单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5352 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-03-13 |
Single-cell analysis identifies Ifi27l2a as a novel gene regulator of microglial inflammation in the context of aging and stroke
2023-Feb-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2557290/v1
PMID:36824976
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，识别出Ifi27l2a作为调控老年和卒中背景下小胶质细胞炎症反应的新基因 | 首次发现Ifi27l2a基因在老年和卒中背景下对小胶质细胞功能和神经炎症的调控作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外培养的小胶质细胞，人类样本验证有限 | 探索调控小胶质细胞功能的基因，以发现新的治疗干预手段 | 老年小鼠脑组织、卒中模型、小胶质细胞培养物、人类尸检样本 | 生物医学 | 卒中 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 老年小鼠脑组织、卒中模型、小胶质细胞培养物、人类尸检样本 |
| 42 | 2025-03-12 |
CD8+ lymphocytes are critical for early control of tuberculosis in macaques
2023-12-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230707
PMID:37843832
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研究论文 | 本文研究了CD8+淋巴细胞在结核病早期控制中的功能作用，通过去除猕猴中的先天和/或适应性CD8+淋巴细胞，展示了CD8α+细胞的缺失如何显著影响结核分枝杆菌感染的早期控制 | 首次在猕猴模型中系统地展示了CD8+淋巴细胞在结核病早期控制中的关键作用，并揭示了CD8+淋巴细胞的多功能细胞毒性反应作为疫苗靶点的潜力 | 研究仅限于猕猴模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨CD8+淋巴细胞在结核病早期控制中的功能作用 | 猕猴 | 免疫学 | 结核病 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 生物样本数据 | 猕猴样本 |
| 43 | 2025-03-11 |
Early clinical outcomes and molecular smooth muscle cell phenotyping using a prophylactic aortic arch replacement strategy in Loeys-Dietz syndrome
2023-11, The Journal of thoracic and cardiovascular surgery
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.jtcvs.2023.07.023
PMID:37500053
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研究论文 | 本研究评估了在Loeys-Dietz综合征患者中预防性主动脉弓置换策略的临床风险和血流动力学后果，并表征了Loeys-Dietz综合征动脉瘤和正常大小下游主动脉的平滑肌细胞表型 | 首次在Loeys-Dietz综合征患者中结合预防性主动脉弓置换和保留瓣膜的主动脉根部置换手术，并通过单细胞RNA测序和四维磁共振成像技术详细分析了平滑肌细胞表型和血流动力学变化 | 样本量较小（Loeys-Dietz综合征患者n=8），且随访时间较短（中位随访时间为2年） | 评估预防性主动脉弓置换策略在Loeys-Dietz综合征中的临床效果和血流动力学影响，并研究平滑肌细胞表型的变化 | Loeys-Dietz综合征患者（n=8）、Marfan综合征患者（n=5）和无主动脉病变的对照组患者（n=5） | 心血管疾病 | Loeys-Dietz综合征 | 四维磁共振成像、单细胞RNA测序 | NA | 影像数据、RNA测序数据 | Loeys-Dietz综合征患者8人，Marfan综合征患者5人，无主动脉病变的对照组5人 |
| 44 | 2024-08-07 |
[Research progress of single-cell RNA sequencing in airway type 2 inflammatory diseases]
2023-12-07, Zhonghua er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Chinese journal of otorhinolaryngology head and neck surgery
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2025-03-06 |
Construction of a circRNA- lincRNA-lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA regulatory network identifies genes and pathways linked to goat fertility
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1195480
PMID:37547465
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，比较了高生育力和低生育力山羊的颗粒细胞转录组，构建了ceRNA调控网络，并鉴定了与山羊生育力相关的基因和通路 | 首次利用单细胞RNA测序技术比较了高生育力和低生育力山羊的颗粒细胞转录组，并构建了ceRNA调控网络，鉴定了与生育力相关的关键基因和通路 | 研究依赖于公开的单细胞RNA测序数据，样本量相对较小，且仅限于Ji'ning Gray山羊 | 研究山羊生育力的遗传基础，特别是通过转录组分析揭示与生育力相关的基因和通路 | 高生育力和低生育力的Ji'ning Gray山羊的颗粒细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 30个样本（15个高生育力山羊和15个低生育力山羊） |
| 46 | 2025-03-05 |
Brain-wide correspondence of neuronal epigenomics and distant projections
2023-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06823-w
PMID:38092919
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研究论文 | 本文通过单细胞分析技术，将小鼠大脑中的神经元与其远程投射联系起来，揭示了神经元表观基因组与细胞类型之间的关系 | 使用epi-retro-seq技术，首次将单细胞表观基因组与远程投射的细胞类型联系起来，提供了全面的神经元投射类型与转录组和表观基因组关系的分析 | 研究仅限于小鼠大脑，未涉及其他物种或人类大脑 | 研究神经元表观基因组与远程投射之间的关系，解析细胞类型及其功能 | 小鼠大脑中的33,034个神经元，来自32个不同区域，投射到24个不同目标 | 神经科学 | NA | epi-retro-seq, 空间转录组学 | NA | 表观基因组数据, 转录组数据 | 33,034个神经元，来自32个不同区域，投射到24个不同目标 |
| 47 | 2025-03-04 |
A framework for defining mesenchymal cell types associated with murine periosteal and endosteal bone
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.17.567528
PMID:38014179
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，定义了与小鼠骨膜和骨内膜相关的间充质细胞类型，并创建了一个小鼠骨相关细胞的图谱 | 首次比较了骨膜细胞与骨内膜和骨小梁细胞的差异，并揭示了11个主要的细胞簇，包括新定义的Osteo-X细胞类型 | 现有数据集包含的成熟成骨细胞和骨细胞数量相对较少，且研究仅限于小鼠模型 | 增加成骨细胞和骨细胞的单细胞RNA测序数据量，比较骨膜细胞与骨内细胞的差异，明确与小鼠骨相关的主要细胞类型 | 小鼠骨膜和骨内膜的间充质细胞 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过100,000个间充质细胞 |
| 48 | 2025-03-02 |
Single-cell analysis of lizard blastema fibroblasts reveals phagocyte-dependent activation of Hedgehog-responsive chondrogenesis
2023-08-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40206-z
PMID:37563130
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析蜥蜴尾巴再生过程中的成纤维细胞和吞噬细胞群体，揭示了吞噬细胞依赖的Hedgehog信号通路调控的软骨形成机制 | 首次在蜥蜴尾巴再生过程中识别出与软骨形成相关的成纤维细胞和吞噬细胞群体，并揭示了吞噬细胞诱导的成纤维细胞基因激活层级 | 研究仅限于蜥蜴尾巴再生模型，未涉及其他物种或组织类型的再生机制 | 探索蜥蜴尾巴再生过程中成纤维细胞和吞噬细胞在软骨形成中的作用机制 | 蜥蜴尾巴再生过程中的成纤维细胞和吞噬细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 蜥蜴尾巴再生过程中的细胞群体 |
| 49 | 2025-03-01 |
Immunophenotypic correlates of sustained MRD negativity in patients with multiple myeloma
2023-09-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40966-8
PMID:37660077
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体β测序以及CyTOF质谱流式细胞术，全面分析了多发性骨髓瘤患者的免疫系统，旨在发现长期治疗反应的关联因素 | 首次在多发性骨髓瘤患者中，通过单细胞RNA测序和CyTOF质谱流式细胞术，纵向分析了免疫微环境的变化，并发现了与持续微小残留病（MRD）阴性状态相关的免疫表型特征 | 样本量较小（23名患者），且仅观察了一年的治疗反应，长期效果尚不明确 | 探讨多发性骨髓瘤患者在接受持续来那度胺维持治疗期间，免疫微环境对长期治疗反应的影响 | 新诊断的多发性骨髓瘤患者 | 免疫学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, T细胞受体β测序, CyTOF质谱流式细胞术 | NA | RNA测序数据, 质谱流式细胞数据 | 23名患者 |
| 50 | 2025-03-01 |
Network analysis of large-scale ImmGen and Tabula Muris datasets highlights metabolic diversity of tissue mononuclear phagocytes
2023-02-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112046
PMID:36708514
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研究论文 | 本文通过代谢网络分析，研究了单核吞噬细胞（MNP）在不同组织中的代谢多样性，并开发了一种基于网络的基因和代谢物（GAM）聚类方法 | 引入了三个大规模转录数据集，并开发了一种新的网络计算方法GAM聚类，用于无偏识别关键代谢子网络 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类MNP的代谢多样性 | 理解单核吞噬细胞在不同组织中的代谢多样性 | 单核吞噬细胞（MNP） | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | GAM聚类 | 转录数据 | 337个样本（ImmGen MNP数据集），202个样本（ImmGen Phase I数据集），51,364个细胞（Tabula Muris Senis数据集） |
| 51 | 2025-03-01 |
Cross center single-cell RNA sequencing study of the immune microenvironment in rapid progressing multiple myeloma
2023-Jan-26, NPJ genomic medicine
IF:4.7Q1
DOI:10.1038/s41525-022-00340-x
PMID:36702834
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研究论文 | 本研究通过多中心单细胞RNA测序技术，探讨了快速进展型多发性骨髓瘤（MM）患者免疫微环境的特征 | 首次在多中心背景下使用单细胞RNA测序技术分析快速进展型MM的免疫微环境，揭示了与疾病快速进展相关的细胞类型和信号通路 | 样本量相对较小（18名患者），且仅分析了诊断时的骨髓样本，未涵盖疾病进展过程中的动态变化 | 探讨快速进展型多发性骨髓瘤的免疫微环境特征，以识别促进疾病快速进展的因素 | 18名多发性骨髓瘤患者的48个CD138骨髓样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 102,207个细胞，来自18名患者的48个骨髓样本 |
| 52 | 2025-02-28 |
Transfer learning in a biomaterial fibrosis model identifies in vivo senescence heterogeneity and contributions to vascularization and matrix production across species and diverse pathologies
2023-08, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-00785-7
PMID:37079217
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研究论文 | 本文通过开发一种体内来源的衰老特征（SenSig），利用p16-CreER;Ai14报告小鼠的外来体反应驱动的纤维化模型，识别了周细胞和“软骨样”成纤维细胞为衰老细胞，并定义了细胞类型特异性的衰老相关分泌表型（SASPs） | 开发了一种新的体内衰老特征（SenSig），并应用转移学习和衰老评分技术，在不同病理的鼠类和人类单细胞RNA测序数据集中识别了衰老细胞群体 | 研究中使用的模型和数据集可能限制了结果的普遍适用性 | 研究细胞衰老在伤口愈合、组织纤维化和肿瘤抑制中的作用，并识别衰老细胞的表型 | p16-CreER;Ai14报告小鼠的周细胞和“软骨样”成纤维细胞 | 生物医学 | 纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 转移学习 | RNA测序数据 | NA |
| 53 | 2025-02-28 |
Spatial Transcriptomics Depict Ligand-Receptor Cross-talk Heterogeneity at the Tumor-Stroma Interface in Long-Term Ovarian Cancer Survivors
2023-05-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1821
PMID:36787106
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，探讨了高级别浆液性卵巢癌（HGSC）长期存活者肿瘤微环境中的基质异质性及其与患者生存的关系 | 首次通过空间转录组学揭示了HGSC长期存活者肿瘤微环境中特定CAF亚型与肿瘤细胞亚型之间的空间配体-受体相互作用，并发现其与患者长期生存相关 | 需要进一步研究确认这些相互作用是否在调节HGSC恶性表型中起作用，并验证其作为患者生存预测生物标志物的潜力 | 探讨HGSC长期存活者肿瘤微环境中的基质异质性及其与患者生存的关系，以识别潜在的治疗靶点 | 高级别浆液性卵巢癌（HGSC）患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序，多重免疫组化 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据，免疫组化数据 | 高级别浆液性卵巢癌长期存活者（LTS）和短期存活者（STS）的肿瘤组织样本 |
| 54 | 2025-02-27 |
Gene module reconstruction elucidates cellular differentiation processes and the regulatory logic of specialized secretion
2023-Dec-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.29.573643
PMID:38234833
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）发育轨迹重建分化过程，以斑马鱼脊索和孵化腺为模型系统，揭示基因模块识别方法及其在细胞分化过程中的应用 | 提出了一种整合表达和功能相似性的基因模块识别方法，揭示了已知和新关联的分化过程及其时间顺序 | 研究局限于斑马鱼脊索和孵化腺，未涉及其他生物或组织 | 研究细胞分化过程中的基因模块重建及其调控逻辑 | 斑马鱼脊索和孵化腺 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼胚胎 |
| 55 | 2025-02-27 |
Mitochondrial integrated stress response controls lung epithelial cell fate
2023-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06423-8
PMID:37558881
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研究论文 | 本文研究了线粒体复合物I在肺上皮细胞命运调控中的作用，特别是在出生后肺泡发育中的重要性 | 揭示了线粒体复合物I依赖的NAD再生在细胞命运决定中的新机制，通过防止病理性的综合应激反应（ISR）诱导 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨线粒体复合物I在肺上皮细胞命运调控中的作用 | 小鼠肺上皮细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 56 | 2025-02-26 |
Innate and adaptive AAV-mediated immune responses in a mouse model of Duchenne muscular dystrophy
2023-Sep-14, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2023.06.002
PMID:37746243
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研究论文 | 本文研究了在杜氏肌营养不良症小鼠模型中，腺相关病毒（AAV）介导的先天性和适应性免疫反应 | 通过双剂量AAV9给药的小鼠模型，更好地模拟了人类对AAV的免疫反应，揭示了抗AAV IgG和补体激活在免疫反应中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 理解AAV诱导的免疫反应机制，以改进临床前模型 | 杜氏肌营养不良症小鼠模型 | 免疫学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | RNA测序数据 | NA |
| 57 | 2025-02-26 |
Immune checkpoint blockade induces distinct alterations in the microenvironments of primary and metastatic brain tumors
2023-09-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI169314
PMID:37655659
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，比较了免疫检查点阻断（ICB）对原发性脑肿瘤和转移性脑肿瘤微环境的不同影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术系统地比较了ICB对原发性脑肿瘤和转移性脑肿瘤微环境的影响，并揭示了ICB对T细胞浸润和特定巨噬细胞群体的影响 | 样本量相对较小，且主要依赖于已发表的数据集，可能限制了结果的普遍性 | 探讨免疫检查点阻断（ICB）对转移性脑肿瘤微环境的影响，以寻找提高ICB疗效的潜在策略 | 19个ICB未治疗和9个ICB治疗的转移性脑肿瘤样本，以及已发表的复发性胶质母细胞瘤（rGBM）数据 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），多重免疫荧光，空间转录组学 | NA | RNA测序数据，图像数据 | 28个脑转移瘤样本（19个ICB未治疗，9个ICB治疗） |
| 58 | 2025-02-26 |
Matrix stiffness enhances cancer-macrophage interactions and M2-like macrophage accumulation in the breast tumor microenvironment
2023-06, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2022.04.031
PMID:35483629
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了基质硬度对乳腺癌肿瘤微环境中细胞间通讯和巨噬细胞表型的影响 | 首次系统地研究了基质硬度对肿瘤内异质性的影响，特别是对肿瘤促进型M2样巨噬细胞的影响 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类肿瘤中的适用性尚需进一步验证 | 探讨基质硬度对乳腺癌肿瘤微环境中细胞间通讯和巨噬细胞表型的影响 | MMTV-PyMT小鼠乳腺肿瘤 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | MMTV-PyMT小鼠乳腺肿瘤样本 |
| 59 | 2025-02-26 |
The pluripotency factor Tex10 finetunes Wnt signaling for PGC and male germline development
2023-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.23.529824
PMID:36865339
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研究论文 | 本文探讨了Tex10在原始生殖细胞（PGC）规范和精子发生中的晚期发育作用，发现Tex10通过调节Wnt信号在PGC样细胞阶段发挥关键作用 | 揭示了Tex10在PGC规范和男性生殖系发育中通过精细调节Wnt信号的新角色 | 研究主要依赖于细胞和动物模型，可能无法完全反映人类生理情况 | 研究Tex10在PGC规范和精子发生中的作用 | 原始生殖细胞（PGC）和精子发生过程 | 生物医学 | NA | 单细胞RNA测序 | 条件性敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 60 | 2025-02-25 |
Engrailed transcription factors direct excitatory cerebellar neuron diversity and survival
2023-Dec-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.30.569445
PMID:38077070
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间表达分析，定义了小脑核内侧兴奋性神经元的分子亚域，并揭示了EN1/2在小脑兴奋性神经元谱系中的保守作用 | 首次定义了胚胎期小脑核内侧兴奋性神经元的分子多样性，并揭示了EN1/2在小脑兴奋性神经元分化与存活中的保守功能 | 研究主要聚焦于胚胎期，未涉及成年期的分子机制 | 研究小脑核内侧兴奋性神经元的分子多样性及其发育机制 | 小脑核内侧兴奋性神经元 | 神经科学 | NA | scRNA-seq, 空间表达分析 | NA | 基因表达数据 | 胚胎期小脑核内侧兴奋性神经元 |