单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 41 | 2026-03-13 |
Integrative Single-Cell and Bulk Transcriptomes Analyses Identify Intrinsic HNSCC Subtypes with Distinct Prognoses and Therapeutic Vulnerabilities
2023-Aug-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-3563
PMID:37192003
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，定义了头颈鳞状细胞癌的内在分子亚型，并评估了其临床意义和治疗脆弱性 | 首次通过单细胞RNA测序分析提出HNSCC的三个内在共识分子亚型，并开发了基于机器学习的预后和治疗预测签名 | NA | 定义HNSCC的内在上皮亚型，以改善患者分层、个性化治疗和预后预测 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 机器学习 | RNA测序数据 | 来自多个队列的1,325名患者 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2026-03-13 |
Immunosuppressive tumor microenvironment contributes to tumor progression in diffuse large B-cell lymphoma upon anti-CD19 chimeric antigen receptor T therapy
2023-Aug, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-022-0972-8
PMID:37060525
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了抗CD19 CAR-T细胞疗法在弥漫性大B细胞淋巴瘤患者中的肿瘤微环境变化，揭示了M2亚型巨噬细胞在治疗失败和疾病进展中的关键作用 | 首次在CAR-T细胞治疗背景下，利用单细胞RNA测序技术系统分析了DLBCL患者治疗前后肿瘤微环境的动态变化，并明确了M2巨噬细胞在介导免疫抑制微环境和治疗抵抗中的核心机制 | 样本量相对较小（22例可评估患者），且为观察性研究，需要更大规模的前瞻性研究验证结论 | 探究抗CD19 CAR-T细胞疗法在DLBCL患者中失败的根本机制，特别是肿瘤微环境的变化如何影响治疗效果 | 接受抗CD19 CD28z CAR-T细胞疗法（FKC876）治疗的复发或难治性弥漫性大B细胞淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 22例可评估的DLBCL患者（其中7例完全缓解，10例部分缓解，4例疾病稳定） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2026-03-13 |
Disease-Associated Oligodendrocyte: New Player in Alzheimer's Disease and CNS Pathologies
2023-Jul-07, Journal of integrative neuroscience
IF:2.5Q3
DOI:10.31083/j.jin2204090
PMID:37519162
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综述 | 本文综述了少突胶质细胞在阿尔茨海默病中的作用及其分子特征，并探讨了靶向少突胶质细胞作为治疗或预防新策略的可能性 | 提出了少突胶质细胞功能障碍可能是阿尔茨海默病早期进展的第一步，并引入了通过单细胞测序技术发现的“疾病相关少突胶质细胞”这一新概念 | NA | 探讨少突胶质细胞在阿尔茨海默病认知衰退中的可能作用及其分子特征 | 少突胶质细胞、髓鞘、阿尔茨海默病 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2026-03-13 |
[Evaluation of peripheral blood T-lymphocyte subpopulations features in patients with hepatitis B virus-related acute-on-chronic liver failure based on single-cell sequencing technology]
2023-Apr-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，评估了乙型肝炎病毒相关慢加急性肝衰竭患者外周血T淋巴细胞亚群的特征 | 首次在HBV-ACLF患者中，基于单细胞测序技术系统描绘了外周血T淋巴细胞的分化轨迹，并鉴定出具有高度耗竭特征的CD4(+)TIGIT(+)和CD8(+)LAG3(+)亚群 | 样本量较小（6例患者和3例健康对照），且为单中心研究，需要更大样本验证 | 探索HBV-ACLF患者外周血耗竭T淋巴细胞的特征，为ACLF免疫功能障碍寻找潜在的治疗靶点分子 | 乙型肝炎病毒相关慢加急性肝衰竭患者的外周血T淋巴细胞 | 单细胞组学 | 肝衰竭 | 单细胞RNA测序 | 拟时序分析 | 单细胞转录组数据 | 6例HBV-ACLF患者和3例健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2026-03-13 |
[Research progress of single-cell sequencing technology in liver diseases]
2023-Feb-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肝脏疾病研究中的进展 | 总结了单细胞测序作为一种新兴测序方法在揭示肝脏疾病复杂机制方面的应用潜力 | NA | 综述单细胞测序技术在肝脏疾病研究中的应用进展 | 肝脏疾病 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 46 | 2026-03-10 |
Dissecting the immune suppressive human prostate tumor microenvironment via integrated single-cell and spatial transcriptomic analyses
2023-02-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36325-2
PMID:36750562
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组分析，深入解析了人类前列腺肿瘤微环境的免疫抑制特性 | 首次结合单细胞RNA测序和高分辨率空间转录组技术，全面描述局部前列腺癌的肿瘤微环境，并推断未解离组织切片中的细胞间相互作用 | 未明确提及研究样本量限制或技术验证的不足 | 理解前列腺癌免疫逃逸和肿瘤进展的驱动因素，以改善临床治疗策略 | 局部前列腺癌患者样本、邻近正常组织和健康对照 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 47 | 2026-03-06 |
Anterior Pituitary Transcriptomics Following a High-Fat Diet: Impact of Oxidative Stress on Cell Metabolism
2023-12-23, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad191
PMID:38103263
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研究论文 | 本研究通过高脂饮食诱导肥胖，利用单细胞RNA测序分析前垂体转录组变化，探讨肥胖相关氧化应激对垂体细胞代谢的影响 | 首次在热中性环境中结合高脂饮食和单细胞RNA测序技术，系统比较雄性和雌性小鼠垂体细胞对肥胖应激的差异反应，并识别出雌性中最易受影响的垂体细胞群体 | 研究仅使用FVB.129P小鼠品系，结果可能不适用于其他遗传背景；实验周期最长15周，未能评估长期效应；未深入探讨分子机制 | 探究肥胖引起的氧化应激如何影响前垂体细胞功能，并比较性别差异 | 雄性和雌性FVB.129P小鼠的前垂体细胞 | 单细胞转录组学 | 肥胖相关代谢紊乱 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | FVB.129P小鼠，高脂饮食组10-15周，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2026-03-06 |
CD8+ lymphocytes are critical for early control of tuberculosis in macaques
2023-12-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230707
PMID:37843832
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研究论文 | 本研究通过耗竭猕猴的CD8+淋巴细胞，揭示了其在结核病早期控制中的关键作用 | 首次在非人灵长类动物模型中系统性地证明了CD8+淋巴细胞（包括先天性和适应性亚群）对结核分枝杆菌早期感染控制的关键作用，并利用单细胞RNA测序技术揭示了肉芽肿中多功能的细胞毒性CD8+淋巴细胞特征 | 研究仅在猕猴模型中进行，结果向人类直接外推需谨慎；CD8耗竭的长期效应和具体分子机制有待进一步阐明 | 阐明CD8+淋巴细胞在结核病免疫防御中的功能作用 | 猕猴（非人灵长类动物） | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，配体-受体分析 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 猕猴感染模型（具体数量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2026-03-06 |
Inflammatory Activity of Epithelial Stem Cell Variants from Cystic Fibrosis Lungs Is Not Resolved by CFTR Modulators
2023-11-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202305-0818OC
PMID:37695863
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研究论文 | 本研究揭示了囊性纤维化（CF）晚期肺中存在三种促炎性干细胞变异体，且这些变异体的促炎功能无法通过CFTR基因补偿或CFTR调节剂药物恢复CFTR活性而缓解 | 首次在CF晚期肺中鉴定出三种促炎性干细胞变异体，并证明其促炎功能不受CFTR功能恢复的影响，这为解释CF患者在接受CFTR调节剂治疗后肺部炎症持续存在提供了新机制 | 研究样本量较小（仅4例终末期CF患者），且均为晚期疾病患者，可能无法完全代表早期或轻度CF患者的干细胞异质性 | 确定CF肺中是否存在类似COPD的致病性干细胞变异体，识别可能促进CF肺部炎症状态的特定变异体，并评估CFTR基因补偿或CFTR调节剂对这些炎症变异体的影响 | 终末期囊性纤维化（CF）患者的肺组织 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、干细胞克隆技术、异种移植、RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、基因表达数据 | 4例终末期CF患者（3例CFTR:F508D纯合子，1例CFTR F508D/L1254X杂合子）的肺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 50 | 2026-03-06 |
Molecular signature incorporating the immune microenvironment enhances thyroid cancer outcome prediction
2023-Oct-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100409
PMID:37868034
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研究论文 | 本研究通过整合基因组、转录组和空间转录组数据，开发了一个名为MAP评分的分子特征，用于增强甲状腺癌的预后预测 | 首次结合DNA/RNA测序、空间转录组学和多重免疫荧光技术，从大型患者队列中识别出甲状腺癌的侵袭性分子特征，并开发了MAP评分，该评分超越了传统高风险突变的预后能力，特别关注了肿瘤微环境中的淋巴细胞富集基质 | 研究基于两个三级医疗中心的251名患者样本，样本来源可能有限，且未来需要更多临床验证来确认MAP评分在广泛人群中的适用性 | 改善甲状腺癌的预后预测和免疫治疗指导 | 251名甲状腺癌患者的312个样本 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | DNA测序, RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 251名患者的312个样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 51 | 2026-03-06 |
Single-Cell RNA Sequencing (scRNA-seq) Identifies L1CAM as a Key Mediator between Epithelial Tuft Cell and Innate Lymphoid Cell in the Colon of Hnrnp I Knockout Mice
2023-Oct-09, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11102734
PMID:37893107
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Hnrnp I敲除小鼠结肠中，上皮簇细胞通过L1CAM-整合素相互作用与第2组固有淋巴细胞（ILC2s）进行关键通讯，从而促进2型免疫反应和炎症的机制 | 首次在Hnrnp I敲除小鼠模型中，利用单细胞RNA测序技术揭示了结肠上皮簇细胞通过L1CAM-整合素相互作用与ILC2s建立特异性细胞通讯，驱动2型免疫反应的新机制 | 研究局限于小鼠模型，尚未在人类样本或临床环境中验证；机制研究主要基于相关性分析，缺乏直接的因果验证实验 | 探究Hnrnp I敲除导致结肠炎症和增生过程中，上皮细胞谱系动态变化和细胞间通讯的分子机制 | 野生型和Hnrnp I敲除小鼠的结肠组织及分离的单个细胞 | 单细胞组学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色，细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据，蛋白质表达数据 | 野生型和Hnrnp I敲除小鼠的结肠组织（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2026-03-06 |
Spatial atlas of the mouse central nervous system at molecular resolution
2023-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06569-5
PMID:37758947
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研究论文 | 本研究利用STARmap PLUS原位测序技术，在三维空间中以单细胞分辨率绘制了小鼠中枢神经系统的分子细胞类型图谱 | 开发了STARmap PLUS原位测序方法，首次在三维尺度上以高分辨率（194×194×345 nm体素）同时分析1,022个基因，实现了对小鼠全脑和脊髓的全面空间转录组分析 | NA | 绘制小鼠中枢神经系统在分子分辨率下的空间图谱，以揭示大脑解剖结构和功能的分子基础 | 成年小鼠的大脑和脊髓组织 | 数字病理学 | NA | 原位测序 | NA | 空间转录组数据 | 109万个高质量细胞 | NA | 空间转录组学 | STARmap PLUS | STARmap PLUS原位测序技术，体素尺寸为194×194×345 nm |
| 53 | 2026-03-06 |
Spatial transcriptomics analysis of neoadjuvant cabozantinib and nivolumab in advanced hepatocellular carcinoma identifies independent mechanisms of resistance and recurrence
2023-09-18, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01218-y
PMID:37723590
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学分析肝细胞癌新辅助卡博替尼和纳武利尤单抗治疗后的肿瘤微环境，揭示了响应与非响应肿瘤的异质性机制 | 首次应用空间转录组学技术系统性描绘肝细胞癌新辅助联合治疗下的肿瘤微环境异质性，识别出PAX5模块激活和B细胞成熟在治疗响应中的关键作用，以及癌症相关成纤维细胞介导的细胞外基质重塑机制 | 样本量较小（仅15例患者），且仅基于单中心前瞻性试验数据，需要更大规模验证 | 探究肝细胞癌对现代系统性治疗（卡博替尼联合纳武利尤单抗）响应差异的分子和细胞机制 | 肝细胞癌患者的肿瘤切除标本 | 空间转录组学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 15例肝细胞癌患者（其中5例有病理响应） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 54 | 2026-03-06 |
An integrated genomic approach identifies follistatin as a target of the p63-epidermal growth factor receptor oncogenic network in head and neck squamous cell carcinoma
2023-Sep, NAR cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/narcan/zcad038
PMID:37492374
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研究论文 | 本文通过整合基因组学方法，识别了头颈鳞状细胞癌中p63-表皮生长因子受体致癌网络的关键靶点卵泡抑素 | 首次将卵泡抑素确定为p63的直接转录靶点，并揭示了其在连接TGF-β和EGFR通路中的功能作用，同时通过单细胞RNA测序数据明确了癌细胞是肿瘤微环境中卵泡抑素的主要来源 | 未详细探讨卵泡抑素在肿瘤微环境中与免疫细胞相互作用的分子机制 | 阐明头颈鳞状细胞癌中致癌基因及其下游靶点介导肿瘤进展的机制 | 头颈鳞状细胞癌患者样本和代表性细胞系模型 | 基因组学 | 头颈鳞状细胞癌 | 整合基因组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 来自头颈鳞状细胞癌患者和细胞系模型的多个转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2026-03-06 |
Transcriptomic forecasting with neural ordinary differential equations
2023-Aug-11, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2023.100793
PMID:37602211
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研究论文 | 本文开发了一种基于神经常微分方程的方法RNAForecaster，用于预测单细胞中多个未来时间步的基因表达状态 | 提出了一种嵌入无关的方法，能够从具有时间信息的高通量数据集中短期预测未来表达状态 | NA | 解决从细胞状态快照推断轨迹到估计细胞基因表达时间变化的挑战 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经常微分方程 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2026-03-06 |
Cellular barcoding tracks heterogeneous clones through selective pressures and phenotypic transitions
2023-07, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2023.03.008
PMID:37105856
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综述 | 本文综述了细胞条形码技术在追踪异质性癌症克隆亚群命运中的应用，特别是与单细胞转录组学结合，以克隆级分辨率分析分子机制 | 结合细胞条形码与单细胞转录组学，实现克隆水平的高分辨率纵向分析，为研究肿瘤异质性起源和贡献提供了新工具 | NA | 探讨肿瘤细胞异质性的起源和贡献，以及选择和表型可塑性在疾病进展和治疗中的作用 | 异质性癌症细胞群体中的克隆亚群 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 57 | 2026-03-06 |
Spatial Single-Cell Technologies for Exploring Gastrointestinal Tissue Transcriptome
2023-06-26, Comprehensive Physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1002/cphy.c210053
PMID:37358516
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综述 | 本文总结了空间单细胞转录组技术在探索胃肠道组织转录组方面的最新进展及其对理解胃肠道生理学的促进作用 | 系统综述了新兴的空间单细胞技术如何通过提供全基因组水平的基因表达空间信息，弥补传统方法在解析胃肠道组织结构和细胞异质性方面的不足 | 作为一篇小型综述，未涉及具体实验数据或技术细节的深入分析，主要聚焦于技术概述和应用前景讨论 | 探讨空间单细胞转录组技术在胃肠道组织研究中的应用价值和发展前景 | 胃肠道组织及其多层次结构和异质性细胞群体 | 空间转录组学 | NA | 空间单细胞转录组技术 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 58 | 2026-03-06 |
TFAP2 paralogs regulate midfacial development in part through a conserved ALX genetic pathway
2023-Jun-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.16.545376
PMID:37398373
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研究论文 | 本研究揭示了TFAP2旁系同源物通过调控ALX基因表达，在脊椎动物中面部发育中发挥关键作用 | 首次通过联合失活TFAP2A和TFAP2B，结合bulk和单细胞RNA-seq分析，揭示了TFAP2在调控中面部基因调控网络中的核心作用，并证实了TFAP2-ALX调控轴在脊椎动物间的保守性 | 研究主要基于小鼠和斑马鱼模型，在人类或其他哺乳动物中的直接验证尚需进一步探索 | 探究TFAP2旁系同源物在中面部发育中的调控机制 | 小鼠和斑马鱼的颅神经嵴细胞及中面部发育过程 | 发育生物学 | 面部畸形 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据, 染色质免疫沉淀数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2026-03-06 |
Activation of Angiopoietin-Tie2 Signaling Protects the Kidney from Ischemic Injury by Modulation of Endothelial-Specific Pathways
2023-06-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000098
PMID:36787763
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研究论文 | 本研究探讨了通过激活Angiopoietin-Tie2信号通路来保护肾脏免受缺血性损伤的分子机制，并测试了一种新型angiopoietin模拟物Hepta-ANG1的治疗潜力 | 揭示了VE-PTP在缺血再灌注损伤中上调并抑制Tie2的机制，首次展示了Hepta-ANG1作为新型治疗生物制剂在单细胞水平上促进肾脏内皮细胞新亚群出现的能力 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证Hepta-ANG1的安全性和有效性 | 探究Angiopoietin-Tie2信号通路在缺血再灌注急性肾损伤中的保护作用及分子机制 | 小鼠肾脏内皮细胞及缺血再灌注损伤模型 | 单细胞组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用VE-PTP野生型或敲除小鼠及C57BL/6J小鼠进行实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2026-03-06 |
RhoA GEF Mcf2lb regulates rosette integrity during collective cell migration
2023-Apr-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.19.537573
PMID:37131612
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研究论文 | 本研究利用斑马鱼后侧线原基作为模型系统，发现RhoA鸟嘌呤核苷酸交换因子Mcf2lb通过调控顶端收缩来维持集体细胞迁移过程中多细胞玫瑰花结结构的完整性 | 首次鉴定出Mcf2lb作为RhoA特异性GEF在调控多细胞玫瑰花结结构完整性中的关键作用，并揭示了其通过RhoA-Rock-2a-非肌肉肌球蛋白II信号轴调控顶端收缩的分子机制 | 研究主要基于斑马鱼模型系统，在哺乳动物系统中的保守性有待进一步验证；对Mcf2lb调控RhoA活性的具体生化机制尚未深入解析 | 探究多细胞玫瑰花结结构形成和维持的分子调控机制 | 斑马鱼后侧线原基中的多细胞玫瑰花结结构 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，整体原位杂交，活体成像，3D分析 | NA | 基因表达数据，成像数据 | 斑马鱼后侧线原基细胞群（约150个细胞） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |