单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5351 篇文献，本页显示第 1141 - 1160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1141 | 2024-08-05 |
Cellular barcoding tracks heterogeneous clones through selective pressures and phenotypic transitions
2023-07, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2023.03.008
PMID:37105856
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研究论文 | 本文探讨了细胞条形码如何跟踪癌细胞群体中的异质性克隆 | 结合细胞条形码和单细胞转录组学进行克隆水平的纵向分析 | 未提及具体的研究限制 | 研究癌细胞异质性及其在疾病进展中的作用 | 癌细胞亚群体及其克隆状态 | 数字病理学 | 癌症 | 基因组DNA条形码 | NA | NA | NA |
| 1142 | 2024-08-05 |
Dysregulation of murine long noncoding single-cell transcriptome in nonalcoholic steatohepatitis and liver fibrosis
2023-07, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.079580.123
PMID:37015806
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研究论文 | 这篇文章揭示了高脂饮食诱导的非酒精性脂肪性肝炎和四氯化碳诱导的肝纤维化小鼠模型中lncRNA的失调现象 | 通过汇编>2000个RNA-seq样本，发现了48261种肝脏表达的lncRNA，大部分是新发现的，且揭示了肝脏lncRNA的细胞类型特异性及其空间分布模式 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能对人类适用性有限 | 探讨在非酒精性脂肪性肝炎和肝纤维化中的lncRNA失调及其相关调控网络 | 鼠类（小鼠）模型的肝脏lncRNA及相关细胞类型 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | RNA-seq | NA | RNA数据 | 超过2000个RNA-seq样本 |
| 1143 | 2024-08-05 |
Transcriptome-based measurement of CD8+ T cell age and its applications
2023-07, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2023.05.005
PMID:37248098
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研究论文 | 本文讨论了基于转录组的CD8+ T细胞年龄测量及其应用 | 首次提出了机器学习辅助的转录组量化CD8 T细胞年龄的方法 | 本文未提及具体的样本大小和实验条件 | 提高对T细胞老化相关细胞变化的测量 | CD8+ T细胞的年龄和相关的基因表达变化 | 机器学习 | 老年疾病 | 转录组分析 | 机器学习 | 基因表达数据 | NA |
| 1144 | 2024-08-05 |
Lineage-Specific Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Smooth Muscle Cell Modeling Predicts Integrin Alpha-V Antagonism Reduces Aortic Root Aneurysm Formation in Marfan Syndrome Mice
2023-07, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.122.318448
PMID:37078287
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研究论文 | 本研究探讨了整合素αv在马凡综合症主动脉瘤形成中的作用，并验证了其拮抗剂GLPG0187的治疗效果 | 首次展示了从特定谱系衍生的诱导性多能干细胞光滑肌细胞对整合素αv的过表达及其在马凡综合症相关主动脉瘤中的作用机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，临床适用性尚需进一步验证 | 探讨整合素αv信号通路在马凡综合症主动脉瘤中的机制及其作为治疗策略的有效性 | 研究对象为诱导性多能干细胞生成的主动脉光滑肌细胞以及马凡综合症小鼠模型 | 数字病理学 | 马凡综合症 | 单细胞RNA测序 | Fbn1C1039G/+小鼠模型 | 细胞 | 涉及的样本包括小鼠模型和不同谱系的光滑肌细胞 |
| 1145 | 2024-08-05 |
Proteogenomic and V(D)J Analysis of Human Decidual T Cells Highlights Unique Transcriptional Programming and Clonal Distribution
2023-07-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200061
PMID:37195197
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研究论文 | 本文探讨了人类胎盘T细胞的独特转录编程和克隆分布 | 使用单细胞RNA测序技术同时获得转录、有限蛋白和受体组合，揭示了胎盘T细胞的特殊转录组特征和克隆多样性减少 | 目前对母体与胎儿免疫共存的调控机制仍然认识不足 | 研究胎盘T细胞的转录组特征及其在母胎界面的作用 | 胎盘和匹配的母体外周人类T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 1146 | 2024-08-05 |
Dynamics of human hematopoietic stem and progenitor cell differentiation to the erythroid lineage
2023-07, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2023.05.001
PMID:37172755
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综述 | 该文章深入探讨了红血球生成过程中所有细胞类型的免疫表型特征 | 文章强调了红血球不同阶段的异质性，并描述了与经典红血球生成模型的偏差 | 尽管scRNA-seq提供了新见解，但流式细胞术仍然是验证新免疫表型的主要方法 | 研究红血球生成过程中细胞类型的免疫表型特征及其异质性 | 研究对象包括人类造血干细胞和其转化为红血球的各个阶段 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA | NA |
| 1147 | 2024-08-05 |
Unbiased Human Kidney Tissue Proteomics Identifies Matrix Metalloproteinase 7 as a Kidney Disease Biomarker
2023-07-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000141
PMID:37022120
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研究论文 | 该论文通过无偏的蛋白质组学分析确定基质金属蛋白酶7作为肾病生物标志物。 | 首次利用无偏的组织蛋白质组学信息发现MMP7与肾功能和纤维化的显著相关性，并识别MMP7作为未来肾功能下降的生物标志物。 | 研究主要集中于样本数量较小的个体，并可能受限于特定人群的临床信息。 | 研究人类糖尿病肾病（DKD）的无偏组织蛋白质组学，以确定潜在生物标志物。 | 23名DKD患者和10名健康对照的肾脏样本。 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | SomaScan平台与单细胞RNA测序 | NA | 组织样本与血液样本 | 共收集23名DKD患者和10名健康对照的肾脏样本，和11,030份血液样本 |
| 1148 | 2024-08-05 |
The Long Noncoding RNA Cardiac Mesoderm Enhancer-Associated Noncoding RNA (Carmn) Is a Critical Regulator of Gastrointestinal Smooth Muscle Contractile Function and Motility
2023-07, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.03.229
PMID:37030336
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研究论文 | 本研究揭示了长非编码RNA Carmn在调节胃肠道平滑肌收缩功能和运动性方面的关键作用 | 这是首次研究长非编码RNA在调节内脏平滑肌表型中的重要性 | 仅在小鼠模型中进行研究，人体临床相关性尚需进一步验证 | 研究Carmn在维持胃肠道平滑肌收缩功能中的角色 | 以小鼠为模型，重点研究内脏平滑肌细胞的功能 | 数字病理学 | 肠道疾病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了小鼠及人类的胚胎、成年胃肠道组织样本 |
| 1149 | 2024-08-05 |
Detection of the effect of microvibrational stimulation on human discarded immature oocytes by single-cell transcriptome sequencing technology
2023-Jul, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-023-02837-5
PMID:37273164
|
研究论文 | 本研究探讨了对人类未成熟卵母细胞施加微振动机械刺激后转录组水平的变化。 | 该研究首次使用单细胞转录组测序技术揭示微振动刺激对卵母细胞基因表达的影响。 | 研究仅使用了有限数量的卵母细胞样本，且主要集中在特定的刺激频率上。 | 研究微振动机械刺激对人类卵母细胞转录组的影响。 | 被收集的为辅助生殖周期中未受精的废弃卵母细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 12个（每组6个，分别为微振动组和静态培养组） |
| 1150 | 2024-08-05 |
Stress promotes the infiltration of peripheral immune cells to the brain
2023-07, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2023.05.003
PMID:37169132
|
研究论文 | 本研究报道了应激后海马免疫微环境的变化，揭示了免疫细胞向海马的浸润与其适应或抗压能力之间的关系 | 首次在单细胞水平揭示了应激后海马中免疫细胞浸润的调控机制 | 本研究可能未考虑其他潜在因素对免疫细胞浸润的影响 | 探讨应激对海马中免疫细胞分布和功能的影响 | 研究对象为经历学习无助实验的小鼠，关注其海马区域的免疫细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫荧光 | NA | 生物数据 | 实验中使用了学习无助小鼠的多个样本 |
| 1151 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics unveils xylem cell development and evolution
2023-01-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02845-1
PMID:36624504
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研究论文 | 该研究揭示了木质部细胞在不同植物物种中的发育谱系和进化关系 | 通过单细胞转录组学和激光捕获微切割技术，首次解析了多个木本被子植物的木质部细胞发育谱系 | 研究主要集中在有限数量的木本被子植物上，可能无法全面代表所有植物的木质部细胞发展 | 探索不同植物的木质部细胞类型的发育和进化过程 | 四种不同的木本被子植物的木质部细胞类型 | 数字植物学 | NA | 单细胞转录组分析，激光捕获微切割 | NA | 转录组数据 | 四种木本被子植物的多个样本 |
| 1152 | 2024-08-05 |
H2-O deficiency promotes regulatory T cell differentiation and CD4 T cell hyperactivity
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1304798
PMID:38250071
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研究论文 | 本研究揭示了H2-O缺乏如何增强胸腺调节性T细胞的分化及CD4 T细胞的活性 | 首次提供了H2-O在胸腺调节性T细胞发育中的直接证据 | 缺乏对其他潜在机制的综合考虑 | 深入理解H2-O缺乏对自体免疫性疾病的影响 | 主要研究胸腺调节性T细胞及外周CD4 T细胞 | 免疫学 | 自体免疫疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | NA |
| 1153 | 2024-08-04 |
Hofbauer cells and fetal brain microglia share transcriptional profiles and responses to maternal diet-induced obesity
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.16.571680
PMID:38187648
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研究论文 | 本研究探讨了母体饮食诱导肥胖对胎儿大脑小胶质细胞和霍夫鲍尔细胞的转录组影响 | 首次证明霍夫鲍尔细胞可以作为胎儿大脑小胶质细胞发育的非侵入性生物标志物 | 研究主要基于小鼠模型，尚需在其他动物模型或人类中验证 | 识别反映胎儿大脑小胶质细胞程序的非侵入性生物标志物以支持干预 | 小鼠模型中的胎儿大脑小胶质细胞和胎盘霍夫鲍尔细胞 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用小鼠模型进行的实验，样本数量未详细说明 |
| 1154 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling reveals the impact of genetic alterations on the differentiation of inflammation-induced colon tumors
2023-Dec-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.30.569463
PMID:38077052
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研究论文 | 这篇文章揭示了遗传改变对炎症诱导的结肠肿瘤分化的影响 | 首次使用单细胞RNA测序分析了不同遗传突变在结肠肿瘤细胞分化中的作用 | 研究仅基于小鼠模型，可能无法完全反映人类结肠癌的形成机制 | 探索炎症诱导的结肠肿瘤中遗传突变与细胞分化之间的关系 | 使用小鼠模型研究具有不同遗传突变的结肠肿瘤 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同突变类型的结肠肿瘤样本 |
| 1155 | 2024-08-05 |
Genomic and transcriptomic advances in amyotrophic lateral sclerosis
2023-12, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2023.102126
PMID:37972860
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研究论文 | 本文综述了基因组学、表观基因组学、转录组学和微RNA在肌萎缩侧索硬化症(ALS)研究中的应用 | 提出了微RNA作为潜在生物标志物和分子干预的有前景工具 | 至今尚缺乏有效的ALS治疗方法 | 深入探讨ALS的发展和维持的分子机制 | 与ALS发病机制相关的主要基因及其表观修饰 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 高通量测序技术 | 体外及体内模型 | 基因组数据，转录组数据 | NA |
| 1156 | 2024-08-05 |
Development of a Nanoparticle-Based Tendon-Targeting Drug Delivery System to Pharmacologically Modulate Tendon Healing
2023-Nov-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.29.569204
PMID:38076889
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研究论文 | 该文章讨论了一种基于纳米颗粒的药物递送系统，旨在靶向促进腱的愈合 | 创新地利用TRAP结合肽功能化纳米颗粒，实现了对腱的靶向药物递送 | 目前仅在小鼠模型中测试，临床应用的可行性尚未确定 | 研究旨在提高腱愈合过程中的药物递送效率 | 研究对象为腱损伤后的愈合过程 | 数字病理学 | NA | 纳米颗粒药物递送系统 | NA | 实验数据 | 小鼠模型 |
| 1157 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis characterizes PLK1 as a catalyst of an immunosuppressive tumor microenvironment in LUAD
2023-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.02.551692
PMID:37577553
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研究论文 | 这篇文章揭示了PLK1在肺腺癌中作为免疫抑制肿瘤微环境的催化剂的作用 | 本文首次阐明了PLK1在调控肿瘤免疫和肿瘤微环境中的新作用 | 对PLK1与肿瘤微环境之间复杂相互作用的理解仍不完整 | 研究PLK1在肺腺癌中的作用及其对免疫微环境的影响 | 使用基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序分析探索PLK1的功能 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 1158 | 2024-08-05 |
Tumor gene signatures that correlate with release of extracellular vesicles shape the immune landscape in head and neck squamous cell carcinoma
2023-07-05, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxad019
PMID:36752300
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研究论文 | 这项研究评估了与肿瘤释放的细胞外小泡相关的基因特征对抗肿瘤免疫反应的临床相关性和影响 | 研究揭示了肿瘤基因特征与细胞外小泡产生之间的关系，及其如何影响免疫细胞浸润和抗肿瘤免疫 | 样本来源限制于单一的癌症基因组图谱和几个小型数据集，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨头颈鳞状细胞癌中基因特征与细胞外小泡释放的相关性及其对免疫反应的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者的基因表达和免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 头颈癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 522名患者（癌症基因组图谱），250名患者（GSE65858数据集），18名患者（单细胞RNA测序数据集） |
| 1159 | 2024-08-04 |
Polymorphic KIR3DL3 expression modulates tissue-resident and innate-like T cells
2023-06-30, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.ade5343
PMID:37390222
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研究论文 | 本研究探讨了多态性KIR3DL3的表达对组织驻留和类固有T细胞的调节作用 | 首次揭示了KIR3DL3在γδ和CD8 T细胞中的高表达及其抑制T细胞受体刺激的功能 | 未能检测到KIR3DL3多态性对配体结合的影响 | 研究KIR3DL3的表达特征及其生物学功能 | 主要对象是KIR3DL3表达的γδ和CD8 T细胞 | 免疫学 | NA | 高分辨率流式细胞术和单细胞转录组测序 | NA | 细胞 | 涉及少量的KIR3DL3表达细胞 |
| 1160 | 2024-08-05 |
Basement membrane proteins in extracellular matrix characterize NF1 neurofibroma development and response to MEK inhibitor
2023-06-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI168227
PMID:37140985
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研究论文 | 本研究系统调查了在神经纤维瘤发展过程中的细胞外基质(ECM)的富集情况 | 发现基底膜(BM)蛋白是上调的ECM成分，而非主要胶原亚型，并且确定了TGF-β1信号在ECM动态中的作用 | 关于神经纤维瘤发展和治疗反应过程中ECM沉积机制的了解仍然有限 | 研究NF1神经纤维瘤中ECM的变化及其对MEK抑制剂治疗的反应 | 以神经纤维瘤的发育和MEK抑制剂的响应为研究对象 | 数字病理学 | 神经纤维瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据 | NA |