单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 1081 - 1100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1081 | 2024-08-05 |
Development of a Nanoparticle-Based Tendon-Targeting Drug Delivery System to Pharmacologically Modulate Tendon Healing
2023-Nov-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.29.569204
PMID:38076889
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研究论文 | 该文章讨论了一种基于纳米颗粒的药物递送系统，旨在靶向促进腱的愈合 | 创新地利用TRAP结合肽功能化纳米颗粒，实现了对腱的靶向药物递送 | 目前仅在小鼠模型中测试，临床应用的可行性尚未确定 | 研究旨在提高腱愈合过程中的药物递送效率 | 研究对象为腱损伤后的愈合过程 | 数字病理学 | NA | 纳米颗粒药物递送系统 | NA | 实验数据 | 小鼠模型 |
| 1082 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis characterizes PLK1 as a catalyst of an immunosuppressive tumor microenvironment in LUAD
2023-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.02.551692
PMID:37577553
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研究论文 | 这篇文章揭示了PLK1在肺腺癌中作为免疫抑制肿瘤微环境的催化剂的作用 | 本文首次阐明了PLK1在调控肿瘤免疫和肿瘤微环境中的新作用 | 对PLK1与肿瘤微环境之间复杂相互作用的理解仍不完整 | 研究PLK1在肺腺癌中的作用及其对免疫微环境的影响 | 使用基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序分析探索PLK1的功能 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 1083 | 2024-08-05 |
Tumor gene signatures that correlate with release of extracellular vesicles shape the immune landscape in head and neck squamous cell carcinoma
2023-07-05, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxad019
PMID:36752300
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研究论文 | 这项研究评估了与肿瘤释放的细胞外小泡相关的基因特征对抗肿瘤免疫反应的临床相关性和影响 | 研究揭示了肿瘤基因特征与细胞外小泡产生之间的关系，及其如何影响免疫细胞浸润和抗肿瘤免疫 | 样本来源限制于单一的癌症基因组图谱和几个小型数据集，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨头颈鳞状细胞癌中基因特征与细胞外小泡释放的相关性及其对免疫反应的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者的基因表达和免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 头颈癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 522名患者（癌症基因组图谱），250名患者（GSE65858数据集），18名患者（单细胞RNA测序数据集） |
| 1084 | 2024-08-04 |
Polymorphic KIR3DL3 expression modulates tissue-resident and innate-like T cells
2023-06-30, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.ade5343
PMID:37390222
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研究论文 | 本研究探讨了多态性KIR3DL3的表达对组织驻留和类固有T细胞的调节作用 | 首次揭示了KIR3DL3在γδ和CD8 T细胞中的高表达及其抑制T细胞受体刺激的功能 | 未能检测到KIR3DL3多态性对配体结合的影响 | 研究KIR3DL3的表达特征及其生物学功能 | 主要对象是KIR3DL3表达的γδ和CD8 T细胞 | 免疫学 | NA | 高分辨率流式细胞术和单细胞转录组测序 | NA | 细胞 | 涉及少量的KIR3DL3表达细胞 |
| 1085 | 2024-08-05 |
Basement membrane proteins in extracellular matrix characterize NF1 neurofibroma development and response to MEK inhibitor
2023-06-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI168227
PMID:37140985
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研究论文 | 本研究系统调查了在神经纤维瘤发展过程中的细胞外基质(ECM)的富集情况 | 发现基底膜(BM)蛋白是上调的ECM成分，而非主要胶原亚型，并且确定了TGF-β1信号在ECM动态中的作用 | 关于神经纤维瘤发展和治疗反应过程中ECM沉积机制的了解仍然有限 | 研究NF1神经纤维瘤中ECM的变化及其对MEK抑制剂治疗的反应 | 以神经纤维瘤的发育和MEK抑制剂的响应为研究对象 | 数字病理学 | 神经纤维瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据 | NA |
| 1086 | 2024-08-05 |
Regionally distinct progenitor cells in the lower airway give rise to neuroendocrine and multiciliated cells in the developing human lung
2023-06-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2210113120
PMID:37279279
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研究论文 | 本文描述了在发育中的人类肺部下气道中富集的一种细胞 | 通过单细胞条形码谱系追踪方法，揭示了该细胞与基底细胞的不同分化潜能 | 研究未明确指出具体的局限性 | 研究下气道中细胞的分化潜力及其在上皮多样性中的作用 | 发育中的人类肺部下气道细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和显微镜 | NA | 细胞 | NA |
| 1087 | 2024-08-05 |
Improving head and neck cancer therapies by immunomodulation of the tumour microenvironment
2023-03, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-022-00531-9
PMID:36456755
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研究论文 | 本文探讨了通过免疫调节肿瘤微环境改善头颈部癌症治疗的策略 | 文章创新性在于全面分析了头颈部鳞状细胞癌的肿瘤微环境，包括免疫与非免疫细胞的相互作用 | 研究中可能存在样本选择的影响，以及对于小规模的不同TME特征的个体化分析不足 | 研究目的是提高头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤特异性T细胞反应 | 研究对象为头颈部鳞状细胞癌患者及其TME | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序，高维流式细胞术，空间多光谱成像 | NA | 数据集 | 利用了癌症基因组图谱等丰富的数据资源进行分析 |
| 1088 | 2024-08-05 |
A robust model for cell type-specific interindividual variation in single-cell RNA sequencing data
2023-Feb-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.24.529987
PMID:36909553
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研究论文 | 本研究开发了一个新的模型CTMM，以检测和量化个体间的细胞类型特异性变异 | 创新点在于提出了CTMM模型，可以在单细胞RNA测序数据中识别个体之间的细胞类型特异性变异 | 样本规模较小可能会对结果的普适性产生影响 | 研究的目的是提高统计能力，以识别细胞类型特异性的生物学特征 | 研究对象为人类诱导多能干细胞中的转录组变异 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | CTMM | 转录组数据 | NA |
| 1089 | 2024-08-04 |
Cell-type specific defects in PTEN-mutant cortical organoids converge on abnormal circuit activity
2023-09-05, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddad107
PMID:37384417
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研究论文 | 这篇文章探讨了PTEN基因杂合突变对不同细胞类型在人脑发育中的影响。 | 本研究通过不同供体的人类皮质类器官揭示了PTEN杂合突变对细胞类型特异性发育事件的影响。 | 研究的样本量和供体背景的多样性可能限制了结论的普适性。 | 探讨PTEN基因的杂合突变如何影响人类大脑发育中的不同细胞类型。 | 使用不同供体的人类皮质类器官作为研究对象。 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序，蛋白质组学，空间转录组学 | NA | 基因组数据，蛋白质组数据 | 不同供体的人类皮质类器官 |
| 1090 | 2024-08-05 |
Identification of CD133+ intercellsomes in intercellular communication to offset intracellular signal deficit
2023-10-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86824
PMID:37846866
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研究论文 | 本文报道了CD133在细胞间通信中的作用，以补偿细胞内信号不足 | 提出了名为'intercellsome'的细胞间结构，并发现其与CD133表达相关 | 尚未探讨CD133 intercellsomes在其他组织或不同生理环境下的行为 | 研究CD133在细胞间通信和应对细胞内信号不足中的作用 | 主要研究CD133阳性肝细胞及其在肝再生中的表现 | 数字病理 | 肿瘤相关疾病 | 单细胞RNA测序，超分辨率显微镜，电子显微镜 | NA | mRNA | 多个动物物种中的癌细胞类型和肝脏、肠脏的原器官 |
| 1091 | 2024-08-05 |
Key Genetic Determinants Driving Esophageal Squamous Cell Carcinoma Initiation and Immune Evasion
2023-09, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.05.030
PMID:37257519
|
研究论文 | 本研究揭示了TP53、CDKN2A和NOTCH1的缺失如何诱导食道肿瘤和免疫逃逸，促进食道鳞状细胞癌的发生 | 建立了32种基因工程食道类器官，并识别出驱动食道鳞状细胞癌启动的关键基因决定因素 | 本研究的局限性在于只涉及小鼠模型，是否适用于人类尚需进一步验证 | 探索食道鳞状细胞癌的启动机制和免疫逃逸的遗传决定因素 | 使用CRISPR/Cas9基因敲除技术靶向9个基因进行的食道类器官研究 | 数字病理学 | 食道癌 | CRISPR/Cas9 | 小鼠食道类器官 | 单细胞RNA测序 | 32个基因工程食道类器官 |
| 1092 | 2024-08-04 |
Smooth muscle α-actin missense variant promotes atherosclerosis through modulation of intracellular cholesterol in smooth muscle cells
2023-08-01, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehad373
PMID:37377039
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研究论文 | 该研究探讨了平滑肌α-肌动蛋白突变如何通过调节平滑肌细胞内胆固醇促进动脉粥样硬化 | 建立了一种新的机制，表明平滑肌特异性收缩蛋白中的致病性突变与动脉粥样硬化的易感性有关 | 研究未考虑其他可能影响动脉粥样硬化的环境因素 | 研究平滑肌α-肌动蛋白变异如何导致动脉粥样硬化 | 使用携带ACTA2变异的小鼠模型和体外提取的平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 基因组学，单细胞转录组分析 | NA | 生物样本 | Apoe-/-小鼠及其携带和不携带变异的平滑肌细胞 |
| 1093 | 2024-08-04 |
Integrated multi-omics analyses reveal homology-directed repair pathway as a unique dependency in near-haploid leukemia
2023-06-08, Blood cancer journal
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41408-023-00863-1
PMID:37286545
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研究论文 | 本文揭示了近单倍体白血病依赖同源重组修复通路的独特性 | 首次系统性地揭示了近单倍体白血病中RAD51B作为关键基因的重要性 | 研究主要集中在细胞周期特定的基因表达，而对其他潜在机制的探讨有限 | 揭示近单倍体急性淋巴细胞白血病的独特生理特征及潜在易感性 | 近单倍体急性淋巴细胞白血病细胞及相关基因 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大量近单倍体急性淋巴细胞白血病患者样本 |
| 1094 | 2024-08-05 |
Upregulation of acid ceramidase contributes to tumor progression in tuberous sclerosis complex
2023-05-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.166850
PMID:36927688
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研究论文 | 本研究探讨了酸性神经酰胺酶在结节性硬化症中对肿瘤进展的贡献 | 研究首次揭示了TSC2缺失细胞中ASAH1上调与肿瘤形成相关的机制 | 仅在小鼠模型中进行实验，未在人类样本中验证结果 | 探讨ASAH1在结节性硬化症（TSC）和淋巴管平滑肌肉瘤（LAM）中的作用 | 研究对象为结节性硬化症相关突变细胞及其小鼠异种移植模型 | 数字病理学 | 结节性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了TSC2缺失的小鼠模型和人类细胞样本 |
| 1095 | 2024-08-04 |
Hyperactive mTORC1 in lung mesenchyme induces endothelial cell dysfunction and pulmonary vascular remodeling
2023-Dec-20, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172116
PMID:38127441
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research paper | 该研究探讨了肺间质中mTORC1的过度活跃如何导致内皮细胞功能障碍和肺血管重塑 | 本研究提出了肺间质细胞与内皮细胞之间的配体-受体间相互作用，强调了在LAM及其他mTORC1驱动疾病中改变的间质细胞与内皮细胞轴的重要性 | 当前研究的限制是未能探讨TSC2突变对内皮细胞的直接影响 | 研究LAM细胞如何与内皮细胞相互作用，以引发血管重塑 | 使用含有Tsc2基因缺失的mTORC1功能获得小鼠模型来研究肺间质细胞与内皮细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | Tbx4LME-Cre Tsc2fl/fl小鼠模型 | 基因组数据 | 涉及1年的Tbx4LME-Cre Tsc2fl/fl小鼠 |
| 1096 | 2024-08-04 |
Construction and Validation of a Prognostic Model Based on Novel Senescence-Related Genes in Non-Small Cell Lung Cancer Patients with Drug Sensitivity and Tumor Microenvironment
2023-12, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300190
PMID:37518773
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研究论文 | 本文开发了一种基于新颖衰老相关基因的预后模型，以评估非小细胞肺癌患者的药物敏感性和肿瘤微环境 | 提出了一种新的预后系统，基于12个衰老基因的表达，评估肺腺癌患者的生存风险 | 研究主要依赖于TCGA和GEO数据库的数据，可能会受到数据集的限制 | 研究衰老相关基因在非小细胞肺癌中对预后的影响 | 非小细胞肺癌（LUAD）患者以及相关细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | LASSO Cox回归 | NA | 基因表达数据 | 基于TCGA和GEO数据集的样本，具体数量未在摘要中说明 |
| 1097 | 2024-08-04 |
Spatial Single-Cell Technologies for Exploring Gastrointestinal Tissue Transcriptome
2023-06-26, Comprehensive Physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1002/cphy.c210053
PMID:37358516
|
评论 | 本文总结了空间单细胞技术在探索胃肠组织转录组方面的最新进展 | 提出了利用空间转录组技术提供基因表达的基因组范围全景，以揭示胃肠组织的分子组成 | 未在摘要中明确指出具体的局限性 | 推广对胃肠生理的理解 | 胃肠道组织及其单细胞层次的功能和表达 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | NA | NA |
| 1098 | 2024-08-04 |
HSV-2 triggers upregulation of MALAT1 in CD4+ T cells and promotes HIV latency reversal
2023-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI164317
PMID:37079384
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研究论文 | 本研究探讨了单纯疱疹病毒2型（HSV-2）如何促进CD4+ T细胞中MALAT1的上调以及HIV的潜伏期逆转 | 研究首次揭示了HSV-2通过上调MALAT1和其他机制促进HIV-1的再激活 | 本研究没有提及样本的多样性和长期观察的结果 | 探究HSV-2感染如何影响HIV-1的潜伏期和再激活机制 | 研究的对象是人类CD4+ T细胞和2D10细胞模型 | 数字病理学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序 | 2D10细胞模型 | RNA序列数据 | 使用了人类CD4+ T细胞和若干2D10细胞样本 |
| 1099 | 2024-08-04 |
Dissociation protocols used for sarcoma tissues bias the transcriptome observed in single-cell and single-nucleus RNA sequencing
2023-May-31, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-10977-1
PMID:37254069
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研究论文 | 本文研究了不同肉瘤亚型的细胞分离方法对转录组的影响 | 首次阐明了分离方法对肉瘤患者衍生肿瘤样本分子特征解读的影响 | 仅探讨了三种肉瘤亚型，可能不适用于所有肉瘤类型 | 评估不同的细胞分离方法如何影响肉瘤样本的转录组数据 | 患者来源的肉瘤样本及其相应的单细胞和单核RNA测序数据 | 数字病理 | 肉瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 125,831个细胞和细胞核 |
| 1100 | 2024-08-05 |
Clonally expanded, thyrotoxic effector CD8+ T cells driven by IL-21 contribute to checkpoint inhibitor thyroiditis
2023-05-17, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg0675
PMID:37196065
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研究论文 | 本研究揭示了IL-21驱动的克隆扩展的效应CD8+ T细胞在免疫检查点抑制剂相关甲状腺炎中的作用 | 首次直接比较了免疫检查点抑制剂甲状腺炎与自身免疫性桥本甲状腺炎的免疫浸润，揭示了IL-21在甲状腺毒性CD8 T细胞中的关键作用 | 研究主要依赖于小鼠模型，缺乏临床试验数据支持 | 探讨免疫检查点抑制剂相关副作用的免疫机制及潜在治疗靶点 | 包括接受免疫检查点抑制剂治疗的患者和桥本甲状腺炎患者的甲状腺样本 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本 | 涉及多个患者的甲状腺样本 |