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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-11-27 |
Fasting-Mimicking Diet Drives Antitumor Immunity against Colorectal Cancer by Reducing IgA-Producing Cells
2023-11-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0323
PMID:37602826
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研究论文 | 本研究揭示模拟禁食饮食通过抑制IgA+B细胞激活抗肿瘤免疫从而抑制结直肠癌的机制 | 首次发现模拟禁食饮食通过促进脂肪酸氧化诱导RUNX3乙酰化,进而抑制IgA类型转换和CD8+T细胞抑制 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证有限 | 阐明模拟禁食饮食在结直肠癌中激活抗肿瘤免疫的具体分子机制 | 结直肠癌小鼠模型和患者样本 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2025-11-27 |
Radiotherapy-Induced Neurocognitive Impairment Is Driven by Heightened Apoptotic Priming in Early Life and Prevented by Blocking BAX
2023-10-13, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1337
PMID:37470810
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了放疗引起神经认知损伤的年龄依赖性机制,并发现阻断BAX可预防此类损伤 | 首次发现幼年神经细胞存在更高的凋亡启动状态,并阐明BAX介导的凋亡通路是放疗神经毒性的关键机制 | 研究基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究放疗引起年龄依赖性神经认知损伤的分子机制及防护策略 | 小鼠神经干细胞、祖细胞、神经元和星形胶质细胞 | 神经科学 | 中枢神经系统肿瘤 | 单细胞RNA测序,BH3分析,组织学分析 | 小鼠放疗模型 | 基因表达数据,组织学图像 | 不同年龄阶段的小鼠神经细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2025-11-27 |
Single-Cell Characterization of Pulmonary Nodules Implicates Suppression of Immunosurveillance across Early Stages of Lung Adenocarcinoma
2023-10-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0128
PMID:37477508
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析早期肺腺癌肺结节的免疫特征,发现免疫监视在早期阶段即受到抑制 | 首次在早期肺腺癌谱系中系统揭示自然杀伤细胞和自然杀伤T细胞细胞毒性活性下降及调节性T细胞早期增加 | 样本来源仅限于手术切除的肺结节,未涵盖更广泛的早期病变类型 | 阐明早期肺肿瘤发生的免疫发病机制 | 手术切除的肺结节及相关正常肺组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,免疫荧光图像 | 多个手术切除肺结节样本及相关正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2025-11-27 |
Elevated Mast Cell Abundance Is Associated with Enrichment of CCR2+ Cytotoxic T Cells and Favorable Prognosis in Lung Adenocarcinoma
2023-08-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-3140
PMID:37249584
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序分析肺腺癌患者样本,揭示肥大细胞在肿瘤微环境中的功能异质性及其与CCR2+细胞毒性T细胞的相互作用 | 首次发现肺腺癌中肥大细胞的功能异质性及其通过CCL2-CCR2轴招募细胞毒性T细胞的机制 | 肥大细胞浸润与化疗后生存改善无关联,且样本来源仅限于肺腺癌患者 | 探究肥大细胞在肺腺癌肿瘤微环境中的调控机制和功能作用 | 肺腺癌患者肿瘤组织样本 | 单细胞测序分析 | 肺腺癌 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 肺腺癌患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2025-11-27 |
Chi3l1 Is a Modulator of Glioma Stem Cell States and a Therapeutic Target in Glioblastoma
2023-06-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-3629
PMID:37101376
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研究论文 | 本研究揭示Chi3l1通过调控胶质瘤干细胞状态促进胶质母细胞瘤生长的分子机制 | 首次发现Chi3l1通过CD44受体诱导Akt/β-catenin信号通路和MAZ转录活性,形成促进间质表型的正向反馈环路 | NA | 探究Chi3l1在胶质母细胞瘤干细胞状态调控中的作用及其治疗潜力 | 患者来源的胶质瘤干细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,ATAC-seq,RNA velocity | NA | 基因表达数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,ATAC-seq | NA | NA |
| 46 | 2025-11-27 |
Spatially Resolved Transcriptomics Deconvolutes Prognostic Histological Subgroups in Patients with Colorectal Cancer and Synchronous Liver Metastases
2023-04-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-2794
PMID:37057593
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术解析结直肠癌肝转移患者预后相关的组织学亚群 | 首次将空间转录组学应用于同步切除的结直肠癌原发灶和肝转移灶,揭示了肿瘤内部和病灶间的异质性及驱动不同表型的转录组程序 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 确定组织学评估在预测结直肠癌肝转移同步切除术后预后的实际应用价值,并探究驱动疾病进展的功能生物学机制 | 接受同步切除的原发性结直肠癌和肝转移患者样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 组织学评估、基因组panel分析、bulk转录组、免疫组化、空间转录组学 | NA | 组织样本、转录组数据、空间转录组数据 | 接受同步切除的结直肠癌肝转移患者样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组分析 |
| 47 | 2025-11-27 |
Phagocytosis of Glioma Cells Enhances the Immunosuppressive Phenotype of Bone Marrow-Derived Macrophages
2023-03-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1570
PMID:36622331
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现胶质母细胞瘤中表达巨噬细胞和肿瘤特征的双阳性TAMs亚群,并证明其通过吞噬胶质瘤细胞获得免疫抑制表型 | 首次鉴定出胶质母细胞瘤中表达双标记的TAMs亚群,并证明BMDMs通过吞噬胶质瘤细胞转化为免疫抑制表型的机制 | 研究主要基于体外实验和测序数据分析,需要进一步体内验证 | 探究肿瘤相关巨噬细胞如何转化为免疫抑制表型及其在肿瘤微环境中的作用 | 胶质母细胞瘤组织、骨髓来源巨噬细胞、肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞测序分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 全外显子测序 | NA | 基因表达数据, 基因组数据 | 胶质母细胞瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子测序 | NA | NA |
| 48 | 2025-11-27 |
Meta-Analysis of Human Cancer Single-Cell RNA-Seq Datasets Using the IMMUcan Database
2023-02-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-0074
PMID:36459564
|
研究论文 | 本文介绍了IMMUcan scDB数据库的开发与应用,这是一个专门用于人类癌症单细胞RNA测序数据的集成数据库 | 开发了首个专门针对人类癌症的单细胞RNA测序数据库,包含144个数据集和56种癌症类型,提供详细的临床、技术和生物学注释 | 数据库主要基于已发表研究,可能受原始数据质量和研究异质性的限制 | 通过整合和分析多个人类癌症单细胞RNA测序数据集,促进肿瘤微环境的研究 | 人类癌症单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 细胞本体分类器 | 单细胞RNA测序数据 | 144个数据集,涵盖56种不同癌症类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2025-11-26 |
Systematic benchmarking of imaging spatial transcriptomics platforms in FFPE tissues
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.07.570603
PMID:38106230
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研究论文 | 对三种商业化成像空间转录组平台在FFPE组织中的性能进行系统性基准测试 | 首次在包含23种肿瘤和正常组织类型的组织芯片上对三种商业iST平台进行全面性能比较 | 研究基于组织芯片样本,可能无法完全代表完整组织切片的情况 | 评估成像空间转录组平台在FFPE组织中的技术和生物学性能 | 包含23种肿瘤和正常组织类型的组织芯片连续切片 | 空间转录组学 | 多种肿瘤类型 | 成像空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 包含23种组织类型的组织芯片 | 10x Genomics | 成像空间转录组学 | 10x Xenium | 三种商业化成像空间转录组平台(包括10x Xenium) |
| 50 | 2025-11-24 |
Potential to Enhance Large Scale Molecular Assessments of Skin Photoaging through Virtual Inference of Spatial Transcriptomics from Routine Staining
2023-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.30.551188
PMID:37577612
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研究论文 | 本研究开发了从常规H&E染色组织切片推断空间转录组信息的机器学习方法 | 首次探索从常规H&E染色切片虚拟推断空间转录组信息,以克服现有技术成本高和样本间变异大的限制 | 研究样本量相对较小(仅4名患者),可能限制结果的普适性 | 通过虚拟推断空间转录组信息来增强皮肤光老化的大规模分子评估能力 | 皮肤光老化组织,特别是基底细胞和鳞状细胞角质瘤手术切除部位邻近的皮肤标本 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 空间转录组学,全玻片成像,机器学习 | 机器学习模型 | 图像,转录组数据 | 来自261个皮肤标本队列中的4名患者样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium CytAssist | Visium CytAssist空间转录组分析,50微米分辨率,分析超过18,000个基因 |
