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当前共找到 5350 篇文献，本页显示第 601 - 620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2025-10-07 |
Common and divergent gene regulatory networks control injury-induced and developmental neurogenesis in zebrafish retina
2023-12-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44142-w
PMID:38123561
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研究论文 | 通过单细胞测序技术比较斑马鱼视网膜发育和损伤诱导的神经再生过程 | 首次系统比较发育和再生过程中视网膜细胞的基因调控网络差异，发现不同类型视网膜细胞损伤会诱导独特的米勒胶质细胞再生反应 | 研究仅限于斑马鱼模型，结果可能不完全适用于哺乳动物 | 探究视网膜损伤后神经再生的分子机制及其与发育过程的异同 | 斑马鱼视网膜发育和损伤再生过程中的米勒胶质细胞和视网膜祖细胞 | 发育生物学 | 视网膜损伤 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序, ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 发育和再生过程中的斑马鱼视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, ATAC测序 | NA | NA |
| 602 | 2025-10-07 |
Single-cell multi-omics analysis of human testicular germ cell tumor reveals its molecular features and microenvironment
2023-12-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44305-9
PMID:38123589
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研究论文 | 通过单细胞多组学和空间转录组学分析揭示人类睾丸生殖细胞肿瘤的分子特征和微环境 | 首次结合单细胞多组学和空间转录组学技术系统解析精原细胞瘤的分子特征，发现其与原始生殖细胞的基因表达程序相似性，并鉴定TFAP2C在肿瘤侵袭迁移中的关键作用 | 研究样本量有限，主要基于精原细胞瘤样本和细胞系，需要更多验证 | 探索精原细胞瘤的分子特征和肿瘤微环境组成 | 人类睾丸生殖细胞肿瘤（精原细胞瘤）样本和精原细胞瘤细胞系 | 数字病理学 | 睾丸癌 | 单细胞多组学测序, 空间转录组学, 基因组学分析 | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据 | 精原细胞瘤样本和细胞系（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 603 | 2025-10-07 |
Reassessing endothelial-to-mesenchymal transition in mouse bone marrow: insights from lineage tracing models
2023-12-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44312-w
PMID:38123537
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研究论文 | 通过谱系追踪模型重新评估小鼠骨髓中内皮-间质转化的发生情况 | 结合单细胞RNA测序与多种谱系追踪模型，首次系统评估内皮细胞向骨髓基质细胞的转化潜力 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证；使用的遗传模型可能存在局限性 | 探究内皮细胞是否通过内皮-间质转化过程贡献于骨髓基质细胞的生成 | 小鼠骨髓中的内皮细胞和骨髓基质细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，谱系追踪，转基因小鼠模型 | NA | 基因表达数据，细胞定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 604 | 2025-10-07 |
Pathway centric analysis for single-cell RNA-seq and spatial transcriptomics data with GSDensity
2023-12-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44206-x
PMID:38110427
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研究论文 | 介绍GSDensity方法，用于单细胞RNA测序和空间转录组数据的通路中心分析 | 无需进行细胞聚类即可实现通路中心的单细胞和空间转录组数据分析，能够发现现有方法忽略的细胞-通路关联 | NA | 开发新的计算方法来解析高度异质性的单细胞和空间转录组数据 | 小鼠大脑发育过程和人类肿瘤组织 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 图模型 | 单细胞基因表达数据，空间转录组数据 | 六种不同肿瘤类型 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 605 | 2025-10-07 |
Autophagy of OTUD5 destabilizes GPX4 to confer ferroptosis-dependent kidney injury
2023-12-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44228-5
PMID:38110369
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研究论文 | 本研究揭示了肾脏缺血再灌注损伤中通过OTUD5自噬降解GPX4诱导铁死亡的新机制 | 首次发现OTUD5作为GPX4结合蛋白通过稳定GPX4赋予铁死亡抗性，并揭示mTORC1介导的自噬导致OTUD5降解的新通路 | 未明确说明研究样本的具体数量和组织来源 | 探究肾脏缺血再灌注损伤中铁死亡的空间分布和GPX4减少的分子机制 | 肾脏组织、肾小管细胞 | 空间转录组学 | 急性肾损伤 | 空间转录组学、AAV介导的基因递送 | NA | 空间转录组数据、分子相互作用数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 606 | 2025-10-07 |
Common and divergent gene regulatory networks control injury-induced and developmental neurogenesis in zebrafish retina
2023-Sep-18, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3294233/v1
PMID:37790324
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术比较斑马鱼视网膜发育和损伤诱导再生的基因调控网络 | 首次系统比较了不同视网膜神经元亚型缺失后诱导的米勒胶质细胞重编程差异，以及再生过程与发育过程的异同 | 研究仅限于斑马鱼模型，结果可能不完全适用于哺乳动物 | 探索视网膜损伤后再生与发育过程中基因调控网络的共同点和差异 | 斑马鱼视网膜发育和损伤再生过程中的米勒胶质细胞和神经元前体细胞 | 发育生物学 | 视网膜损伤 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序, ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 发育和再生视网膜样本 | NA | single-cell RNA-seq, single-nuclear RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 607 | 2025-10-07 |
Common and divergent gene regulatory networks control injury-induced and developmental neurogenesis in zebrafish retina
2023-Aug-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.08.552451
PMID:37609307
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术比较斑马鱼视网膜发育和损伤诱导的神经再生过程 | 首次系统比较了不同视网膜神经元亚型缺失后Müller胶质细胞重编程的差异，揭示了损伤诱导神经再生与发育过程在基因调控网络上的异同 | 研究主要基于斑马鱼模型，结果在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探索视网膜损伤后神经再生的分子机制及其与发育过程的异同 | 斑马鱼视网膜发育和损伤再生过程中的Müller胶质细胞和神经祖细胞 | 发育生物学 | 视网膜损伤 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序, ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 发育和再生过程中的斑马鱼视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 608 | 2025-10-07 |
DeMixSC: a deconvolution framework that uses single-cell sequencing plus a small benchmark dataset for improved analysis of cell-type ratios in complex tissue samples
2023-Nov-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.10.561733
PMID:37873318
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研究论文 | 提出一种名为DeMixSC的去卷积框架，通过结合单细胞测序数据和小型基准数据集来提高复杂组织样本中细胞类型比例的分析精度 | 引入匹配跨平台生物信号的实验设计，开发基于加权非负最小二乘法的新框架，能够识别和调整技术差异高的基因 | NA | 解决跨测序平台技术差异对细胞类型去卷积分析精度限制的问题 | 复杂生物样本中的细胞类型比例分析 | 生物信息学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | 加权非负最小二乘法 | 基因表达数据 | 453名年龄相关性黄斑变性患者队列加上健康视网膜基准数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 609 | 2025-10-07 |
Comprehensive single cell aging atlas of mammary tissues reveals shared epigenomic and transcriptomic signatures of aging and cancer
2023-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.20.563147
PMID:37961129
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研究论文 | 通过单细胞分辨率研究小鼠乳腺组织衰老过程中的转录组和表观基因组变化，揭示衰老与癌症之间的分子联系 | 首次构建了乳腺组织衰老的单细胞图谱，揭示了衰老过程中上皮细胞、基质细胞和免疫细胞的表观遗传和转录组变化，并发现衰老特征与人类乳腺癌的相似性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；空间转录组数据可能覆盖区域有限 | 探究衰老如何影响乳腺组织的细胞和分子程序，以及这些变化与癌症发生的关系 | 小鼠乳腺组织中的上皮细胞、基质细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,表观基因组分析 | NA | 单细胞转录组数据,表观基因组数据,空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量的小鼠乳腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 610 | 2025-10-07 |
Epigenetics of Early Cardiometabolic Disease: Mechanisms and Precision Medicine
2023-06-09, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.322135
PMID:37289899
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综述 | 本综述全面探讨了表观遗传学在心血管代谢疾病中的作用机制及其在精准医学中的应用前景 | 系统整合DNA甲基化作为精准医学生物标志物的潜力，并探讨社会健康决定因素、肠道细菌表观基因组学等新兴因素对疾病发展的影响 | NA | 阐述表观遗传学在心血管代谢疾病中的分子机制及其在精准医学中的应用 | 心血管和代谢疾病相关的表观遗传过程 | 表观遗传学 | 心血管代谢疾病 | 单细胞测序, 表观遗传编辑 | NA | 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 611 | 2025-10-07 |
High-throughput single nucleus total RNA sequencing of formalin-fixed paraffin-embedded tissues by snRandom-seq
2023-05-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38409-5
PMID:37173341
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研究论文 | 开发了一种名为snRandom-seq的高通量单核总RNA测序技术，用于福尔马林固定石蜡包埋组织 | 使用随机引物捕获全长总RNA，相比现有技术具有更低的双胞率、更高的RNA覆盖度，并能检测更多非编码RNA和新生RNA | NA | 开发适用于FFPE组织的单核RNA测序技术 | 福尔马林固定石蜡包埋组织样本 | 单细胞测序 | 肝癌 | 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类肝癌FFPE标本 | NA | 单核RNA测序 | snRandom-seq | 基于液滴的单核总RNA测序技术，使用随机引物捕获全长RNA |
| 612 | 2025-10-07 |
Single cell spatial transcriptomics reveals distinct patterns of dysregulation in non-neuronal and neuronal cells induced by the Trem2R47H Alzheimer's risk gene mutation
2023-Dec-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3656139/v1
PMID:38106071
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研究论文 | 通过单细胞空间转录组学分析Trem2R47H阿尔茨海默病风险基因突变对非神经元和神经元细胞的差异性调控模式 | 首次利用MERFISH空间转录组技术系统揭示Trem2R47H突变在不同脑细胞类型中的空间特异性转录调控机制 | 研究仅限于小鼠模型，样本量相对有限（15个脑切片） | 探究Trem2R47H突变对阿尔茨海默病相关转录组失调的细胞类型特异性影响 | 野生型、Trem2R47H突变型、5xFAD和Trem2R47H;5xFAD复合基因型小鼠脑组织 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | MERFISH空间转录组学 | 自定义分析流程 | 空间转录组数据、神经病理学数据 | 15个小鼠脑切片 | NA | 空间转录组学 | MERFISH | NA |
| 613 | 2025-10-07 |
The Histone Methyltransferase SETDB2 Modulates Tissue Inhibitors of Metalloproteinase-Matrix Metalloproteinase Activity During Abdominal Aortic Aneurysm Development
2023-09-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000005963
PMID:37325923
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研究论文 | 本研究揭示组蛋白甲基转移酶SETDB2通过调控TIMP-MMP活性在腹主动脉瘤发展中的关键作用 | 首次发现SETDB2通过H3K9me3修饰抑制TIMP1-3基因表达，从而调控巨噬细胞介导的蛋白酶活性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究巨噬细胞特异性表观遗传酶在腹主动脉瘤发展中的作用机制 | 人类主动脉组织样本和髓系特异性SETDB2缺陷小鼠模型 | 表观遗传学 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序，基因敲除，表观遗传分析 | NA | 基因表达数据，组织学数据 | 人类AAA组织和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 614 | 2025-10-07 |
Macrophage-mediated PDGF Activation Correlates With Regenerative Outcomes Following Musculoskeletal Trauma
2023-08-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000005704
PMID:36111847
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析巨噬细胞亚群与肌肉骨骼损伤后再生或纤维化愈合的关系 | 首次在多种肌肉骨骼损伤模型中系统鉴定出与再生和纤维化愈合相关的巨噬细胞亚群，并发现血小板衍生生长因子信号在再生条件下的增强作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 识别与肌肉骨骼损伤后再生或纤维化愈合相关的巨噬细胞亚群和基因特征 | 小鼠肌肉骨骼损伤模型，包括再生性和纤维化肌肉损失、再生性指端截肢和异位骨化 | 单细胞转录组学 | 肌肉骨骼损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多种小鼠损伤模型的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 615 | 2025-10-07 |
Spatial heterogeneity of bone marrow endothelial cells unveils a distinct subtype in the epiphysis
2023-10, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-023-01240-7
PMID:37798545
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了骨髓内皮细胞的空间异质性，并在骨骺区发现了一种独特的毛细血管亚型——S型内皮细胞 | 首次在骨骺区鉴定出具有独特表型特征的S型内皮细胞，发现其通过分泌I型胶原蛋白参与骨强度获得，并形成造血干细胞的特殊储存库 | NA | 探索骨髓内皮细胞的异质性及其在骨形成和造血过程中的功能 | 骨髓内皮细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 616 | 2025-10-07 |
Screening of four lysosome-related genes in sepsis based on RNA sequencing technology
2023-12-06, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-023-00588-7
PMID:38057716
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研究论文 | 通过RNA测序技术筛选与脓毒症相关的溶酶体相关基因 | 首次通过整合RNA测序数据和溶酶体相关基因数据库，筛选出与脓毒症预后相关的四个核心基因 | 样本量较小（22例患者和10例正常对照），需要更大规模研究验证 | 筛选脓毒症患者中与溶酶体相关的基因，为溶酶体靶向治疗提供方向 | 脓毒症患者和正常对照者的外周血样本 | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 22例脓毒症患者和10例正常对照 | NA | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 617 | 2025-10-07 |
KRT19 is a Promising Prognostic Biomarker and Associates with Immune Infiltrates in Serous Ovarian Cystadenocarcinoma
2023, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S419235
PMID:37916194
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析发现KRT19是浆液性卵巢囊腺癌中具有前景的预后生物标志物，并与免疫浸润相关 | 首次系统分析KRT19在卵巢癌中的表达特征、预后价值和免疫浸润关联 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探讨KRT19在卵巢癌中的表达特征、预后价值和免疫学功能 | 浆液性卵巢囊腺癌患者样本 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 生物信息学分析，单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 来自TCGA、GTEx、GEO和HPA数据库的卵巢癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 618 | 2025-10-07 |
Simultaneous CRISPR screening and spatial transcriptomics reveals intracellular, intercellular, and functional transcriptional circuits
2023-Dec-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.30.569494
PMID:38076932
|
研究论文 | 开发了一种结合CRISPR筛选和空间转录组学的新方法Perturb-FISH，用于研究单细胞分辨率下的遗传和分子关联 | 首次将成像空间转录组学与并行光学检测扩增的引导RNA相结合，能够同时分析细胞内、细胞间和功能转录回路 | NA | 开发一种能够在单细胞分辨率下研究空间和功能生物学遗传和分子关联的通用方法 | 培养的单核细胞、诱导多能干细胞衍生的星形胶质细胞 | 空间转录组学 | 自闭症谱系障碍 | CRISPR筛选、空间转录组学、成像技术 | NA | 转录组数据、空间位置数据、功能表型数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞转录组学 | NA | Perturb-FISH平台 |
| 619 | 2025-10-07 |
Differential chromatin accessibility and transcriptional dynamics define breast cancer subtypes and their lineages
2023-Nov-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.31.565031
PMID:37961519
|
研究论文 | 本研究通过多组学技术分析乳腺癌亚型与起源细胞之间的染色质可及性和转录动态特征 | 首次在单细胞水平整合染色质可及性和转录组数据，系统揭示乳腺癌亚型与特定起源细胞的谱系关系 | 样本量相对有限（37例患者），部分分子机制仍需进一步验证 | 阐明乳腺癌不同亚型的细胞起源及其转录调控网络 | 37名乳腺癌患者的61个样本（包括肿瘤和正常组织） | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,单核ATAC测序,空间转录组学,多重成像 | PAM50亚型分析算法,轨迹分析,调控网络分析 | 基因组,转录组,表观基因组,空间定位数据 | 37例乳腺癌患者的61个样本 | NA | 单细胞RNA-seq,单核ATAC-seq,空间转录组学,多重成像, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 620 | 2025-10-07 |
Graft dysfunction in compassionate use of genetically engineered pig-to-human cardiac xenotransplantation: a case report
2023-07-29, Lancet (London, England)
DOI:10.1016/S0140-6736(23)00775-4
PMID:37393920
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病例报告 | 报告首例基因工程猪-人心脏异种移植的临床病例，分析移植功能障碍的原因 | 首次在人类患者中实施基因工程猪心脏异种移植并详细分析移植失败机制 | 单病例研究，结果可能不具有普遍性 | 探索异种心脏移植的临床可行性和失败机制 | 57岁终末期心力衰竭男性患者和基因工程猪心脏移植物 | 移植医学 | 心血管疾病 | DNA PCR, RNA转录分析, 单细胞RNA测序, 电子显微镜, 免疫组化 | NA | 临床监测数据, 分子生物学数据, 病理学数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |