单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 5350 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
101 2025-10-22
Universal recording of cell-cell contacts in vivo for interaction-based transcriptomics
2023-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种通用型细胞间接触记录技术uLIPSTIC,用于在体监测免疫细胞间的瞬时相互作用 将LIPSTIC技术从特定CD40L-CD40通路扩展为不依赖特定受体-配体的通用型细胞相互作用记录平台 技术仍处于开发验证阶段,在更多生物系统中的适用性有待进一步验证 建立能够普遍记录体内细胞间物理相互作用的技术方法 免疫细胞(T细胞、树突状细胞、调节性T细胞、滤泡辅助T细胞)与肠道上皮细胞等 单细胞生物学 NA 酶标记技术、单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
102 2025-10-17
Stomach encyclopedia: Combined single-cell and spatial transcriptomics reveal cell diversity and homeostatic regulation of human stomach
2023-10-31, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 通过单细胞和空间转录组学技术构建人类胃部细胞图谱,揭示胃部细胞多样性和稳态调控机制 构建了迄今为止最大的胃部单细胞和空间转录组数据集,发现LEFTY1作为未表征的干细胞标志物 NA 阐明人类胃部的精确细胞生物学特征和稳态调控机制 人类胃部组织 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 约380,000个细胞 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
103 2025-10-16
A Novel Prognostic Pyroptosis-Related Gene Signature Correlates to Oxidative Stress and Immune-Related Features in Gliomas
2023, Oxidative medicine and cellular longevity
研究论文 构建并验证了一个基于焦亡相关基因的胶质瘤预后模型 首次将焦亡相关基因与胶质瘤预后关联,并构建了包含9个基因的预后特征 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 开发胶质瘤预后预测工具并探索潜在治疗靶点 胶质瘤患者和U87胶质瘤细胞系 生物信息学 胶质瘤 单细胞RNA测序,LASSO-Cox回归,Kaplan-Meier分析,KEGG/GO富集分析 预后风险模型 基因表达数据,临床数据 TCGA和CGGA队列的胶质瘤患者样本 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
104 2025-10-15
Differential detection workflows for multi-sample single-cell RNA-seq data
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发用于单细胞转录组数据中差异检测分析的工作流程 提出差异检测(DD)概念,关注基因在样本或细胞中被检测到的平均比例差异,而非传统差异基因表达(DE)的平均表达量差异 NA 建立联合评估差异基因表达和差异检测的统一工作流程 单细胞转录组数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
105 2025-10-12
A transcriptional response to replication stress selectively expands a subset of Brca2-mutant mammary epithelial cells
2023-08-25, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了BRCA2突变乳腺上皮细胞在复制压力下通过转录反应选择性扩增激素受体阴性管腔细胞的机制 首次发现BRCA2杂合突变乳腺器官在复制压力下通过激活特定转录反应选择性扩增HR-管腔细胞,并鉴定出Tspan8和Thrsp基因在此过程中的关键作用 研究主要基于乳腺器官模型,需要在体内环境中进一步验证这些发现 探究BRCA2突变如何影响乳腺上皮亚群在复制压力下的行为 Brca2突变乳腺器官和乳腺上皮细胞 癌症生物学 乳腺癌 CyTOF质谱流式,scRNA-seq单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9基因编辑 NA 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 野生型和Brca2突变乳腺器官 NA 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 NA NA
106 2025-10-11
A comparative study of in vitro air-liquid interface culture models of the human airway epithelium evaluating cellular heterogeneity and gene expression at single cell resolution
2023-Aug-28, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 比较BCi-NS1.1细胞系与原发性细胞来源的气液界面培养模型在单细胞分辨率下的细胞异质性和基因表达差异 首次在单细胞分辨率下系统比较工程化基底细胞系与原发性细胞来源的气液界面培养模型的基因表达和免疫功能差异 样本量较小(各3个独立分化/供体),未完全表征所有基因表达和免疫功能差异 评估BCi-NS1.1细胞系作为气液界面培养模型的适用性 人气道上皮细胞的气液界面培养模型 单细胞生物学 呼吸道感染疾病 单细胞RNA测序,免疫荧光染色 NA 单细胞RNA测序数据,图像数据 BCi-NS1.1来源培养物(3个独立分化),原代细胞来源培养物(3个不同供体) NA 单细胞RNA测序 NA NA
107 2025-10-05
CD34+ cell-derived fibroblast-macrophage cross-talk drives limb ischemia recovery through the OSM-ANGPTL signaling axis
2023-04-14, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究揭示了CD34+细胞通过OSM-ANGPTL信号轴促进肢体缺血恢复的细胞机制 首次结合单细胞RNA测序和遗传谱系追踪技术,提供了正常和缺血肢体组织的精确单细胞图谱,发现CD34+细胞作为成纤维细胞前体促进组织再生 未明确说明样本规模和技术重复次数 探究CD34+细胞在缺血肌肉微环境中的分化潜能和功能作用 人类和小鼠的正常及缺血肢体组织 单细胞生物学 肢体缺血 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
108 2025-10-05
Atypical B cells consist of subsets with distinct functional profiles
2023-Dec-15, iScience IF:4.6Q1
研究论文 通过单细胞测序技术识别了非典型B细胞中三个功能各异的亚群 首次在慢性疟疾暴露人群中鉴定出三个具有不同转录和功能特征的非典型B细胞新亚群 研究聚焦于疟疾慢性感染人群,结果可能不适用于其他免疫激活状态 阐明非典型B细胞在人类适应性免疫应答中的具体作用 慢性疟疾寄生虫暴露个体的非典型B细胞 单细胞生物学 疟疾 单细胞测序 NA 转录组、细胞表面标志物、B细胞受体 慢性疟疾暴露个体(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
109 2025-10-05
Single-cell sequencing of a novel model of neonatal bile duct ligation in mice identifies macrophage heterogeneity in obstructive cholestasis
2023-08-29, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究开发了一种新型新生小鼠胆道梗阻模型,并通过单细胞测序揭示了梗阻性胆汁淤积中巨噬细胞的异质性 创建了死亡率低的新生儿胆道结扎模型,首次通过单细胞RNA测序比较不同病因胆汁淤积中巨噬细胞功能的特异性差异 研究仅限于小鼠模型,需要进一步与人类数据进行比较验证 阐明梗阻性胆汁淤积中巨噬细胞亚群的特异性功能和作用机制 新生BALB/c小鼠胆道结扎模型和轮状病毒诱导的胆道闭锁模型 单细胞生物学 梗阻性胆汁淤积 单细胞RNA测序,流式细胞术,组织学染色 动物模型 单细胞转录组数据,流式细胞数据,组织学图像数据 新生BALB/c小鼠胆道结扎模型和对照组 NA 单细胞RNA测序 NA NA
110 2025-10-05
A high-throughput single-cell RNA expression profiling method identifies human pericyte markers
2023-12, Neuropathology and applied neurobiology IF:4.0Q1
研究论文 通过高通量单细胞RNA测序方法鉴定人脑周细胞特异性标志物 首次使用EasySci单细胞转录组测序技术系统鉴定人脑周细胞特异性基因标志物SLC6A12和SLC19A1 在其他人体器官(肾、肺、肝、肌肉)中未观察到相同的周细胞染色模式,组织特异性较强 鉴定和优化人脑周细胞的通用组织学标志物 人和小鼠不同脑区的周细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序, 免疫组化, 免疫印迹 NA 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 多个人和小鼠脑区样本,以及肾、肺、肝、肌肉等器官探索性样本 NA 单细胞RNA-seq EasySci 高通量低成本单细胞转录组测序方法
