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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-01-09 |
Gleaning Euglenozoa-specific DNA polymerases in public single-cell transcriptome data
2023-12, Protist
IF:1.9Q4
DOI:10.1016/j.protis.2023.125997
PMID:38039844
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研究论文 | 本研究通过分析公共单细胞转录组数据,发现了眼虫门中16个新的家族A DNA聚合酶序列,并探讨了这些酶在眼虫门中的多样性和进化 | 利用单细胞转录组数据填补了眼虫门深支系中家族A DNA聚合酶序列的空白,首次从基础分支物种中获取了相关序列数据 | 研究仅基于转录组数据,可能未覆盖所有DNA聚合酶基因;样本数量有限,可能无法完全代表眼虫门的多样性 | 探究眼虫门中家族A DNA聚合酶的多样性和进化历史 | 眼虫门中的吞噬性眼虫和共生虫类 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 33个吞噬性眼虫和2个共生虫类 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2026-01-09 |
The murine meninges acquire lymphoid tissue properties and harbour autoreactive B cells during chronic Trypanosoma brucei infection
2023-11, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002389
PMID:37983289
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和质谱流式细胞术,揭示了慢性布氏锥虫感染如何诱导小鼠脑膜形成异位淋巴聚集体,并产生自身反应性B细胞和自身抗体 | 首次发现慢性布氏锥虫感染可诱导脑膜获得淋巴组织特性,形成包含成纤维网状细胞、滤泡树突状细胞、滤泡辅助T样细胞和GC样B细胞的异位淋巴聚集体,并产生识别脑抗原的高亲和力自身抗体 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;自身抗体在疾病进展中的具体作用机制尚未完全阐明 | 探究慢性布氏锥虫感染对脑膜免疫景观的影响,特别是异位淋巴聚集体形成和自身免疫反应的机制 | 小鼠脑膜组织、人类脑脊液样本、布氏锥虫寄生虫 | 数字病理学 | 非洲锥虫病(昏睡病) | 单细胞转录组学、质谱流式细胞术(CyTOF)、中通量筛选、体内干预 | NA | 单细胞RNA测序数据、质谱流式细胞数据、蛋白质筛选数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2026-01-09 |
The miR-221/222 cluster regulates hematopoietic stem cell quiescence and multipotency by suppressing both Fos/AP-1/IEG pathway activation and stress-like differentiation to granulocytes
2023-11, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002015
PMID:37983263
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研究论文 | 本研究探讨了miR-221/222簇在调控造血干细胞静息状态和多能性中的作用,通过抑制Fos/AP-1/IEG通路激活和应激样粒细胞分化 | 首次揭示miR-221/222通过抑制Fos/AP-1/IEG通路和应激样粒细胞分化来维持造血干细胞静息与多能性,为改善骨髓移植提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型,人类HSC中miR-221/222的具体调控机制需进一步验证 | 探究miR-221/222在应激条件下对造血干细胞功能调控的分子机制 | 小鼠造血干细胞和多能祖细胞 | 分子生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序,条件性基因敲除 | NA | 转录组数据 | C57BL/6J小鼠的造血干细胞和祖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2026-01-09 |
A Drosophila glial cell atlas reveals a mismatch between transcriptional and morphological diversity
2023-10, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002328
PMID:37862379
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了果蝇中枢神经系统中的胶质细胞,揭示了胶质细胞形态多样性与转录特征之间的不匹配关系 | 发现了果蝇腹神经索中一个新的形态和转录上独特的表面胶质细胞群体,并证明胶质细胞在形态水平上比转录水平上表现出更多样性 | 许多胶质细胞形态类别在转录上无法区分,且转录多样性可能受限于特定神经纤维层位置 | 探索果蝇胶质细胞形态多样性与转录特征之间的关系 | 果蝇中枢神经系统中的胶质细胞,包括胚胎腹神经索和成体视叶组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 果蝇胚胎腹神经索和成体视叶组织中的胶质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 105 | 2026-01-09 |
Virally encoded interleukin-6 facilitates KSHV replication in monocytes and induction of dysfunctional macrophages
2023-10, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011703
PMID:37883374
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)如何利用其编码的病毒白介素-6(vIL-6)促进病毒在单核细胞中的复制,并诱导功能障碍的巨噬细胞分化 | 首次在单细胞水平上阐明KSHV的vIL-6通过激活STAT1/3信号通路,不仅维持病毒裂解复制,还驱动受感染单核细胞增殖并分化为具有免疫抑制功能的巨噬细胞,揭示了病毒逃避免疫监视的新机制 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内模型验证;对vIL-6如何精确调控病毒长链非编码RNA(PAN RNA)表达的分子机制尚未完全阐明 | 探究KSHV病毒编码的vIL-6在病毒感染单核细胞、维持病毒复制及诱导免疫功能障碍巨噬细胞中的作用机制 | 卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)、人CD14+单核细胞、重组KSHV病毒(vIL-6缺失型与回复型) | 病毒学与免疫学 | 卡波西肉瘤、淋巴增生性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、重组病毒构建、转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,使用原代单核细胞进行实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 106 | 2026-01-09 |
CD4 T cell Responses in the CNS during SIV infection
2023-Aug-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.24.554055
PMID:37662237
|
研究论文 | 本研究通过模拟亚优依从性的抗逆转录病毒疗法(ART)方案,在SIVmac251感染的恒河猴中,探究了CD4 T细胞在中枢神经系统(CNS)中的分布、对感染的反应以及ART启动后的潜在恢复情况 | 首次在SIV感染模型中,利用单细胞RNA测序技术揭示了CNS中CD4 T细胞与病毒转录本的共定位,以及T细胞内抗病毒分子和特定效应程序的显著激活,强调了CD4 T细胞在CNS病毒感染中的功能性参与 | 研究样本量较小(仅10只恒河猴),且ART方案模拟的是亚优依从性,可能无法完全反映人类HIV感染的最佳治疗情况 | 探究SIV感染期间CD4 T细胞在中枢神经系统中的反应、分布及ART后的恢复潜力,以增进对Neuro-HIV病理机制的理解 | SIVmac251感染的恒河猴,包括急性期(4只)和慢性期(6只)的动物 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 10只SIVmac251感染的恒河猴 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2026-01-08 |
Single-cell profiling of alveolar rhabdomyosarcoma reveals RAS pathway inhibitors as cell-fate hijackers with therapeutic relevance
2023-02-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ade9238
PMID:36753540
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术解析肺泡型横纹肌肉瘤的肿瘤内异质性,揭示了其细胞层级结构,并发现RAF和MEK抑制剂组合可诱导肿瘤细胞向分化状态转变,从而抑制肿瘤生长 | 首次在肺泡型横纹肌肉瘤中系统解析了包含肌肉干细胞样细胞、循环祖细胞和分化细胞的细胞层级结构,并创新性地通过药物筛选发现RAS通路抑制剂可作为“细胞命运劫持者”诱导肿瘤分化 | 研究主要基于患者来源的原代培养细胞,尚未在体内模型或大规模临床样本中全面验证 | 解析肺泡型横纹肌肉瘤的肿瘤内异质性、细胞发育状态与临床结局的关系,并寻找新的治疗策略 | 肺泡型横纹肌肉瘤患者来源的原代培养细胞 | 数字病理学 | 横纹肌肉瘤 | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 高内涵成像 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 图像数据 | 患者来源的原代培养细胞(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2026-01-07 |
ENPP1 is an innate immune checkpoint of the anticancer cGAMP-STING pathway in breast cancer
2023-12-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2313693120
PMID:38117852
|
研究论文 | 本文揭示了ENPP1作为先天免疫检查点,通过抑制细胞外cGAMP-STING通路促进乳腺癌生长和转移的机制 | 首次在单细胞水平证明ENPP1通过水解细胞外cGAMP抑制STING通路,是乳腺癌免疫逃逸的关键因子 | 研究主要基于乳腺癌模型,其他癌症类型中的机制尚未完全阐明 | 探究ENPP1在乳腺癌进展中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力 | 乳腺癌细胞、正常组织及患者样本 | 癌症免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量,但包括乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 109 | 2026-01-07 |
A distinct human cell type expressing MHCII and RORγt with dual characteristics of dendritic cells and type 3 innate lymphoid cells
2023-12-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2318710120
PMID:38109523
|
研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术,识别并表征了人类中一种罕见的具有树突状细胞特征的RORγt细胞亚群,称为RORγt DC样细胞 | 首次在人类中识别出一种独特的RORγt DC样细胞亚群,该细胞兼具树突状细胞和3型先天淋巴样细胞的特征,并展示了其增殖潜力和向CD1c DC2样细胞分化的可塑性 | 研究主要基于体外实验,其在体内免疫稳态、炎症和自身免疫中的具体功能和影响仍需进一步探究 | 探究人类中表达RORγt的抗原呈递细胞亚群的特性、功能及其在免疫调节中的作用 | 人类RORγt DC样细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 110 | 2026-01-07 |
Genetic and immune determinants of E. coli liver abscess formation
2023-12-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2310053120
PMID:38096412
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术,揭示了小鼠肝脏脓肿形成的遗传和免疫决定因素,特别是TLR4介导的早期炎症反应在脓肿易感性中的作用 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,系统性地表征了E. coli肝脏脓肿的免疫细胞组成和遗传基础,并发现TLR4介导的先天免疫反应过度激活是脓肿易感性的关键驱动因素 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证;脓肿形成的具体分子机制和遗传位点仍需进一步探索 | 探究E. coli感染后肝脏脓肿形成的宿主遗传和免疫决定因素 | 小鼠(特别是C57BL品系)的肝脏组织及E. coli细菌 | 空间转录组学 | 肝脏感染 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个小鼠品系(包括C57BL/6N雌性等) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2026-01-07 |
Interleukin-17-mediated protective cytokine signaling against degeneration of the retinal pigment epithelium
2023-12-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2311647120
PMID:38085785
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脉络膜γδ T细胞通过IL-17信号通路调控视网膜下小胶质细胞代谢重编程,从而保护视网膜色素上皮免受损伤的机制 | 首次在单细胞水平上鉴定脉络膜γδ T细胞为IL-17的主要生产者,并阐明IL-17通过受体介导的级联反应调控小胶质细胞脂质代谢的新保护机制 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类视网膜疾病中验证;单细胞测序数据可能受样本量和技术限制 | 探究视网膜色素上皮损伤后免疫细胞相互作用的分子机制 | 小鼠脉络膜免疫细胞和视网膜色素上皮细胞 | 单细胞组学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量的小鼠脉络膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2026-01-07 |
Lymph node stromal cell responses to perinatal T cell waves, a temporal atlas
2023-12-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2316957120
PMID:38079541
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了小鼠早期淋巴结微环境的时序图谱,揭示了围产期T细胞耐受诱导过程中基质细胞的动态变化及其与T细胞的相互作用 | 首次系统描绘了围产期淋巴结微环境的动态演变图谱,并揭示了α:β T细胞功能障碍对基质细胞的急性影响机制 | 研究局限于小鼠模型,人类围产期淋巴结微环境的可比性尚未验证 | 阐明围产期T细胞耐受诱导过程中淋巴结微环境的动态变化机制 | 小鼠淋巴结基质细胞与围产期T细胞(特别是调节性T细胞) | 单细胞组学 | 免疫耐受相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2026-01-07 |
Single-cell reconstruction and mutation enrichment analysis identifies dysregulated cardiomyocyte and endothelial cells in congenital heart disease
2023-12-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
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研究论文 | 本研究结合基因组学与单细胞转录组学,对先天性心脏病(CHD)进行了综合分析,识别了90个潜在的风险基因,并揭示了心肌细胞和心内膜细胞是主要的CHD相关细胞类型 | 首次将基因组学与CHD单细胞转录组学进行综合分析,识别了6个新的候选CHD基因,并揭示了CHD基因的异质性表达 | NA | 识别先天性心脏病(CHD)的潜在风险基因和相关细胞类型,以理解其表型异质性 | 先天性心脏病(CHD)患者的心脏组织 | 单细胞转录组学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6个CHD组织和4个对照组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-01-07 |
Genetic and immune determinants of E. coli liver abscess formation
2023-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.11.543319
PMID:37398354
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术,揭示了小鼠肝脏脓肿形成的遗传和免疫决定因素,特别是TLR4介导的早期炎症反应在脓肿易感性中的作用 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,系统性地描述了E. coli肝脏脓肿的免疫细胞组成和遗传易感性,并发现TLR4介导的早期炎症反应在脓肿形成与细菌清除之间的权衡机制 | 研究主要基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;脓肿形成的详细分子机制仍需进一步探索 | 探究E. coli肝脏脓肿形成的宿主遗传和免疫决定因素 | 小鼠肝脏组织及E. coli感染模型 | 数字病理学 | 肝脏感染 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多种小鼠品系(如C57BL/6N雌性) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2026-01-07 |
ENPP1 is an innate immune checkpoint of the anticancer cGAMP-STING pathway
2023-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.01.543353
PMID:37333273
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研究论文 | 本文揭示了ENPP1作为抗癌cGAMP-STING通路中的先天免疫检查点,通过抑制细胞外cGAMP水解和激活免疫抑制性腺苷信号,促进乳腺癌生长和转移 | 首次在单细胞水平上证明ENPP1通过协同抑制cGAMP-STING抗肿瘤免疫和激活免疫抑制性腺苷信号驱动乳腺癌进展,并发现选择性抑制其cGAMP水解活性可恢复旁分泌cGAMP-STING信号 | 研究主要聚焦于乳腺癌,未广泛验证其他癌症类型;机制研究依赖于小鼠模型,临床转化需进一步验证 | 探究ENPP1在肿瘤发生中的分子和细胞机制,特别是其在cGAMP-STING通路中的免疫调节作用 | 乳腺癌细胞、肿瘤微环境中的基质细胞和免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 未明确指定样本数量,但涉及乳腺癌患者数据和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-01-07 |
A mannitol-based buffer improves single-cell RNA sequencing of high-salt marine cells
2023-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.26.538465
PMID:37163054
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研究论文 | 本文介绍了一种基于甘露醇的缓冲液(PBS-M),用于改善高盐度海洋生物细胞的单细胞RNA测序质量 | 提出了一种低盐度磷酸盐缓冲液补充D-甘露醇(PBS-M)的方法,能减少细胞死亡和背景mRNA,提高海洋生物单细胞RNA测序的数据质量和细胞状态检测能力 | NA | 改善高盐度海洋生物细胞的单细胞RNA测序兼容性和数据质量 | 海鞘血细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2026-01-06 |
Single-cell insights into epithelial morphogenesis in the neonatal mouse uterus
2023-12-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2316410120
PMID:38019863
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了新生小鼠子宫上皮细胞的形态发生过程 | 首次在新生儿期小鼠子宫中应用单细胞转录组技术,识别了上皮细胞异质性、新腺体上皮基因以及调控网络 | 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类或其他哺乳动物;样本时间点限于出生后1至15天 | 阐明新生儿期子宫上皮细胞的成熟、决定和分化的细胞与分子机制 | 新生小鼠子宫的上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 新生小鼠子宫上皮细胞(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2026-01-03 |
Deciphering the immune landscape of head and neck squamous cell carcinoma: A single-cell transcriptomic analysis of regulatory T cell responses to PD-1 blockade therapy
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0295863
PMID:38096229
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,探讨了PD-1阻断疗法(Nivolumab)对头颈鳞状细胞癌中调节性T细胞(Treg)的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了Nivolumab治疗后HNSCC肿瘤微环境中Treg数量增加、抑制活性增强的机制,并识别了CD44-SSP1轴、NKG2C/D-HLA-E轴及KRAS信号通路等关键变化 | 样本量较小(仅4名供体的8个组织),且为观察性研究,需进一步验证机制 | 研究PD-1阻断疗法如何影响HNSCC肿瘤微环境中的Treg细胞 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4名HNSCC供体的8个组织(治疗前后配对样本) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2026-01-01 |
Longitudinal multi-functional analysis identified responses of T cells, B cells, and monocytes as hallmarks of immunotherapy tolerance in patients with merkel cell carcinoma
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0293922
PMID:37983224
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了默克尔细胞癌患者外周血中免疫细胞的动态变化,揭示了免疫治疗耐受的机制 | 采用纵向多组学方法,结合单细胞RNA测序和批量RNA数据验证,识别了T细胞耗竭、B细胞失调和单细胞亚群变化作为免疫逃逸的关键标志 | 样本量较小(仅基于四名患者的时间点数据),且主要依赖外周血分析,可能未完全反映肿瘤微环境的变化 | 探究默克尔细胞癌患者免疫治疗耐受的细胞机制和免疫逃逸条件 | 默克尔细胞癌患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 皮肤癌(默克尔细胞癌) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 四名患者的外周血样本,采集自四个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2025-12-31 |
Novel Populations of Lung Capillary Endothelial Cells and Their Functional Significance
2023-May-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2887159/v1
PMID:37205391
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术,在肺毛细血管内皮细胞中发现了五个具有不同分子特征和功能的新细胞群 | 首次识别出五个新的肺毛细血管内皮细胞群,包括表达特定离子转运蛋白的细胞群、具有再生功能的“根”细胞群以及具有血管生成调节能力的细胞群 | 研究主要基于单细胞转录组学数据,需要进一步的体内功能验证 | 探究肺毛细血管内皮细胞的异质性及其在生理和病理过程中的功能 | 肺毛细血管内皮细胞 | 单细胞组学 | 肺疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |