成和分子机制 | 本文没有具体提及研究的样本量和实验限制 | 探讨单细胞转录组学在胰腺生物学和疾病中的应用 | 胰腺及相关细胞类型和状态 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞类型和状态 | NA |
| 1448 | 2024-08-07 |
Hedgehog signalling in Foxd1+ embryonic kidney stromal progenitors controls nephron formation via Cxcl12 and Wnt5a
2023-12, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6195
PMID:37772431
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研究论文 | 研究揭示了胚胎肾脏间质祖细胞中Hedgehog信号通路在通过Cxcl12和Wnt5a调控肾单位形成中的主要致病作用 | 首次确定了Hedgehog信号通路在胚胎肾脏间质细胞中的过度激活导致先天性肾单位数量减少的机制，并发现Cxcl12和Wnt5a是其下游关键分子 | 研究主要基于小鼠模型和人类肾脏类器官，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现 | 探讨先天性肾脏和尿道异常（CAKUT）中肾单位数量减少的病理机制 | 胚胎肾脏间质祖细胞中的Hedgehog信号通路及其对肾单位形成的影响 | 数字病理学 | 先天性肾脏和尿道异常 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织 | 小鼠模型和人类肾脏类器官 |
| 1449 | 2024-08-07 |
Prostatic proliferative inflammatory atrophy: welcome to the club†
2023-12, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6213
PMID:37775958
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研究论文 | 本研究使用RNA原位杂交技术，在人类前列腺中发现了与肺部club细胞具有转录相似性的上皮细胞，并探讨了这些细胞在前列腺炎症和癌症中的潜在作用 | 首次在人类前列腺中定位了club-like细胞，并揭示了它们在前列腺炎症和癌症中的表达模式 | 尚未完全理解club-like细胞在人类前列腺炎症、再生和疾病中的功能角色 | 探讨club-like细胞在人类前列腺炎症、再生和疾病中的作用 | 人类前列腺中的club-like细胞及其与前列腺炎症和癌症的关系 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA原位杂交 | NA | RNA序列 | 未具体说明样本数量 |
| 1450 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling identifies distinct hormonal, immunologic, and inflammatory signatures of endometriosis-constituting cells
2023-11, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6178
PMID:37807404
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了卵巢子宫内膜囊肿、浅表腹膜子宫内膜异位症和深部浸润性子宫内膜异位症患者的细胞类型及其分子特征 | 发现了子宫内膜异位症特有的MUC5B细胞、间皮细胞来源的肌成纤维细胞以及NRG1-ERBB3相互作用，这些可能与子宫内膜异位症的发病机制有关 | NA | 探讨子宫内膜异位症构成细胞与正常子宫内膜的差异及其分子特征与表型表现的关系 | 卵巢子宫内膜囊肿、浅表腹膜子宫内膜异位症和深部浸润性子宫内膜异位症 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 12名患者 |
| 1451 | 2024-08-07 |
Club-like cells in proliferative inflammatory atrophy of the prostate
2023-09, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6149
PMID:37550827
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和染色RNA原位杂交技术，在前列腺增生性炎症萎缩（PIA）中发现并定位了类似肺部纤毛细胞的细胞群 | 首次在前列腺中发现与肺部纤毛细胞相似的细胞群，并探讨了这些细胞在前列腺炎症和癌变中的作用 | 研究主要集中在前列腺癌手术标本，对健康前列腺组织的研究较少 | 识别并定位前列腺中的纤毛细胞样细胞，并探讨其在前列腺炎症和癌变中的作用 | 前列腺组织，包括健康捐赠者和前列腺癌患者的前列腺标本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），染色RNA原位杂交 | NA | 组织样本 | 包括健康前列腺组织和前列腺癌手术标本 |
| 1452 | 2024-08-04 |
Revolutionizing cancer immunotherapy in solid tumor: CAR engineering and single-cell sequencing insights
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1310285
PMID:38090577
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mini-review | 这篇文章探讨了嵌合抗原受体（CAR）细胞疗法在实体肿瘤治疗中的进展及单细胞RNA测序（scRNA-seq）的应用 | 结合scRNA-seq与CAR疗法，提供了对CAR细胞生物特性及肿瘤免疫逃逸的新见解，推动癌症免疫治疗的创新 | 主要面临识别可靠的肿瘤相关抗原和肿瘤微环境复杂性的问题 | 研究CAR细胞疗法在实体肿瘤中的应用以及scRNA-seq的潜力 | CAR-T细胞和实体肿瘤 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | NA |
| 1453 | 2024-08-04 |
An integrated analysis of bulk and single-cell sequencing data reveals that EMP1+/COL3A1+ fibroblasts contribute to the bone metastasis process in breast, prostate, and renal cancers
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1313536
PMID:38187400
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研究论文 | 本研究通过综合分析大规模测序和单细胞RNA转录组数据，揭示了EMP1+/COL3A1+成纤维细胞在乳腺癌、前列腺癌和肾癌的骨转移过程中的作用 | 首次调查了成纤维细胞与多种肿瘤微环境中的骨转移过程之间的关系 | 尚未明确骨转移机制的所有细节 | 探索不同肿瘤的骨转移相关特征 | 乳腺癌、前列腺癌和肾癌样本中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌、前列腺癌、肾癌 | 大规模测序和单细胞RNA测序 | NA | RNA转录组数据 | 乳腺癌、前列腺癌和肾癌的骨转移样本 |
| 1454 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals heterogeneity in esophageal squamous epithelial cells and constructs models for predicting patient prognosis and immunotherapy
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1322147
PMID:38098487
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研究论文 | 该文章探讨了食管鳞状上皮细胞异质性，并建立了预测患者预后和免疫治疗模型 | 通过单细胞转录组学揭示了恶性上皮细胞亚群的异质性，并建立了与生存相关的预后模型 | 样本量和所用数据集的选择可能限制了结果的普遍适用性 | 全面探索食管鳞状细胞癌微环境中恶性鳞状上皮细胞亚群的异质性 | 主要研究食管鳞状细胞癌患者中的恶性鳞状上皮细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA数据 | TCGA和GSE53624队列的样本 |
| 1455 | 2024-08-07 |
Single-cell landscape of immune cells during the progression from HBV infection to HBV cirrhosis and HBV-associated hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1320414
PMID:38116005
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了不同疾病阶段的人类肝脏免疫微环境，揭示了HBV感染至HBV相关肝硬化和肝细胞癌过程中免疫细胞的变化 | 首次详细描述了从HBV感染到肝硬化和肝细胞癌进展过程中肝脏免疫微环境的单细胞景观，并识别了两个相关的免疫细胞亚群Macrophage-CD9/IL18和macrophage-CD9/IFI6 | 研究样本量相对较小，可能需要进一步扩大样本量以验证结果的普遍性 | 探究HBV相关肝脏疾病进展过程中肝脏免疫环境的变化 | HBV感染、HBV肝硬化和HBV相关肝细胞癌患者的肝脏免疫细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 118,455个免疫细胞，来自6名健康个体、4名HBV感染患者、5名HBV肝硬化患者和3名HBV相关肝细胞癌患者 |
| 1456 | 2024-08-07 |
Unraveling the enigma of B cells in diffuse large B-cell lymphoma: unveiling cancer stem cell-like B cell subpopulation at single-cell resolution
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1310292
PMID:38149239
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据和多种生物信息学工具，全面分析了弥漫大B细胞淋巴瘤中的B细胞亚群，特别是揭示了一种具有癌症干细胞特性的B细胞亚群 | 首次在单细胞分辨率下揭示了弥漫大B细胞淋巴瘤中存在具有癌症干细胞特性的B细胞亚群，并探讨了其与不良预后的关联 | 研究样本量较小，且仅限于DLBCL和正常淋巴组织，未来需扩大样本量和涵盖更多类型的淋巴瘤 | 揭示弥漫大B细胞淋巴瘤中癌症干细胞样B细胞亚群的特性和其在疾病进展中的作用 | 弥漫大B细胞淋巴瘤中的B细胞亚群及其与癌症干细胞的关系 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 230个DLBCL组织样本和3个DLBCL样本及1个正常淋巴组织样本 |
| 1457 | 2024-08-07 |
Interferon response and profiling of interferon response genes in peripheral blood of vaccine-naive COVID-19 patients
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1315602
PMID:38268924
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研究论文 | 本研究旨在通过分析COVID-19患者外周血中的干扰素（IFN）反应基因表达，深入了解COVID-19感染期间的系统性干扰素反应 | 首次在未接种疫苗的COVID-19患者中研究了干扰素反应基因的表达，并利用单细胞RNA测序数据分析了特定细胞类型在干扰素反应中的作用 | 样本仅限于疾病发作后10天内的血液样本，且未考虑接种疫苗后的情况 | 研究COVID-19患者在自然感染期间的先天免疫反应，特别是干扰素反应 | COVID-19患者和健康对照组的外周血样本 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | RNA | 105名COVID-19患者和30名健康对照 |
| 1458 | 2024-08-07 |
Effect of sodium stibogluconate in recruiting and awakening immune cells in the pleural fluid of pancreatic cancer: preparation for immunotherapy
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1315468
PMID:38313432
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研究论文 | 研究钠锑葡萄糖酸盐（SSG）在胰腺癌患者的胸腔积液中招募和唤醒免疫细胞的效果，为免疫治疗做准备 | 首次使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）研究SSG在胰腺癌胸腔积液中的免疫激活作用 | 研究仅限于胰腺癌患者的胸腔积液，未涉及其他类型的癌症或疾病 | 探讨SSG在胰腺癌胸腔积液中激活免疫细胞的机制，为免疫治疗提供新策略 | 胰腺癌患者的胸腔积液中的免疫细胞 | 免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中明确 |
| 1459 | 2024-08-04 |
Current annotation strategies for T cell phenotyping of single-cell RNA-seq data
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1306169
PMID:38187377
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综述 | 本文评估了当前单细胞RNA测序数据中T细胞表型注释的策略 | 提出了对T细胞及其亚群体的自动注释策略，并指出了现有工具中缺失的关键信息 | 缺乏金标准的细胞表型注释方法，导致对T细胞亚型的标记仍然存在问题 | 研究单细胞RNA测序中T细胞的表型注释方法 | 针对T细胞及其亚群体的注释工具和策略 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1460 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing analysis related to sphingolipid metabolism guides immunotherapy and prognosis of skin cutaneous melanoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1304466
PMID:38077400
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研究论文 | 本文探讨了与皮肤黑色素瘤相关的鞘脂代谢基因，以开发患者预后的指标 | 本文通过单细胞测序分析识别了与免疫微环境相关的关键预后基因，提出了一种基于SRG的风险标志 | 鞘脂代谢在黑色素瘤中的具体作用和机制尚不完全明确 | 开发一个与皮肤黑色素瘤患者预后相关的指标 | 研究对象为皮肤黑色素瘤患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | scRNA-seq | LASSO和Cox回归 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的黑色素瘤患者的单细胞测序数据 |