111 2025-10-05
Spatial atlas of the mouse central nervous system at molecular resolution
2023-10, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究使用STARmap PLUS原位测序技术构建了小鼠中枢神经系统的分子分辨率空间图谱 开发了STARmap PLUS原位测序方法,首次在三维空间中以单细胞分辨率绘制了全脑分子细胞类型图谱 仅检测了1,022个基因,需要通过整合其他数据来推断全转录组表达谱 构建小鼠中枢神经系统的分子分辨率空间图谱 成年小鼠大脑和脊髓 空间转录组学 NA 原位测序,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,空间位置数据 109万个高质量细胞 NA 原位测序,单细胞RNA测序 STARmap PLUS STARmap PLUS原位测序技术,体素尺寸194×194×345纳米
112 2025-10-05
A spatially resolved atlas of the human lung characterizes a gland-associated immune niche
2023-01, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 本研究通过多组学单细胞技术和空间转录组学构建了人类肺部空间分辨图谱,揭示了气管粘膜下腺中的免疫细胞生存微环境 发现了气管粘膜下腺中IgA浆细胞的生存微环境,并证明腺上皮细胞通过表达CCL28、APRIL和IL-6招募B细胞和IgA浆细胞,促进其局部存活和抗体分泌 NA 重新定义肺和气管的组织结构,解析人类肺部的空间组织结构 健康人类肺部的五个近端到远端位置 空间转录组学 呼吸系统疾病 单细胞转录组学, 空间转录组学, 多组学分析 NA 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 人类肺部五个解剖位置的样本 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 NA NA
113 2025-10-05
Rapid and signal crowdedness-robust in situ sequencing through hybrid block coding
2023-11-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 介绍一种名为SPRINTseq的新型原位测序方法,通过混合块编码和分子稀释策略实现快速、高分辨率的空间转录组分析 结合混合块编码和分子稀释策略,解决了现有方法在分辨率、灵敏度或速度方面的限制 NA 开发改进的空间转录组技术以探索复杂生物过程和疾病机制 小鼠大脑冠状切片中的453,843个细胞 空间转录组学 阿尔茨海默病 原位测序 NA 空间转录组数据 4个小鼠大脑冠状切片中的453,843个细胞,恢复超过1.42亿个转录本 NA 空间转录组学,原位测序 SPRINTseq 使用108个基因panel的混合块编码和分子稀释策略
114 2025-10-05
NMDAR antagonists suppress tumor progression by regulating tumor-associated macrophages
2023-11-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究揭示了NMDAR在肿瘤相关巨噬细胞中的免疫抑制作用及其拮抗剂的抗肿瘤潜力 首次发现NMDAR激活通过钙内流和活性氧生成驱动肿瘤相关巨噬细胞的免疫抑制功能,并证明NMDAR拮抗剂可逆转此过程 研究主要聚焦于肝细胞肉瘤和纤维肉瘤模型,尚未验证其他肿瘤类型 探究NMDAR在肿瘤微环境中对巨噬细胞的调控机制及治疗潜力 肿瘤相关巨噬细胞、T细胞、NK细胞 肿瘤免疫学 肝细胞肉瘤、纤维肉瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
115 2025-10-05
Controlling donor and newborn neuron migration and maturation in the eye through microenvironment engineering
2023-11-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 通过微环境工程控制供体和新生神经元在眼中的迁移与成熟 建立了'计算模拟-体外实验-体内验证'框架,首次利用单细胞转录组数据筛选出SDF1作为引导分子,在视网膜中构建人工梯度显著促进神经元迁移 研究仅聚焦于视网膜神经节细胞,未验证该方法在其他神经元类型或脑区的普适性 开发控制移植后供体细胞行为的精准方法,促进神经元整合 视网膜神经节细胞(RGCs) 神经科学 青光眼 单细胞转录组测序,计算机模拟分析,体外功能实验 NA 基因表达数据,细胞迁移数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
116 2025-10-05
A cellular and molecular spatial atlas of dystrophic muscle
2023-07-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,构建了营养不良肌肉的高分辨率细胞和分子空间图谱 首次将空间转录组学与单细胞RNA测序相结合,揭示了DMD肌肉中细胞群体的非均匀分布和异步再生特征 研究基于D2-mdx小鼠模型,结果向人类DMD的转化需要进一步验证 研究杜氏肌营养不良症中异步肌肉再生对疾病进展的生物学机制 严重营养不良的D2-mdx小鼠模型的肌肉组织 空间生物学 杜氏肌营养不良症 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA 空间基因表达数据, 单细胞基因表达数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
117 2025-10-05
Integrative in situ mapping of single-cell transcriptional states and tissue histopathology in a mouse model of Alzheimer's disease
2023-03, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 开发STARmap PLUS方法,结合空间转录组学和蛋白质检测,绘制阿尔茨海默病小鼠模型的单细胞转录状态与组织病理学图谱 首次实现高分辨率空间转录组学与蛋白质检测在同一组织切片中的整合,揭示淀粉样斑块周围的核心-壳结构细胞分布 仅在阿尔茨海默病小鼠模型中验证,样本量有限 研究阿尔茨海默病发病机制中的时空细胞和分子变化 阿尔茨海默病小鼠模型的脑组织 空间转录组学 阿尔茨海默病 空间转录组学,蛋白质检测 NA 空间转录组数据,蛋白质表达数据,组织图像 8月龄和13月龄阿尔茨海默病小鼠脑组织 NA 空间转录组学 STARmap PLUS 高分辨率空间转录组学与蛋白质检测整合方法
118 2025-10-05
Insights gained from single-cell analysis of chimeric antigen receptor T-cell immunotherapy in cancer
2023-11-08, Military Medical Research IF:16.7Q1
综述 探讨单细胞分析在嵌合抗原受体T细胞免疫疗法中的应用与进展 系统总结单细胞测序技术如何优化CAR-T细胞疗法的受体设计、基因修饰和制造条件 NA 分析CAR-T免疫疗法在临床实践中失败的原因及单细胞测序技术带来的突破 嵌合抗原受体T细胞免疫疗法 单细胞分析 血液系统恶性肿瘤 单细胞测序 NA 单细胞数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
119 2025-10-05
Netrin-1 blockade inhibits tumour growth and EMT features in endometrial cancer
2023-08, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究评估了netrin-1阻断剂NP137在子宫内膜癌中的抗肿瘤效果及其对上皮间质转化的抑制作用 首次报道netrin-1阻断在子宫内膜癌中的临床应用,并发现其能同时诱导肿瘤消退和抑制EMT I期临床试验样本量较小(14例患者),需要更大规模研究验证 评估netrin-1阻断作为子宫内膜癌治疗策略的有效性和作用机制 子宫内膜癌小鼠模型和14例晚期子宫内膜癌患者 癌症研究 子宫内膜癌 RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据, 转录组数据 14例患者(临床试验)加上小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
120 2025-10-05
Analysis of Donor Pancreata Defines the Transcriptomic Signature and Microenvironment of Early Neoplastic Lesions
2023-06-02, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 本研究通过分析脑死亡供体的胰腺组织,首次揭示了成人健康胰腺和早期胰腺肿瘤病变的转录组特征和微环境 首次使用脑死亡供体胰腺避免了组织缺血损伤,结合多重免疫组化、单细胞RNA测序和空间转录组学技术,首次全面表征了成人健康胰腺和散发性PanIN病变的独特微环境 样本量相对有限(30例供体),且仅包含无已知胰腺疾病的个体 研究健康成人胰腺和早期胰腺肿瘤病变的转录组特征和微环境特征 脑死亡供体的胰腺组织,包括健康胰腺组织、胰腺癌组织和癌旁组织 数字病理学 胰腺癌 多重免疫组化,单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 组织图像,单细胞转录组数据,空间转录组数据 30例不同年龄和种族的脑死亡供体胰腺样本 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫组化 NA NA
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