单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5351 篇文献，本页显示第 1241 - 1260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1241 | 2024-08-05 |
A longitudinal single-cell atlas of treatment response in pediatric AML
2023-12-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.10.008
PMID:37977148
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序剖析儿童急性髓系白血病(pAML)的治疗反应。 | 揭示了在治疗过程中，亚型特异性的细胞塑性出现，并识别了可能的靶向过程。 | 该研究样本规模较小，仅涉及28名患者。 | 研究儿童急性髓系白血病不同亚型的细胞组成及其对治疗反应的影响。 | 28名代表不同pAML亚型的儿童患者，涵盖诊断、缓解和复发阶段。 | 数字病理学 | 儿童急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 | NA | 基因组数据 | 28名患者 |
| 1242 | 2024-08-05 |
Cell-in-Cell-Mediated Entosis Reveals a Progressive Mechanism in Pancreatic Cancer
2023-12, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.08.035
PMID:37657757
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研究论文 | 该文章探讨了细胞间介导的细胞吞噬在胰腺癌中的作用机制 | 研究首次揭示了NET1作为胰腺癌进展的一个新型相关基因，且细胞吞噬与胰腺癌预后不良相关 | 未能全面探索细胞吞噬在所有胰腺癌表现中发挥的作用 | 阐明细胞吞噬在胰腺导管腺癌进展中的作用 | 研究对象包括胰腺导管腺癌细胞和其在不同培养条件下的表现 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 涉及胰腺癌样本及其肝转移样本 |
| 1243 | 2024-08-05 |
Stricturing Crohn's Disease Single-Cell RNA Sequencing Reveals Fibroblast Heterogeneity and Intercellular Interactions
2023-11, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.07.014
PMID:37507073
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研究论文 | 这篇文章通过单细胞RNA测序揭示了克罗恩病狭窄中的成纤维细胞异质性和细胞间相互作用 | 首次生成了狭窄肠道的单细胞RNA测序图谱，揭示了成纤维细胞异质性和相互作用 | 该研究可能未涵盖所有克罗恩病狭窄的生物学特征，且主要集中于成纤维细胞 | 探索克罗恩病中狭窄形成的机制并识别新的治疗靶点 | 克罗恩病的全厚度组织样本，特别是成纤维细胞的异质性和功能 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本和细胞数据 | 99个组织样本和409,001个细胞 |
| 1244 | 2024-08-04 |
AML/T cell interactomics uncover correlates of patient outcomes and the key role of ICAM1 in T cell killing of AML
2023-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.21.558911
PMID:37790561
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research paper | 本研究探讨了AML患者样本与T细胞相互作用对患者预后的影响及ICAM1的关键作用 | 揭示了与AML敏感性或抗性相关的转录程序，并发现ICAM1在T细胞介导的杀伤中扮演重要角色 | 研究可能未涵盖所有AML患者的异质性 | 探讨T细胞与急性髓性白血病之间的相互作用及其对患者预后的影响 | 急性髓性白血病患者样本及其与工程化CD4 T细胞的相互作用 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 多例AML患者样本及CD4 T细胞 |
| 1245 | 2024-08-05 |
Temporal dynamics and genomic programming of plasma cell fates
2023-Sep-06, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3296446/v1
PMID:37720050
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研究论文 | 研究浆细胞命运的时序动态和基因组程序 | 提出了一种新的浆细胞过渡状态，促使功能性浆细胞前体的生成 | 尚未明确抗原特异性浆细胞前体的发育动力学和基因组程序 | 阐明浆细胞的发育动态和基因组程序 | 研究抗原特异性的浆细胞前体 | NA | NA | scRNA-seq+BCR-seq | NA | NA | NA |
| 1246 | 2024-08-04 |
The Use of Single-Cell RNA-Sequencing and Spatial Transcriptomics in Understanding the Pathogenesis and Treatment of Skin Diseases
2023-Jul, JID innovations : skin science from molecules to population health
DOI:10.1016/j.xjidi.2023.100198
PMID:37205302
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review | 本论文回顾了单细胞RNA测序和空间转录组学在皮肤疾病研究中的应用 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学来剖析皮肤疾病的关键细胞成分及其空间排列 | NA | 提升皮肤疾病治疗的精准医学水平 | 皮肤疾病，包括异常伤口愈合、炎症性皮肤疾病和癌症 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 1247 | 2024-08-05 |
Identification of an adipose tissue-resident pro-preadipocyte population
2023-05-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112440
PMID:37119138
