单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 1421 - 1440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1421 | 2024-08-04 |
Allograft tissue under the microscope: only the beginning
2023-04-01, Current opinion in organ transplantation
IF:1.8Q3
DOI:10.1097/MOT.0000000000001052
PMID:36787238
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review | 回顾了肾移植活检的新方法，以补充当前的Banff分类方案 | 引入了人工智能、机器学习和数字病理学等新方法来改进移植组织的检查 | 活检的内在抽样误差和没有自动形态测量分析限制了其在移植健康预后中的表现 | 探索可以改进肾移植组织活检分析的新方法 | 肾移植活检样本和相关组织研究 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | AI和ML算法 | 组织样本 | NA |
| 1422 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomic heterogeneity between conduit and resistance mesenteric arteries in rats
2023-04-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
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研究论文 | 该文章探讨了大鼠导管和阻力肠系膜动脉中内皮细胞的单细胞转录组异质性 | 通过单细胞RNA测序，揭示了不同动脉节段的内皮和血管平滑肌细胞在表型上的差异 | 仅基于9只成年雄性斯普拉格-道利大鼠进行研究，可能限制了结果的外推性 | 研究内皮细胞和血管平滑肌细胞在不同动脉之间的表型异质性 | 成年雄性斯普拉格-道利大鼠的不同径向动脉 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9只成年雄性斯普拉格-道利大鼠，分为6个样本 |
| 1423 | 2024-08-04 |
MicroRNA-155 Plays Selective Cell-Intrinsic Roles in Brain-Infiltrating Immune Cell Populations during Neuroinflammation
2023-04-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200478
PMID:36883849
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研究论文 | 本研究探讨了miR-155在神经炎症中浸润的免疫细胞群体中的细胞内作用 | 本研究首次确认了miR-155在不同免疫细胞中的特异性作用，展示了通过条件性KO方法对其功能的重要见解 | 研究未能确定miR-155在浸润的巨噬细胞中的作用 | 研究miR-155在多发性硬化症模型中不同免疫细胞群体的重要性 | 主要研究对象为小鼠模型中的T细胞、巨噬细胞和树突状细胞 | 数字病理学 | 神经炎症 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除（KO）模型 | RNA序列数据 | 多个小鼠样本，包括全球miR-155 KO小鼠和野生型对照小鼠 |
| 1424 | 2024-08-04 |
NOX1 is essential for TNFα-induced intestinal epithelial ROS secretion and inhibits M cell signatures
2023-04, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-326305
PMID:36191961
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研究论文 | 本文探讨了NOX1缺失如何影响肠道上皮ROS分泌及M细胞特征 | 揭示了NOX1缺失对M细胞诱导的影响及其在UC炎症中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型，可能不能完全反映人类疾病的复杂性 | 探讨NOX1在炎症性肠病（IBD）中的角色和机制 | 以NOX1基因型和TNFα刺激分层的肠道类器官为研究对象 | 数字病理学 | 肠炎 | 单细胞转录组分析，免疫组化 | 小鼠 | 基因表达数据 | 使用了多个人来源的肠道类器官和小鼠模型 |
| 1425 | 2024-08-04 |
Osteoimmunology in Periodontitis and Orthodontic Tooth Movement
2023-04, Current osteoporosis reports
IF:4.2Q1
DOI:10.1007/s11914-023-00774-x
PMID:36862360
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review | 综述免疫细胞在牙周炎和正畸牙齿移动中的作用及其与其他细胞的相互作用 | 首次结合单细胞RNA测序揭示不同细胞类型在对抗细菌挑战中的作用 | 未能详细探讨系统性疾病对免疫反应的影响 | 研究免疫细胞与牙周组织中细胞的相互作用在牙周炎和正畸牙齿移动中的作用 | 牙周炎和正畸牙齿移动中细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 1426 | 2024-08-07 |
Chronic jetlag accelerates pancreatic neoplasia in conditional Kras-mutant mice
2023-04, Chronobiology international
IF:2.2Q3
DOI:10.1080/07420528.2023.2186122
PMID:36912021
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研究论文 | 研究探讨了慢性时差对携带胰腺特异性激活突变的小鼠胰腺癌发生的影响 | 首次揭示了非细胞自主性时钟功能障碍在加速胰腺癌前病变发展中的作用，并通过单细胞RNA测序识别了与时钟依赖性变化最相关的细胞群 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步的人体研究来验证这些发现 | 探究时钟错位与胰腺癌之间的关联及其机制 | 携带胰腺特异性激活突变的小鼠 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1427 | 2024-08-07 |
Preneoplastic stromal cells promote BRCA1-mediated breast tumorigenesis
2023-04, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-023-01298-x
PMID:36914836
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研究论文 | 本文研究了BRCA1突变携带者中，癌前基质细胞如何促进乳腺肿瘤的发生 | 首次揭示了癌前基质微环境在BRCA1驱动的肿瘤发生中的作用，特别是通过促进上皮细胞增殖和改变腔前体细胞的分化 | NA | 探讨BRCA1突变携带者中癌前基质细胞对乳腺肿瘤发生的影响 | BRCA1突变携带者的乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类癌前BRCA1和非携带者的乳腺组织 |
| 1428 | 2024-08-04 |
Identifying the programmed cell death index of hepatocellular carcinoma for prognosis and therapy response improvement by machine learning: a bioinformatics analysis and experimental validation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1298290
PMID:38170006
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研究论文 | 本研究探讨了程序性细胞死亡与肝细胞癌之间的关联，并构建了用于预后和治疗反应预测的程序性死亡指数。 | 提出了一种基于机器学习的整合框架来构建程序性死亡指数（PCDI），超越了以往的预后模型。 | 研究可能存在数据来源的局限性，未提供样本具体数量的信息。 | 阐明程序性细胞死亡与肝细胞癌之间的关系，以改善临床管理及个体化治疗。 | 肝细胞癌患者，关注程序性死亡相关基因及其临床特征。 | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞测序，蛋白质组学 | 机器学习 | 基因数据，蛋白质组学数据 | NA |
| 1429 | 2024-08-07 |
Immune and oxidative stress disorder in ovulation-dysfunction women revealed by single-cell transcriptome
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1297484
PMID:38116006
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了排卵功能障碍女性中免疫和氧化应激紊乱的情况 | 首次系统性地分析了排卵功能障碍女性中免疫图谱的变化，并揭示了cDC介导的信号通路对炎症反应的重要贡献 | NA | 深入了解排卵功能障碍的机制，为更好的诊断和治疗提供依据 | 排卵功能障碍女性中的免疫细胞和氧化应激 | NA | 排卵功能障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 80,689个PBMCs样本 |
| 1430 | 2024-08-07 |
Lineage tracing of T cell differentiation from T-iPSC by 2D feeder-free culture and 3D organoid culture
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1303713
PMID:38162650
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研究论文 | 本研究通过2D无饲养层培养和3D类器官培养追踪T细胞分化，分析了T-iPS-T细胞在不同培养阶段的单细胞水平数据，并识别了关键基因用于CD4+ T-iPS-T细胞的诱导。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，比较了2D无饲养层培养和3D类器官培养中T-iPS-T细胞的关键基因，为CD4+ T细胞的生成提供了新的见解。 | 研究主要集中在T-iPS-T细胞的基因表达分析，未涉及这些细胞在免疫治疗中的实际应用效果。 | 旨在通过追踪T细胞分化过程，优化T-iPS-T细胞的培养条件，以促进其在免疫治疗中的应用。 | 研究对象为从抗原特异性T细胞衍生的诱导多能干细胞（T-iPS-T细胞）。 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及多个T-iPS-T细胞样本和人类胸腺细胞数据集 |
| 1431 | 2024-08-07 |
Elucidating common pathogenic transcriptional networks in infective endocarditis and sepsis: integrated insights from biomarker discovery and single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1298041
PMID:38332910
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研究论文 | 本研究通过微阵列数据和单细胞RNA测序数据，揭示了感染性心内膜炎和脓毒症在转录水平上的共同致病机制，并发现了相关的生物标志物。 | 首次综合利用微阵列和单细胞RNA测序技术，揭示了感染性心内膜炎和脓毒症的共同致病机制，并发现了新的治疗靶点。 | 数据量有限，实验验证不足。 | 旨在揭示感染性心内膜炎和脓毒症的共同致病机制，并发现新的治疗靶点和生物标志物。 | 感染性心内膜炎和脓毒症的共同致病机制及相关的生物标志物。 | 数字病理学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 1432 | 2024-08-07 |
Apoptosis recognition receptors regulate skin tissue repair in mice
2023-Dec-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86269
PMID:38127424
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，探讨了在小鼠皮肤伤口早期炎症期间，细胞凋亡途径和吞噬凋亡细胞受体在纤维母细胞和免疫细胞中的上调情况，并分析了其在伤口修复中的作用。 | 本研究首次揭示了Axl信号在小鼠伤口修复中的必要性，以及Timd4受体在吞噬凋亡细胞和伤口修复中的作用，为慢性伤口的治疗提供了潜在的靶点。 | 研究主要集中在小鼠模型上，对人类糖尿病足伤口的应用和效果需要进一步验证。 | 探讨细胞凋亡识别受体在皮肤组织修复中的调控机制。 | 小鼠皮肤伤口的早期炎症过程。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠皮肤伤口样本 |
| 1433 | 2024-08-04 |
Cellular and transcriptome signatures unveiled by single-cell RNA-Seq following ex vivo infection of murine splenocytes with Borrelia burgdorferi
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1296580
PMID:38149246
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠脾细胞在Borrelia burgdorferi感染后的特征 | 首次利用GFP标记的Borrelia burgdorferi对小鼠脾细胞进行单细胞RNA测序分析，揭示了免疫响应的分子和细胞特征 | 研究结果主要基于小鼠模型，可能无法完全转化至人类 | 揭示Borrelia burgdorferi感染后宿主的免疫反应和相关生物标志物 | 感染Borrelia burgdorferi的小鼠脾细胞 | 数字病理学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从小鼠中分离的GFP+和GFP-脾细胞 |
| 1434 | 2024-08-07 |
Multi-omics analyses unravel DNA damage repair-related clusters in breast cancer with experimental validation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1297180
PMID:38022619
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了乳腺癌中与DNA损伤修复（DDR）相关的特征，并通过实验验证了其分类 | 本研究首次构建了DDR分类，并通过多层队列分析验证了DDR评分，揭示了恶性细胞在单细胞水平上对DDR评分的贡献 | NA | 研究乳腺癌中DNA损伤修复的异质性，并探索其个性化分子和临床病理机制 | 乳腺癌中的DNA损伤修复相关特征 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多组学分析 | NA | 转录组学、基因组学、单细胞转录组数据 | 276个DDR相关基因，多个公共数据集包括SCAN-B数据集、METABRIC数据库和TCGA-BRCA数据库 |
| 1435 | 2024-08-04 |
Retinoic acid drives intestine-specific adaptation of effector ILC2s originating from distant sites
2023-12-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221015
PMID:37773047
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研究论文 | 该研究展示了小肠微环境中效应性ILC2细胞的适应性变化及其功能 | 展示了效应性ILC2细胞能够在不同组织微环境中适应并改变表型的机制 | 研究主要集中在小肠和寄生虫感染的模型上，可能无法全面适用所有类型的组织适应 | 探讨效应性ILC2细胞在不同组织微环境中的适应性及其功能 | 小鼠效应性2型天生淋巴样细胞 (ILC2s) | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞数据 | 小鼠多个器官的ILC2细胞 |
| 1436 | 2024-08-07 |
Hepatitis C virus infects and perturbs liver stem cells
2023-Nov-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01318-23
PMID:37938000
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研究论文 | 本文研究了丙型肝炎病毒（HCV）感染肝干细胞并干扰其正常功能，导致肝脏损伤和癌症风险增加的情况。 | 首次发现HCV可以感染肝干细胞，并通过转录重编程促进癌细胞发展和免疫反应改变。 | NA | 探讨HCV感染如何导致肝脏疾病进展和增加癌症风险。 | 肝干细胞和由其衍生的3D肝脏类器官。 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自活动性HCV感染个体的肝干细胞衍生的3D肝脏类器官 |
| 1437 | 2024-08-04 |
Robust enhancer-gene regulation identified by single-cell transcriptomes and epigenomes
2023-Jul-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100342
PMID:37492103
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和表观基因组数据识别增强子与基因之间的调控关系 | 提出了一种基于非参数置换的程序，以控制增强子-基因关联研究中的假阳性风险 | 未提及具体的样本大小和多样性限制 | 研究如何通过单细胞测序数据实现增强子与基因的稳健链接 | 包括小鼠和人脑的多种组织的大规模转录组和表观基因组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 1438 | 2024-08-04 |
Integrative analysis of disulfidptosis and immune microenvironment in hepatocellular carcinoma: a putative model and immunotherapeutic strategies
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1294677
PMID:38235128
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研究论文 | 本文研究了肝细胞癌中二硫键死亡及其免疫微环境的整合分析 | 建立了一个新模型以预测肝细胞癌患者的预后，并探讨了可能的治疗靶点 | NA | 探索肝细胞癌细胞的二硫键死亡及其与免疫微环境的关系 | 肝细胞癌细胞及其免疫微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 结合了多个RNA测序数据集 |
| 1439 | 2024-08-04 |
MediMer: a versatile do-it-yourself peptide-receptive MHC class I multimer platform for tumor neoantigen-specific T cell detection
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1294565
PMID:38239352
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研究论文 | 本研究开发了一种名为MediMer的平台，用于肿瘤新抗原特异性T细胞的检测 | MediMer是一个多功能自制的pMHC-I多聚体平台，能够以较少的操作时间定制并生产用于个体化肿瘤患者的新抗原检测 | 未提及具体的局限性 | 提高针对个体肿瘤患者新抗原的T细胞受体的发现能力 | 主要研究人类抗原特异性T细胞，特别是针对黑色素瘤患者的新抗原特异性T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 重组MHC分子 | NA | 细胞 | 黑色素瘤患者血液样本中发现稀有T细胞亚群 |
| 1440 | 2024-08-04 |
Amnion responses to intrauterine inflammation and effects of inhibition of TNF signaling in preterm Rhesus macaque
2023-Nov-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108118
PMID:37953944
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研究论文 | 研究了羊膜在子宫内炎症中的反应及TNF信号抑制的影响 | 使用非人类灵长类动物模型与人类队列对比研究了羊膜转录组，揭示了关键的分娩介导基因的调控机制 | 本研究主要基于一个非人类灵长类动物模型，可能存在物种之间的差异 | 阐明子宫内感染/炎症在母胎界面如何调节 | 比较早产猕猴模型与人类病人群体的羊膜转录组 | 数字病理学 | 早产 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 早产猕猴模型与人类病例的比较，即多个样本 |