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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2025-10-07 |
APOE deficiency impacts neural differentiation and cholesterol biosynthesis in human iPSC-derived cerebral organoids
2023-08-21, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03444-y
PMID:37605285
|
研究论文 | 本研究通过人类iPSC来源的脑类器官探究APOE缺失对神经分化和胆固醇生物合成的影响 | 首次在人类iPSC来源的脑类器官模型中系统研究APOE缺失对脑稳态的影响,并发现其通过EIF2和Wnt/β-catenin信号通路调节细胞组成和脂质代谢 | 研究仅使用体外脑类器官模型,未在体内验证结果 | 探究APOE基因在脑稳态中的作用及其作为阿尔茨海默病最强遗传风险因子的机制 | 人类iPSC来源的脑类器官 | 干细胞生物学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 脑类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 亲代iPSC系及其同基因APOE缺陷系衍生的脑类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 642 | 2025-03-20 |
FRC transplantation restores lymph node conduit defects in laminin α4-deficient mice
2023-04-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.167816
PMID:37092548
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研究论文 | 本研究揭示了细胞外基质Lama4在调节淋巴结导管中的特定作用,并探讨了FRC移植对Lama4缺陷小鼠淋巴结导管缺陷的修复作用 | 首次揭示了FRC衍生的Lama4在维持导管纤维完整性中的关键作用,并展示了通过FRC移植修复Lama4缺陷小鼠的淋巴结导管结构和功能的创新方法 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探讨FRC衍生的Lama4在调节淋巴结导管结构和功能中的作用,并评估FRC移植对Lama4缺陷小鼠的修复效果 | Lama4缺陷小鼠及其淋巴结导管 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Lama4缺陷小鼠及其淋巴结组织 | NA | NA | NA | NA |
| 643 | 2025-03-20 |
LAL deficiency induced myeloid-derived suppressor cells as targets and biomarkers for lung cancer
2023-03, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-006272
PMID:36914206
|
研究论文 | 本文探讨了溶酶体酸性脂肪酶(LAL)缺乏诱导的髓系来源抑制细胞(MDSCs)在肺癌中的潜在作用及其作为抗癌免疫治疗靶点和生物标志物的可能性 | 揭示了LAL缺乏如何通过改变代谢途径诱导MDSCs的产生,并展示了这些细胞在肿瘤免疫抑制和促进肿瘤生长中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和人类血液样本,缺乏直接的人体组织验证 | 探索LAL缺乏诱导的MDSCs在肺癌中的机制及其作为治疗靶点的潜力 | 小鼠骨髓来源的Ly6G+髓系细胞和非小细胞肺癌(NSCLC)患者的血液样本 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式细胞术 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 小鼠骨髓细胞和NSCLC患者的血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 644 | 2024-08-07 |
Re: Single-cell transcriptome analysis for characterizing primary Sca-1 positive, non-endothelial cardiac cells
2023-09, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2023.07.001
PMID:37454412
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 645 | 2025-10-07 |
Brief literature review and comprehensive bioinformatics analytics unravel the potential mechanism of curcumin in the treatment of periodontitis
2023-07-08, BMC oral health
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12903-023-03181-x
PMID:37422651
|
研究论文 | 通过生物信息学分析揭示姜黄素治疗牙周炎的潜在分子机制 | 整合单细胞转录组和批量RNA测序数据,结合分子对接和动力学模拟筛选姜黄素治疗牙周炎的关键靶点 | 研究基于计算模拟,缺乏实验验证 | 探索姜黄素治疗牙周炎的分子作用机制 | 牙周炎相关基因和姜黄素分子 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | PPI网络分析, KEGG/GO富集分析 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集(GSE164241, GSE10334, GSE16134) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 使用Seurat和Limma软件包进行数据分析 |
| 646 | 2025-10-07 |
hdWGCNA identifies co-expression networks in high-dimensional transcriptomics data
2023-06-26, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100498
PMID:37426759
|
研究论文 | 开发了hdWGCNA框架用于高维转录组数据的共表达网络分析 | 支持单细胞和空间RNA测序数据的系统级共表达网络分析,能够进行异构体水平网络分析 | 未明确说明具体的技术限制或数据要求 | 开发高维转录组数据的共表达网络分析工具 | 自闭症谱系障碍和阿尔茨海默病脑样本数据 | 生物信息学 | 自闭症谱系障碍,阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,空间RNA测序,长读长单细胞测序 | 共表达网络分析 | 转录组数据 | 包含近100万个细胞的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 647 | 2025-10-07 |
Single-nucleus RNA sequencing of human pancreatic islets identifies novel gene sets and distinguishes β-cell subpopulations with dynamic transcriptome profiles
2023-05-01, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01179-2
PMID:37127706
|
研究论文 | 通过单核RNA测序技术分析人类胰岛细胞,识别新型基因标记并区分具有动态转录组特征的β细胞亚群 | 发现胰岛内分泌细胞中非经典基因标记,首次通过整合scRNA-seq和snRNA-seq区分出三个具有不同生物学动态状态的β细胞亚群 | 研究样本来源有限,仅使用同一供体的胰岛细胞进行分析 | 探索人类胰岛细胞的转录组特征和细胞异质性 | 人类胰岛细胞及其在免疫缺陷小鼠中的移植模型 | 单细胞测序 | 糖尿病 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 同一供体的人类胰岛细胞 | NA | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 使用GRCh38-2020-A文库进行snRNA-seq数据分析,包含内含子读取 |
| 648 | 2025-10-07 |
APOE modulates microglial immunometabolism in response to age, amyloid pathology, and inflammatory challenge
2023-03-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112196
PMID:36871219
|
研究论文 | 本研究探讨APOE基因型如何调控小胶质细胞的免疫代谢功能,及其在衰老、淀粉样病理和炎症挑战中的作用 | 结合bulk、单细胞和空间转录组学技术,系统揭示APOE4通过影响Hif1α表达、TCA循环和糖酵解途径改变小胶质细胞免疫代谢特征 | 研究主要基于表达人类APOE的小鼠模型,人类样本验证尚需进一步研究 | 阐明APOE基因型在调节小胶质细胞免疫代谢中的核心作用机制 | 表达人类APOE的小鼠模型中的小胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 质谱成像 | NA | 转录组数据, 代谢组数据, 空间表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 649 | 2025-10-07 |
Image-based spatial transcriptomics identifies molecular niche dysregulation associated with distal lung remodeling in pulmonary fibrosis
2023-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.15.571954
PMID:38168317
|
研究论文 | 本研究通过图像空间转录组学分析肺纤维化远端肺重塑的分子生态失调 | 首次使用亚细胞分辨率图像空间转录组学技术,结合机器学习和轨迹分析方法,系统揭示了肺纤维化进展过程中从肺泡上皮失调到巨噬细胞极化的分子变化序列 | 样本量相对有限(19个肺组织),且主要关注肺纤维化,对其他慢性肺疾病的适用性有待验证 | 解析肺纤维化远端肺重塑的空间分子机制 | 人类肺组织中的上皮细胞、基质细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 图像空间转录组学 | 机器学习, 轨迹分析 | 空间转录组数据, 图像数据 | 19个独特肺组织的超过100万个细胞 | NA | 空间转录组学 | NA | 亚细胞分辨率图像空间转录组学 |
| 650 | 2025-10-07 |
Osteosarcoma tumors maintain intra-tumoral transcriptional heterogeneity during bone and lung colonization
2023-04-27, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01593-3
PMID:37106386
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析骨肉瘤在骨和肺转移过程中维持肿瘤内转录异质性的机制 | 首次结合谱系追踪和单细胞转录组学揭示肺转移过程中具有不同转录谱的多个克隆被富集并在细胞世代间保持稳定 | 研究主要基于细胞系和患者来源的异种移植模型,可能不能完全反映人类体内真实情况 | 研究肿瘤细胞异质性在适应不同微环境中的作用机制 | 骨肉瘤细胞系和患者来源的异种移植模型 | 单细胞生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 47,977个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 651 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis identifies Ifi27l2a as a novel gene regulator of microglial inflammation in the context of aging and stroke
2023-Feb-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2557290/v1
PMID:36824976
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别Ifi27l2a为调控衰老和脑卒中背景下小胶质细胞炎症反应的新型基因 | 首次发现Ifi27l2a基因在神经退行性疾病中的作用机制,揭示其通过活性氧介导神经炎症的新功能 | 研究主要基于小鼠模型和细胞培养实验,人类样本验证有限 | 探索调控小胶质细胞功能的关键基因,为脑卒中治疗提供新靶点 | 衰老小鼠大脑、小胶质细胞培养模型、人类尸检样本 | 单细胞生物学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 652 | 2025-10-07 |
CD8+ lymphocytes are critical for early control of tuberculosis in macaques
2023-12-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230707
PMID:37843832
|
研究论文 | 本研究通过CD8+淋巴细胞耗竭实验证明其在结核病早期控制中的关键作用 | 首次在灵长类动物模型中系统证明CD8+淋巴细胞对结核分枝杆菌早期感染控制的关键作用,并揭示其多功能细胞毒性特征 | 研究仅限于非人灵长类动物模型,未在人类中验证 | 阐明CD8+淋巴细胞在结核病免疫防御中的功能作用 | 食蟹猴(非人灵长类动物) | 免疫学 | 结核病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 食蟹猴实验模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 653 | 2025-10-07 |
Early clinical outcomes and molecular smooth muscle cell phenotyping using a prophylactic aortic arch replacement strategy in Loeys-Dietz syndrome
2023-11, The Journal of thoracic and cardiovascular surgery
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.jtcvs.2023.07.023
PMID:37500053
|
研究论文 | 本研究评估了Loeys-Dietz综合征患者预防性主动脉弓置换术的临床风险和血流动力学后果,并通过单细胞RNA测序表征平滑肌细胞表型 | 首次结合预防性主动脉弓置换术的临床评估与单细胞RNA测序分析,揭示Loeys-Dietz综合征主动脉平滑肌细胞的表型连续变化谱 | 样本量较小(Loeys-Dietz综合征患者n=8),随访时间较短(中位2年) | 评估预防性主动脉弓置换术在Loeys-Dietz综合征中的安全性和有效性,并探究疾病相关的平滑肌细胞分子表型 | Loeys-Dietz综合征患者、马凡综合征患者、无主动脉病变的对照患者及器官捐献者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,四维血流磁共振成像,组织学评估 | NA | 基因表达数据,医学影像数据,组织学数据 | 8例Loeys-Dietz综合征患者,5例马凡综合征患者,5例对照患者,2例器官捐献者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 654 | 2024-08-07 |
[Research progress of single-cell RNA sequencing in airway type 2 inflammatory diseases]
2023-12-07, Zhonghua er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Chinese journal of otorhinolaryngology head and neck surgery
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 655 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA-Sequencing in Astrocyte Development, Heterogeneity, and Disease
2023-Oct, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-023-01397-7
PMID:37552355
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综述 | 本文综述了星形胶质细胞的发育、异质性及其在中枢神经系统生理和病理环境中的关键作用,重点关注单细胞测序技术的应用 | 系统整合了单细胞RNA测序技术在揭示星形胶质细胞异质性、发育轨迹和疾病作用方面的最新研究进展 | NA | 探讨星形胶质细胞的发育过程、细胞异质性及其在中枢神经系统疾病中的作用 | 星形胶质细胞 | 单细胞生物学 | 中枢神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 656 | 2025-10-07 |
Construction of a circRNA- lincRNA-lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA regulatory network identifies genes and pathways linked to goat fertility
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1195480
PMID:37547465
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术构建了山羊颗粒细胞中ceRNA调控网络,揭示了与山羊繁殖力相关的关键基因和通路 | 首次在山羊中整合circRNA、lincRNA、lncRNA、miRNA和mRNA构建ceRNA调控网络,鉴定出18个与繁殖力相关的枢纽基因 | 研究依赖于公开可用的单细胞RNA测序数据,样本量相对有限,需要进一步实验验证 | 探究高繁殖力和低繁殖力山羊颗粒细胞的转录组差异,构建ceRNA调控网络 | 济宁青山羊的颗粒细胞(15只高繁殖力,15只低繁殖力) | 生物信息学 | 繁殖障碍 | 单细胞RNA测序,功能富集分析,文献挖掘 | ceRNA调控网络,基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据 | 30个样本(15高繁殖力,15低繁殖力) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 657 | 2025-10-07 |
A framework for defining mesenchymal cell types associated with murine periosteal and endosteal bone
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.17.567528
PMID:38014179
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据建立了小鼠骨相关间充质细胞类型的分类框架 | 首次比较了骨膜和骨内膜/骨小梁的细胞差异,定义了11个主要细胞簇,包括新发现的osteo-X细胞类型 | 研究仅针对小鼠模型,人类骨细胞的适用性需要进一步验证 | 增加骨细胞单细胞RNA测序数据量,比较骨膜与骨内细胞差异,明确小鼠骨相关细胞类型主要类别 | 小鼠骨相关间充质细胞 | 单细胞转录组学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过100,000个间充质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 658 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis of lizard blastema fibroblasts reveals phagocyte-dependent activation of Hedgehog-responsive chondrogenesis
2023-08-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40206-z
PMID:37563130
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析蜥蜴尾部再生过程,揭示了吞噬细胞依赖的Hedgehog信号通路调控软骨形成机制 | 首次在蜥蜴再生模型中鉴定出spp1激活的成纤维细胞作为胚芽细胞来源,并发现sulf1表达群体对Hedgehog信号的特异性响应 | 研究仅针对蜥蜴模型,在其他物种中的适用性需要进一步验证 | 探索蜥蜴尾部再生过程中胚芽形成和软骨生成的调控机制 | 蜥蜴再生尾部的成纤维细胞和吞噬细胞群体 | 单细胞生物学 | 组织再生障碍 | 单细胞RNA测序,伪时间轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 蜥蜴再生尾部组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 659 | 2025-10-07 |
Immunophenotypic correlates of sustained MRD negativity in patients with multiple myeloma
2023-09-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40966-8
PMID:37660077
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术分析多发性骨髓瘤患者免疫微环境特征与持续微小残留病阴性状态的相关性 | 首次结合单细胞RNA测序、T细胞受体测序和质谱流式技术,纵向分析维持治疗期间多发性骨髓瘤患者的免疫微环境动态变化 | 样本量较小(23例患者),且研究人群限于接受来那度胺维持治疗的新诊断患者 | 探索多发性骨髓瘤患者长期治疗反应与免疫微环境特征之间的关联 | 新诊断多发性骨髓瘤患者 | 单细胞分析 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, T细胞受体β测序, 质谱流式技术 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据, 蛋白质表达数据 | 23例患者 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式技术 | NA | NA |
| 660 | 2025-10-07 |
Network analysis of large-scale ImmGen and Tabula Muris datasets highlights metabolic diversity of tissue mononuclear phagocytes
2023-02-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112046
PMID:36708514
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研究论文 | 通过代谢网络分析研究组织单核吞噬细胞的代谢多样性 | 开发了基于网络的GAM聚类计算方法,首次在38种不同组织中系统识别了单核吞噬细胞的9个关键代谢子网络 | 研究主要基于小鼠数据集,结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 理解单核吞噬细胞在不同组织中的代谢变异性 | 小鼠单核吞噬细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,代谢网络分析 | GAM聚类 | 转录组数据 | 337个样本(ImmGen MNP数据集)+202个样本(ImmGen Phase I)+51,364个细胞(Tabula Muris scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |