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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 821 - 840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2025-10-07 |
hdWGCNA identifies co-expression networks in high-dimensional transcriptomics data
2023-06-26, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100498
PMID:37426759
|
研究论文 | 开发了hdWGCNA框架用于高维转录组数据的共表达网络分析 | 支持单细胞和空间RNA测序数据的系统级共表达网络分析，能够进行异构体水平网络分析 | 未明确说明具体的技术限制或数据要求 | 开发高维转录组数据的共表达网络分析工具 | 自闭症谱系障碍和阿尔茨海默病脑样本数据 | 生物信息学 | 自闭症谱系障碍,阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,空间RNA测序,长读长单细胞测序 | 共表达网络分析 | 转录组数据 | 包含近100万个细胞的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 822 | 2025-10-07 |
Single-nucleus RNA sequencing of human pancreatic islets identifies novel gene sets and distinguishes β-cell subpopulations with dynamic transcriptome profiles
2023-05-01, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01179-2
PMID:37127706
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研究论文 | 通过单核RNA测序技术分析人类胰岛细胞，识别新型基因标记并区分具有动态转录组特征的β细胞亚群 | 发现胰岛内分泌细胞中非经典基因标记，首次通过整合scRNA-seq和snRNA-seq区分出三个具有不同生物学动态状态的β细胞亚群 | 研究样本来源有限，仅使用同一供体的胰岛细胞进行分析 | 探索人类胰岛细胞的转录组特征和细胞异质性 | 人类胰岛细胞及其在免疫缺陷小鼠中的移植模型 | 单细胞测序 | 糖尿病 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 同一供体的人类胰岛细胞 | NA | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 使用GRCh38-2020-A文库进行snRNA-seq数据分析，包含内含子读取 |
| 823 | 2025-10-07 |
Image-based spatial transcriptomics identifies molecular niche dysregulation associated with distal lung remodeling in pulmonary fibrosis
2023-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.15.571954
PMID:38168317
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研究论文 | 本研究通过图像空间转录组学分析肺纤维化远端肺重塑的分子生态失调 | 首次使用亚细胞分辨率图像空间转录组学技术，结合机器学习和轨迹分析方法，系统揭示了肺纤维化进展过程中从肺泡上皮失调到巨噬细胞极化的分子变化序列 | 样本量相对有限（19个肺组织），且主要关注肺纤维化，对其他慢性肺疾病的适用性有待验证 | 解析肺纤维化远端肺重塑的空间分子机制 | 人类肺组织中的上皮细胞、基质细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 图像空间转录组学 | 机器学习, 轨迹分析 | 空间转录组数据, 图像数据 | 19个独特肺组织的超过100万个细胞 | NA | 空间转录组学 | NA | 亚细胞分辨率图像空间转录组学 |
| 824 | 2025-10-07 |
Osteosarcoma tumors maintain intra-tumoral transcriptional heterogeneity during bone and lung colonization
2023-04-27, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01593-3
PMID:37106386
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析骨肉瘤在骨和肺转移过程中维持肿瘤内转录异质性的机制 | 首次结合谱系追踪和单细胞转录组学揭示肺转移过程中具有不同转录谱的多个克隆被富集并在细胞世代间保持稳定 | 研究主要基于细胞系和患者来源的异种移植模型，可能不能完全反映人类体内真实情况 | 研究肿瘤细胞异质性在适应不同微环境中的作用机制 | 骨肉瘤细胞系和患者来源的异种移植模型 | 单细胞生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色，谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 47,977个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 825 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis identifies Ifi27l2a as a novel gene regulator of microglial inflammation in the context of aging and stroke
2023-Feb-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2557290/v1
PMID:36824976
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别Ifi27l2a为调控衰老和脑卒中背景下小胶质细胞炎症反应的新型基因 | 首次发现Ifi27l2a基因在神经退行性疾病中的作用机制，揭示其通过活性氧介导神经炎症的新功能 | 研究主要基于小鼠模型和细胞培养实验，人类样本验证有限 | 探索调控小胶质细胞功能的关键基因，为脑卒中治疗提供新靶点 | 衰老小鼠大脑、小胶质细胞培养模型、人类尸检样本 | 单细胞生物学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 826 | 2025-10-07 |
Early clinical outcomes and molecular smooth muscle cell phenotyping using a prophylactic aortic arch replacement strategy in Loeys-Dietz syndrome
2023-11, The Journal of thoracic and cardiovascular surgery
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.jtcvs.2023.07.023
PMID:37500053
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研究论文 | 本研究评估了Loeys-Dietz综合征患者预防性主动脉弓置换术的临床风险和血流动力学后果，并通过单细胞RNA测序表征平滑肌细胞表型 | 首次结合预防性主动脉弓置换术的临床评估与单细胞RNA测序分析，揭示Loeys-Dietz综合征主动脉平滑肌细胞的表型连续变化谱 | 样本量较小（Loeys-Dietz综合征患者n=8），随访时间较短（中位2年） | 评估预防性主动脉弓置换术在Loeys-Dietz综合征中的安全性和有效性，并探究疾病相关的平滑肌细胞分子表型 | Loeys-Dietz综合征患者、马凡综合征患者、无主动脉病变的对照患者及器官捐献者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，四维血流磁共振成像，组织学评估 | NA | 基因表达数据，医学影像数据，组织学数据 | 8例Loeys-Dietz综合征患者，5例马凡综合征患者，5例对照患者，2例器官捐献者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 827 | 2024-08-07 |
[Research progress of single-cell RNA sequencing in airway type 2 inflammatory diseases]
2023-12-07, Zhonghua er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Chinese journal of otorhinolaryngology head and neck surgery
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 828 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA-Sequencing in Astrocyte Development, Heterogeneity, and Disease
2023-Oct, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-023-01397-7
PMID:37552355
|
综述 | 本文综述了星形胶质细胞的发育、异质性及其在中枢神经系统生理和病理环境中的关键作用，重点关注单细胞测序技术的应用 | 系统整合了单细胞RNA测序技术在揭示星形胶质细胞异质性、发育轨迹和疾病作用方面的最新研究进展 | NA | 探讨星形胶质细胞的发育过程、细胞异质性及其在中枢神经系统疾病中的作用 | 星形胶质细胞 | 单细胞生物学 | 中枢神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 829 | 2025-10-07 |
Construction of a circRNA- lincRNA-lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA regulatory network identifies genes and pathways linked to goat fertility
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1195480
PMID:37547465
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术构建了山羊颗粒细胞中ceRNA调控网络，揭示了与山羊繁殖力相关的关键基因和通路 | 首次在山羊中整合circRNA、lincRNA、lncRNA、miRNA和mRNA构建ceRNA调控网络，鉴定出18个与繁殖力相关的枢纽基因 | 研究依赖于公开可用的单细胞RNA测序数据，样本量相对有限，需要进一步实验验证 | 探究高繁殖力和低繁殖力山羊颗粒细胞的转录组差异，构建ceRNA调控网络 | 济宁青山羊的颗粒细胞（15只高繁殖力，15只低繁殖力） | 生物信息学 | 繁殖障碍 | 单细胞RNA测序，功能富集分析，文献挖掘 | ceRNA调控网络，基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据 | 30个样本（15高繁殖力，15低繁殖力） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 830 | 2025-10-07 |
A framework for defining mesenchymal cell types associated with murine periosteal and endosteal bone
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.17.567528
PMID:38014179
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据建立了小鼠骨相关间充质细胞类型的分类框架 | 首次比较了骨膜和骨内膜/骨小梁的细胞差异，定义了11个主要细胞簇，包括新发现的osteo-X细胞类型 | 研究仅针对小鼠模型，人类骨细胞的适用性需要进一步验证 | 增加骨细胞单细胞RNA测序数据量，比较骨膜与骨内细胞差异，明确小鼠骨相关细胞类型主要类别 | 小鼠骨相关间充质细胞 | 单细胞转录组学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过100,000个间充质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 831 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis of lizard blastema fibroblasts reveals phagocyte-dependent activation of Hedgehog-responsive chondrogenesis
2023-08-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40206-z
PMID:37563130
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析蜥蜴尾部再生过程，揭示了吞噬细胞依赖的Hedgehog信号通路调控软骨形成机制 | 首次在蜥蜴再生模型中鉴定出spp1激活的成纤维细胞作为胚芽细胞来源，并发现sulf1表达群体对Hedgehog信号的特异性响应 | 研究仅针对蜥蜴模型，在其他物种中的适用性需要进一步验证 | 探索蜥蜴尾部再生过程中胚芽形成和软骨生成的调控机制 | 蜥蜴再生尾部的成纤维细胞和吞噬细胞群体 | 单细胞生物学 | 组织再生障碍 | 单细胞RNA测序，伪时间轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 蜥蜴再生尾部组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 832 | 2025-10-07 |
Network analysis of large-scale ImmGen and Tabula Muris datasets highlights metabolic diversity of tissue mononuclear phagocytes
2023-02-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112046
PMID:36708514
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研究论文 | 通过代谢网络分析研究组织单核吞噬细胞的代谢多样性 | 开发了基于网络的GAM聚类计算方法，首次在38种不同组织中系统识别了单核吞噬细胞的9个关键代谢子网络 | 研究主要基于小鼠数据集，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 理解单核吞噬细胞在不同组织中的代谢变异性 | 小鼠单核吞噬细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，代谢网络分析 | GAM聚类 | 转录组数据 | 337个样本（ImmGen MNP数据集）+202个样本（ImmGen Phase I）+51,364个细胞（Tabula Muris scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 833 | 2025-10-07 |
Spatial Transcriptomics Depict Ligand-Receptor Cross-talk Heterogeneity at the Tumor-Stroma Interface in Long-Term Ovarian Cancer Survivors
2023-05-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1821
PMID:36787106
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了卵巢癌肿瘤微环境中配体-受体交互的异质性及其与长期生存的关系 | 首次整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据，开发计算方法研究肿瘤微环境中不同肿瘤细胞与癌症相关成纤维细胞亚型之间的空间配体-受体相互作用 | 需要进一步研究确认这种交互是否在调节高级别浆液性卵巢癌恶性表型中发挥作用 | 探索卵巢癌肿瘤微环境中基质异质性及其与患者长期生存的关系 | 高级别浆液性卵巢癌长期生存者和短期生存者的治疗初治肿瘤组织 | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学 | 计算方法 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 高级别浆液性卵巢癌长期生存者和短期生存者的肿瘤样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 834 | 2025-10-07 |
Innate and adaptive AAV-mediated immune responses in a mouse model of Duchenne muscular dystrophy
2023-Sep-14, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2023.06.002
PMID:37746243
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研究论文 | 本研究通过建立小鼠模型探究AAV介导的先天性和适应性免疫反应机制 | 开发了间隔4周双次给药AAV9的小鼠模型，更好地模拟人类对AAV的免疫反应 | 研究仅在小鼠模型中进行，与人类免疫系统存在差异 | 理解AAV诱导的免疫反应机制 | 杜氏肌营养不良症小鼠模型 | 免疫学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 835 | 2025-10-07 |
Immune checkpoint blockade induces distinct alterations in the microenvironments of primary and metastatic brain tumors
2023-09-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI169314
PMID:37655659
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了免疫检查点阻断对脑转移瘤和胶质母细胞瘤微环境的不同影响 | 首次在单细胞水平比较ICB对原发性和转移性脑肿瘤免疫微环境的差异影响，发现ICB在脑转移瘤中诱导更显著的T细胞浸润和独特的血管周巨噬细胞变化 | 样本量相对有限（28个脑转移瘤样本），且为观察性研究 | 探究免疫检查点阻断对脑肿瘤微环境的调控机制 | 脑转移瘤患者肿瘤组织 | 单细胞组学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | 28个脑转移瘤样本（19个ICB初治，9个ICB治疗） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 836 | 2025-10-07 |
Engrailed transcription factors direct excitatory cerebellar neuron diversity and survival
2023-Dec-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.30.569445
PMID:38077070
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间表达分析定义了小脑核兴奋性神经元的分子亚域，并揭示了Engrailed转录因子在神经元多样性和存活中的关键作用 | 首次在胚胎发育过程中定义小脑核内侧兴奋性神经元的分子亚域，并发现EN1/2转录因子在小脑兴奋性神经元谱系中的保守功能 | 研究主要关注胚胎发育阶段，对成年后神经元功能的长期影响需要进一步验证 | 探究小脑核兴奋性神经元多样性发育机制及转录因子调控作用 | 小鼠小脑核兴奋性神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间表达分析 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 胚胎期小鼠小脑组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 837 | 2025-10-07 |
Steatosis drives monocyte-derived macrophage accumulation in human metabolic dysfunction-associated fatty liver disease
2023-Nov, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100877
PMID:37869071
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研究论文 | 本研究探讨了代谢功能障碍相关脂肪肝病中巨噬细胞异质性与肝脏脂肪变性的关系 | 首次在人类MAFLD中系统描述巨噬细胞亚群组成，发现单核细胞源性巨噬细胞与肝脏脂肪变性程度相关，并揭示其在脂质摄取中的独特作用 | 样本量较小（n=21），单细胞RNA测序仅对3个样本进行，缺乏长期随访数据 | 研究人类MAFLD早期阶段巨噬细胞异质性及其与肝脏脂肪变性的关系 | 接受减重手术的21名参与者的肝组织样本及小鼠肝脂肪变性模型 | 单细胞生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫荧光，H&E显微镜，MRI，电子显微镜 | NA | 基因表达数据，图像数据，临床数据 | 21名人类参与者，其中3个样本进行单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 838 | 2025-10-07 |
Spatial and single-nucleus transcriptomic analysis of genetic and sporadic forms of Alzheimer's Disease
2023-Jul-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.24.550282
PMID:37546983
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研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞核RNA测序分析阿尔茨海默病的遗传性和散发性形式 | 首次结合空间转录组学和单细胞核RNA测序技术，同时研究散发性AD和唐氏综合征相关AD，并进行跨物种比较 | 样本数量未明确说明，研究主要聚焦于早期和晚期AD阶段 | 探索阿尔茨海默病的转录组特征及其在空间和细胞类型水平的变化 | 人类皮质样本（早期AD、晚期AD、唐氏综合征相关AD）和5xFAD转基因小鼠模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，单细胞核RNA测序，淀粉样斑块成像 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据，影像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 839 | 2025-10-07 |
SEC-seq: association of molecular signatures with antibody secretion in thousands of single human plasma cells
2023-06-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39367-8
PMID:37322036
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研究论文 | 开发了一种名为SEC-seq的新方法，能够在单细胞水平上将抗体分泌量与表面标志物和转录组信息关联 | 利用含腔水凝胶纳米小瓶捕获细胞分泌物，首次实现了在数千个单个人类浆细胞中同时分析IgG分泌量、表面标志物和转录组 | NA | 建立分泌功能与分子特征关联的分析方法 | 人类B细胞和浆细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术,成像流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质分泌数据,表面标志物数据 | 数千个单个人类浆细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | SEC-seq（分泌组关联单细胞测序） |
| 840 | 2025-10-07 |
High-Quality Brain and Bone Marrow Nuclei Preparation for Single Nuclei Multiome Assays
2023-12-22, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65715
PMID:38189499
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研究论文 | 本文介绍了用于10X Genomics多组学测序流程的大脑和骨髓样本高质量细胞核制备方法 | 开发了针对大脑和骨髓组织的标准化细胞核制备方案，确保产生高质量的单细胞核悬浮液 | 仅针对大脑和骨髓两种特定组织类型，未验证其他组织类型的适用性 | 建立优化的单细胞核制备流程以提高多组学测序数据质量 | 大脑组织和骨髓组织样本 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞多组学测序，单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | 基因组学数据，表观遗传学数据 | NA | 10x Genomics | single-cell multi-omics, single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | 10x Chromium | 10X Genomics droplet-based single-cell profiling platform for multiome assays |