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当前共找到 5351 篇文献，本页显示第 641 - 660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2025-10-07 |
STalign: Alignment of spatial transcriptomics data using diffeomorphic metric mapping
2023-12-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43915-7
PMID:38065970
|
研究论文 | 开发了一种名为STalign的空间转录组数据对齐工具，使用微分同胚度量映射技术解决不同切片间的空间对齐问题 | 采用微分同胚度量映射方法处理部分匹配的组织切片和局部非线性扭曲，显著提升了基因表达和细胞类型在匹配空间位置上的对应关系 | NA | 解决空间转录组数据在不同切片、样本和技术间的比较难题 | 空间转录组数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，微分同胚度量映射 | 微分同胚度量映射 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 642 | 2025-10-07 |
Alignment of spatial transcriptomics data using diffeomorphic metric mapping
2023-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.11.534630
PMID:37090640
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研究论文 | 开发了一种名为STalign的空间转录组学数据对齐工具，能够处理部分匹配的组织切片和局部非线性形变 | 使用微分同胚度量映射方法实现空间转录组数据对齐，显著改善了基于标志点的仿射对齐方法 | NA | 解决跨切片、样本和技术的空间转录组数据比较难题 | 小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 微分同胚度量映射 | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 643 | 2025-10-07 |
Unique adipose tissue invariant natural killer T cell subpopulations control adipocyte turnover in mice
2023-12-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44181-3
PMID:38129377
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脂肪组织中恒定自然杀伤T细胞(iNKT)的异质性及其在脂肪细胞更新调控中的关键作用 | 首次发现KLRG1 iNKT细胞是脂肪组织特有的iNKT细胞亚群，并阐明CX3CR1 iNKT细胞通过杀伤肥大炎症脂肪细胞和招募巨噬细胞调控脂肪组织稳态 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探究脂肪组织iNKT细胞的异质性及其在脂肪细胞更新调控中的作用机制 | 瘦型和肥胖小鼠的脂肪组织iNKT细胞 | 单细胞生物学 | 肥胖相关代谢疾病 | 单细胞RNA测序，过继转移实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 瘦型和肥胖小鼠的脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 644 | 2025-10-07 |
Deciphering driver regulators of cell fate decisions from single-cell transcriptomics data with CEFCON
2023-12-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44103-3
PMID:38123534
|
研究论文 | 提出基于网络的计算框架CEFCON，用于从单细胞转录组数据中识别控制细胞命运决定的驱动调控因子 | 开发了结合图神经网络和网络控制理论的创新方法，能够构建细胞谱系特异性基因调控网络并识别驱动调控因子 | 方法主要适用于单细胞RNA测序数据，在其他类型单细胞数据上的应用效果需要进一步验证 | 研究细胞命运决定的调控机制 | 小鼠造血干细胞分化过程 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络(GNN) with attention mechanism | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 645 | 2025-10-07 |
Common and divergent gene regulatory networks control injury-induced and developmental neurogenesis in zebrafish retina
2023-12-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44142-w
PMID:38123561
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术比较斑马鱼视网膜发育和损伤诱导的神经再生过程 | 首次系统比较发育和再生过程中视网膜细胞的基因调控网络差异，发现不同类型视网膜细胞损伤会诱导独特的米勒胶质细胞再生反应 | 研究仅限于斑马鱼模型，结果可能不完全适用于哺乳动物 | 探究视网膜损伤后神经再生的分子机制及其与发育过程的异同 | 斑马鱼视网膜发育和损伤再生过程中的米勒胶质细胞和视网膜祖细胞 | 发育生物学 | 视网膜损伤 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序, ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 发育和再生过程中的斑马鱼视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, ATAC测序 | NA | NA |
| 646 | 2025-10-07 |
Single-cell multi-omics analysis of human testicular germ cell tumor reveals its molecular features and microenvironment
2023-12-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44305-9
PMID:38123589
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研究论文 | 通过单细胞多组学和空间转录组学分析揭示人类睾丸生殖细胞肿瘤的分子特征和微环境 | 首次结合单细胞多组学和空间转录组学技术系统解析精原细胞瘤的分子特征，发现其与原始生殖细胞的基因表达程序相似性，并鉴定TFAP2C在肿瘤侵袭迁移中的关键作用 | 研究样本量有限，主要基于精原细胞瘤样本和细胞系，需要更多验证 | 探索精原细胞瘤的分子特征和肿瘤微环境组成 | 人类睾丸生殖细胞肿瘤（精原细胞瘤）样本和精原细胞瘤细胞系 | 数字病理学 | 睾丸癌 | 单细胞多组学测序, 空间转录组学, 基因组学分析 | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据 | 精原细胞瘤样本和细胞系（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 647 | 2025-10-07 |
Reassessing endothelial-to-mesenchymal transition in mouse bone marrow: insights from lineage tracing models
2023-12-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44312-w
PMID:38123537
|
研究论文 | 通过谱系追踪模型重新评估小鼠骨髓中内皮-间质转化的发生情况 | 结合单细胞RNA测序与多种谱系追踪模型，首次系统评估内皮细胞向骨髓基质细胞的转化潜力 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证；使用的遗传模型可能存在局限性 | 探究内皮细胞是否通过内皮-间质转化过程贡献于骨髓基质细胞的生成 | 小鼠骨髓中的内皮细胞和骨髓基质细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，谱系追踪，转基因小鼠模型 | NA | 基因表达数据，细胞定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 648 | 2025-10-07 |
Pathway centric analysis for single-cell RNA-seq and spatial transcriptomics data with GSDensity
2023-12-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44206-x
PMID:38110427
|
研究论文 | 介绍GSDensity方法，用于单细胞RNA测序和空间转录组数据的通路中心分析 | 无需进行细胞聚类即可实现通路中心的单细胞和空间转录组数据分析，能够发现现有方法忽略的细胞-通路关联 | NA | 开发新的计算方法来解析高度异质性的单细胞和空间转录组数据 | 小鼠大脑发育过程和人类肿瘤组织 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 图模型 | 单细胞基因表达数据，空间转录组数据 | 六种不同肿瘤类型 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 649 | 2025-10-07 |
Autophagy of OTUD5 destabilizes GPX4 to confer ferroptosis-dependent kidney injury
2023-12-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44228-5
PMID:38110369
|
研究论文 | 本研究揭示了肾脏缺血再灌注损伤中通过OTUD5自噬降解GPX4诱导铁死亡的新机制 | 首次发现OTUD5作为GPX4结合蛋白通过稳定GPX4赋予铁死亡抗性，并揭示mTORC1介导的自噬导致OTUD5降解的新通路 | 未明确说明研究样本的具体数量和组织来源 | 探究肾脏缺血再灌注损伤中铁死亡的空间分布和GPX4减少的分子机制 | 肾脏组织、肾小管细胞 | 空间转录组学 | 急性肾损伤 | 空间转录组学、AAV介导的基因递送 | NA | 空间转录组数据、分子相互作用数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 650 | 2025-10-07 |
Common and divergent gene regulatory networks control injury-induced and developmental neurogenesis in zebrafish retina
2023-Sep-18, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3294233/v1
PMID:37790324
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术比较斑马鱼视网膜发育和损伤诱导再生的基因调控网络 | 首次系统比较了不同视网膜神经元亚型缺失后诱导的米勒胶质细胞重编程差异，以及再生过程与发育过程的异同 | 研究仅限于斑马鱼模型，结果可能不完全适用于哺乳动物 | 探索视网膜损伤后再生与发育过程中基因调控网络的共同点和差异 | 斑马鱼视网膜发育和损伤再生过程中的米勒胶质细胞和神经元前体细胞 | 发育生物学 | 视网膜损伤 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序, ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 发育和再生视网膜样本 | NA | single-cell RNA-seq, single-nuclear RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 651 | 2025-10-07 |
Common and divergent gene regulatory networks control injury-induced and developmental neurogenesis in zebrafish retina
2023-Aug-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.08.552451
PMID:37609307
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术比较斑马鱼视网膜发育和损伤诱导的神经再生过程 | 首次系统比较了不同视网膜神经元亚型缺失后Müller胶质细胞重编程的差异，揭示了损伤诱导神经再生与发育过程在基因调控网络上的异同 | 研究主要基于斑马鱼模型，结果在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探索视网膜损伤后神经再生的分子机制及其与发育过程的异同 | 斑马鱼视网膜发育和损伤再生过程中的Müller胶质细胞和神经祖细胞 | 发育生物学 | 视网膜损伤 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序, ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 发育和再生过程中的斑马鱼视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 652 | 2025-10-07 |
DeMixSC: a deconvolution framework that uses single-cell sequencing plus a small benchmark dataset for improved analysis of cell-type ratios in complex tissue samples
2023-Nov-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.10.561733
PMID:37873318
|
研究论文 | 提出一种名为DeMixSC的去卷积框架，通过结合单细胞测序数据和小型基准数据集来提高复杂组织样本中细胞类型比例的分析精度 | 引入匹配跨平台生物信号的实验设计，开发基于加权非负最小二乘法的新框架，能够识别和调整技术差异高的基因 | NA | 解决跨测序平台技术差异对细胞类型去卷积分析精度限制的问题 | 复杂生物样本中的细胞类型比例分析 | 生物信息学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | 加权非负最小二乘法 | 基因表达数据 | 453名年龄相关性黄斑变性患者队列加上健康视网膜基准数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 653 | 2025-10-07 |
Comprehensive single cell aging atlas of mammary tissues reveals shared epigenomic and transcriptomic signatures of aging and cancer
2023-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.20.563147
PMID:37961129
|
研究论文 | 通过单细胞分辨率研究小鼠乳腺组织衰老过程中的转录组和表观基因组变化，揭示衰老与癌症之间的分子联系 | 首次构建了乳腺组织衰老的单细胞图谱，揭示了衰老过程中上皮细胞、基质细胞和免疫细胞的表观遗传和转录组变化，并发现衰老特征与人类乳腺癌的相似性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；空间转录组数据可能覆盖区域有限 | 探究衰老如何影响乳腺组织的细胞和分子程序，以及这些变化与癌症发生的关系 | 小鼠乳腺组织中的上皮细胞、基质细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,表观基因组分析 | NA | 单细胞转录组数据,表观基因组数据,空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量的小鼠乳腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 654 | 2025-10-07 |
Epigenetics of Early Cardiometabolic Disease: Mechanisms and Precision Medicine
2023-06-09, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.322135
PMID:37289899
|
综述 | 本综述全面探讨了表观遗传学在心血管代谢疾病中的作用机制及其在精准医学中的应用前景 | 系统整合DNA甲基化作为精准医学生物标志物的潜力，并探讨社会健康决定因素、肠道细菌表观基因组学等新兴因素对疾病发展的影响 | NA | 阐述表观遗传学在心血管代谢疾病中的分子机制及其在精准医学中的应用 | 心血管和代谢疾病相关的表观遗传过程 | 表观遗传学 | 心血管代谢疾病 | 单细胞测序, 表观遗传编辑 | NA | 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 655 | 2025-10-07 |
High-throughput single nucleus total RNA sequencing of formalin-fixed paraffin-embedded tissues by snRandom-seq
2023-05-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38409-5
PMID:37173341
|
研究论文 | 开发了一种名为snRandom-seq的高通量单核总RNA测序技术，用于福尔马林固定石蜡包埋组织 | 使用随机引物捕获全长总RNA，相比现有技术具有更低的双胞率、更高的RNA覆盖度，并能检测更多非编码RNA和新生RNA | NA | 开发适用于FFPE组织的单核RNA测序技术 | 福尔马林固定石蜡包埋组织样本 | 单细胞测序 | 肝癌 | 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类肝癌FFPE标本 | NA | 单核RNA测序 | snRandom-seq | 基于液滴的单核总RNA测序技术，使用随机引物捕获全长RNA |
| 656 | 2025-10-07 |
Single cell spatial transcriptomics reveals distinct patterns of dysregulation in non-neuronal and neuronal cells induced by the Trem2R47H Alzheimer's risk gene mutation
2023-Dec-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3656139/v1
PMID:38106071
|
研究论文 | 通过单细胞空间转录组学分析Trem2R47H阿尔茨海默病风险基因突变对非神经元和神经元细胞的差异性调控模式 | 首次利用MERFISH空间转录组技术系统揭示Trem2R47H突变在不同脑细胞类型中的空间特异性转录调控机制 | 研究仅限于小鼠模型，样本量相对有限（15个脑切片） | 探究Trem2R47H突变对阿尔茨海默病相关转录组失调的细胞类型特异性影响 | 野生型、Trem2R47H突变型、5xFAD和Trem2R47H;5xFAD复合基因型小鼠脑组织 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | MERFISH空间转录组学 | 自定义分析流程 | 空间转录组数据、神经病理学数据 | 15个小鼠脑切片 | NA | 空间转录组学 | MERFISH | NA |
| 657 | 2025-10-07 |
The Histone Methyltransferase SETDB2 Modulates Tissue Inhibitors of Metalloproteinase-Matrix Metalloproteinase Activity During Abdominal Aortic Aneurysm Development
2023-09-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000005963
PMID:37325923
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研究论文 | 本研究揭示组蛋白甲基转移酶SETDB2通过调控TIMP-MMP活性在腹主动脉瘤发展中的关键作用 | 首次发现SETDB2通过H3K9me3修饰抑制TIMP1-3基因表达，从而调控巨噬细胞介导的蛋白酶活性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究巨噬细胞特异性表观遗传酶在腹主动脉瘤发展中的作用机制 | 人类主动脉组织样本和髓系特异性SETDB2缺陷小鼠模型 | 表观遗传学 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序，基因敲除，表观遗传分析 | NA | 基因表达数据，组织学数据 | 人类AAA组织和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 658 | 2025-10-07 |
Macrophage-mediated PDGF Activation Correlates With Regenerative Outcomes Following Musculoskeletal Trauma
2023-08-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000005704
PMID:36111847
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析巨噬细胞亚群与肌肉骨骼损伤后再生或纤维化愈合的关系 | 首次在多种肌肉骨骼损伤模型中系统鉴定出与再生和纤维化愈合相关的巨噬细胞亚群，并发现血小板衍生生长因子信号在再生条件下的增强作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 识别与肌肉骨骼损伤后再生或纤维化愈合相关的巨噬细胞亚群和基因特征 | 小鼠肌肉骨骼损伤模型，包括再生性和纤维化肌肉损失、再生性指端截肢和异位骨化 | 单细胞转录组学 | 肌肉骨骼损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多种小鼠损伤模型的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 659 | 2025-10-07 |
Spatial heterogeneity of bone marrow endothelial cells unveils a distinct subtype in the epiphysis
2023-10, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-023-01240-7
PMID:37798545
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了骨髓内皮细胞的空间异质性，并在骨骺区发现了一种独特的毛细血管亚型——S型内皮细胞 | 首次在骨骺区鉴定出具有独特表型特征的S型内皮细胞，发现其通过分泌I型胶原蛋白参与骨强度获得，并形成造血干细胞的特殊储存库 | NA | 探索骨髓内皮细胞的异质性及其在骨形成和造血过程中的功能 | 骨髓内皮细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 660 | 2025-10-07 |
Screening of four lysosome-related genes in sepsis based on RNA sequencing technology
2023-12-06, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-023-00588-7
PMID:38057716
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研究论文 | 通过RNA测序技术筛选与脓毒症相关的溶酶体相关基因 | 首次通过整合RNA测序数据和溶酶体相关基因数据库，筛选出与脓毒症预后相关的四个核心基因 | 样本量较小（22例患者和10例正常对照），需要更大规模研究验证 | 筛选脓毒症患者中与溶酶体相关的基因，为溶酶体靶向治疗提供方向 | 脓毒症患者和正常对照者的外周血样本 | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 22例脓毒症患者和10例正常对照 | NA | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |