单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5356 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-04-20 |
Simultaneous CRISPR screening and spatial transcriptomics reveals intracellular, intercellular, and functional transcriptional circuits
2023-Dec-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.30.569494
PMID:38076932
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研究论文 | 介绍了一种结合CRISPR筛选和空间转录组学的新方法Perturb-FISH，用于研究单细胞水平的遗传和分子关联 | 首次将成像空间转录组学与并行光学检测扩增的引导RNA相结合，揭示了细胞内、细胞间及功能转录回路 | NA | 开发一种新方法来研究空间和功能生物学的遗传和分子关联 | 培养的单核细胞和诱导多能干细胞衍生的星形胶质细胞 | 分子生物学 | 自闭症谱系障碍 | CRISPR筛选、空间转录组学、Perturb-FISH | NA | 转录组数据、光学成像数据 | NA |
| 122 | 2025-04-18 |
Differential chromatin accessibility and transcriptional dynamics define breast cancer subtypes and their lineages
2023-Nov-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.31.565031
PMID:37961519
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研究论文 | 通过分析染色质可及性和转录动态，定义乳腺癌亚型及其谱系 | 应用单细胞、单核多组学技术及空间转录组学，揭示了乳腺癌亚型与起源细胞之间的基因表达和染色质可及性特征联系 | 样本量相对较小（61个样本来自37名患者），可能影响结果的广泛适用性 | 探究乳腺癌亚型的起源细胞及其转录网络 | 乳腺癌患者样本（包括肿瘤和正常组织） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核ATAC测序（snATAC）、空间转录组学、多重成像 | PAM50亚型分析算法 | 转录组数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 61个样本来自37名乳腺癌患者 |
| 123 | 2025-04-17 |
Graft dysfunction in compassionate use of genetically engineered pig-to-human cardiac xenotransplantation: a case report
2023-07-29, Lancet (London, England)
DOI:10.1016/S0140-6736(23)00775-4
PMID:37393920
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病例报告 | 报告了一例基因工程猪心脏异种移植的病例，详细分析了移植后功能障碍的原因 | 首次详细分析了基因工程猪心脏异种移植后的功能障碍原因，包括免疫学和组织病理学研究 | 仅基于单一病例，结果可能不具有普遍性 | 探讨异种心脏移植后功能障碍的原因及可能的改进措施 | 57岁男性终末期心力衰竭患者 | 异种移植 | 心力衰竭 | DNA PCR、RNA转录、电子显微镜、单细胞RNA测序 | NA | 临床监测数据、免疫学和组织病理学数据 | 1例患者 |
| 124 | 2025-04-13 |
Binned multinomial logistic regression for integrative cell-type annotation
2023-Dec, The annals of applied statistics
DOI:10.1214/23-aoas1769
PMID:40206429
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研究论文 | 提出一种新的多项逻辑回归估计器，用于整合具有不同分辨率标签的多个数据集，以建模细胞类型概率 | 提出一种新的多项逻辑回归估计器，能够整合多个具有不一致标签的数据集，解决了现有方法在统一建模方面的挑战 | 未明确提及具体限制，但可能涉及非凸优化问题的计算复杂性 | 开发一种自动化的细胞类型注释方法，以提高单细胞基因组学数据分析的效率和准确性 | 单细胞RNA测序数据集中的细胞类型 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多项逻辑回归 | 单细胞RNA测序数据 | 十个单细胞RNA测序数据集 |
| 125 | 2024-08-07 |
Re: Single-cell transcriptome analysis for characterizing primary Sca-1 positive, non-endothelial cardiac cells
2023-09, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2023.07.001
PMID:37454412
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2025-04-12 |
Recent insights into the pathogenesis and therapeutic targets of chronic liver diseases
2023-Oct, eGastroenterology
DOI:10.1136/egastro-2023-100020
PMID:38074919
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评论 | 本文综述了慢性肝病的发病机制及治疗靶点的最新研究进展 | 重点讨论了非编码RNA、自噬、肝外信号传导、巨噬细胞等在肝病中的作用，以及单细胞RNA测序在肝病研究中的应用 | 未提及具体研究数据或实验验证 | 探讨慢性肝病的发病机制及潜在治疗靶点 | 病毒性肝炎、酒精性肝病(ALD)、非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)及肝癌 | 肝病学 | 慢性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 127 | 2025-04-10 |
Hematopoietic stem and progenitor cells confer cross-protective trained immunity in mouse models
2023-Sep-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107596
PMID:37664586
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research paper | 该研究探讨了造血干细胞和祖细胞（HSPCs）在小鼠模型中通过训练免疫机制赋予交叉保护性免疫的能力 | 揭示了HSPCs在感染后通过异质性激活干扰素γ反应基因和稀有细胞群扩增，赋予骨髓来源巨噬细胞增强功能并实现对抗原性不同病原体的交叉保护 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究HSPCs在训练免疫中的特异性作用和细胞类型 | 小鼠造血干细胞和祖细胞（HSPCs）及其衍生的巨噬细胞 | 免疫学 | 感染性疾病 | scRNA-seq（单细胞RNA测序） | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明小鼠数量，但涉及多种病原体挑战实验 |
| 128 | 2025-04-06 |
Progesterone attenuates Th17-cell pathogenicity in autoimmune uveitis via Id2/Pim1 axis
2023-Jun-21, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02829-3
PMID:37344856
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研究论文 | 本研究探讨了孕酮（PRG）通过Id2/Pim1轴减弱Th17细胞在自身免疫性葡萄膜炎（AU）中的致病性 | 首次通过单细胞RNA测序构建了PRG治疗的EAU模型小鼠的高维免疫图谱，揭示了PRG通过调节Th17/Treg平衡及Id2/Pim1轴缓解炎症的机制 | 研究仅使用动物模型，尚未在人体中进行验证 | 探究孕酮治疗自身免疫性葡萄膜炎的作用机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）模型小鼠 | 免疫学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序 | EAU动物模型 | 基因表达数据 | 未明确提及样本数量 |
| 129 | 2025-04-06 |
Spatial epigenome-transcriptome co-profiling of mammalian tissues
2023-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-05795-1
PMID:36922587
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research paper | 该研究开发了两种空间表观基因组和转录组联合分析技术，用于在小鼠和人类脑组织中同时检测染色质可及性、组蛋白修饰和基因表达 | 首次实现了空间分辨的全基因组表观组和转录组联合分析，能够在近单细胞分辨率下同时检测多种分子层信息 | 技术尚未应用于更广泛的生物样本和疾病模型 | 研究表观遗传机制如何控制组织中的转录表型和细胞动态 | 小鼠胚胎和幼年脑组织、成年人类脑组织 | 空间组学 | NA | 空间转录组学、空间表观组学、共测序技术 | NA | 空间组学数据（表观组+转录组） | 小鼠胚胎和幼年脑组织、成年人类脑组织样本 |
| 130 | 2025-04-04 |
Toll-Like Receptor 4 Agonist Injection With Concurrent Radiotherapy in Patients With Metastatic Soft Tissue Sarcoma: A Phase 1 Nonrandomized Controlled Trial
2023-12-01, JAMA oncology
IF:22.5Q1
DOI:10.1001/jamaoncol.2023.4015
PMID:37824131
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研究论文 | 评估TLR4激动剂GLA-SE与放疗联合治疗转移性软组织肉瘤的安全性和免疫调节效果 | 首次在转移性软组织肉瘤患者中研究TLR4激动剂GLA-SE与放疗联合使用的安全性和免疫调节作用 | 样本量较小（12例患者），且为非随机对照试验 | 评估IT GLA-SE与放疗联合治疗的安全性和有效性 | 转移性软组织肉瘤患者 | 肿瘤免疫治疗 | 软组织肉瘤 | 免疫组织化学、T细胞受体（TCR）测序、单细胞测序 | NA | 临床数据、测序数据 | 12例患者（中位年龄65岁，8例女性） |
| 131 | 2025-04-04 |
Single-Cell Transcriptomics of Mtb/HIV Co-Infection
2023-09-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12182295
PMID:37759517
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综述 | 本文总结了利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）在定义结核病（TB）和人类免疫缺陷病毒（HIV）感染的免疫图谱方面取得的进展 | 使用scRNA-seq技术揭示TB和HIV共感染中的宿主-病原体相互作用、HIV发病机制的异质性以及用于模拟疾病的动物模型 | 未提及具体的实验样本量或数据集的详细描述 | 探索TB和HIV共感染的免疫图谱，寻找潜在的生物标志物和转录特征 | 结核病（TB）和人类免疫缺陷病毒（HIV）共感染 | 数字病理学 | 结核病/HIV共感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | NA |
| 132 | 2025-04-03 |
Randomized Phase II Trial of Dendritic Cell/Myeloma Fusion Vaccine with Lenalidomide Maintenance after Upfront Autologous Hematopoietic Cell Transplantation for Multiple Myeloma: BMT CTN 1401
2023-12-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-0235
PMID:37463058
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研究论文 | 评估树突状细胞/多发性骨髓瘤融合疫苗联合来那度胺维持治疗在自体造血细胞移植后的效果 | 首次在随机II期试验中评估DC/MM融合疫苗联合来那度胺维持治疗的临床反应率和免疫诱导效果 | 疫苗组与对照组在1年后的完全缓解率无统计学显著差异 | 评估DC/MM融合疫苗联合来那度胺维持治疗对多发性骨髓瘤患者的疗效 | 多发性骨髓瘤患者 | 肿瘤免疫治疗 | 多发性骨髓瘤 | DC/MM融合疫苗技术、单细胞转录组学 | NA | 临床数据、免疫学数据 | 203名患者入组，140名随机分组，63名成功生产疫苗 |
| 133 | 2025-04-02 |
A single-cell atlas reveals shared and distinct immune responses and metabolic profiles in SARS-CoV-2 and HIV-1 infections
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1105673
PMID:36992700
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序数据比较了SARS-CoV-2和HIV-1感染中的免疫反应和代谢特征，揭示了两种病毒感染的共同和差异 | 提出了一种新颖的共识单细胞注释方法，整合了来自COVID-19和HIV-1患者的单细胞RNA测序数据，系统比较了两种病毒感染的免疫细胞表型特征和调控通路 | 样本量相对较小，仅包括7例COVID-19患者、10例HIV-1患者和3例健康对照 | 比较SARS-CoV-2和HIV-1感染中的免疫反应和代谢特征，以理解疾病进展和开发有效的疫苗和治疗方法 | SARS-CoV-2和HIV-1感染患者的单细胞RNA测序数据 | digital pathology | COVID-19, HIV-1 | scRNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 111,566个单PBMCs，来自7例COVID-19患者、10例HIV-1患者和3例健康对照 |
| 134 | 2025-04-01 |
Cell-type-specific aging clocks to quantify aging and rejuvenation in neurogenic regions of the brain
2023-01, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-022-00335-4
PMID:37118510
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研究论文 | 本研究开发了基于单细胞转录组学的细胞类型特异性衰老时钟，用于量化大脑神经发生区域的衰老和年轻化 | 首次从单细胞转录组数据开发高分辨率衰老时钟，并应用于量化转录组年轻化 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 量化大脑神经发生区域的衰老和年轻化过程 | 小鼠大脑室下区神经发生区域的细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | 基于单细胞的回归模型 | 单细胞转录组数据 | 28只不同年龄的小鼠 |
| 135 | 2025-03-29 |
Single-cell profiling of murine bladder cancer identifies sex-specific transcriptional signatures with prognostic relevance
2023-Sep-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107703
PMID:37701814
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究小鼠膀胱癌中性别特异性转录特征及其预后相关性 | 首次在小鼠膀胱癌模型中应用单细胞RNA测序技术，揭示了性别特异性转录特征及其与人类膀胱癌数据的关联 | 研究仅基于小鼠模型，人类数据的验证仍需进一步研究 | 探究膀胱癌中性别差异的生物学基础及其临床意义 | 小鼠BBN诱导的膀胱癌模型及人类BLCA数据集 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠BBN诱导的肿瘤样本及多个人类BLCA数据集 |
| 136 | 2025-03-29 |
Transcriptional Signatures of Hippocampal Tau Pathology in Primary Age-Related Tauopathy and Alzheimer's Disease
2023-Sep-12, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.09.12.23295440
PMID:37745408
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术，比较了原发性年龄相关tau病变（PART）和阿尔茨海默病（AD）中CA1锥体神经元的转录变化 | 发现了与神经元内tau病理相关的两种新型基因表达特征，并揭示了PART和AD在tau病理相关的转录变化上的相似性 | 样本量较小（PART和AD各6例，对照4例），且仅研究了海马CA1区的神经元 | 探究PART和AD中tau病理相关的分子变化及其相似性 | CA1锥体神经元（有/无tau病理） | 神经退行性疾病研究 | 阿尔茨海默病/原发性年龄相关tau病变 | GeoMx空间转录组学 | NA | mRNA表达数据 | 6例PART患者、6例AD患者和4例对照 |
| 137 | 2025-03-29 |
Transgenic ferret models define pulmonary ionocyte diversity and function
2023-Sep, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06549-9
PMID:37730992
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研究论文 | 研究通过转基因雪貂模型探索肺离子细胞的多样性和功能 | 首次使用条件性遗传雪貂模型研究肺离子细胞生物学和功能，揭示了离子细胞在囊性纤维化中的关键作用 | 研究仅限于雪貂模型，尚未在人类中验证 | 阐明肺离子细胞在气道中的生物学功能和囊性纤维化中的作用 | 转基因雪貂模型和囊性纤维化雪貂 | 生物医学研究 | 囊性纤维化 | 条件性遗传模型、单细胞转录组学、体内谱系追踪 | FOXI1-Cre::ROSA-TG, FOXI1-KO, FOXI1-Cre::CFTR | 基因表达数据、生理功能数据 | 转基因雪貂模型和囊性纤维化雪貂 |
| 138 | 2025-03-29 |
Single-cell transcriptome reveals cell division-regulated hub genes in the unicellular eukaryote Paramecium
2023-Jun, European journal of protistology
IF:1.9Q4
DOI:10.1016/j.ejop.2023.125978
PMID:37080141
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了单细胞真核生物草履虫在细胞分裂过程中调控的关键基因 | 首次在草履虫中揭示了细胞分裂过程中上调基因的功能关联，并鉴定了可能在此过程中起关键作用的枢纽基因 | 研究仅限于Paramecium cf. multimicronucleatum这一特定物种，结论在其他纤毛虫中的普适性需要进一步验证 | 探究纤毛虫细胞分裂过程中的分子调控机制 | Paramecium cf. multimicronucleatum细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA) | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量的草履虫细胞 |
| 139 | 2025-03-29 |
A mannitol-based buffer improves single-cell RNA sequencing of high-salt marine cells
2023-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.26.538465
PMID:37163054
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研究论文 | 本文介绍了一种基于甘露醇的缓冲液（PBS-M），用于提高高盐海洋生物细胞的单细胞RNA测序（scRNA-seq）质量 | 提出了一种新型缓冲液PBS-M，显著减少细胞死亡和环境mRNA，从而揭示以往无法检测的细胞状态 | 研究仅针对海鞘血细胞进行了验证，未涉及其他海洋生物细胞 | 优化单细胞RNA测序技术，使其适用于高盐环境下的海洋生物细胞 | 海鞘血细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量，研究对象为海鞘血细胞 |
| 140 | 2025-03-28 |
Multi-omic analysis of the cardiac cellulome defines a vascular contribution to cardiac diastolic dysfunction in obese female mice
2023-03-29, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-023-00983-6
PMID:36988733
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了肥胖雌性小鼠心脏细胞组中血管对心脏舒张功能障碍的贡献 | 揭示了平滑肌细胞特异性矿物皮质激素受体（SMC-MR）缺失在预防肥胖相关冠状动脉和心脏舒张功能障碍中的作用，并发现了SMC-MR信号在心脏炎症和白细胞招募中的新机制 | 研究仅限于雌性小鼠模型，未涉及雄性小鼠或人类样本 | 探讨肥胖雌性小鼠中平滑肌细胞特异性矿物皮质激素受体缺失对冠状动脉和心脏舒张功能的影响 | 肥胖雌性小鼠及其心脏非心肌细胞群体 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、基因表达谱分析 | 小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 肥胖雌性小鼠及其对照组 |