单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202301-202312] [清除筛选条件]
当前共找到 5353 篇文献,本页显示第 41 - 60 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2026-04-14
Transcriptomic research in atherosclerosis: Unravelling plaque phenotype and overcoming methodological challenges
2023-Dec, Journal of molecular and cellular cardiology plus
综述 本文综述了转录组学在动脉粥样硬化研究中的应用,重点探讨了其在揭示斑块表型、克服方法学挑战以及未来研究方向方面的价值 系统总结了转录组学在动脉粥样硬化斑块表型研究中的最新进展,包括单细胞测序等新技术的应用价值,并强调了研究方法标准化与多组学数据整合的重要性 作为综述文章,未提出新的实验数据或模型,主要基于现有文献进行总结和展望 探讨转录组学如何帮助理解动脉粥样硬化斑块的不同表型,并解决该领域研究方法可重复性低、缺乏标准化等挑战 动脉粥样硬化斑块 自然语言处理 心血管疾病 转录组测序 机器学习 文本 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
42 2026-04-14
CD73-generated extracellular adenosine promotes resolution of neutrophil-mediated tissue injury and restrains metaplasia in pancreatitis
2023-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究探讨了CD73通过生成细胞外腺苷在胰腺炎中促进中性粒细胞介导的组织损伤消退和抑制化生的作用 首次揭示了CD73在胰腺炎中通过腺苷信号通路调控中性粒细胞浸润和化生过程的具体机制,并提出了CD73增强剂作为潜在治疗策略 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中得到验证;未详细探讨不同病因(如酒精性、胆源性)胰腺炎中CD73作用的异质性 阐明CD73在胰腺炎炎症消退和组织修复中的作用机制 CD73基因敲除小鼠和野生型C57BL/6小鼠 单细胞组学 胰腺炎 单细胞RNA测序,免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据,组织图像数据 CD73敲除小鼠和野生型小鼠的胰腺组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
43 2026-04-14
Cerebrospinal fluid immune cells appear similar across neuropathic and non-neuropathic pain conditions
2023, Wellcome open research
研究论文 本研究通过分析脑脊液免疫细胞,探讨其作为神经病理性疼痛中微胶质细胞激活的替代指标的可能性 首次结合FACS、RNA测序和CITE测序技术,系统比较神经病理性与非神经病理性疼痛患者脑脊液免疫细胞的相似性,并挑战了脑脊液作为微胶质功能生物标志物的直接应用 样本量较小,且无法明确区分脑脊液蛋白质来源是循环单核细胞还是脊髓实质中的微胶质细胞 评估脑脊液是否可作为人类微胶质细胞激活的生物标志物,以研究神经病理性疼痛的病理机制 神经病理性疼痛患者(如带状疱疹后神经痛和背部手术失败后神经痛)的脑脊液免疫细胞 NA 神经病理性疼痛 荧光激活细胞分选(FACS)、RNA测序、CITE测序 NA 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据 包括神经病理性疼痛患者及与已发表单细胞RNA测序数据的比较,具体样本数未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
44 2026-04-14
Mast cell marker gene signature: prognosis and immunotherapy response prediction in lung adenocarcinoma through integrated scRNA-seq and bulk RNA-seq
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,开发了一个基于肥大细胞相关基因的预后特征,用于预测肺腺癌患者的生存和免疫治疗反应 结合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据构建了包含九个肥大细胞相关基因的预后特征,并验证了其在预测免疫治疗反应方面的潜力 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于SYAP1基因的体外功能研究,缺乏临床样本的广泛验证 探究肥大细胞在肺腺癌预后和免疫治疗反应中的作用 肺腺癌患者和肿瘤细胞 生物信息学 肺腺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA RNA测序数据 多个外部队列(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
45 2026-04-12
Deep scRNA sequencing reveals a broadly applicable Regeneration Classifier and implicates antioxidant response in corticospinal axon regeneration
2023-12-20, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过深度单细胞RNA测序揭示了适用于多种神经元类型的再生分类器,并强调了抗氧化反应在皮质脊髓轴突再生中的关键作用 开发了一个广泛适用的再生分类器,能够预测不同神经元类型在发育阶段或损伤后的再生潜力,并通过条件基因删除验证了NRF2在皮质脊髓束再生中的作用 仅对数百个表型鉴定的神经元进行了深度测序,样本规模相对较小,可能限制了结果的普适性 探究中枢神经系统轴突再生的生物学机制,特别是皮质脊髓束在脊髓损伤后的再生潜力 皮质脊髓束神经元,特别是经过PTEN和SOCS3删除处理的再生神经元 数字病理学 脊髓损伤 单细胞RNA测序 监督分类(使用Garnett) 单细胞转录组数据 数百个表型鉴定的神经元 NA 单细胞RNA-seq NA NA
46 2026-04-12
Probing regenerative heterogeneity of corticospinal neurons with scRNA-Seq
2023-Feb-21, Research square
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术探究了皮质脊髓神经元在脊髓损伤后再生能力的异质性 通过单细胞RNA测序技术深入分析稀有再生神经元,揭示了抗氧化反应和线粒体生物合成在皮质脊髓神经元再生中的关键作用,并开发了再生分类器用于预测不同神经元类型的再生能力 研究仅涉及数百个表型鉴定的皮质脊髓神经元,样本量相对较小,可能无法全面代表所有神经元亚群的再生特性 探究皮质脊髓神经元在脊髓损伤后再生能力的异质性及其分子机制 皮质脊髓神经元 单细胞测序 脊髓损伤 单细胞RNA测序 监督分类方法(Garnett) 单细胞RNA测序数据 数百个表型鉴定的皮质脊髓神经元 NA 单细胞RNA-seq NA NA
47 2026-04-11
Transcription factor NFYa controls cardiomyocyte metabolism and proliferation during mouse fetal heart development
2023-12-18, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本研究探讨了转录因子NFYa在小鼠胎儿心脏发育过程中调控心肌细胞代谢和增殖的作用 揭示了NFYa通过与辅因子SP2相互作用,在转录水平激活连接代谢和增殖的基因,这是先前未被识别的心脏代谢转录调控机制 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类,且未深入探讨NFYa在成年心脏再生中的具体作用 探究NFYa在协调心肌细胞代谢和增殖中的机制,以理解胎儿心脏发育和再生的调控 小鼠胎儿心脏中的心肌细胞 数字病理学 心血管疾病 空间转录组分析,单细胞转录组分析 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
48 2026-04-11
Universal recording of cell-cell contacts in vivo for interaction-based transcriptomics
2023-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种通用版本的LIPSTIC技术(uLIPSTIC),用于在体内记录细胞间物理相互作用,并结合单细胞转录组学分析免疫细胞与非免疫细胞间的互作网络 开发了不依赖于特定受体-配体对的通用细胞间接触记录技术,扩展了原LIPSTIC技术的应用范围 未明确说明技术灵敏度或可能存在的假阳性/假阴性问题 开发通用技术以研究免疫细胞与非免疫细胞间的瞬时物理相互作用 免疫细胞(CD8 T细胞、调节性T细胞、滤泡辅助T细胞)与肠道上皮细胞等非免疫细胞 单细胞组学 NA 单细胞转录组学 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
49 2026-04-11
Targeting Immune-Fibroblast Crosstalk in Myocardial Infarction and Cardiac Fibrosis
2023-Jan-26, Research square
研究论文 本研究通过多组学单细胞分析揭示了人类心肌梗死和心脏纤维化中免疫-成纤维细胞交互作用的分子机制 首次在人类心脏疾病中系统探索免疫-成纤维细胞交互的分子机制,并识别出由IL-1β信号驱动的促纤维化成纤维细胞亚群 样本量相对有限(38名捐赠者),且动物模型与人类疾病表型的完全重现性仍有待验证 探究心肌梗死和心脏纤维化中免疫细胞与成纤维细胞之间的交互作用机制 人类心脏组织(急性梗死和慢性衰竭心脏)以及小鼠心脏损伤模型 单细胞多组学 心血管疾病 单细胞基因表达分析、表位映射、染色质可及性分析、空间转录组学 NA 单细胞多组学数据、空间转录组数据 38名捐赠者的人类心脏样本 NA 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 NA NA
50 2026-04-09
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing data identifies the characteristics of ferroptosis in lumbar disc herniation
2023-Sep-01, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,识别了腰椎间盘突出症中铁死亡的特征,并发现MYB基因可能是一个潜在的治疗靶点 首次将单细胞RNA测序与bulk RNA测序数据整合分析,用于研究腰椎间盘突出症中的铁死亡特征,并揭示了MYB基因在疾病中的关键作用及与免疫细胞的关联 研究主要基于生物信息学分析,实验验证部分仅通过RT-qPCR确认了标志基因的功能,缺乏更深入的体内外功能实验验证 阐明铁死亡在腰椎间盘突出症发病机制中的具体作用,并寻找潜在的治疗靶点 腰椎间盘突出症患者的转录组数据集和单细胞RNA测序数据 生物信息学 腰椎间盘突出症 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, RT-qPCR, 生物信息学分析 LASSO, SVM-RFE, CIBERSORT, AUCell RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
51 2026-04-09
Multiomic analyses implicate a neurodevelopmental program in the pathogenesis of cerebral arachnoid cysts
2023-03, Nature medicine IF:58.7Q1
研究论文 本研究通过多组学分析探讨了脑蛛网膜囊肿的发病机制,揭示了其与神经发育程序的关联 首次整合患者-父母外显子组、单细胞RNA测序转录组和医疗记录自然语言处理数据,系统性分析脑蛛网膜囊肿的遗传基础和临床亚型 研究样本量相对有限,且主要基于外显子组数据,可能遗漏非编码区域的变异 阐明脑蛛网膜囊肿的发病机制及其与神经发育障碍的关联 脑蛛网膜囊肿患者及其父母、人类和小鼠的脑及脑膜单细胞转录组数据 自然语言处理 脑蛛网膜囊肿 外显子组测序、单细胞RNA测序、自然语言处理 NA 基因组数据、转录组数据、文本数据 617个患者-父母三重外显子组、152,898个人类和小鼠脑及脑膜单细胞转录组 NA 单细胞RNA-seq NA NA
52 2026-04-08
An Integrated Map of Cell Type-Specific Gene Expression in Pancreatic Islets
2023-11-01, Diabetes IF:6.2Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序构建了一个胰腺胰岛细胞类型特异性基因表达的综合图谱,涵盖多种疾病状态 首次整合了来自65名供体的192,203个细胞的单细胞RNA测序数据,创建了一个易于查询和用于生物信息学流程的胰岛细胞类型特异性基因表达参考图谱 研究主要基于单细胞RNA测序数据,可能未涵盖其他组学层面(如蛋白质组学或表观遗传学)的信息,且样本来源和数量可能限制某些罕见细胞类型的全面表征 构建一个全面的胰岛细胞类型特异性基因表达参考图谱,以促进胰岛生物学研究和糖尿病相关疾病的理解 来自无糖尿病、1型糖尿病自身抗体阳性、1型糖尿病和2型糖尿病供体的胰腺胰岛细胞 数字病理学 糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 192,203个细胞,来自65名供体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
53 2026-04-08
The 'omics of obesity in B-cell acute lymphoblastic leukemia
2023-05-04, Journal of the National Cancer Institute. Monographs
研究论文 本研究通过多组学方法探讨肥胖如何影响B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)的细胞功能和化疗耐药性 首次结合单细胞和批量转录组学、代谢组学及蛋白质组学分析,揭示脂肪细胞分泌组对B-ALL细胞的代谢、氧化应激保护、生存和化疗耐药性的调控作用,并发现肥胖相关的B细胞特异性转录特征与患者生存结局相关 研究主要基于体外和动物模型,人类样本分析可能受限于样本数量和异质性,且未详细探讨肥胖与B-ALL之间的因果关系机制 探究肥胖如何通过脂肪细胞影响B-ALL细胞的生物学功能及化疗耐药性,以识别潜在的治疗靶点 正常和恶性B细胞、小鼠模型、健康捐赠者和B-ALL患者的血清和血浆样本 数字病理学 B细胞急性淋巴细胞白血病 RNA测序(单细胞和批量转录组学)、质谱分析(代谢组学和蛋白质组学) NA 转录组数据、代谢组数据、蛋白质组数据 涉及小鼠模型、健康捐赠者和B-ALL患者的样本,具体数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 代谢组学, 蛋白质组学 NA NA
54 2026-04-08
Single-cell RNA-seq integrated with multi-omics reveals SERPINE2 as a target for metastasis in advanced renal cell carcinoma
2023-01-16, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序与多组学数据,揭示了SERPINE2作为晚期肾细胞癌转移的潜在治疗靶点 首次在晚期肾细胞癌中整合单细胞转录组、Hi-C、ATAC-seq和RNA-seq多组学数据,系统解析了恶性细胞与肿瘤微环境的相互作用,并鉴定出SERPINE2作为关键转移驱动因子 样本量相对有限(8例患者组织样本),主要基于细胞系验证,需要在更大规模临床队列中进一步验证 揭示晚期肾细胞癌进展中基因组、转录组和表观遗传改变的机制,并寻找转移治疗靶点 肾细胞癌患者组织样本、Caki-1肾癌细胞系、HK-2人肾小管上皮细胞系 数字病理学 肾细胞癌 单细胞RNA测序, Hi-C, ATAC-seq, RNA测序, 微阵列, 组织芯片 非负矩阵分解 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 三维基因组数据, 批量转录组数据 8例RCC患者组织样本(含2对原发-转移匹配样本), 407例RCC患者微阵列数据, 两个组织芯片队列(TMA-30和TMA-2020) NA 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, RNA-seq NA NA
55 2026-04-07
AML/T cell interactomics uncover correlates of patient outcomes and the key role of ICAM1 in T cell killing of AML
2023-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析急性髓系白血病(AML)与T细胞间的相互作用,揭示了ICAM1在T细胞杀伤AML中的关键作用及其与患者预后的关联 首次在单细胞水平上系统解析AML与T细胞相互作用的转录组特征,并发现ICAM1作为免疫突触关键成分在AML免疫杀伤中的决定性作用 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证;样本量相对有限;未涵盖所有AML亚型 探究AML对T细胞杀伤抵抗的机制,并寻找影响患者预后的关键分子 原发性AML患者样本和人类工程化CD4+ T细胞 单细胞组学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量,使用原发性AML患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
56 2026-04-07
Molecular and spatial profiling of the paraventricular nucleus of the thalamus
2023-03-03, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过单核RNA测序和多重荧光原位杂交技术,揭示了小鼠丘脑室旁核的分子多样性和空间组织特征 首次识别了五种分子上不同的PVT神经元亚型,并发现了以前未知的分子梯度组织模式,提供了对PVT与皮层连接的新见解 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类或其他物种;单核RNA测序可能无法完全捕获所有细胞类型的转录组信息 阐明丘脑室旁核的分子身份和空间分布,以理解其功能多样性 小鼠丘脑室旁核的神经元 神经科学 NA 单核RNA测序,多重荧光原位杂交 NA RNA序列数据,图像数据 未明确指定样本数量,但基于小鼠脑组织 NA 单核RNA测序 NA NA
57 2026-04-06
Canine peripheral blood TCRαβ T cell atlas: Identification of diverse subsets including CD8A+ MAIT-like cells by combined single-cell transcriptome and V(D)J repertoire analysis
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组库测序技术,首次构建了健康犬外周血TCRαβ T细胞的详细图谱,并鉴定了包括CD8A+ MAIT样细胞在内的多种新亚群 首次在犬中结合单细胞转录组和V(D)J组库分析,揭示了犬T细胞多样性,特别是发现了犬黏膜相关恒定T细胞(MAIT)样细胞等先前未描述的亚群 研究仅基于健康犬外周血样本,未涉及疾病状态或其他组织,且犬特异性抗体的缺乏限制了传统流式细胞术验证 生成健康犬外周血TCRαβ T细胞的详细图谱,以增进对犬T细胞多样性的理解,并为人类疾病模型研究提供参考 健康犬的外周血TCRαβ T细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序(scRNAseq),免疫组库测序 NA 单细胞转录组数据,V(D)J序列数据 未明确指定样本数量,但基于健康犬外周血 NA 单细胞RNA-seq NA NA
58 2026-04-05
Single-cell transcriptomic profiling of microvascular endothelial cell heterogeneity in congenital diaphragmatic hernia
2023-06-17, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了先天性膈疝(CDH)肺中微血管内皮细胞的异质性,特别是炎症性mvEC簇和mvCa4+ ECs的减少,可能参与疾病发病机制 首次在CDH模型中利用单细胞RNA测序识别出转录组学上不同的微血管内皮细胞簇,包括独特的炎症性mvEC簇和与肺发育相关的mvCa4+ ECs减少 研究基于大鼠硝苯酮模型,可能无法完全模拟人类CDH的复杂性;样本量相对较小;未进行功能验证实验 探究先天性膈疝肺中微血管内皮细胞异质性及其与肺发育不良和重塑的关系 大鼠胎儿肺组织(E21.5),包括健康对照组、硝苯酮暴露对照组和硝苯酮诱导的CDH组 数字病理学 先天性膈疝 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 三组大鼠胎儿肺组织(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
59 2026-04-03
Combined near infrared photoacoustic imaging and ultrasound detects vulnerable atherosclerotic plaque
2023-11, Biomaterials IF:12.8Q1
研究论文 本研究结合近红外自发光声成像与超声成像,用于检测动脉粥样硬化斑块的脆弱性 首次将NIRAPA成像与超声结合,以区分稳定与脆弱斑块,并通过空间转录组学和蛋白质组学验证信号来源 研究为离体实验,样本量较小(25例患者),临床适用性需进一步验证 开发一种成像方法以检测动脉粥样硬化斑块的脆弱性 动脉粥样硬化斑块,特别是脆弱斑块 数字病理学 心血管疾病 近红外自发光声成像,超声成像,免疫组化,空间转录组学,空间蛋白质组学 NA 图像,分子数据 25例患者的切除斑块样本 NA 空间转录组学,空间蛋白质组学 NA NA
60 2026-04-03
JAK-STAT activation contributes to cytotoxic T cell-mediated basal cell death in human chronic lung allograft dysfunction
2023-03-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了JAK-STAT信号通路在慢性肺同种异体移植物功能障碍(CLAD)中通过上调气道基底细胞MHC-I表达、介导细胞毒性T细胞杀伤的机制 首次在人类CLAD移植组织中结合单细胞RNA测序与空间转录组学分析,发现JAK-STAT信号通过上调气道基底细胞MHC-I表达介导T细胞杀伤的新机制 研究基于移植组织样本,样本来源有限;机制验证主要在观察层面,缺乏体内干预实验 探究慢性肺同种异体移植物功能障碍(CLAD)的发病机制 人类肺移植受者的移植组织(CLAD患者) 数字病理学 肺移植相关疾病 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA RNA测序数据,空间转录组数据 人类肺移植受者的移植组织样本(具体数量未说明) NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
回到顶部