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研究论文 | 本研究揭示了脂肪组织中一种特定的前脂肪细胞群体及其分化路径 | 通过单细胞RNA测序发现了一种新的人类CD31 CD45细胞群，并将其放置于已知前脂肪细胞群之前的表观遗传路径上 | 研究可能受到样本选择和细胞异质性的限制 | 揭示脂肪细胞的分化过程及其生理机制 | 研究了脂肪组织中的间质血管部分(SVF)中细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 1248 | 2024-08-05 |
Osteoblast-intrinsic defect in glucose metabolism impairs bone formation in type II diabetic male mice
2023-05-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85714
PMID:37144869
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研究论文 | 本研究揭示了糖尿病小鼠骨生成受损的机制，强调了骨母细胞内在的葡萄糖代谢缺陷 | 首次识别糖尿病小鼠中骨母细胞内在的葡萄糖代谢缺陷是糖尿病性骨质疏松的潜在原因 | 仅在小鼠模型中进行研究，限制了结果对人类的直接适用性 | 探讨2型糖尿病对骨生成的影响及其机制 | 以青少年2型糖尿病小鼠为研究对象 | 数字病理学 | 糖尿病性骨质疏松 | 稳定同位素追踪，Seahorse测定，单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | NA |
| 1249 | 2024-08-05 |
A discrete 'early-responder' stromal-cell subtype orchestrates immunocyte recruitment to injured tissue
2023-Dec, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01669-w
PMID:37932455
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研究论文 | 这篇文章探讨了一种在急性损伤后促进组织再生的特殊间充质干细胞亚型。 | 首次识别了'早期反应'间充质干细胞亚型，并展示了其如何促进免疫细胞的募集与组织再生。 | 未详细阐述该亚型在其他组织和病理情况中的作用。 | 研究急性损伤后间充质干细胞如何促进组织再生。 | 肌肉间充质干细胞(MmSCs)及其在急性损伤后的反应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 转录组数据 | NA |
| 1250 | 2024-08-05 |
CO-CLUSTERING OF SPATIALLY RESOLVED TRANSCRIPTOMIC DATA
2023-Jun, The annals of applied statistics
DOI:10.1214/22-aoas1677
PMID:37811520
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研究论文 | 本文介绍了一种新统计模型SpaRTaCo，用于对空间基因表达数据进行共聚类 | 提出了一种利用空间信息进行细胞和基因聚类的新方法 | 尚欠缺广泛的实证验证，尤其在不同类型组织样本中的适用性 | 旨在更好地理解组织中基因功能和相互作用的空间变化 | 研究细胞类型和基因在组织中空间表达模式的聚类 | 数字病理学 | NA | 10X-Visium | 聚类模型 | 转录组数据 | 应用于一个人脑组织样本 |
| 1251 | 2024-08-05 |
Endoplasmic reticulum in oocytes: spatiotemporal distribution and function
2023-Jun, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-023-02782-3
PMID:37171741
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综述 | 本文系统地回顾了内质网在哺乳动物卵母细胞中的功能、结构以及与其他细胞器的相互作用 | 文章结合了内质网在体外成熟中引发的临床问题，并通过单细胞RNA测序识别了内质网的机制 | NA | 探讨内质网在哺乳动物卵母细胞中的时空分布及其功能 | 哺乳动物卵母细胞及其内质网 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | NA |
| 1252 | 2024-08-05 |
Exploring the heterogeneity of white adipose tissue in mouse and man
2023-06, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2023.102045
PMID:37094486
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研究论文 | 本文讨论了人类和小鼠白色脂肪组织的异质性，特别是成熟脂肪细胞的异质性 | 该研究通过单核RNA测序和空间转录组学拓展了对脂肪细胞亚群体的理解 | 该研究未说明具体实验数据或样本规模 | 探讨脂肪组织的异质性及其在代谢病生理中的潜在贡献 | 人类和小鼠的白色脂肪组织及其细胞成分 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | 细胞类型相关的数据 | NA |
| 1253 | 2024-08-05 |
Activation of lineage competence in hemogenic endothelium precedes the formation of hematopoietic stem cell heterogeneity
2023-06, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-023-00797-0
PMID:37016019
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研究论文 | 该文章揭示了血液干细胞异质性的起源及形成机制 | 使用单细胞多组学结合谱系追踪和功能检测，首次展示了胚胎HSPCs起源于异质性血管内皮细胞 | 研究主要集中在斑马鱼胚胎中，可能无法完全适用于其他物种 | 探讨HSPC异质性的形成及其生物功能 | 胚胎中来源于血管内皮细胞的血液干细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞多组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎中的多个细胞样本 |
| 1254 | 2024-08-05 |
Smooth Muscle Cell Klf4 Expression Is Not Required for Phenotype Modulation or Aneurysm Formation in Marfan Syndrome Mice-Brief Report
2023-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.122.318509
PMID:37128911
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研究论文 | 该研究探讨了Klf4在Marfan综合征小鼠平滑肌细胞表型调节和动脉瘤形成中的作用 | 这项研究证实了Klf4并不是开始平滑肌细胞表型调节的必要因素，但可能对高度去分化的平滑肌细胞中的软骨生成基因发挥调控作用 | 研究未探讨Klf4在其他潜在机制或其它类型细胞中的角色 | 研究Marfan综合征中平滑肌细胞的表型变化与Klf4的关系 | Marfan综合征小鼠模型 | 数字病理学 | NA | RNA测序, 组化技术 | NA | 组织切片, 单细胞RNA测序 | 至少包含24只小鼠 |
| 1255 | 2024-08-05 |
Stiffness Restricts the Stemness of the Intestinal Stem Cells and Skews Their Differentiation Toward Goblet Cells
2023-06, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.02.030
PMID:36871599
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研究论文 | 本研究探讨了组织硬度如何影响肠道干细胞的命运和功能。 | 提出了组织硬度对肠道干细胞的干性和分化路径的显著调节作用。 | 没有提及具体的样本量和详细的实验条件。 | 旨在确定组织硬度对肠道干细胞的影响及其在炎症性肠病中的作用。 | 研究对象为肠道干细胞及其分化后代。 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 肠道组织样本 | 小鼠结肠模型和人类IBD样本 |
| 1256 | 2024-08-05 |
Multi-omics identification of an immunogenic cell death-related signature for clear cell renal cell carcinoma in the context of 3P medicine and based on a 101-combination machine learning computational framework
2023-Jun, The EPMA journal
DOI:10.1007/s13167-023-00327-3
PMID:37275552
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研究论文 | 该研究构建了一个与免疫性细胞死亡相关的签名，以预测透明细胞肾细胞癌的预后 | 创新点在于开发了一个包含10种机器学习算法及其101种组合的共识免疫性细胞死亡相关签名 | 研究的局限性在于没有提及样本的多样性和外部验证集的详细信息 | 研究的目的在于建立有效的预后生物标志物以支持个体化医疗 | 研究对象为透明细胞肾细胞癌患者及其免疫相关基因 | 数字病理学 | 肾癌 | qRT-PCR | 机器学习 | 基因组、单细胞转录组、散装转录组数据 | 涉及的样本数量和类型未具体说明 |
| 1257 | 2024-08-05 |
SCUBE2 mediates bone metastasis of luminal breast cancer by modulating immune-suppressive osteoblastic niches
2023-06, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-023-00810-6
PMID:37142671
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研究论文 | 本文展示了ER调控的分泌蛋白SCUBE2如何促进乳腺癌的骨转移。 | 揭示了SCUBE2通过调节免疫抑制性成骨细胞微环境，促进乳腺癌骨转移的机制。 | 该研究可能未能涵盖所有乳腺癌亚型的骨转移机制。 | 探讨ER阳性乳腺癌骨转移的特异机制及其潜在的治疗方法。 | 聚焦于ER阳性乳腺癌及其在骨转移中的行为。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 肿瘤细胞数据 | 多个转移模型 |
| 1258 | 2024-08-05 |
Involucrin Modulates Vitamin D Receptor Activity in the Epidermis
2023-06, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.12.009
PMID:36642403
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研究论文 | 这篇文章研究了角质形成细胞中的involucrin如何调节维生素D受体的活性 | 研究揭示了involucrin在皮肤中对维生素D受体活性产生积极影响的功能角色 | 研究的功能意义尚不清楚 | 探讨involucrin如何在表皮中调节维生素D受体的功能 | 使用Ivl小鼠和野生型小鼠研究维生素D受体活性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，16S细菌分型 | NA | 基因组数据 | 使用Ivl和野生型小鼠进行的研究 |
| 1259 | 2024-08-05 |
Systematic dissection of coordinated stromal remodeling identifies Sox10+ glial cells as a therapeutic target in myelofibrosis
2023-06-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.05.002
PMID:37267917
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研究论文 | 该文章系统性地分析了骨髓微环境的重塑，识别出Sox10+神经胶质细胞作为骨髓纤维化的治疗靶点 | 研究首次确定骨髓内Sox10+神经胶质细胞在骨髓纤维化中的重要作用，并提出它们作为潜在的治疗靶点 | 研究未能深入探讨小胶质细胞在纤维化过程中具体的分子机制 | 探索骨髓微环境重塑在纤维化病理中的作用 | 以小鼠模型为研究对象，分析其骶髓细胞的来源和功能 | 数字病理学 | 骨髓纤维化 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞 | 多个小鼠模型的多样本 |
| 1260 | 2024-08-05 |
Transcriptional and Clonal Characterization of Cytotoxic T Cells in Crescentic Glomerulonephritis
2023-06-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000116
PMID:36913357
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研究论文 | 本研究描述了在新月体肾小管炎中细胞毒性T细胞的转录和克隆特征。 | 本文首次揭示了新月体肾小管炎中克隆扩展的细胞毒性T细胞的致病功能，确定了GzmB作为潜在的治疗靶点。 | 该研究主要集中于T细胞的功能特征，可能未全面了解其他免疫细胞在新月体肾小管炎中的作用。 | 阐明新月体肾小管炎中T细胞的浸润及其对肾损伤的影响。 | 研究对象包括ANCA相关新月体肾小管炎患者及实验性新月体肾小管炎小鼠模型中的T细胞。 | 数字病理学 | 免疫介导的肾病 | 单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序 | NA | 组织样本 | 来自ANCA相关新月体肾小管炎患者的肾活检和血液样本，以及实验性小鼠的样本 |