单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5351 篇文献，本页显示第 601 - 620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2024-10-04 |
Divergent Actions of Renal Tubular and Endothelial Type 1 IL-1 Receptor Signaling in Toxin-Induced AKI
2023-10-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000191
PMID:37545036
|
研究论文 | 研究IL-1受体1在肾小管和内皮细胞中的不同信号传导对毒素诱导的急性肾损伤的影响 | 发现IL-1R1在肾小管和内皮细胞中的激活对急性肾损伤有相反的影响，肾小管中的激活加剧损伤，而内皮细胞中的激活减轻损伤 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类中验证结果 | 探讨IL-1R1在不同肾脏细胞类型中的信号传导对急性肾损伤的影响 | IL-1R1在肾小管和内皮细胞中的信号传导 | NA | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和小鼠的肾脏组织样本 |
| 602 | 2024-10-04 |
Single-cell analysis of dorsal root ganglia reveals metalloproteinase signaling in satellite glial cells and pain
2023-10, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2023.08.005
PMID:37557960
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术分析背根神经节中的卫星胶质细胞，揭示了金属蛋白酶信号在疼痛中的作用 | 首次揭示了卫星胶质细胞中金属蛋白酶信号通路在处理躯体感觉刺激中的作用，并发现了一种潜在的疼痛治疗方法 | 研究主要集中在体外实验和细胞水平，尚未在动物模型或人体中验证 | 探讨卫星胶质细胞在疼痛中的作用及其分子机制 | 背根神经节中的卫星胶质细胞和感觉神经元 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 多个卫星胶质细胞样本 |
| 603 | 2024-10-04 |
Tumor-associated macrophages trigger MAIT cell dysfunction at the HCC invasive margin
2023-08-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.07.026
PMID:37595566
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、流式细胞术和CODEX成像技术，研究了肝细胞癌（HCC）中黏膜相关不变T细胞（MAIT细胞）的功能障碍及其与肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的相互作用 | 首次揭示了肿瘤相关巨噬细胞通过CSF1RPD-L1信号通路诱导MAIT细胞功能障碍，并提出了通过aPD-1/aPD-L1疗法靶向治疗HCC患者中MAIT细胞的可能性 | NA | 探讨MAIT细胞在肝细胞癌中的功能及其与肿瘤微环境的关系 | 肝细胞癌（HCC）患者样本中的MAIT细胞及其与肿瘤相关巨噬细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、CODEX成像 | 机器学习 | 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据、图像数据 | 配对的HCC患者样本及小鼠模型 |
| 604 | 2024-10-04 |
A spatially resolved single-cell genomic atlas of the adult human breast
2023-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06252-9
PMID:37380767
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研究论文 | 构建了成人人类乳腺的单细胞和空间分辨率的全面细胞图谱 | 首次构建了成人人类乳腺的单细胞和空间分辨率的全面细胞图谱，揭示了丰富的血管周围、内皮和免疫细胞群以及高度多样的腔上皮细胞状态 | NA | 研究成人正常乳腺组织的细胞组成和空间分布，为乳腺生物学和疾病研究提供参考 | 成人人类乳腺的单细胞和空间分辨率细胞图谱 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 714,331个细胞来自126名女性，117,346个细胞核来自20名女性 |
| 605 | 2024-10-04 |
Transcriptional programming of CD4+ TRM differentiation in viral infection balances effector- and memory-associated gene expression
2023-05-12, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abq7486
PMID:37172104
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研究论文 | 研究了在病毒感染后，CD4+ T细胞在小肠中的表型、功能和转录特征，揭示了其与循环T1细胞的共同基因表达程序和染色质可及性特征 | 首次揭示了CD4+ T细胞在病毒感染后形成的早期T细胞与T1效应细胞之间的发育关系，并比较了CD4+ T细胞与CD8+ T细胞的差异 | NA | 探讨CD4+ T细胞在病毒感染后的分化和转录调控机制 | CD4+ T细胞在小肠中的表型、功能和转录特征 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 606 | 2024-10-04 |
An optimized approach for multiplexing single-nuclear ATAC-seq using oligonucleotide-conjugated antibodies
2023-04-28, Epigenetics & chromatin
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s13072-023-00486-7
PMID:37118773
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研究论文 | 本文介绍了一种使用寡核苷酸偶联抗体进行单核ATAC-seq多重分析的优化方法 | 开发了一种简单的核哈希方法NuHash，使用寡核苷酸偶联抗体识别核孔复合体蛋白，用于snATAC-seq文库制备的多重分析 | NA | 研究单细胞分辨率下转录和染色质结构的分析技术 | 人类和鼠类细胞样本的snATAC-seq分析 | 基因组学 | NA | 单核ATAC-seq (snATAC-seq) | NA | 基因组数据 | 9144个核（2-plex）和12,208个核（4-plex） |
| 607 | 2024-10-02 |
A telencephalon cell type atlas for goldfish reveals diversity in the evolution of spatial structure and cell types
2023-11-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh7693
PMID:37910612
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，系统比较了金鱼端脑的细胞类型，揭示了其分子神经解剖学的分区 | 首次构建了金鱼端脑的细胞类型图谱，发现了神经元基因表达的多样性和模块化特征，并提出了金鱼端脑中存在海马结构的可能性 | NA | 研究金鱼端脑的细胞类型多样性及其在进化中的空间结构变化 | 金鱼端脑的细胞类型及其分子特征 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 金鱼端脑的多个细胞样本 |
| 608 | 2024-10-02 |
Spatially Resolved Transcriptomics Technology Facilitates Cancer Research
2023-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202302558
PMID:37632718
|
综述 | 本文综述了空间转录组学技术在癌症研究中的应用及其在揭示基因表达和细胞功能空间位置方面的主要成就 | 空间转录组学技术（SRT）能够探索特定细胞与其空间背景之间的关系，弥补了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在空间信息上的不足 | NA | 旨在通过深入理解肿瘤细胞与周围非恶性细胞的相互作用，开发更有效的临床治疗策略 | 肿瘤细胞及其周围非恶性细胞的空间位置与功能 | 数字病理学 | 癌症 | 下一代测序（NGS） | NA | 转录组数据 | NA |
| 609 | 2024-10-02 |
Lepr-Expressing PDLSCs Contribute to Periodontal Homeostasis and Respond to Mechanical Force by Piezo1
2023-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303291
PMID:37553778
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研究论文 | 研究揭示了Lepr+ PDLSCs在牙周稳态中的作用及其对机械力的响应机制 | 首次通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术鉴定出Lepr+ PDLSCs，并发现Piezo1介导了Lepr+ PDLSCs的机械感应 | NA | 探讨Lepr+ PDLSCs在牙周稳态中的作用及其对机械力的响应机制 | Lepr+ PDLSCs及其在牙周组织修复和稳态维持中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 610 | 2024-10-02 |
Simultaneous estimation of gene regulatory network structure and RNA kinetics from single cell gene expression
2023-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.21.558277
PMID:37790443
|
研究论文 | 开发了一种深度学习模型，通过单细胞RNA测序数据同时推断基因调控网络结构和RNA动力学参数 | 首次将深度学习模型应用于同时推断基因调控网络结构和RNA动力学参数，并展示了其在预测基因表达状态和模拟转录因子变化效果方面的优越性 | NA | 构建一个完整的、预测性的生物物理模型，用于基因表达调控 | 基因调控网络结构和RNA动力学参数 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型 | 基因表达数据 | 175,000个单细胞 |
| 611 | 2024-10-02 |
Single-Nucleus RNA-Seq: Open the Era of Great Navigation for FFPE Tissue
2023-Sep-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241813744
PMID:37762049
|
综述 | 本文综述了单核RNA测序（snRNA-seq）在福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织中的应用及其技术进展 | snRNA-seq技术减少了离子化转录偏差，适用于更丰富的样本，为深入探索FFPE组织提供了新机会 | 本文总结了snRNA-seq在FFPE样本中的局限性和潜在技术发展 | 探讨单核RNA测序技术在福尔马林固定石蜡包埋组织中的应用 | 单核RNA测序技术及其在FFPE组织中的应用 | 基因组学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 612 | 2024-10-02 |
Integrative single-cell RNA-seq and ATAC-seq analysis of myogenic differentiation in pig
2023-02-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01519-z
PMID:36726129
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和ATAC测序分析了猪骨骼肌分化的分子和细胞动态 | 首次在猪胚胎发育过程中对骨骼肌分化进行了单细胞分辨率的基因表达和染色质可及性分析 | 研究仅限于猪胚胎发育阶段，未涵盖成年猪或人类 | 深入理解猪胚胎骨骼肌分化的分子和细胞动态 | 猪胚胎的骨骼肌分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和ATAC测序 | NA | 基因表达数据和染色质可及性数据 | 猪胚胎的骨骼肌细胞 |
| 613 | 2024-10-02 |
A Zinc- and Calcium-Rich Lysosomal Nanoreactor Rescues Monocyte/Macrophage Dysfunction under Sepsis
2023-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202205097
PMID:36596693
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研究论文 | 本文研究了一种富含锌和钙的溶酶体纳米反应器在脓毒症中恢复单核细胞/巨噬细胞功能的作用 | 开发了一种名为Alpha-MOFs的纳米颗粒，通过释放溶酶体敏感的离子来提升单核细胞/巨噬细胞的吞噬能力 | NA | 研究脓毒症中单核细胞/巨噬细胞功能失调的机制，并开发新的治疗方法 | 脓毒症中的单核细胞/巨噬细胞及其吞噬功能 | NA | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 外周血单核细胞 |
| 614 | 2024-10-01 |
Revealing the impact of CD70 expression on the manufacture and functions of CAR-70 T-cells based on single-cell transcriptomics
2023-Oct, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03475-7
PMID:37382633
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研究论文 | 研究基于单细胞转录组学揭示CD70表达对CAR-70 T细胞制造和功能的影响 | 首次探讨了在CAR T细胞制造过程中敲除CD70对T细胞扩增、存活和抗肿瘤效果的影响 | 研究仅限于实验室环境，尚未在临床上验证其效果 | 探讨CD70表达对CAR-70 T细胞制造和功能的影响，为CAR T细胞治疗T细胞癌症提供指导 | CD70敲除和野生型CAR-70 T细胞的制造和抗肿瘤能力 | 细胞治疗 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序和TCR测序 | NA | 基因表达数据 | CD70敲除和野生型CAR-70 T细胞 |
| 615 | 2024-10-01 |
Identification of an antigen-presenting cells/T/NK cells-related gene signature to predict prognosis and CTSL to predict immunotherapeutic response for lung adenocarcinoma: an integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing
2023-Oct, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03485-5
PMID:37458771
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研究论文 | 本研究旨在通过综合分析bulk和单细胞RNA测序数据，识别与抗原呈递细胞（APC）/T/NK细胞相关的基因特征（ATNKGS）和潜在的免疫细胞相关基因（IRGs），以实现肺癌腺癌（LUAD）患者的危险分层、预后预测和免疫治疗反应预测 | 本研究首次构建了一个包含16个基因的ATNKGS，用于预测LUAD患者的总体生存率，并揭示了CTSL在免疫治疗反应预测中的重要作用 | 本研究主要基于公共数据集和外部免疫治疗队列进行验证，未来需要更多的临床试验数据来进一步验证这些发现 | 识别与APC/T/NK细胞相关的基因特征和潜在的免疫细胞相关基因，以实现LUAD患者的危险分层、预后预测和免疫治疗反应预测 | 肺癌腺癌（LUAD）患者 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | LASSO Cox回归 | RNA测序数据 | 1108名患者 |
| 616 | 2024-10-01 |
Female Gene Networks Are Expressed in Myofibroblast-Like Smooth Muscle Cells in Vulnerable Atherosclerotic Plaques
2023-10, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319325
PMID:37589136
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研究论文 | 研究探讨了女性基因网络在易损性动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞中的表达 | 首次揭示了女性基因网络在易损性动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞中的表达，并识别了两个主要的平滑肌细胞基因调控网络 | 研究主要集中在人类颈动脉斑块和Apoe-/-小鼠模型上，可能无法完全代表所有动脉粥样硬化情况 | 探讨女性基因网络在易损性动脉粥样硬化斑块中的作用 | 人类颈动脉斑块和Apoe-/-小鼠模型 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类颈动脉斑块样本和Apoe-/-小鼠模型 |
| 617 | 2024-10-01 |
Single-Cell RNA Sequencing and Its Applications in the Study of Psychiatric Disorders
2023-Jul, Biological psychiatry global open science
DOI:10.1016/j.bpsgos.2022.03.013
PMID:37519459
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术及其在精神疾病研究中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序技术在神经科学领域的创新应用，能够更准确地分类神经元和胶质细胞亚型，并发现新的细胞类型 | 目前对转录组的知识主要来自批量RNA测序，可能忽略单细胞分辨率下的微小转录组差异 | 探讨单细胞RNA测序技术在脑细胞分类、神经发育和精神疾病研究中的应用 | 神经元和胶质细胞亚型、神经发育过程、精神疾病 | 基因组学 | 精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 618 | 2024-10-01 |
Effects of 3-HAA on HCC by Regulating the Heterogeneous Macrophages-A scRNA-Seq Analysis
2023-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202207074
PMID:37013458
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研究论文 | 研究3-HAA对肝细胞癌（HCC）的免疫调节作用及其对异质性巨噬细胞的影响 | 首次通过scRNA-Seq分析揭示了3-HAA在HCC中的免疫调节作用及其对巨噬细胞亚群的影响 | 研究仅限于实验模型，尚未在临床环境中验证 | 探讨3-HAA在肝细胞癌中的免疫调节作用 | 3-HAA对HCC模型中巨噬细胞亚群的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-Seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涉及HCC模型的多个细胞亚群 |
| 619 | 2024-10-01 |
Keystone pathobionts associated with colorectal cancer promote oncogenic reprograming
2023-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.535410
PMID:37066368
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研究论文 | 研究了与结直肠癌相关的关键病原体如何促进致癌重编程 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了Fn和ETBF在结直肠癌模型小鼠中的具体作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨关键病原体在结直肠癌中的作用及其对上皮细胞和局部免疫细胞的影响 | 结直肠癌患者肠道微生物群中的Fn和ETBF | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型小鼠和结直肠癌模型小鼠 |
| 620 | 2024-09-30 |
Hormonal gatekeeping via the blood-brain barrier governs caste-specific behavior in ants
2023-09-28, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.08.002
PMID:37683635
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研究论文 | 揭示血脑屏障在调节蚂蚁复杂社会行为中的新作用 | 发现血脑屏障中的关键激素降解酶——保幼激素酯酶（Jhe）在调节蚂蚁社会行为中的作用 | 研究主要集中在蚂蚁和果蝇，未涉及其他物种 | 探讨血脑屏障在调节蚂蚁社会行为中的作用 | 蚂蚁和果蝇的血脑屏障及保幼激素酯酶 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 蚂蚁和果蝇的样本 |