单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 1021 - 1040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1021 | 2024-08-05 |
Intragraft B cell differentiation during the development of tolerance to kidney allografts is associated with a regulatory B cell signature revealed by single cell transcriptomics
2023-09, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2023.05.036
PMID:37295719
|
研究论文 | 该文章探讨了在肾移植物耐受的发展过程中，肾移植物内B细胞的分化与调节B细胞特征的关联 | 首次展示了在肾移植物中B细胞的比例随时间变化，并揭示了调节B细胞在移植物耐受中的潜在作用 | 该研究主要基于小鼠模型，可能在临床转化方面存在局限 | 研究肾移植物接受过程中B细胞的分化和功能 | 小鼠肾移植物及其免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 接受和拒绝的肾移植物样本，研究涉及的时间范围为1周至6个月 |
| 1022 | 2024-08-04 |
Human endogenous retrovirus K contributes to a stem cell niche in glioblastoma
2023-07-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI167929
PMID:37395282
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研究论文 | 本研究报告了HML-2在人类恶性胶质瘤中的病理性表达及其与癌症干细胞表型和不良预后的相关性 | 该研究首次揭示了HML-2在胶质母细胞瘤中的重要作用，并且展示了其在维护肿瘤干性和促进肿瘤生成中的关键性 | 未提及具体的临床试验数据或长期跟踪观察结果 | 探究HERV-K（HML-2）在胶质母细胞瘤干细胞小环境中的作用 | 恶性胶质瘤细胞，特定的神经前体样细胞群体 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序，CRISPR干扰 | 小鼠肿瘤模型 | 组织样本，细胞样本 | 涉及的样本数量和类型在摘要中未明确说明 |
| 1023 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal cancer-associated fibroblasts in glioblastoma with protumoral effects
2023-03-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI147087
PMID:36856115
|
研究论文 | 该研究揭示了在胶质母细胞瘤中与癌症相关的成纤维细胞的肿瘤促进作用 | 首次在胶质母细胞瘤中识别与癌症相关的成纤维细胞及其与肿瘤干细胞的相互作用 | 研究未提及样本的时间跨度或CAF与其他细胞类型交互详细信息 | 旨在探讨胶质母细胞瘤中的CAFs及其与肿瘤干细胞的相互作用 | 研究对象为12名患者的胶质母细胞瘤样本中的CAFs | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 细胞样本 | 12名患者的胶质母细胞瘤 |
| 1024 | 2024-08-05 |
De novo identification of expressed cancer somatic mutations from single-cell RNA sequencing data
2023-12-18, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01269-1
PMID:38111063
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研究论文 | 提出了一种计算框架RESA用于从单细胞RNA测序数据中识别表达的肿瘤体细胞突变 | RESA提供了一种新的方法来进行表达的肿瘤体细胞突变分析，并在现有方法中表现优异 | 没有提及具体的局限性 | 旨在提高从单细胞RNA测序数据中识别表达肿瘤突变的准确性 | 针对黑色素瘤药物耐药性数据集分析肿瘤内突变异质性 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据集 | 19个数据集 |
| 1025 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals characteristics of myeloid cells in pulmonary post-acute sequelae of SARS-CoV-2
2023-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.31.551349
PMID:37577518
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研究论文 | 本文揭示了SARS-CoV-2后肺病症状患者中骨髓来源细胞的特征。 | 通过单细胞RNA测序，首次详细描绘了与COVID-19后急性并发症相关的免疫细胞特征和代谢变化。 | 样本大小和控制组的选择可能限制了结果的普遍适用性。 | 研究COVID-19后急性并发症患者中免疫反应的特点。 | 与SARS-CoV-2病毒感染后的慢性肺部症状相关的外周血单核细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了34,139个外周血单核细胞样本 |
| 1026 | 2024-08-05 |
Cross-species scRNA-seq reveals the cellular landscape of retina and early alterations in type 2 diabetes mice
2023-07, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2023.110644
PMID:37279838
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研究论文 | 本研究揭示了2型糖尿病小鼠视网膜的细胞景观和早期病理变化 | 首次通过跨物种的单细胞RNA测序详细描述了视网膜细胞图谱，并发现了新的视网膜双极细胞亚型 | 该研究仅基于小鼠和人类的数据，未涵盖其他物种的视网膜变化 | 探索2型糖尿病对视网膜的早期影响 | 人类和小鼠的视网膜细胞 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 276,402个细胞 |
| 1027 | 2024-08-05 |
Activation of Angiopoietin-Tie2 Signaling Protects the Kidney from Ischemic Injury by Modulation of Endothelial-Specific Pathways
2023-06-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000098
PMID:36787763
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研究论文 | 本研究探讨了激活Angiopoietin-Tie2信号通路如何通过调节内皮特异性途径来保护肾脏免受缺血损伤。 | 引入了Hepta-ANG1作为一种新的治疗生物药物，并提供了Tie2激活保护肾脏的分子机制依据。 | 本研究的局限性未在摘要中提到 | 研究缺血再灌注急性肾损伤（IR-AKI）中Tie2信号的激活及其保护作用。 | 使用VE-PTP小鼠和C57BL/6J小鼠进行实验，研究其在肾脏缺血再灌注损伤中的作用。 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织活检, RNA测序 | 使用VE-PTP野生型和敲除小鼠及C57BL/6J小鼠的样本 |
| 1028 | 2024-08-04 |
Accurate integration of multiple heterogeneous single-cell RNA-seq data sets by learning contrastive biological variation
2023-05, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277522.122
PMID:37308294
|
研究论文 | 本文介绍了一个新的单细胞RNA测序数据集整合方法 scInt | scInt通过构建精确、稳健的细胞间相似性并学习统一的对比生物变异，从多个数据集中进行有效整合，超越了现有的十种 cutting-edge 方法 | 针对复杂实验设计的整合效果仍需进一步验证 | 实现多种异质单细胞RNA测序数据集的有效整合 | 不同生物条件下的单细胞异质样本及其功能性亚群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 涉及多种生物条件的多个模拟和真实数据集 |
| 1029 | 2024-08-04 |
Glioblastoma-instructed microglia transition to heterogeneous phenotypic states with phagocytic and dendritic cell-like features in patient tumors and patient-derived orthotopic xenografts
2023-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.05.531162
PMID:36945572
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研究论文 | 本研究系统表征了胶质母细胞瘤在患者肿瘤和患者衍生的肿瘤异种移植中的肿瘤微环境 | 本研究揭示了教育后的小胶质细胞在不同胶质母细胞瘤环境和肿瘤腔室中转变为多样的表型状态，并显示其在支持胶质母细胞瘤生长和治疗反应中的关键作用 | 关于胶质母细胞瘤生态系统及其在临床前模型中的再现性尚不充分，导致结果不准确和临床试验失败 | 深入理解胶质母细胞瘤驱动的肿瘤微环境及其在临床前模型中的再现 | 以胶质母细胞瘤（GBM）患者的肿瘤和患者衍生的肿瘤异种移植为研究对象 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多色流式细胞术、免疫组化及功能研究 | NA | 细胞 | 不同肿瘤表型的胶质母细胞瘤PDOXs与胶质瘤小鼠GL261同源模型和患者肿瘤进行比较 |
| 1030 | 2024-08-05 |
Personalized tumor combination therapy optimization using the single-cell transcriptome
2023-12-01, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01256-6
PMID:38041202
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研究论文 | 该文章提出了一种利用单细胞转录组优化个性化肿瘤联合治疗的方法 | 介绍了一种名为comboSC的计算原型，能够基于单细胞转录组评估个别患者的免疫微环境并优化联合治疗 | 该研究的具体临床应用和实验验证尚需进一步探索 | 推动个性化癌症治疗的方法和工具的发展 | 119个来自15种癌症类型的肿瘤样本的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 119个肿瘤样本 |
| 1031 | 2024-08-05 |
Complementary and countervailing actions of Jak2 and Ikk2 in hematopoiesis in mice
2023-12, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2023.08.005
PMID:37611729
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研究论文 | 本研究探讨了Jak2和Ikk2在小鼠造血中的互补和相对作用 | 提出了Jak2和Ikk2在促进造血干细胞自我更新与髓系分化之间的相互作用机制 | 研究局限于小鼠模型，临床应用尚需进一步验证 | 探讨NFκB通路的高活性如何与Jak2 V617F突变相互作用影响造血过程 | 使用含有Jak2 V617F突变和Ikk2-CA的小鼠模型进行实验 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 包含多个小鼠模型，具体样本大小未明确提及 |
| 1032 | 2024-08-04 |
Loss of p53-DREAM-mediated repression of cell cycle genes as a driver of lymph node metastasis in head and neck cancer
2023-11-17, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01236-w
PMID:37978395
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研究论文 | 本研究探索了p53-DREAM介导的细胞周期基因抑制的丧失如何驱动头颈癌的淋巴结转移 | 本文揭示了淋巴结转移相关基因与癌细胞的上皮去分化及细胞周期调节之间的新的联系 | 未具体讨论治疗选项或干预措施的有效性 | 识别驱动头颈癌转移及进展的分子通路 | 2074个头颈癌组织活检样本及其基因表达数据 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序和整体RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2074个头颈癌活检样本 |
| 1033 | 2024-08-04 |
An ANXA11 P93S variant dysregulates TDP-43 and causes corticobasal syndrome
2023-Oct-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3462973/v1
PMID:37886540
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研究论文 | 本研究识别了ANXA11中的一个新型变异P93S，其导致TDP-43的异常调控，并与皮质基底综合征相关。 | 首次将ANXA11 P93S变异与皮质基底综合征联系起来，拓展了ANXA11突变所致临床综合征的范围。 | 关于ANXA11 P93S变异对神经元功能的影响尚未全面理解，且样本规模可能有限。 | 探讨ANXA11突变在皮质基底综合征中的致病作用及其相关生物学机制。 | 针对携带ANXA11 P93S突变的个体进行的表型分析和细胞功能研究。 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 多组学评估 | iPSC衍生神经元 | 单细胞测序和蛋白组学分析 | 涉及对应突变的个体样本及其iPSC衍生的神经元和小胶质细胞 |
| 1034 | 2024-08-04 |
scDrugPrio: A framework for the analysis of single-cell transcriptomics to address multiple problems in precision medicine in immune-mediated inflammatory diseases
2023-Nov-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.08.566249
PMID:38014022
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研究论文 | 提出了一种名为scDrugPrio的计算框架，旨在基于单细胞转录组学分析免疫介导的炎症性疾病中的药物优先顺序 | scDrugPrio通过构建网络模型，整合细胞类型特异性表达变化、细胞间相互作用和药理特性，提供了一种系统的药物优先级和重定位的解决方案 | 相较于小鼠模型，患者在相同诊断下的细胞和基因表达存在显著差异，这可能影响药物反应的预测 | 研究免疫介导的炎症性疾病中的药物优先级和个性化治疗 | 研究对象包括小鼠抗原诱导性关节炎模型及多名克罗恩病患者 | 数字病理学 | 免疫介导的炎症性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 网络模型 | 基因表达数据 | 研究涉及多个小鼠样本以及十一名克罗恩病患者的单细胞RNA测序数据 |
| 1035 | 2024-08-05 |
Anti-PD-1 immunotherapy with androgen deprivation therapy induces robust immune infiltration in metastatic castration-sensitive prostate cancer
2023-11-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.10.006
PMID:37922910
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研究论文 | 这项研究探讨了抗PD-1免疫疗法与雄激素剥夺治疗（ADT）联合使用对转移性去势敏感前列腺癌的免疫浸润影响 | 本研究通过单细胞RNA测序全面评估转移性去势敏感前列腺癌的肿瘤微环境，并发现治疗反应与临床结果之间的相关性 | 关于研究的影响因素和样本的多样性缺乏深度讨论 | 评估治疗方法对转移性去势敏感前列腺癌中免疫微环境的影响 | 转移性去势敏感前列腺癌患者的转移部位 | 数字病理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 参与者来自第二阶段临床试验，具体样本量NA |
| 1036 | 2024-08-05 |
The shaky foundations of simulating single-cell RNA sequencing data
2023-03-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-02904-1
PMID:36991470
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研究论文 | 本文评估了合成单细胞RNA测序数据生成方法的能力 | 提出了对不同模拟器在检验数据相似性以及对现有工具影响的全面评估 | 大多数模拟器无法处理复杂设计，且引入了人工效应 | 探讨合成单细胞RNA测序数据生成方法的有效性 | 合成单细胞RNA测序数据生成方法及其与实验数据的比较 | 计算机视觉 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 合成数据 | NA |
| 1037 | 2024-08-05 |
Border-associated macrophages mediate the neuroinflammatory response in an alpha-synuclein model of Parkinson disease
2023-06-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39060-w
PMID:37365181
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研究论文 | 这篇文章探讨了边界相关巨噬细胞在帕金森病α-突触核蛋白模型中的神经炎症反应中的作用 | 揭示了边界相关巨噬细胞在神经炎症反应中的关键作用，尤其是在抗原呈递和CD4 T细胞反应中的独特地位 | 尚不清楚边界相关巨噬细胞在其他神经退行性疾病中的作用 | 研究边界相关巨噬细胞在帕金森病神经炎症中的作用 | 边界相关巨噬细胞以及它们在α-突触核蛋白引发的神经炎症中的角色 | 数字病理 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 从后期死亡的帕金森病大脑中关于巨噬细胞和T细胞的位置特征进行的研究 |
| 1038 | 2024-08-04 |
ENGEP: advancing spatial transcriptomics with accurate unmeasured gene expression prediction
2023-12-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03139-w
PMID:38129866
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研究论文 | 本研究介绍了ENGEP，这是一个基于集成学习的工具，用于在空间转录组数据中预测未测量的基因表达 | ENGEP能够通过多个单细胞RNA测序数据集作为参考，准确预测未测量的基因表达，超越了当前的先进工具 | 本文未提及具体的限制 | 旨在提高空间转录组技术的基因表达预测能力 | 研究对象为空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成学习 | 转录组数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 |
| 1039 | 2024-08-05 |
A time-resolved meta-analysis of consensus gene expression profiles during human T-cell activation
2023-12-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03120-7
PMID:38098113
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研究论文 | 本文分析了不同T细胞群体在激活过程中的时间模式，以开发共识基因特征 | 本研究首次描述了不同T细胞群体的时间解析基因表达模式 | 研究未提及样本的具体来源和数量限制 | 本研究旨在识别和验证用于评估T细胞激活的生物标志物特征 | 研究对象为不同类型的激活T细胞 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 包括521个基因和最多10个不同时间点的激活样本 |
| 1040 | 2024-08-04 |
Cytomulate: accurate and efficient simulation of CyTOF data
2023-11-16, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03099-1
PMID:37974276
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研究论文 | 本文开发了一种可重复的准确的CyTOF数据模拟算法Cytomulate | Cytomulate在捕捉CyTOF数据特性和学习数据分布上优于现有方法 | 缺乏对现有分析工具的客观评估 | 为CyTOF数据的未来方法开发和评估提供基础 | CyTOF数据及其分析方法 | 数字病理学 | NA | CyTOF | NA | 数据分布 | NA |