| 51 | 2025-11-24 |
Spatial Omics Driven Crossmodal Pretraining Applied to Graph-based Deep Learning for Cancer Pathology Analysis
2023-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.30.551187
PMID:37577686
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研究论文 | 本研究探索利用空间转录组学数据通过对比跨模态预训练机制生成深度学习模型,以提取分子和组织学信息用于基于图的学习任务 | 首次将空间组学数据与组织学成像配对,通过对比跨模态预训练机制增强基于图的深度学习模型在癌症病理分析中的性能 | NA | 开发能够更好理解癌变形态学和分子基础的算法,提升基于图的深度学习在癌症病理分析中的性能 | 癌症组织病理学全切片图像和空间转录组学数据 | 数字病理学 | 癌症 | 对比跨模态预训练,基于图的深度学习 | 图神经网络 | 图像,空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 50微米分辨率定位的组织学成像 |
| 52 | 2025-11-22 |
Identification of tumor immunophenotypes associated with immunotherapy response in bladder cancer
2023-12, International journal of urology : official journal of the Japanese Urological Association
IF:1.8Q3
DOI:10.1111/iju.15276
PMID:37602677
|
研究论文 | 本研究通过分析膀胱癌免疫表型,开发了与免疫治疗反应相关的基因特征,并验证了SRRM4、NPHS1和TMEM72作为预测生物标志物的潜力 | 首次基于肿瘤免疫细胞评分系统性地定义了膀胱癌的炎症型和免疫排斥型免疫表型,并建立了可预测免疫检查点抑制剂治疗反应的基因特征模型 | 研究主要基于公共数据集进行回顾性分析,缺乏前瞻性临床验证 | 揭示与膀胱癌免疫治疗反应相关的免疫表型特征,为改善免疫治疗效果提供新的分子靶点 | 膀胱癌患者 | 生物信息学 | 膀胱癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据,蛋白质表达数据,临床预后数据 | 多个膀胱癌队列数据集(GSE32894、Imvigor210、GSE145140) | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2025-11-20 |
Revisiting the critical roles of reactive astrocytes in neurodegeneration
2023-07, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-023-02061-8
PMID:37037874
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综述 | 重新探讨反应性星形胶质细胞在神经退行性疾病中的多维作用 | 基于单细胞测序分析提出星形胶质细胞亚群与其功能的精确关联 | NA | 重新评估反应性星形胶质细胞在神经退行性疾病中的关键作用 | 反应性星形胶质细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2025-11-19 |
Single-cell RNA sequencing identifies eggplant as a regulator of germ cell development in Drosophila
2023-10-09, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256475
PMID:37603128
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术发现茄子基因(eggpl)在果蝇生殖细胞发育中起关键调控作用 | 首次发现茄子基因(eggpl)在连接营养状态与生殖细胞增殖分化中的调控作用 | 研究仅限于果蝇模型,未在其他生物中进行验证 | 探索果蝇生殖细胞发育的调控机制 | 果蝇卵巢生殖系干细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,RNAi筛选,生物信息学分析 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 55 | 2025-11-19 |
Defects in microvillus crosslinking sensitize to colitis and inflammatory bowel disease
2023-10-09, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202357084
PMID:37691494
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研究论文 | 本研究探讨微绒毛交联缺陷如何通过破坏肠道屏障功能增加结肠炎和炎症性肠病的易感性 | 首次揭示微绒毛交联在肠道屏障功能中的关键作用,并证明CDHR5缺陷与黏液层通透性增加共同导致炎症性肠病易感性 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅来自单细胞RNA测序分析,需要进一步验证 | 探究微绒毛交联在结肠炎和炎症性肠病发病机制中的作用 | CDHR5基因敲除小鼠和溃疡性结肠炎患者的肠道上皮细胞 | 细胞生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,电子显微镜 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,显微图像 | CDHR5缺陷小鼠和溃疡性结肠炎患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 56 | 2025-11-19 |
Deciphering pathogenic cellular module at single-cell resolution in checkpoint inhibitor-related pneumonitis
2023-10, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-023-02805-4
PMID:37653115
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示检查点抑制剂相关肺炎的关键致病细胞模块和分子通路 | 首次在单细胞分辨率下系统解析CIP的免疫微环境,发现CXCL13+ T细胞和CXCL9+单核细胞的关键作用,并提出具有高诊断能力的免疫特征 | 样本来源仅限于支气管肺泡灌洗液,未涉及其他组织部位;样本量相对有限 | 阐明检查点抑制剂相关肺炎的病理生理机制,为精准诊断和治疗提供新策略 | 支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 免疫相关肺炎 | 单细胞RNA测序,T细胞受体分析,拟时序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 57 | 2025-11-19 |
Old and newly synthesized histones are asymmetrically distributed in Drosophila intestinal stem cell divisions
2023-07-05, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256404
PMID:37255015
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研究论文 | 本研究报道了果蝇肠道干细胞分裂过程中新旧组蛋白H3和H4的不对称分配现象及其与细胞命运决定的关系 | 首次在体细胞干细胞谱系中发现组蛋白不对称继承现象,并证明其通过影响Delta基因表达参与细胞命运决定 | 研究仅针对果蝇肠道干细胞,在其他物种或组织中的普适性尚未验证 | 探究组蛋白继承模式在干细胞分裂和细胞命运决定中的作用机制 | 果蝇肠道干细胞及其分裂后的细胞对 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,突变体表达 | NA | 基因表达数据,蛋白质分布数据 | 果蝇肠道干细胞及其衍生细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2025-11-19 |
Monocytes differentiate along two alternative pathways during sterile inflammation
2023-07-05, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256308
PMID:37191947
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了单细胞在无菌炎症中沿两种不同途径分化为巨噬细胞或树突状细胞的命运决定机制 | 首次通过时间序列单细胞RNA测序在体外模型中同时追踪人类单细胞向巨噬细胞和树突状细胞的分化路径,并鉴定出关键的命运决定转录因子 | 研究主要基于体外模型和小鼠体内验证,人类体内直接证据有限 | 阐明单细胞在炎症过程中分化为巨噬细胞或树突状细胞的命运决定机制 | 人类单细胞和小鼠无菌性腹膜炎模型 | 单细胞生物学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序,计算生物学方法 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2025-11-18 |
Multiomic analysis of cervical squamous cell carcinoma identifies cellular ecosystems with biological and clinical relevance
2023-12, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-023-01570-0
PMID:37985817
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示宫颈鳞状细胞癌的肿瘤细胞状态多样性及其与免疫微环境的相互作用 | 首次在宫颈鳞癌中系统绘制高分辨率空间转录组图谱,发现三种肿瘤状态及其特异性免疫微环境,揭示FABP5介导的免疫排斥机制 | 临床样本分析尚属初步,需要更大规模验证 | 解析宫颈鳞癌肿瘤异质性及其对免疫治疗响应的机制 | 宫颈鳞状细胞癌组织样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,空间蛋白质组学,遗传扰动,药理学扰动 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 60 | 2025-11-18 |
East Asian-specific and cross-ancestry genome-wide meta-analyses provide mechanistic insights into peptic ulcer disease
2023-12, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-023-01569-7
PMID:38036781
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研究论文 | 通过跨祖先基因组荟萃分析揭示消化性溃疡疾病的遗传机制 | 首次进行大规模跨祖先(东亚和欧洲)消化性溃疡疾病基因组荟萃分析,发现25个新位点并揭示胃溃疡和十二指肠溃疡的遗传结构差异 | NA | 探索消化性溃疡疾病的遗传基础和发病机制 | 消化性溃疡疾病患者(52,032例)和对照人群(905,344例) | 基因组学 | 消化性溃疡 | 全基因组关联研究(GWAS)、转录组分析 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 52,032病例和905,344对照 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |