单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5350 篇文献，本页显示第 1441 - 1460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1441 | 2024-08-05 |
Systematic characterization of therapeutic vulnerabilities in Multiple Myeloma with Amp1q reveals increased sensitivity to the combination of MCL1 and PI3K inhibitors
2023-Aug-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.01.551480
PMID:37577538
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研究论文 | 本研究系统性地表征了具有Amp1q的多发性骨髓瘤的治疗脆弱性 | 揭示了MCL1和PI3K抑制剂组合对具有Amp1q的多发性骨髓瘤的增加敏感性 | 未提及具体限制 | 开发针对具有Amp1q的多发性骨髓瘤患者的靶向治疗 | 带有和不带有Amp1q的多发性骨髓瘤亚克隆 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用相同患者肿瘤中的不同亚克隆进行比较，具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 1442 | 2024-08-04 |
scKINETICS: inference of regulatory velocity with single-cell transcriptomics data
2023-06-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad267
PMID:37387147
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研究论文 | 本研究提出了scKINETICS，一个用于推断细胞速度的基因表达动态模型 | 引入了同时学习每个细胞转录速度和基因调控网络的期望最大化方法，揭示了新的调控因子 | 没有提及具体的限制因素 | 研究转录动态与基因表达变异之间的关系 | 急性胰腺炎数据集中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | 动态模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1443 | 2024-08-05 |
Ligament injury in adult zebrafish triggers ECM remodeling and cell dedifferentiation for scar-free regeneration
2023-Sep-19, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-023-00329-9
PMID:37726321
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研究论文 | 这项研究揭示了成年斑马鱼韧带在损伤后的无疤痕再生能力 | 建立了一个新的成年无疤痕韧带再生模型，强调了免疫和间充质细胞相互作用在细胞外基质重塑中的作用 | 尚未明确不同免疫细胞在再生过程中的具体功能 | 研究成年斑马鱼韧带受伤后的再生机制 | 成年斑马鱼的韧带组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | NA | 斑马鱼数目未具体提及 | NA | NA | NA | NA |
| 1444 | 2024-08-04 |
Identification of ulcerative colitis-specific immune cell signatures from public single-cell RNA-seq data
2023-07, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-023-01390-w
PMID:37133723
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研究论文 | 本研究利用公共单细胞RNA-seq数据研究溃疡性结肠炎的组织微环境 | 研究揭示了溃疡性结肠炎特异性的免疫细胞标志，并探讨了不同免疫细胞间的相互作用 | 未提及所有数据集的细胞类型注释，可能影响细胞群体的选择 | 研究溃疡性结肠炎的组织微环境及其免疫细胞机制 | 溃疡性结肠炎患者的免疫细胞亚群 | 数字病理 | 肠道炎症 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及的样本量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 1445 | 2024-08-05 |
Peripheral Ischemia Imprints Epigenetic Changes in Hematopoietic Stem Cells to Propagate Inflammation and Atherosclerosis
2023-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.318956
PMID:36891902
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研究论文 | 本研究探讨了外周缺血对造血干细胞的表观遗传变化及其在炎症和动脉粥样硬化中的作用 | 揭示了外周缺血后HSPC的迁移和增殖增加，并确认了IL-3Rb和IL-1R1在炎症和动脉粥样硬化加剧中的关键作用 | 未详细阐明外周动脉疾病患者炎症加剧的具体机制 | 研究外周缺血如何影响造血干细胞及其在慢性炎症和动脉粥样硬化中的潜在作用 | 使用外周动脉疾病患者的外周血和不同饮食条件下的啮齿类动物 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | RNA测序，流式细胞术 | Apoe-/-小鼠，C57BL/6J小鼠 | 血液样本，骨髓样本 | 外周动脉疾病患者的样本和数个小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1446 | 2024-08-04 |
Investigating the Role of Ferroptosis-Related Genes in Ovarian Aging and the Potential for Nutritional Intervention
2023-05-25, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu15112461
PMID:37299424
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研究论文 | 本研究探讨了铁死亡相关基因对卵巢衰老的影响及营养干预的潜力 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序研究铁死亡与卵巢衰老的关系 | 缺乏广泛的样本数据支持和长期效果评估 | 探讨铁死亡相关基因在卵巢衰老中的作用及营养补充的效果 | 75名卵巢衰老不足患者 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 75名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1447 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics analysis identifies a unique tumor-promoting function of the meningeal stroma in melanoma leptomeningeal disease
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572266
PMID:38187574
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研究论文 | 本研究描述了在黑色素瘤脑膜下疾病中脑膜间质的肿瘤促进功能 | 首次揭示了脑膜间质在黑色素瘤LMD中的肿瘤促进作用及其机制 | 仅针对特定肿瘤微环境进行研究，结果可能不适用于其它类型的转移性肿瘤 | 研究黑色素瘤脑膜下疾病的肿瘤微环境与肿瘤细胞之间的相互作用 | 侧重于黑色素瘤LMD的脑膜组织及对应的外脑转移位点 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组分析 | NA | 组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1448 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals dysregulated fibroblast subclusters in prurigo nodularis
2023-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.29.526050
PMID:36778229
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研究论文 | 单细胞RNA测序揭示了瘙痒结节病中失调的成纤维细胞亚群。 | 本研究首次识别了瘙痒结节病中的七个独特的成纤维细胞亚群，并揭示了成纤维细胞与神经元之间的相互作用。 | 研究仍未完全理解瘙痒结节病的发病机制，且样本主要集中在黑人患者。 | 本研究旨在揭示瘙痒结节病的致病机制及相关细胞组分。 | 研究对象为28,695个瘙痒结节病损及非病损皮肤细胞。 | 数字病理学 | 瘙痒结节病 | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 28695个瘙痒结节病细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1449 | 2024-08-04 |
Mapping visual functions onto molecular cell types in the mouse superior colliculus
2023-06-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.03.036
PMID:37086721
|
研究论文 | 本研究揭示了小鼠上丘的不同神经元亚型及其在视觉功能中的角色 | 研究首次通过单细胞转录组学识别了28种神经元亚型，并提出小鼠上丘内抑制性神经元分子亚型的功能组织逻辑 | 研究主要集中在小鼠模型上，结果可能不适用于其他物种 | 探讨小鼠上丘神经元在视觉处理中的分子功能 | 成年小鼠的上丘神经元亚型及其对应的标记基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因转录数据 | 数万个成年小鼠上丘神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 1450 | 2024-08-04 |
Identification of Niche-Specific Gene Signatures between Malignant Tumor Microenvironments by Integrating Single Cell and Spatial Transcriptomics Data
2023-10-31, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14112033
PMID:38002976
|
研究论文 | 该文章提出了一种整合单细胞RNA测序和空间转录组数据的方法，以识别恶性肿瘤微环境中的特定基因特征 | 通过整合scRNA-seq和空间转录组数据，识别特定于细胞生态位的基因特征，展示了这一整合方法的潜力 | 未提及具体的局限性 | 旨在综合评估组织样本中的基因活性并识别细胞生态位特异性基因特征 | 研究对象包括五种癌症类型的配对或匹配的scRNA-seq和Visium平台数据 | 数字病理学 | 乳腺癌、胃肠道间质肿瘤、肝细胞癌、子宫内膜癌、卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及五种癌症类型的配对或匹配样本数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1451 | 2024-08-04 |
Targeting intratumor heterogeneity suppresses colorectal cancer chemoresistance and metastasis
2023-08-03, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256416
PMID:37338390
|
研究论文 | 本文研究了肠道肿瘤异质性的建立及其对结直肠癌化疗抗性和转移的影响 | 创新点在于揭示了结直肠癌干细胞样细胞的不对称分裂在早期肿瘤异质性建立中的关键作用 | 本研究仅集中于结直肠癌，可能无法广泛适用于其他类型癌症 | 研究肠内肿瘤异质性的建立及其对结直肠癌治疗的影响 | 研究对象为结直肠癌干细胞样细胞及其衍生的细胞亚型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 七个细胞亚型的异种移植模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1452 | 2024-08-04 |
Immune mechanisms shape the clonal landscape during early progression of prostate cancer
2023-06-19, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.04.010
PMID:37148881
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研究论文 | 本文探讨了免疫微环境在前列腺癌早期进展中调节肿瘤克隆景观的作用 | 研究展示了肿瘤中的多克隆景观与微环境的关系，并揭示了免疫编辑在克隆生存中的重要性 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类前列腺癌的复杂性 | 探讨免疫微环境如何影响肿瘤内异质性和克隆景观 | 主要研究了前列腺癌小鼠模型中的肿瘤微环境和克隆动态 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学，基因工程小鼠模型 | NA | NA | 使用了基因工程小鼠模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 1453 | 2024-08-05 |
Genomic Insights into Molecular Regulation Mechanisms of Intramuscular Fat Deposition in Chicken
2023-12-10, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14122197
PMID:38137019
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综述 | 本文综述了影响鸡肉中 intramuscular fat (IMF) 沉积的分子调控机制 | 通过多种基因组学方法，系统描述了与IMF沉积相关的遗传和表观遗传因素 | NA | 探索鸡肉中IMF沉积的分子调控机制 | 鸡肉中的内脏脂肪沉积 | 数字病理学 | NA | 全基因组关联研究, 整个转录组测序, 蛋白质组测序, 单细胞RNA测序, 高通量染色体构象捕获, DNA甲基化测序, mA甲基化测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1454 | 2024-08-04 |
Comparative Analysis of Single-cell and Single-nucleus RNA-sequencing in a Rabbit Model of Retinal Detachment-related Proliferative Vitreoretinopathy
2023-Dec, Ophthalmology science
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.xops.2023.100335
PMID:37496518
|
研究论文 | 本研究比较了兔子模型中与视网膜脱离相关的增生性玻璃体视网膜病的单细胞和单核RNA测序 | 创新点在于结合使用单细胞RNA测序和单核RNA测序，以更准确地识别与增生性玻璃体视网膜病相关的转录网络 | 两种RNA测序技术的局限性均被强调，特别是在细胞类型捕获率方面 | 研究增生性玻璃体视网膜病的发病机制 | 使用兔子模型诱导的单侧增生性玻璃体视网膜病变 | 数字病理学 | 增生性玻璃体视网膜病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 兔子眼睛的增生性玻璃体视网膜病样本及对侧眼作为对照 | NA | NA | NA | NA |
| 1455 | 2024-08-04 |
Characterization of Chemotaxis-Associated Gene Dysregulation in Myeloid Cell Populations in the Lungs during Lipopolysaccharide-Mediated Acute Lung Injury
2023-06-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200822
PMID:37163318
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研究论文 | 本研究探讨了在脂多糖介导的急性肺损伤中的化学趋向因子及其受体对骨髓细胞群体的调节作用 | 揭示了化学趋向因子配体与受体相互作用导致骨髓细胞异质性及细胞招募至肺部的机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全代表人类情况 | 研究脂多糖介导的急性肺损伤中化学趋向因子的作用 | C57BL/6J小鼠中的骨髓细胞群体 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | C57BL/6J小鼠，未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 1456 | 2024-08-04 |
Immune profiling of murine cardiac leukocytes identifies triggering receptor expressed on myeloid cells 2 as a novel mediator of hypertensive heart failure
2023-10-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad093
PMID:37314125
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研究论文 | 本文探讨了小鼠模型中Trem2在高血压性心力衰竭中的新型介导作用 | 发现Trem2在高血压性心力衰竭中的心脏保护作用，并表明其在心脏免疫细胞中的调控 | 尚未确定Trem2在高血压性心力衰竭具体机制的详细信息 | 研究心脏免疫细胞在HFpEF中的改变及其潜在的治疗策略 | 高血压性心力衰竭小鼠模型及其心脏免疫细胞 | 数字病理学 | 心力衰竭 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用小鼠模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 1457 | 2024-08-05 |
Gene signature from cutaneous autoimmune diseases provides potential immunotherapy-relevant biomarkers in melanoma
2023-09-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-42238-3
PMID:37700026
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研究论文 | 本研究探讨了自身免疫性皮肤病中T细胞基因特征在黑色素瘤免疫治疗中的应用潜力 | 提出了自身免疫性皮肤病的基因特征可以作为预测黑色素瘤免疫治疗反应的生物标志物 | 研究可能限制于特定类型的自身免疫性皮肤病，样本数量和多样性尚需进一步验证 | 探讨自身免疫性皮肤病的免疫细胞在黑色素瘤免疫治疗中的有效性 | 自身免疫性皮肤病（系统性红斑狼疮、特应性皮炎、银屑病）中的T细胞基因特征 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自多种自身免疫性皮肤病的样本，具体数量未在摘要中明确 | NA | NA | NA | NA |
| 1458 | 2024-08-05 |
Reanalysis of single-cell RNA sequencing data does not support herpes simplex virus 1 latency in non-neuronal ganglionic cells in mice
2023-Jul-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.17.549345
PMID:37503290
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研究论文 | 本文重新分析了单细胞RNA测序数据，未能支持小鼠非神经节细胞中存在单纯疱疹病毒1型的潜伏感染。 | 研究证明了在小鼠模型中，数据分析的不准确性导致了对潜伏病毒存在的错误结论。 | 该研究依赖于现有数据，未能提供新的实验数据。 | 重新分析与单纯疱疹病毒潜伏感染相关的RNA测序数据。 | 小鼠模型中的非神经节细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1459 | 2024-08-07 |
Chemoenzymatic Measurement of LacNAc in Single-Cell Multiomics Reveals It as a Cell-Surface Indicator of Glycolytic Activity of CD8+ T Cells
2023-06-14, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.3c02602
PMID:37276352
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研究论文 | 本文报道了一种化学酶法用于单细胞水平检测N-乙酰乳糖胺（LacNAc），并通过特定DNA条形码标记LacNAc，揭示了其在CD8+ T细胞中的糖酵解活性指示作用。 | 开发了一种新的化学酶法用于单细胞水平的LacNAc检测，该方法与多种单细胞RNA测序平台兼容，并能与TCR序列和细胞表面表位信息（如scTCR和CITE-seq）结合进行多组学分析。 | NA | 研究单细胞水平上LacNAc作为CD8+ T细胞糖酵解活性指示的生物学作用。 | CD8+ T细胞的糖酵解活性和LacNAc水平。 | 生物化学 | NA | 化学酶法 | NA | 单细胞RNA测序 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 1460 | 2024-08-05 |
Creeping fat exhibits distinct Inflammation-specific adipogenic preadipocytes in Crohn's disease
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1198905
PMID:38111581
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研究论文 | 本研究分析了克罗恩病患者中的爬行脂肪及其与炎症特异性脂肪前体细胞的关系 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了爬行脂肪中与炎症和纤维化相关的脂肪前体细胞的特征 | 尚未完全理解爬行脂肪在克罗恩病纤维化发展中的潜在机制 | 分析克罗恩病中爬行脂肪的转录组特征，探索与纤维化和炎症的关系 | 研究了克罗恩病患者的爬行脂肪及其相关的预脂肪细胞群体 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |