单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5351 篇文献，本页显示第 1341 - 1360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1341 | 2024-08-04 |
Deep Crypt Secretory Cell Differentiation in the Colonic Epithelium Is Regulated by Sprouty2 and Interleukin 13
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.11.004
PMID:36414210
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研究论文 | 深隐窝分泌（DCS）细胞的分化受到Sprouty2和白细胞介素13的调控 | 本研究揭示了Sprouty2如何通过抑制IL13信号通路来限制结肠DCS细胞分化的机制 | 尚未探讨DCS细胞数量和功能调控的所有可能机制 | 研究Sprouty2与IL13在结肠DCS细胞分化中的作用 | 小鼠肠上皮特异性Sprouty2缺失模型与对照组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、免疫染色、bulk RNA测序、定量聚合酶链反应 | NA | RNA | 小鼠结肠组织 |
| 1342 | 2024-08-04 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and chipset data unravels PANoptosis-related genes in sepsis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1247131
PMID:38239341
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和芯片数据，揭示了败血症中PANoptosis相关基因 | 开发了一种基于Boruta算法的机器学习模型，用于识别PANoptosis相关亚组并预测败血症的生存和临床特征 | 尚未全面阐明PANoptosis在败血症中的角色 | 研究PANoptosis相关基因在败血症中的作用及其预后潜力 | 败血症样本和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 败血症 | 单细胞RNA-seq | Boruta算法 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的败血症样本和单细胞RNA-seq数据 |
| 1343 | 2024-08-05 |
Impaired Reorganization of Centrosome Structure Underlies Human Infantile Dilated Cardiomyopathy
2023-04-25, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了中心粒缺陷导致的人类婴儿扩张型心肌病的机制 | 首次将中心粒缺陷与非综合征型扩张型心肌病相关联，并发现RTTN在心脏发育中的新角色 | 该研究仅基于一名患者，可能无法广泛适用 | 探讨中心粒结构重组的障碍如何影响心肌细胞生物学及其与人类心脏疾病的关系 | 一名罕见的婴儿扩张型心肌病(I-DCM)患者 | 心血管疾病 | 扩张型心肌病 | CRISPR/Cas9基因敲除和校正、单细胞RNA测序 | 斑马鱼和果蝇 | 基因组数据、细胞数据 | 单个患者样本及其父母的全外显子组 |
| 1344 | 2024-08-05 |
Integrative single-cell RNA sequencing and metabolomics decipher the imbalanced lipid-metabolism in maladaptive immune responses during sepsis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1181697
PMID:37180171
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研究论文 | 本文旨在识别与脓毒症免疫功能障碍相关的差异表达脂质代谢基因。 | 通过机器学习算法筛选出关键的脂质代谢相关中心基因，揭示了脓毒症中的免疫抑制微环境。 | 未提及具体的样本来源和大小，可能限制结果的普遍适用性。 | 探讨脓毒症中脂质代谢失衡与免疫反应的关系。 | 脓毒症患者与健康对照者的脂质代谢相关基因及相关免疫功能。 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | 支持向量机-递归特征消除(SVM-RFE) | 基因数据 | 508个差异表达脂质代谢相关基因 |
| 1345 | 2024-08-05 |
Cerebrospinal fluid immune cells appear similar across neuropathic and non-neuropathic pain conditions
2023, Wellcome open research
DOI:10.12688/wellcomeopenres.20153.1
PMID:38707493
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研究论文 | 该研究调查了在神经性疼痛和非神经性疼痛情况下，脑脊液中的免疫细胞是否相似 | 结果表明，无论疼痛的病因如何，免疫细胞的数量和表型并没有明显差异，挑战了脑脊液作为微胶质细胞活化的生物标志物的有效性 | 该研究未能确定脑脊液中蛋白质的确切来源，是否直接来自于循环脑脊液单核细胞或源于脊髓微胶质细胞 | 本研究旨在探讨脑脊液是否可以用作人类微胶质细胞活化的代理测量 | 分析来自遭受神经性特征疼痛的个体的脑脊液免疫细胞群体 | 数字病理学 | 神经性疼痛 | RNA测序，CITE测序 | NA | 生物样本（脑脊液免疫细胞） | 分析了忍受神经性疼痛的个体的免疫细胞群体，样本大小未具体说明 |
| 1346 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics uncovers a non-autonomous Tbx1-dependent genetic program controlling cardiac neural crest cell development
2023-03-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37015-9
PMID:36941249
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研究论文 | 这篇文章揭示了一个非自主的Tbx1依赖的基因程序，该程序控制心脏神经嵴细胞的发展 | 首次使用单细胞RNA测序揭示了心脏神经嵴细胞的动态转变及其在Tbx1缺失下的非自主变化 | 未提及研究的限制 | 探讨心脏神经嵴细胞在发育过程中的命运动态 | 对照小鼠胚胎和Tbx1失活小鼠的神经嵴细胞进行单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 来自对照小鼠和Tbx1失活小鼠的神经嵴细胞 |
| 1347 | 2024-08-05 |
BOMA, a machine-learning framework for comparative gene expression analysis across brains and organoids
2023-02-27, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100409
PMID:36936070
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研究论文 | 本研究提出了一种机器学习框架BOMA，用于比较大脑和类器官之间的基因表达分析 | 开发了一种全球对齐和局部细化的机器学习框架，能够揭示大脑和类器官间保护的和特定的发育轨迹 | 没有提到具体的局限性 | 旨在比较和分析大脑与类器官之间的基因表达差异 | 研究对象为人类大脑和人类类器官，以及非人灵长类动物的大脑 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用多个人类大脑和类器官的样本，具体数量未说明 |
| 1348 | 2024-08-04 |
ProtoCell4P: an explainable prototype-based neural network for patient classification using single-cell RNA-seq
2023-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad493
PMID:37540223
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研究论文 | 本文提出了一种名为ProtoCell4P的原型基础神经网络，用于基于单细胞RNA测序进行患者分类并提供可解释性 | 该模型通过利用细胞知识和细胞的代表（称为原型）来缓解样本稀缺和细胞数量多样性的问题，具备良好的可解释性 | 样本数量通常较小，单细胞表达轮廓较嘈杂，并且高维性可能限制了一些分析 | 旨在设计深度学习模型对患者表型进行精准分类 | 研究对象为通过单细胞RNA测序数据获得的患者样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 原型基础神经网络 | 单细胞表达数据 | 样本数量通常较小，具体数字未给出 |
| 1349 | 2024-08-05 |
Generation of ventralized human thalamic organoids with thalamic reticular nucleus
2023-05-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.03.007
PMID:37019105
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研究论文 | 本研究报告了一种将人类胚胎干细胞转化为具有不同核身份的腹侧丘脑类器官的方法 | 实现了以前未能达到的丘脑模式，展现了丘脑网状核的特征 | 未影响整体丘脑谱系发育的神经功能变化可能限定了结果的适用性 | 探索人类丘脑中核特异性发育与病理的机制 | 使用腹侧丘脑类器官研究TRN特异性与病相关基因的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 组织样本 | NA |
| 1350 | 2024-08-05 |
The 'omics of obesity in B-cell acute lymphoblastic leukemia
2023-05-04, Journal of the National Cancer Institute. Monographs
DOI:10.1093/jncimonographs/lgad014
PMID:37139973
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研究论文 | 本研究探讨了肥胖如何影响人类B细胞急性淋巴细胞白血病的功能 | 使用多组学方法揭示了肥胖相关的B细胞特异性标志与生存结果之间的关联，提供了新的见解 | 研究未提及样本的多样性和肥胖机制的广泛性 | 理解脂肪细胞如何影响B细胞急性淋巴细胞白血病中的代谢和耐药性 | 正常和恶性B细胞，特别是B细胞急性淋巴细胞白血病细胞 | 数字病理学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | RNA测序，质谱 | NA | 血清和血浆样本 | 健康供体和B-ALL患者的样本 |
| 1351 | 2024-08-05 |
PD-1 Mediated Regulation of Unique Activated CD8 + T Cells by NK Cells in the Submandibular Gland
2023-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.15.557930
PMID:37745414
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研究论文 | 本文研究了NK细胞如何通过PD-1/PD-L1轴在下颌下腺调控CD8 T细胞的稳态 | 发现PD-1缺乏小鼠的下颌下腺中存在独特的CD8 T细胞群，以及NK细胞在该部位的免疫调节作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，缺乏在人体中的验证 | 探讨NK细胞在下颌下腺对CD8 T细胞稳态的调控作用 | PD-1缺乏小鼠及NK细胞缺乏的小鼠模型 | 数字病理学 | 干燥综合症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 涉及PD-1缺乏和NK细胞缺乏的小鼠样本 |
| 1352 | 2024-08-04 |
Delivery of mitochondria confers cardioprotection through mitochondria replenishment and metabolic compliance
2023-05-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2023.02.016
PMID:36805084
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研究论文 | 本研究探讨了线粒体移植在心力衰竭中的保护作用及其机制 | 研究揭示了线粒体移植通过恢复心脏功能和代谢适应性来保护心脏 | 未明确讨论线粒体移植的长期效果及其临床应用的挑战 | 旨在研究线粒体移植在心力衰竭中的效果及机制 | 研究对象为两种不同模型的心力衰竭，包括多柔比星诱导的心力衰竭模型和人诱导的多能干细胞衍生的心肌细胞模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 线粒体移植、单细胞RNA测序 | 人诱导的多能干细胞衍生心肌细胞模型 | RNA序列 | NA |
| 1353 | 2024-08-05 |
Tissue nanotransfection causes tumor regression by its effect on nanovesicle cargo that alters microenvironmental macrophage state
2023-05-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2022.11.003
PMID:36380587
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研究论文 | 本研究首次报告了肿瘤来源的细胞外囊泡的纳米尺度荧光可视化，揭示了其对小鼠肿瘤相关巨噬细胞状态的影响 | 揭示了肿瘤源性囊泡携带的miR-126对肿瘤相关巨噬细胞状态改变的肿瘤发生机制 | 未提及具体的临床研究数据或在人类模型中的应用 | 研究肿瘤来源的细胞外囊泡如何影响肿瘤相关巨噬细胞并导致肿瘤退缩 | 主要研究对象是肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤来源的细胞外囊泡 | 数字病理学 | 肿瘤 | 纳米转染技术 | 小鼠肿瘤模型 | 分子和基因表达数据 | 涉及的样本数量未具体列出 |
| 1354 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies hippocampal microglial dysregulation in diet-induced obesity
2023-Mar-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106164
PMID:36915697
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序研究饮食诱导肥胖下海马微胶质细胞的失调 | 利用小鼠高脂饮食模型揭示饮食诱导肥胖对海马微胶质细胞活化的深刻影响 | 关于肥胖期间微胶质细胞活化的确切机制尚未完全理解 | 探讨肥胖对海马微胶质细胞的影响及其与认知障碍之间的关系 | 肥胖小鼠模型中的海马微胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 研究了饮食诱导肥胖下的海马微胶质细胞，在高脂饮食下观察了不同时间点的变化 |
| 1355 | 2024-08-04 |
Conserved Transcriptome Features Define Prepubertal Primate Spermatogonial Stem Cells as Adark Spermatogonia and Identify Unique Regulators
2023-Mar-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24054755
PMID:36902187
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析未成熟的猕猴和狒狒睾丸细胞，探讨了人类前青春期生精干细胞的分子特征及调控因子 | 确定了前青春期人类生精干细胞的分子特征，并发现了新的调控通路，这可能有助于其体外选择和传播 | 尚未确定专门的生物标志物来明确识别前青春期生精干细胞 | 明确前青春期生精干细胞的分子身份 | 猕猴、狒狒与人类的生精干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 未成熟的猕猴和狒狒睾丸细胞 |
| 1356 | 2024-08-05 |
Cholesterol homeostasis regulated by ABCA1 is critical for retinal ganglion cell survival
2023-02, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-021-2126-2
PMID:35829808
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研究论文 | 本文探讨了ABCA1在视网膜神经节细胞存活中的重要性以及其与原发性开角型青光眼的关联 | 研究表明ABCA1表达降低和HDL水平下降是POAG的风险因素，并提出使用他汀类药物作为预防治疗 | 研究主要集中在小鼠模型，临床转化需要进一步验证 | 探明ABCA1与视网膜神经节细胞存活之间的关系及其在原发性开角型青光眼中的作用 | 主要研究对象为小鼠模型以及POAG患者的白细胞样本 | 数字病理 | 原发性开角型青光眼 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞样本和基因表达数据 | 小鼠模型和POAG患者的血液样本 |
| 1357 | 2024-08-04 |
A Cdh3-β-catenin-laminin signaling axis in a subset of breast tumor leader cells control leader cell polarization and directional collective migration
2023-01-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.12.005
PMID:36626870
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研究论文 | 本文探讨了一组乳腺肿瘤领袖细胞如何通过Cdh3-β-catenin-laminin信号轴控制细胞极化和方向性集体迁移 | 提出了领袖细胞需要生成高推力并克服细胞外基质阻力以引导集体迁移的新机制 | 研究主要基于体外模型，尚未在体内模型中验证 | 了解肿瘤细胞如何通过集体迁移进行扩散 | 乳腺肿瘤细胞及其微环境的相互作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | 3D计算模型 | 视频，细胞序列数据 | 包括多个小鼠和人类乳腺肿瘤类器官的样本 |
| 1358 | 2024-08-05 |
Macrophage activation drives ovarian failure and masculinization in zebrafish
2023-11-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adg7488
PMID:37992158
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研究论文 | 该文章探讨了巨噬细胞活化如何驱动斑马鱼的卵巢衰退和男性化 | 通过建立巨噬细胞活化与卵巢衰退之间的因果关系，确定了促进卵巢衰退和性别逆转的生殖细胞-体细胞信号轴 | 对人类卵巢衰退机制的适用性可能受到限制，因为研究是在斑马鱼模型中进行的 | 研究BMP15突变引起的卵巢衰退和免疫因素的细胞机制 | 主要研究对象为斑马鱼，特别是涉及到巨噬细胞和卵巢细胞的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 1359 | 2024-08-04 |
Molecular Evidence for Olfactory Neuroblastoma as a Tumor of Malignant Globose Basal Cells
2023-05, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2023.100122
PMID:36841178
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研究论文 | 本文利用人鼠集成的单细胞图谱识别与嗅神经母细胞瘤的特定干/祖细胞群体相关的转录组程序 | 首次将嗅神经母细胞瘤与特定细胞类型联系起来，并识别出保守的发育通路 | 缺乏对嗅上皮细胞类型标记在临床实践中的应用 | 探讨嗅神经母细胞瘤与嗅上皮中球状基底细胞之间的关系 | 嗅神经母细胞瘤及其与嗅上皮细胞的联系 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠的鼻粘膜样本 |
| 1360 | 2024-08-05 |
Epigenetic regulation of cancer-associated fibroblast heterogeneity
2023-05, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2023.188901
PMID:37120098
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review | 本文回顾了癌相关成纤维细胞(CAF)成熟过程中的表观遗传变化，重点讨论了DNA甲基化和组蛋白修饰 | 探讨了CAF中表观遗传变化与肿瘤生长之间的关系，提出了一些CAF激活因子与表观遗传改变之间的联系 | 没有提供关于CAF的具体样本数据和实验结果的详细信息 | 旨在深入了解癌相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 | 集中讨论癌相关成纤维细胞及其成熟过程中的表观遗传变化 | 数字病理学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA |