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当前共找到 5350 篇文献，本页显示第 881 - 900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2024-10-13 |
Thalamocortical control of cell-type specificity drives circuits for processing whisker-related information in mouse barrel cortex
2023-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41749-x
PMID:37770450
|
研究论文 | 研究了小鼠体感皮层中棘星形神经元和锥体神经元在处理胡须诱发信号中的不同作用 | 通过空间转录组学技术，识别了与细胞类型相关的基因表达模式，并揭示了这些模式与特定丘脑输入在发育过程中的关联 | NA | 探讨棘星形神经元在处理特定胡须信号和形成特定胡须相关皮层回路中的作用 | 小鼠体感皮层中的棘星形神经元和锥体神经元 | 神经科学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠体感皮层样本 | NA | NA | NA | NA |
| 882 | 2024-10-13 |
scBridge embraces cell heterogeneity in single-cell RNA-seq and ATAC-seq data integration
2023-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41795-5
PMID:37770437
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scBridge的多组学数据整合方法，通过利用细胞异质性来提高单细胞RNA测序和ATAC测序数据的整合效果 | 本文创新性地利用细胞异质性来改善多组学数据整合，而不是将其视为干扰因素 | NA | 研究如何通过利用细胞异质性来提高单细胞多组学数据的整合效果 | 单细胞RNA测序和ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 基因组数据 | 七个多组学数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 883 | 2024-10-13 |
Spatial transcriptomics: recent developments and insights in respiratory research
2023-08-17, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-023-00471-x
PMID:37592342
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在呼吸系统研究中的最新进展及其应用 | 空间转录组学填补了传统RNA测序方法在空间定位和细胞相互作用方面的空白 | 当前挑战包括高通量全长转录组、多组学整合、时空组学和生物信息学分析等 | 探讨空间转录组学在呼吸系统生理和病理过程中的应用 | 呼吸系统的细胞异质性和空间定位 | 空间转录组学 | 呼吸系统疾病 | 空间转录组学 (ST) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 884 | 2024-10-13 |
Cell-type-specific co-expression inference from single cell RNA-sequencing data
2023-08-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40503-7
PMID:37563115
|
研究论文 | 本文提出了一种名为CS-CORE的统计方法，用于从单细胞RNA测序数据中推断特定细胞类型的共表达关系 | CS-CORE方法明确地建模了单细胞RNA测序数据中的测序深度变化和测量误差，解决了现有方法在这方面的不足 | NA | 旨在改进从单细胞RNA测序数据中推断特定细胞类型共表达关系的方法 | 单细胞RNA测序数据中的特定细胞类型共表达关系 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | RNA测序数据 | 包括阿尔茨海默病和COVID-19患者的脑组织和血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 885 | 2024-10-13 |
Macrophage-organoid co-culture model for identifying treatment strategies against macrophage-related gemcitabine resistance
2023-Aug-09, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02756-4
PMID:37553567
|
研究论文 | 研究通过巨噬细胞与肿瘤类器官共培养模型，揭示了巨噬细胞介导的吉西他滨耐药机制，并提出了新的治疗策略 | 首次揭示了巨噬细胞-CCL5-Sp1-AREG反馈环在吉西他滨耐药中的作用，并验证了靶向该反馈环的药物组合在胰腺癌治疗中的潜力 | 研究主要基于体外模型和动物模型，临床应用的有效性和安全性仍需进一步验证 | 揭示巨噬细胞在胰腺癌吉西他滨耐药中的作用机制，并开发新的治疗策略 | 胰腺癌患者来源的类器官、巨噬细胞、胰腺癌细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 48名胰腺癌患者，3年内的肿瘤组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 886 | 2024-10-13 |
Identification of hepatocellular carcinoma-related subtypes and development of a prognostic model: a study based on ferritinophagy-related genes
2023-Aug-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-023-00756-6
PMID:37555866
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研究论文 | 本研究基于铁蛋白自噬相关基因，识别肝细胞癌相关亚型并开发预测模型 | 首次探讨了铁蛋白自噬相关基因在肝细胞癌中的潜在作用，并构建了基于这些基因的风险模型 | 研究主要基于TCGA数据库的数据，可能存在样本偏倚和数据异质性 | 深入研究肝细胞癌的发生和发展机制，识别新的治疗靶点 | 肝细胞癌患者及其铁蛋白自噬相关基因的表达 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | LASSO和COX回归分析 | 基因表达数据 | TCGA数据库中的肝细胞癌患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 887 | 2024-10-12 |
Defining spatiotemporal gene modules in liver regeneration using Analytical Dynamic Visual Spatial Omics Representation (ADViSOR)
2023-11-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000289
PMID:37889540
|
研究论文 | 本文使用ADViSOR计算管道分析空间转录组数据，揭示了肝脏再生过程中基因表达的时空变化 | 提出了ADViSOR计算管道，结合时间间隔主成分分析和滑动动态超图，用于分析空间转录组数据，揭示肝脏再生过程中的时空分子机制 | NA | 研究肝脏再生过程中基因表达的时空变化 | 肝脏再生过程中的基因表达 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 100个基因在肝脏再生过程中的连续检测 | NA | NA | NA | NA |
| 888 | 2024-10-12 |
Spatial tumour gene signature discriminates neoplastic from non-neoplastic compartments in colon cancer: unravelling predictive biomarkers for relapse
2023-08-05, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04384-0
PMID:37543577
|
研究论文 | 本文通过空间转录组技术研究结肠癌II期患者的组织成分，以识别复发相关的预测性生物标志物 | 开发了一种名为Genes-To-Count（GTC）的计算工具，用于自动化定量原位信号，并准确识别肿瘤和非肿瘤组织区域 | 样本量较小，仅包括10名患者（5名复发和5名未复发） | 探索结肠癌II期患者复发与未复发组织的空间基因表达差异，以发现新的预测性生物标志物 | 结肠癌II期患者的组织样本 | 数字病理学 | 结肠癌 | 原位测序 | NA | 基因表达数据 | 10名结肠癌II期患者（5名复发和5名未复发） | NA | NA | NA | NA |
| 889 | 2024-10-12 |
Spatially resolved transcriptomic profiles reveal unique defining molecular features of infiltrative 5ALA-metabolizing cells associated with glioblastoma recurrence
2023-07-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01207-1
PMID:37434262
|
研究论文 | 研究通过空间解析的转录组分析揭示了与胶质母细胞瘤复发相关的5-氨基乙酰丙酸代谢细胞的独特分子特征 | 首次揭示了5-氨基乙酰丙酸代谢细胞在胶质母细胞瘤复发中的作用及其独特的分子特征 | 研究样本量较小，且仅限于IDH-wt胶质母细胞瘤患者 | 探讨5-氨基乙酰丙酸代谢细胞在胶质母细胞瘤复发中的分子特征及其潜在治疗价值 | 5-氨基乙酰丙酸代谢细胞及其在胶质母细胞瘤复发中的作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 空间解析的批量RNA分析 | NA | 转录组数据 | 10名IDH-wt胶质母细胞瘤患者和16名独立IDH-wt胶质母细胞瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 890 | 2024-10-12 |
Methylcellulose colony assay and single-cell micro-manipulation reveal progenitor-like cells in adult human pancreatic ducts
2023-03-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.02.001
PMID:36868230
|
研究论文 | 本文通过微操作和三维集落分析，在成人胰腺外分泌组织中鉴定出类似祖细胞的细胞 | 首次在成人胰腺外分泌组织中发现具有自我更新和三系分化能力的祖细胞样细胞 | 研究主要在体外和动物模型中进行，尚未在人体内验证 | 探索成人胰腺中具有再生医学潜力的祖细胞 | 成人胰腺外分泌组织中的祖细胞样细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 成人胰腺外分泌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 891 | 2024-10-11 |
Systematic investigation of mitochondrial transfer between cancer cells and T cells at single-cell resolution
2023-10-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.09.003
PMID:37816332
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术和MERCI统计反卷积方法，系统研究了癌细胞和T细胞之间线粒体转移的现象 | 引入MERCI方法，能够追踪和量化癌细胞和T细胞之间的线粒体转移，并准确预测接收细胞及其相对线粒体组成 | NA | 研究癌细胞和T细胞之间线粒体转移的现象，并探索其潜在的治疗机会 | 癌细胞和T细胞之间的线粒体转移 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 统计反卷积方法 | RNA序列 | 涉及多种癌症类型的人类癌症样本 | NA | NA | NA | NA |
| 892 | 2024-10-11 |
ZNF683 marks a CD8+ T cell population associated with anti-tumor immunity following anti-PD-1 therapy for Richter syndrome
2023-10-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.08.013
PMID:37738974
|
研究论文 | 研究分析了Richter综合征患者在接受PD-1阻断治疗后的单细胞转录组数据，发现ZNF683标记的CD8+ T细胞与抗肿瘤免疫反应相关 | 首次发现ZNF683在PD-1阻断治疗后标记的CD8+ T细胞与Richter综合征患者的抗肿瘤免疫反应相关 | 研究样本量较小，仅涉及6名Richter综合征患者和10名其他患者的预处理外周血样本 | 探究Richter综合征患者在接受PD-1阻断治疗后的抗肿瘤免疫反应机制 | Richter综合征患者的骨髓样本和外周血样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 17个骨髓样本和10个外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 893 | 2024-10-11 |
Artificial Intelligence Models for Cell Type and Subtype Identification Based on Single-Cell RNA Sequencing Data in Vision Science
2023 Sep-Oct, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2023.3284795
PMID:37294649
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综述 | 本文综述了基于单细胞RNA测序数据在视觉科学中使用人工智能技术进行细胞类型和亚型识别的最新进展 | 介绍了人工智能在细胞类型识别中的应用，提供了更快、更准确和用户友好的方法 | 开发新的单细胞RNA测序数据分析方法仍然是未来研究需要解决的问题 | 帮助视觉科学家选择合适的单细胞RNA测序数据集和计算工具进行分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型和亚型 | 计算机视觉 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 894 | 2024-10-09 |
scResolve: Recovering single cell expression profiles from multi-cellular spatial transcriptomics
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572269
PMID:38187629
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scResolve的方法，用于从多细胞空间转录组学测量中恢复单细胞表达谱 | scResolve能够准确恢复单细胞在其位置上的表达谱，这是细胞类型反卷积无法实现的 | NA | 开发一种方法来恢复多细胞空间转录组学测量中的单细胞表达谱 | 人类乳腺癌数据和人类肺部疾病数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 人类乳腺癌和肺部疾病数据 | NA | NA | NA | NA |
| 895 | 2024-10-09 |
A review of the current state of single-cell proteomics and future perspective
2023-Nov, Analytical and bioanalytical chemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1007/s00216-023-04759-8
PMID:37285026
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综述 | 本文综述了单细胞蛋白质组学的当前状态，包括工作流程、样本制备技术、仪器和生物应用，并展望了其未来发展 | 单细胞蛋白质组学作为单细胞转录组学的补充，为生物研究提供了新的视角 | 目前存在样本体积小和数据解释需要稳健统计方法的挑战 | 评估单细胞蛋白质组学的当前技术状态，并展望其在生物研究中的未来应用 | 单细胞蛋白质组学的工作流程、样本制备技术、仪器和生物应用 | NA | NA | 单细胞蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 896 | 2024-10-09 |
Cross-Dataset Single-Cell Analysis Identifies Temporal Alterations in Cell Populations of Primary Pancreatic Tumor and Liver Metastasis
2023-Apr-21, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15082396
PMID:37190324
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研究论文 | 本研究通过跨数据集的单细胞RNA测序分析，揭示了原发性胰腺肿瘤和肝转移瘤中细胞群落的时空变化 | 首次系统比较了原发性胰腺癌和肝转移瘤的细胞群落组成和基因组特征，并识别出肝转移瘤中独特的癌细胞亚群和标记物 | NA | 探讨胰腺导管腺癌（PDAC）原发肿瘤和肝转移瘤中细胞群落的组成和基因组特征的差异 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的原发肿瘤和肝转移瘤 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据 | 使用了转基因KPC小鼠模型及其自发PDAC和匹配的肝转移瘤的scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 897 | 2024-10-08 |
Inference of differential key regulatory networks and mechanistic drug repurposing candidates from scRNA-seq data with SCANet
2023-11-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad644
PMID:37862243
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SCANet的工具，用于从单细胞RNA测序数据中推断差异关键调控网络和机制性药物再利用候选者 | 开发了SCANet，一个集成的单细胞分析工具，涵盖了从基因共表达模块推断、驱动基因检测、转录调控网络重建到机制性药物再利用候选者预测的整个流程 | NA | 解决从单细胞RNA测序数据中重建细胞（亚）类型发育差异的关键调控网络的计算问题 | 急性呼吸疾病患者中的细胞因子风暴机制和肥胖小鼠肠道干细胞中的细胞驱动机制 | 生物信息学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及两个研究的数据，包括急性呼吸疾病患者和肥胖小鼠的肠道干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 898 | 2024-10-08 |
Chromatin accessibility profiling of targeted cell populations with laser capture microdissection coupled to ATAC-seq
2023-10-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100598
PMID:37776856
|
研究论文 | 本研究报告了激光捕获显微切割与ATAC-seq结合（LCM-ATAC-seq）用于新鲜冷冻样本的空间染色质可及性特征分析 | 首次将激光捕获显微切割与ATAC-seq结合，用于空间染色质可及性分析 | 研究仅限于新鲜冷冻样本，未涉及其他类型的样本 | 探索空间表观基因组学领域，提供基因调控的进一步见解 | 染色质可及性在健康和疾病中的作用 | 表观基因组学 | NA | 激光捕获显微切割（LCM），ATAC-seq | NA | 染色质可及性数据 | 新鲜冷冻样本 | NA | NA | NA | NA |
| 899 | 2024-10-08 |
Studying stochastic systems biology of the cell with single-cell genomics data
2023-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.17.541250
PMID:37292934
|
综述 | 本文综述了单细胞基因组学数据在细胞系统生物学中的应用，并提出了一种统一的数学框架来处理单分子生物随机性和基因组学技术变异 | 提出了一个统一的数学框架，通过生成函数的方法整合单细胞RNA测序中的各种现象 | NA | 探讨单细胞基因组学数据在系统生物学中的应用，并提出一个数学框架来处理生物随机性和技术变异 | 单细胞RNA测序中的RNA转录过程和微流控技术中的封装和文库构建步骤 | 系统生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成函数 | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 900 | 2024-10-08 |
Spatial genomic, biochemical, and cellular mechanisms drive meningioma heterogeneity and evolution
2023-May-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2921804/v1
PMID:37292686
|
研究论文 | 本文整合了空间转录组学和空间蛋白质组学方法，研究了高级别脑膜瘤的基因组、生化和细胞机制，揭示了肿瘤内异质性与分子、时间和空间演化的关系 | 通过空间转录组学和蛋白质组学方法，揭示了高级别脑膜瘤的基因和蛋白质表达差异，并发现了治疗抵抗性的空间扩展亚克隆拷贝数变异 | NA | 研究脑膜瘤的肿瘤内异质性和演化机制，为个性化医疗治疗提供基础 | 高级别脑膜瘤 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、多重顺序免疫荧光（seqIF）、空间解卷积 | NA | 基因组数据、蛋白质数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |