单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5354 篇文献，本页显示第 921 - 940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2024-08-07 |
Renin Cell Development: Insights From Chromatin Accessibility and Single-Cell Transcriptomics
2023-08-04, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.322827
PMID:37395102
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 922 | 2024-08-07 |
NNMT enriches for AQP5+ cancer stem cells to drive malignant progression in early gastric cardia adenocarcinoma
2023-12-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2022-328408
PMID:36977555
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索早期胃食管腺癌（EGCA）的细胞和分子异质性 | 本研究首次揭示了NNMT+/AQP5+细胞群在EGCA恶性进展中的作用，并提出了可能的早期诊断和治疗策略 | NA | 深入理解早期胃食管腺癌的异质性及其恶性进展机制 | 早期胃食管腺癌及其配对的非恶性活检样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 95,551个细胞 |
| 923 | 2024-08-07 |
Tff2 defines transit-amplifying pancreatic acinar progenitors that lack regenerative potential and are protective against Kras-driven carcinogenesis
2023-08-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.07.002
PMID:37541213
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研究论文 | 研究通过长期谱系追踪和单细胞RNA测序分析，揭示了表达Tff2的胰腺腺泡前体细胞在正常稳态中的作用及其在Kras驱动的癌变中的保护作用 | 首次定义了表达Tff2的胰腺腺泡过渡放大前体细胞（TAP），并揭示其在Kras驱动的癌变中的保护作用 | NA | 探讨胰腺腺泡前体细胞在正常稳态及癌变过程中的作用 | 表达Tff2的胰腺腺泡前体细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 924 | 2024-08-04 |
Molecular and immune signatures, and pathological trajectories of fatal COVID-19 lungs defined by in situ spatial single-cell transcriptome analysis
2023-08, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29009
PMID:37563850
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研究论文 | 本研究通过原位测序分析了COVID-19死亡患者肺部的单细胞分子和细胞特征 | 首次建立了COVID-19肺部细胞和分子特征的空间单细胞图谱 | 仅针对死后肺组织进行研究，可能无法全面代表所有COVID-19患者的肺部病理 | 旨在定义COVID-19肺部的分子和免疫特征及病理轨迹 | 研究对象为COVID-19死亡患者的肺部组织样本 | 数字病理学 | 肺炎COVID-19 | 原位测序（ISS） | 稀疏非负矩阵分解（SNMF） | 转录组数据 | 研究中涉及221个基因，分析了1719459个细胞 |
| 925 | 2024-08-04 |
The progenitor basis of cortical projection neuron diversity
2023-08, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2023.102726
PMID:37148649
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研究论文 | 本研究探讨了不同类型的神经祖细胞如何产生皮层投射神经元的多样性。 | 创新点在于通过细胞类型解析的追踪方法来理解神经祖细胞在投射神经元多样性中的作用。 | 目前关于中间祖细胞在投射神经元多样性中的角色仍然研究不足。 | 研究神经祖细胞如何产生皮层投射神经元的多样性和层级组织。 | 主要研究对象为辐射胶质细胞和中间祖细胞。 | 神经科学 | NA | 细胞类型解析遗传命运追踪，轴突追踪，空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 926 | 2024-08-05 |
Protective Renalase Deficiency in β-Cells Shapes Immune Metabolism and Function in Autoimmune Diabetes
2023-08-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0030
PMID:37216639
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研究论文 | 本文探讨了肾素缺乏如何影响自身免疫糖尿病中β细胞的免疫代谢和功能 | 首次揭示了肾素缺乏在移植的β细胞中调节局部免疫细胞代谢和功能的能力 | 研究仅在小鼠模型中进行，缺乏对人类适用性的验证 | 本研究旨在了解肾素缺乏对自身免疫糖尿病中β细胞的影响 | 主要研究对象为小鼠模型中的β细胞和浸润的免疫细胞 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 细胞 | NA |
| 927 | 2024-08-05 |
Ezh2 Knockout in B Cells Impairs Plasmablast Differentiation and Ameliorates Lupus-like Disease in MRL/lpr Mice
2023-08, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42492
PMID:36897808
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研究论文 | 本研究评估了EZH2在B细胞中的表达对狼疮病理机制的影响 | 首次揭示EZH2缺失对浆细胞发育和狼疮样疾病的改善效果 | 研究主要集中在小鼠模型，临床相关性尚需进一步验证 | 评估EZH2在B细胞中的角色及其与狼疮发病机制的关系 | MRL/lpr小鼠模型中的B细胞和人类狼疮患者的B细胞 | 数字病理 | 狼疮 | 单细胞RNA测序 | 鼠模型 | 细胞类型数据 | 小鼠模型和人类狼疮患者的多样本 |
| 928 | 2024-08-05 |
Stimulation of Immune Checkpoint Molecule B and T-Lymphocyte Attenuator Alleviates Experimental Crescentic Glomerulonephritis
2023-08-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000159
PMID:37367205
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研究论文 | 这篇文章探讨了免疫检查点分子BTLA在实验性新月型肾小管肾炎中的作用 | 这项研究首次揭示BTLA在新月型肾小管肾炎中的保护作用和抗体治疗的潜力 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能在临床应用中存在差异 | 研究BTLA在新月型肾小管肾炎中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | BTLA缺陷小鼠和野生型小鼠的实验 | 免疫学 | 肾炎 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 生物样本（小鼠模型） | 使用BTLA缺陷小鼠和野生型小鼠进行实验，但具体样本量未提及 |
| 929 | 2024-08-05 |
Distinct Inflammatory Milieu in Patients With Right Heart Failure
2023-08, Circulation. Heart failure
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研究论文 | 这项研究探讨了右心衰竭患者的循环炎症环境 | 识别了可预测患者预后的新生物标志物soluble CD163和CXCL12 | 样本数量较小，且需进一步研究这些分子如何影响心衰表现和疾病进展 | 了解右心衰竭与肝脏相互作用的机制 | 包括正常心脏功能的对照组和满足右心衰竭标准的心衰患者 | 数字病理学 | 心衰 | 多重蛋白检测和单细胞RNA测序 | NA | 血液样本和组织成像 | 三组患者的血液样本，具体数量未说明 |
| 930 | 2024-08-05 |
Spatially patterned 3D model mimics key features of cancer metastasis to bone
2023-08, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本文报道了空间模式化的组织工程3D模型，模仿乳腺癌和前列腺癌骨转移的关键特征 | 提出了一种空间模式化的3D骨转移模型，可以模拟骨特异性侵袭和癌症对骨重塑的诱导性失调 | 缺乏对这些模型的广泛验证和应用研究 | 填补缺乏生理相关的体外模型的空白，探索骨转移的生物学 | 乳腺癌和前列腺癌的骨转移 | 数字病理学 | 乳腺癌和前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 3D模型 | NA | NA |
| 931 | 2024-08-05 |
Characterization of altered molecular mechanisms in Parkinson's disease through cell type-resolved multiomics analyses
2023-04-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo2467
PMID:37058563
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研究论文 | 通过细胞类型解析的多组学分析，揭示帕金森病中改变的分子机制。 | 首次通过多组学数据整合提供了细胞类型特异性的cREs失调及其对帕金森病相关基因的转录影响。 | 未具体讨论其他神经退行性疾病的相关性及其影响。 | 研究帕金森病的细胞类型依赖性转录调控机制。 | 健康对照者和帕金森病患者的113,207个细胞核样本。 | 数字病理学 | 帕金森病 | 转录组学和表观基因组学 | NA | 单细胞转录组和表观基因组数据 | 113,207个细胞核 |
| 932 | 2024-08-04 |
A Universal Method for Crossing Molecular and Atlas Modalities using Simplex-Based Image Varifolds and Quadratic Programming
2023-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.28.534622
PMID:37034802
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研究论文 | 本文阐明了一种在分子尺度转录组学和组织尺度图谱之间建立对应关系的解决方案 | 提出了一种通用算法，通过交替优化LDDMM和二次规划方法，解决坐标和潜在转录特征分数的最小化几何形状的变换 | NA | 研究目的在于结合分子和细胞数据，创建一个统一的坐标系统 | 主要涉及分子尺度转录组学数据和组织尺度图谱数据 | 数字病理学 | NA | LDDMM优化与二次规划 | NA | 转录组学数据 | NA |
| 933 | 2024-08-05 |
DUSP6 mediates resistance to JAK2 inhibition and drives leukemic progression
2023-01, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-022-00486-8
PMID:36581736
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研究论文 | 本研究揭示DUSP6在髓系恶性肿瘤转化中的作用及其作为潜在治疗靶点的价值 | 发现DUSP6的异常表达与疾病转化相关，且DUSP6-RSK1通路可作为药物靶点 | 未详细探讨DUSP6在不同患者中的具体作用机制 | 探索DUSP6在髓系恶性肿瘤和急性髓性白血病转化中的角色 | 靶向DUSP6 的治疗效果及其在患者衍生的异种移植模型中的作用 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | PDX模型 | 基因表达数据 | 多名患者的骨髓干细胞和祖细胞 |
| 934 | 2024-08-04 |
Epicardioid single-cell genomics uncovers principles of human epicardium biology in heart development and disease
2023-Dec, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01718-7
PMID:37012447
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研究论文 | 这篇论文探讨了人类心包生物学在心脏发育和疾病中的原则 | 该研究首次生成了具有自我组织能力的人类多能干细胞衍生的心包内体，揭示了心包和心肌的形态、分子和功能模式 | 该研究未明确提及限制因素 | 了解心包在心脏发育和疾病过程中的功能及其机制 | 研究对象为人类胚胎发育中心包细胞系和心肌细胞类型 | 数字病理学 | 先天性疾病 | 单细胞转录组学 | 自我组织体 | NA | NA |
| 935 | 2024-08-04 |
SEACells infers transcriptional and epigenomic cellular states from single-cell genomics data
2023-Dec, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01716-9
PMID:36973557
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研究论文 | 本文提出了一种算法SEACells，用于从单细胞基因组数据推断转录组和表观基因组细胞状态 | SEACells通过克服单细胞数据的稀疏性，识别细胞状态的分类，而保留传统细胞聚类所掩盖的异质性 | NA | 探索单细胞数据的细胞状态及其在相关疾病研究中的应用 | 单细胞基因组数据中的细胞状态 | 计算生物学 | COVID-19 | 单细胞测序 | 聚类算法 | 基因组数据 | 分析了多个数据集中的单细胞样本，包括COVID-19患者队列 |
| 936 | 2024-08-05 |
Multimodal spatiotemporal phenotyping of human retinal organoid development
2023-Dec, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01747-2
PMID:37156914
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研究论文 | 本研究生成了人类视网膜类器官发展的多模态时空表型 | 开发了一种工具包，用于可视化前体细胞和神经元的位置以及细胞外和亚细胞组分的空间排列 | 缺乏不同空间尺度和分子模式的定量测量 | 研究人类视网膜类器官的发育和疾病 | 人类多能干细胞生成的视网膜类器官和主要成年的视网膜组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 基因组数据和空间分割的细胞核数据 | 时间序列数据集和主要成人视网膜组织 |
| 937 | 2024-08-04 |
IL-33 Expression Is Lower in Current Smokers at both Transcriptomic and Protein Levels
2023-11-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202210-1881OC
PMID:37708400
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研究论文 | 这项研究探讨吸烟状态对IL-33表达的影响。 | 本研究首次显示吸烟会导致IL-33在转录组和蛋白水平上的减少，特别是在当前吸烟者中。 | 研究主要集中在COPD患者身上，可能不适用于其他疾病。 | 了解吸烟状态如何影响IL-33的表达情况。 | 研究对象为肺气道中的IL-33表达水平和吸烟状态。 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | RNA-seq, 西方印迹分析, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 生物组织样本 | 涉及八个独立的转录组研究和来自COPD患者的肺组织样本 |
| 938 | 2024-08-04 |
Spatiotemporal mapping of immune and stem cell dysregulation after volumetric muscle loss
2023-04-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.162835
PMID:36821376
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研究论文 | 本研究探讨了体积肌肉损失后免疫细胞和干细胞失调的时空分布 | 创新点在于使用空间转录组学揭示了在VML反应中纤维化与炎性巨噬细胞与间充质来源细胞之间的细胞间相互作用 | 未提及具体的限制 | 研究体积肌肉损失后细胞间的通讯及其对肌肉修复的影响 | 以小鼠模型为对象，研究VML后的细胞行为 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 小鼠模型 | NA | NA |
| 939 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals unique monocyte-derived interstitial macrophage subsets during lipopolysaccharide-induced acute lung inflammation
2023-04-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00223.2022
PMID:36852927
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研究论文 | 本研究揭示了在脂多糖诱导的急性肺炎症期间独特的单核细胞源间质巨噬细胞亚群 | 研究深入探讨了间质巨噬细胞的起源、亚群及转录组特征，并提出了其特定功能的可能性 | 缺乏对IMs在不同类型炎症中的作用的全面理解 | 特征化间质巨噬细胞在稳态和急性肺炎症中的起源及亚群 | 研究对象为小鼠肺中的间质巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 使用了小鼠模型及其肺组织样本 |
| 940 | 2024-08-05 |
A comprehensive assessment of hurdle and zero-inflated models for single cell RNA-sequencing analysis
2023-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad272
PMID:37507115
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研究论文 | 本文全面评估了单细胞RNA测序分析中的障碍和零膨胀模型 | 提出了一个基于TensorFlow的Python包TensorZINB，解决了零膨胀负二项式模型的数值稳定性问题，并结合了混合模型来提高性能 | 未提及特定的局限性 | 提高单细胞RNA测序数据分析中的统计模型的准确性和计算速度 | 障碍和零膨胀模型的性能评估及其对单细胞RNA测序数据的应用 | 数字病理 | NA | RNA-seq | 零膨胀负二项式（ZINB）模型 | 文本 | 使用真实的单细胞RNA测序数据集进行评估 |