单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5351 篇文献，本页显示第 1221 - 1240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1221 | 2024-08-05 |
Non-classical circulating monocytes expressing high levels of microsomal prostaglandin E2 synthase-1 tag an aberrant IFN-response in systemic sclerosis
2023-Nov, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2023.103097
PMID:37633117
|
研究论文 | 该研究探讨了在系统性硬化症中，外周血单核细胞的组成和活化异变 | 首次揭示了非经典单核细胞在系统性硬化症患者中的过度表达及其异常IFN反应 | 样本数量较小，仅包括8名系统性硬化症患者和8名对照组 | 了解CD14外周血单核细胞在系统性硬化症中的作用 | 系统性硬化症患者与健康对照患者的外周血单核细胞 | 数字病理 | 系统性硬化症 | 单细胞转录组分析 (scRNA-seq) | NA | 血液样本 | 共16个样本，8名系统性硬化症患者和8名对照组 |
| 1222 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of the nervous system at small and large scales with instant partitions
2023-Jul-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.14.549051
PMID:37503160
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研究论文 | 这篇文章探讨了PIPseq在神经科学中进行单细胞RNA测序的应用。 | 引入PIPseq方法，能够在不同规模和神经科学实验中收集和序列化单细胞基因表达变化。 | 样本输入大小和初始资本投入的限制可能会排除一些研究者的应用。 | 研究PIPseq在单细胞RNA测序中的有效性和应用。 | 涉及多种样本和实验，包括小鼠模型和非传统模型物种的基因表达分析。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 数十个样本（每个样本1,000-100,000个细胞） |
| 1223 | 2024-08-05 |
A targeted CRISPR-Cas9 mediated F0 screen identifies genes involved in establishment of the enteric nervous system
2023-Dec-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.28.573581
PMID:38234831
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研究论文 | 本研究利用CRISPR-Cas9介导的筛查识别参与肠神经系统建立的基因 | 使用高效的CRISPR筛查方法，发现新基因进而推动肠神经系统的研究 | 研究仅限于斑马鱼模型，可能不完全适用于其他脊椎动物 | 探讨和识别参与肠神经系统发育的基因 | 以斑马鱼为模型研究肠神经系统的形成与基因调控 | 数字病理学 | Hirschsprung病 | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 1224 | 2024-08-04 |
Combined near infrared photoacoustic imaging and ultrasound detects vulnerable atherosclerotic plaque
2023-11, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 该研究显示近红外自发光声成像(NIRAPA)与超声联合可检测易损的动脉粥样硬化斑块 | 创新点在于首次将近红外自发光声成像与超声成像结合，用于区分稳定与易损斑块 | 研究的局限性在于仅在25名患者的切除斑块上进行的体外研究 | 研究旨在通过成像技术有效管理动脉粥样硬化疾病 | 研究对象为25例患者的切除动脉粥样硬化斑块 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 近红外自发光声成像(NIRAPA)与超声成像 | NA | 图像 | 25个切除的动脉粥样硬化斑块样本 |
| 1225 | 2024-08-05 |
Hypoxia-Inducible Factor-1α in SM22α-Expressing Cells Modulates Alveolarization
2023-10, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0045OC
PMID:37290124
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研究论文 | 本文研究了HIF-1α在SM22α表达细胞中的作用对肺泡化的影响 | 文章创新性地探讨了HIF-1α在特定间充质细胞亚群中调节出生后肺泡化的机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，可能无法完全推及人类 | 研究HIF-1α在SM22α表达细胞中的功能及其对肺发育的影响 | 以SM22α-表达细胞为对象，分析其在肺泡化中的作用 | 数字病理学 | 慢性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 使用了小鼠模型和早产儿样本 |
| 1226 | 2024-08-04 |
Cardiac pericytes mediate the remodeling response to myocardial infarction
2023-05-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI162188
PMID:37183820
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研究论文 | 这篇文章探讨了心脏周细胞在心肌梗死后的重塑反应中的作用 | 首次揭示了心脏周细胞在急性缺血损伤后调控血管稳态和纤维化反应的关键角色 | 未详细探讨心脏周细胞的全部作用机制 | 旨在阐明心脏周细胞在缺血性重塑中的角色 | 心脏周细胞与心肌梗死后的纤维化及血管通透性变化 | 数字病理学 | 心脏病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 多个来源的心脏周细胞样本 |
| 1227 | 2024-08-04 |
Regulation of human salt-sensitivite hypertension by myeloid cell renin-angiotensin-aldosterone system
2023, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2023.1208270
PMID:37534363
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研究论文 | 本研究探讨了饮食盐对人类单核细胞免疫细胞中肾素-血管紧张素-醛固酮系统基因表达的影响及其在盐敏感性高血压中的作用 | 揭示了饮食盐摄入对人类单核细胞中RAAS表达的调控机制与系统性RAAS的不同 | 未探讨盐敏感高血压的长期影响和其他潜在的影响因素 | 研究盐敏感高血压中免疫细胞对饮食盐影响的机理 | 人类的单核细胞免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | bulk和单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了高盐处理的人类免疫细胞 |
| 1228 | 2024-08-05 |
Single-Cell Multiomics
2023-08-10, Annual review of biomedical data science
IF:7.0Q1
|
review | 本综述讨论了单细胞多组学技术和计算集成方法，旨在结合不同生物数据以获得更深入的生物学见解 | 提出了新颖的单细胞技术以测量基因组、表观基因组、蛋白组和空间数据，并探索计算集成方法 | NA | 旨在通过集成不同模态的数据来加深对细胞生物学的理解 | 探讨不同单细胞技术和计算集成方法 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组、表观基因组、蛋白组、空间数据 | NA |
| 1229 | 2024-08-05 |
Emergence of highly profibrotic and proinflammatory Lrat+Fbln2+ HSC subpopulation in alcoholic hepatitis
2023-07-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32793
PMID:36181700
|
研究论文 | 本研究识别了在酒精性肝炎中HSC的高纤维化和促炎性亚群 | 发现了Lrat+Fbln2+细胞亚群在酒精性肝炎中的显著扩展及其功能 | 实验主要集中在小鼠模型，可能与人类疾病表现有差异 | 研究酒精性肝炎中HSC和门静脉成纤维细胞的相对作用 | 小鼠模型中的胶原蛋白1α1表达细胞亚群 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 涉及Col1a1-GFP小鼠的多种处理，包括酒精性肝炎、CCl4和胆管结扎 |
| 1230 | 2024-08-05 |
The mitochondrial unfolded protein response regulates hippocampal neural stem cell aging
2023-06-06, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2023.04.012
PMID:37146607
|
研究论文 | 这篇文章探讨了线粒体未折叠蛋白反应如何影响海马神经干细胞的衰老 | 创新点在于首次将线粒体蛋白折叠压力与神经干细胞衰老的关系建立起来 | 该研究可能仅限于小鼠模型，缺乏对人类的直接验证 | 研究线粒体蛋白折叠压力在神经干细胞衰老中的作用 | 年轻和老年小鼠的海马神经干细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 年轻和老年小鼠的单细胞样本 |
| 1231 | 2024-08-04 |
Profiling the bloodstream form and procyclic form Trypanosoma brucei cell cycle using single-cell transcriptomics
2023-05-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86325
PMID:37166108
|
研究论文 | 本研究使用单细胞转录组学剖析了非同步细胞群体中非洲锥虫血流型和前周期型的细胞周期 | 该研究首次在未分选或同步的细胞中获得了高分辨率的细胞周期调控转录组，并提出了一种高效的冻融策略用于冷冻保存单细胞的转录组分析 | 研究中使用的细胞群体为非同步，可能影响结果的精确性 | 研究非洲锥虫不同生物型的细胞周期及其调控机制 | 分析了血流型和前周期型锥虫的细胞周期相关转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 1232 | 2024-08-04 |
Novel Populations of Lung Capillary Endothelial Cells and Their Functional Significance
2023-May-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2887159/v1
PMID:37205391
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学发现了肺毛细血管内皮细胞的新亚群及其功能意义 | 识别出五种具有不同分子特征和角色的新亚群，包括与血管分区和再生修复相关的细胞 | 未提及具体的实验数据或样本特征，可能影响所发现细胞的普遍性 | 探索肺毛细血管内皮细胞的多样性及其在肺部疾病中的作用 | 新鉴定的肺毛细血管内皮细胞亚群 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 (scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1233 | 2024-08-04 |
IL-13-associated epithelial remodeling correlates with clinical severity in nasal polyposis
2023-05, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.12.826
PMID:36736797
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研究论文 | 这篇文章探讨了上皮细胞重塑与慢性鼻窦炎的炎症表型和疾病结果之间的关系 | 本研究首次通过单细胞测序和RNA测序分析，揭示了IL-13介导的上皮重塑与鼻息肉临床严重程度之间的相关性 | 研究的样本主要来自于慢性鼻窦炎患者，未涵盖所有潜在的鼻窦炎类型及其相应的临床数据 | 本研究旨在理解上皮细胞重塑与慢性鼻窦炎的炎症表型和疾病结果之间的关系 | 研究对象为慢性鼻窦炎患者，比较有鼻息肉和无鼻息肉患者的上皮细胞特征 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 参与研究的样本包括来自慢性鼻窦炎患者的筛查样本和健康对照样本 |
| 1234 | 2024-08-04 |
Apoptotic cell fragments locally activate tingible body macrophages in the germinal center
2023-03-16, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.02.004
PMID:36868219
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研究论文 | 文章探讨了凋亡细胞碎片如何在生发中心局部激活蜕变体巨噬细胞 | 研究揭示了蜕变体巨噬细胞的前体来源及其对凋亡细胞的捕获机制 | 本文没有讨论其他类型巨噬细胞的潜在作用 | 研究凋亡细胞在免疫反应中的作用及其对巨噬细胞的影响 | 研究对象为在淋巴结的蜕变体巨噬细胞及其与凋亡细胞的相互作用 | 数字病理学 | 自身免疫病 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 免疫淋巴结中的单细胞簇 |
| 1235 | 2024-08-05 |
A single-cell atlas of murine reproductive tissues during preterm labor
2023-01-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111846
PMID:36599348
|
研究论文 | 本文生成了小鼠生殖组织在早产劳动期间的单细胞图谱。 | 使用单细胞RNA测序技术揭示了早产劳动对特定免疫和非免疫细胞亚群转录组特征的影响 | 研究主要集中在小鼠模型，可能不完全适用于人类早产的情况 | 揭示早产劳动中生殖组织的细胞景观和细胞通讯 | 小鼠子宫、蜕膜和宫颈的单细胞数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠生殖组织的多个细胞类型 |
| 1236 | 2024-08-04 |
Statistical Inference for High-Dimensional Generalized Linear Models with Binary Outcomes
2023, Journal of the American Statistical Association
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/01621459.2021.1990769
PMID:37366472
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研究论文 | 本文提出了一种高维二元广义线性模型统计推断的统一框架 | 引入了新的下界技术，提供了自适应的最优置信区间分析，并展示了对回归向量稀疏性的适应性 | 关于已知与未知设计分布的情况的讨论较为有限 | 研究高维二元广义线性模型的统计推断方法 | 研究高维二元广义线性模型，及其置信区间和假设检验的构建 | 统计 | NA | 仿真研究，单细胞RNA序列分析 | 广义线性模型 | RNA-seq数据 | 单细胞RNA-seq数据集中的样本 |
| 1237 | 2024-08-04 |
Multimodal single-cell and whole-genome sequencing of small, frozen clinical specimens
2023-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01268-9
PMID:36624340
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研究论文 | 本文展示了从小型冷冻临床标本中进行多模态单细胞和全基因组测序的可能性 | 首次将多模态单核RNA/T细胞受体测序、空间转录组学和全基因组测序应用于小型冷冻组织 | 仍然面临一些实际和预分析挑战，可能影响方法的广泛临床应用 | 探索小型冷冻临床标本中进行单细胞基因组学的可行性和应用 | 研究对象包括皮肤黑色素瘤患者以及与之匹配的全基因组数据 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | snRNA/TCR测序, 全基因组测序 | NA | 基因组数据 | 从KEYNOTE-001试验中收集的多个黑色素瘤样本和与其匹配的全基因组数据 |
| 1238 | 2024-08-05 |
Age-associated B cells are heterogeneous and dynamic drivers of autoimmunity in mice
2023-05-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221346
PMID:36828389
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研究论文 | 年龄相关的B细胞（ABCs）在小鼠中是异质性和动态的自身免疫驱动因子 | 首次揭示了ABCs在狼疮发病机制中的直接作用及其异质性和动态特性 | 研究主要集中于小鼠模型，临床相关性尚未得到验证 | 探讨年龄相关B细胞在自身免疫病中的作用 | 小鼠中的年龄相关B细胞及其在自身免疫中的作用 | 数字病理学 | 狼疮 | scRNA-seq | MRL/lpr SLE模型 | 细胞数据 | NA |
| 1239 | 2024-08-05 |
An atlas of gene regulatory networks for memory CD4 + T cells in youth and old age
2023-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.07.531590
PMID:36945549
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研究论文 | 该文章整合了单细胞RNA测序、scATAC-seq和基因组规模建模，表征了年轻和老年小鼠的记忆CD4 T细胞的基因调控网络 | 文章中建立的基因调控网络为记忆T细胞中的预测调控机制提供了全面资源，并揭示了与年龄相关的CD4 TM的变化 | 研究中可能缺乏对其他免疫细胞类型的全面考察 | 研究旨在阐明衰老对记忆CD4 T细胞功能和调控机制的影响 | 研究对象为年轻和老年小鼠的记忆CD4 T细胞 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, scATAC-seq | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠的13个CD4 TM群体 |
| 1240 | 2024-08-07 |
Heterogeneity and transcriptional drivers of triple-negative breast cancer
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113564
PMID:38100350
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研究论文 | 本研究通过结合功能和分子 profiling 以及计算分析，定义了三阴性乳腺癌（TNBC）的转录、表观遗传和代谢亚型及其亚型驱动的超级增强子和转录因子 | 本研究首次揭示了三阴性乳腺癌的转录亚型在单细胞水平上的相对均一性，并发现 PRRX1 转录因子是驱动间质型 TNBC 的关键因素 | NA | 旨在表征三阴性乳腺癌的异质性及其转录驱动因素 | 三阴性乳腺癌的转录、表观遗传和代谢亚型及其驱动因素 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞 RNA 测序 | NA | 转录组数据 | 大规模多平台多组学研究 |