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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2024-10-05 |
Cellular Heterogeneity of Activated Primary Human Macrophages and Associated Drug-Gene Networks: From Biology to Precision Therapeutics
2023-11-07, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究了干扰素-γ激活的人类原代巨噬细胞的细胞异质性及其相关的药物-基因网络,旨在从生物学到精准治疗 | 通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,鉴定了两种主要的巨噬细胞亚群,并结合细胞签名药物库识别了一种新型化合物,该化合物能够靶向治疗动脉粥样硬化 | NA | 探索巨噬细胞亚群在动脉粥样硬化中的作用,并开发新的免疫治疗方法 | 干扰素-γ激活的人类原代巨噬细胞及其在动脉粥样硬化中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、代谢物消耗分析、免疫测定、功能测试 | NA | RNA序列数据 | 人类原代巨噬细胞、人类颈动脉粥样硬化斑块、小鼠动脉粥样硬化模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1062 | 2024-10-05 |
Adrenomedullin has a pivotal role in trophoblast differentiation: A promising nanotechnology-based therapeutic target for early-onset preeclampsia
2023-11-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi4777
PMID:37922358
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研究论文 | 研究探讨了肾上腺髓质素(ADM)在滋养层细胞分化中的关键作用,并提出了一种基于纳米技术的早期子痫前期的潜在治疗靶点 | 首次揭示了ADM在滋养层细胞分化中的重要作用,并提出了一种基于纳米技术的治疗策略 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未在人体中进行验证 | 探讨ADM在早期子痫前期中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 滋养层细胞、早期子痫前期患者、妊娠小鼠 | 生物医学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人类绒毛膜滋养层细胞、滋养层干细胞、滋养层类器官、妊娠小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 1063 | 2024-10-05 |
Multi-scale characterisation of homologous recombination deficiency in breast cancer
2023-11-02, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01239-7
PMID:37919776
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研究论文 | 本文研究了乳腺癌中同源重组缺陷的多尺度特征,开发了基于插入缺失事件的分类方法和转录组特征,以提高同源重组缺陷的分类准确性 | 本文创新性地利用插入缺失事件和转录组特征来提高同源重组缺陷的分类准确性,并展示了其在单细胞转录组数据中的应用 | 本文未详细讨论所开发方法在其他癌症类型中的适用性 | 研究乳腺癌中同源重组缺陷的多尺度特征,并开发新的分类方法 | 乳腺癌中的同源重组缺陷及其与BRCA1/2缺陷状态的关系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 外显子测序、单细胞RNA测序 | 多重弹性网络回归模型 | 基因表达数据 | 涉及多个乳腺癌样本,包括单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1064 | 2024-10-05 |
Neutrophils resist ferroptosis and promote breast cancer metastasis through aconitate decarboxylase 1
2023-10-03, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2023.09.004
PMID:37793345
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研究论文 | 研究揭示了中性粒细胞通过aconitate脱羧酶1(Acod1)抵抗铁死亡并促进乳腺癌转移的机制 | 首次发现Acod1在中性粒细胞中的高表达及其在抵抗铁死亡和促进乳腺癌转移中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行大规模验证 | 探讨中性粒细胞在乳腺癌转移中的作用及其潜在治疗靶点 | 肿瘤浸润中性粒细胞(TINs)和循环中性粒细胞 | 癌症研究 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠乳腺肿瘤模型中的TINs和循环中性粒细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1065 | 2024-10-05 |
NOTCH3 drives meningioma tumorigenesis and resistance to radiotherapy
2023-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.10.548456
PMID:37503127
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研究论文 | 研究报告NOTCH3在驱动脑膜瘤肿瘤发生和放射治疗抵抗中的作用 | 发现NOTCH3+脑膜瘤壁细胞在人类、狗和鼠中保守,并揭示了NOTCH3在肿瘤起始、细胞增殖、血管生成和放射治疗抵抗中的作用 | 研究主要基于小鼠遗传和异种移植模型,需要在临床试验中进一步验证 | 探讨NOTCH3在脑膜瘤肿瘤发生和放射治疗抵抗中的作用及其潜在治疗价值 | 脑膜瘤及其对放射治疗的抵抗性 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞转录组学、谱系追踪和成像技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及人类、狗和鼠的脑膜瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1066 | 2024-10-05 |
Spatiotemporal single-cell transcriptomic profiling reveals inflammatory cell states in a mouse model of diffuse alveolar damage
2023-Jun, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20220171
PMID:37933384
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研究论文 | 本文通过结合单细胞和空间转录组学技术,系统分析了在小鼠弥漫性肺泡损伤模型中,由蓖麻毒素气溶胶吸入引起的嗜中性粒细胞炎症的细胞状态 | 本文揭示了稳态下的成纤维细胞向超炎症状态的转变,并发现激活的成纤维细胞与嗜中性粒细胞之间的CXCL1-CXCR2趋化因子轴在进一步招募嗜中性粒细胞中的作用 | NA | 研究弥漫性肺泡损伤过程中炎症细胞状态的变化 | 小鼠弥漫性肺泡损伤模型中的炎症细胞状态 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1067 | 2024-10-04 |
Population-level single-cell genomics reveals conserved gene programs in systemic juvenile idiopathic arthritis
2023-11-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI166741
PMID:37733441
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研究论文 | 研究通过单细胞基因组学揭示了系统性幼年特发性关节炎中保守的基因程序 | 引入了两个新的计算框架UDON和SATAY-UDON,用于定义患者亚型及其相关生物标志物或临床特征,并发现了新的补体和干扰素激活程序 | NA | 揭示系统性幼年特发性关节炎中保守的基因程序 | 系统性幼年特发性关节炎患者的外周血单核细胞 | 基因组学 | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过1,000名健康捐赠者和系统性幼年特发性关节炎患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1068 | 2024-10-04 |
IL-17 Signaling in Primary Sclerosing Cholangitis Patient-Derived Organoids
2023-Oct-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3406046/v1
PMID:37886596
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研究论文 | 研究了IL-17信号在原发性硬化性胆管炎患者来源的类器官中的作用 | 首次直接评估了IL-17信号在原发性硬化性胆管炎胆管细胞中的作用 | 未发现IL-17通路相关基因的罕见变异,但发现了MAPK信号通路的罕见变异 | 探讨原发性硬化性胆管炎外周胆管细胞类器官对IL-17A刺激的反应 | 原发性硬化性胆管炎和非原发性硬化性胆管炎患者的胆管细胞类器官 | NA | 原发性硬化性胆管炎 | 转录组学、分泌组分析、基因组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 来自原发性硬化性胆管炎和非原发性硬化性胆管炎患者的胆管细胞类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 1069 | 2024-10-04 |
Molecular insights using spatial transcriptomics of the distal lung in congenital diaphragmatic hernia
2023-10-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00154.2023
PMID:37605849
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研究论文 | 研究使用空间转录组学技术分析先天性膈疝(CDH)远端肺组织的转录组特征 | 首次在CDH患者中应用空间转录组学技术,识别不同肺细胞亚群在CDH病理生理中的作用,并强调性别特异性差异 | NA | 探讨先天性膈疝(CDH)远端肺组织与正常肺组织在转录组水平上的差异 | 先天性膈疝(CDH)和正常新生儿的远端肺组织 | 数字病理学 | 先天性疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 男性和女性CDH及正常新生儿的肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1070 | 2024-10-04 |
Identification of de novo Mutations in the Chinese Autism Spectrum Disorder Cohort via Whole-Exome Sequencing Unveils Brain Regions Implicated in Autism
2023-Oct, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-023-01037-6
PMID:36881370
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研究论文 | 通过全外显子测序在中国自闭症谱系障碍队列中识别新生突变,揭示与自闭症相关的大脑区域 | 结合全基因组筛查、单细胞测序和脑成像数据的综合分析,揭示了与自闭症病因相关的大脑区域 | 东亚自闭症队列在全基因组遗传研究中仍代表性不足 | 识别中国自闭症谱系障碍队列中的新生突变,并研究其与大脑区域的关系 | 369个中国自闭症三联体(包括患者及其未受影响的父母) | 基因组学 | 自闭症谱系障碍 | 全外显子测序 | NA | 基因组数据、单细胞测序数据、脑成像数据 | 369个自闭症三联体 | NA | NA | NA | NA |
| 1071 | 2024-10-04 |
Transcriptomic Profiling Identifies Ferroptosis-Related Gene Signatures in Ischemic Muscle Satellite Cells Affected by Peripheral Artery Disease-Brief Report
2023-10, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319518
PMID:37675635
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研究论文 | 研究通过转录组分析识别出外周动脉疾病影响下的缺血肌肉卫星细胞中与铁死亡相关的基因特征 | 首次发现铁死亡相关基因在外周动脉疾病影响的人类骨骼肌中差异表达 | 样本量较小,仅基于8个捐赠者的样本 | 探讨外周动脉疾病对肌肉卫星细胞转录组的影响,识别与肌肉病变相关的损伤途径 | 外周动脉疾病患者的肌肉卫星细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 8个捐赠者的25000多个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1072 | 2024-10-04 |
Transforming Growth Factor-β Blockade in Pancreatic Cancer Enhances Sensitivity to Combination Chemotherapy
2023-10, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.05.038
PMID:37263309
|
研究论文 | 研究探讨了在胰腺癌中阻断TGFβ与化疗联合使用的效果 | 首次证明了TGFβ阻断在胰腺癌模型中增强化疗敏感性的作用,并提供了在临床环境中评估NIS793与FOLFIRINOX或吉西他滨/纳米颗粒(白蛋白结合)紫杉醇联合化疗的理论基础 | 研究仅在动物模型中进行,尚未在人类临床试验中验证 | 研究TGFβ阻断在胰腺癌中与化疗联合使用的效果 | 胰腺癌细胞及其微环境 | 癌症研究 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序和免疫荧光 | NA | RNA序列和免疫荧光图像 | 使用了正位胰腺癌模型中的小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1073 | 2024-10-04 |
Divergent Actions of Renal Tubular and Endothelial Type 1 IL-1 Receptor Signaling in Toxin-Induced AKI
2023-10-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000191
PMID:37545036
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研究论文 | 研究IL-1受体1在肾小管和内皮细胞中的不同信号传导对毒素诱导的急性肾损伤的影响 | 发现IL-1R1在肾小管和内皮细胞中的激活对急性肾损伤有相反的影响,肾小管中的激活加剧损伤,而内皮细胞中的激活减轻损伤 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类中验证结果 | 探讨IL-1R1在不同肾脏细胞类型中的信号传导对急性肾损伤的影响 | IL-1R1在肾小管和内皮细胞中的信号传导 | NA | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和小鼠的肾脏组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1074 | 2024-10-04 |
Single-cell analysis of dorsal root ganglia reveals metalloproteinase signaling in satellite glial cells and pain
2023-10, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2023.08.005
PMID:37557960
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术分析背根神经节中的卫星胶质细胞,揭示了金属蛋白酶信号在疼痛中的作用 | 首次揭示了卫星胶质细胞中金属蛋白酶信号通路在处理躯体感觉刺激中的作用,并发现了一种潜在的疼痛治疗方法 | 研究主要集中在体外实验和细胞水平,尚未在动物模型或人体中验证 | 探讨卫星胶质细胞在疼痛中的作用及其分子机制 | 背根神经节中的卫星胶质细胞和感觉神经元 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 多个卫星胶质细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1075 | 2024-10-04 |
Transcriptional programming of CD4+ TRM differentiation in viral infection balances effector- and memory-associated gene expression
2023-05-12, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abq7486
PMID:37172104
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研究论文 | 研究了在病毒感染后,CD4+ T细胞在小肠中的表型、功能和转录特征,揭示了其与循环T1细胞的共同基因表达程序和染色质可及性特征 | 首次揭示了CD4+ T细胞在病毒感染后形成的早期T细胞与T1效应细胞之间的发育关系,并比较了CD4+ T细胞与CD8+ T细胞的差异 | NA | 探讨CD4+ T细胞在病毒感染后的分化和转录调控机制 | CD4+ T细胞在小肠中的表型、功能和转录特征 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1076 | 2024-10-02 |
A telencephalon cell type atlas for goldfish reveals diversity in the evolution of spatial structure and cell types
2023-11-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh7693
PMID:37910612
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统比较了金鱼端脑的细胞类型,揭示了其分子神经解剖学的分区 | 首次构建了金鱼端脑的细胞类型图谱,发现了神经元基因表达的多样性和模块化特征,并提出了金鱼端脑中存在海马结构的可能性 | NA | 研究金鱼端脑的细胞类型多样性及其在进化中的空间结构变化 | 金鱼端脑的细胞类型及其分子特征 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 金鱼端脑的多个细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1077 | 2024-10-02 |
Spatially Resolved Transcriptomics Technology Facilitates Cancer Research
2023-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202302558
PMID:37632718
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在癌症研究中的应用及其在揭示基因表达和细胞功能空间位置方面的主要成就 | 空间转录组学技术(SRT)能够探索特定细胞与其空间背景之间的关系,弥补了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在空间信息上的不足 | NA | 旨在通过深入理解肿瘤细胞与周围非恶性细胞的相互作用,开发更有效的临床治疗策略 | 肿瘤细胞及其周围非恶性细胞的空间位置与功能 | 数字病理学 | 癌症 | 下一代测序(NGS) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1078 | 2024-10-02 |
Lepr-Expressing PDLSCs Contribute to Periodontal Homeostasis and Respond to Mechanical Force by Piezo1
2023-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303291
PMID:37553778
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研究论文 | 研究揭示了Lepr+ PDLSCs在牙周稳态中的作用及其对机械力的响应机制 | 首次通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术鉴定出Lepr+ PDLSCs,并发现Piezo1介导了Lepr+ PDLSCs的机械感应 | NA | 探讨Lepr+ PDLSCs在牙周稳态中的作用及其对机械力的响应机制 | Lepr+ PDLSCs及其在牙周组织修复和稳态维持中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1079 | 2024-10-02 |
Simultaneous estimation of gene regulatory network structure and RNA kinetics from single cell gene expression
2023-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.21.558277
PMID:37790443
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研究论文 | 开发了一种深度学习模型,通过单细胞RNA测序数据同时推断基因调控网络结构和RNA动力学参数 | 首次将深度学习模型应用于同时推断基因调控网络结构和RNA动力学参数,并展示了其在预测基因表达状态和模拟转录因子变化效果方面的优越性 | NA | 构建一个完整的、预测性的生物物理模型,用于基因表达调控 | 基因调控网络结构和RNA动力学参数 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型 | 基因表达数据 | 175,000个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1080 | 2024-10-02 |
Single-Nucleus RNA-Seq: Open the Era of Great Navigation for FFPE Tissue
2023-Sep-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241813744
PMID:37762049
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综述 | 本文综述了单核RNA测序(snRNA-seq)在福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织中的应用及其技术进展 | snRNA-seq技术减少了离子化转录偏差,适用于更丰富的样本,为深入探索FFPE组织提供了新机会 | 本文总结了snRNA-seq在FFPE样本中的局限性和潜在技术发展 | 探讨单核RNA测序技术在福尔马林固定石蜡包埋组织中的应用 | 单核RNA测序技术及其在FFPE组织中的应用 | 基因组学 | NA | 单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |