单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 1101 - 1120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1101 | 2024-08-05 |
ALOX5 acts as a key role in regulating the immune microenvironment in intrahepatic cholangiocarcinoma, recruiting tumor-associated macrophages through PI3K pathway
2023-12-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04804-1
PMID:38124204
|
研究论文 | 研究ALOX5在调控肝内胆管癌免疫微环境中的关键作用 | 揭示了ALOX5通过其代谢产物LTB4招募M2型巨噬细胞的机制 | 未明确提出在临床应用中的具体限制 | 探讨ALOX5调控肿瘤相关巨噬细胞的潜在机制及其靶向治疗的转化效果 | ALOX5及其代谢产物与肝内胆管癌中肿瘤相关巨噬细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，多重免疫荧光分析 | NA | 组织样本，细胞培养模型 | 在小鼠异种移植肿瘤实验中使用的样本数量未详细说明 |
| 1102 | 2024-08-04 |
Research progress on the application of single-cell sequencing in autoimmune diseases
2023-10, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-023-00216-9
PMID:37550409
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综述 | 该文章总结了单细胞RNA测序技术在自身免疫疾病领域的应用进展 | 提供了对单细胞RNA测序技术的发展和在自身免疫疾病研究中的应用的系统性回顾 | 尚未完全理解自身免疫疾病的病因和发病机制 | 提供对自身免疫疾病发病机制、诊断和治疗的理解参考 | 自身免疫疾病 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1103 | 2024-08-04 |
PFKFB3-Mediated Glycolysis Boosts Fibroblast Activation and Subsequent Kidney Fibrosis
2023-08-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12162081
PMID:37626891
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研究论文 | 该研究探讨了PFKFB3在肾纤维化中的作用，揭示其对成纤维细胞激活的影响 | 首次探索了PFKFB3在肾纤维化中的角色，强调其在成纤维细胞激活和肾纤维化进程中的重要性 | 本研究主要基于小鼠模型，尚需在人类样本中验证 | 研究PFKFB3在肾纤维化中的作用及其机制 | 主要研究对象为肾成纤维细胞和小鼠模型 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 生物样本数据 | 小鼠模型研究中采取了多个样本，包括野生型和缺失PFKFB3的小鼠 |
| 1104 | 2024-08-05 |
A stem cell epigenome is associated with primary nonresponse to CD19 CAR T cells in pediatric acute lymphoblastic leukemia
2023-08-08, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022008977
PMID:36607839
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研究论文 | 这篇文章探讨了干细胞表观基因组与儿童急性淋巴细胞白血病中CD19 CAR T细胞治疗的初级非应答之间的关联 | 本研究首次揭示了干细胞表观基因组与CD19-CAR治疗初级非应答的关联，为理解白血病抵抗机制提供了新见解 | 研究样本规模有限，仅为14名患者，可能影响结果的广泛适用性 | 旨在探讨儿童急性淋巴细胞白血病中，与CD19-CAR疗法相关的初级非应答的机制 | 研究对象为14名参与PLAT-02试验的儿童急性淋巴细胞白血病患者，包括7例初级非应答和7例初级敏感 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 长读长PacBio测序和单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 14名患者（7名初级非应答和7名初级敏感） |
| 1105 | 2024-08-05 |
Systematic characterization of therapeutic vulnerabilities in Multiple Myeloma with Amp1q reveals increased sensitivity to the combination of MCL1 and PI3K inhibitors
2023-Aug-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.01.551480
PMID:37577538
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研究论文 | 本研究系统性地表征了具有Amp1q的多发性骨髓瘤的治疗脆弱性 | 揭示了MCL1和PI3K抑制剂组合对具有Amp1q的多发性骨髓瘤的增加敏感性 | 未提及具体限制 | 开发针对具有Amp1q的多发性骨髓瘤患者的靶向治疗 | 带有和不带有Amp1q的多发性骨髓瘤亚克隆 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用相同患者肿瘤中的不同亚克隆进行比较，具体样本数量未提及 |
| 1106 | 2024-08-04 |
scKINETICS: inference of regulatory velocity with single-cell transcriptomics data
2023-06-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad267
PMID:37387147
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研究论文 | 本研究提出了scKINETICS，一个用于推断细胞速度的基因表达动态模型 | 引入了同时学习每个细胞转录速度和基因调控网络的期望最大化方法，揭示了新的调控因子 | 没有提及具体的限制因素 | 研究转录动态与基因表达变异之间的关系 | 急性胰腺炎数据集中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | 动态模型 | 基因表达数据 | NA |
| 1107 | 2024-08-04 |
Late-Stage Metastatic Melanoma Emerges through a Diversity of Evolutionary Pathways
2023-06-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-22-1427
PMID:36977461
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研究论文 | 本研究揭示了晚期转移性黑色素瘤的多样性进化路径 | 提供了迄今为止最全面的黑色素瘤转移数据集，并揭示了不同克隆来源和基因组变化在转移中的作用 | 样本来源仅限于14名接受免疫检查点抑制剂治疗的患者，可能影响结果的普遍适用性 | 研究转移路径及免疫检查点抑制剂的抵抗机制，以改善黑色素瘤的预后 | 来自14名接受ICI治疗患者的222个外显子组测序，493个面板测序，161个RNA测序，以及22个单细胞全基因组测序样本 | 数字病理 | 黑色素瘤 | 外显子组测序、面板测序、RNA测序、单细胞全基因组测序 | NA | 基因组数据 | 共涉及14名患者的数据，包括222个外显子组样本，493个面板样本，161个RNA样本，和22个单细胞样本 |
| 1108 | 2024-08-04 |
Transcriptomic landscapes of effective and failed liver regeneration in humans
2023-Apr, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100683
PMID:36950091
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研究论文 | 本文系统评估了人类肝脏再生过程中的早期转录变化及其与功能障碍肝脏再生的差异 | 首次在人类中探索功能性与功能障碍性肝脏再生相关的转录组变化，揭示了DUSP4减少与肝内炎症反应之间的关系 | 研究主要集中于术后肝脏再生的早期阶段，未能覆盖全面的康复过程 | 旨在探讨人类肝脏再生过程中的转录组变化及相关机制 | 154名患者的血样和46名进行肝切除手术患者的组织样本 | 数字病理学 | 肝病 | RNA测序 | NA | 血液样本和组织样本 | 154名患者的血样和46名患者的组织样本 |
| 1109 | 2024-08-05 |
Mimicking Tumor Cell Heterogeneity of Colorectal Cancer in a Patient-derived Organoid-Fibroblast Model
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2023.02.014
PMID:36868311
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研究论文 | 本文开发了一种结合匹配的上皮细胞和间质成纤维细胞的结直肠癌类器官模型 | 创新点在于该模型反映了肿瘤微环境的复杂性，并提供了更贴近体内肿瘤形态的细胞异质性 | 此模型可能未能完全再现所有肿瘤微环境的复杂因素 | 研究结直肠癌中肿瘤细胞与间质成纤维细胞的相互作用 | 本研究对象为结直肠癌样本中分离的肿瘤细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 3D类器官模型 | 细胞 | 来自结直肠癌样本的主要成纤维细胞和肿瘤细胞 |
| 1110 | 2024-08-05 |
Ligament injury in adult zebrafish triggers ECM remodeling and cell dedifferentiation for scar-free regeneration
2023-Sep-19, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-023-00329-9
PMID:37726321
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研究论文 | 这项研究揭示了成年斑马鱼韧带在损伤后的无疤痕再生能力 | 建立了一个新的成年无疤痕韧带再生模型，强调了免疫和间充质细胞相互作用在细胞外基质重塑中的作用 | 尚未明确不同免疫细胞在再生过程中的具体功能 | 研究成年斑马鱼韧带受伤后的再生机制 | 成年斑马鱼的韧带组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | NA | 斑马鱼数目未具体提及 |
| 1111 | 2024-08-04 |
Identification of ulcerative colitis-specific immune cell signatures from public single-cell RNA-seq data
2023-07, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-023-01390-w
PMID:37133723
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研究论文 | 本研究利用公共单细胞RNA-seq数据研究溃疡性结肠炎的组织微环境 | 研究揭示了溃疡性结肠炎特异性的免疫细胞标志，并探讨了不同免疫细胞间的相互作用 | 未提及所有数据集的细胞类型注释，可能影响细胞群体的选择 | 研究溃疡性结肠炎的组织微环境及其免疫细胞机制 | 溃疡性结肠炎患者的免疫细胞亚群 | 数字病理 | 肠道炎症 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及的样本量未具体说明 |
| 1112 | 2024-08-05 |
Peripheral Ischemia Imprints Epigenetic Changes in Hematopoietic Stem Cells to Propagate Inflammation and Atherosclerosis
2023-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.318956
PMID:36891902
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研究论文 | 本研究探讨了外周缺血对造血干细胞的表观遗传变化及其在炎症和动脉粥样硬化中的作用 | 揭示了外周缺血后HSPC的迁移和增殖增加，并确认了IL-3Rb和IL-1R1在炎症和动脉粥样硬化加剧中的关键作用 | 未详细阐明外周动脉疾病患者炎症加剧的具体机制 | 研究外周缺血如何影响造血干细胞及其在慢性炎症和动脉粥样硬化中的潜在作用 | 使用外周动脉疾病患者的外周血和不同饮食条件下的啮齿类动物 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | RNA测序，流式细胞术 | Apoe-/-小鼠，C57BL/6J小鼠 | 血液样本，骨髓样本 | 外周动脉疾病患者的样本和数个小鼠模型 |
| 1113 | 2024-08-04 |
Investigating the Role of Ferroptosis-Related Genes in Ovarian Aging and the Potential for Nutritional Intervention
2023-05-25, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu15112461
PMID:37299424
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研究论文 | 本研究探讨了铁死亡相关基因对卵巢衰老的影响及营养干预的潜力 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序研究铁死亡与卵巢衰老的关系 | 缺乏广泛的样本数据支持和长期效果评估 | 探讨铁死亡相关基因在卵巢衰老中的作用及营养补充的效果 | 75名卵巢衰老不足患者 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 75名患者 |
| 1114 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics analysis identifies a unique tumor-promoting function of the meningeal stroma in melanoma leptomeningeal disease
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572266
PMID:38187574
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研究论文 | 本研究描述了在黑色素瘤脑膜下疾病中脑膜间质的肿瘤促进功能 | 首次揭示了脑膜间质在黑色素瘤LMD中的肿瘤促进作用及其机制 | 仅针对特定肿瘤微环境进行研究，结果可能不适用于其它类型的转移性肿瘤 | 研究黑色素瘤脑膜下疾病的肿瘤微环境与肿瘤细胞之间的相互作用 | 侧重于黑色素瘤LMD的脑膜组织及对应的外脑转移位点 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组分析 | NA | 组织样本 | NA |
| 1115 | 2024-08-04 |
Coordinated immune dysregulation in Juvenile Dermatomyositis revealed by single-cell genomics
2023-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.07.566033
PMID:37986917
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研究论文 | 该文章探讨了青少年皮肌炎的免疫失调特征 | 首次通过单细胞基因组学揭示了青少年皮肌炎中免疫系统的协调失调 | 对疾病机制的理解仍然不完全，治疗选择有限 | 旨在理解青少年皮肌炎的免疫失调及其与疾病活动的关系 | 研究对象为不同疾病活动阶段的青少年皮肌炎患者的外周血 | 数字病理学 | 青少年皮肌炎 | 单细胞转录组学 | NA | 外周血单核细胞的转录组数据 | NA |
| 1116 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals dysregulated fibroblast subclusters in prurigo nodularis
2023-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.29.526050
PMID:36778229
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研究论文 | 单细胞RNA测序揭示了瘙痒结节病中失调的成纤维细胞亚群。 | 本研究首次识别了瘙痒结节病中的七个独特的成纤维细胞亚群，并揭示了成纤维细胞与神经元之间的相互作用。 | 研究仍未完全理解瘙痒结节病的发病机制，且样本主要集中在黑人患者。 | 本研究旨在揭示瘙痒结节病的致病机制及相关细胞组分。 | 研究对象为28,695个瘙痒结节病损及非病损皮肤细胞。 | 数字病理学 | 瘙痒结节病 | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 28695个瘙痒结节病细胞 |
| 1117 | 2024-08-04 |
Mapping visual functions onto molecular cell types in the mouse superior colliculus
2023-06-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.03.036
PMID:37086721
|
研究论文 | 本研究揭示了小鼠上丘的不同神经元亚型及其在视觉功能中的角色 | 研究首次通过单细胞转录组学识别了28种神经元亚型，并提出小鼠上丘内抑制性神经元分子亚型的功能组织逻辑 | 研究主要集中在小鼠模型上，结果可能不适用于其他物种 | 探讨小鼠上丘神经元在视觉处理中的分子功能 | 成年小鼠的上丘神经元亚型及其对应的标记基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因转录数据 | 数万个成年小鼠上丘神经元 |
| 1118 | 2024-08-04 |
Identification of Niche-Specific Gene Signatures between Malignant Tumor Microenvironments by Integrating Single Cell and Spatial Transcriptomics Data
2023-10-31, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14112033
PMID:38002976
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研究论文 | 该文章提出了一种整合单细胞RNA测序和空间转录组数据的方法，以识别恶性肿瘤微环境中的特定基因特征 | 通过整合scRNA-seq和空间转录组数据，识别特定于细胞生态位的基因特征，展示了这一整合方法的潜力 | 未提及具体的局限性 | 旨在综合评估组织样本中的基因活性并识别细胞生态位特异性基因特征 | 研究对象包括五种癌症类型的配对或匹配的scRNA-seq和Visium平台数据 | 数字病理学 | 乳腺癌、胃肠道间质肿瘤、肝细胞癌、子宫内膜癌、卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及五种癌症类型的配对或匹配样本数据 |
| 1119 | 2024-08-04 |
Targeting intratumor heterogeneity suppresses colorectal cancer chemoresistance and metastasis
2023-08-03, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256416
PMID:37338390
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研究论文 | 本文研究了肠道肿瘤异质性的建立及其对结直肠癌化疗抗性和转移的影响 | 创新点在于揭示了结直肠癌干细胞样细胞的不对称分裂在早期肿瘤异质性建立中的关键作用 | 本研究仅集中于结直肠癌，可能无法广泛适用于其他类型癌症 | 研究肠内肿瘤异质性的建立及其对结直肠癌治疗的影响 | 研究对象为结直肠癌干细胞样细胞及其衍生的细胞亚型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 七个细胞亚型的异种移植模型 |
| 1120 | 2024-08-04 |
Immune mechanisms shape the clonal landscape during early progression of prostate cancer
2023-06-19, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.04.010
PMID:37148881
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研究论文 | 本文探讨了免疫微环境在前列腺癌早期进展中调节肿瘤克隆景观的作用 | 研究展示了肿瘤中的多克隆景观与微环境的关系，并揭示了免疫编辑在克隆生存中的重要性 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类前列腺癌的复杂性 | 探讨免疫微环境如何影响肿瘤内异质性和克隆景观 | 主要研究了前列腺癌小鼠模型中的肿瘤微环境和克隆动态 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学，基因工程小鼠模型 | NA | NA | 使用了基因工程小鼠模型进行研究 |