单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5354 篇文献，本页显示第 781 - 800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2025-10-06 |
Simultaneous selection of nanobodies for accessible epitopes on immune cells in the tumor microenvironment
2023-11-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43038-z
PMID:37978291
|
研究论文 | 开发了一种名为INSPIRE-seq的方法，用于在肿瘤微环境中筛选免疫细胞结合纳米抗体 | 首次提出利用纳米抗体库和二代测序技术并行富集能够穿透肿瘤微环境的免疫细胞结合纳米抗体 | NA | 开发筛选靶向肿瘤微环境中免疫细胞表位的纳米抗体技术 | 肿瘤微环境中的免疫细胞，包括树突状细胞等亚型 | 合成生物学 | 肿瘤 | 二代测序，单细胞RNA测序，免疫荧光，结构建模与对接 | NA | 测序数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 782 | 2025-05-09 |
scDREAMER for atlas-level integration of single-cell datasets using deep generative model paired with adversarial classifier
2023-11-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43590-8
PMID:38012145
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研究论文 | 介绍了一种名为scDREAMER的数据集成框架，用于整合异质性单细胞测序数据集 | 结合深度生成模型和对抗训练，支持无监督和有监督的数据集成，能够处理批次效应、细胞类型分布不均等问题 | 未提及具体的技术限制或应用范围的局限性 | 开发一个高效的框架来整合跨组织、时间和条件的单细胞测序数据集 | 单细胞测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 深度生成模型与对抗分类器 | 单细胞测序数据 | 六个真实基准数据集和一个包含100万细胞的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 783 | 2025-05-09 |
Detection of isoforms and genomic alterations by high-throughput full-length single-cell RNA sequencing in ovarian cancer
2023-11-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43387-9
PMID:38012143
|
研究论文 | 通过高通量全长单细胞RNA测序在卵巢癌中检测异构体和基因组改变 | 使用长读长单细胞RNA测序技术，提高了PacBio测序深度至每个细胞12,000读长，捕获了152,000个异构体，其中52,000个是先前未报道的 | 研究样本仅来自三名卵巢癌患者，样本量较小 | 理解癌症的复杂背景，提供单细胞分辨率的基因型-表型信息 | 卵巢癌患者的临床样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 长读长单细胞RNA测序（scRNA-seq），PacBio测序 | NA | RNA测序数据 | 三名卵巢癌患者的临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 784 | 2025-05-09 |
Robust mapping of spatiotemporal trajectories and cell-cell interactions in healthy and diseased tissues
2023-11-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43120-6
PMID:38007580
|
研究论文 | 开发了三种计算统计算法，整合空间转录组学的多种数据类型，以增强对健康与疾病组织中细胞过程的理解 | 提出了基于空间图的方法PSTS、空间约束的两级置换测试SCTP以及基于神经网络的插补方法stSME，用于建模细胞间相互作用和纠正技术噪声 | NA | 增强对健康与疾病组织中细胞过程的理解 | 细胞过程、细胞间相互作用 | 空间转录组学 | 癌症、脑损伤 | 空间转录组学 | 神经网络、基于图的方法 | 基因表达数据、物理距离数据、组织形态数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 785 | 2025-05-09 |
The extrafollicular B cell response is a hallmark of childhood idiopathic nephrotic syndrome
2023-11-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43504-8
PMID:37996443
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术，揭示了儿童特发性肾病综合征（INS）中B细胞的异常反应特征 | 首次在儿童INS中发现了以非滤泡性B细胞反应为主的免疫扰动，并识别了特定的B细胞亚群扩增 | 样本量较小（13名INS患儿和24名健康对照），且仅分析了血液样本 | 探究儿童特发性肾病综合征的免疫发病机制 | 儿童特发性肾病综合征患者和健康对照的B细胞 | 免疫学 | 肾病综合征 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 13名INS患儿和24名健康对照的血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 786 | 2025-05-09 |
Mouse models of pediatric high-grade gliomas with MYCN amplification reveal intratumoral heterogeneity and lineage signatures
2023-11-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43564-w
PMID:38001143
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research paper | 该研究通过构建基因工程小鼠模型，模拟人类MYCN扩增的儿童高级别胶质瘤，揭示了肿瘤的分子特征和潜在治疗选项 | 首次构建了模拟人类HGG-MYCN的小鼠模型，并通过单细胞RNA测序揭示了肿瘤内异质性和谱系特征 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证 | 探索MYCN扩增的儿童高级别胶质瘤的肿瘤发生机制和分子特征，寻找潜在治疗选项 | 基因工程小鼠模型和人类肿瘤细胞 | 肿瘤生物学 | 儿童高级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序，高通量药物筛选 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据，药物反应数据 | 未明确说明小鼠数量，但使用了小鼠和人类肿瘤细胞进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 787 | 2025-05-09 |
Vector-borne Trypanosoma brucei parasites develop in artificial human skin and persist as skin tissue forms
2023-11-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43437-2
PMID:37996412
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研究论文 | 该研究通过人工人类皮肤模型和采采蝇自然感染，详细描述了布氏锥虫在皮肤中的发育过程及其进入可逆静止状态的特性 | 首次使用先进的人工人类皮肤模型和单细胞RNA测序技术，揭示了布氏锥虫在皮肤中的发育时序及其可逆静止状态 | 研究依赖于人工皮肤模型，可能无法完全模拟自然感染环境 | 探究布氏锥虫在人类皮肤中的发育过程及其持久感染机制 | 布氏锥虫及其在人工人类皮肤中的发育 | 寄生虫学 | 锥虫病 | 单细胞RNA测序 | 人工人类皮肤模型 | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 788 | 2025-05-09 |
Single-cell epigenomics and spatiotemporal transcriptomics reveal human cerebellar development
2023-11-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43568-6
PMID:37993461
|
研究论文 | 通过单细胞表观基因组学和时空转录组学揭示人类小脑发育的分子调控网络 | 结合单细胞转录组学、空间转录组学和单细胞染色质可及性状态，系统描绘了人类胎儿小脑发育的时空景观 | 研究主要关注人类胎儿小脑发育，可能不适用于其他物种或成体小脑 | 揭示人类小脑发育的分子调控机制及其与神经精神疾病的关联 | 人类胎儿小脑 | 基因组学 | 神经精神疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学、单细胞染色质可及性分析 | NA | 单细胞RNA-seq数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 人类胎儿小脑样本 | NA | NA | NA | NA |
| 789 | 2025-10-07 |
SMARCB1 loss activates patient-specific distal oncogenic enhancers in malignant rhabdoid tumors
2023-12-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43498-3
PMID:38040699
|
研究论文 | 本研究揭示了SMARCB1基因缺失通过激活患者特异性远端致癌增强子驱动恶性横纹肌样瘤发生的机制 | 首次发现SMARCB1缺失导致患者特异性远端增强子与MYC癌基因启动子形成染色质环，揭示了MRT肿瘤发生中的表观遗传重编程机制 | 研究主要基于患者来源的类器官模型，需要在更广泛的临床样本中验证 | 探究SMARCB1缺失在恶性横纹肌样瘤中如何改变调控景观并驱动肿瘤发生 | 恶性横纹肌样瘤患者来源的类器官组织和患者MRT组织 | 表观遗传学 | 恶性横纹肌样瘤 | 多组学分析、染色体构象捕获、单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq | NA | 基因组学数据、表观遗传学数据、转录组数据 | 患者来源的MRT类器官和患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 790 | 2025-10-07 |
PD-1- CD45RA+ effector-memory CD8 T cells and CXCL10+ macrophages are associated with response to atezolizumab plus bevacizumab in advanced hepatocellular carcinoma
2023-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43381-1
PMID:38030622
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析阿特珠单抗联合贝伐珠单抗治疗晚期肝细胞癌的免疫反应机制 | 首次在单细胞水平揭示PD-1-CD45RA+效应记忆CD8 T细胞和CXCL10+巨噬细胞与治疗反应的相关性 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 探索阿特珠单抗联合贝伐珠单抗治疗晚期肝细胞癌的免疫机制 | 晚期肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 791 | 2025-10-07 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics data using deep generative models with SpatialScope
2023-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43629-w
PMID:38030617
|
研究论文 | 提出一种整合空间转录组和单细胞转录组数据的深度生成模型方法SpatialScope | 通过创新的模型和算法设计，能够同时提升测序型ST数据的单细胞分辨率并准确推断成像型ST数据的全转录组表达水平 | NA | 解决当前空间转录组技术在细胞分辨率或全转录组分析方面的局限性 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序参考数据 | 计算生物学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 深度生成模型 | 空间转录组数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 792 | 2025-10-07 |
Cellular underpinnings of the selective vulnerability to tauopathic insults in Alzheimer's disease
2023-Nov-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.06.548027
PMID:38076913
|
研究论文 | 本研究通过细胞类型定位技术探索阿尔茨海默病中tau病理选择性易感性的细胞基础 | 首次在全脑水平系统研究细胞类型分布与tau病理选择性易感性的关系，发现细胞类型组成比风险基因更能预测tau病理 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 揭示阿尔茨海默病中tau病理区域性易感性的细胞机制 | 小鼠脑组织中的神经元和非神经元细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，细胞类型定位分析，基因本体分析 | MISS（矩阵逆和子集选择）细胞类型定位流程 | 单细胞RNA测序数据，转基因小鼠模型数据 | 12种不同的PS19小鼠模型，5项转基因小鼠研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 793 | 2025-10-07 |
Impact of Memory T Cells on SARS-COV-2 Vaccine Response in Hematopoietic Stem Cell Transplant
2023-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.564259
PMID:37961434
|
研究论文 | 评估造血干细胞移植受者对SARS-CoV-2 mRNA疫苗的免疫反应特征 | 首次在HSCT受者中结合单细胞RNA测序与TCR/BCR测序分析疫苗无应答机制 | 样本量较小（仅42例患者），缺乏长期随访数据 | 探究造血干细胞移植受者对SARS-CoV-2疫苗的免疫应答机制 | 造血干细胞移植受者和健康对照者 | 免疫学 | 传染病 | 单细胞RNA测序，TCR测序，BCR测序，抗体滴度检测 | NA | 单细胞转录组数据，血清学数据 | 42例HSCT受者，5例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 794 | 2025-10-07 |
Predicting tumor immune microenvironment and checkpoint therapy response of head & neck cancer patients from blood immune single-cell transcriptomics
2023-Jan-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.17.524455
PMID:36789425
|
研究论文 | 本研究探索如何通过血液单细胞转录组数据推断头颈癌患者肿瘤免疫微环境状态并预测免疫检查点治疗反应 | 首次证明肿瘤免疫细胞比例和基因表达可从匹配的PBMC单细胞转录组数据推断，并发现肿瘤记忆B细胞与调节性T细胞比例比传统标志物更能预测免疫治疗反应 | 研究样本量有限，需要更大规模验证 | 开发基于血液单细胞转录组的肿瘤免疫微环境推断和免疫治疗反应预测方法 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 单细胞转录组学 | 头颈癌 | scRNA-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 两个头颈癌患者数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 外周血单个核细胞单细胞RNA测序 |
| 795 | 2025-10-07 |
Construction of monocyte-related prognosis model based on comprehensive analysis of bulk RNA-seq and single-cell RNA-seq in high-grade serous ovarian cancer
2023-Dec-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000036548
PMID:38115318
|
研究论文 | 基于批量RNA-seq和单细胞RNA-seq综合分析构建高级别浆液性卵巢癌的单核细胞相关预后模型 | 首次结合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据识别单核细胞相关基因并构建HGSOC预后风险模型 | 研究依赖于公共数据库数据，缺乏独立验证队列 | 开发高级别浆液性卵巢癌的预后预测模型并探索单核细胞在肿瘤发展中的作用机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 生物信息学分析 | Cox风险比例模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的HGSOC样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 796 | 2025-10-07 |
Identification of central genes for endometriosis through integration of single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing analysis
2023-Dec-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000036707
PMID:38115253
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序分析识别子宫内膜异位症的核心基因并构建预测模型 | 首次结合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，采用细胞通讯分析识别关键细胞亚型，并通过LASSO模型筛选出4个核心基因 | NA | 识别子宫内膜异位症发展的关键基因并构建诊断预测模型 | 子宫内膜异位症相关基因和细胞亚型 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,生物信息学分析 | LASSO模型,WGCNA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 797 | 2025-10-07 |
Secretory GFP reconstitution labeling of neighboring cells interrogates cell-cell interactions in metastatic niches
2023-12-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43855-2
PMID:38052804
|
研究论文 | 开发了一种名为sGRAPHIC的分泌型GFP重组标记系统，用于研究转移灶中癌细胞与邻近组织驻留细胞的相互作用 | 改进了基于分裂GFP的基因编码系统，开发出能高效标记深部组织中与癌细胞相邻的组织驻留细胞的sGRAPHIC技术 | 研究基于小鼠肝脏转移模型，在人类临床应用的转化价值仍需进一步验证 | 阐明转移灶中细胞间相互作用的机制 | 转移灶中的癌细胞和邻近组织驻留细胞（特别是肝细胞） | 单细胞生物学 | 癌症转移 | 单细胞RNA测序，基因编码荧光标记系统 | NA | 单细胞转录组数据，荧光成像数据 | 小鼠肝脏转移模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 798 | 2025-10-07 |
Interaction dynamics between innate and adaptive immune cells responding to SARS-CoV-2 vaccination in non-human primates
2023-12-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43420-x
PMID:38042809
|
研究论文 | 通过单细胞测序研究猕猴接种SARS-CoV-2 mRNA疫苗后先天免疫与适应性免疫细胞的相互作用动态 | 首次整合分析mRNA-1273疫苗接种后先天免疫细胞与抗原特异性B/T细胞的单细胞转录组和适应性免疫受体 | 研究仅使用非人灵长类动物模型，样本量较小 | 揭示SARS-CoV-2疫苗接种后先天免疫与适应性免疫系统的双向信号传导机制 | 恒河猴的先天免疫细胞和抗原特异性外周B细胞、T细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据、适应性免疫受体数据 | 猕猴免疫细胞样本（包含疫苗接种前和两剂疫苗接种后时间点） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 799 | 2025-10-07 |
Young infants display heterogeneous serological responses and extensive but reversible transcriptional changes following initial immunizations
2023-12-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43758-2
PMID:38042900
|
研究论文 | 本研究分析了2月龄婴儿在初次免疫接种后的血清学反应和转录组变化 | 首次在婴儿疫苗接种研究中结合全血转录组和单细胞RNA测序，揭示了免疫反应的异质性和可逆的转录变化 | 样本量相对有限，仅观察了短期免疫反应 | 探究婴儿对常规疫苗的免疫反应特征 | 2月龄婴儿 | 免疫学 | 传染病 | 单细胞RNA测序, 全血转录组分析 | NA | 转录组数据, 血清学数据 | 两个队列的2月龄婴儿 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 800 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics deconvolution at single-cell resolution using Redeconve
2023-12-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43600-9
PMID:38040768
|
研究论文 | 提出Redeconve算法，实现空间转录组数据在单细胞分辨率下的解卷积分析 | 首次实现空间转录组数据在单细胞分辨率而非仅细胞类型分辨率下的解卷积 | NA | 开发高分辨率空间转录组数据解卷积方法 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | Redeconve算法 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |