单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 1441 - 1460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1441 | 2024-08-04 |
Distinct Th17 effector cytokines differentially promote microglial and blood-brain barrier inflammatory responses during post-infectious encephalitis
2023-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.10.532135
PMID:37215000
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研究论文 | 本研究探讨了不同Th17效应细胞因子在感染后脑炎期间对小胶质细胞和血脑屏障炎症反应的不同促进作用 | 阐明了GAS感染中内皮细胞和小胶质细胞的反应机制，并识别了关键的Th17衍生细胞因子 | 研究主要在小鼠疾病模型中进行，可能无法完全反映人类的情况 | 探讨在GAS感染后的神经精神后遗症中Th17细胞因子的作用 | 小鼠模型中的内皮细胞和小胶质细胞 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 血清样本 | 未明确指出样本数量，仅提到患者血清 |
| 1442 | 2024-08-07 |
Characterisation of macrophage infiltration and polarisation based on integrated transcriptomic and histological analyses in Primary Sjögren's syndrome
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1292146
PMID:38022546
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研究论文 | 本研究通过综合转录组学和组织学分析，探讨了原发性干燥综合征（pSS）中巨噬细胞浸润和极化的机制 | 首次详细描述了pSS患者中巨噬细胞的浸润和极化状态，并揭示了巨噬细胞与炎症微环境之间的双向关系 | 研究样本量较小，且仅使用了公开数据集中的样本，可能影响结果的普遍性 | 探究原发性干燥综合征中巨噬细胞浸润和极化的机制 | 原发性干燥综合征患者的外周血单个核细胞和唾液腺组织 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | NA | 转录组数据 | pSS患者5例，健康个体5例，pSS唾液腺组织24例，非pSS唾液腺组织12例 |
| 1443 | 2024-08-07 |
Imprinted genes and the manipulation of parenting in mammals
2023-Nov, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-023-00644-3
PMID:37714957
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研究论文 | 本文探讨了基因组印记及其在哺乳动物亲代抚育中的调控作用 | 利用单细胞RNA测序数据支持了印记基因与母体抚育质量之间更为深思熟虑的关系 | NA | 研究基因组印记在哺乳动物亲代抚育中的作用及其对人类健康的潜在影响 | 基因组印记及其在母体抚育中的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 1444 | 2024-08-04 |
Interferon-independent processes constrain measles virus cell-to-cell spread in primary human airway epithelial cells
2023-Sep-19, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.01361-23
PMID:37724882
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研究论文 | 本研究探讨了麻疹病毒在主要人类气道上皮细胞中的细胞间传播机制 | 这项研究揭示了IFN信号在麻疹病毒细胞间传播中并不是限制因素，强调了IFN独立过程的重要性 | 研究未能完全理解阻止麻疹病毒传播的机制 | 了解麻疹病毒在气道上皮细胞中的传播特征和机制 | 主要人类气道上皮细胞(Hae)和麻疹病毒(MeV)突变体 | NA | NA | 深度测序、定量RT-PCR和单细胞RNA测序 | NA | 细胞模型 | 主要人类气道上皮细胞的培养 |
| 1445 | 2024-08-04 |
Preclinical models for prediction of immunotherapy outcomes and immune evasion mechanisms in genetically heterogeneous multiple myeloma
2023-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-02178-3
PMID:36928817
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研究论文 | 本文介绍了一种反映多发性骨髓瘤遗传异质性的前临床模型，以预测免疫治疗结果和免疫逃逸机制 | 建立了包含八种MM病变的新型小鼠模型，揭示了与免疫检查点阻断反应相关的CD8 T细胞与T细胞的比例 | 未提及具体的实验样本来源和规模的局限性 | 探讨多发性骨髓瘤的遗传和免疫特点与治疗反应之间的关系 | 多发性骨髓瘤模型小鼠及相关临床患者的免疫反应 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学与功能检测 | 小鼠模型 | 生物样本和临床数据 | 约500只小鼠和约1000名患者 |
| 1446 | 2024-08-07 |
Combined PD-1, BRAF and MEK inhibition in BRAFV600E colorectal cancer: a phase 2 trial
2023-02, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-02181-8
PMID:36702949
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研究论文 | 本研究进行了一项单臂2期临床试验，评估联合使用PD-1、BRAF和MEK抑制剂在BRAFV600E结直肠癌患者中的效果 | 研究揭示了MAPK抑制与免疫反应之间潜在的协同作用机制，为优化结直肠癌的靶向和免疫联合治疗提供了新的临床评估方向 | 尽管研究达到了主要终点，但总体反应率仍然较低，且缺乏持久性 | 探索联合使用PD-1、BRAF和MEK抑制剂在BRAFV600E结直肠癌中的临床疗效 | 37名BRAFV600E结直肠癌患者 | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 23对治疗前和治疗第15天的肿瘤活检样本 |
| 1447 | 2024-08-04 |
Corrigendum: Application of single-cell sequencing to the research of tumor microenvironment
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1345222
PMID:38116015
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更正 | 本文更正了关于单细胞测序在肿瘤微环境研究中的应用的文章 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1448 | 2024-08-04 |
Identification of TRDV-TRAJ V domains in human and mouse T-cell receptor repertoires
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1286688
PMID:38077312
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研究论文 | 本文描述了在人类和小鼠T细胞受体库中识别含有TRDV基因的两种T细胞受体 | 首次在小鼠和人类中识别到包括TRDV基因的TRA链，展示了这些TRDV基因对TRA多样性的贡献 | TRDV-TRA链在最终结果中被排除，可能导致对其丰富性的低估 | 研究TRDV基因在T细胞受体中的角色及其对TRA多样性的影响 | 人类和小鼠的T细胞受体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 21个来自人类和23个来自小鼠的单细胞RNA-seq数据集 |
| 1449 | 2024-08-04 |
Application of single-cell sequencing to the research of tumor microenvironment
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1285540
PMID:37965341
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综述 | 本文总结了单细胞测序及肿瘤微环境分析的最新进展 | 结合单细胞测序和肿瘤微环境分析为揭示肿瘤发展和进展的分子机制提供了独特机会 | NA | 探讨单细胞测序在肿瘤微环境研究中的应用 | 肿瘤微环境及其与单细胞测序的关系 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组，转录组和表观基因组 | NA |
| 1450 | 2024-08-04 |
Examining the function of macrophage oxidative stress response and immune system in glioblastoma multiforme through analysis of single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1288137
PMID:38274828
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研究论文 | 该论文探讨了巨噬细胞在胶质母细胞瘤中的氧化应激反应和免疫系统的功能 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了巨噬细胞在胶质母细胞瘤微环境中的中心角色及其潜在的极化机制 | 对现有巨噬细胞在胶质母细胞瘤作用机制的理解仍然有限 | 旨在重新定义胶质母细胞瘤肿瘤核心和周边区域内的细胞景观 | 研究对象为胶质母细胞瘤中的巨噬细胞及其相关亚群体 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA |
| 1451 | 2024-08-04 |
Genetic and immunological insights into COVID-19 with acute myocardial infarction: integrated analysis of mendelian randomization, transcriptomics, and clinical samples
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1286087
PMID:38022594
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研究论文 | 本文探讨了COVID-19与急性心肌梗死之间的遗传和免疫学关联 | 采用两样本孟德尔随机化和机器学习发现TLR4和ABCA1作为相关性中心基因，具有高诊断价值 | 未能确认COVID-19与急性心肌梗死之间的直接因果关系 | 理解COVID-19与急性心肌梗死之间的分子机制 | 研究COVID-19患者中急性心肌梗死的遗传和免疫特征 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 机器学习 | 基因组数据, 临床血样本 | 在研究中包含了多样本的RNA-seq数据和临床血液样本 |
| 1452 | 2024-08-07 |
Crosstalk of disulfidptosis-related subtypes, establishment of a prognostic signature and immune infiltration characteristics in bladder cancer based on a machine learning survival framework
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1180404
PMID:37152941
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研究论文 | 本研究探讨了胱硫醚病相关基因（DRGs）对膀胱癌（BLCA）预后的影响，并开发了一种基于机器学习生存框架的预测模型，用于评估患者的预后、免疫特征和治疗反应 | 本研究首次将胱硫醚病相关基因与膀胱癌的预后和免疫浸润特征联系起来，并开发了一种新的预测模型 | NA | 研究胱硫醚病相关基因在膀胱癌中的作用，并开发一种新的预测模型以指导临床管理和个性化治疗 | 膀胱癌患者及其胱硫醚病相关基因的表达和突变特征 | 机器学习 | 膀胱癌 | RNA测序 | 机器学习算法 | RNA-Seq数据 | 三个膀胱癌队列 |
| 1453 | 2024-08-07 |
Spatial modelling of the tumor microenvironment from multiplex immunofluorescence images: methods and applications
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1288802
PMID:38179056
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研究论文 | 本文探讨了通过多重免疫荧光（mIF）图像的空间建模方法来研究肿瘤微环境（TME）中的细胞相互作用及其在临床应用中的潜力 | 本文引入了多种数学模型，这些模型最初用于景观生态学和地理信息研究，现在应用于肿瘤微环境分析，以评估细胞群的空间聚集性 | NA | 提高基于免疫疗法的临床试验的成功率 | 肿瘤微环境中的细胞相互作用及其对治疗反应的影响 | 数字病理学 | NA | 多重免疫荧光（mIF） | 数学模型 | 图像 | 组织样本来自基线和治疗期间不同时间点的患者 |
| 1454 | 2024-08-07 |
An integrative analysis of single-cell and bulk transcriptome and bidirectional mendelian randomization analysis identified C1Q as a novel stimulated risk gene for Atherosclerosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1289223
PMID:38179058
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量转录组数据，并使用双向孟德尔随机化分析，确定了C1Q作为动脉粥样硬化的新风险基因 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和批量RNA分析确定了C1Q相关的关键基因，并使用双向孟德尔随机化分析验证了C1Q与动脉粥样硬化的关联 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序和批量RNA分析确定C1Q相关的关键基因，以更有效地诊断和预测动脉粥样硬化患者，并研究C1Q与动脉粥样硬化（缺血性中风）的关联 | C1Q相关基因在人类动脉粥样硬化斑块中的作用 | 基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | 转录组数据 | 使用了来自RAW264.7巨噬细胞和apoE-/-小鼠的样本 |
| 1455 | 2024-08-04 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq reveals RNA N6-methyladenosine modification associated with prognosis and drug resistance in acute myeloid leukemia
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1281687
PMID:38022588
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研究论文 | 本文探讨了RNA N6-甲基腺苷修饰与急性髓系白血病的预后和耐药性的关系 | 该研究首次揭示了m6A修饰在急性髓系白血病中的作用，识别出与预后相关的特定亚型 | 研究仅基于m6A修饰情况，未深入探讨其他可能影响结果的因素 | 研究m6A修饰模式及其在急性髓系白血病中的临床意义 | 急性髓系白血病患者的细胞样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 基于急性髓系白血病患者的样本，具体样本数量未提及 |
| 1456 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals the heterogeneity of IL-10 producing regulatory B cells in lupus-prone mice
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1282770
PMID:38155972
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了易患狼疮小鼠中IL-10产生调节性B细胞的异质性 | 首次详细描述了狼疮易感小鼠中调节性B细胞亚群在疾病进展不同阶段的基因表达变化 | 研究仅限于狼疮易感小鼠模型，可能不完全适用于人类疾病 | 探讨调节性B细胞在狼疮发病机制中的作用 | 狼疮易感小鼠的调节性B细胞 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 狼疮易感小鼠的脾脏Breg亚群 |
| 1457 | 2024-08-07 |
NMF Clustering: Accessible NMF-based Clustering Utilizing GPU Acceleration
2023, Journal of bioinformatics and systems biology : Open access
DOI:10.26502/jbsb.5107072
PMID:38390437
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研究论文 | 本文介绍了一种基于非负矩阵分解（NMF）的聚类方法，利用GPU加速技术提高计算效率 | 通过使用CuPy库和消息传递接口（MPI）在GPU计算节点上实现NMF聚类，显著减少了计算时间 | NA | 旨在解决NMF算法在处理大规模基因表达数据时的计算密集问题 | 大规模RNA测序和单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 非负矩阵分解（NMF） | NA | 基因表达数据 | 涉及数万个基因的数据集 |
| 1458 | 2024-08-07 |
Alcohol reverses the effects of KCNJ6 (GIRK2) noncoding variants on excitability of human glutamatergic neurons
2023-02, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-022-01818-x
PMID:36207584
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研究论文 | 研究探讨了KCNJ6基因非编码变异对人类谷氨酸能神经元兴奋性的影响及其与酒精使用障碍的关系，并通过iPSC来源的神经元模型进行了验证 | 首次揭示了酒精能够逆转KCNJ6非编码变异对神经元兴奋性的影响，并可通过过表达GIRK2模拟酒精的效果 | 研究样本量较小，仅包括四名受影响和四名未受影响的个体 | 探究KCNJ6基因非编码变异对神经元兴奋性的影响及其与酒精使用障碍的关联 | KCNJ6基因非编码变异对人类谷氨酸能神经元的影响 | 神经科学 | 酒精使用障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四名酒精使用障碍诊断的受影响个体和四名未受影响的控制个体 |
| 1459 | 2024-08-04 |
Distinct mast cell subpopulations within and around lymphatic vessels regulate lymph flow and progression of inflammatory-erosive arthritis in TNF-transgenic mice
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1275871
PMID:38155962
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研究论文 | 本文探讨了小鼠模型中肥大细胞对淋巴管功能和炎症侵蚀性关节炎的影响 | 首次阐明了不同肥大细胞亚群对关节淋巴流动及炎症-侵蚀性关节炎进展的调控作用 | 研究主要集中在TNF转基因小鼠上，缺乏对其他模型的验证 | 研究肥大细胞在肿瘤坏死因子转基因小鼠中对关节淋巴管功能和炎症-侵蚀性关节炎的作用 | TNF转基因小鼠和各种基因缺失小鼠，用于评估肥大细胞的作用 | 数字病理学 | 炎症性关节炎 | 单细胞RNA测序和免疫荧光显微镜 | TNF转基因小鼠 | 组织学和生物信息学数据 | TNF-tg小鼠、WT小鼠及cKit缺失小鼠共计数十只 |
| 1460 | 2024-08-05 |
The utilization of single-cell sequencing technology in investigating the immune microenvironment of ccRCC
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1276658
PMID:38090562
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评论 | 本文回顾了单细胞测序技术在研究ccRCC免疫微环境中的应用。 | 文章创新地强调了单细胞测序技术如何揭示肿瘤微环境中特定细胞特征的重要性。 | 以往的先进测序方法忽视了特定较少的细胞特征，可能未能全面反映肿瘤微环境的复杂性。 | 探讨ccRCC中肿瘤微环境的特性及其免疫浸润的最新进展。 | ccRCC中肿瘤微环境和免疫浸润相关的细胞特征。 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞特征数据 | NA |