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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-03-21 |
Reanalysis of single-cell RNA sequencing data does not support herpes simplex virus 1 latency in non-neuronal ganglionic cells in mice
2023-Jul-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.17.549345
PMID:37503290
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研究论文 | 本文通过重新分析小鼠模型中的单细胞RNA测序数据,挑战了单纯疱疹病毒1型在非神经元神经节细胞中存在潜伏感染的观点 | 揭示了3'端单细胞RNA测序实验中脱靶引物效应导致非多聚腺苷酸化的HSV-1内含子RNA被错误检测,并首次系统论证了神经元细胞死亡导致的RNA污染是先前结论的主要成因 | 研究基于已发表数据的二次分析,缺乏新的实验验证;结论主要依赖于生物信息学推断,可能存在未考虑的技术偏差 | 验证单纯疱疹病毒1型潜伏感染的细胞特异性,澄清单细胞测序数据分析中的技术假象 | 小鼠外周神经节中的神经元与非神经元细胞 | 数字病理学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 生物信息学分析流程 | 单细胞转录组数据 | 基于已发表小鼠模型单细胞数据集(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 3'端单细胞RNA测序实验 |
| 82 | 2026-03-20 |
Thrombospondin-1 promotes fibro-adipogenic stromal expansion and contractile dysfunction of the diaphragm in obesity
2023-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.17.553733
PMID:37645822
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研究论文 | 本研究探讨了肥胖症中血小板反应蛋白-1(THBS1)如何促进膈肌纤维脂肪基质扩张和收缩功能障碍 | 首次确立THBS1作为肥胖诱导膈肌基质重塑和收缩功能障碍的必要介质,并识别其作为潜在治疗靶点 | 研究基于小鼠模型,人类相关性需进一步验证;未详细探讨THBS1下游信号通路 | 探究THBS1在肥胖相关膈肌功能障碍中的作用机制 | 野生型和THBS1敲除小鼠的膈肌组织 | NA | 肥胖症 | bulk转录组学, single-cell转录组学 | NA | 转录组数据 | 野生型和THBS1敲除小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 83 | 2026-03-20 |
Human ureteric bud organoids recapitulate branching morphogenesis and differentiate into functional collecting duct cell types
2023-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01429-5
PMID:36038632
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研究论文 | 本研究描述了从人类多能干细胞高效分化出输尿管芽类器官和功能性集合管细胞,模拟肾脏发育过程 | 首次实现人类多能干细胞在无血清条件下高效分化为输尿管芽类器官,并展示其分支形态发生和功能性集合管细胞分化 | NA | 肾脏再生医学,旨在通过干细胞分化模拟肾脏发育和功能 | 人类多能干细胞、输尿管芽类器官、集合管细胞 | 再生医学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2026-03-19 |
Single-cell level deconvolution, convolution, and clustering in spatial transcriptomics by aligning spot level transcriptome to nuclear morphology
2023-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.17.572084
PMID:38187541
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研究论文 | 本文提出了一种名为STIE的算法,通过将空间转录组数据与匹配的组织学图像中的核形态对齐,实现单细胞水平的去卷积、卷积和聚类分析 | STIE算法首次通过核形态相似性和邻域信息,从斑点间高达约70%的间隙区域恢复缺失细胞,实现了真正的单细胞水平分析,超越了现有方法仅关注斑点大小提升的局限 | 算法依赖于匹配的组织学图像和核形态数据,可能受图像质量或配准误差影响,且在处理高度异质或重叠细胞时性能未完全评估 | 旨在解决基于斑点的空间转录组学中无法精确捕获单细胞转录组的问题,实现单细胞水平的分辨率提升 | 真实和模拟的空间转录组学数据,包括低分辨率和高分辨率斑点 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | EM算法 | 图像、文本(转录组数据) | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 85 | 2026-03-19 |
Endogenous adenine mediates kidney injury in diabetic models and predicts diabetic kidney disease in patients
2023-10-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170341
PMID:37616058
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研究论文 | 本研究提出内源性腺嘌呤可能是糖尿病肾病(DKD)的致病因子,并探讨了尿腺嘌呤/肌酐比值(UAdCR)作为预测终末期肾病(ESKD)的机制性生物标志物的潜力 | 首次提出内源性腺嘌呤是DKD的致病因子,发现UAdCR可作为无大量白蛋白尿患者ESKD的预测生物标志物,并确定了腺嘌呤通过mTOR通路促进肾损伤的机制 | 研究主要基于观察性队列,因果关系需进一步实验验证;样本来自特定人群,结果外推需谨慎 | 探究内源性腺嘌呤在糖尿病肾病发生发展中的作用,并寻找预测DKD进展的机制性生物标志物 | 糖尿病患者(来自CRIC、SMART2D和美国印第安人研究)、糖尿病小鼠模型、肾小管细胞 | 代谢组学与转录组学 | 糖尿病肾病 | 空间代谢组学、单细胞转录组学 | NA | 尿液代谢物数据、空间代谢组数据、单细胞转录组数据 | 多个队列的糖尿病患者(具体人数未明确说明)、糖尿病小鼠模型 | NA | 空间代谢组学, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 86 | 2026-03-19 |
Single-cell RNA sequencing identifies hippocampal microglial dysregulation in diet-induced obesity
2023-Mar-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106164
PMID:36915697
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了高脂饮食诱导的肥胖对海马区小胶质细胞功能失调的影响及其与认知障碍的关联 | 利用单细胞转录组学分析,揭示了肥胖状态下海马小胶质细胞在细胞间通讯、免疫调节和蛋白质处理方面的动态变化机制 | 研究基于小鼠模型,其机制在人类中的适用性仍需进一步验证 | 探究肥胖诱导的认知障碍中海马小胶质细胞激活的精确分子机制 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠模型中的海马小胶质细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 87 | 2026-03-19 |
Cross center single-cell RNA sequencing study of the immune microenvironment in rapid progressing multiple myeloma
2023-Jan-26, NPJ genomic medicine
IF:4.7Q1
DOI:10.1038/s41525-022-00340-x
PMID:36702834
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研究论文 | 本研究通过多中心单细胞RNA测序,分析了快速进展型多发性骨髓瘤患者的骨髓免疫微环境特征 | 首次通过多中心协作的单细胞RNA测序研究,系统比较了快速进展与非进展多发性骨髓瘤患者的免疫微环境差异,并验证了不同研究中心数据的一致性 | 样本量相对有限(18名患者),且为横断面研究,无法确定观察到的细胞群变化与疾病进展的因果关系 | 探究多发性骨髓瘤快速进展的免疫微环境机制 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓CD138样本 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 48份骨髓样本(来自18名患者),共计102,207个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 88 | 2026-03-18 |
An update on methods for detection of prognostic and predictive biomarkers in melanoma
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1290696
PMID:37900283
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综述 | 本文综述了黑色素瘤中预后和预测性免疫生物标志物检测的最新方法 | 整合了从批量组织基因表达谱到单细胞空间转录组学和基于人工智能的图像分析等多种技术,以全面表征黑色素瘤免疫微环境 | 作为综述文章,未提供原始实验数据或新方法验证,主要总结现有研究 | 改进黑色素瘤的免疫基础预测和预后生物标志物检测方法 | 黑色素瘤患者,特别是II-IV期患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 基因表达谱分析,空间转录组学,人工智能图像分析 | NA | 图像,文本(基因表达数据) | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 89 | 2026-03-18 |
A novel lncRNA-mediated epigenetic regulatory mechanism in periodontitis
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.87977
PMID:37928259
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研究论文 | 本研究探讨了长链非编码RNA lncR-APDC在牙周炎进展中的调控作用及其治疗潜力 | 首次揭示了lncR-APDC在牙周炎中的关键调控作用,发现了一个新的上皮细胞亚群,并提出了lncR-APDC与特定蛋白直接结合的可能性 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证;部分分子相互作用机制尚未完全阐明 | 理解lncR-APDC在牙周炎进展中的调控作用 | lncR-APDC基因敲除小鼠、实验性牙周炎模型、牙周组织免疫细胞 | 表观遗传学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、基因敲除、AAV9介导的基因治疗 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2026-03-15 |
Single-Cell Sequencing of Lung Macrophages and Monocytes Reveals Novel Therapeutic Targets in COPD
2023-12-05, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12242771
PMID:38132091
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析COPD患者肺组织中巨噬细胞和单核细胞的转录组特征,揭示了其功能失调和过度炎症状态,并识别出新的治疗靶点 | 首次在COPD患者肺组织中利用单细胞测序技术系统性地鉴定出16个转录组学上不同的巨噬细胞和单核细胞亚群,并发现吸入性皮质类固醇等化合物可调节这些细胞的转录组特征 | 研究样本量相对有限(COPD组18例,对照组28例),且主要基于体外组织分析,体内验证仅通过一项临床试验数据 | 探究COPD患者肺组织中巨噬细胞和单核细胞的转录组特征,识别新的治疗靶点 | COPD患者和对照者的肺组织样本中的巨噬细胞和单核细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | COPD患者18例,对照者28例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2026-03-15 |
Single-Cell RNA Analysis Reveals Cell-Intrinsic Functions of CAR T Cells Correlating with Response in a Phase II Study of Lymphoma Patients
2023-Oct-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-0178
PMID:37540566
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析CAR-T输注产品的转录谱,揭示了与淋巴瘤患者临床反应相关的细胞内在功能特征 | 首次在II期临床试验中,利用靶向单细胞RNA测序结合多色流式细胞术,将CAR-T输注产品的细胞内在特征与临床反应直接关联,并发现效应样CD8+ CAR-T的多功能性、高细胞毒性和细胞因子产生谱与低功能障碍特征与反应相关 | 样本量较小(n=24),且仅针对第三代CD19导向的CAR-T,可能限制结果的普适性 | 探究CAR-T输注产品质量对B细胞恶性肿瘤患者临床反应的影响 | B细胞淋巴瘤(n=23)和白血病(n=1)患者接受CD19 CAR-T治疗的输注产品 | 单细胞组学 | 淋巴瘤 | 靶向单细胞RNA测序,多色流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 24名患者(23例淋巴瘤,1例白血病) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2026-03-15 |
Single-cell RNA-sequencing identifies disease-associated oligodendrocytes in male APP NL-G-F and 5XFAD mice
2023-02-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36519-8
PMID:36781874
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,在阿尔茨海默病小鼠模型及人类死后大脑中鉴定出一种疾病相关的少突胶质细胞亚群,并探讨了其通过Erk1/2信号通路在疾病进展中的作用 | 首次在阿尔茨海默病背景下鉴定出疾病相关的少突胶质细胞亚群,并揭示了Erk1/2信号通路在该细胞亚群激活及疾病病理中的关键作用 | 研究主要基于雄性小鼠模型,可能无法完全反映雌性个体或人类群体的全部情况,且人类样本来源于死后大脑,可能存在保存偏差 | 探究少突胶质细胞在阿尔茨海默病发病机制中的作用 | 雄性APP NL-G-F和5XFAD阿尔茨海默病小鼠模型的大脑组织,以及人类死后阿尔茨海默病患者的大脑组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 雄性APP NL-G-F和5XFAD小鼠大脑及人类死后AD大脑样本(具体数量未在摘要中明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2026-03-14 |
Ghrelin deletion and conditional ghrelin cell ablation increase pancreatic islet size in mice
2023-12-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI169349
PMID:38099492
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研究论文 | 本研究探讨了胃饥饿素缺失或胃饥饿素细胞条件性消融对小鼠胰腺胰岛大小和β细胞质量的影响 | 揭示了胃饥饿素减少通过降低β细胞凋亡来增加胰岛大小和β细胞数量,并利用单细胞转录组学鉴定了相关基因表达变化 | 研究主要基于小鼠模型,对人类糖尿病的直接治疗意义仍需进一步验证 | 确定胃饥饿素是否影响胰岛大小和β细胞质量 | 小鼠胰腺胰岛和β细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 不同年龄和基因型的小鼠(如4周龄、10-12周龄的GKO和WT小鼠) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2026-03-14 |
Single cell RNA-seq in phytohormone signaling: a promising future
2023-Nov, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2023.07.010
PMID:37550122
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综述 | 本文探讨了单细胞RNA测序在植物激素信号传导研究中的应用前景 | 强调了scRNA-seq在解析激素介导的时空基因调控网络方面的独特潜力,并引用Nolan等人的研究作为案例 | NA | 探索单细胞RNA测序技术如何促进对植物激素信号传导机制的理解 | 植物激素信号传导及其在植物生长和发育中的作用 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2026-03-14 |
Phase II trial of hypomethylating agent combined with nivolumab for acute myeloid leukaemia relapse after allogeneic haematopoietic cell transplantation-Immune signature correlates with response
2023-Oct, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.19007
PMID:37539479
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研究论文 | 本研究是一项前瞻性II期临床试验,评估了低甲基化药物联合纳武利尤单抗治疗异基因造血干细胞移植后急性髓系白血病复发的疗效,并利用单细胞技术分析免疫特征与治疗反应的相关性 | 首次在异基因造血干细胞移植后复发AML患者中前瞻性评估HMA联合抗PD-1抗体纳武利尤单抗的疗效,并采用多组学单细胞技术深入解析免疫应答机制 | 单臂研究设计且样本量较小(16例患者),缺乏对照组,可能影响结果的普遍性 | 评估HMA联合纳武利尤单抗在allo-HCT后AML复发患者中的安全性和有效性,并探索免疫生物标志物 | 异基因造血干细胞移植后复发的急性髓系白血病患者 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞DNA、RNA和蛋白质多组学技术,高参数流式细胞术,单细胞转录组学 | NA | 单细胞多组学数据,临床数据 | 16例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 96 | 2026-03-14 |
Tumor-specific CD4 T cells instruct monocyte fate in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-07-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112732
PMID:37402168
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研究论文 | 本研究通过巨噬细胞命运示踪和单细胞RNA测序技术,揭示了胰腺导管腺癌中肿瘤特异性CD4 T细胞通过抗原呈递指导单核细胞分化为抗肿瘤巨噬细胞的机制 | 首次证明肿瘤特异性CD4 T细胞(而非CD8 T细胞)通过巨噬细胞的MHC II类抗原呈递,指导单核细胞分化为抗肿瘤巨噬细胞,并揭示了IFNγ和CD40信号的非冗余作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本的验证尚需进一步开展;单细胞测序样本量有限 | 探究胰腺导管腺癌中肿瘤相关巨噬细胞异质性的形成机制及免疫调控作用 | 胰腺导管腺癌小鼠模型中的单核细胞、巨噬细胞和T细胞 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,巨噬细胞命运示踪技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 97 | 2026-03-14 |
A neuroepithelial wave of BMP signalling drives anteroposterior specification of the tuberal hypothalamus
2023-02-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.83133
PMID:36718990
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研究论文 | 本研究结合实验与生物信息学方法,揭示了胚胎期结节下丘脑的渐进式生成机制,发现其由下丘脑底板样细胞产生,并受神经上皮来源的BMP信号波调控 | 首次揭示结节下丘脑由下丘脑底板样细胞渐进生成,并发现从前向后扫过的神经上皮BMP信号波驱动其前后轴特化 | 研究主要在鸡胚胎中进行,哺乳动物系统的保守性需进一步验证;信号通路的上下游调控网络尚未完全解析 | 探究中枢神经系统结节下丘脑区域在胚胎发育过程中的细胞来源与信号通路特化机制 | 鸡胚胎的结节下丘脑发育过程 | 发育生物学 | NA | 命运图谱研究、功能获得与缺失实验、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2026-03-13 |
scFED: Clustering Identifying Cell Types of scRNA-Seq Data Based on Feature Engineering Denoising
2023-Dec, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-023-00574-y
PMID:37402002
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研究论文 | 本研究提出了一种基于特征工程去噪的单细胞RNA测序数据聚类方法scFED,用于识别细胞类型 | 提出了一种结合特征工程去噪和组织特异性细胞分类参考数据库(CellMatch)的基因选择框架,通过重建方法减少噪声并放大关键信息 | 仅在四个真实单细胞数据集上进行了验证,未提及方法在更大规模或更复杂数据集上的适用性 | 提高单细胞RNA测序数据的聚类效果和细胞类型识别准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 特征工程框架 | 基因表达数据 | 四个真实单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 99 | 2026-03-13 |
Understanding cervical cancer at single-cell resolution
2023-Nov-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216408
PMID:37769795
|
综述 | 本文综述了利用单细胞测序技术解析宫颈癌生态系统异质性的最新进展 | 通过单细胞测序技术高分辨率地解析宫颈癌生态系统的演变,为靶向治疗和个性化医疗提供新视角 | NA | 深入理解宫颈癌生态系统以改善患者预后 | 宫颈癌 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 100 | 2026-03-13 |
Multi-omics analysis defines a cuproptosis-related prognostic model for ovarian cancer: Implication of WASF2 in cuproptosis resistance
2023-Nov-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2023.122081
PMID:37717621
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研究论文 | 本研究通过多组学分析构建了一个与铜死亡相关的卵巢癌预后模型,并验证了WASF2基因在铜死亡抵抗中的作用 | 首次将单细胞测序与批量转录组数据结合,构建了基于铜死亡相关基因的卵巢癌预后模型,并实验验证了WASF2在铜死亡抵抗和铂类耐药中的功能 | 研究主要基于公共数据库数据,实验验证部分可能样本量有限,需要进一步扩大临床样本验证 | 探索铜死亡相关特征在卵巢癌中的作用,构建预后预测模型 | 卵巢癌患者样本(包括单细胞和批量转录组数据) | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,基因集富集分析,随机森林建模 | 随机森林 | 单细胞测序数据,批量转录组数据,临床数据 | 单细胞数据来自GSE154600,批量数据包括TCGA的378例,GSE140082的379例和GSE53963的173例卵巢癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |