单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 5354 篇文献，本页显示第 1441 - 1460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1441 | 2024-08-29 |
SPASCER: spatial transcriptomics annotation at single-cell resolution
2023-01-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac889
PMID:36243975
|
研究论文 | 本文构建了一个名为SPASCER的新型空间转录组数据库，旨在帮助理解组织结构的异质性、区域特异性微环境及跨组织结构的多层次细胞间相互作用 | SPASCER数据库整合了来自43项研究的1082个子数据集，涵盖四种物种的16种器官类型，并结合scRNA-seq数据进行空间转录组的解卷积/映射，以及空间细胞间相互作用、基因模式和通路富集分析 | NA | 研究目的是通过构建SPASCER数据库，深入理解健康和疾病组织中的生物学过程机制 | 研究对象包括组织结构异质性、区域特异性微环境及细胞间相互作用 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 43项研究的1082个子数据集，涵盖16种器官类型，涉及四种物种 | NA | NA | NA | NA |
| 1442 | 2024-08-27 |
Dual inhibition of glycolysis and glutaminolysis for synergistic therapy of rheumatoid arthritis
2023-09-20, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-023-03161-0
PMID:37730663
|
研究论文 | 研究通过双重抑制糖酵解和谷氨酰胺分解途径，探讨其在类风湿性关节炎治疗中的协同作用 | 提出通过双重抑制糖酵解和谷氨酰胺分解途径作为治疗类风湿性关节炎的新方法 | NA | 探讨双重抑制糖酵解和谷氨酰胺分解途径在类风湿性关节炎治疗中的潜在协同作用 | 类风湿性关节炎中的滑膜成纤维细胞 | NA | 类风湿性关节炎 | scRNA-seq, H1-核磁共振波谱 | NA | 细胞类型, 基因表达 | 涉及人类滑膜细胞和关节炎小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1443 | 2024-08-25 |
Behind the Indolent Facade: Uncovering the Molecular Features and Malignancy Potential in Lung Minimally Invasive Adenocarcinoma by Single-Cell Transcriptomics
2023-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303753
PMID:37991139
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了肺微小侵袭性腺癌（MIA）的分子特征及其恶性潜能 | 首次通过单细胞转录组学分析，揭示了MIA与侵袭性腺癌（IA）之间的联系和异质性，并发现了可能导致MIA恶性进展的机制 | 研究样本仅来自三位患者，可能影响结果的普遍性 | 揭示肺微小侵袭性腺癌的分子特征及其恶性潜能 | 肺微小侵袭性腺癌（MIA）及其免疫微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 156,447个细胞，来自三位同步多发性肺腺癌患者的MIA和IA肿瘤样本、外周血单个核细胞及邻近正常组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1444 | 2024-08-25 |
Single-Cell Analysis Reveals Malignant Cells Reshape the Cellular Landscape and Foster an Immunosuppressive Microenvironment of Extranodal NK/T-Cell Lymphoma
2023-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303913
PMID:37949673
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了外周NK/T细胞淋巴瘤的肿瘤微环境，揭示了恶性NK细胞在重塑细胞景观和促进免疫抑制微环境中的关键作用 | 首次在单细胞分辨率下解析了外周NK/T细胞淋巴瘤肿瘤微环境的异质组成，强调了携带EBV编码LMP1的恶性NK细胞在重塑细胞景观和促进免疫抑制微环境中的重要作用 | NA | 更好地理解外周NK/T细胞淋巴瘤的异质性起源 | 外周NK/T细胞淋巴瘤的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个患者队列 | NA | NA | NA | NA |
| 1445 | 2024-08-25 |
Single-Cell RNA-Sequencing Provides Insight into Skeletal Muscle Evolution during the Selection of Muscle Characteristics
2023-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202305080
PMID:37870215
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术（scRNA-seq）探讨了人工选择对猪骨骼肌细胞特征的影响 | 本研究首次提供了全景式的肌肉常驻细胞特征，并识别了新的和品种特异性的细胞类型，以及它们在伪时间轨迹上的分布 | NA | 探究人工选择对骨骼肌细胞特征的影响及其机制 | 猪的骨骼肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及不同品种的猪的骨骼肌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1446 | 2024-08-25 |
Identification and Characterization of CD8+ CD27+ CXCR3- T Cell Dysregulation and Progression-Associated Biomarkers in Systemic Lupus Erythematosus
2023-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202300123
PMID:37875396
|
研究论文 | 本研究通过质谱流式细胞术、流式细胞术和单细胞RNA测序，全面分析了263例临床外周血样本中系统性红斑狼疮（SLE）患者的免疫细胞失调情况，并探讨了CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在SLE病理和疾病进展中的作用。 | 本研究首次详细描述了CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在SLE中的失调情况及其与疾病活动性的关联，并构建了动态网络生物标志物（DNB）模型，用于预测SLE的疾病进展。 | NA | 探讨CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在系统性红斑狼疮（SLE）中的失调情况及其作为疾病进展相关生物标志物的潜力。 | CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在系统性红斑狼疮（SLE）中的作用及其作为生物标志物的可能性。 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 质谱流式细胞术、流式细胞术、单细胞RNA测序 | 动态网络生物标志物（DNB）模型 | 外周血样本 | 263例临床外周血样本，包括活动性SLE（aSLE）、缓解期SLE（rSLE）和健康对照（HCs） | NA | NA | NA | NA |
| 1447 | 2024-08-25 |
Loss of ATOH1 in Pit Cell Drives Stemness and Progression of Gastric Adenocarcinoma by Activating AKT/mTOR Signaling through GAS1
2023-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202301977
PMID:37824217
|
研究论文 | 研究探讨了ATOH1在胃癌干细胞维持中的作用及其通过GAS1激活AKT/mTOR信号通路促进胃腺癌进展的机制 | 首次揭示了ATOH1通过调控GAS1和RET/AKT/mTOR信号通路影响胃癌干细胞的维持和化疗耐药性 | 研究主要基于小鼠模型和组织样本，需要进一步的人体临床试验验证 | 阐明ATOH1在胃癌干细胞维持中的作用及其分子机制 | 胃癌干细胞及胃腺癌样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 包括小鼠模型和胃腺癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1448 | 2024-08-23 |
Tertiary lymphoid structures correlate with enhancement of antitumor immunity in esophageal squamous cell carcinoma
2023-10, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-023-02396-7
PMID:37604932
|
研究论文 | 本文研究了三级淋巴结构（TLSs）与食管鳞状细胞癌（ESCC）预后及肿瘤免疫微环境（TIME）的关系 | 首次探讨了TLSs在ESCC中的预后意义及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 研究样本量有限，且仅限于ESCC组织 | 探讨TLSs在ESCC中的预后意义及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 180例ESCC组织样本及14例ESCC组织的单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本 | 180例ESCC组织样本及14例ESCC组织 | NA | NA | NA | NA |
| 1449 | 2024-08-20 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals a Role for Reactive Oxygen Species and Peroxiredoxins in Fatty Acid-Induced Rat β-Cell Proliferation
2023-01-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db22-0121
PMID:36191509
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨了脂肪酸诱导的大鼠β细胞增殖的转录机制 | 首次揭示了活性氧物种和过氧化物酶在脂肪酸诱导的β细胞增殖中的关键作用 | 研究仅限于大鼠模型，且未探讨其他脂肪酸类型对β细胞增殖的影响 | 探究脂肪酸诱导β细胞增殖的分子机制 | 大鼠胰岛β细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了大鼠胰岛样本，具体数量未详述 | NA | NA | NA | NA |
| 1450 | 2024-08-18 |
Alterations in the preneoplastic breast microenvironment of BRCA1/2 mutation carriers revealed by spatial transcriptomics
2023-May-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.24.542078
PMID:37292816
|
研究论文 | 本文利用空间转录组学技术研究了BRCA1/2基因突变携带者癌前乳腺组织中乳腺上皮细胞分化的缺陷及其微环境的改变 | 发现了β1-整合素介导的自分泌信号在BRCA1和BRCA2缺陷乳腺上皮细胞中的差异，并揭示了突变携带者乳腺组织中上皮-基质旁分泌信号的增强 | NA | 深入理解肿瘤发生的生理过程，为高风险患者设计创新的乳腺癌化学预防策略 | BRCA1/2基因突变携带者的癌前乳腺组织和非携带者的正常乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 1451 | 2024-08-18 |
MD-ALL: an Integrative Platform for Molecular Diagnosis of B-cell Acute Lymphoblastic Leukemia
2023-Apr-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2798895/v1
PMID:37090504
|
研究论文 | 介绍MD-ALL平台，该平台基于基因表达谱和关键遗传改变，提供敏感且准确的B-细胞急性淋巴母细胞白血病分类 | MD-ALL平台整合了关键遗传病变，包括序列突变、大规模拷贝数变异和基因重排，实现全面的B-ALL分类 | NA | 开发一个用户友好的平台，用于B-细胞急性淋巴母细胞白血病的综合、准确和全面分类 | B-细胞急性淋巴母细胞白血病的分类 | 数字病理学 | 白血病 | RNA测序 | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 2,955个B-ALL RNA测序样本和974个验证样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1452 | 2024-08-17 |
Upregulation of exosome secretion from tumor-associated macrophages plays a key role in the suppression of anti-tumor immunity
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113224
PMID:37805922
|
研究论文 | 本文报道了肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)分泌的外泌体在抑制抗肿瘤免疫中的关键作用 | 首次揭示了TAMs通过增加外泌体分泌来抑制CD8 T细胞的增殖和功能，并提出靶向外泌体作为改善免疫疗法的潜在策略 | NA | 探讨肿瘤相关巨噬细胞分泌的外泌体在抑制抗肿瘤免疫中的作用及机制 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)、外泌体、CD8 T细胞 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及患者黑色素瘤组织和小鼠黑色素瘤模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1453 | 2024-08-15 |
Characterization of Wnt signaling pathway under treatment of Lactobacillus acidophilus postbiotic in colorectal cancer using an integrated in silico and in vitro analysis
2023-12-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-50047-x
PMID:38151510
|
研究论文 | 本研究通过整合计算和体外实验分析，探讨了乳酸菌酸ophilus后生物制剂对结直肠癌中Wnt信号通路的影响 | 首次采用单细胞RNA测序和深度学习方法ExpiMap分析结直肠癌中的差异表达基因，并研究了乳酸菌酸ophilus后生物制剂对其的影响 | 研究仅限于HT-29细胞系，未来研究应扩展到其他细胞系和临床试验 | 探讨乳酸菌酸ophilus后生物制剂对结直肠癌中Wnt信号通路的影响及其治疗潜力 | 结直肠癌中的差异表达基因及乳酸菌酸ophilus后生物制剂对其的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、实时定量PCR(RT-qPCR)、流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | HT-29细胞系及正常邻近组织 | NA | NA | NA | NA |
| 1454 | 2024-08-14 |
Spatial Transcriptomic Cell-type Deconvolution Using Graph Neural Networks
2023-Jun-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.10.532112
PMID:37333198
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于图神经网络的细胞类型反卷积模型STdGCN，用于空间转录组数据的细胞类型解析 | STdGCN是首个结合单细胞RNA测序数据表达谱和空间转录组数据空间定位信息进行细胞类型反卷积的模型 | NA | 开发一种新的方法来解析空间转录组数据中的细胞类型 | 空间转录组数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 转录组数据 | 多个空间转录组数据集，包括人类乳腺癌Visium数据集和人类心脏空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1455 | 2024-08-14 |
Early Deregulation of Cholangiocyte NR0B2 During Primary Sclerosing Cholangitis
2023, Gastro hep advances
DOI:10.1016/j.gastha.2022.07.023
PMID:39130146
|
研究论文 | 本文通过PubMed数据挖掘，研究了原发性硬化性胆管炎（PSC）中胆管细胞NR0B2的早期失调，并探讨了其与代谢和癌前重编程的关系。 | 首次揭示了PSC中胆管细胞NR0B2的早期失调及其在代谢和癌前重编程中的作用，并提出了针对NR0B2的治疗策略。 | NA | 研究PSC中胆管细胞NR0B2的早期失调及其在疾病进展中的作用。 | 胆管细胞NR0B2的表达及其在PSC中的作用。 | NA | 原发性硬化性胆管炎 | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个PSC肝脏转录组训练和验证队列，FXR激动剂或FXR敲除小鼠肝脏转录组，Abcb4-/-小鼠PSC模型肝脏单细胞转录组。 | NA | NA | NA | NA |
| 1456 | 2024-08-13 |
Early transcriptomic signatures and biomarkers of renal damage due to prolonged exposure to embedded metal
2023-12, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-023-09806-9
PMID:37058270
|
研究论文 | 本文研究了长期暴露于嵌入金属导致的肾脏损伤的早期转录组特征和生物标志物 | 结合高通量转录组学和深度学习技术，有效识别受金属暴露影响的肾细胞，并发现miRNA-423作为早期系统性标志物 | NA | 研究长期暴露于有毒重金属导致的肾脏损伤的早期分子特征 | 肾脏组织和血清样本中的RNA | 数字病理学 | 肾脏损伤 | RNA测序 | 随机森林 | RNA | 使用大鼠模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 1457 | 2024-08-13 |
Hyperhomocysteinemia lowers serum testosterone concentration via impairing testosterone production in Leydig cells
2023-12, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-023-09819-4
PMID:37495868
|
研究论文 | 研究报告了高同型半胱氨酸血症（HHcy）通过影响睾丸间质细胞（LCs）中的睾酮生成，导致血清睾酮水平降低 | 首次揭示了HHcy通过下调关键转录因子Nr5a1及其相关基因，影响睾酮合成，并发现了新的细胞群——巨噬细胞样睾丸间质细胞（McLCs） | NA | 探讨高同型半胱氨酸血症对睾酮生成的影响及其机制 | 高同型半胱氨酸血症小鼠的睾丸间质细胞 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 高同型半胱氨酸血症小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 1458 | 2024-08-13 |
Trps1 acts as a regulator of Sf-1 transcription and testosterone synthesis in mouse Leydig cells
2023-12, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-023-09823-8
PMID:37531013
|
研究论文 | 本研究探讨了Trps1基因在小鼠Leydig细胞中对睾酮合成的影响及其机制 | 首次揭示了Trps1通过调节Sf-1转录和组蛋白乙酰化影响睾酮合成 | NA | 探索睾酮生物合成中的关键因素，为疾病研究和临床治疗提供新视角 | 小鼠Leydig细胞中的Trps1基因及其对睾酮合成的影响 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序分析 | NA | RNA | 小鼠Leydig细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1459 | 2024-08-13 |
Single-cell RNA sequencing reveals differences between force application and bearing in ankle cartilage
2023-12, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-023-09829-2
PMID:37783808
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了踝关节软骨在不同受力条件下的差异 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了踝关节软骨在受力和承力区域的分子差异 | 样本来自因致命事故死亡的捐赠者，可能影响结果的普遍性 | 深入了解软骨细胞在不同受力条件下的功能 | 踝关节软骨组织中的软骨细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 共分析了149,816个细胞，来自6名捐赠者的11个软骨组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1460 | 2024-08-11 |
Age-dependent Microglial Disease Phenotype Results in Functional Decline in Gut Macrophages
2023, Gastro hep advances
DOI:10.1016/j.gastha.2022.09.006
PMID:36908772
|
研究论文 | 研究探讨了年龄依赖性的肌肉层巨噬细胞（MMs）的遗传特征变化及其与微胶质细胞的比较 | 首次揭示了肌肉层巨噬细胞随年龄增长而出现的老年状态表型，及其与微胶质细胞疾病相关表型的相似性 | 研究主要集中在小鼠和人类组织上，可能需要更多物种的数据支持 | 识别肌肉层巨噬细胞在年龄依赖性变化中的遗传特征，并比较其与微胶质细胞的基因表达 | 小鼠和人类的肌肉层巨噬细胞及其基因表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序和定量实时PCR | NA | 基因表达数据 | 年轻（3个月）和老年（16-24个月）的C57BL/6小鼠及人类组织 | NA | NA | NA | NA |