单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5354 篇文献，本页显示第 1281 - 1300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1281 | 2024-09-20 |
NPM3 as a novel oncogenic factor and poor prognostic marker contributes to cell proliferation and migration in lung adenocarcinoma
2023-May-31, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-023-00289-6
PMID:37254219
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研究论文 | 研究探讨了NPM3在肺腺癌中的表达及其作为致癌因子和预后不良标志物的作用 | 首次揭示了NPM3在肺腺癌中的高表达与不良预后和免疫抑制微环境的关联，并证明了NPM3通过促进细胞增殖和迁移促进肺腺癌进展 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探讨NPM3在肺腺癌肿瘤微环境中的表达和功能 | NPM3在肺腺癌中的表达及其对细胞增殖和迁移的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | 生物信息学工具、单细胞测序、siRNA敲低 | NA | 基因表达数据、单细胞数据 | 包括NCI-H1299和SPC-A1细胞在内的多个肺腺癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1282 | 2024-09-20 |
Single-cell technologies in multiple myeloma: new insights into disease pathogenesis and translational implications
2023-May-31, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-023-00502-8
PMID:37259170
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在多发性骨髓瘤中的应用及其对疾病发病机制和转化医学的影响 | 单细胞测序技术揭示了多发性骨髓瘤的细胞和分子景观，改变了我们对肿瘤间和肿瘤内异质性、肿瘤微环境和治疗抵抗机制的理解 | NA | 总结单细胞测序方法在多发性骨髓瘤研究中的最新进展，并讨论其在临床转化中的未来方向 | 多发性骨髓瘤的细胞和分子景观、肿瘤异质性、治疗反应和抵抗的机制及生物标志物 | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1283 | 2024-09-20 |
Emergence of division of labor in tissues through cell interactions and spatial cues
2023-05-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112412
PMID:37086403
|
研究论文 | 本文开发了一个计算框架，研究细胞类型群体中劳动分工的机制 | 提出了一个方法来构建专家细胞之间的配体-受体网络，并使用单细胞RNA测序和空间转录组学数据推断劳动分工机制 | NA | 研究细胞类型群体中劳动分工的机制 | 细胞类型群体中的劳动分工 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 (RNA-seq) 和空间转录组学 | 计算框架 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1284 | 2024-09-20 |
Multimodal single cell analysis infers widespread enhancer co-activity in a lymphoblastoid cell line
2023-05-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04954-4
PMID:37237005
|
研究论文 | 本文利用单细胞技术分析了淋巴母细胞系中增强子的共活性 | 首次在单细胞水平上研究了增强子对同一基因的共活性，并预测了增强子之间的关联 | 研究仅基于单一细胞系，预测的增强子关联需要进一步的功能验证 | 探究增强子在基因表达调控中的共活性模式 | 人类淋巴母细胞系中的增强子和基因表达 | 基因组学 | NA | 单细胞ATAC-seq和单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据和染色质状态数据 | 24,844个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1285 | 2024-09-20 |
Subcellular spatially resolved gene neighborhood networks in single cells
2023-05-22, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100476
PMID:37323566
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研究论文 | 本文介绍了一种用于分析亚细胞基因邻近关系的空间解析基因邻域网络（spaGNN）管道 | 提出了一种新的空间解析基因邻域网络（spaGNN）方法，用于分析亚细胞空间转录组数据中的基因邻近关系 | NA | 开发一种新的方法来分析亚细胞空间转录组数据中的基因邻近关系，并展示其在细胞类型分类任务中的应用 | 亚细胞空间转录组数据中的基因邻近关系 | 数字病理学 | NA | 荧光原位杂交（FISH） | 机器学习 | 图像 | 使用了成纤维细胞、U2-OS细胞和间充质干细胞（MSCs）的FISH数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1286 | 2024-09-20 |
Applying causal discovery to single-cell analyses using CausalCell
2023-05-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.81464
PMID:37129360
|
研究论文 | 本文介绍了CausalCell工作流程和平台，用于在单细胞分析中应用因果发现 | 开发了CausalCell平台，通过基准测试四种因果发现方法，并分析多个单细胞RNA测序数据集，提出在大多数情况下基于约束的PC算法与基于核的条件独立性测试效果最佳 | 评估和选择因果发现方法以及开发和执行适当的工作流程仍然存在挑战 | 将因果发现应用于单细胞分析，以解决科学问题中的因果关系 | 单细胞RNA测序数据中的因果交互 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | PC算法 | 单细胞RNA测序数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1287 | 2024-09-20 |
Single-cell characteristics and malignancy regulation of alpha-fetoprotein-producing gastric cancer
2023-05, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.5883
PMID:37017469
|
研究论文 | 研究了甲胎蛋白产生型胃癌的单细胞特征及其恶性调控因子 | 首次在单细胞水平上描述了甲胎蛋白产生型胃癌的特征，并发现DKK1与AFP表达和恶性表型相关 | NA | 在单细胞水平上描述甲胎蛋白产生型胃癌的特征，并识别调控AFP表达和恶性的因子 | 甲胎蛋白产生型胃癌的单细胞特征及其恶性调控因子 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两个甲胎蛋白产生型胃癌患者的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1288 | 2024-09-20 |
Single-cell transcriptomes in the heart: when every epigenome counts
2023-03-17, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvac040
PMID:35325060
|
综述 | 本文综述了心脏中单细胞转录组学的研究进展，探讨了细胞异质性的生物学意义及其在心脏功能和疾病中的作用 | 本文通过全面分析心脏中的单细胞转录组学数据，提出了新的心脏功能模型和假设，并讨论了新兴的表观基因组学方法与单细胞RNA测序的结合 | NA | 探讨心脏中单细胞转录组学的生物学意义及其在心脏功能和疾病中的作用 | 心脏中的单细胞转录组学数据和新兴的表观基因组学方法 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1289 | 2024-09-20 |
Fibrotic immune microenvironment remodeling mediates superior anti-tumor efficacy of a nano-PD-L1 trap in hepatocellular carcinoma
2023-01-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2022.09.012
PMID:36146933
|
研究论文 | 研究报道了一种纳米PD-L1陷阱基因在治疗肝纤维化相关肝细胞癌中的优越疗效 | 首次报道了纳米PD-L1陷阱基因在肝纤维化相关肝细胞癌治疗中的应用，相比传统单克隆抗体，其诱导的肿瘤消退更大且无毒性 | 研究主要基于动物模型，尚未在临床试验中验证其疗效 | 探讨纳米PD-L1陷阱基因在肝纤维化相关肝细胞癌治疗中的疗效及机制 | 肝纤维化相关肝细胞癌及其微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个临床队列的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1290 | 2024-09-19 |
MIOX inhibits autophagy to regulate the ROS -driven inhibition of STAT3/c-Myc-mediated epithelial-mesenchymal transition in clear cell renal cell carcinoma
2023-12, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2023.102956
PMID:37977044
|
研究论文 | 研究探讨了MIOX基因在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的作用及其抑制STAT3/c-Myc介导的上皮-间质转化（EMT）的机制 | 首次揭示了MIOX通过抑制自噬来调节ROS水平，从而抑制STAT3/c-Myc介导的EMT，进而影响ccRCC的进展 | 研究主要集中在体外和体内实验，缺乏更大规模的人体临床试验数据 | 探讨MIOX在透明细胞肾细胞癌中的作用及其分子机制 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）及其相关基因MIOX | NA | 肾细胞癌 | scRNA-seq | NA | RNA | 包括ccRCC患者的肿瘤组织和配对的邻近肾组织，以及体外和体内的ccRCC细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1291 | 2024-09-19 |
Single-cell RNA sequencing of intestinal crypts reveals vital events in damage repair and the double-edged sword effect of the Wnt3/β-catenin pathway in irradiated mice
2023-12, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2023.102942
PMID:37918127
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了不同时间点（第一天、第三天和第五天）接受13 Gy和15 Gy腹部辐射暴露后的小肠隐窝，探讨了损伤修复过程中的关键事件以及Wnt3/β-catenin通路的多重效应 | 本研究首次揭示了Wnt3/β-catenin通路在辐射暴露后损伤修复中的双重作用，并提出了肠道隐窝干细胞与巨噬细胞通过MIF-CD74/CD44轴相互作用可能加剧辐射损伤的新观点 | 本研究主要依赖于单细胞RNA测序和生物信息学分析，缺乏对Wnt3/β-catenin通路和MIF-CD74/CD44轴的直接调控实验 | 探讨辐射暴露后小肠隐窝损伤修复的关键事件及Wnt3/β-catenin通路的多重效应 | 小肠隐窝细胞在不同辐射剂量下的基因表达变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 接受13 Gy和15 Gy腹部辐射暴露的小鼠小肠隐窝细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1292 | 2024-09-19 |
Stemness signature and targeted therapeutic drugs identification for Triple Negative Breast Cancer
2023-11-20, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02709-8
PMID:37985782
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研究论文 | 本研究旨在分析三阴性乳腺癌（TNBC）的癌症干细胞相关基因特征，以确定患者的危险分层和预后特征 | 本研究应用一类别逻辑回归（OCLR）算法计算TNBC患者的干细胞指数，并建立了基于16个基因的预后特征，通过分子对接筛选出针对预测基因的小分子化合物 | NA | 分析TNBC的癌症干细胞相关基因特征，确定患者的危险分层和预后特征 | 三阴性乳腺癌（TNBC）患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 一类别逻辑回归（OCLR）算法、Cox回归分析、LASSO回归分析、分子对接 | NA | 基因表达数据、scRNA-seq数据 | TCGA和METABRIC合并数据集、GSE176078数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1293 | 2024-09-19 |
Cancer-associated fibroblasts in early-stage lung adenocarcinoma correlate with tumor aggressiveness
2023-10-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-43296-3
PMID:37848457
|
研究论文 | 研究早期肺腺癌中癌症相关成纤维细胞与肿瘤侵袭性的关系 | 首次发现早期肺腺癌中ADH1B癌症相关成纤维细胞的数量与肿瘤侵袭性呈负相关，并发现其与特定的细胞外基质和免疫细胞特征相关 | 研究仅基于早期肺腺癌样本，结果可能不适用于其他阶段或类型的肺癌 | 探讨早期肺腺癌中癌症相关成纤维细胞对肿瘤侵袭性的影响，以改进诊断和治疗策略 | 早期肺腺癌患者的组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 早期肺腺癌患者的组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1294 | 2024-09-19 |
PLA2G2E-mediated lipid metabolism triggers brain-autonomous neural repair after ischemic stroke
2023-10-04, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.06.024
PMID:37490917
|
研究论文 | 研究揭示了PLA2G2E介导的脂质代谢在缺血性脑损伤后触发脑自主神经修复的机制 | 首次发现PLA2G2E通过生成二高-γ-亚麻酸（DGLA）触发脑自主神经修复，并确定15-羟基-二十碳三烯酸（15-HETrE）作为促进功能恢复的关键代谢物 | NA | 阐明脑损伤后脑自主恢复的内在机制 | PLA2G2E、二高-γ-亚麻酸（DGLA）及其代谢物15-羟基-二十碳三烯酸（15-HETrE）在脑损伤后的作用 | NA | 脑卒中 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、表观遗传分析 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1295 | 2024-09-19 |
OX40L-expressing recombinant modified vaccinia virus Ankara induces potent antitumor immunity via reprogramming Tregs
2023-08-07, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221166
PMID:37145142
|
研究论文 | 本文报道了一种通过理性工程改造的重组MVA病毒，该病毒表达OX40L并能有效诱导抗肿瘤免疫，通过重新编程肿瘤微环境中的调节性T细胞（Tregs） | 通过删除vaccinia E5R基因并表达Flt3L和OX40L，成功设计了一种能够重新编程肿瘤微环境中Tregs的重组MVA病毒 | NA | 开发一种新的癌症免疫治疗方法，通过重新编程肿瘤微环境中的Tregs来增强抗肿瘤免疫 | 肿瘤微环境中的调节性T细胞（Tregs） | 癌症免疫治疗 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1296 | 2024-09-19 |
Evaluation of genetic demultiplexing of single-cell sequencing data from model species
2023-08, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202301979
PMID:37197983
|
研究论文 | 评估基因型基础的单细胞测序数据去复用技术在不同模型物种中的应用 | 提出了一种基因型基础的去复用技术，适用于非同基因的模型物种，减少了成本并增加了实验的可重复性和多样性 | 该方法的局限性在于需要单细胞测序数据和从头转录组资源 | 研究基因型基础的去复用技术在不同模型物种中的适用性 | 从斑马鱼到非人灵长类等多种非同基因的模型物种 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因型数据 | 多个个体混合的单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1297 | 2024-09-19 |
Integrated Multi-omics Analysis of Early Lung Adenocarcinoma Links Tumor Biological Features with Predicted Indolence or Aggressiveness
2023-07, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-22-0373
PMID:37501683
|
研究论文 | 本文研究了早期肺腺癌的生物学特征与预测的惰性或侵袭性之间的关系 | 通过整合多组学数据，揭示了放射组学与肿瘤生物学之间的关联，为区分惰性和侵袭性肺腺癌提供了新的见解 | 样本量相对较小，可能影响结果的普适性 | 探讨早期肺腺癌惰性或侵袭性的生物学决定因素 | 早期肺腺癌患者及其肿瘤特征 | 数字病理学 | 肺癌 | CyTOF, RNA-seq | NA | 图像, 基因表达数据 | 92名肺腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1298 | 2024-09-19 |
ADEPT: Autoencoder with differentially expressed genes and imputation for robust spatial transcriptomics clustering
2023-Jun-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106792
PMID:37235055
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于图自编码器和差异表达基因矩阵的迭代聚类方法ADEPT，用于提高空间转录组数据的聚类鲁棒性 | ADEPT通过图自编码器和差异表达基因矩阵的迭代聚类方法，显著提高了空间转录组数据在不同平台上的聚类性能 | NA | 开发一种鲁棒的聚类方法，以提高空间转录组数据在不同平台上的分析效果 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组测序 | 图自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1299 | 2024-09-19 |
APOL1 promotes endothelial cell activation beyond the glomerulus
2023-Jun-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106830
PMID:37250770
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研究论文 | 研究探讨了APOL1高风险基因型通过内皮细胞内在激活和功能障碍促进慢性肾病的可能性 | 首次揭示了APOL1在多个肾血管床中作为内皮细胞激活诱导剂的作用，并可能影响肾小球血管以外的区域 | 研究主要基于单细胞RNA测序和转录组数据，缺乏直接的体内实验验证 | 探讨APOL1高风险基因型在慢性肾病中的作用机制 | 内皮细胞和APOL1表达 | NA | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括来自Kidney Precision Medicine Project的数据集、非洲裔美国人的肾组织数据集以及APOL1表达的转基因小鼠数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1300 | 2024-09-19 |
Single-cell and spatial transcriptomics: deciphering brain complexity in health and disease
2023-06, Nature reviews. Neurology
DOI:10.1038/s41582-023-00809-y
PMID:37198436
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研究论文 | 本文讨论了单细胞和空间转录组学技术在解析健康和疾病状态下大脑复杂性中的应用 | 本文介绍了单细胞和空间转录组学技术在解析大脑疾病病理机制中的创新应用，特别是在选择性神经元脆弱性、神经免疫功能障碍和细胞类型特异性治疗反应方面的见解 | 单细胞RNA测序需要组织样本的解离，导致细胞间相互关系的信息丢失；空间转录组学技术虽然保留了空间信息，但仍存在局限性，并讨论了未来的发展方向 | 探讨单细胞和空间转录组学技术在解析大脑疾病病理机制中的应用 | 大脑在健康和疾病状态下的复杂性 | 单细胞技术 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 数千个细胞 | NA | NA | NA | NA |