单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5354 篇文献，本页显示第 601 - 620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2024-09-25 |
Myocardial Milieu Favors Local Differentiation of Regulatory T Cells
2023-03-03, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.122.322183
PMID:36744467
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研究论文 | 研究心肌微环境如何影响局部调节性T细胞的分化 | 首次揭示了心肌微环境通过促进抗原特异性Treg细胞的分化来塑造局部免疫反应 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类中验证 | 探讨心肌微环境对T辅助细胞分化的影响 | 心肌微环境中的抗原特异性CD4+ T细胞 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 小鼠心肌梗死模型 |
| 602 | 2024-09-25 |
Pairing of single-cell RNA analysis and T cell antigen receptor profiling indicates breakdown of T cell tolerance checkpoints in atherosclerosis
2023-Mar, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-023-00218-w
PMID:37621765
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序与T细胞抗原受体测序相结合的方法，研究了动脉粥样硬化斑块、动脉三级淋巴器官和淋巴结中的T细胞耐受检查点 | 首次揭示了动脉粥样硬化斑块中T细胞耐受检查点的破坏模式，并发现人类冠状动脉和颈动脉斑块中存在类似的CD8 T细胞耐受功能障碍 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，可能无法完全代表人类动脉粥样硬化的复杂性 | 探讨动脉粥样硬化中T细胞耐受检查点的功能障碍 | 动脉粥样硬化斑块、动脉三级淋巴器官、淋巴结和血液中的T细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、T细胞抗原受体测序 | NA | RNA | 小鼠和人类样本 |
| 603 | 2024-09-25 |
Radiation-induced circulating myeloid-derived suppressor cells induce systemic lymphopenia after chemoradiotherapy in patients with glioblastoma
2023-01-25, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abn6758
PMID:36696484
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研究论文 | 研究了胶质母细胞瘤患者在接受放化疗后出现的淋巴细胞减少症的生物学机制，并探讨了药物抑制MDSC对缓解这一现象的潜力 | 首次揭示了放疗诱导的循环髓源抑制细胞（MDSC）与系统性淋巴细胞减少之间的因果关系，并验证了药物抑制MDSC在临床前模型中的有效性 | 研究仅限于临床前模型和少量患者样本，需要进一步的临床试验验证 | 探讨胶质母细胞瘤患者在接受放化疗后淋巴细胞减少的生物学机制，并寻找潜在的治疗方法 | 胶质母细胞瘤患者的外周血样本和临床前小鼠模型 | 免疫学 | 脑癌 | RNA测序、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、免疫监测数据 | 20名胶质母细胞瘤患者的外周血样本和临床前小鼠模型 |
| 604 | 2024-09-25 |
Multi-omics analysis identifies IgG2b class-switching with ALCAM-CD6 co-stimulation in joint-draining lymph nodes during advanced inflammatory-erosive arthritis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1237498
PMID:37691918
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研究论文 | 本文利用多组学空间和单细胞转录组学技术，研究了在严重类风湿性关节炎（RA）患者中，关节引流淋巴结中淋巴引流功能障碍的分子机制 | 首次整合单细胞和空间转录组学数据，揭示了ALCAM-CD6共刺激在促进IgG2b类别转换中的作用 | 需要进一步研究免疫球蛋白克隆性和潜在的自身免疫后果，以及抗CD6疗法的有效性 | 探讨严重类风湿性关节炎中淋巴引流功能障碍的分子机制 | 关节引流淋巴结中的淋巴内皮细胞、巨噬细胞、B细胞和T细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 野生型小鼠10只，TNF-Tg小鼠18只（早期6只，晚期12只） |
| 605 | 2024-09-25 |
scDemultiplex: An iterative beta-binomial model-based method for accurate demultiplexing with hashtag oligos
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.08.013
PMID:37664174
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研究论文 | 提出了一种基于beta-二项分布模型的迭代方法scDemultiplex，用于准确的多重样本解复用 | scDemultiplex采用beta-二项分布模型和迭代策略，相比现有七种方法在高质量和低质量数据中均表现出色，并能与其他方法结合以提升性能 | 未提及 | 开发一种准确的多重样本解复用方法，以提高单细胞测序数据的分析质量 | 单细胞测序中的多重样本解复用问题 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | beta-二项分布模型 | 单细胞测序数据 | 未提及 |
| 606 | 2024-09-25 |
The Comparative Pathology Workbench: Interactive visual analytics for biomedical data
2023, Journal of pathology informatics
DOI:10.1016/j.jpi.2023.100328
PMID:37693862
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研究论文 | 设计了一个名为比较病理工作台（CPW）的交互式系统，用于生物医学数据的视觉分析 | 开发了一个基于网络浏览器的视觉分析平台，提供共享访问和交互式图像数据展示，支持多用户协作和讨论 | NA | 开发一个支持病理学家比较不同样本、病例和物种间正常和病变组织图像的交互式系统 | 病理图像和相关分析数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 图像 | NA |
| 607 | 2024-09-23 |
Blockade of IL-6R prevents preterm birth and adverse neonatal outcomes
2023-Dec, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2023.104865
PMID:37944273
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研究论文 | 研究探讨了IL-6R阻断剂在预防早产和不良新生儿结局中的作用 | 首次证明了IL-6R阻断剂可以有效预防由无菌性羊膜内炎症引起的早产和不良新生儿结局 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类临床试验中验证 | 探讨IL-6R阻断剂在预防早产和不良新生儿结局中的潜在治疗作用 | IL-6和IL-1α在无菌性羊膜内炎症中的作用，以及IL-6R阻断剂的治疗效果 | NA | 早产 | 蛋白质组学、单细胞RNA测序、QUEST-MRI、宏基因组测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、MRI图像、宏基因组数据 | C57BL/6小鼠模型，具体样本数量未明确提及 |
| 608 | 2024-09-23 |
Single-cell profiling and zebrafish avatars reveal LGALS1 as immunomodulating target in glioblastoma
2023-11-08, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202318144
PMID:37791581
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序和斑马鱼模型揭示了胶质母细胞瘤中LGALS1作为免疫调节靶点的潜力 | 首次通过单细胞RNA测序和斑马鱼模型研究了胶质母细胞瘤相关巨噬细胞与肿瘤细胞的动态相互作用，并识别出LGALS1作为主要的免疫抑制调节因子 | NA | 揭示胶质母细胞瘤中肿瘤异质性和免疫抑制微环境的关键因素，并寻找新的免疫调节靶点 | 胶质母细胞瘤相关巨噬细胞与肿瘤细胞的相互作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个胶质母细胞瘤患者样本 |
| 609 | 2024-09-23 |
Microfluidics-free single-cell genomics with templated emulsification
2023-Nov, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01685-z
PMID:36879006
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研究论文 | 本文介绍了一种无需微流控设备的新型单细胞基因组学方法，基于粒子模板乳化技术 | 开发了一种无需微流控设备和专业硬件的单细胞RNA测序方法，通过粒子模板乳化技术实现单细胞封装和cDNA条码化 | NA | 开发一种简便、灵活且可扩展的单细胞测序工作流程 | 单细胞RNA测序和多组学测量 | 基因组学 | 急性白血病 | RNA测序 | NA | 转录组 | 数千个样本或数百万个细胞 |
| 610 | 2024-09-23 |
Does Chronic Obstructive Pulmonary Disease Originate from Different Cell Types?
2023-11, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0175PS
PMID:37584669
|
研究论文 | 本文探讨了慢性阻塞性肺病（COPD）是否由不同细胞类型引起，并讨论了当前研究中的知识空白和技术应用 | 本文提出了通过新技术如单细胞转录组学和蛋白质组学来研究COPD的潜在机制 | 本文主要讨论了当前研究的局限性和知识空白，未提供具体实验数据 | 探讨COPD是否由不同细胞类型引起，并研究这些细胞在疾病发展中的作用 | COPD的病理机制和不同细胞类型在疾病发展中的作用 | NA | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | NA | NA |
| 611 | 2024-09-23 |
Loss of ANT1 Increases Fibrosis and Epithelial Cell Senescence in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2023-11, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0315OC
PMID:37487137
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研究论文 | 研究探讨了ANT1在特发性肺纤维化中的作用及其对细胞衰老和纤维化的影响 | 首次揭示了ANT1缺失通过线粒体功能障碍、增加细胞衰老和减少AT2细胞再生能力，促进特发性肺纤维化的机制 | NA | 探究ANT1在特发性肺纤维化中的作用及其对细胞衰老和纤维化的影响 | 特发性肺纤维化患者肺组织中的ANT1和ANT2表达 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序和组织染色 | NA | RNA | 特发性肺纤维化患者肺组织样本 |
| 612 | 2024-09-23 |
A new Bayesian factor analysis method improves detection of genes and biological processes affected by perturbations in single-cell CRISPR screening
2023-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02017-4
PMID:37770710
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研究论文 | 本文介绍了一种新的贝叶斯因子分析方法，用于改进单细胞CRISPR筛选中受扰动影响的基因和生物过程的检测 | 开发了一种名为引导稀疏因子分析（GSFA）的新统计方法，通过推断潜在因子来检测基因扰动效应，显著提高了检测能力 | NA | 改进单细胞CRISPR筛选数据的分析方法，提高基因扰动效应的检测能力 | 单细胞CRISPR筛选数据，特别是受扰动影响的基因和生物过程 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，CRISPR筛选 | 贝叶斯因子分析 | 基因表达数据 | 人类CD8 T细胞和神经前体细胞的单细胞CRISPR数据 |
| 613 | 2024-09-23 |
Camel nanobody-based B7-H3 CAR-T cells show high efficacy against large solid tumours
2023-09-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41631-w
PMID:37739951
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研究论文 | 研究基于骆驼纳米抗体的B7-H3 CAR-T细胞对大型实体瘤的高效性 | 开发了基于骆驼纳米抗体识别B7-H3 IgC域的CAR-T细胞，显示出对大型肿瘤的强大抗肿瘤活性 | 研究仅在雌性小鼠模型中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 优化基于CAR-T细胞的免疫疗法，特别是针对实体瘤 | B7-H3蛋白及其在实体瘤中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组RNA测序，功能性T细胞蛋白质组学分析 | NA | RNA测序数据，蛋白质组学数据 | 雌性小鼠 |
| 614 | 2024-09-23 |
Genetic activation of glycolysis in osteoblasts preserves bone mass in type I diabetes
2023-09-21, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2023.07.003
PMID:37562406
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研究论文 | 研究探讨了I型糖尿病中骨形成受损的机制，并发现通过激活成骨细胞中的糖酵解可以维持骨量 | 首次揭示了I型糖尿病中成骨细胞糖代谢缺陷是骨质疏松的致病机制，并提出增强成骨细胞糖酵解可能是一种潜在的骨形成疗法 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 探讨I型糖尿病中骨形成受损的机制，并寻找潜在的治疗策略 | I型糖尿病小鼠的成骨细胞和骨组织 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、稳定同位素示踪 | NA | RNA序列数据 | 小鼠模型 |
| 615 | 2024-09-23 |
Bulk brain tissue cell-type deconvolution with bias correction for single-nuclei RNA sequencing data using DeTREM
2023-Sep-19, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05476-w
PMID:37726653
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研究论文 | 本文提出了一种名为DeTREM的改进方法，用于校正单核RNA测序数据与批量RNA测序数据之间的偏差，以提高脑组织细胞类型反卷积的准确性 | DeTREM方法通过补偿单核RNA测序与批量RNA测序数据之间的差异，提高了细胞类型反卷积的准确性，并优于其他反卷积方法 | NA | 提高脑组织细胞类型反卷积的准确性 | 人脑组织的细胞类型反卷积 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 (snRNA-seq) | MuSiC | RNA测序数据 | NA |
| 616 | 2024-09-23 |
SiGra: single-cell spatial elucidation through an image-augmented graph transformer
2023-09-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41437-w
PMID:37699885
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研究论文 | 本文提出了一种名为SiGra的方法，通过图像增强的图变换器来揭示单细胞空间域并增强稀疏和噪声的转录组数据 | SiGra方法结合了多通道免疫组化图像信息，通过混合图变换器在单细胞空间图上进行处理，显著提高了模型性能 | NA | 开发一种方法来利用图像信息揭示空间域并增强转录组数据 | 单细胞和斑点级别的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 免疫组化 | 图变换器 | 图像 | 复杂组织中的单细胞和斑点级别的空间转录组数据 |
| 617 | 2024-09-23 |
Alk1 acts in non-endothelial VE-cadherin+ perineurial cells to maintain nerve branching during hair homeostasis
2023-09-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40761-5
PMID:37699906
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研究论文 | 研究了VE-cadherin和Alk1在非内皮细胞中的作用，特别是在神经分支维持中的作用 | 发现VE-cadherin和Alk1不仅在内皮细胞中起作用，还在非内皮细胞中维持神经分支 | NA | 探讨VE-cadherin和Alk1在皮肤血管重塑和神经分支维持中的作用 | VE-cadherin阳性细胞和Alk1在皮肤中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠 |
| 618 | 2024-09-23 |
Notch and retinoic acid signals regulate macrophage formation from endocardium downstream of Nkx2-5
2023-09-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41039-6
PMID:37669937
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研究论文 | 研究揭示了Nkx2-5下游的Notch和视黄酸信号在心肌内膜向巨噬细胞分化的调控网络 | 首次揭示了Nkx2-5/Notch/RA信号通路在心肌内膜向巨噬细胞分化中的关键作用 | NA | 探讨心肌内膜向巨噬细胞分化的分子机制 | 心肌内膜、巨噬细胞、Nkx2-5、Notch信号、视黄酸信号 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 619 | 2024-09-23 |
NF-κB subunits direct kinetically distinct transcriptional cascades in antigen receptor-activated B cells
2023-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01561-7
PMID:37524800
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研究论文 | 研究了NF-κB家族中的Rel和RelA在B细胞受体激活后的基因表达调控中的不同功能 | 揭示了Rel和RelA在B细胞激活后基因表达调控中的不同动力学特征和功能对抗性 | NA | 探讨NF-κB家族成员在B细胞激活后的基因表达调控中的特异性功能 | Rel和RelA在B细胞中的基因表达调控功能 | NA | NA | 多组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 620 | 2024-09-23 |
Projecting RNA measurements onto single cell atlases to extract cell type-specific expression profiles using scProjection
2023-08-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40744-6
PMID:37626024
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scProjection的方法，用于将多模态RNA测量映射到深度测序的scRNA-seq图谱上，以提取细胞类型特异性的单细胞基因表达谱 | scProjection方法结合了多模态和scRNA-seq测量的优势，能够精确地进行单细胞的多模态测量 | NA | 开发一种方法，将多模态RNA测量映射到深度测序的scRNA-seq图谱上，以提取细胞类型特异性的单细胞基因表达谱 | 多模态RNA测量和scRNA-seq图谱 | 单细胞测序 | NA | scRNA-seq | NA | RNA | NA |