单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 5354 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-08-18 |
Ruxolitinib improves hematopoietic regeneration by restoring mesenchymal stromal cell function in acute graft-versus-host disease
2023-08-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI162201
PMID:37338986
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示急性移植物抗宿主病中骨髓间充质基质细胞功能受损，并证明鲁索替尼通过JAK2/STAT1通路直接恢复其功能，改善造血再生 | 首次在单细胞水平全面解析aGVHD中骨髓微环境损伤机制，并发现鲁索替尼直接作用于骨髓间充质基质细胞而非仅通过免疫抑制改善造血功能 | 研究主要基于小鼠模型，患者样本验证范围有限，且未深入探讨JAK2/STAT1下游具体靶基因 | 阐明aGVHD中骨髓微环境损伤机制，并评估鲁索替尼对造血再生的改善作用及其机制 | 小鼠aGVHD模型中的骨髓非造血细胞（特别是间充质基质细胞）及患者样本 | 数字病理学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型（具体数量未提及）及患者样本（数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 62 | 2026-08-18 |
Cloning a profibrotic stem cell variant in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-04-26, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abp9528
PMID:37099633
|
研究论文 | 通过单细胞克隆技术，在特发性肺纤维化（IPF）患者远端肺中鉴定出一种促纤维化干细胞变体，该变体能够转化正常成纤维细胞并激活肌成纤维细胞，且对特定药物敏感 | 首次利用单细胞克隆技术从IPF患者肺中分离出促纤维化干细胞变体，并揭示其与慢性阻塞性肺病中的促纤维化变体不同，为IPF发病机制提供新视角 | 未提供具体局限性信息 | 探讨IPF中肺基底干细胞异质性及其在纤维化发病中的致病作用 | 来自16名IPF患者和10名对照者的远端肺基底干细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞克隆技术 | 不适用 | 单细胞基因表达数据 | 16名IPF患者和10名对照者的肺组织样本 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 63 | 2026-08-18 |
Reconstruction Set Test (RESET): a computationally efficient method for single sample gene set testing based on randomized reduced rank reconstruction error
2023-Apr-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.535366
PMID:37066315
|
研究论文 | 提出了一种新的单样本基因集检验方法RESET，基于随机化降秩重建误差，能高效检测差异丰度和差异相关模式。 | RESET方法创新性地利用随机化降秩重建算法，能同时检测差异丰度和差异相关模式，解决了现有方法在竞争性场景、组间比较及大数据集计算效率上的局限。 | 摘要未提及具体限制。 | 开发一种计算高效的单样本基因集检验方法，以克服现有技术的局限性。 | 基因集，用于评估样本和数据集层面的基因集重要性。 | 机器学习 | NA | NA | 随机化降秩重建算法 | 基因表达数据（特别是单细胞RNA测序数据） | 使用真实和模拟的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2026-08-18 |
Placental Inflammation Leads to Abnormal Embryonic Heart Development
2023-03-21, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型发现，中性粒细胞驱动的胎盘炎症可导致胎盘发育不良，进而使母体炎性单核细胞迁移至胚胎心脏，引发心脏结构和功能异常，并持续至出生后 | 首次揭示了中性粒细胞驱动的胎盘炎症直接导致胚胎心脏发育异常的机制，证明胎盘炎症可通过免疫细胞迁移影响胎儿心脏，并通过调节胎盘炎症可预防心脏缺陷 | 研究基于小鼠模型，未在人类中验证；未深入探讨炎症单核细胞迁移的具体分子机制 | 探究胎盘炎症如何导致先天性心脏病的机制 | 小鼠胚胎心脏和胎盘组织 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 流式细胞术、组织学、批量RNA测序、单细胞测序 | 中性粒细胞耗竭小鼠模型 | 测序数据、图像数据 | 小鼠胚胎（不同发育阶段）和出生后幼鼠，具体数量未提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 65 | 2026-08-18 |
Nuclear factor I-C overexpression promotes monocytic development and cell survival in acute myeloid leukemia
2023-02, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-022-01801-z
PMID:36572750
|
研究论文 | 本研究揭示核因子I-C（NFIC）在急性髓系白血病中过度表达，促进单核细胞分化和细胞存活，并可能成为治疗靶点 | 首次发现NFIC在69%的AML患者中显著过表达，并通过单细胞RNA测序和功能实验阐明其促进单核细胞分化和细胞存活的机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，缺乏大量患者样本的验证，且NFIC作为治疗靶点的体内疗效尚未评估 | 探讨NFIC在急性髓系白血病中的表达及其对单核细胞分化和细胞存活的影响，评估其作为治疗靶点的潜力 | 急性髓系白血病患者样本、造血干细胞和祖细胞（HSPCs）、AML细胞系（THP-1）和AML患者原始细胞 | 癌症生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、短发夹RNA（shRNA）敲低 | NA | 基因表达数据、细胞生物学数据 | 69%的AML患者（具体数量未提供）；多个AML细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2026-08-17 |
Sibling chimerism among microglia in marmosets
2023-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.16.562516
PMID:37904944
|
研究论文 | 该研究通过分析狨猴的单细胞RNA测序数据，发现其脑内小胶质细胞存在来自兄弟姐妹的嵌合现象，且这种嵌合仅限于造血来源的细胞 | 首次在单细胞水平上证实狨猴脑内小胶质细胞嵌合完全来源于造血细胞，并揭示不同脑区嵌合比例的差异及其与局部环境的关联 | 仅分析了部分狨猴的组织和脑区，且未探讨嵌合细胞的功能影响 | 探究狨猴组织嵌合是否由血液来源细胞驱动及其在不同细胞类型中的分布，并评估嵌合对基因表达的影响 | 狨猴的血液、肝脏、肾脏及多个脑区组织 | 单细胞基因组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）与单核苷酸多态性（SNP）分析 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 多个狨猴个体的血液、肝脏、肾脏及多个脑区样本 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 67 | 2026-08-13 |
Connecting single-cell transcriptomes to projectomes in mouse visual cortex
2023-Nov-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.25.568393
PMID:38168270
|
研究论文 | 本研究通过结合Patch-seq和全脑形态学数据，建立了小鼠视觉皮层兴奋性神经元的整合分类，并揭示了转录组、形态和电生理特性与投射目标之间的关系 | 首次将单细胞转录组与长程投射特征相关联，通过多步骤分类器统一Patch-seq和全脑形态学数据，建立了整合的形态-电生理-转录组（MET）类型分类，并可预测单个神经元的投射目标 | 研究仅局限于小鼠视觉皮层，且分类器可能依赖于特定数据集，扩展至全脑或其他物种时可能需要调整 | 建立整合的兴奋性神经元分类，连接转录组身份与长程投射，并预测神经元投射目标 | 小鼠视觉皮层的兴奋性神经元 | 单细胞转录组学、神经科学 | NA | Patch-seq、全脑形态学重建、单细胞RNA测序 | 多步骤分类器 | 单细胞转录组数据、形态学数据、电生理数据 | 300个神经元的全脑形态重建和相应的Patch-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2026-08-13 |
Lysyl oxidase regulates epithelial differentiation and barrier integrity in eosinophilic esophagitis
2023-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.27.534387
PMID:37034590
|
研究论文 | 本研究探讨了赖氨酰氧化酶（LOX）在嗜酸性食管炎（EoE）中对上皮分化和屏障完整性的调控作用，发现LOX通过激活骨形态发生蛋白（BMP）信号通路促进上皮稳态。 | 首次揭示了LOX在食管上皮中的非经典功能，即作为信号分子通过BMP通路调节上皮分化和屏障功能，提出了LOX/BMP轴作为EoE治疗的潜在靶点。 | 研究主要基于体外3D类器官和空气-液体界面培养模型，缺乏体内验证；且未深入探讨LOX/BMP轴的上下游调控机制。 | 阐明LOX在EoE食管上皮中的功能作用及其分子机制，评估其作为治疗靶点的潜力。 | 人食管上皮类器官和空气-液体界面培养细胞，经IL-13刺激模拟EoE炎症环境。 | 分子生物学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序、定量逆转录聚合酶链反应、Western blot、组织学分析、屏障功能分析 | 3D类器官和空气-液体界面培养模型 | 基因表达数据和功能实验数据 | 患者来源的类器官（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2026-08-07 |
Cas9-mediated knockout of Ndrg2 enhances the regenerative potential of dendritic cells for wound healing
2023-08-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40519-z
PMID:37550295
|
研究论文 | 本文开发了一种CRISPR/Cas9介导的Ndrg2基因敲除方法，增强树突状细胞的再生潜力，促进伤口愈合 | 利用单细胞RNA测序鉴定Ndrg2作为树突状细胞祖细胞的标志物，并通过CRISPR敲除增强其促血管生成和再生能力，结合水凝胶递送系统实现体内细胞治疗 | 研究仍处于临床前阶段，需进一步评估安全性和有效性 | 开发一种增强树突状细胞治疗慢性伤口潜力的CRISPR基因编辑方法 | 小鼠树突状细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型（非糖尿病和糖尿病） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 70 | 2026-08-07 |
Disentangling brain vasculature in neurogenesis and neurodegeneration using single-cell transcriptomics
2023-07, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2023.04.007
PMID:37210315
|
综述 | 本文综述了利用单细胞转录组学揭示脑脉管系统在神经发生和神经退行性疾病中的作用 | 利用单细胞转录组学技术解析血管细胞亚型、组织结构和分区，并揭示神经血管和胶质血管相互作用功能障碍在神经退行性疾病发病机制中的贡献 | 未提及具体局限性 | 总结单细胞转录组学在脑脉管系统研究中的最新进展，并强调未来神经血管生物学研究的关键挑战 | 胚胎和成体大脑中的血管细胞 | 单细胞转录组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2026-08-07 |
Modulation of virus-induced neuroinflammation by the autophagy receptor SHISA9 in mice
2023-05, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-023-01357-3
PMID:37081201
|
研究论文 | 本研究揭示了自噬受体SHISA9通过介导IKKi的自噬依赖性降解，调节单纯疱疹病毒1型感染诱导的神经炎症，并影响小胶质细胞和星形胶质细胞的免疫异质性 | 首次鉴定SHISA9为自噬货物受体，通过非锚定K48连接多聚泛素链识别IKKi并桥接至自噬体膜组分GABARAPL1，揭示了SHISA9-IKKi轴在调控中枢神经系统不同驻留细胞免疫异质性中的关键作用 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究SHISA9在病毒诱导的神经炎症中对自噬和免疫活性的调控作用及其机制 | 小鼠模型中的小胶质细胞和星形胶质细胞，以及单纯疱疹病毒1型感染过程 | 神经免疫学 | 单纯疱疹病毒性脑炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及Shisa9缺陷小鼠和野生型小鼠，具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2026-08-07 |
Multiplexed evaluation of mouse wound tissue using oligonucleotide barcoding with single-cell RNA sequencing
2023-03-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101946
PMID:36525348
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用寡核苷酸条形码结合单细胞RNA测序对小鼠伤口组织进行多重评估的协议。 | 提出了一种针对伤口组织这一挑战性样本类型的寡核苷酸条形码标记和合并方案，降低了单细胞RNA测序在大规模研究中的成本。 | 文中未明确提及局限性，但可能受限于样本准备复杂性和跨物种应用的验证需求。 | 开发一种成本效益高的单细胞RNA测序方法，用于评估伤口愈合过程中的组织异质性，并可推广至其他物种。 | 小鼠皮肤伤口组织，以及可能的大鼠、猪和人类样本。 | 单细胞转录组学 | 伤口愈合 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据（单细胞转录组） | 未具体说明样本数量，但涉及小鼠模型。 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 未详细说明，可能使用10x Chromium单细胞3'试剂盒。 |
| 73 | 2026-08-06 |
Dual-scRNA-seq analysis reveals rare and uncommon parasitized cell populations in chronic L. donovani infection
2023-09-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113097
PMID:37682713
|
研究论文 | 利用双单细胞RNA测序分析慢性利什曼原虫感染小鼠脾脏和骨髓中的寄生细胞群体，发现罕见且非典型的寄生细胞类型 | 开发了双单细胞RNA测序方法，能同时分析宿主细胞和寄生虫转录组，无偏地检测罕见的寄生细胞群体 | 未提供明确的局限性信息 | 识别并注释慢性杜氏利什曼原虫感染中脾脏和骨髓内的寄生细胞群体 | 慢性感染小鼠的脾脏和骨髓细胞 | 单细胞转录组学 | 利什曼病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 慢性感染小鼠的脾脏和骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2026-08-06 |
Single-cell transcriptomic characterization of sheep conceptus elongation and implantation
2023-08-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112860
PMID:37494181
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析绵羊胚胎伸长和着床过程中胚胎与子宫内膜的转录组动态 | 首次对绵羊伸长前后胚胎及对应子宫内膜进行单细胞转录组表征，揭示了细胞类型分化的转变及多种配体-受体对介导的胚胎-母体对话 | 未提及局限性 | 阐明绵羊胚胎伸长和着床过程中细胞类型特异性的转录组调控机制及胚胎-子宫内膜相互作用 | 绵羊球形囊胚、伸长胚胎及对应子宫内膜组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，但涵盖球形囊胚和伸长胚胎及子宫内膜 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2026-08-04 |
A fibroblast-dependent TGFβ1/sFRP2 noncanonical Wnt signaling axis underlies epithelial metaplasia in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-Aug-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.02.551383
PMID:37577522
|
研究论文 | 本研究通过给予特发性肺纤维化患者EGCG并采用单细胞RNA测序，揭示了成纤维细胞分泌的sFRP2介导的TGFβ1非经典Wnt信号轴在驱动肺泡上皮化生中的作用 | 首次发现sFRP2作为TGFβ1的新型成纤维细胞靶基因，并阐明其通过Frizzled5受体介导非经典Wnt信号促进AEC2向基底细胞转分化，为IPF上皮功能障碍提供新机制 | 研究样本量有限，且主要基于体外类器官和肺切片模型，需要进一步体内验证及长期临床随访 | 探究肺泡成纤维细胞与上皮细胞间的相互作用在肺纤维化中的机制，并评估EGCG的潜在治疗价值 | 间质性肺病患者的肺活检组织、非疾病供体及终末期ILD组织、人类AEC2-成纤维细胞共培养类器官、正常供体精密切割肺切片 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 接受诊断性肺活检的ILD患者（具体数量未提供） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 76 | 2026-08-04 |
Global decoupling of cell differentiation from cell division in early embryo development
2023-Jul-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.29.551123
PMID:37546736
|
研究论文 | 本研究通过抑制斑马鱼胚胎细胞周期，结合单细胞RNA测序，发现细胞分裂在早期胚胎发育中对组织分化是非必需的，但影响细胞状态比例 | 首次通过两种独立方法全局阻断细胞分裂并联合单细胞转录组分析，揭示细胞分化与分裂在早期发育中的全局解耦关系 | 未明确细胞周期阻滞的具体分子机制及长期影响，且研究仅限于斑马鱼模型 | 阐明细胞分裂在早期胚胎发育中对细胞分化的作用 | 斑马鱼胚胎 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，涉及斑马鱼胚胎多个发育阶段 | 不明确 | 单细胞RNA-seq | 不明确 | 不明确 |
| 77 | 2026-08-04 |
Recording morphogen signals reveals origins of gastruloid symmetry breaking
2023-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.02.543474
PMID:37333235
|
研究论文 | 使用合成基因回路追踪胃类器官中的信号动态，揭示Wnt和TGF信号异质性如何驱动前后轴对称性破缺 | 创新点在于实时追踪单细胞信号历史，并识别关键的6小时窗口，表明细胞分选和差异粘附驱动对称性破缺 | 局限性包括类器官模型与体内环境的差异，以及合成回路可能带来的干扰 | 阐明干细胞胃类器官如何从均匀聚集体转变为极化结构并定义单一前后轴 | 哺乳动物干细胞形成的三维胃类器官 | 干细胞生物学 | NA | 合成基因回路、单细胞RNA测序、活体成像 | NA | 图像和基因表达数据 | 未明确 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于单细胞RNA测序的10x Chromium平台 |
| 78 | 2026-08-02 |
Single-cell isolation from full-thickness human intestinal tissue resections for single-cell RNA sequencing
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102686
PMID:37925636
|
研究论文 | 本文提出了一种从全层肠道组织切除标本中分离单细胞的方案，用于单细胞RNA测序。 | 提供了一套详细的从全层肠道组织中获取高质量单细胞悬液的标准化步骤，适用于10× Chromium平台。 | 摘要中未提及具体局限性，可能需要依赖固定和细胞质量评估步骤的准确性。 | 开发并验证从人类全层肠道组织切除标本中分离单细胞的有效流程，以支持单细胞RNA测序研究。 | 人类全层肠道组织切除标本。 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium平台 |
| 79 | 2026-08-02 |
Stricturing Crohn's Disease Single-Cell RNA Sequencing Reveals Fibroblast Heterogeneity and Intercellular Interactions
2023-11, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.07.014
PMID:37507073
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建克罗恩病狭窄肠壁的全层细胞图谱，揭示成纤维细胞异质性和细胞间相互作用，并验证CDH11作为潜在治疗靶点 | 首次生成狭窄肠道的单细胞RNA测序图谱，发现狭窄选择性变化主要发生在黏膜/黏膜下层，揭示CXCL14+和MMP/WNT5A+成纤维细胞的中心信号作用，并验证CDH11为潜在治疗靶点 | 未明确提及局限性，但研究基于有限样本量（13例克罗恩病和7例正常）及特定技术平台，可能存在批次效应或样本代表性不足 | 通过系统级分析表征克罗恩病狭窄形成中的成纤维细胞异质性及功能，为治疗靶点验证提供原理证明 | 克罗恩病患者的全层肠壁组织（包含非受累、炎症非狭窄和狭窄段）及正常非克罗恩病肠段 | 单细胞转录组学, 计算生物学 | 克罗恩病, 肠纤维化 | 单细胞RNA测序, NanoString nCounter, 下一代测序, 蛋白质组学, 动物模型 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 组织图像 | 13例克罗恩病全层切除标本（每例分为黏膜/黏膜下层和肌层，共99个组织样本，409,001个细胞）及7例正常非克罗恩病肠段 | 10x Genomics, NanoString, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 10x Chromium, NanoString nCounter, Illumina NovaSeq | 10x Chromium 单细胞3'端的单细胞RNA测序，NanoString nCounter 基因表达分析，Illumina NovaSeq 测序平台 |
| 80 | 2026-08-02 |
Stricturing Crohn's disease single-cell RNA sequencing reveals fibroblast heterogeneity and intercellular interactions
2023-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.534781
PMID:37066202
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建克罗恩病狭窄肠壁的细胞图谱，揭示成纤维细胞异质性及细胞间相互作用，并验证CDH11作为潜在治疗靶点 | 首个严格性克罗恩病全层肠壁的单细胞RNA测序图谱，识别出狭窄特异性成纤维细胞亚群及关键信号网络，并首次验证CDH11在纤维化中的促纤维化功能 | 样本量有限，且功能验证主要依赖体外实验和动物模型，需在更大临床队列中进一步验证 | 通过系统级研究解析克罗恩病狭窄形成中成纤维细胞的异质性和功能，识别新的治疗靶点 | 克罗恩病患者的手术切除肠壁组织（包括非受累、炎症非狭窄和狭窄段）及正常非克罗恩病肠壁组织 | 单细胞转录组学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序、NanoString nCounter、下一代测序、蛋白质组学 | 细胞间相互作用模型 | 单细胞基因表达数据、组织样本、蛋白质组数据 | 13例克罗恩病全层切除组织（99个组织样本，共409,001个细胞）和7例正常非克罗恩病肠段 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |