单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 1221 - 1240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1221 | 2024-08-04 |
Re-convolving the compositional landscape of primary and recurrent glioblastoma reveals prognostic and targetable tissue states
2023-05-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38186-1
PMID:37142563
|
研究论文 | 本文研究了原发性和复发性胶质母细胞瘤中的细胞组成和转录状态 | 通过研究特定亚群体之间的共居模式识别了三种组成性组织状态，并提出了针对GBM微环境相互依赖性的治疗方案 | 未说明样本数量和研究范围的具体限制 | 本研究旨在确定原发性和复发性胶质母细胞瘤的细胞组成及其转录状态 | 研究对象为原发性和复发性胶质母细胞瘤中的细胞类型及其相互关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单核RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA数据 | NA |
| 1222 | 2024-08-05 |
Esm-1 mediates transcriptional polarization associated with diabetic kidney disease
2023-Mar-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.01.530562
PMID:36993439
|
研究论文 | 本研究探讨了Esm-1在糖尿病肾病中的转录极化机制 | 揭示了Esm-1在糖尿病肾病发病机制中的作用及其在肾脏内皮细胞中的表达模式 | 未详细研究Esm-1在所有成熟组织中的表达及其潜在的生物学效应 | 研究Esm-1在糖尿病肾病中的表达和功能 | 研究对象包括成年人和小鼠的肾脏内皮细胞 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 27,786个肾脏内皮细胞，及20名健康受试者和41名糖尿病肾病患者 |
| 1223 | 2024-08-05 |
Benchmarking single-cell hashtag oligo demultiplexing methods
2023-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad086
PMID:37829177
|
研究论文 | 本研究对七种HTO去复用工具的性能进行了评估 | 首次比较了七种HTO去复用工具的性能，并引入了对比基于遗传变异的数据 | 部分方法在较低质量数据下表现不佳 | 评估多种HTO去复用工具在单细胞RNA测序中的性能 | 七种HTO去复用工具 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 七种工具，在多个样本中使用遗传变异进行比较 |
| 1224 | 2024-08-05 |
Spatial Single Cell Analysis of Proteins in 2D Human Gastruloids Using Iterative Immunofluorescence
2023-Oct, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.915
PMID:37882990
|
研究论文 | 本文描述了一种迭代免疫荧光协议和计算管道，用于在2D人类胚层模型中分析蛋白质的空间模式形成 | 提出的迭代免疫荧光协议实现了比标准免疫荧光技术更高的多重测量能力，并能够同时分析27种蛋白质 | 未详细讨论方法在实际生物样本中的应用限制 | 揭示细胞信号如何在时间和空间上共同指示细胞命运 | 主要研究2D人类胚层的细胞及其在不同信号通路下的蛋白质表达 | 数字病理学 | NA | 免疫荧光 | NA | 图像 | 超过27种蛋白质的单细胞表达聚类分析 |
| 1225 | 2024-08-05 |
Single-Cell Profiling of Tumor Immune Microenvironment Reveals Immune Irresponsiveness in Gastric Signet-Ring Cell Carcinoma
2023-07, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.03.008
PMID:36921674
|
研究论文 | 本研究揭示了胃信号环细胞癌（GSRCC）肿瘤免疫微环境的特征及其临床意义 | 提供了GSRCC肿瘤免疫微环境特征的全面分子图谱，并指出CXCL13在适应性免疫无反应中的中介作用 | 样本量有限，仅包含32名晚期GC患者，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨胃信号环细胞癌的肿瘤免疫微环境特征及其对临床结果的影响 | 纳入32名不同亚型的晚期胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 针对抗体面板的质量细胞计数 | NA | RNA, 蛋白质 | 32名晚期胃癌患者 |
| 1226 | 2024-08-05 |
Functional characterization of age-dependent p16 epimutation reveals biological drivers and therapeutic targets for colorectal cancer
2023-May-04, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02689-y
PMID:37143122
|
研究论文 | 本文探讨了与年龄相关的p16表观突变在结直肠癌中的角色及其潜在的治疗靶点 | 本研究首次揭示了年龄依赖的p16表观突变在肠道肿瘤发生中的生物驱动因素和治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，临床适用性需要进一步验证 | 改善结直肠癌患者的临床治疗 | 对携带Apc突变和p16表观突变的小鼠进行肿瘤发展与进展的研究 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 小鼠肿瘤和结肠上皮细胞样本 |
| 1227 | 2024-08-04 |
Transcriptomic signature, bioactivity and safety of a non-hepatoxic analgesic generating AM404 in the mid-brain PAG region
2023-May-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2883310/v1
PMID:37205420
|
研究论文 | 这篇文章探讨了一种新型非肝毒性的镇痛药SRP-001的转录组特征、生物活性和安全性 | SRP-001作为一种小分子药物，具有非肝毒性并能够在中脑PAG区域生成AM404，展现出与传统镇痛药相比的创新效果 | 研究主要集中在转录组学的分析上，未提供大规模的临床验证数据 | 本研究旨在开发一种安全有效的非opioid镇痛药以替代现有的药物 | 主要研究对象是SRP-001及其在中脑PAG区域的生物作用及安全性 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 生物样本 | NA |
| 1228 | 2024-08-05 |
Dedifferentiation maintains melanocyte stem cells in a dynamic niche
2023-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-05960-6
PMID:37076619
|
研究论文 | 该文章研究了黑色素干细胞在动态微环境中的去分化现象 | 文章提出黑色素干细胞在发育和成熟过程中在不同状态间转变的机制，挑战了现有理论 | 研究未详细探讨外部因素如何影响黑色素干细胞的迁移和去分化 | 探索黑色素干细胞如何在动态微环境中维持 | 黑色素干细胞及其在毛囊中的行为 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，活体成像 | NA | NA | NA |
| 1229 | 2024-08-05 |
Identification of GPI-anchored protein LYPD1 as an essential factor for odontoblast differentiation in tooth development
2023-05, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.104638
PMID:36963497
|
研究论文 | 本研究识别了GPI锚定蛋白LYPD1作为牙齿发育中牙本质细胞分化的关键因素 | LYPD1被发现是发育中牙齿中前牙本质细胞的新标记，并且在通过其GPI-AP功能调节Smad1/5/8磷酸化以促进牙本质细胞分化中扮演重要角色 | 研究仅在小鼠牙髓细胞和外源性器官培养系统中验证，可能无法完全概括人类牙齿发育机制 | 探讨脂质筏对牙齿发育的具体影响，并确认LYPD1在牙本质细胞分化中的作用 | 通过微阵列和单细胞RNA测序方法研究前牙本质细胞以及相关的信号传导机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了小鼠牙髓细胞和牙胚的外源性器官培养 |
| 1230 | 2024-08-04 |
Proteomic Profiling of Fallopian Tube-Derived Extracellular Vesicles Using a Microfluidic Tissue-on-Chip System
2023-Mar-27, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering10040423
PMID:37106610
|
研究论文 | 本研究建立了一种微流控平台来培养人类输卵管上皮以收集细胞外囊泡，并首次报告了295种常见的输卵管衍生小细胞外囊泡蛋白 | 首次描述了由人类输卵管衍生的小细胞外囊泡蛋白质组成及其与腺癌转录组的关联 | 目前对hFTE衍生的小细胞外囊泡的内容和功能理解有限 | 旨在揭示输卵管来源的小细胞外囊泡的基线蛋白质谱以及其在卵巢癌发生中的潜在作用 | 研究对象是人类输卵管上皮和其衍生的小细胞外囊泡 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 质谱分析 | 微流控组织芯片 | 蛋白质 | 295种小细胞外囊泡蛋白 |
| 1231 | 2024-08-05 |
Loss of MC1R signaling implicates TBX3 in pheomelanogenesis and melanoma predisposition
2023-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.10.532018
PMID:37090624
|
研究论文 | 本研究揭示了MC1R信号传导缺失如何通过TBX3影响红色头发颜色（RHC）性状和黑色素瘤的易感性 | 首次发现TBX3在红色头发颜色性状中的作用，并揭示其与黑色素瘤易感性之间的关系 | 研究主要基于小鼠模型，结果是否完全适用于人类尚需进一步验证 | 探究MC1R信号传导缺失如何通过改变黑色素生成影响黑色素瘤的易感性 | 研究对象为来自RHC小鼠模型的黑素细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因数据 | 通过RHC小鼠模型提取的黑素细胞 |
| 1232 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveal extracellular vesicles secretion with a cardiomyocyte proteostasis signature during pathological remodeling
2023-01-21, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04402-9
PMID:36681760
|
研究论文 | 该文章揭示了在病理重塑过程中，心肌细胞分泌具有蛋白质稳态特征的外泌体 | 首次通过单细胞转录组分析揭示心肌细胞在病理重塑中的外泌体分泌机制以及相关的蛋白质特征 | 该研究主要集中在小鼠模型，临床相关性尚需进一步验证 | 研究心肌细胞在病理重塑过程中外泌体的分泌与蛋白质稳态特征的关系 | 包含诱导性心肌特异性Wnt激活的小鼠模型及人源诱导多能干细胞衍生的心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用了β-cat小鼠模型和来自人源诱导多能干细胞的心肌细胞 |
| 1233 | 2024-08-05 |
CONSTRUCTION OF SEPSIS DIAGNOSTIC MODELS AND IDENTIFICATION OF MACROPHAGE SUBPOPULATIONS BASED ON PYROPTOSIS-RELATED GENES
2023-07-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002137
PMID:37179249
|
研究论文 | 本文构建了基于炎性细胞死亡相关基因的败血症诊断模型，并识别了巨噬细胞亚群 | 创新点在于基于10种关键炎性细胞死亡相关基因构建败血症风险评分，并确定了一种与预后相关的巨噬细胞亚群 | 研究局限性在于样本来源仅依赖公共数据库，可能忽略了临床样本的多样性 | 研究炎性细胞死亡在败血症患者中的预后和诊断价值 | 研究对象包括败血症患者的单细胞和总体RNA序列数据 | 数字病理 | 败血症 | RNA-seq | 逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 根据公共数据库进行分析，样本数量未明确 |
| 1234 | 2024-08-04 |
Concerted epithelial and stromal changes during progression of Barrett's Esophagus to invasive adenocarcinoma exposed by multi-scale, multi-omics analysis
2023-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.08.544265
PMID:37333362
|
研究论文 | 本研究通过多规模、多组学分析揭示了巴雷特食管进展为侵袭性腺癌过程中的上皮和基质的变化 | 整合单细胞转录组学、细胞外基质蛋白组学等多个组学的分析，揭示了肿瘤进程的共享特征和患者特异特征 | 该研究样本数量相对较少，且仅限于特定患者的病理进程 | 探讨巴雷特食管向侵袭性腺癌进展中的生物学变化 | 分析来自12名患者的64个样本，研究其从鳞状上皮到腺癌的发展路径 | 数字病理学 | 食管腺癌 | 单细胞转录组学，细胞外基质蛋白组学，组织力学，空间蛋白组学 | NA | 样本 | 64个样本来自12名患者 |
| 1235 | 2024-08-05 |
Spatial-temporal proliferation of hepatocytes during pregnancy revealed by genetic lineage tracing
2023-11-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.09.002
PMID:37794588
|
研究论文 | 本研究揭示了妊娠期间肝细胞的时空增殖模式及其来源 | 发现妊娠期肝细胞增殖的独特时空模式，主要来源于zone 2的Ccnd1肝细胞 | 研究主要集中在小鼠模型，临床应用效果尚未测试 | 研究妊娠期间母体肝脏细胞来源和增殖机制 | 妊娠过程中肝细胞的增殖及其来源 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，双重重组酶介导的遗传谱系追踪 | NA | NA | NA |
| 1236 | 2024-08-04 |
Cardiac splicing as a diagnostic and therapeutic target
2023-08, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-022-00828-0
PMID:36653465
|
综述 | 本文讨论了心脏替代剪接在心肌健康和疾病中的重要性及其作为诊断和治疗靶点的潜力 | 强调了心脏剪接调节因子作为治疗靶点的识别以及在临床试验中评估剪接调节剂的转化管道的开发 | 可能缺乏对所有类型心脏病患者的广泛适应性和细节深入的分析 | 识别心脏剪接在心肌疾病中的作用，以改善诊断和治疗 | 心脏病患者及其心肌替代剪接机制的研究 | 数字病理学 | 心肌病 | 多组学技术和长读取及单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 1237 | 2024-08-07 |
Identifying leukocyte phenotypes by scRNA-seq to predict cardiovascular risk
2023-07, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-023-00891-1
PMID:37217590
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1238 | 2024-08-04 |
Differentiation of IL-26+ TH17 intermediates into IL-17A producers via epithelial crosstalk in psoriasis
2023-06-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39484-4
PMID:37391412
|
研究论文 | 本研究识别出IL-26+ T17中间细胞通过上皮细胞间的相互作用分化为IL-17A产生细胞的机制 | 首次揭示IL-26在银屑病T17细胞应答中的作用，及其通过调节基底角质细胞的TGF-β1产生促进自身分化的过程 | 未详细探讨IL-26在其他免疫环境中的作用及其是否适用于其他疾病 | 研究IL-26在银屑病中作为T17细胞前体的分化作用 | IL-26+ T17中间细胞及其在银屑病皮肤中的作用 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序，TCR测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1239 | 2024-08-05 |
MICROGLIA AND INFILTRATING T-CELLS ADOPT LONG-TERM, AGE-SPECIFIC, TRANSCRIPTIONAL CHANGES AFTER TRAUMATIC BRAIN INJURY IN MICE
2023-02-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002027
PMID:36730818
|
研究论文 | 本研究探讨了老年小鼠在创伤性脑损伤后的微胶质细胞和浸润T细胞的长期转录变化 | 研究发现老年小鼠的微胶质细胞和T细胞在创伤后表现出独特的基因特征，提供了有关年龄相关脑损伤反应的新见解 | 研究仅基于小鼠模型，可能无法完全推广到人类 | 研究创伤性脑损伤后，不同年龄小鼠的免疫反应及其机制 | 年轻和老年的C57BL/6小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠各组（具体样本数未提供） |
| 1240 | 2024-08-04 |
The Functional Roles of MDSCs in Severe COVID-19 Pathogenesis
2023-12-23, Viruses
DOI:10.3390/v16010027
PMID:38257728
|
评论 | 本文总结了骨髓来源抑制细胞(MDSCs)在严重COVID-19发病机制中的功能角色 | 文章提出MDSCs的早期扩展可能是严重COVID-19进展的关键特征，并探讨其作为潜在预后生物标志物的作用 | 缺乏对严重COVID-19进展的全面分子决定因素的阐明 | 探讨骨髓来源抑制细胞在严重COVID-19发病机制中的作用 | 严重COVID-19患者的MDSCs及其功能 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序, 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 通过转录组RNA-seq和单细胞测序数据的荟萃分析得出的数据 |