单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 5350 篇文献，本页显示第 721 - 740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2025-10-07 |
Epigenetic Induction of Smooth Muscle Cell Phenotypic Alterations in Aortic Aneurysms and Dissections
2023-09-19, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了主动脉瘤和夹层中平滑肌细胞表型转变的表观遗传调控机制 | 首次发现IRF3通过STING-TBK1信号通路调控平滑肌细胞表型转变的表观遗传机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究主动脉瘤和夹层中平滑肌细胞表型转变的分子机制 | 小鼠主动脉平滑肌细胞和人类升主动脉瘤组织 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据,表观基因组数据 | 小鼠模型和人类主动脉瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 722 | 2025-10-07 |
Proximal immune-epithelial progenitor interactions drive chronic tissue sequelae post COVID-19
2023-Nov-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3587418/v1
PMID:38077031
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和成像技术揭示了COVID-19后遗症中免疫细胞与上皮祖细胞相互作用的机制 | 首次发现肺驻留CD8 T细胞-巨噬细胞相互作用在维持异常上皮祖细胞和驱动纤维化后遗症中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人类患者中进一步验证 | 阐明呼吸道COVID-19后遗症的病理生理机制 | PASC患者和小鼠模型中的肺组织 | 空间转录组学 | COVID-19后遗症 | 空间转录组学, 成像技术 | 小鼠疾病模型 | 空间转录组数据, 图像数据 | 三个独立的PASC患者队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 723 | 2025-10-07 |
Expansion spatial transcriptomics
2023-08, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01911-1
PMID:37349575
|
研究论文 | 本研究提出了一种扩展空间转录组学方法，通过组织透明化和膨胀处理提高基因表达检测的空间分辨率 | 通过组织透明化和膨胀处理结合改进的捕获协议，突破了传统空间转录组技术中阵列密度对分辨率的限制 | 仅在小鼠脑样本中进行了验证，尚未在其他组织类型或物种中测试 | 开发高分辨率空间转录组学技术以更精确解析组织中的基因表达模式 | 小鼠脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，polyA转录组捕获 | NA | 基因表达数据，空间位置信息 | 小鼠脑样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 724 | 2025-10-07 |
Generation and Functional Analysis of Defective Viral Genomes during SARS-CoV-2 Infection
2023-06-27, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00250-23
PMID:37074178
|
研究论文 | 本研究阐明了SARS-CoV-2感染过程中缺陷病毒基因组的生成机制及其与宿主抗病毒免疫反应的关系 | 首次发现SARS-CoV-2缺陷病毒基因组与持续性病毒感染相关，并识别了四个基因组重组热点区域 | 缺陷病毒基因组生成的具体分子机制仍需进一步研究 | 探究SARS-CoV-2缺陷病毒基因组的生成机制和免疫功能 | SARS-CoV-2病毒和COVID-19患者样本 | 病毒学 | COVID-19 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 二代测序 | NA | 转录组测序数据 | COVID-19患者感染样本和尸检肺组织 | NA | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 725 | 2025-10-07 |
Preparation of noninfectious scRNAseq samples from SARS-CoV-2-infected epithelial cells
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0281898
PMID:36827401
|
研究论文 | 开发了一种从SARS-CoV-2感染细胞制备非传染性单细胞RNA测序样本的方法 | 首次建立甲醇-丙酮灭活方法，使单细胞RNA测序分析可在BSL2实验室安全进行 | 方法仅在非洲绿猴肾上皮细胞和原代人肺上皮细胞中验证，需进一步测试其他细胞类型 | 开发安全研究SARS-CoV-2的高通量分子检测方法 | SARS-CoV-2感染的非洲绿猴肾上皮细胞和原代人肺上皮细胞 | 单细胞测序 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，组织培养感染剂量测定 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 非洲绿猴肾上皮细胞和原代人肺上皮细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 726 | 2025-10-07 |
Multiplexed single-cell lineage tracing of mitotic kinesin inhibitor resistance in glioblastoma
2023-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.09.557001
PMID:37745469
|
研究论文 | 利用多重单细胞谱系追踪和单细胞RNA测序技术研究胶质母细胞瘤对KIF11抑制剂的耐药机制 | 首次在患者来源的胶质母细胞瘤神经球中应用多重谱系追踪条码技术，揭示长期KIF11抑制剂治疗诱导细胞向预后较好的前神经表型转变 | 主要基于体外细胞模型研究，动物模型验证相对有限 | 探究胶质母细胞瘤对KIF11抑制剂ispinesib产生耐药性的机制 | 患者来源的胶质母细胞瘤神经球细胞 | 单细胞测序分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 多重谱系追踪条码技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 患者来源的胶质母细胞瘤神经球细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 727 | 2025-10-07 |
Ancestry-based differences in the immune phenotype are associated with lupus activity
2023-08-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169584
PMID:37606045
|
研究论文 | 通过多组学方法揭示系统性红斑狼疮中与种族相关的免疫表型差异及其对疾病严重程度的影响 | 首次结合质谱流式、单细胞转录组/蛋白质组和血浆介质分析，系统揭示黑人SLE患者特有的免疫细胞活化和表观遗传特征 | 研究样本仅限于黑人和白人群体，未涵盖其他种族群体 | 探究种族相关的免疫表型差异如何影响系统性红斑狼疮的疾病严重程度 | 系统性红斑狼疮患者和健康对照者的免疫细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 质谱流式技术, 单细胞转录组学, 单细胞蛋白质组学, 多重血浆介质检测 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | 未明确样本数量（包含SLE患者和健康对照） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 | NA | 基于液滴的单细胞转录组学和蛋白质组学技术 |
| 728 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct T cell populations in immune-related adverse events of checkpoint inhibitors
2023-01-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100868
PMID:36513074
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示检查点抑制剂免疫相关不良事件中不同的T细胞群体 | 首次使用单细胞RNA测序技术结合K近邻网络图分析，识别了不同免疫相关不良事件中特定的T细胞亚群和基因特征 | 样本量有限，仅分析了特定几种免疫相关不良事件，需要更大规模研究验证 | 研究抗PD-1治疗期间T细胞的细胞变化，探索免疫相关不良事件的机制 | 癌症患者的循环T细胞 | 单细胞组学 | 癌症免疫治疗相关不良事件 | 单细胞RNA测序 | K近邻网络图布局 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 729 | 2025-10-07 |
Rapid and Quantitative Functional Interrogation of Human Enhancer Variant Activity in Live Mice
2023-Dec-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.10.570890
PMID:38105996
|
研究论文 | 开发了一种基于Cas9的双色荧光报告系统dual-enSERT，用于在活体小鼠中快速定量比较增强子等位基因活性 | 首次实现活体小鼠中增强子变体功能的快速定量分析，可在两周内完成从候选变异识别到胚胎活体分析的全流程 | 主要依赖小鼠模型，在人类疾病直接应用方面存在局限性 | 开发高效分析人类非编码变体功能的方法 | 与肢体多指症、自闭症和颅面畸形相关的增强子变体 | 功能基因组学 | 先天性畸形 | CRISPR-Cas9基因编辑，单细胞转录组测序 | 双色荧光报告系统 | 荧光成像数据，单细胞RNA测序数据 | 活体小鼠胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 730 | 2025-10-07 |
Bioinformatics and system biology analysis revealed the crosstalk between COVID-19 and osteoarthritis
2023-12, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.1123
PMID:38156385
|
研究论文 | 通过生物信息学和系统生物学分析揭示COVID-19与骨关节炎之间的相互作用机制 | 首次通过生物信息学方法系统识别COVID-19与骨关节炎的共同病理机制，发现4个关键枢纽基因及相关调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证；样本来源和数量未明确说明 | 探索COVID-19与骨关节炎之间的共同病理机制和潜在治疗靶点 | COVID-19患者和骨关节炎患者的基因表达数据，以及OA小鼠模型 | 生物信息学 | COVID-19, 骨关节炎 | 差异表达基因分析, 蛋白互作网络分析, 功能富集分析, qPCR, Western Blot, 单细胞RNA测序 | OA小鼠模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 731 | 2025-10-07 |
Transcriptomic research in atherosclerosis: Unravelling plaque phenotype and overcoming methodological challenges
2023-Dec, Journal of molecular and cellular cardiology plus
DOI:10.1016/j.jmccpl.2023.100048
PMID:39802625
|
综述 | 本文探讨转录组学在动脉粥样硬化斑块表型研究中的应用价值及方法论挑战 | 系统阐述整合多组学数据与机器学习在动脉粥样硬化研究中的创新价值 | 研究结果可重复性低且缺乏标准化流程 | 通过转录组学研究揭示动脉粥样硬化斑块表型及推进精准医疗 | 动脉粥样硬化斑块 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | bulk sequencing, single-cell sequencing | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 732 | 2025-10-07 |
Size matters: the impact of nucleus size on results from spatial transcriptomics
2023-04-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04129-z
PMID:37081484
|
研究论文 | 本研究探讨了连续切片数据整合方法对空间转录组学分析结果的影响 | 提出了连续切片数据整合方法，解决了细胞核尺寸超过组织切片厚度时对转录组数据捕获的负面影响 | 研究仅针对人类死后大脑组织，未验证在其他组织类型中的适用性 | 评估连续切片数据整合对空间转录组学spot聚类和解卷积准确性的影响 | 人类死后大脑组织切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单核RNA测序 | 无监督聚类 | 空间基因表达数据，组织学图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium Spatial Gene Expression |
| 733 | 2025-10-07 |
Sex specific molecular networks and key drivers of Alzheimer's disease
2023-06-20, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-023-00624-5
PMID:37340466
|
研究论文 | 通过系统生物学方法研究阿尔茨海默病中性别特异性分子网络和关键驱动因子 | 首次通过多组学网络分析识别LRP10作为AD性别差异的关键网络调节因子，并验证其在性别和APOE基因型特异性中的作用机制 | 研究主要基于死后脑组织样本，可能无法完全反映疾病发展过程中的动态变化 | 阐明阿尔茨海默病性别差异的分子机制 | 人类死后脑组织样本和AD小鼠模型 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 转录组学、单细胞RNA测序、酵母双杂交系统、基因扰动实验 | 网络分析、共表达网络 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 两个队列（MSBB和ROSMAP）的大规模人类死后脑样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 734 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Global Markers of Transcriptional Diversity across Different Forms of Cellular Senescence
2023, Aging biology
DOI:10.59368/agingbio.20230008
PMID:39781544
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析不同形式细胞衰老中的转录多样性全局标志物 | 首次通过单细胞转录组学系统比较三种主要衰老形式（癌基因诱导衰老、复制性衰老和DNA损伤诱导衰老），发现不同衰老形式共有的细胞亚群及其特征 | 研究基于基因同质的克隆细胞系，可能无法完全反映体内衰老细胞的复杂性 | 探索不同形式细胞衰老中的转录多样性及其共同特征 | 基因同质的克隆细胞系（包括癌基因诱导衰老、复制性衰老和DNA损伤诱导衰老） | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种衰老形式的克隆细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 735 | 2025-10-07 |
Benchmarking single-cell hashtag oligo demultiplexing methods
2023-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad086
PMID:37829177
|
研究论文 | 本研究对七种单细胞哈希寡核苷酸(HTO)解复用工具进行了性能评估和比较 | 首次使用遗传变异数据作为'地面真实值'来系统评估HTO解复用工具的性能 | 研究结果可能受限于所使用的特定数据集和实验条件 | 评估和比较单细胞HTO解复用方法的准确性和可靠性 | 七种HTO解复用工具(hashedDrops, HTODemux, GMM-Demux, demuxmix, deMULTIplex, BFF, HashSolo) | 单细胞测序数据分析 | NA | 单细胞RNA测序, 哈希寡核苷酸标记 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 736 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomic interrogation of the murine bone marrow signaling landscape
2023-11-06, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-023-00298-1
PMID:37926705
|
研究论文 | 本研究结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，探索小鼠骨髓中骨骼干细胞和祖细胞的信号调控网络 | 首次将空间转录组学应用于完全矿化组织，并开发结合空间和单细胞转录组学的分析方法 | 研究仅限于成年小鼠股骨组织，尚未验证于其他物种或病理条件 | 解析骨骼干细胞和祖细胞在骨髓微环境中的空间分布和调控机制 | 成年小鼠股骨中的骨骼干细胞和祖细胞及其微环境 | 空间转录组学 | 骨骼疾病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 多重反卷积分析 | 预测建模流程 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 成年小鼠股骨样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 737 | 2025-10-07 |
Elimination of senescent cells by treatment with Navitoclax/ABT263 reverses whole brain irradiation-induced blood-brain barrier disruption in the mouse brain
2023-10, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-00870-x
PMID:37642933
|
研究论文 | 本研究通过Navitoclax/ABT263清除衰老细胞，逆转全脑照射导致的小鼠血脑屏障破坏 | 首次证明清除衰老内皮细胞可逆转辐射引起的血脑屏障破坏 | 样本量有限，仅在小鼠模型中进行研究 | 探究全脑照射诱导内皮细胞衰老与血脑屏障破坏的因果关系 | 转基因p16-3MR小鼠 | 神经科学 | 脑转移瘤 | 双光子显微镜、成像流式细胞术、免疫标记、单细胞RNA测序 | 动物模型 | 图像、序列数据 | 转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 738 | 2025-10-07 |
Accelerated cerebromicrovascular senescence contributes to cognitive decline in a mouse model of paclitaxel (Taxol)-induced chemobrain
2023-07, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13832
PMID:37243381
|
研究论文 | 本研究探讨了紫杉醇诱导的脑血管内皮细胞衰老在化疗脑认知功能下降中的作用机制 | 首次证明紫杉醇诱导的脑血管内皮细胞衰老是化疗脑的关键致病机制，并通过遗传和药理学方法清除衰老细胞逆转了认知功能障碍 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证 | 阐明紫杉醇诱导认知功能障碍的分子机制并探索潜在治疗策略 | 转基因p16-3MR小鼠 | 神经科学 | 化疗相关认知障碍 | 流式细胞术，单细胞转录组测序 | NA | 生理功能数据，分子生物学数据，行为学数据 | 转基因小鼠模型 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 739 | 2025-01-07 |
Protocols for single-cell RNA-seq and spatial gene expression integration and interactive visualization
2023-03-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102047
PMID:36853708
|
研究论文 | 本文提供了整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间基因表达数据的协议，并展示了如何创建交互式网络应用来可视化和分享结果 | 提供了使用Seurat和Giotto软件包整合scRNA-seq和空间转录组数据的详细协议，并展示了如何创建交互式网络应用 | 协议仅适用于特定数据集，可能不适用于所有类型的scRNA-seq和空间转录组数据 | 整合单细胞RNA测序和空间基因表达数据，以解析细胞类型分布 | 人类输尿管scRNA-seq数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据，空间基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 740 | 2025-01-03 |
Single-Cell Sequencing in Neurodegenerative Disorders
2023-09, Molecular diagnosis & therapy
IF:4.1Q1
DOI:10.1007/s40291-023-00668-9
PMID:37552451
|
综述 | 本文回顾了单细胞测序技术在神经退行性疾病中的应用及其最新进展 | 利用单细胞组学技术深入探索神经退行性疾病中的细胞异质性，为诊断和治疗提供新视角 | 目前主要关注转录组变化，未来需要进一步技术发展以更好地理解和操纵相关通路 | 探讨单细胞测序技术在神经退行性疾病中的应用及其潜力 | 帕金森病、阿尔茨海默病、亨廷顿病和多发性硬化症等常见神经退行性疾病 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |