单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5354 篇文献，本页显示第 681 - 700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2024-09-05 |
Mast-Cell Expressed Membrane Protein-1 (MCEMP1) is expressed in classical monocytes and alveolar macrophages in Idiopathic Pulmonary Fibrosis and regulates cell chemotaxis, adhesion, and migration in a TGFβ dependent manner
2023-Oct-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.07.561349
PMID:37873485
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研究论文 | 本文研究了MCEMP1在特发性肺纤维化中的表达及其对细胞趋化、粘附和迁移的调控作用 | 首次揭示了MCEMP1在特发性肺纤维化中通过TGFβ依赖的方式调控单核细胞的趋化、粘附和迁移 | NA | 探究MCEMP1在特发性肺纤维化中的机制作用 | MCEMP1在特发性肺纤维化患者中的表达及其功能 | NA | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、染色质免疫沉淀、邻近连接分析、RNA干扰、慢病毒转导、批量RNA测序、活性RHO下拉实验 | NA | RNA | 来自特发性肺纤维化患者和对照组的PBMC和肺组织样本，以及THP-1细胞 |
| 682 | 2024-09-05 |
ER stress mediates Angiotensin II-augmented innate immunity memory and facilitates distinct susceptibilities of thoracic from abdominal aorta to aneurysm development
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1268916
PMID:37731512
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研究论文 | 研究通过转录组分析探讨了内质网（ER）应激和训练免疫在Ang II诱导的动脉瘤模型中的作用，发现Ang II在腹部主动脉（AA）中诱导更强的炎症反应和基因上调，以及ER应激在不同主动脉中的不同作用。 | 首次聚焦于内质网应激的转录组分析，揭示了内质网作为感知多种DAMPs并启动ER应激的免疫细胞器的作用，以及其在Ang II加速训练免疫和不同主动脉对疾病易感性差异中的作用。 | NA | 确定内质网（ER）应激和训练免疫在Ang II诱导的动脉瘤发展中的作用 | 胸主动脉（TA）和腹主动脉（AA） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 胸主动脉（TA）和腹主动脉（AA）样本 |
| 683 | 2024-09-04 |
Single-cell level deconvolution, convolution, and clustering in spatial transcriptomics by aligning spot level transcriptome to nuclear morphology
2023-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.17.572084
PMID:38187541
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研究论文 | 本文提出了一种名为STIE的EM算法，通过将空间转录组数据与基于组织学图像的核形态对齐，实现了单细胞水平的空间转录组解卷积、卷积和聚类。 | STIE算法通过核形态相似性和邻域信息，填补了高达70%的间隙区域，实现了真正的单细胞水平和全切片尺度的解卷积/卷积和聚类。 | NA | 实现单细胞水平的空间转录组分析，提高空间转录组数据的分辨率和准确性。 | 空间转录组数据与组织学图像的核形态对齐，以及单细胞水平的解卷积、卷积和聚类。 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | EM算法 | 空间转录组数据 | NA |
| 684 | 2024-09-04 |
Convergent alterations in the tumor microenvironment of MYC-driven human and murine prostate cancer
2023-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.07.553268
PMID:37905029
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和分子病理学方法，探讨了MYC驱动的肿瘤微环境在人类和小鼠前列腺癌中的变化 | 首次在MYC驱动的肿瘤微环境中，通过单细胞RNA测序技术揭示了人类和小鼠前列腺癌中细胞状态的保守性 | 研究主要依赖于基因工程小鼠模型，可能与人类前列腺癌的实际情况存在差异 | 探究MYC信号激活在前列腺癌肿瘤微环境变化中的作用 | 人类和小鼠的前列腺癌细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | RNA | 涉及人类和小鼠的前列腺癌组织样本 |
| 685 | 2024-09-04 |
Single-cell RNA sequencing deciphers the mechanism of sepsis-induced liver injury and the therapeutic effects of artesunate
2023-Sep, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-023-01065-y
PMID:37041228
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了脓毒症诱导的肝脏损伤机制及青蒿琥酯的治疗效果 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了脓毒症对肝脏细胞的具体影响，并评估了青蒿琥酯的肝保护作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未进行临床试验验证 | 探讨脓毒症对肝脏的影响及青蒿琥酯的肝保护机制 | 小鼠肝脏在脓毒症感染后的细胞反应及青蒿琥酯的治疗效果 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 686 | 2024-09-01 |
Cell-intrinsic effects of clonal hematopoiesis in heart failure
2023-Sep, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-023-00322-x
PMID:39196061
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研究论文 | 本文研究了克隆性造血（CHIP）在心力衰竭患者中的细胞内在效应 | 使用改进的单细胞测序流程（MutDetect-Seq）展示了DNMT3A突变型单核细胞、CD4+ T细胞和NK细胞的基因表达谱改变，并验证了突变型与野生型单核细胞和T细胞之间的旁分泌信号通路 | NA | 探讨CHIP在心力衰竭患者中的细胞内在效应及其对预后的影响 | 心力衰竭患者中的CHIP突变细胞 | NA | 心力衰竭 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 687 | 2024-09-01 |
Stress resilience-enhancing drugs preserve tissue structure and function in degenerating retina via phosphodiesterase inhibition
2023-05-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2221045120
PMID:37126699
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研究论文 | 本文通过系统药理学平台，利用单细胞转录组学、蛋白质组学和磷酸蛋白质组学，研究了通过选择性抑制环核苷酸磷酸二酯酶（PDEs）来增强退化视网膜的应激抵抗能力，从而保护组织结构和功能。 | 本文首次报道了通过靶向抑制PDEs来稳定转录组、蛋白质组和磷酸蛋白质组，激活保护机制并协同抑制退化过程，从而增强视网膜对急性及慢性应激的抵抗能力。 | NA | 开发新的治疗策略，以应对慢性进行性视网膜疾病，如年龄相关性黄斑变性、糖尿病视网膜病变和视网膜色素变性。 | 年龄相关性和遗传性视网膜退化模型。 | 系统药理学 | 视网膜疾病 | 单细胞转录组学、蛋白质组学和磷酸蛋白质组学 | NA | 转录组、蛋白质组和磷酸蛋白质组数据 | 多种年龄相关性和遗传性视网膜退化模型的细胞样本 |
| 688 | 2024-08-31 |
Antigen-specific CD4+ T cells exhibit distinct transcriptional phenotypes in the lymph node and blood following vaccination in humans
2023-Sep-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3304466/v1
PMID:37790414
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研究论文 | 本研究评估了BNT162b2 mRNA疫苗接种后人类血液和引流淋巴结中刺突特异性CD4 T细胞的单细胞转录组学特征 | 本研究定义了新的克隆型，并使用基于深度学习的反向表位映射方法Trex来预测抗原特异性 | NA | 研究SARS-CoV-2感染和mRNA疫苗接种诱导的CD4 T细胞反应及其在保护性免疫中的作用 | 人类血液和引流淋巴结中的刺突特异性CD4 T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学 | 深度学习 | 转录组数据 | 多个刺突特异性CD4 T细胞克隆型 |
| 689 | 2024-08-30 |
Loss of metabolic fitness drives tumor resistance after CAR-NK cell therapy and can be overcome by cytokine engineering
2023-07-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add6997
PMID:37494448
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术分析了CAR-NK细胞在体内的异质性和进化过程，特别是在肿瘤控制到复发阶段的变化。 | 研究发现了与体内进化和肿瘤控制不同阶段相关的NK细胞群的激活、功能和代谢特征的独特模式，并证明了通过在CAR构建体中加入IL-15可以部分克服肿瘤高度代谢活性导致的NK细胞代谢适应性丧失。 | 研究主要基于一个非治愈性淋巴瘤的临床前模型和一个响应者与一个非响应者的患者样本，可能需要更多样本和不同类型的肿瘤模型来验证结果。 | 探讨CAR-NK细胞治疗后肿瘤抵抗的机制及其克服方法。 | CAR-NK细胞的异质性、体内进化及其与肿瘤控制的关系。 | 生物技术 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | 一个响应者和一个非响应者的患者样本 |
| 690 | 2024-08-29 |
SPASCER: spatial transcriptomics annotation at single-cell resolution
2023-01-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac889
PMID:36243975
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研究论文 | 本文构建了一个名为SPASCER的新型空间转录组数据库，旨在帮助理解组织结构的异质性、区域特异性微环境及跨组织结构的多层次细胞间相互作用 | SPASCER数据库整合了来自43项研究的1082个子数据集，涵盖四种物种的16种器官类型，并结合scRNA-seq数据进行空间转录组的解卷积/映射，以及空间细胞间相互作用、基因模式和通路富集分析 | NA | 研究目的是通过构建SPASCER数据库，深入理解健康和疾病组织中的生物学过程机制 | 研究对象包括组织结构异质性、区域特异性微环境及细胞间相互作用 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 43项研究的1082个子数据集，涵盖16种器官类型，涉及四种物种 |
| 691 | 2024-08-27 |
Dual inhibition of glycolysis and glutaminolysis for synergistic therapy of rheumatoid arthritis
2023-09-20, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-023-03161-0
PMID:37730663
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研究论文 | 研究通过双重抑制糖酵解和谷氨酰胺分解途径，探讨其在类风湿性关节炎治疗中的协同作用 | 提出通过双重抑制糖酵解和谷氨酰胺分解途径作为治疗类风湿性关节炎的新方法 | NA | 探讨双重抑制糖酵解和谷氨酰胺分解途径在类风湿性关节炎治疗中的潜在协同作用 | 类风湿性关节炎中的滑膜成纤维细胞 | NA | 类风湿性关节炎 | scRNA-seq, H1-核磁共振波谱 | NA | 细胞类型, 基因表达 | 涉及人类滑膜细胞和关节炎小鼠模型 |
| 692 | 2024-08-27 |
CTLA-4 tail fusion enhances CAR-T antitumor immunity
2023-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01571-5
PMID:37500885
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研究论文 | 本文通过将细胞毒性T淋巴细胞相关抗原-4（CTLA-4）的细胞质尾部融合到嵌合抗原受体（CAR）的C端，重新编程CAR功能，显著增强了CAR-T细胞的体内疗效 | 通过融合CTLA-4的细胞质尾部到CAR的C端，实现了CAR-T细胞功能的重新编程，从而提高了其抗肿瘤免疫效果 | NA | 研究如何通过融合CTLA-4的细胞质尾部到CAR的C端来增强CAR-T细胞的抗肿瘤免疫效果 | 嵌合抗原受体T细胞（CAR-T）及其在抗肿瘤免疫中的应用 | 免疫学 | 白血病 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 693 | 2024-08-27 |
Graft dysfunction in compassionate use of genetically engineered pig-to-human cardiac xenotransplantation: a case report
2023-07-29, Lancet (London, England)
DOI:10.1016/S0140-6736(23)00775-4
PMID:37393920
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病例报告 | 本文报告了一例基因工程猪心脏异种移植到人类心脏的同情使用案例，详细描述了移植后的功能障碍及其原因 | 成功避免了超急性排斥反应，并识别了潜在的血管内皮损伤介质 | 文章主要关注单一病例，可能缺乏更广泛的临床数据支持 | 探讨基因工程猪心脏异种移植后的功能障碍及其潜在原因 | 基因工程猪心脏异种移植的功能和排斥反应 | NA | 心脏衰竭 | 电子显微镜、DNA PCR、RNA转录、单细胞RNA测序 | NA | 组织、细胞 | 单一病例 |
| 694 | 2024-08-27 |
Profiling Transcriptional Heterogeneity with Seq-Well S3: A Low-Cost, Portable, High-Fidelity Platform for Massively Parallel Single-Cell RNA-Seq
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2756-3_3
PMID:36495445
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研究论文 | 本文介绍了Seq-Well S3平台，这是一种低成本、便携式、高保真的单细胞RNA测序技术，能够同时分析数千个细胞的转录组 | Seq-Well S3通过引入第二链合成步骤，增强了从单个细胞捕获的信息量，提高了通常在原始Seq-Well协议中遗漏的细胞转录本的检测 | NA | 旨在改进Seq-Well技术，提高单细胞RNA测序的信息捕获能力 | 单细胞RNA测序技术Seq-Well S3及其应用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数千个细胞 |
| 695 | 2024-08-25 |
Behind the Indolent Facade: Uncovering the Molecular Features and Malignancy Potential in Lung Minimally Invasive Adenocarcinoma by Single-Cell Transcriptomics
2023-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303753
PMID:37991139
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了肺微小侵袭性腺癌（MIA）的分子特征及其恶性潜能 | 首次通过单细胞转录组学分析，揭示了MIA与侵袭性腺癌（IA）之间的联系和异质性，并发现了可能导致MIA恶性进展的机制 | 研究样本仅来自三位患者，可能影响结果的普遍性 | 揭示肺微小侵袭性腺癌的分子特征及其恶性潜能 | 肺微小侵袭性腺癌（MIA）及其免疫微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 156,447个细胞，来自三位同步多发性肺腺癌患者的MIA和IA肿瘤样本、外周血单个核细胞及邻近正常组织样本 |
| 696 | 2024-08-25 |
Single-Cell Analysis Reveals Malignant Cells Reshape the Cellular Landscape and Foster an Immunosuppressive Microenvironment of Extranodal NK/T-Cell Lymphoma
2023-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303913
PMID:37949673
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了外周NK/T细胞淋巴瘤的肿瘤微环境，揭示了恶性NK细胞在重塑细胞景观和促进免疫抑制微环境中的关键作用 | 首次在单细胞分辨率下解析了外周NK/T细胞淋巴瘤肿瘤微环境的异质组成，强调了携带EBV编码LMP1的恶性NK细胞在重塑细胞景观和促进免疫抑制微环境中的重要作用 | NA | 更好地理解外周NK/T细胞淋巴瘤的异质性起源 | 外周NK/T细胞淋巴瘤的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个患者队列 |
| 697 | 2024-08-25 |
Single-Cell RNA-Sequencing Provides Insight into Skeletal Muscle Evolution during the Selection of Muscle Characteristics
2023-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202305080
PMID:37870215
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术（scRNA-seq）探讨了人工选择对猪骨骼肌细胞特征的影响 | 本研究首次提供了全景式的肌肉常驻细胞特征，并识别了新的和品种特异性的细胞类型，以及它们在伪时间轨迹上的分布 | NA | 探究人工选择对骨骼肌细胞特征的影响及其机制 | 猪的骨骼肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及不同品种的猪的骨骼肌细胞 |
| 698 | 2024-08-25 |
Identification and Characterization of CD8+ CD27+ CXCR3- T Cell Dysregulation and Progression-Associated Biomarkers in Systemic Lupus Erythematosus
2023-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202300123
PMID:37875396
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研究论文 | 本研究通过质谱流式细胞术、流式细胞术和单细胞RNA测序，全面分析了263例临床外周血样本中系统性红斑狼疮（SLE）患者的免疫细胞失调情况，并探讨了CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在SLE病理和疾病进展中的作用。 | 本研究首次详细描述了CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在SLE中的失调情况及其与疾病活动性的关联，并构建了动态网络生物标志物（DNB）模型，用于预测SLE的疾病进展。 | NA | 探讨CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在系统性红斑狼疮（SLE）中的失调情况及其作为疾病进展相关生物标志物的潜力。 | CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在系统性红斑狼疮（SLE）中的作用及其作为生物标志物的可能性。 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 质谱流式细胞术、流式细胞术、单细胞RNA测序 | 动态网络生物标志物（DNB）模型 | 外周血样本 | 263例临床外周血样本，包括活动性SLE（aSLE）、缓解期SLE（rSLE）和健康对照（HCs） |
| 699 | 2024-08-25 |
Loss of ATOH1 in Pit Cell Drives Stemness and Progression of Gastric Adenocarcinoma by Activating AKT/mTOR Signaling through GAS1
2023-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202301977
PMID:37824217
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研究论文 | 研究探讨了ATOH1在胃癌干细胞维持中的作用及其通过GAS1激活AKT/mTOR信号通路促进胃腺癌进展的机制 | 首次揭示了ATOH1通过调控GAS1和RET/AKT/mTOR信号通路影响胃癌干细胞的维持和化疗耐药性 | 研究主要基于小鼠模型和组织样本，需要进一步的人体临床试验验证 | 阐明ATOH1在胃癌干细胞维持中的作用及其分子机制 | 胃癌干细胞及胃腺癌样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 包括小鼠模型和胃腺癌组织样本 |
| 700 | 2024-08-23 |
Single-cell RNA sequencing identifies eggplant as a regulator of germ cell development in Drosophila
2023-Oct-09, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256475
PMID:37603128
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNAi筛选和生物信息学分析，鉴定了影响果蝇卵巢生殖干细胞（GSCs）发育的基因，特别是名为eggplant（eggpl）的基因 | 首次鉴定并命名了eggplant基因，并揭示了其在调节生殖细胞增殖和分化中的作用 | NA | 探索调节果蝇早期生殖细胞发育的信号网络 | 果蝇卵巢生殖干细胞（GSCs）及其发育过程中的基因调控 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 包括34个在早期生殖细胞发育中表达上调的基因和19个可能调节生殖细胞分化的基因 |