单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5355 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-12-06 |
Single-cell RNA-seq methods to interrogate virus-host interactions
2023-01, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-022-00972-2
PMID:36414692
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在病毒-宿主相互作用研究中的应用 | 本文总结了scRNA-seq技术及其在抗病毒免疫中的应用，强调了其在理解病毒基因组和宿主反应异质性、感染细胞与旁观细胞的差异反应以及细胞间通信网络方面的重要作用 | NA | 探讨scRNA-seq技术在病毒-宿主相互作用研究中的应用及其在抗病毒治疗策略开发中的潜力 | 病毒与宿主细胞的相互作用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 42 | 2024-12-02 |
Deterministic evolution and stringent selection during preneoplasia
2023-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06102-8
PMID:37258665
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研究论文 | 本文通过双等位基因失活TP53模拟胃癌前病变，研究了早期肿瘤发生过程中的确定性进化和严格选择 | 本文首次在胃器官模型中模拟了TP53失活后的实验进化过程，揭示了早期肿瘤发生中的选择压力和表型收敛现象 | 研究仅限于胃器官模型，可能无法完全代表人体内的复杂情况 | 研究早期肿瘤发生过程中的进化机制和选择压力 | TP53失活的胃器官模型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 多个克隆来源的胃器官培养物，历时2年 |
| 43 | 2024-12-01 |
Spatial Transcriptomics Resolve an Emphysema-specific Lymphoid Follicle B Cell Signature in COPD
2023-Dec-08, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202303-0507OC
PMID:38064378
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研究论文 | 研究分析了慢性阻塞性肺疾病（COPD）中与肺气肿相关的淋巴滤泡（LF）的转录组特征 | 揭示了肺气肿患者淋巴滤泡中B细胞活化的独特转录组特征 | 研究样本仅限于40名COPD患者和吸烟者，可能无法代表所有COPD患者的情况 | 探讨COPD患者中肺气肿与淋巴滤泡B细胞免疫成分的关系 | COPD患者和吸烟者的肺组织中的淋巴滤泡 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 40名COPD患者和吸烟者的肺组织样本 |
| 44 | 2024-11-29 |
T-BET and EOMES sustain mature human NK cell identity and antitumor function
2023-07-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI162530
PMID:37279078
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研究论文 | 研究探讨了T-BET和EOMES转录因子在维持成熟人类NK细胞身份和抗肿瘤功能中的持续需求 | 首次揭示了T-BET和EOMES在成熟NK细胞中的持续表达对其功能和身份维持的重要性 | 研究仅限于未扩增的初级人类NK细胞，可能无法完全代表所有NK细胞群体 | 探讨T-BET和EOMES在成熟NK细胞中的持续需求及其对细胞功能和身份的影响 | 人类NK细胞 | 免疫学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑技术，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未扩增的初级人类NK细胞 |
| 45 | 2024-11-27 |
A spatial human thymus cell atlas mapped to a continuous tissue axis
2023-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.25.562925
PMID:37986877
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研究论文 | 本文通过空间解析分析，建立了一个新的定量形态学框架，用于描述胸腺的皮质-髓质轴，并展示了胸腺细胞和胸腺上皮细胞的高度组织性 | 本文创新性地结合了多模态单细胞、空间转录组学和高分辨率多重成像技术，构建了一个连续组织轴上的空间人类胸腺细胞图谱 | NA | 研究胸腺细胞在出生前和出生后的发育过程及其微解剖学基础 | 胸腺细胞和胸腺上皮细胞的发育轨迹及其组织结构 | NA | NA | 空间转录组学、高分辨率多重成像 | NA | 单细胞数据、空间转录组数据、图像数据 | NA |
| 46 | 2024-11-25 |
Spatial transcriptomics reveals distinct tissue niches linked with steroid responsiveness in acute gastrointestinal GVHD
2023-11-23, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023020644
PMID:37699201
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研究论文 | 研究利用空间转录组技术揭示了急性胃肠道GVHD中与类固醇反应性相关的不同组织微环境 | 首次利用空间转录组技术分析了急性胃肠道GVHD患者的组织微环境，并发现了与类固醇反应性相关的独特基因表达特征 | 样本量较小，仅包括32名患者，可能影响结果的普适性 | 揭示急性胃肠道GVHD中与类固醇反应性相关的组织微环境，并识别潜在的预后生物标志物 | 急性胃肠道GVHD患者的组织样本 | 数字病理学 | 造血系统疾病 | 空间转录组技术 | NA | 基因表达数据 | 32名急性胃肠道GVHD患者 |
| 47 | 2024-11-25 |
Temporal regulation of neural diversity in Drosophila and vertebrates
2023-06, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2022.05.011
PMID:35623984
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综述 | 本文综述了果蝇和脊椎动物神经多样性的时间调控机制 | 本文通过比较果蝇和脊椎动物的脑发育程序，揭示了神经多样性生成中的时间模式机制的共性 | NA | 探讨果蝇和脊椎动物神经多样性的时间调控机制 | 果蝇和脊椎动物的神经多样性生成 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | 大量单细胞样本 |
| 48 | 2024-11-24 |
Differential chromatin accessibility and transcriptional dynamics define breast cancer subtypes and their lineages
2023-Nov-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.31.565031
PMID:37961519
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研究论文 | 本文研究了乳腺癌亚型及其谱系的染色质可及性和转录动力学的差异 | 首次应用多组学技术结合空间转录组学和多重成像技术，揭示了乳腺癌亚型与其潜在起源细胞之间的基因表达和染色质可及性的特征联系 | 研究样本量相对较小，且仅限于乳腺癌患者 | 探讨乳腺癌亚型及其谱系的起源细胞和转录网络 | 乳腺癌亚型及其谱系的起源细胞和转录网络 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、空间转录组学、多重成像 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 61个样本，来自37名乳腺癌患者 |
| 49 | 2024-11-24 |
FRC transplantation restores lymph node conduit defects in laminin α4-deficient mice
2023-04-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.167816
PMID:37092548
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研究论文 | 研究探讨了纤维母细胞网状细胞（FRCs）通过产生层粘连蛋白α4（Lama4）在调节淋巴结（LN）结构和功能中的特定作用 | 首次揭示了Lama4在维持淋巴结导管完整性中的关键作用，并通过FRC移植恢复了Lama4缺陷小鼠的淋巴结导管缺陷 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类中验证这些发现 | 探讨FRCs在免疫调节中的作用及其在淋巴结结构和功能中的具体机制 | 纤维母细胞网状细胞（FRCs）和层粘连蛋白α4（Lama4）在淋巴结（LN）中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用FRC特异性KO小鼠进行研究 |
| 50 | 2024-11-23 |
An Anterior Second Heart Field Enhancer Regulates the Gene Regulatory Network of the Cardiac Outflow Tract
2023-11-21, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 研究通过CRISPR-Cas9基因编辑技术删除心脏增强子，探讨其在心脏流出道基因调控网络中的作用 | 揭示了前第二心场增强子在连接GATA6与NKX2-5依赖的旋转和隔膜基因程序中的关键作用 | NA | 探讨心脏流出道发育异常的基因调控网络 | 心脏流出道、前第二心场增强子、GATA6、NKX2-5 | NA | 心血管疾病 | CRISPR-Cas9基因编辑、RNA测序、单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序、转座酶可及染色质测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 小鼠模型、人类诱导多能干细胞衍生的心肌细胞 |
| 51 | 2024-11-23 |
Single-Cell Integration of BMD GWAS Results Prioritize Candidate Genes Influencing Age-Related Bone Loss
2023-Oct, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/jbm4.10795
PMID:37808401
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研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序数据整合骨密度全基因组关联研究结果，优先筛选影响年龄相关骨丢失的候选基因 | 通过单细胞RNA测序数据，揭示了候选基因在特定细胞类型中的表达特征，为骨密度维持提供了新的治疗靶点 | 主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 研究年龄相关骨丢失的遗传机制，并筛选潜在的治疗靶点 | 骨密度相关基因及其在不同细胞类型中的表达 | 基因组学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 老年小鼠的骨髓和骨组织样本 |
| 52 | 2024-11-23 |
Immunophenotypic correlates of sustained MRD negativity in patients with multiple myeloma
2023-09-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40966-8
PMID:37660077
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研究论文 | 本研究探讨了多发性骨髓瘤患者在接受连续来那度胺维持治疗期间，免疫微环境在维持疾病缓解中的作用 | 利用单细胞RNA测序、T细胞受体β测序和CyTOF质谱流式细胞术，全面分析了23名新诊断的多发性骨髓瘤患者在接受来那度胺治疗前后的免疫景观变化 | 样本量较小，仅包括23名患者 | 旨在发现与长期治疗反应相关的免疫表型特征 | 新诊断的多发性骨髓瘤患者在接受来那度胺维持治疗期间的免疫微环境 | NA | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、T细胞受体β测序、CyTOF质谱流式细胞术 | NA | RNA序列、T细胞受体序列、质谱流式细胞术数据 | 23名患者 |
| 53 | 2024-11-23 |
Mammary duct luminal epithelium controls adipocyte thermogenic programme
2023-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06361-5
PMID:37495690
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研究论文 | 研究报告了乳腺导管上皮细胞在脂肪微环境中调节冷暴露诱导的小鼠皮下白色脂肪组织中脂肪细胞UCP1表达的作用 | 首次揭示了乳腺导管上皮细胞通过分泌因子'mammokines'调控脂肪细胞UCP1表达，并发现这些因子在性别特异性脂肪生成中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，结果的普遍性和在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨乳腺导管上皮细胞在脂肪细胞UCP1表达调控中的作用及其在性别特异性脂肪生成中的意义 | 小鼠皮下白色脂肪组织中的乳腺导管上皮细胞和脂肪细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠皮下白色脂肪组织样本 |
| 54 | 2024-11-23 |
SPICEMIX enables integrative single-cell spatial modeling of cell identity
2023-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01256-z
PMID:36624346
|
研究论文 | 介绍了一种名为SPICEMIX的计算方法，用于整合单细胞空间转录组数据，以揭示细胞身份 | SPICEMIX基于概率潜变量建模，能够显著改进细胞类型及其空间模式的推断，优于现有方法 | NA | 开发一种能够利用空间转录组数据独特性质揭示细胞身份的计算方法 | 空间转录组数据中的细胞类型及其空间模式 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 概率潜变量模型 | 基因表达数据 | 人类和小鼠脑区的空间转录组数据，通过seqFISH+、STARmap和Visium技术获取 |
| 55 | 2024-11-22 |
Transcription factor NFYa controls cardiomyocyte metabolism and proliferation during mouse fetal heart development
2023-Dec-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.10.012
PMID:37972593
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研究论文 | 研究转录因子NFYa在小鼠胎儿心脏发育中对心肌细胞代谢和增殖的调控作用 | 首次揭示了NFYa在调节胎儿心脏生长中的关键作用，并发现了一种新的心脏代谢转录调控机制 | NA | 探讨NFYa在心肌细胞代谢和增殖中的作用及其对心脏发育的影响 | 小鼠胎儿心脏中的心肌细胞 | NA | NA | 空间和单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 56 | 2024-11-22 |
Single-cell transcriptomics stratifies organoid models of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2023-Dec-11, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2023113898
PMID:37962490
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析，评估了三种不同条件下的人类肝脏类器官模型在代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）中的表现 | 首次系统评估了人类肝脏类器官模型在MASLD中的转化潜力，并提供了单细胞参考数据以基准未来的类器官损伤模型 | NA | 评估人类肝脏类器官模型在代谢功能障碍相关脂肪性肝病中的表现，并提供单细胞参考数据 | 人类肝脏类器官模型在不同条件下的MASLD表现 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 三种不同条件下的肝脏类器官模型 |
| 57 | 2024-11-22 |
Latent human herpesvirus 6 is reactivated in CAR T cells
2023-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06704-2
PMID:37938768
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研究论文 | 研究通过大规模病毒基因组挖掘，揭示了人类潜伏性病毒再激活的现状，并发现HHV-6B可以在人类CD4 T细胞培养中重新激活 | 首次通过单细胞测序技术识别出HHV-6的'超级表达者'，并证明这些细胞在CAR T细胞治疗产品中的存在 | 研究主要集中在实验室培养的细胞和已批准或正在进行临床试验的产品，未涵盖所有可能的细胞治疗产品 | 探讨细胞治疗产品中潜伏性人类疱疹病毒6的再激活机制及其对临床的影响 | 人类CD4 T细胞和CAR T细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 涉及研究级同种异体嵌合抗原受体T细胞和接受细胞治疗产品的患者 |
| 58 | 2024-11-22 |
Single-Cell Analysis Reveals Distinct Immune and Smooth Muscle Cell Populations that Contribute to Chronic Thromboembolic Pulmonary Hypertension
2023-05-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202203-0441OC
PMID:36803741
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示了慢性血栓栓塞性肺动脉高压中不同的免疫和肌细胞群体及其功能障碍 | 首次通过单细胞RNA测序技术，全面分析了慢性血栓栓塞性肺动脉高压中的多种细胞类型及其功能，并识别出潜在的治疗靶点PAR1 | 研究样本量较小，仅涉及五名患者，可能影响结果的普适性 | 识别构成慢性血栓栓塞性肺动脉高压血栓的多种细胞类型，并研究其功能障碍 | 慢性血栓栓塞性肺动脉高压中的免疫细胞和肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五名患者 |
| 59 | 2024-11-22 |
Enteroendocrine Cells Protect the Stem Cell Niche by Regulating Crypt Metabolism in Response to Nutrients
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.12.016
PMID:36608902
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研究论文 | 研究探讨了肠内分泌细胞在调节隐窝代谢和肠道干细胞功能中的作用 | 首次揭示了肠内分泌细胞在传递营养信息至干细胞微环境中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和人类肠道类器官，可能无法完全代表所有物种的肠道生理 | 探讨肠内分泌细胞在调节隐窝代谢和肠道干细胞功能中的作用 | 肠内分泌细胞、肠道干细胞、隐窝代谢 | NA | NA | 间接量热法、1H-核磁共振代谢组学、线粒体活体成像、Seahorse生物分析仪、10x Genomics单细胞测序 | NA | 代谢数据、单细胞转录组数据 | 小鼠模型和人类肠道类器官 |
| 60 | 2024-11-21 |
Dissecting mammalian reproduction with spatial transcriptomics
2023-11-02, Human reproduction update
IF:14.8Q1
DOI:10.1093/humupd/dmad017
PMID:37353907
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在哺乳动物生殖系统研究中的应用，重点介绍了其在配子发生、胚胎发生和生殖病理学方面的生物学新见解 | 空间转录组学技术通过保留细胞在原生组织环境中的空间背景，揭示了细胞状态如何通过与邻近体细胞的相互作用进行调控 | 当前的空间转录组学技术在应用于生殖研究时仍面临实验和计算上的挑战 | 综述空间转录组学技术在哺乳动物生殖系统研究中的最新进展，并讨论其在未来的应用前景 | 哺乳动物生殖系统中的配子发生、胚胎发生和生殖病理学 | 空间转录组学 | 生殖系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |