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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2025-10-07 |
Intestinal stem cell aging at single-cell resolution: Transcriptional perturbations alter cell developmental trajectory reversed by gerotherapeutics
2023-05, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13802
PMID:36864750
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究肠道干细胞衰老过程中的转录重编程及其对细胞发育轨迹的影响,并探索老年保护药物的逆转作用 | 首次在单细胞分辨率下揭示衰老导致的Lgr5肠道干细胞转录重编程如何改变细胞发育轨迹,并发现二甲双胍和雷帕霉素可逆转这些衰老效应 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究衰老对肠道干细胞功能及其子代细胞成熟过程的影响,以及老年保护药物的干预效果 | 小鼠肠道Lgr5阳性肠道干细胞及其子代细胞 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肠道细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 722 | 2025-10-07 |
Multiplex Immunohistochemistry Staining for Paraffin-embedded Lung Cancer Tissue
2023-11-21, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65850
PMID:38078595
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研究论文 | 本文开发了用于石蜡包埋肺癌组织的多重免疫组化染色实验方案 | 通过优化实验方案解决了肺组织自发荧光和通道串扰问题,实现了标记靶细胞和蛋白的多重免疫组化染色 | NA | 开发有效的多重免疫组化染色方法以解析肺癌肿瘤微环境中细胞间关系 | 临床来源的肺鳞状细胞癌石蜡包埋组织切片 | 数字病理学 | 肺癌 | 多重免疫组化,酪胺信号放大技术 | NA | 图像 | NA | NA | 多重免疫组化染色 | NA | 基于酪胺信号放大技术的多重免疫组化染色方法 |
| 723 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis profiles cellular and molecular alterations in submandibular gland and blood in IgG4-related disease
2023-10, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224363
PMID:37474274
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了IgG4相关疾病中颌下腺和血液的细胞与分子改变 | 发现了三种新型组织驻留免疫细胞亚群,揭示了TOP2A_B细胞和TOP2A_T细胞的分化轨迹,以及ICOS_PD-1_B细胞在B细胞向IgG4+浆细胞分化中的中间状态 | 样本量有限,需要在更大队列中验证发现 | 解析IgG4相关疾病的细胞种群和免疫细胞与非免疫细胞间的相互作用 | IgG4相关疾病患者和匹配对照的颌下腺组织和外周血单个核细胞 | 单细胞生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多重免疫荧光染色 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据, 免疫组库数据, 图像数据 | IgG4相关疾病患者和匹配对照的颌下腺和PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 724 | 2025-10-07 |
The covariance environment defines cellular niches for spatial inference
2023-Apr-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.18.537375
PMID:37131616
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研究论文 | 开发了一种名为COVET的细胞生态位表示方法和ENVI空间推断算法,用于整合空间转录组和单细胞RNA-seq数据 | 提出协方差环境(COVET)表示法捕捉细胞生态位的连续多变量性质,并开发基于最优传输的距离度量和环境变分推断(ENVI)算法 | NA | 解决多路空间分析技术中的计算挑战,开发细胞生态位的合适表示方法 | 细胞生态位和空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 条件变分自编码器 | 空间转录组数据,单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 725 | 2025-10-07 |
Distinct mechanisms for sebaceous gland self-renewal and regeneration provide durability in response to injury
2023-09-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113121
PMID:37715952
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研究论文 | 本研究揭示了皮脂腺在稳态下通过专用干细胞池自我更新,在损伤后通过毛囊来源的替代干细胞再生的双重机制 | 首次发现皮脂腺损伤后可通过毛囊 bulge 区的替代干细胞实现再生,且该过程依赖 FGFR2 信号通路并可被毛发生长加速 | 研究主要集中于小鼠背部皮肤模型,尚未验证其他部位或其他物种的适用性 | 探究皮脂腺在稳态维持和损伤应答中的细胞机制 | 小鼠皮脂腺及其干细胞 | 细胞生物学 | 皮肤损伤 | 靶向单细胞 RNA 测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | NA |
| 726 | 2025-10-07 |
Screening cell-cell communication in spatial transcriptomics via collective optimal transport
2023-02, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01728-4
PMID:36690742
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研究论文 | 开发了一种名为COMMOT的计算方法,通过集体最优传输技术分析空间转录组数据中的细胞间通讯 | 提出了考虑不同配体-受体物种竞争和细胞间空间距离的集体最优传输方法,能够处理复杂分子相互作用和空间约束 | NA | 推断空间转录组中的细胞间通讯 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术,单细胞RNA测序 | 最优传输模型,机器学习模型 | 空间转录组数据 | 模拟数据和8个空间数据集,涉及5种不同技术 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 727 | 2025-10-07 |
M2 macrophages drive leukemic transformation by imposing resistance to phagocytosis and improving mitochondrial metabolism
2023-04-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf8522
PMID:37058562
|
研究论文 | 本研究揭示了M2巨噬细胞通过降低吞噬活性和增强线粒体代谢促进急性髓系白血病转化的机制 | 首次发现M2巨噬细胞通过线粒体转移和代谢重编程保护白血病原始细胞免受吞噬,增强其体内转化潜能 | 研究样本量有限,机制研究仍需进一步深入 | 探究肿瘤微环境中免疫细胞如何促进急性髓系白血病的恶性进展 | 急性髓系白血病患者的骨髓样本和白血病原始细胞 | 肿瘤免疫学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,细胞表型数据 | 急性髓系白血病患者骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 728 | 2025-10-07 |
Piezo inhibition prevents and rescues scarring by targeting the adipocyte to fibroblast transition
2023-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.535302
PMID:37066136
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研究论文 | 本研究揭示了脂肪细胞通过机械传感转化为成纤维细胞驱动伤口纤维化的机制 | 首次证明机械力足以驱动脂肪细胞向成纤维细胞转化,并发现Piezo抑制可预防和挽救疤痕形成 | 研究主要基于小鼠模型和新型人源异种移植伤口模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究脂肪细胞在疤痕形成中的作用及其治疗潜力 | 脂肪细胞、成纤维细胞、伤口愈合过程 | 细胞生物学 | 皮肤疤痕 | 克隆谱系追踪、单细胞RNA测序、空间转录组学、CODEX多标检测 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、多标成像数据 | 小鼠伤口模型和人类异种移植伤口模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Visium | 空间转录组技术 |
| 729 | 2025-10-07 |
Disruption of cortical cell type composition and function underlies diabetes-associated cognitive decline
2023-08, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-05935-2
PMID:37351595
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了2型糖尿病引起大脑皮层细胞类型组成和功能紊乱的分子机制 | 首次在2型糖尿病模型中应用单细胞转录组测序技术系统分析大脑皮层细胞组成变化及其与认知功能下降的关联 | 研究样本量相对有限,且主要基于动物模型,人类样本验证仍需扩大 | 探索2型糖尿病相关认知功能下降的病理基础 | db/db糖尿病模型小鼠和2型糖尿病患者的大脑皮层组织 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞转录组测序,免疫组织化学,代谢评估,行为学测试 | NA | 单细胞RNA测序数据,蛋白质表达数据,行为学数据 | db/db糖尿病模型小鼠和对照小鼠,2型糖尿病患者(74.3±5.5岁)和对照个体(87.0±8.5岁) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 730 | 2025-10-07 |
T-BET and EOMES sustain mature human NK cell identity and antitumor function
2023-07-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI162530
PMID:37279078
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研究论文 | 本研究揭示了T-BET和EOMES转录因子在维持成熟人类NK细胞身份和抗肿瘤功能中的关键作用 | 首次在未扩增的原代人类NK细胞中使用CRISPR/Cas9技术删除T-BET和EOMES,发现这些转录因子不仅启动NK细胞发育,还持续维持其成熟状态和功能特性 | 研究主要关注原代人类NK细胞,未涉及其他物种或疾病模型 | 探究T-BET和EOMES转录因子在成熟人类NK细胞稳态、功能和分子编程中的持续需求 | 未扩增的原代人类NK细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | CRISPR/Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 原代人类NK细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 731 | 2025-10-07 |
Targeting Epsins to Inhibit Fibroblast Growth Factor Signaling While Potentiating Transforming Growth Factor-β Signaling Constrains Endothelial-to-Mesenchymal Transition in Atherosclerosis
2023-02-21, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过靶向Epsins蛋白调控成纤维细胞生长因子信号通路,抑制内皮-间质转化过程从而治疗动脉粥样硬化 | 首次揭示Epsins通过调控FGFR1内化和降解促进TGF-β信号通路的新机制,并开发了靶向治疗肽 | 研究主要基于小鼠模型,尚未进行人体临床试验验证 | 探究Epsins在动脉粥样硬化中促进内皮-间质转化的分子机制并评估治疗策略 | Apoe-/-基因敲除小鼠和谱系示踪/PCSK9突变病毒诱导的动脉粥样硬化小鼠模型 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,分子、细胞和生化分析,谱系示踪技术 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据 | 多种基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 732 | 2025-02-04 |
Post-ischemic inactivation of HIF prolyl hydroxylases in endothelium promotes maladaptive kidney repair by inducing glycolysis
2023-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.03.560700
PMID:37873349
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研究论文 | 本文研究了缺血性急性肾损伤(AKI)后内皮细胞中氧感应脯氨酰羟化酶(PHD)的作用及其对肾脏修复的影响 | 发现了内皮细胞中PHD1、PHD2和PHD3的联合失活促进不良肾脏修复的机制,并提出了通过抑制MCT4来恢复适应性肾脏修复的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型,人类肾脏样本的研究仍需进一步验证 | 探讨缺血性急性肾损伤后内皮细胞中PHD酶的作用及其对肾脏修复的影响 | 小鼠和人类肾脏内皮细胞 | 生物医学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类肾脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 733 | 2025-10-07 |
Genetic control of the dynamic transcriptional response to immune stimuli and glucocorticoids at single-cell resolution
2023-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.276765.122
PMID:37442575
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索糖皮质激素对免疫刺激后外周血单个核细胞转录反应的遗传调控机制 | 开发了新的统计方法量化基因表达变异性和响应伪时间,首次在单细胞水平揭示糖皮质激素逆转免疫刺激效应的动态转录调控 | 研究样本仅来自非裔美国儿童,可能限制结果在其他人群的普适性 | 阐明糖皮质激素对免疫刺激转录反应的动态调控机制及遗传基础 | 96名非裔美国儿童的外周血单个核细胞 | 单细胞基因组学 | 免疫相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 对角线线性判别分析 | 单细胞转录组数据 | 96名非裔美国儿童 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 734 | 2025-10-07 |
Mapping the landscape of lineage-specific dynamic regulation of gene expression using single-cell transcriptomics and application to genetics of complex disease
2023-Dec-14, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.10.24.23297476
PMID:37961453
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研究论文 | 开发单细胞转录组学框架量化基因表达动态遗传调控及其细胞类型特异性 | 建立细胞类型特异性和细胞状态调整的基因表达遗传模型,实现单细胞分辨率下基因表达动态遗传调控的量化 | 研究聚焦中脑神经元,模型在其他细胞类型中的普适性需进一步验证 | 解析遗传变异如何通过影响基因表达参与人类生物学过程和复杂疾病 | 诱导多能干细胞分化的中脑神经元 | 单细胞转录组学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | 遗传模型 | 单细胞转录组数据 | 英国生物银行1500多种表型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 735 | 2025-10-07 |
Neoadjuvant chemotherapy plus nivolumab with or without ipilimumab in operable non-small cell lung cancer: the phase 2 platform NEOSTAR trial
2023-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-02189-0
PMID:36928818
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研究论文 | 评估纳武利尤单抗联合化疗与联合伊匹木单抗在可手术非小细胞肺癌新辅助治疗中的疗效和生物标志物 | 首次在NEOSTAR平台试验中比较纳武利尤单抗+化疗与联合伊匹木单抗三药方案的病理缓解率,并通过单细胞测序和多平台免疫分析探索生物标志物 | 样本量较小(每组22例患者),II期试验需要更大规模验证 | 评估新辅助免疫治疗联合化疗在可手术非小细胞肺癌中的疗效和安全性 | 可手术的非小细胞肺癌患者 | 临床肿瘤学 | 肺癌 | 单细胞测序,多平台免疫分析,微生物组分析 | NA | 临床数据,基因组数据,微生物组数据 | 44例患者(每组22例) | NA | 单细胞RNA测序,免疫分析,微生物组测序 | NA | NA |
| 736 | 2025-10-07 |
PPARγ agonist treatment reduces fibroadipose tissue in secondary lymphedema by exhausting fibroadipogenic PDGFRα+ mesenchymal cells
2023-12-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.165324
PMID:38131378
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研究论文 | 本研究探讨PPARγ激动剂罗格列酮通过消耗PDGFRα+间充质细胞减少继发性淋巴水肿中纤维脂肪组织沉积的机制 | 首次发现促脂肪生成药物罗格列酮能同时减少淋巴水肿中的纤维化和脂肪组织沉积,揭示了PDGFRα+细胞在病理过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类组织验证有限,临床转化需要进一步研究 | 探究PPARγ激动剂治疗继发性淋巴水肿的机制和效果 | 继发性淋巴水肿小鼠模型和人类组织样本 | 病理生理学 | 淋巴水肿 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 组织学分析 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据, 组织图像 | 小鼠模型和人类组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 737 | 2025-10-07 |
Functional Pdgfra fibroblast heterogeneity in normal and fibrotic mouse lung
2023-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.164380
PMID:37824216
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了正常和纤维化小鼠肺中Pdgfra+成纤维细胞的功能异质性 | 首次在单细胞水平上描述了肺损伤后Pdgfra+脂成纤维细胞的转录组变化,并发现其获得促纤维化特性同时保留脂源性身份 | 研究仅限于小鼠模型,且观察时间点为损伤后14天,未涵盖纤维化全过程 | 探究肺损伤对Pdgfra+脂成纤维细胞功能的影响及其在肺纤维化中的作用机制 | 小鼠肺组织中的Pdgfra+成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序,PdgfraGFP谱系追踪,3D类器官模型 | NA | 单细胞转录组数据 | 正常和博来霉素损伤后14天的小鼠肺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 738 | 2025-10-07 |
Smooth muscle-derived adventitial progenitor cells direct atherosclerotic plaque composition complexity in a Klf4-dependent manner
2023-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.174639
PMID:37991018
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研究论文 | 本研究探讨平滑肌来源的外膜祖细胞通过Klf4依赖性方式调控动脉粥样硬化斑块组成复杂性 | 首次揭示AdvSca1-SM祖细胞在慢性动脉粥样硬化中的作用机制及Klf4基因对其分化和斑块组成的调控功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 阐明平滑肌来源外膜祖细胞在动脉粥样硬化中的功能及其分子调控机制 | 血管平滑肌来源的外膜祖细胞(AdvSca1-SM)及其在动脉粥样硬化斑块中的分化命运 | 心血管疾病研究 | 动脉粥样硬化 | scRNA-Seq, 流式细胞术, 组织学分析, 细胞谱系追踪 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 组织学图像 | 野生型和Klf4敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 739 | 2025-10-07 |
Coordinated immune dysregulation in Juvenile Dermatomyositis revealed by single-cell genomics
2023-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.07.566033
PMID:37986917
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研究论文 | 通过单细胞基因组学揭示幼年皮肌炎中协调的免疫失调机制 | 首次通过单细胞转录组学结合表面蛋白表达分析,发现B细胞区室向幼稚状态偏移是JDM的标志特征,并揭示I型干扰素反应与蛋白质加工失调和细胞死亡程序调控的协调网络 | 研究样本量有限,仅分析了血液样本,未涉及组织特异性免疫反应 | 解析幼年皮肌炎的免疫失调机制 | 幼年皮肌炎患者的外周血单核细胞 | 单细胞基因组学 | 幼年皮肌炎 | 单细胞转录组学,表面蛋白表达分析,免疫表型分析,网络分析 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白表达数据 | 不同疾病活动期的JDM患者血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 740 | 2025-10-07 |
Virus-specific TRM cells of both donor and recipient origin reside in human kidney transplants
2023-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172681
PMID:37751288
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研究论文 | 本研究表征了人类肾移植组织中组织驻留淋巴细胞的特征及其在抗病毒免疫中的潜在作用 | 首次发现肾移植中存在供体和受体来源的病毒特异性组织驻留记忆T细胞,并证明它们具有相似的转录组特征和共享的TCR克隆型 | 研究样本为肾移植切除组织,可能无法完全代表正常功能移植中的免疫状态 | 表征肾移植中组织驻留淋巴细胞的特征并研究其在抗病毒免疫中的作用 | 人类肾移植切除组织中的组织驻留淋巴细胞 | 免疫学 | 肾脏移植 | 单细胞转录组测序, T细胞受体测序, 病毒dextramer染色 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 流式细胞术数据 | 肾移植切除组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | NA |