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当前共找到 5354 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 41 | 2026-05-26 |
Spatiotemporal molecular dynamics of the developing human thalamus
2023-10-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf9941
PMID:37824646
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研究论文 | 利用单细胞和多重空间转录组学揭示人类丘脑发育过程中的时空分子动态 | 首次在人类发育中的丘脑中描绘分子定义的神经元分化轨迹和空间组织模式，鉴定出不同丘脑核团中富集的谷氨酸能和GABA能神经元亚型 | 对丘脑发育的分子架构理解仍不完整，尤其对人类而言 | 阐明人类丘脑发育中细胞命运特化和组织的分子轨迹 | 人类发育中的丘脑组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、多重空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人类发育中期（第二孕期）的丘脑样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组平台 |
| 42 | 2026-05-25 |
Tissue nanotransfection causes tumor regression by its effect on nanovesicle cargo that alters microenvironmental macrophage state
2023-05-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2022.11.003
PMID:36380587
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研究论文 | 本研究首次通过纳米级荧光可视化，揭示肿瘤来源携带miR-126的细胞外囊泡如何改变肿瘤相关巨噬细胞状态，促进肿瘤形成，并通过组织纳米转染技术实现肿瘤消退 | 首次实现肿瘤来源细胞外囊泡及其miR-126 cargo的纳米级荧光可视化，并阐明其通过诱导肿瘤相关巨噬细胞向血管生成状态转变来促进肿瘤形成的新机制，同时利用局部组织纳米转染技术有效靶向该过程 | 研究基于小鼠血管肿瘤模型，结论向人类肿瘤的转化尚需验证；未明确组织纳米转染技术应用于深层肿瘤的可行性 | 探究肿瘤来源细胞外囊泡携带的miR-126如何通过改变肿瘤微环境中的巨噬细胞状态来促进肿瘤形成，并评估局部组织纳米转染技术作为治疗手段的效果 | 小鼠致死性血管肿瘤模型中的肿瘤细胞、肿瘤相关巨噬细胞及肿瘤来源细胞外囊泡 | 数字病理学 | 肿瘤（血管肿瘤） | NA | NA | 图像（纳米级荧光可视化）、测序数据（单细胞RNA-seq） | 小鼠模型，未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2026-05-25 |
Improving cellular phylogenies through the integrated use of mutation order and optimality principles
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.07.018
PMID:37602230
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研究论文 | 开发了一种整合突变顺序和最优性原则的计算方法，用于从单细胞测序数据中推断细胞系统发育关系 | 首次将标准系统发育最优性原则与序列变异共现模式整合应用于单细胞测序数据，生成更准确且更完整的细胞系统发育树 | 未提及具体局限性 | 提高单细胞测序数据的系统发育推断准确性，用于肿瘤演化研究 | 单细胞测序数据中的体细胞变异及CRISPR/Cas9基因编辑数据集 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 44 | 2026-05-24 |
Endothelial cells are a key target of IFN-g during response to combined PD-1/CTLA-4 ICB treatment in a mouse model of bladder cancer
2023-Oct-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107937
PMID:37810214
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术，在膀胱癌小鼠模型中探究联合PD-1/CTLA-4免疫检查点阻断治疗后不同细胞类型的应答机制，发现内皮细胞是IFN-γ信号的关键靶点 | 首次通过单细胞分辨率揭示内皮细胞中IFN-γ信号在联合ICB治疗中的关键作用，并利用基因敲除实验验证其功能 | 仅在小鼠模型中进行验证，缺乏人类样本数据，且未深入探究内皮细胞IFN-γ信号下游的具体分子机制 | 探索联合PD-1/CTLA-4 ICB治疗在不同细胞类型中的应答机制 | 膀胱癌小鼠模型中的肿瘤细胞、内皮细胞及CD4 T细胞 | 单细胞转录组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞基因表达数据 | 三种条件下的肿瘤组织样本：未治疗、治疗后、CD4 T细胞清除后治疗 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2026-05-24 |
Cloning a profibrotic stem cell variant in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-04-26, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abp9528
PMID:37099633
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研究论文 | 通过单细胞克隆技术从特发性肺纤维化患者远端肺中鉴定出一种促纤维化干细胞变体，该变体能够转化正常肺成纤维细胞并激活肌成纤维细胞，其基因表达网络与器官纤维化相关 | 首次通过单细胞克隆技术鉴定出特发性肺纤维化中一种促纤维化干细胞变体，该变体在正常和胎儿肺中低量存在，但具有转化正常成纤维细胞为致病性肌成纤维细胞的能力，并筛选出表皮生长因子和雷帕霉素靶蛋白信号通路抑制剂作为潜在治疗靶点 | 未明确说明研究的局限性，但可能包括样本量有限、体外实验与体内微环境的差异、以及干细胞变体在疾病中的确切致病机制仍需进一步验证 | 揭示特发性肺纤维化中肺基底干细胞异质性的致病机制，鉴定促纤维化干细胞变体及其治疗靶点 | 16例特发性肺纤维化患者和10例对照者的远端肺基底干细胞 | 机器学习和数字病理学 | 特发性肺纤维化，慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序，单细胞克隆技术 | NA | 基因表达数据 | 16例特发性肺纤维化患者和10例对照者的远端肺样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 46 | 2026-05-24 |
Reconstruction of Single-Cell Trajectories Using Stochastic Tree Search
2023-01-26, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14020318
PMID:36833245
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研究论文 | 提出一种用于单细胞轨迹重建的随机树搜索算法 | 引入惩罚似然框架和随机树搜索算法，旨在解决大且非凸树空间中的全局最优问题，相比现有方法提高了细胞排序和伪时间估计的准确性和鲁棒性 | 未明确提及局限性 | 开发更准确且鲁棒的单细胞轨迹推断方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机树搜索 | 基因表达数据 | 模拟数据和真实数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2026-05-23 |
Dimension-agnostic and granularity-based spatially variable gene identification using BSP
2023-11-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43256-5
PMID:37963892
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研究论文 | 提出一种名为BSP的非参数模型，用于从二维或三维空间转录组数据中快速稳健地识别空间可变基因 | BSP方法能处理三维空间转录组数据，具有快速、稳健的优点，且是非参数模型，能比较两个空间粒度的基因表达模式 | 未提及主要局限性 | 开发一种维度无关且基于粒度的空间可变基因识别方法 | 空间可变基因 | 机器学习 | 癌症、类风湿性关节炎、肾脏疾病 | 空间转录组学 | 非参数模型（BSP） | 空间转录组数据 | 模拟数据及来自癌症、神经科学、类风湿性关节炎和肾脏研究的多种空间转录组技术数据 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 48 | 2026-05-23 |
Proteogenomic and V(D)J Analysis of Human Decidual T Cells Highlights Unique Transcriptional Programming and Clonal Distribution
2023-07-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200061
PMID:37195197
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术对人类蜕膜T细胞进行蛋白质组学和V(D)J分析，揭示其独特的转录编程和克隆分布 | 首次在单细胞水平同时获得人类蜕膜T细胞的转录组、有限蛋白质和受体库信息，揭示了蜕膜T细胞独特的转录编程机制和克隆分布的差异 | 未明确说明文章局限性 | 研究人类蜕膜T细胞的亚群分布、转录编程和克隆多样性，以理解母胎界面的免疫耐受机制 | 人类蜕膜和配对母体外周T细胞 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组、蛋白质、受体库 | 人类蜕膜和配对母体外周血T细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 49 | 2026-05-22 |
Inflammatory Activity of Epithelial Stem Cell Variants from Cystic Fibrosis Lungs Is Not Resolved by CFTR Modulators
2023-11-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202305-0818OC
PMID:37695863
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研究论文 | 该研究探讨了囊性纤维化肺中上皮干细胞变体的炎症活性，并发现CFTR调节剂无法解决这一问题 | 首次识别出囊性纤维化肺中存在多种促炎性干细胞变体，并证明CFTR调节剂无法消除其炎症活性 | 研究仅限于终末期囊性纤维化肺的样本，且仅分析了少数患者，可能无法代表早期或不同基因型的情况 | 确定囊性纤维化肺是否含有类似慢性阻塞性肺病的致病性干细胞变体，并评估它们对炎症的贡献及CFTR调节剂的影响 | 囊性纤维化患者的终末期肺组织（来自4例患者） | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序、RNA测序、异种移植 | NA | RNA测序数据、异种移植实验结果 | 4例囊性纤维化患者的肺组织（3例纯合CFTR:F508D，1例CFTR F508D/L1254X；FEV范围为14-30%） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 50 | 2026-05-22 |
ScRNA-seq defines dynamic T-cell subsets in longitudinal colon and peripheral blood samples in immune checkpoint inhibitor-induced colitis
2023-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007358
PMID:37586769
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析免疫检查点抑制剂诱导结肠炎患者纵向结肠和外周血样本中T细胞亚群的动态变化 | 首次利用单细胞RNA测序和T细胞受体测序技术，纵向追踪结肠炎发展及治疗过程中结肠和外周免疫环境的动态变化，揭示了CD8+ T细胞在生物治疗中的优先耗竭及其与炎症和免疫抑制反应的关联 | 基于单个病例的研究，样本量有限，无法推广至更广泛人群；且未阐明驱动ICI结肠炎的具体分子机制 | 探究免疫检查点抑制剂诱导结肠炎在结肠和外周免疫环境中的动态变化机制 | 一名患有梅克尔细胞癌并接受帕博利珠单抗治疗后发生结肠炎的患者 | 单细胞转录组学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和 T细胞受体测序 (TCR-seq) | NA | 单细胞基因表达数据和T细胞受体序列 | 一名患者的多个时间点（治疗前后）的结肠组织和外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA |
| 51 | 2026-05-22 |
Stress resilience-enhancing drugs preserve tissue structure and function in degenerating retina via phosphodiesterase inhibition
2023-05-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2221045120
PMID:37126699
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研究论文 | 通过系统药理学平台识别环核苷酸磷酸二酯酶抑制作为增强视网膜应激韧性的治疗策略，在多种视网膜退行性模型中保护组织结构与功能 | 首次通过整合单细胞转录组学、蛋白质组学和磷酸蛋白质组学，揭示年龄相关和遗传性视网膜退行性病变的通用分子机制，并证明选择性抑制环核苷酸磷酸二酯酶可同时激活保护性机制并协同抑制退行性过程 | 未提供 | 开发针对视网膜退行性疾病早期阶段的治疗方法，以保留视网膜结构和视觉功能 | 年龄相关和遗传性视网膜退行性病变的多种模型 | 系统药理学 | 年龄相关性黄斑变性、糖尿病视网膜病变、视网膜色素变性 | 单细胞转录组学、蛋白质组学、磷酸蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、磷酸蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、磷酸蛋白质组学 | NA | NA |
| 52 | 2026-05-21 |
Morphological, molecular, and functional characterization of mouse glutamatergic myenteric neurons
2023-Sep-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.18.558146
PMID:37781576
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研究论文 | 系统表征小鼠结肠直肠中VGLUT2阳性肠神经元的形态、分子和功能特性 | 首次通过稀疏标记、单细胞mRNA测序和钙成像技术，全面揭示VGLUT2阳性肠神经元为功能独特的神经元群体，具有单个向尾端投射的长轴突，并通过烟碱型胆碱能神经传递间接响应结直肠机械拉伸 | 单细胞mRNA测序仅分析52个VGLUT2阳性神经元，样本量较小；研究局限于小鼠远端结肠和直肠，未涉及其他肠道区域或物种 | 阐明小鼠结肠直肠中VGLUT2阳性肠神经元的形态、分子和功能特征 | 小鼠结肠直肠中的VGLUT2阳性肠神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞mRNA测序、AAV稀疏标记、GCaMP6f钙成像 | NA | 基因表达数据、钙成像数据 | 31个VGLUT2阳性肠神经元用于形态分析，52个用于单细胞测序，215个用于钙成像 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2026-05-20 |
Single-cell transcriptome analysis illuminating the characteristics of species-specific innate immune responses against viral infections
2023-10-17, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giad086
PMID:37848618
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析，揭示蝙蝠和灵长类动物在病毒感染中先天免疫反应的物种特异性特征 | 首次通过单细胞RNA测序比较灵长类（人类、黑猩猩、猕猴）与蝙蝠（埃及果蝠）对多种病原刺激的免疫反应差异，并鉴定蝙蝠特有的单核细胞亚群 | 未明确提及局限性，但可能包括样本数量有限或仅关注外周血单核细胞 | 阐明蝙蝠与灵长类动物在病毒感染中先天免疫反应的差异及其潜在机制 | 灵长类（人类、黑猩猩、猕猴）和蝙蝠（埃及果蝠）的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及人类、黑猩猩、猕猴和蝙蝠的样本，具体数量未提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 54 | 2026-05-20 |
A Specialized Epithelial Cell Type Regulating Mucosal Immunity and Driving Human Crohn's Disease
2023-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.30.560293
PMID:37873404
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析，发现一种名为LND的新型上皮细胞类型在克罗恩病中显著扩增，并驱动黏膜免疫失调 | 首次鉴定出LND细胞作为克罗恩病特异性致病上皮细胞亚型，揭示其通过抗菌反应和免疫调控参与疾病发病机制，并发现其亚群比例与抗TNF治疗反应相关 | 未提供具体局限性信息 | 解析克罗恩病的细胞异质性，识别新的致病细胞类型和生物标志物 | 克罗恩病患者和正常对照的回肠末端及升结肠组织样本 | 单细胞生物学, 免疫学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序, 高分辨率原位RNA成像, 多重蛋白成像 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 65例克罗恩病患者和18例非炎症性肠病对照的170份样本，共202,359个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 55 | 2026-05-20 |
Single-Cell Kinetic Modeling of β-Lapachone Metabolism in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2023-Mar-17, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox12030741
PMID:36978989
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，对头颈部鳞状细胞癌中β-拉帕醌代谢进行动力学建模，模拟药物诱导的氧化应激反应 | 首次构建了基于单细胞转录组的抗氧化酶网络模型，揭示了健康与癌细胞之间氧化还原状态的系统性差异，为解释NQO1生物活化药物的临床异质性提供了机制基础 | 模型基于转录组数据推断酶活性，未直接测量蛋白质表达或代谢通量；样本量有限（10名患者），可能无法完全代表HNSCC的异质性 | 利用单细胞RNA测序数据模拟头颈部鳞状细胞癌对β-拉帕醌治疗的反应异质性 | 10名头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织及对应的健康组织细胞 | 单细胞组学、系统生物学建模 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、系统动力学建模 | 抗氧化酶网络模型（基于微分方程的系统生物学模型） | 单细胞转录组数据 | 10名头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤和健康组织样本，超过4000个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于单细胞RNA测序数据的计算建模，未提及具体测序平台 |
| 56 | 2026-05-16 |
Single-cell RNA sequencing reveals cell landscape following antimony exposure during spermatogenesis in Drosophila testes
2023-Mar-09, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-023-01391-4
PMID:36894529
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示锑暴露对果蝇睾丸精子发生过程中细胞景观的影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示锑暴露对果蝇睾丸精子发生的转录调控机制，并发现新的基因（如Dup98B）在精子发生过程中的状态偏向表达 | 未提及具体局限性 | 研究锑暴露对果蝇睾丸精子发生的影响及单细胞分辨率下的转录调控机制 | 果蝇睾丸细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 果蝇暴露于锑10天的睾丸样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2026-05-15 |
Genome-wide mapping of cancer dependency genes and genetic modifiers of chemotherapy in high-risk hepatoblastoma
2023-07-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39717-6
PMID:37414763
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研究论文 | 通过改进的MYC驱动肝母细胞瘤小鼠模型结合CRISPR-Cas9筛选，绘制了癌症依赖基因图谱并鉴定化疗遗传修饰因子 | 首次在肝母细胞瘤中整合单细胞转录组、空间转录组及CRISPR全基因组筛选，发现与高风险人类疾病相关的可药物化靶点（如CDK7、CDK9、PRMT1、PRMT5）及化疗增敏调控因子PRKDC | 未提及具体局限性（标题与摘要未提供） | 构建肝母细胞瘤的遗传模型并系统鉴定治疗靶点及化疗反应修饰因子 | 高风险的胚胎型肝母细胞瘤 | 机器学习 | 肝母细胞瘤 | CRISPR-Cas9筛选，单细胞RNA测序，空间转录组学，转录组测序 | NA | 基因表达数据，单细胞数据，空间转录组数据 | 小鼠模型及衍生细胞系（具体数量未提） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium |
| 58 | 2026-05-15 |
The current state and future of T-cell exhaustion research
2023, Oxford open immunology
DOI:10.1093/oxfimm/iqad006
PMID:37554723
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综述 | 本文回顾了T细胞耗竭的研究现状，讨论了其分子定义不一致的问题，并提出了通过系统遗传学方法（如单细胞RNA-seq和CRISPR筛选）达成共识的进展，同时强调了体外生成耗竭T细胞的研究重要性 | 提出了用一组基于代谢、表观遗传、转录和激活的表型标志物（称为M.E.T.A）来统一定义T细胞耗竭，旨在解决不同研究语境下耗竭定义不一致的问题 | 由于在体内环境中进行操作困难，理解耗竭如何发生仍具挑战性 | 探讨T细胞耗竭的当前知识、研究方法及未来方向，推动统一定义和标准化分析 | T细胞，特别是耗竭T细胞 | 机器学习 | 慢性病毒感染，癌症 | 单细胞RNA-seq，CRISPR筛选 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 59 | 2026-05-11 |
Analysis of Single-Cell RNA-seq Data
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2986-4_6
PMID:36929075
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综述 | 描述了单细胞RNA测序数据分析的标准工作流程和相关工具，并提供使用建议 | NA | NA | 介绍单细胞RNA测序数据分析的标准工作流程和常用方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2026-05-09 |
Convergent alterations in the tumor microenvironment of MYC-driven human and murine prostate cancer
2023-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.07.553268
PMID:37905029
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研究论文 | 通过对人类和基因工程小鼠模型的前列腺癌进行单细胞RNA测序和分子病理学分析，揭示了MYC驱动的肿瘤微环境趋同变化 | 首次系统阐明了MYC信号激活作为人类前列腺癌肿瘤微环境重塑的共同驱动因素，并通过跨物种比较研究验证了该发现 | 文中未明确说明，但可能涉及小鼠模型与人类疾病的差异以及样本量有限 | 探究MYC驱动的前列腺癌细胞如何调控肿瘤微环境改变 | 人类前列腺癌组织及基因工程小鼠模型的前列腺组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 人类组织样本和小鼠模型样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |