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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-03-06 |
Spatial transcriptomics analysis of neoadjuvant cabozantinib and nivolumab in advanced hepatocellular carcinoma identifies independent mechanisms of resistance and recurrence
2023-09-18, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01218-y
PMID:37723590
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学分析肝细胞癌新辅助卡博替尼和纳武利尤单抗治疗后的肿瘤微环境，揭示了响应与非响应肿瘤的异质性机制 | 首次应用空间转录组学技术系统性描绘肝细胞癌新辅助联合治疗下的肿瘤微环境异质性，识别出PAX5模块激活和B细胞成熟在治疗响应中的关键作用，以及癌症相关成纤维细胞介导的细胞外基质重塑机制 | 样本量较小（仅15例患者），且仅基于单中心前瞻性试验数据，需要更大规模验证 | 探究肝细胞癌对现代系统性治疗（卡博替尼联合纳武利尤单抗）响应差异的分子和细胞机制 | 肝细胞癌患者的肿瘤切除标本 | 空间转录组学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 15例肝细胞癌患者（其中5例有病理响应） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 122 | 2026-03-06 |
An integrated genomic approach identifies follistatin as a target of the p63-epidermal growth factor receptor oncogenic network in head and neck squamous cell carcinoma
2023-Sep, NAR cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/narcan/zcad038
PMID:37492374
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研究论文 | 本文通过整合基因组学方法，识别了头颈鳞状细胞癌中p63-表皮生长因子受体致癌网络的关键靶点卵泡抑素 | 首次将卵泡抑素确定为p63的直接转录靶点，并揭示了其在连接TGF-β和EGFR通路中的功能作用，同时通过单细胞RNA测序数据明确了癌细胞是肿瘤微环境中卵泡抑素的主要来源 | 未详细探讨卵泡抑素在肿瘤微环境中与免疫细胞相互作用的分子机制 | 阐明头颈鳞状细胞癌中致癌基因及其下游靶点介导肿瘤进展的机制 | 头颈鳞状细胞癌患者样本和代表性细胞系模型 | 基因组学 | 头颈鳞状细胞癌 | 整合基因组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 来自头颈鳞状细胞癌患者和细胞系模型的多个转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 123 | 2026-03-06 |
Transcriptomic forecasting with neural ordinary differential equations
2023-Aug-11, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2023.100793
PMID:37602211
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研究论文 | 本文开发了一种基于神经常微分方程的方法RNAForecaster，用于预测单细胞中多个未来时间步的基因表达状态 | 提出了一种嵌入无关的方法，能够从具有时间信息的高通量数据集中短期预测未来表达状态 | NA | 解决从细胞状态快照推断轨迹到估计细胞基因表达时间变化的挑战 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经常微分方程 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 124 | 2026-03-06 |
Cellular barcoding tracks heterogeneous clones through selective pressures and phenotypic transitions
2023-07, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2023.03.008
PMID:37105856
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综述 | 本文综述了细胞条形码技术在追踪异质性癌症克隆亚群命运中的应用，特别是与单细胞转录组学结合，以克隆级分辨率分析分子机制 | 结合细胞条形码与单细胞转录组学，实现克隆水平的高分辨率纵向分析，为研究肿瘤异质性起源和贡献提供了新工具 | NA | 探讨肿瘤细胞异质性的起源和贡献，以及选择和表型可塑性在疾病进展和治疗中的作用 | 异质性癌症细胞群体中的克隆亚群 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 125 | 2026-03-06 |
Spatial Single-Cell Technologies for Exploring Gastrointestinal Tissue Transcriptome
2023-06-26, Comprehensive Physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1002/cphy.c210053
PMID:37358516
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综述 | 本文总结了空间单细胞转录组技术在探索胃肠道组织转录组方面的最新进展及其对理解胃肠道生理学的促进作用 | 系统综述了新兴的空间单细胞技术如何通过提供全基因组水平的基因表达空间信息，弥补传统方法在解析胃肠道组织结构和细胞异质性方面的不足 | 作为一篇小型综述，未涉及具体实验数据或技术细节的深入分析，主要聚焦于技术概述和应用前景讨论 | 探讨空间单细胞转录组技术在胃肠道组织研究中的应用价值和发展前景 | 胃肠道组织及其多层次结构和异质性细胞群体 | 空间转录组学 | NA | 空间单细胞转录组技术 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 126 | 2026-03-06 |
TFAP2 paralogs regulate midfacial development in part through a conserved ALX genetic pathway
2023-Jun-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.16.545376
PMID:37398373
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研究论文 | 本研究揭示了TFAP2旁系同源物通过调控ALX基因表达，在脊椎动物中面部发育中发挥关键作用 | 首次通过联合失活TFAP2A和TFAP2B，结合bulk和单细胞RNA-seq分析，揭示了TFAP2在调控中面部基因调控网络中的核心作用，并证实了TFAP2-ALX调控轴在脊椎动物间的保守性 | 研究主要基于小鼠和斑马鱼模型，在人类或其他哺乳动物中的直接验证尚需进一步探索 | 探究TFAP2旁系同源物在中面部发育中的调控机制 | 小鼠和斑马鱼的颅神经嵴细胞及中面部发育过程 | 发育生物学 | 面部畸形 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据, 染色质免疫沉淀数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 127 | 2026-03-06 |
Activation of Angiopoietin-Tie2 Signaling Protects the Kidney from Ischemic Injury by Modulation of Endothelial-Specific Pathways
2023-06-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000098
PMID:36787763
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研究论文 | 本研究探讨了通过激活Angiopoietin-Tie2信号通路来保护肾脏免受缺血性损伤的分子机制，并测试了一种新型angiopoietin模拟物Hepta-ANG1的治疗潜力 | 揭示了VE-PTP在缺血再灌注损伤中上调并抑制Tie2的机制，首次展示了Hepta-ANG1作为新型治疗生物制剂在单细胞水平上促进肾脏内皮细胞新亚群出现的能力 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证Hepta-ANG1的安全性和有效性 | 探究Angiopoietin-Tie2信号通路在缺血再灌注急性肾损伤中的保护作用及分子机制 | 小鼠肾脏内皮细胞及缺血再灌注损伤模型 | 单细胞组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用VE-PTP野生型或敲除小鼠及C57BL/6J小鼠进行实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 128 | 2026-03-06 |
RhoA GEF Mcf2lb regulates rosette integrity during collective cell migration
2023-Apr-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.19.537573
PMID:37131612
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研究论文 | 本研究利用斑马鱼后侧线原基作为模型系统，发现RhoA鸟嘌呤核苷酸交换因子Mcf2lb通过调控顶端收缩来维持集体细胞迁移过程中多细胞玫瑰花结结构的完整性 | 首次鉴定出Mcf2lb作为RhoA特异性GEF在调控多细胞玫瑰花结结构完整性中的关键作用，并揭示了其通过RhoA-Rock-2a-非肌肉肌球蛋白II信号轴调控顶端收缩的分子机制 | 研究主要基于斑马鱼模型系统，在哺乳动物系统中的保守性有待进一步验证；对Mcf2lb调控RhoA活性的具体生化机制尚未深入解析 | 探究多细胞玫瑰花结结构形成和维持的分子调控机制 | 斑马鱼后侧线原基中的多细胞玫瑰花结结构 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，整体原位杂交，活体成像，3D分析 | NA | 基因表达数据，成像数据 | 斑马鱼后侧线原基细胞群（约150个细胞） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 129 | 2026-03-06 |
Impaired Reorganization of Centrosome Structure Underlies Human Infantile Dilated Cardiomyopathy
2023-04-25, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究首次揭示人类婴儿扩张型心肌病由中心体结构重组缺陷引起，并发现RTTN基因在围产期心脏发育中的新作用 | 首次将中心体缺陷与非综合征性扩张型心肌病联系起来，并发现RTTN基因在心脏发育中的关键作用 | 研究基于单一罕见病例，未来需要更多样本验证；动物模型与人类疾病存在差异 | 探究中心体重组过程在心肌细胞生物学中的作用及其缺陷与人类心脏疾病的关系 | 婴儿扩张型心肌病患者、诱导多能干细胞、斑马鱼、果蝇模型 | 心血管疾病研究 | 扩张型心肌病 | 全外显子组测序、CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、图像数据 | 1名iDCM患者及其父母 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 130 | 2026-03-06 |
APOE modulates microglial immunometabolism in response to age, amyloid pathology, and inflammatory challenge
2023-03-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112196
PMID:36871219
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研究论文 | 本研究探讨了APOE基因型如何通过免疫代谢机制影响小胶质细胞的功能，特别是在衰老、神经炎症和阿尔茨海默病病理背景下 | 结合了bulk、单细胞和空间转录组学，以及细胞特异性和空间分辨的代谢分析，系统性地揭示了APOE4在小胶质细胞免疫代谢调控中的核心作用 | 研究基于小鼠模型表达人类APOE，可能无法完全模拟人类疾病的所有复杂性 | 探究APOE基因型对小胶质细胞免疫代谢的调控作用及其在衰老、神经炎症和阿尔茨海默病病理中的影响 | 表达人类APOE的小鼠模型中的小胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 质谱成像 | NA | 转录组数据, 代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 131 | 2026-03-06 |
Compressed phenotypic screens for complex multicellular models and high-content assays
2023-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.23.525189
PMID:36747859
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研究论文 | 本文提出了一种通过合并扰动和计算反卷积来压缩高通量表型筛选的方法，以提高复杂多细胞模型和高内涵检测的筛选效率 | 建立了压缩筛选方法，通过合并扰动和计算反卷积，显著提高了复杂多细胞模型和高内涵检测的筛选效率，并证明了其在药物发现和基础生物学中的通用性 | 未明确说明方法在更广泛生物模型或不同扰动类型中的适用性限制，也未讨论计算反卷积算法的潜在误差来源 | 开发一种高效的压缩表型筛选方法，以克服传统高通量筛选在复杂多细胞模型和高内涵检测中的规模限制 | 小分子化合物库、患者来源的胰腺癌类器官、肿瘤微环境相关的重组蛋白配体库 | 计算生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、高内涵成像 | 计算反卷积模型 | 图像数据、转录组数据 | 未明确指定具体样本数量，涉及小分子库和重组蛋白配体库的筛选 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 132 | 2026-03-05 |
Central lung gene expression associates with myofibroblast features in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-02, BMJ open respiratory research
IF:3.6Q1
DOI:10.1136/bmjresp-2022-001391
PMID:36725082
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析特发性肺纤维化（IPF）中央与周边肺组织的基因表达差异，揭示了中央肺区肌成纤维细胞特征与疾病进展的关联 | 首次系统比较IPF中央与周边肺组织的转录组差异，并识别出85个中央IPF相关基因（CAG），这些基因在肌成纤维细胞中高度表达且与疾病信号通路相关 | 研究样本量有限，且依赖于计算细胞去卷积方法而非直接单细胞实验验证 | 探究中央肺组织在特发性肺纤维化发病机制中的作用 | 特发性肺纤维化患者的中央与周边肺组织活检样本，以及非IPF肺组织对照 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序分析 | 计算细胞去卷积分析，网络分析 | 基因表达数据，组织活检数据 | 未明确具体样本数量，但包括配对IPF中央与周边肺组织及非IPF对照 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 133 | 2026-03-04 |
Integrating spatial and single-nucleus transcriptomic data elucidates microglial-specific responses in female cynomolgus macaques with depressive-like behaviors
2023-08, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01379-4
PMID:37443281
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单核RNA测序数据，揭示了雌性食蟹猴在抑郁样行为中特定于小胶质细胞的反应 | 首次在雌性非人灵长类动物中结合空间转录组学和单核RNA测序，识别出与抑郁样行为相关的小胶质细胞亚群及其在皮质层中的特异性分布 | 研究仅针对雌性食蟹猴，样本可能有限，且结果可能无法直接推广到人类或其他物种 | 探究重度抑郁障碍的细胞和分子机制，特别是在小胶质细胞中的特异性反应 | 雌性食蟹猴的背外侧前额叶皮质 | 数字病理学 | 重度抑郁障碍 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 雌性食蟹猴样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 134 | 2026-03-04 |
Atlas-scale single-cell chromatin accessibility using nanowell-based combinatorial indexing
2023-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.276655.122
PMID:36792372
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研究论文 | 本文介绍了基于纳米孔芯片的单细胞组合索引染色质可及性测定技术的进展，实现了大规模细胞通量（>10^5个细胞）的低成本测量 | 利用5184纳米孔芯片在PCR索引阶段实现规模提升52倍并降低单细胞制备成本，优化工作流程获得高比例峰值内读数（>80%）和低细胞双联率 | NA | 开发低成本、高通量的单细胞染色质可及性测定技术 | 小鼠脑组织样本 | 表观遗传学 | NA | 单细胞组合索引ATAC-seq | NA | 染色质可及性数据 | >10^5个细胞 | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | 基于纳米孔芯片的sciATAC平台 |
| 135 | 2026-03-02 |
Semi-reference based cell type deconvolution with application to human metastatic cancers
2023-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad109
PMID:38143958
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SECRET的新型去卷积方法，利用单细胞RNA测序数据中的细胞类型特异性基因表达谱，从批量RNA测序数据中准确估计细胞类型比例 | SECRET方法能够适应批量数据中存在的细胞类型在参考数据中未表示的情况，从而提高了参考选择的灵活性 | NA | 开发一种去卷积方法以从批量RNA测序数据中估计细胞类型比例，应用于人类转移性癌症研究 | 人类转移性癌症 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 去卷积方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 136 | 2026-03-02 |
Increased spatial coupling of integrin and collagen IV in the immunoresistant clear cell renal cell carcinoma tumor microenvironment
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.16.567457
PMID:38014063
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，分析了免疫治疗（IO）敏感与耐药性透明细胞肾细胞癌（ccRCC）肿瘤微环境中整合素与胶原蛋白IV的空间耦合变化 | 首次在细胞分辨率水平上，通过空间转录组学揭示了IO耐药性ccRCC肿瘤微环境中COL4A1-ITGAV配体-受体对的空间自相关性增强 | 样本量相对较小（21例），且主要依赖相关性分析，需要进一步的功能性实验验证 | 探究透明细胞肾细胞癌对免疫治疗产生耐药性的肿瘤微环境机制 | 免疫治疗初治（IO naïve）与经治（IO exposed）的原发性透明细胞肾细胞癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 空间分子成像（SMI）、空间基因集富集分析（GSEA）、多重免疫荧光（mIF）、数据库分析（TCGA、CPTAC） | NA | 空间转录组数据、图像数据、批量RNA表达数据、蛋白质组数据 | 21例患者样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 137 | 2026-03-02 |
Immune profiling of murine cardiac leukocytes identifies triggering receptor expressed on myeloid cells 2 as a novel mediator of hypertensive heart failure
2023-10-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad093
PMID:37314125
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析小鼠心脏免疫细胞，发现TREM2在高血压性心力衰竭中具有心脏保护作用 | 首次使用CITE-seq技术绘制高血压性心力衰竭小鼠模型的心脏免疫细胞图谱，并揭示TREM2在心脏保护中的新功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限，且机制研究仍需深入 | 探究高血压性心力衰竭的免疫机制，寻找新的诊断和治疗靶点 | 小鼠心脏免疫细胞，特别是巨噬细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞测序，CITE-seq | NA | 单细胞转录组和表面蛋白数据 | 小鼠模型，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 138 | 2026-03-02 |
Immunophenotypic correlates of sustained MRD negativity in patients with multiple myeloma
2023-09-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40966-8
PMID:37660077
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术，分析了多发性骨髓瘤患者在接受来那度胺维持治疗前后的免疫微环境，以探索与长期治疗反应相关的免疫表型特征 | 首次结合单细胞RNA测序和T细胞受体β测序与质谱流式细胞术，纵向比较了达到持续微小残留病灶阴性与未达到或无法维持阴性的患者免疫微环境差异 | 样本量较小（仅23名患者），且研究主要关注来那度胺治疗，可能无法推广到其他治疗方案 | 探索多发性骨髓瘤患者免疫微环境在维持疾病缓解中的作用，并发现与长期治疗反应相关的免疫表型相关性 | 新诊断的多发性骨髓瘤患者，接受连续来那度胺维持治疗 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, T细胞受体β测序, 质谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 质谱流式细胞术数据 | 23名患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 139 | 2026-03-02 |
Mammary duct luminal epithelium controls adipocyte thermogenic programme
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06361-5
PMID:37495690
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研究论文 | 本研究揭示了乳腺导管上皮细胞通过分泌因子调控雌性小鼠皮下白色脂肪组织中冷诱导的UCP1表达，从而影响脂肪细胞产热 | 首次发现乳腺导管上皮细胞分泌的“乳腺因子”在交感神经激活下限制脂肪细胞UCP1表达，揭示了性别特异性脂肪产热调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类中的相关性尚未验证；乳腺因子作用的具体分子通路需进一步阐明 | 探究乳腺导管上皮细胞在调控脂肪细胞产热程序中的作用机制 | 雌性小鼠的皮下白色脂肪组织及乳腺导管上皮细胞 | 细胞生物学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序，全组织免疫荧光3D可视化 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 雌性小鼠脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 140 | 2026-03-02 |
150 risk variants for diverticular disease of intestine prioritize cell types and enable polygenic prediction of disease susceptibility
2023-Jul-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100326
PMID:37492107
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研究论文 | 本研究通过大规模基因组关联分析，识别了150个与肠道憩室病相关的风险变异，并利用单细胞RNA测序数据揭示了特定细胞类型在疾病发展中的作用 | 首次整合GWAS结果与人类肠道单细胞RNA测序数据，明确了肠道肌细胞、间皮细胞、基质细胞以及肠神经元和胶质细胞在憩室病发展中的关键作用，并构建了有效的多基因风险评分模型 | 研究主要基于欧洲人群数据，可能限制了结果在其他人群中的普适性；功能验证实验不足，机制研究仍需深入 | 通过基因组学方法揭示肠道憩室病的遗传基础、风险预测和发病机制 | 724,372名个体的基因组数据及人类肠道单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | 肠道憩室病 | 全基因组关联分析（GWAS）、单细胞RNA测序 | 多基因风险评分（PGS） | 基因组数据、单细胞RNA测序数据 | 724,372名个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |