单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 5350 篇文献，本页显示第 1261 - 1280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1261 | 2024-09-08 |
Loss of autism-candidate CHD8 perturbs neural crest development and intestinal homeostatic balance
2023-01, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202201456
PMID:36375841
|
研究论文 | 本文研究了CHD8基因突变对神经嵴发育和肠道稳态平衡的影响 | 首次揭示了CHD8基因突变与神经嵴发育、肠道稳态以及自闭症相关胃肠道症状之间的因果关系 | 研究仅限于斑马鱼模型，尚未在人类中验证 | 探讨CHD8基因突变对神经嵴发育和肠道稳态的影响及其与自闭症相关胃肠道症状的关系 | CHD8基因突变对神经嵴细胞、肠道神经和胶质前体细胞、肠道稳态以及免疫平衡的影响 | 发育生物学 | 自闭症 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 斑马鱼模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1262 | 2024-09-08 |
Single-cell RNA-seq analysis to identify potential biomarkers for diagnosis, and prognosis of non-small cell lung cancer by using comprehensive bioinformatics approaches
2023-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2022.101571
PMID:36401966
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据和生物信息学方法，识别非小细胞肺癌的潜在生物标志物 | 利用单细胞RNA测序数据和生物信息学技术，识别了12个关键基因及其相关的转录因子和miRNA，这些基因在非小细胞肺癌的诊断和预后中具有潜在作用 | 研究依赖于公开数据库中的数据，可能存在数据质量和样本代表性的限制 | 识别非小细胞肺癌的诊断和预后生物标志物 | 非小细胞肺癌的基因生物标志物及其调控因子和信号通路 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从GEO数据库获取的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1263 | 2024-09-07 |
Remodeling of the osteoimmune microenvironment after biomaterials implantation in murine tibia: Single-cell transcriptome analysis
2023-Apr, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2022.10.009
PMID:36311047
|
研究论文 | 研究了在小鼠胫骨中植入生物材料后骨免疫微环境的重组，通过单细胞转录组分析揭示了不同细胞群的异质性和动态变化 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了植入材料对骨免疫微环境的影响，并探讨了中性粒细胞在骨整合中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量相对较小 | 探讨生物材料植入后骨免疫微环境的重组及其对骨整合的影响 | 小鼠胫骨中植入不锈钢和钛合金生物材料后的骨免疫微环境 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 40043个细胞，分为五个不同组 | NA | NA | NA | NA |
| 1264 | 2024-09-07 |
Correspondence analysis for dimension reduction, batch integration, and visualization of single-cell RNA-seq data
2023-01-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-26434-1
PMID:36681709
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于对应分析（CA）的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据降维、批次整合和可视化方法 | 提出了一种基于对应分析（CA）的替代PCA的方法，避免了log转换对数据的扭曲，并提出了五种CA的适应性改进，这些改进在计算细胞嵌入时表现更好或与标准CA和glmPCA相当 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的降维和批次整合方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 对应分析（CA） | 基因表达数据 | 9个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1265 | 2024-09-06 |
Transcriptomic profiling of cardiac tissues from SARS-CoV-2 patients identifies DNA damage
2023-03, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13577
PMID:36107637
|
研究论文 | 研究分析了SARS-CoV-2患者心脏组织的转录组图谱，发现DNA损伤相关基因的上调 | 首次揭示了SARS-CoV-2感染患者心脏组织中DNA损伤和修复相关基因的上调，并通过γ-H2Ax免疫组化进一步验证 | 样本量较小，且仅包括SARS-CoV-2、pH1N1和对照组患者，可能影响结果的普适性 | 探讨SARS-CoV-2感染对心脏组织的分子影响 | SARS-CoV-2、pH1N1和对照组患者的心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 7例SARS-CoV-2患者、2例pH1N1患者和6例对照组患者的心脏组织 | NA | NA | NA | NA |
| 1266 | 2024-09-06 |
Differential cell composition and split epidermal differentiation in human palm, sole, and hip skin
2023-01-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.111994
PMID:36732947
|
研究论文 | 研究通过批量和单细胞RNA测序分析了人类手掌、脚底和臀部皮肤的细胞组成和表皮分化差异 | 揭示了手掌和脚底皮肤中免疫环境的改变，以及特定成纤维细胞在细胞间通信中的关键作用 | NA | 探讨手掌和脚底皮肤的转录程序及其独特性 | 人类手掌、脚底和臀部皮肤 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 涉及手掌、脚底和臀部皮肤的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1267 | 2024-09-05 |
Mast-Cell Expressed Membrane Protein-1 (MCEMP1) is expressed in classical monocytes and alveolar macrophages in Idiopathic Pulmonary Fibrosis and regulates cell chemotaxis, adhesion, and migration in a TGFβ dependent manner
2023-Oct-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.07.561349
PMID:37873485
|
研究论文 | 本文研究了MCEMP1在特发性肺纤维化中的表达及其对细胞趋化、粘附和迁移的调控作用 | 首次揭示了MCEMP1在特发性肺纤维化中通过TGFβ依赖的方式调控单核细胞的趋化、粘附和迁移 | NA | 探究MCEMP1在特发性肺纤维化中的机制作用 | MCEMP1在特发性肺纤维化患者中的表达及其功能 | NA | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、染色质免疫沉淀、邻近连接分析、RNA干扰、慢病毒转导、批量RNA测序、活性RHO下拉实验 | NA | RNA | 来自特发性肺纤维化患者和对照组的PBMC和肺组织样本，以及THP-1细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1268 | 2024-09-05 |
ER stress mediates Angiotensin II-augmented innate immunity memory and facilitates distinct susceptibilities of thoracic from abdominal aorta to aneurysm development
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1268916
PMID:37731512
|
研究论文 | 研究通过转录组分析探讨了内质网（ER）应激和训练免疫在Ang II诱导的动脉瘤模型中的作用，发现Ang II在腹部主动脉（AA）中诱导更强的炎症反应和基因上调，以及ER应激在不同主动脉中的不同作用。 | 首次聚焦于内质网应激的转录组分析，揭示了内质网作为感知多种DAMPs并启动ER应激的免疫细胞器的作用，以及其在Ang II加速训练免疫和不同主动脉对疾病易感性差异中的作用。 | NA | 确定内质网（ER）应激和训练免疫在Ang II诱导的动脉瘤发展中的作用 | 胸主动脉（TA）和腹主动脉（AA） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 胸主动脉（TA）和腹主动脉（AA）样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1269 | 2024-09-04 |
Single-cell level deconvolution, convolution, and clustering in spatial transcriptomics by aligning spot level transcriptome to nuclear morphology
2023-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.17.572084
PMID:38187541
|
研究论文 | 本文提出了一种名为STIE的EM算法，通过将空间转录组数据与基于组织学图像的核形态对齐，实现了单细胞水平的空间转录组解卷积、卷积和聚类。 | STIE算法通过核形态相似性和邻域信息，填补了高达70%的间隙区域，实现了真正的单细胞水平和全切片尺度的解卷积/卷积和聚类。 | NA | 实现单细胞水平的空间转录组分析，提高空间转录组数据的分辨率和准确性。 | 空间转录组数据与组织学图像的核形态对齐，以及单细胞水平的解卷积、卷积和聚类。 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | EM算法 | 空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1270 | 2024-09-04 |
Convergent alterations in the tumor microenvironment of MYC-driven human and murine prostate cancer
2023-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.07.553268
PMID:37905029
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和分子病理学方法，探讨了MYC驱动的肿瘤微环境在人类和小鼠前列腺癌中的变化 | 首次在MYC驱动的肿瘤微环境中，通过单细胞RNA测序技术揭示了人类和小鼠前列腺癌中细胞状态的保守性 | 研究主要依赖于基因工程小鼠模型，可能与人类前列腺癌的实际情况存在差异 | 探究MYC信号激活在前列腺癌肿瘤微环境变化中的作用 | 人类和小鼠的前列腺癌细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | RNA | 涉及人类和小鼠的前列腺癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1271 | 2024-09-04 |
Single-cell RNA sequencing deciphers the mechanism of sepsis-induced liver injury and the therapeutic effects of artesunate
2023-Sep, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-023-01065-y
PMID:37041228
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了脓毒症诱导的肝脏损伤机制及青蒿琥酯的治疗效果 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了脓毒症对肝脏细胞的具体影响，并评估了青蒿琥酯的肝保护作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未进行临床试验验证 | 探讨脓毒症对肝脏的影响及青蒿琥酯的肝保护机制 | 小鼠肝脏在脓毒症感染后的细胞反应及青蒿琥酯的治疗效果 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1272 | 2024-09-01 |
Stress resilience-enhancing drugs preserve tissue structure and function in degenerating retina via phosphodiesterase inhibition
2023-05-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2221045120
PMID:37126699
|
研究论文 | 本文通过系统药理学平台，利用单细胞转录组学、蛋白质组学和磷酸蛋白质组学，研究了通过选择性抑制环核苷酸磷酸二酯酶（PDEs）来增强退化视网膜的应激抵抗能力，从而保护组织结构和功能。 | 本文首次报道了通过靶向抑制PDEs来稳定转录组、蛋白质组和磷酸蛋白质组，激活保护机制并协同抑制退化过程，从而增强视网膜对急性及慢性应激的抵抗能力。 | NA | 开发新的治疗策略，以应对慢性进行性视网膜疾病，如年龄相关性黄斑变性、糖尿病视网膜病变和视网膜色素变性。 | 年龄相关性和遗传性视网膜退化模型。 | 系统药理学 | 视网膜疾病 | 单细胞转录组学、蛋白质组学和磷酸蛋白质组学 | NA | 转录组、蛋白质组和磷酸蛋白质组数据 | 多种年龄相关性和遗传性视网膜退化模型的细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1273 | 2024-08-31 |
Antigen-specific CD4+ T cells exhibit distinct transcriptional phenotypes in the lymph node and blood following vaccination in humans
2023-Sep-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3304466/v1
PMID:37790414
|
研究论文 | 本研究评估了BNT162b2 mRNA疫苗接种后人类血液和引流淋巴结中刺突特异性CD4 T细胞的单细胞转录组学特征 | 本研究定义了新的克隆型，并使用基于深度学习的反向表位映射方法Trex来预测抗原特异性 | NA | 研究SARS-CoV-2感染和mRNA疫苗接种诱导的CD4 T细胞反应及其在保护性免疫中的作用 | 人类血液和引流淋巴结中的刺突特异性CD4 T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学 | 深度学习 | 转录组数据 | 多个刺突特异性CD4 T细胞克隆型 | NA | NA | NA | NA |
| 1274 | 2024-08-29 |
SPASCER: spatial transcriptomics annotation at single-cell resolution
2023-01-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac889
PMID:36243975
|
研究论文 | 本文构建了一个名为SPASCER的新型空间转录组数据库，旨在帮助理解组织结构的异质性、区域特异性微环境及跨组织结构的多层次细胞间相互作用 | SPASCER数据库整合了来自43项研究的1082个子数据集，涵盖四种物种的16种器官类型，并结合scRNA-seq数据进行空间转录组的解卷积/映射，以及空间细胞间相互作用、基因模式和通路富集分析 | NA | 研究目的是通过构建SPASCER数据库，深入理解健康和疾病组织中的生物学过程机制 | 研究对象包括组织结构异质性、区域特异性微环境及细胞间相互作用 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 43项研究的1082个子数据集，涵盖16种器官类型，涉及四种物种 | NA | NA | NA | NA |
| 1275 | 2024-08-27 |
Dual inhibition of glycolysis and glutaminolysis for synergistic therapy of rheumatoid arthritis
2023-09-20, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-023-03161-0
PMID:37730663
|
研究论文 | 研究通过双重抑制糖酵解和谷氨酰胺分解途径，探讨其在类风湿性关节炎治疗中的协同作用 | 提出通过双重抑制糖酵解和谷氨酰胺分解途径作为治疗类风湿性关节炎的新方法 | NA | 探讨双重抑制糖酵解和谷氨酰胺分解途径在类风湿性关节炎治疗中的潜在协同作用 | 类风湿性关节炎中的滑膜成纤维细胞 | NA | 类风湿性关节炎 | scRNA-seq, H1-核磁共振波谱 | NA | 细胞类型, 基因表达 | 涉及人类滑膜细胞和关节炎小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1276 | 2024-08-25 |
Behind the Indolent Facade: Uncovering the Molecular Features and Malignancy Potential in Lung Minimally Invasive Adenocarcinoma by Single-Cell Transcriptomics
2023-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303753
PMID:37991139
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了肺微小侵袭性腺癌（MIA）的分子特征及其恶性潜能 | 首次通过单细胞转录组学分析，揭示了MIA与侵袭性腺癌（IA）之间的联系和异质性，并发现了可能导致MIA恶性进展的机制 | 研究样本仅来自三位患者，可能影响结果的普遍性 | 揭示肺微小侵袭性腺癌的分子特征及其恶性潜能 | 肺微小侵袭性腺癌（MIA）及其免疫微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 156,447个细胞，来自三位同步多发性肺腺癌患者的MIA和IA肿瘤样本、外周血单个核细胞及邻近正常组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1277 | 2024-08-25 |
Single-Cell Analysis Reveals Malignant Cells Reshape the Cellular Landscape and Foster an Immunosuppressive Microenvironment of Extranodal NK/T-Cell Lymphoma
2023-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303913
PMID:37949673
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了外周NK/T细胞淋巴瘤的肿瘤微环境，揭示了恶性NK细胞在重塑细胞景观和促进免疫抑制微环境中的关键作用 | 首次在单细胞分辨率下解析了外周NK/T细胞淋巴瘤肿瘤微环境的异质组成，强调了携带EBV编码LMP1的恶性NK细胞在重塑细胞景观和促进免疫抑制微环境中的重要作用 | NA | 更好地理解外周NK/T细胞淋巴瘤的异质性起源 | 外周NK/T细胞淋巴瘤的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个患者队列 | NA | NA | NA | NA |
| 1278 | 2024-08-25 |
Single-Cell RNA-Sequencing Provides Insight into Skeletal Muscle Evolution during the Selection of Muscle Characteristics
2023-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202305080
PMID:37870215
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术（scRNA-seq）探讨了人工选择对猪骨骼肌细胞特征的影响 | 本研究首次提供了全景式的肌肉常驻细胞特征，并识别了新的和品种特异性的细胞类型，以及它们在伪时间轨迹上的分布 | NA | 探究人工选择对骨骼肌细胞特征的影响及其机制 | 猪的骨骼肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及不同品种的猪的骨骼肌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1279 | 2024-08-25 |
Identification and Characterization of CD8+ CD27+ CXCR3- T Cell Dysregulation and Progression-Associated Biomarkers in Systemic Lupus Erythematosus
2023-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202300123
PMID:37875396
|
研究论文 | 本研究通过质谱流式细胞术、流式细胞术和单细胞RNA测序，全面分析了263例临床外周血样本中系统性红斑狼疮（SLE）患者的免疫细胞失调情况，并探讨了CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在SLE病理和疾病进展中的作用。 | 本研究首次详细描述了CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在SLE中的失调情况及其与疾病活动性的关联，并构建了动态网络生物标志物（DNB）模型，用于预测SLE的疾病进展。 | NA | 探讨CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在系统性红斑狼疮（SLE）中的失调情况及其作为疾病进展相关生物标志物的潜力。 | CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在系统性红斑狼疮（SLE）中的作用及其作为生物标志物的可能性。 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 质谱流式细胞术、流式细胞术、单细胞RNA测序 | 动态网络生物标志物（DNB）模型 | 外周血样本 | 263例临床外周血样本，包括活动性SLE（aSLE）、缓解期SLE（rSLE）和健康对照（HCs） | NA | NA | NA | NA |
| 1280 | 2024-08-25 |
Loss of ATOH1 in Pit Cell Drives Stemness and Progression of Gastric Adenocarcinoma by Activating AKT/mTOR Signaling through GAS1
2023-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202301977
PMID:37824217
|
研究论文 | 研究探讨了ATOH1在胃癌干细胞维持中的作用及其通过GAS1激活AKT/mTOR信号通路促进胃腺癌进展的机制 | 首次揭示了ATOH1通过调控GAS1和RET/AKT/mTOR信号通路影响胃癌干细胞的维持和化疗耐药性 | 研究主要基于小鼠模型和组织样本，需要进一步的人体临床试验验证 | 阐明ATOH1在胃癌干细胞维持中的作用及其分子机制 | 胃癌干细胞及胃腺癌样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 包括小鼠模型和胃腺癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |