单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 5354 篇文献,本页显示第 121 - 140 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
121 2026-03-28
Protocol to assess fatal embolism risks from human stem cells
2023-Jun-16, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文提出了一种协议,用于识别人类脂肪来源多能基质细胞(ADSCs)中促栓塞亚群并预测ADSC输注的致命栓塞风险 开发了一种结合单细胞RNA-seq数据分析和数学建模的协议,以预测干细胞治疗中的栓塞风险 协议细节依赖于先前研究(Yan et al., 2022),可能需进一步验证 评估干细胞治疗中的栓塞风险,以提升细胞质量和临床应用安全性 人类脂肪来源多能基质细胞(ADSCs) 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA-seq 数学模型 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
122 2026-03-28
Isolation of human cutaneous immune cells for single-cell RNA sequencing
2023-Jun-16, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文介绍了一种从人类皮肤中分离高活性免疫细胞用于单细胞RNA测序的协议 提出了一种针对人类皮肤屏障特性的高活性免疫细胞分离方法,适用于单细胞RNA测序 协议依赖于酶解和流式细胞术,可能对细胞活性有特定要求,且未详细讨论所有潜在技术挑战 开发一种从人类皮肤中分离免疫细胞的方法,以支持单细胞RNA测序在炎症性疾病研究中的应用 人类皮肤活检样本中的免疫细胞 数字病理学 炎症性疾病 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
123 2026-03-28
Protocol for analyzing γδ T cells from the vagina of diet-induced obese mice using single-cell RNA sequencing and flow cytometry
2023-Jun-16, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文介绍了一种在高脂饮食诱导的肥胖小鼠中,通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析阴道γδ T细胞的实验方案 开发了针对肥胖小鼠阴道γδ T细胞分析的综合实验方案,结合单细胞RNA测序和流式细胞术,以研究肥胖对生殖器疱疹易感性的影响 NA 研究肥胖如何影响生殖器疱疹(由HSV-2引起)的易感性,并分析阴道γδ T细胞在其中的作用 高脂饮食诱导的肥胖小鼠的阴道γδ T细胞 数字病理学 生殖器疱疹 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
124 2026-03-28
Protocol for tumor dissociation and fluorescence-activated cell sorting of human head and neck cancers
2023-Jun-16, STAR protocols IF:1.3Q4
protocol 本文描述了一种用于新鲜人类头颈部肿瘤标本解离及荧光激活细胞分选获取活性单细胞的逐步操作方案 提供了一种标准化的头颈部肿瘤组织解离与单细胞分选流程,支持下游单细胞RNA测序和三维患者来源类器官生成等应用 NA 建立头颈部肿瘤单细胞研究的前处理实验方案 人类头颈部肿瘤组织 digital pathology head and neck cancer fluorescence-activated cell sorting (FACS), single-cell RNA sequencing, organoid culture NA NA NA NA single-cell RNA-seq NA NA
125 2026-03-28
Isolating peripheral blood mononuclear cells from HIV-infected patients for single-cell RNA sequencing and integration analysis
2023-Jun-16, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文介绍了一种从HIV感染患者中分离外周血单个核细胞并进行单细胞RNA测序及整合分析的实验方案 结合10x Genomics单细胞测序技术和Illumina NovaSeq平台,对HIV感染患者的PBMCs进行单细胞转录组分析,并整合B细胞亚群功能和BCR受体库轨迹分析 未提及样本量大小或具体患者特征,可能限制结果的普适性 研究HIV感染对免疫细胞转录组的影响 HIV感染患者的外周血单个核细胞 单细胞测序 HIV感染 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序 10x Genomics protocol, Illumina NovaSeq 6000 10x Genomics单细胞测序方案结合Illumina NovaSeq 6000测序平台
126 2026-03-25
Graph embedding and Gaussian mixture variational autoencoder network for end-to-end analysis of single-cell RNA sequencing data
2023-01-23, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 提出了一种名为autoCell的深度学习框架,用于单细胞RNA测序数据的端到端分析,包括插补、特征提取和疾病相关网络识别 结合图嵌入和概率深度高斯混合模型的变分自编码网络,用于处理高维稀疏scRNA-seq数据,并应用于细胞发育轨迹分析和疾病相关细胞鉴定 未明确说明模型在大型数据集上的计算效率或与其他先进方法的全面比较 开发一种深度学习方法来改善单细胞RNA测序数据的分析,包括插补和特征提取 单细胞RNA测序数据,包括模拟数据集和生物学相关数据集,如人类胚胎和阿尔茨海默病样本 机器学习 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 变分自编码器,高斯混合模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
127 2026-03-21
Identification of human exTreg cells as CD16+CD56+ cytotoxic CD4+ T cells
2023-10, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过整合小鼠模型和人类单细胞测序数据,鉴定并验证了人类exTreg细胞是具有细胞毒性的CD4+ T细胞亚群 首次将小鼠模型中的exTreg细胞转录组特征映射到人类单细胞数据,鉴定出CD16+CD56+的细胞毒性CD4+ T细胞作为人类exTreg细胞,并证实其克隆扩增和细胞毒功能 研究主要基于转录组和表面标志物分析,对exTreg细胞在动脉粥样硬化中的具体功能机制和临床意义需要进一步验证 鉴定人类动脉粥样硬化中由调节性T细胞转化而来的exTreg细胞的分子特征和功能特性 小鼠和人类的调节性T细胞(Treg)及其转化形成的exTreg细胞 免疫学 动脉粥样硬化 RNA-seq, scRNA-seq, CITE-seq, 流式细胞术, T细胞受体测序, 细胞杀伤实验, CD107a脱颗粒实验 NA 转录组数据, 单细胞数据, 流式数据, 序列数据 来自FoxP3ROSA26-Apoe小鼠模型的Treg和exTreg细胞,以及人类外周血样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, CITE-seq NA NA
128 2026-03-21
Reanalysis of single-cell RNA sequencing data does not support herpes simplex virus 1 latency in non-neuronal ganglionic cells in mice
2023-Jul-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过重新分析小鼠模型中的单细胞RNA测序数据,挑战了单纯疱疹病毒1型在非神经元神经节细胞中存在潜伏感染的观点 揭示了3'端单细胞RNA测序实验中脱靶引物效应导致非多聚腺苷酸化的HSV-1内含子RNA被错误检测,并首次系统论证了神经元细胞死亡导致的RNA污染是先前结论的主要成因 研究基于已发表数据的二次分析,缺乏新的实验验证;结论主要依赖于生物信息学推断,可能存在未考虑的技术偏差 验证单纯疱疹病毒1型潜伏感染的细胞特异性,澄清单细胞测序数据分析中的技术假象 小鼠外周神经节中的神经元与非神经元细胞 数字病理学 病毒感染 单细胞RNA测序 生物信息学分析流程 单细胞转录组数据 基于已发表小鼠模型单细胞数据集(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA 3'端单细胞RNA测序实验
129 2026-03-19
Single-cell level deconvolution, convolution, and clustering in spatial transcriptomics by aligning spot level transcriptome to nuclear morphology
2023-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为STIE的算法,通过将空间转录组数据与匹配的组织学图像中的核形态对齐,实现单细胞水平的去卷积、卷积和聚类分析 STIE算法首次通过核形态相似性和邻域信息,从斑点间高达约70%的间隙区域恢复缺失细胞,实现了真正的单细胞水平分析,超越了现有方法仅关注斑点大小提升的局限 算法依赖于匹配的组织学图像和核形态数据,可能受图像质量或配准误差影响,且在处理高度异质或重叠细胞时性能未完全评估 旨在解决基于斑点的空间转录组学中无法精确捕获单细胞转录组的问题,实现单细胞水平的分辨率提升 真实和模拟的空间转录组学数据,包括低分辨率和高分辨率斑点 数字病理学 NA 空间转录组学 EM算法 图像、文本(转录组数据) NA NA 空间转录组学 NA NA
130 2026-03-19
Endogenous adenine mediates kidney injury in diabetic models and predicts diabetic kidney disease in patients
2023-10-16, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究提出内源性腺嘌呤可能是糖尿病肾病(DKD)的致病因子,并探讨了尿腺嘌呤/肌酐比值(UAdCR)作为预测终末期肾病(ESKD)的机制性生物标志物的潜力 首次提出内源性腺嘌呤是DKD的致病因子,发现UAdCR可作为无大量白蛋白尿患者ESKD的预测生物标志物,并确定了腺嘌呤通过mTOR通路促进肾损伤的机制 研究主要基于观察性队列,因果关系需进一步实验验证;样本来自特定人群,结果外推需谨慎 探究内源性腺嘌呤在糖尿病肾病发生发展中的作用,并寻找预测DKD进展的机制性生物标志物 糖尿病患者(来自CRIC、SMART2D和美国印第安人研究)、糖尿病小鼠模型、肾小管细胞 代谢组学与转录组学 糖尿病肾病 空间代谢组学、单细胞转录组学 NA 尿液代谢物数据、空间代谢组数据、单细胞转录组数据 多个队列的糖尿病患者(具体人数未明确说明)、糖尿病小鼠模型 NA 空间代谢组学, 单细胞转录组学 NA NA
131 2026-03-19
Single-cell RNA sequencing identifies hippocampal microglial dysregulation in diet-induced obesity
2023-Mar-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了高脂饮食诱导的肥胖对海马区小胶质细胞功能失调的影响及其与认知障碍的关联 利用单细胞转录组学分析,揭示了肥胖状态下海马小胶质细胞在细胞间通讯、免疫调节和蛋白质处理方面的动态变化机制 研究基于小鼠模型,其机制在人类中的适用性仍需进一步验证 探究肥胖诱导的认知障碍中海马小胶质细胞激活的精确分子机制 高脂饮食诱导的肥胖小鼠模型中的海马小胶质细胞 数字病理学 老年疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
132 2026-03-19
Cross center single-cell RNA sequencing study of the immune microenvironment in rapid progressing multiple myeloma
2023-Jan-26, NPJ genomic medicine IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过多中心单细胞RNA测序,分析了快速进展型多发性骨髓瘤患者的骨髓免疫微环境特征 首次通过多中心协作的单细胞RNA测序研究,系统比较了快速进展与非进展多发性骨髓瘤患者的免疫微环境差异,并验证了不同研究中心数据的一致性 样本量相对有限(18名患者),且为横断面研究,无法确定观察到的细胞群变化与疾病进展的因果关系 探究多发性骨髓瘤快速进展的免疫微环境机制 多发性骨髓瘤患者的骨髓CD138样本 单细胞组学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 48份骨髓样本(来自18名患者),共计102,207个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
133 2026-03-18
An update on methods for detection of prognostic and predictive biomarkers in melanoma
2023, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
综述 本文综述了黑色素瘤中预后和预测性免疫生物标志物检测的最新方法 整合了从批量组织基因表达谱到单细胞空间转录组学和基于人工智能的图像分析等多种技术,以全面表征黑色素瘤免疫微环境 作为综述文章,未提供原始实验数据或新方法验证,主要总结现有研究 改进黑色素瘤的免疫基础预测和预后生物标志物检测方法 黑色素瘤患者,特别是II-IV期患者 数字病理学 黑色素瘤 基因表达谱分析,空间转录组学,人工智能图像分析 NA 图像,文本(基因表达数据) NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
134 2026-03-18
A novel lncRNA-mediated epigenetic regulatory mechanism in periodontitis
2023, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了长链非编码RNA lncR-APDC在牙周炎进展中的调控作用及其治疗潜力 首次揭示了lncR-APDC在牙周炎中的关键调控作用,发现了一个新的上皮细胞亚群,并提出了lncR-APDC与特定蛋白直接结合的可能性 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证;部分分子相互作用机制尚未完全阐明 理解lncR-APDC在牙周炎进展中的调控作用 lncR-APDC基因敲除小鼠、实验性牙周炎模型、牙周组织免疫细胞 表观遗传学 牙周炎 单细胞RNA测序、基因敲除、AAV9介导的基因治疗 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据 基因敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
135 2026-03-15
Single-Cell Sequencing of Lung Macrophages and Monocytes Reveals Novel Therapeutic Targets in COPD
2023-12-05, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析COPD患者肺组织中巨噬细胞和单核细胞的转录组特征,揭示了其功能失调和过度炎症状态,并识别出新的治疗靶点 首次在COPD患者肺组织中利用单细胞测序技术系统性地鉴定出16个转录组学上不同的巨噬细胞和单核细胞亚群,并发现吸入性皮质类固醇等化合物可调节这些细胞的转录组特征 研究样本量相对有限(COPD组18例,对照组28例),且主要基于体外组织分析,体内验证仅通过一项临床试验数据 探究COPD患者肺组织中巨噬细胞和单核细胞的转录组特征,识别新的治疗靶点 COPD患者和对照者的肺组织样本中的巨噬细胞和单核细胞 数字病理学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 COPD患者18例,对照者28例 NA 单细胞RNA-seq NA NA
136 2026-03-15
Single-Cell RNA Analysis Reveals Cell-Intrinsic Functions of CAR T Cells Correlating with Response in a Phase II Study of Lymphoma Patients
2023-Oct-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析CAR-T输注产品的转录谱,揭示了与淋巴瘤患者临床反应相关的细胞内在功能特征 首次在II期临床试验中,利用靶向单细胞RNA测序结合多色流式细胞术,将CAR-T输注产品的细胞内在特征与临床反应直接关联,并发现效应样CD8+ CAR-T的多功能性、高细胞毒性和细胞因子产生谱与低功能障碍特征与反应相关 样本量较小(n=24),且仅针对第三代CD19导向的CAR-T,可能限制结果的普适性 探究CAR-T输注产品质量对B细胞恶性肿瘤患者临床反应的影响 B细胞淋巴瘤(n=23)和白血病(n=1)患者接受CD19 CAR-T治疗的输注产品 单细胞组学 淋巴瘤 靶向单细胞RNA测序,多色流式细胞术 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 24名患者(23例淋巴瘤,1例白血病) NA 单细胞RNA-seq NA NA
137 2026-03-15
Single-cell RNA-sequencing identifies disease-associated oligodendrocytes in male APP NL-G-F and 5XFAD mice
2023-02-13, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术,在阿尔茨海默病小鼠模型及人类死后大脑中鉴定出一种疾病相关的少突胶质细胞亚群,并探讨了其通过Erk1/2信号通路在疾病进展中的作用 首次在阿尔茨海默病背景下鉴定出疾病相关的少突胶质细胞亚群,并揭示了Erk1/2信号通路在该细胞亚群激活及疾病病理中的关键作用 研究主要基于雄性小鼠模型,可能无法完全反映雌性个体或人类群体的全部情况,且人类样本来源于死后大脑,可能存在保存偏差 探究少突胶质细胞在阿尔茨海默病发病机制中的作用 雄性APP NL-G-F和5XFAD阿尔茨海默病小鼠模型的大脑组织,以及人类死后阿尔茨海默病患者的大脑组织 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 雄性APP NL-G-F和5XFAD小鼠大脑及人类死后AD大脑样本(具体数量未在摘要中明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
138 2026-03-14
Single cell RNA-seq in phytohormone signaling: a promising future
2023-Nov, Trends in plant science IF:17.3Q1
综述 本文探讨了单细胞RNA测序在植物激素信号传导研究中的应用前景 强调了scRNA-seq在解析激素介导的时空基因调控网络方面的独特潜力,并引用Nolan等人的研究作为案例 NA 探索单细胞RNA测序技术如何促进对植物激素信号传导机制的理解 植物激素信号传导及其在植物生长和发育中的作用 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
139 2026-03-14
Phase II trial of hypomethylating agent combined with nivolumab for acute myeloid leukaemia relapse after allogeneic haematopoietic cell transplantation-Immune signature correlates with response
2023-Oct, British journal of haematology IF:5.1Q1
研究论文 本研究是一项前瞻性II期临床试验,评估了低甲基化药物联合纳武利尤单抗治疗异基因造血干细胞移植后急性髓系白血病复发的疗效,并利用单细胞技术分析免疫特征与治疗反应的相关性 首次在异基因造血干细胞移植后复发AML患者中前瞻性评估HMA联合抗PD-1抗体纳武利尤单抗的疗效,并采用多组学单细胞技术深入解析免疫应答机制 单臂研究设计且样本量较小(16例患者),缺乏对照组,可能影响结果的普遍性 评估HMA联合纳武利尤单抗在allo-HCT后AML复发患者中的安全性和有效性,并探索免疫生物标志物 异基因造血干细胞移植后复发的急性髓系白血病患者 数字病理学 急性髓系白血病 单细胞DNA、RNA和蛋白质多组学技术,高参数流式细胞术,单细胞转录组学 NA 单细胞多组学数据,临床数据 16例患者 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 NA NA
140 2026-03-14
Tumor-specific CD4 T cells instruct monocyte fate in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-07-25, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过巨噬细胞命运示踪和单细胞RNA测序技术,揭示了胰腺导管腺癌中肿瘤特异性CD4 T细胞通过抗原呈递指导单核细胞分化为抗肿瘤巨噬细胞的机制 首次证明肿瘤特异性CD4 T细胞(而非CD8 T细胞)通过巨噬细胞的MHC II类抗原呈递,指导单核细胞分化为抗肿瘤巨噬细胞,并揭示了IFNγ和CD40信号的非冗余作用 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本的验证尚需进一步开展;单细胞测序样本量有限 探究胰腺导管腺癌中肿瘤相关巨噬细胞异质性的形成机制及免疫调控作用 胰腺导管腺癌小鼠模型中的单核细胞、巨噬细胞和T细胞 单细胞组学 胰腺癌 单细胞RNA测序,巨噬细胞命运示踪技术 NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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