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当前共找到 5354 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-04-28 |
LRT: Integrative analysis of scRNA-seq and scTCR-seq data to investigate clonal differentiation heterogeneity
2023-07, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011300
PMID:37428794
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研究论文 | 开发LRT框架，整合单细胞RNA测序与单细胞T细胞受体测序数据，研究克隆分化异质性 | 首次提出综合计算框架LRT，整合scRNA-seq和scTCR-seq数据，揭示克隆分化轨迹异质性，弥补单一方法在T细胞克隆分析中的不足 | 研究未涉及其他免疫细胞类型或更大范围的数据验证 | 探索克隆分化轨迹异质性，提供综合分析方法 | CD8+ T细胞和CD4+ T细胞（急性淋巴性脉络丛脑膜炎病毒感染样本） | 机器学习 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | 基因表达数据, TCR序列数据 | CD8+ T细胞和CD4+ T细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 82 | 2026-04-25 |
[Single-cell transcriptome analysis reveals development atlas of mouse molar pulp cells]
2023-May-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析小鼠磨牙发育过程，构建牙髓细胞时空发育图谱 | 首次构建小鼠磨牙牙髓细胞发育的时空图谱，揭示牙髓细胞分化为成熟牙髓细胞和成牙本质细胞的两条发育轨迹 | 仅使用小鼠模型，研究时间点有限（出生后第0、3、7天） | 研究牙齿发育过程中牙髓细胞的发育过程和调控机制 | C57BL/6小鼠的十颗下颌第一磨牙（出生后第0天和第3天）及之前研究中的第7天数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 10颗小鼠下颌第一磨牙（出生后第0天和第3天各5颗） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics平台进行单细胞RNA测序 |
| 83 | 2026-04-24 |
A robust platform for integrative spatial multi-omics analysis to map immune responses to SARS-CoV-2 infection in lung tissues
2023-11, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13679
PMID:37605469
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研究论文 | 开发了一个稳健的空间多组学整合平台，用于分析SARS-CoV-2感染肺组织中的免疫反应 | 通过创新的计算映射方法，首次整合五种组织分析技术（空间转录组学Visium、GeoMx、RNAScope和蛋白质组学CODEX、PhenoImager HT），全面比较病毒感染的肺组织在不同细胞分辨率下的转录组和靶向蛋白质组 | 未在摘要中明确提及 | 理解SARS-CoV-2病毒在肺组织中的分子和细胞反应，尤其是巨噬细胞浸润及其微环境 | COVID-19感染的肺组织样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | 组织图像、转录组数据、蛋白质组数据 | 感染和未感染的肺组织样本，具体数量未说明 | 10x Genomics, NanoString, Akoya Biosciences | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | 10x Visium, GeoMx, RNAScope, CODEX, PhenoImager HT | 10x Visium用于空间转录组，GeoMx用于数字空间分析，RNAScope用于原位杂交，CODEX用于多重蛋白质成像，PhenoImager HT用于高通量成像 |
| 84 | 2026-04-23 |
Single-cell transcriptomics reveals long noncoding RNAs associated with tumor biology and the microenvironment in pancreatic cancer
2023-Dec, NAR cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/narcan/zcad055
PMID:38023733
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了胰腺导管腺癌中与肿瘤生物学和微环境相关的长链非编码RNA | 首次在单细胞分辨率下全面评估了PDAC中的lncRNA景观，揭示了在批量分析中被掩盖的、与肿瘤异质性、突变、治疗反应及肿瘤微环境相关的lncRNA | 研究主要基于转录组数据，lncRNA的功能机制仍需后续实验验证 | 探究胰腺导管腺癌中长链非编码RNA在单细胞水平上的表达特征及其与肿瘤生物学和微环境的关系 | 21名胰腺导管腺癌患者的73个多区域样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 21名患者的73个多区域样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 85 | 2026-04-23 |
High-dimensional deconstruction of pancreatic cancer identifies tumor microenvironmental and developmental stemness features that predict survival
2023-Oct-19, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-023-00455-z
PMID:37857854
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高维基因表达分析，揭示了胰腺导管腺癌肿瘤微环境的细胞状态组成、发育干性特征及其与患者生存的关联 | 首次在诊断时内镜超声引导下细针穿刺活检样本中，结合单细胞和批量RNA测序，系统描绘了PDAC的肿瘤微环境细胞群落和发育干性连续体，并发现其与预后的强相关性 | 样本量相对有限，且依赖于公开数据集进行补充；EUS-FNB样本的细胞获取量和质量可能存在变异 | 解析胰腺导管腺癌肿瘤微环境的高维特征，识别与患者生存相关的细胞状态和发育干性标志 | 胰腺导管腺癌患者组织样本，包括诊断时EUS-FNB样本和手术切除样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | Ecotyper工具（定制版） | 基因表达数据 | 单细胞RNA-seq样本80例（含25例新采集EUS-FNB样本和6例手术样本），批量RNA-seq样本268例 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 86 | 2026-04-23 |
Autologous humanized PDX modeling for immuno-oncology recapitulates features of the human tumor microenvironment
2023-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-006921
PMID:37487666
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研究论文 | 本研究开发了一种利用患者自体骨髓造血干细胞和祖细胞在MISTRG6小鼠中重建患者造血系统，并移植患者来源的异种移植组织，以建立完全基因匹配的模型来模拟个体肿瘤微环境的方法 | 开发了一种自体人源化PDX模型，利用患者自身的造血干细胞和肿瘤组织在MISTRG6小鼠中重建个体化的肿瘤微环境，克服了传统异种移植模型中的物种差异和个体间变异问题 | 模型依赖于小鼠宿主环境，可能无法完全模拟人体内所有的免疫-肿瘤相互作用；研究样本量未明确说明 | 建立一种能够更准确模拟人类肿瘤微环境并用于临床前药物测试的平台 | 实体瘤患者的骨髓造血干细胞和祖细胞以及患者来源的异种移植组织 | 肿瘤免疫学 | 实体瘤 | 单细胞转录组学 | PDX模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2026-04-22 |
ScRNA-seq revealed targeting regulator of G protein signaling 1 to mediate regulatory T cells in Hepatocellular carcinoma
2023, Cancer biomarkers : section A of Disease markers
IF:2.2Q3
DOI:10.3233/CBM-220226
PMID:36938729
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据，发现RGS1在肝细胞癌的调节性T细胞中高表达，并与不良预后相关，提示RGS1可能通过CXCR4信号通路调节Treg功能，是潜在的免疫治疗靶点 | 首次在肝细胞癌中利用单细胞RNA测序数据揭示RGS1在调节性T细胞中的特异性高表达及其与CXCR4信号通路的关联，并发现其与患者临床预后的相关性 | 研究主要基于公共数据库的生物信息学分析和免疫荧光验证，缺乏直接的体内外功能实验验证RGS1的具体调控机制 | 识别肝细胞癌中调节性T细胞的靶向基因，以改善免疫治疗效果 | 肝细胞癌患者的CD4+ T细胞，特别是调节性T细胞 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光分析，转录因子活性推断，基因共表达网络分析，生存分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据，免疫荧光图像数据 | 基于两个独立的公共单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 88 | 2026-04-20 |
A spatial human thymus cell atlas mapped to a continuous tissue axis
2023-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.25.562925
PMID:37986877
|
研究论文 | 本研究通过建立胸腺皮质-髓质连续组织轴，并结合多模态单细胞、空间转录组学和高分辨率多重成像图谱，绘制了人类胸腺的空间细胞图谱，揭示了T细胞发育的微观解剖学基础 | 建立了胸腺定量形态学新框架——皮质-髓质轴，并结合多模态空间分析，首次在单细胞分辨率上系统描绘了人类胸腺从胎儿到出生后的空间组织结构 | NA | 绘制人类胸腺的空间细胞图谱，揭示T细胞发育和胸腺上皮细胞组织的微观解剖学基础 | 人类胸腺组织（胎儿期及出生后） | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，高分辨率多重成像，单细胞分析 | NA | 空间转录组数据，成像数据，单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞分析 | NA | NA |
| 89 | 2026-04-20 |
Protocol for multi-modal single-cell RNA sequencing on M. tuberculosis-infected mouse lungs
2023-03-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102102
PMID:36853694
|
研究论文 | 本文开发了一种用于M. tuberculosis感染小鼠肺组织的多模态单细胞RNA测序协议 | 同时获取每个感染细胞的转录组、表面标志物表达和细菌表型信息 | NA | 阐明不同免疫细胞如何控制或促进M. tuberculosis感染 | M. tuberculosis感染的小鼠肺组织巨噬细胞 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多模态单细胞分析 | NA | NA |
| 90 | 2026-04-20 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals dual sensing of HIV-1 in blood Axl+ dendritic cells
2023-Feb-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106019
PMID:36866043
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了血液中Axl+树突状细胞对HIV-1的双重感知机制 | 首次在血液AxlDC亚群中发现HIV-1可诱导两种不同的广泛转录程序，分别由NF-κB和STAT1/2介导，且病毒进入途径可能决定不同的先天感知通路 | 研究主要关注血液DC亚群，未涉及其他组织或细胞类型对HIV-1的感知机制 | 探究血液树突状细胞亚群对HIV-1的感知和抗病毒反应机制 | 人类血液树突状细胞亚群（特别是AxlDC和cDC2） | 单细胞组学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2026-04-18 |
Hypercapnia alters stroma-derived Wnt production to limit β-catenin signaling and proliferation in AT2 cells
2023-02-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.159331
PMID:36626234
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研究论文 | 本研究探讨高碳酸血症如何通过改变基质细胞Wnt产生，限制AT2细胞的β-catenin信号传导和增殖，从而影响肺损伤修复 | 首次揭示高碳酸血症通过改变PDGFRα+成纤维细胞的Wnt表达，从促进转向拮抗β-catenin信号，进而限制AT2祖细胞功能 | 研究主要基于小鼠模型和体外培养，人类临床数据有限，且高碳酸血症的具体分子机制仍需进一步验证 | 探究高碳酸血症对肺损伤后修复过程的影响，特别是对肺泡II型细胞增殖和信号通路的调控 | 小鼠模型、肺泡II型细胞、PDGFRα+成纤维细胞、3D类器官培养 | 数字病理学 | 肺疾病 | 空间转录组学、细胞谱系追踪、3D培养 | 小鼠模型 | 转录组数据、空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 92 | 2026-04-18 |
Metagenomic and single-cell RNA-Seq survey of the Helicobacter pylori-infected stomach in asymptomatic individuals
2023-02-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.161042
PMID:36810249
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研究论文 | 本研究通过宏基因组测序、单细胞RNA测序等技术，深入调查了无症状幽门螺杆菌感染者胃部的宿主-微生物群环境 | 首次结合宏基因组和单细胞RNA测序全面描绘无症状幽门螺杆菌感染者胃黏膜的微生物组和免疫细胞图谱，揭示了人类胃黏膜中ILC3s的主导地位及其与特定微生物类群的相关性 | 研究主要关注无症状个体，可能无法完全反映有症状感染者的病理变化；样本来源和数量可能限制结果的普适性 | 深入表征幽门螺杆菌感染者胃部的宿主-微生物群环境，比较无症状感染者与未感染者的差异 | 人类胃组织样本，包括幽门螺杆菌感染和无症状个体 | 数字病理学 | 幽门螺杆菌感染 | 宏基因组测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 荧光显微镜 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据, 图像数据 | 未明确指定样本数量，但涉及人类胃组织样本 | NA | 宏基因组测序, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2026-04-17 |
Proteomic and single-cell landscape reveals novel pathogenic mechanisms of HBV-infected intrahepatic cholangiocarcinoma
2023-Feb-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106003
PMID:36852159
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和单细胞测序揭示了HBV感染的肝内胆管癌（ICC）的新致病机制，包括细胞间连接减少和上皮-间质转化（EMT）程序增强 | 首次结合全外显子测序、蛋白质组分析和单细胞RNA测序，系统探究HBV感染对ICC的致癌效应，发现细胞间连接水平降低与EMT程序激活的关联 | 样本量相对较小（32例HBV-ICC和89例非HBV-ICC），且为观察性研究，需进一步实验验证机制 | 探究HBV感染在肝内胆管癌（ICC）中的致癌机制和免疫微环境变化 | HBV感染的肝内胆管癌（ICC）患者和非HBV感染的ICC患者 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 全外显子测序, 蛋白质组分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 121例患者（32例HBV-ICC, 89例非HBV-ICC） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2026-04-14 |
Cerebrospinal fluid immune cells appear similar across neuropathic and non-neuropathic pain conditions
2023, Wellcome open research
DOI:10.12688/wellcomeopenres.20153.1
PMID:38707493
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研究论文 | 本研究通过分析脑脊液免疫细胞，探讨其作为神经病理性疼痛中微胶质细胞激活的替代指标的可能性 | 首次结合FACS、RNA测序和CITE测序技术，系统比较神经病理性与非神经病理性疼痛患者脑脊液免疫细胞的相似性，并挑战了脑脊液作为微胶质功能生物标志物的直接应用 | 样本量较小，且无法明确区分脑脊液蛋白质来源是循环单核细胞还是脊髓实质中的微胶质细胞 | 评估脑脊液是否可作为人类微胶质细胞激活的生物标志物，以研究神经病理性疼痛的病理机制 | 神经病理性疼痛患者（如带状疱疹后神经痛和背部手术失败后神经痛）的脑脊液免疫细胞 | NA | 神经病理性疼痛 | 荧光激活细胞分选（FACS）、RNA测序、CITE测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据 | 包括神经病理性疼痛患者及与已发表单细胞RNA测序数据的比较，具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2026-04-12 |
Deep scRNA sequencing reveals a broadly applicable Regeneration Classifier and implicates antioxidant response in corticospinal axon regeneration
2023-12-20, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.09.019
PMID:37848024
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研究论文 | 本研究通过深度单细胞RNA测序揭示了适用于多种神经元类型的再生分类器，并强调了抗氧化反应在皮质脊髓轴突再生中的关键作用 | 开发了一个广泛适用的再生分类器，能够预测不同神经元类型在发育阶段或损伤后的再生潜力，并通过条件基因删除验证了NRF2在皮质脊髓束再生中的作用 | 仅对数百个表型鉴定的神经元进行了深度测序，样本规模相对较小，可能限制了结果的普适性 | 探究中枢神经系统轴突再生的生物学机制，特别是皮质脊髓束在脊髓损伤后的再生潜力 | 皮质脊髓束神经元，特别是经过PTEN和SOCS3删除处理的再生神经元 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | 监督分类（使用Garnett） | 单细胞转录组数据 | 数百个表型鉴定的神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2026-04-12 |
Probing regenerative heterogeneity of corticospinal neurons with scRNA-Seq
2023-Feb-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2588274/v1
PMID:36865182
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探究了皮质脊髓神经元在脊髓损伤后再生能力的异质性 | 通过单细胞RNA测序技术深入分析稀有再生神经元，揭示了抗氧化反应和线粒体生物合成在皮质脊髓神经元再生中的关键作用，并开发了再生分类器用于预测不同神经元类型的再生能力 | 研究仅涉及数百个表型鉴定的皮质脊髓神经元，样本量相对较小，可能无法全面代表所有神经元亚群的再生特性 | 探究皮质脊髓神经元在脊髓损伤后再生能力的异质性及其分子机制 | 皮质脊髓神经元 | 单细胞测序 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | 监督分类方法（Garnett） | 单细胞RNA测序数据 | 数百个表型鉴定的皮质脊髓神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 97 | 2026-04-11 |
Transcription factor NFYa controls cardiomyocyte metabolism and proliferation during mouse fetal heart development
2023-12-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.10.012
PMID:37972593
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子NFYa在小鼠胎儿心脏发育过程中调控心肌细胞代谢和增殖的作用 | 揭示了NFYa通过与辅因子SP2相互作用，在转录水平激活连接代谢和增殖的基因，这是先前未被识别的心脏代谢转录调控机制 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类，且未深入探讨NFYa在成年心脏再生中的具体作用 | 探究NFYa在协调心肌细胞代谢和增殖中的机制，以理解胎儿心脏发育和再生的调控 | 小鼠胎儿心脏中的心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组分析，单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 98 | 2026-04-11 |
Universal recording of cell-cell contacts in vivo for interaction-based transcriptomics
2023-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.533003
PMID:36993443
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研究论文 | 本文介绍了一种通用版本的LIPSTIC技术（uLIPSTIC），用于在体内记录细胞间物理相互作用，并结合单细胞转录组学分析免疫细胞与非免疫细胞间的互作网络 | 开发了不依赖于特定受体-配体对的通用细胞间接触记录技术，扩展了原LIPSTIC技术的应用范围 | 未明确说明技术灵敏度或可能存在的假阳性/假阴性问题 | 开发通用技术以研究免疫细胞与非免疫细胞间的瞬时物理相互作用 | 免疫细胞（CD8 T细胞、调节性T细胞、滤泡辅助T细胞）与肠道上皮细胞等非免疫细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 99 | 2026-04-11 |
Targeting Immune-Fibroblast Crosstalk in Myocardial Infarction and Cardiac Fibrosis
2023-Jan-26, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2402606/v1
PMID:36747878
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研究论文 | 本研究通过多组学单细胞分析揭示了人类心肌梗死和心脏纤维化中免疫-成纤维细胞交互作用的分子机制 | 首次在人类心脏疾病中系统探索免疫-成纤维细胞交互的分子机制，并识别出由IL-1β信号驱动的促纤维化成纤维细胞亚群 | 样本量相对有限（38名捐赠者），且动物模型与人类疾病表型的完全重现性仍有待验证 | 探究心肌梗死和心脏纤维化中免疫细胞与成纤维细胞之间的交互作用机制 | 人类心脏组织（急性梗死和慢性衰竭心脏）以及小鼠心脏损伤模型 | 单细胞多组学 | 心血管疾病 | 单细胞基因表达分析、表位映射、染色质可及性分析、空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据、空间转录组数据 | 38名捐赠者的人类心脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 100 | 2026-04-09 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing data identifies the characteristics of ferroptosis in lumbar disc herniation
2023-Sep-01, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01216-8
PMID:37653201
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，识别了腰椎间盘突出症中铁死亡的特征，并发现MYB基因可能是一个潜在的治疗靶点 | 首次将单细胞RNA测序与bulk RNA测序数据整合分析，用于研究腰椎间盘突出症中的铁死亡特征，并揭示了MYB基因在疾病中的关键作用及与免疫细胞的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仅通过RT-qPCR确认了标志基因的功能，缺乏更深入的体内外功能实验验证 | 阐明铁死亡在腰椎间盘突出症发病机制中的具体作用，并寻找潜在的治疗靶点 | 腰椎间盘突出症患者的转录组数据集和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 腰椎间盘突出症 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, RT-qPCR, 生物信息学分析 | LASSO, SVM-RFE, CIBERSORT, AUCell | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |