单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5354 篇文献，本页显示第 901 - 920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2024-08-14 |
First-in-human clinical trial of personalized neoantigen vaccines as early intervention in untreated patients with lymphoplasmacytic lymphoma
2023-Sep-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3315017/v1
PMID:37790486
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临床试验 | 本文报道了一项针对淋巴浆细胞性淋巴瘤（LPL）患者的个性化新抗原疫苗的首次人体临床试验，旨在早期干预未治疗的患者 | 该研究首次在人体中测试了一种新型治疗性DNA异型新抗原疫苗，并观察到疫苗对肿瘤免疫微环境的积极影响 | 研究样本量较小，且未探讨与其他治疗策略的联合应用 | 评估个性化新抗原疫苗在未治疗淋巴浆细胞性淋巴瘤患者中的安全性和有效性 | 淋巴浆细胞性淋巴瘤患者 | NA | 淋巴瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 9名患者 |
| 902 | 2024-08-14 |
Spatial Transcriptomic Cell-type Deconvolution Using Graph Neural Networks
2023-Jun-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.10.532112
PMID:37333198
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研究论文 | 本文介绍了一种基于图神经网络的细胞类型反卷积模型STdGCN，用于空间转录组数据的细胞类型解析 | STdGCN是首个结合单细胞RNA测序数据表达谱和空间转录组数据空间定位信息进行细胞类型反卷积的模型 | NA | 开发一种新的方法来解析空间转录组数据中的细胞类型 | 空间转录组数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 转录组数据 | 多个空间转录组数据集，包括人类乳腺癌Visium数据集和人类心脏空间转录组数据集 |
| 903 | 2024-08-14 |
Early Deregulation of Cholangiocyte NR0B2 During Primary Sclerosing Cholangitis
2023, Gastro hep advances
DOI:10.1016/j.gastha.2022.07.023
PMID:39130146
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研究论文 | 本文通过PubMed数据挖掘，研究了原发性硬化性胆管炎（PSC）中胆管细胞NR0B2的早期失调，并探讨了其与代谢和癌前重编程的关系。 | 首次揭示了PSC中胆管细胞NR0B2的早期失调及其在代谢和癌前重编程中的作用，并提出了针对NR0B2的治疗策略。 | NA | 研究PSC中胆管细胞NR0B2的早期失调及其在疾病进展中的作用。 | 胆管细胞NR0B2的表达及其在PSC中的作用。 | NA | 原发性硬化性胆管炎 | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个PSC肝脏转录组训练和验证队列，FXR激动剂或FXR敲除小鼠肝脏转录组，Abcb4-/-小鼠PSC模型肝脏单细胞转录组。 |
| 904 | 2024-08-13 |
Early transcriptomic signatures and biomarkers of renal damage due to prolonged exposure to embedded metal
2023-12, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-023-09806-9
PMID:37058270
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研究论文 | 本文研究了长期暴露于嵌入金属导致的肾脏损伤的早期转录组特征和生物标志物 | 结合高通量转录组学和深度学习技术，有效识别受金属暴露影响的肾细胞，并发现miRNA-423作为早期系统性标志物 | NA | 研究长期暴露于有毒重金属导致的肾脏损伤的早期分子特征 | 肾脏组织和血清样本中的RNA | 数字病理学 | 肾脏损伤 | RNA测序 | 随机森林 | RNA | 使用大鼠模型进行实验 |
| 905 | 2024-08-13 |
Hyperhomocysteinemia lowers serum testosterone concentration via impairing testosterone production in Leydig cells
2023-12, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-023-09819-4
PMID:37495868
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研究论文 | 研究报告了高同型半胱氨酸血症（HHcy）通过影响睾丸间质细胞（LCs）中的睾酮生成，导致血清睾酮水平降低 | 首次揭示了HHcy通过下调关键转录因子Nr5a1及其相关基因，影响睾酮合成，并发现了新的细胞群——巨噬细胞样睾丸间质细胞（McLCs） | NA | 探讨高同型半胱氨酸血症对睾酮生成的影响及其机制 | 高同型半胱氨酸血症小鼠的睾丸间质细胞 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 高同型半胱氨酸血症小鼠 |
| 906 | 2024-08-13 |
Trps1 acts as a regulator of Sf-1 transcription and testosterone synthesis in mouse Leydig cells
2023-12, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-023-09823-8
PMID:37531013
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研究论文 | 本研究探讨了Trps1基因在小鼠Leydig细胞中对睾酮合成的影响及其机制 | 首次揭示了Trps1通过调节Sf-1转录和组蛋白乙酰化影响睾酮合成 | NA | 探索睾酮生物合成中的关键因素，为疾病研究和临床治疗提供新视角 | 小鼠Leydig细胞中的Trps1基因及其对睾酮合成的影响 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序分析 | NA | RNA | 小鼠Leydig细胞 |
| 907 | 2024-08-13 |
Single-cell RNA sequencing reveals differences between force application and bearing in ankle cartilage
2023-12, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-023-09829-2
PMID:37783808
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了踝关节软骨在不同受力条件下的差异 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了踝关节软骨在受力和承力区域的分子差异 | 样本来自因致命事故死亡的捐赠者，可能影响结果的普遍性 | 深入了解软骨细胞在不同受力条件下的功能 | 踝关节软骨组织中的软骨细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 共分析了149,816个细胞，来自6名捐赠者的11个软骨组织样本 |
| 908 | 2024-08-12 |
Defining the cellular complexity of the zebrafish bipotential gonad
2023-Nov-15, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioad096
PMID:37561446
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研究论文 | 本文利用转基因报告基因和单细胞测序分析技术，研究了斑马鱼幼体性腺中不同关键细胞类型的到达情况，揭示了性腺发育过程中的细胞复杂交互作用。 | 首次详细描述了斑马鱼性腺发育过程中血管和淋巴管的并发发展，以及卵巢中pdgfrb+周细胞在血管生成中的作用，并发现了卵巢周细胞特有的基因表达特征。 | NA | 旨在深入理解斑马鱼性腺早期双潜能发育过程中的基本步骤和细胞交互作用。 | 斑马鱼性腺发育过程中的血管内皮细胞、周细胞和巨噬细胞的到达及其在性腺生长和分化中的作用。 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 215个特异表达基因 |
| 909 | 2024-08-11 |
Age-dependent Microglial Disease Phenotype Results in Functional Decline in Gut Macrophages
2023, Gastro hep advances
DOI:10.1016/j.gastha.2022.09.006
PMID:36908772
|
研究论文 | 研究探讨了年龄依赖性的肌肉层巨噬细胞（MMs）的遗传特征变化及其与微胶质细胞的比较 | 首次揭示了肌肉层巨噬细胞随年龄增长而出现的老年状态表型，及其与微胶质细胞疾病相关表型的相似性 | 研究主要集中在小鼠和人类组织上，可能需要更多物种的数据支持 | 识别肌肉层巨噬细胞在年龄依赖性变化中的遗传特征，并比较其与微胶质细胞的基因表达 | 小鼠和人类的肌肉层巨噬细胞及其基因表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序和定量实时PCR | NA | 基因表达数据 | 年轻（3个月）和老年（16-24个月）的C57BL/6小鼠及人类组织 |
| 910 | 2024-08-10 |
Classic genetic and hormonal switches during fetal sex development and beyond
2023-Sep, Medizinische Genetik : Mitteilungsblatt des Berufsverbandes Medizinische Genetik e.V
IF:0.8Q4
DOI:10.1515/medgen-2023-2036
PMID:38840820
|
研究论文 | 本文探讨了人类胎儿性别发育过程中的关键遗传和激素开关，以及这些开关如何决定性腺性别确定和后续的生殖和体细胞性别表型的分化 | 文章指出传统的性别发育模型是不充分的，并介绍了在特定突变情况下，这些开关可能表现出不同的功能，导致基因功能和剂量的连续变化，酶活性，性激素水平和敏感性的变化，从而产生广泛的生物性别发育差异（DSD）和潜在的生殖和体细胞性别表型的多样性 | NA | 探讨人类胎儿性别发育过程中的遗传和激素开关的作用 | 人类胎儿性别发育过程中的遗传和激素开关 | NA | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 911 | 2024-08-10 |
Hypoxic niches attract and sequester tumor-associated macrophages and cytotoxic T cells and reprogram them for immunosuppression
2023-08-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.06.017
PMID:37451265
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研究论文 | 本文研究了胶质母细胞瘤（GBM）中肿瘤相关骨髓细胞（TAMs）和细胞毒性T淋巴细胞（CTLs）在低氧微环境中的分布及功能重编程 | 首次揭示了低氧微环境吸引并隔离TAMs和CTLs，并使其向免疫抑制状态重编程的机制 | NA | 探讨胶质母细胞瘤中免疫抑制的机制 | 肿瘤相关骨髓细胞（TAMs）和细胞毒性T淋巴细胞（CTLs） | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 912 | 2024-08-10 |
Reference-free and cost-effective automated cell type annotation with GPT-4 in single-cell RNA-seq analysis
2023-May-02, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2824971/v1
PMID:37205379
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研究论文 | 本文展示了GPT-4这一强大的大型语言模型在单细胞RNA测序分析中自动准确地进行细胞类型注释的能力 | GPT-4无需高质量参考数据集和额外开发流程，能利用标准单细胞RNA测序分析流程生成的标记基因信息自动注释细胞类型 | NA | 探索在单细胞RNA测序分析中自动进行细胞类型注释的新方法 | 单细胞RNA测序分析中的细胞类型注释 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | GPT-4 | 文本 | 数百种组织类型和细胞类型 |
| 913 | 2024-08-07 |
Single-cell and Spatial Transcriptomics Clustering with an Optimized Adaptive K-Nearest Neighbor Graph
2023-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.13.562261
PMID:37905097
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研究论文 | 本文开发了一种名为aKNNO的方法，通过优化的自适应k近邻图同时识别丰富和稀有细胞类型 | aKNNO方法能够在不牺牲丰富细胞类型聚类性能的情况下，准确发现已知和新的稀有细胞类型 | NA | 开发一种新的方法来同时识别单细胞和空间转录组学数据中的丰富和稀有细胞类型 | 单细胞和空间转录组学数据中的细胞类型 | 单细胞测序 | NA | 单细胞和空间转录组学 | 自适应k近邻图 | 转录组数据 | 38个模拟数据集和20个单细胞及空间转录组学数据集 |
| 914 | 2024-08-07 |
A lipid-associated macrophage lineage rewires the spatial landscape of adipose tissue in early obesity
2023-10-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.171701
PMID:37651193
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和成像技术，探讨了小鼠饮食诱导肥胖过程中脂肪组织巨噬细胞（ATM）的动态变化及其与代谢疾病发展的关系 | 首次将单细胞RNA测序与空间转录组学结合，揭示了肥胖早期脂肪组织中脂质相关巨噬细胞（LAM）前体（pre-LAM）的空间分布及其与脂肪组织功能障碍标志物的共定位 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来研究需要验证这些发现是否适用于人类 | 深入理解肥胖过程中脂肪组织巨噬细胞的多样性及其在代谢疾病发展中的作用 | 脂肪组织巨噬细胞及其在肥胖过程中的动态变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据、图像数据 | 小鼠模型 |
| 915 | 2024-08-07 |
Mild/asymptomatic COVID-19 in unvaccinated pregnant mothers impairs neonatal immune responses
2023-09-12, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172658
PMID:37698937
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研究论文 | 研究分析了未接种疫苗的孕妇在孕期经历轻度或无症状COVID-19感染后，新生儿脐带血和绒毛膜绒毛的免疫细胞组成变化 | 首次详细探讨了轻度或无症状孕妇COVID-19感染对新生儿免疫反应的影响，包括免疫细胞的重编程和功能状态的改变 | 研究主要集中在脐带血和绒毛膜绒毛的免疫细胞分析，未涉及其他可能的影响因素 | 探讨孕妇轻度或无症状COVID-19感染对新生儿免疫系统的影响 | 未接种疫苗的孕妇及其新生儿 | NA | COVID-19 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，体外刺激试验 | NA | 细胞 | 多个新生儿的脐带血和绒毛膜绒毛样本 |
| 916 | 2024-08-07 |
Targeting m6A reader YTHDF1 augments antitumour immunity and boosts anti-PD-1 efficacy in colorectal cancer
2023-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2022-328845
PMID:36717220
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研究论文 | 本文研究了m6A阅读蛋白YTHDF1在结直肠癌免疫微环境中的作用及其机制 | 首次揭示了YTHDF1通过m6A-p65-CXCL1/CXCR2轴影响结直肠癌的免疫微环境，并增强抗PD-1疗法的效果 | NA | 阐明YTHDF1在结直肠癌免疫微环境中的功能和机制 | YTHDF1在结直肠癌中的表达及其对免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、甲基化RNA免疫沉淀测序（MeRIP-seq）、RNA测序（RNA-seq）和核糖体测序（Ribo-seq） | NA | 组织微阵列、TCGA数据集 | 组织微阵列（N=408）、TCGA数据集（N=526） |
| 917 | 2024-08-07 |
Isoformic PD-1-mediated immunosuppression underlies resistance to PD-1 blockade in hepatocellular carcinoma patients
2023-Aug, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2022-327133
PMID:36450387
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研究论文 | 本文探讨了程序性细胞死亡蛋白1（PD-1）的同种型Δ42PD-1在肝细胞癌（HCC）进展和对抗PD-1免疫检查点阻断（ICB）耐药性中的作用 | 发现了Δ42PD-1同种型在HCC患者中对抗PD-1 ICB耐药性的机制，并验证了针对Δ42PD-1的单克隆抗体在HCC免疫治疗中的效用 | NA | 阐明HCC患者对抗PD-1 ICB耐药性的机制，并探索新的免疫治疗策略 | 74名HCC患者，包括未治疗、接受nivolumab治疗和接受pembrolizumab治疗的患者 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液样本和肿瘤组织中的外周血单个核细胞及肿瘤浸润淋巴细胞 | 74名HCC患者 |
| 918 | 2024-08-07 |
An integrated single-cell analysis of human adrenal cortex development
2023-07-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.168177
PMID:37440461
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研究论文 | 本文通过结合单细胞和批量RNA测序、空间转录组学、免疫组化及微焦点计算机断层扫描技术，研究了人类肾上腺皮质在前20周妊娠期的发展关键方面 | 首次展示了肾上腺快速生长和血管化，以及外层确定区（DZ）中细胞分裂的增加，同时揭示了皮质醇和醛固酮合成能力随时间发展的机制 | NA | 探究人类肾上腺皮质在妊娠早期的发育过程 | 人类肾上腺皮质发育 | NA | 肾上腺疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, 微焦点计算机断层扫描 | NA | RNA序列 | 前20周妊娠期的人类肾上腺样本 |
| 919 | 2024-08-07 |
Delayed boosting improves human antigen-specific Ig and B cell responses to the RH5.1/AS01B malaria vaccine
2023-01-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.163859
PMID:36692019
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研究论文 | 研究通过延迟分次剂量（DFx）给药方案（0-1-6个月），使用AS01B佐剂的RH5.1疟疾抗原，深入分析了PfRH5特异性Ig和B细胞反应，发现DFx给药能增加循环中PfRH5特异性B细胞和血清IgG1的数量和持久性 | 首次揭示了DFx给药对体液反应的深远影响，并提出了可能增强抗体持久性的机制，包括血清Ig通过改善FcRn结合和潜在的细胞反应从循环短命浆细胞向非外周长命浆细胞的转变 | NA | 研究疫苗递送方式的改进如何增加血清抗体持久性，以最大化疫苗效力 | PfRH5特异性Ig和B细胞反应 | 免疫学 | 疟疾 | ELISA, 流式细胞术, 系统血清学, 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 血清, 细胞 | NA |
| 920 | 2024-08-07 |
Dry eye disease in mice activates adaptive corneal epithelial regeneration distinct from constitutive renewal in homeostasis
2023-01-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2204134120
PMID:36595669
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠角膜上皮在稳态、老化、糖尿病和干眼病（DED）状态下的转录状态，揭示了DED中角膜上皮适应性再生的独特响应。 | 本研究首次提供了区分稳态更新与适应性再生的全局标记，并验证了SPARC作为适应性再生标记的表达，加速了角膜上皮细胞的伤口闭合。 | NA | 探索干眼病状态下角膜上皮的适应性再生机制，并为未来研究眼部表面干细胞在健康和疾病中的功能提供框架和图谱。 | 小鼠角膜上皮细胞在不同生理和病理状态下的转录状态。 | 数字病理学 | 干眼病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |