本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2025-10-06 |
A single-cell atlas of murine reproductive tissues during preterm labor
2023-01-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111846
PMID:36599348
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建感染诱导早产小鼠生殖组织的单细胞图谱 | 首次在感染诱导早产模型中系统描绘小鼠子宫、蜕膜和宫颈的单细胞转录组图谱,揭示早产相关的细胞间通讯信号通路 | 研究仅限于小鼠模型,需进一步验证人类组织的相关性 | 解析早产过程中生殖组织的细胞组成和分子机制 | 小鼠子宫、蜕膜和宫颈组织 | 单细胞组学 | 早产 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 562 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic characterization of COVID-19 pneumonitis identifies immune circuits related to tissue injury
2023-Jan-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.157837
PMID:36472908
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学方法揭示了COVID-19肺炎中免疫细胞与基质细胞相互作用的免疫回路 | 首次利用空间转录组学技术系统描绘COVID-19肺组织损伤区域的免疫细胞信号回路,发现细胞毒性淋巴细胞与促炎巨噬细胞之间的关键相互作用 | 样本量较小(仅3例患者),存在显著的个体间异质性 | 解析COVID-19肺炎中导致组织损伤的免疫机制 | COVID-19患者的肺组织样本 | 空间转录组学 | COVID-19肺炎 | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | 相关性网络分析 | 基因表达数据,空间转录组数据 | 3例患者的46个感兴趣区域,覆盖超过62,000个细胞 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 563 | 2025-10-06 |
Entropy sorting of single-cell RNA sequencing data reveals the inner cell mass in the human pre-implantation embryo
2023-01-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.09.007
PMID:36240776
|
研究论文 | 提出熵排序(ES)数学框架用于单细胞RNA测序数据分析,成功识别人类胚胎植入前内细胞团 | 开发无需用户定义显著性阈值的无监督特征选择方法,能够区分随机噪声与真实生物学信号 | 方法仅在合成数据和人类胚胎scRNA-seq数据上验证,需要更多应用场景测试 | 开发单细胞基因表达数据分析方法以更好识别细胞异质性 | 人类植入前胚胎单细胞RNA测序数据 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞RNA测序 | 熵排序(ES)数学框架 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 564 | 2025-10-06 |
Epsin Nanotherapy Regulates Cholesterol Transport to Fortify Atheroma Regression
2023-01-06, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.122.321723
PMID:36444722
|
研究论文 | 本研究开发了一种靶向巨噬细胞Epsins的纳米疗法,通过调节胆固醇运输促进动脉粥样硬化斑块消退 | 开发了S2P偶联脂质纳米颗粒靶向递送siRNA沉默Epsins的创新方法,并揭示了Epsins通过调控CD36和ABCG1影响胆固醇代谢的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证疗效和安全性 | 探究Epsins在巨噬细胞介导的代谢调控中的作用,并开发靶向Epsins的动脉粥样硬化治疗方法 | 髓系特异性Epsin双敲除小鼠和ABCG1基因减量小鼠模型,以及动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, MEBOCOST算法, 纳米颗粒递送系统, siRNA技术 | NA | 基因表达数据, 代谢物通讯数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 565 | 2025-10-06 |
Molecular and spatial signatures of mouse brain aging at single-cell resolution
2023-01-05, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.12.010
PMID:36580914
|
研究论文 | 通过空间分辨单细胞转录组学构建小鼠大脑衰老的高分辨率细胞图谱,揭示非神经元细胞在衰老过程中的显著变化 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘小鼠大脑衰老的分子和空间特征,特别关注非神经元细胞的空间组织变化 | 研究仅限于小鼠前额叶皮层和纹状体区域,未涵盖全脑所有区域 | 系统表征大脑衰老过程中的细胞和分子结构变化,理解大脑功能衰退的机制 | 小鼠大脑前额叶皮层和纹状体区域的主要细胞类型 | 空间转录组学 | 衰老相关脑功能衰退 | 空间分辨单细胞转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据和空间位置信息 | 覆盖小鼠整个寿命周期的多个时间点样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 566 | 2025-10-06 |
A New Understanding, Guided by Single-Cell Sequencing, of the Establishment and Maintenance of the Ovarian Reserve in Mammals
2023, Sexual development : genetics, molecular biology, evolution, endocrinology, embryology, and pathology of sex determination and differentiation
IF:2.4Q2
DOI:10.1159/000526426
PMID:36122567
|
综述 | 通过单细胞测序技术探讨哺乳动物卵巢储备建立与维持机制的研究综述 | 聚焦单细胞测序技术在卵巢发育研究中的应用,揭示卵巢储备的新型分子调控机制 | NA | 理解卵巢储备建立和维持的细胞与分子动力学,为调控生殖健康提供基础 | 哺乳动物卵巢发育过程,特别是生殖细胞巢形成、分解及原始卵泡形成与激活阶段 | 生殖生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 567 | 2025-10-06 |
Profiling Transcriptional Heterogeneity with Seq-Well S3: A Low-Cost, Portable, High-Fidelity Platform for Massively Parallel Single-Cell RNA-Seq
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2756-3_3
PMID:36495445
|
研究论文 | 介绍Seq-Well S3平台——一种低成本、便携式、高保真度的单细胞RNA测序技术 | 通过引入第二链合成步骤增强转录本检测能力,解决了传统单细胞RNA测序技术在成本、便携性和可扩展性方面的限制 | NA | 开发改进的单细胞RNA测序平台以更好地分析细胞转录异质性 | 单细胞转录组 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 数千个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | Seq-Well S3 | 基于皮升孔板的高通量单细胞RNA测序平台,具有第二链合成功能 |
| 568 | 2025-10-06 |
A comprehensive single cell data analysis of lymphoblastoid cells reveals the role of super-enhancers in maintaining EBV latency
2023-01, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28362
PMID:36453088
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析淋巴母细胞系,揭示超级增强子在维持EBV潜伏感染中的作用 | 首次在单细胞水平发现EBV感染细胞的异质性,并证明宿主超级增强子通过调控MYC和IRF4等基因维持EBV潜伏期 | 研究仅使用公开数据集,样本来源有限;未在原代细胞中验证发现 | 探究EBV病毒生命周期中宿主-病毒相互作用的分子机制 | 淋巴母细胞系(LCLs)和EBV病毒 | 单细胞生物学 | EB病毒感染相关疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR基因编辑 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 9个公开淋巴母细胞系 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 569 | 2025-10-06 |
Revelations in Thymic Epithelial Cell Biology and Heterogeneity from Single-Cell RNA Sequencing and Lineage Tracing Methodologies
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2740-2_2
PMID:36374449
|
综述 | 本文总结了单细胞RNA测序和谱系追踪方法在揭示胸腺上皮细胞生物学特性和异质性方面的新发现 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了传统群体水平RNA测序或表型研究无法发现的胸腺上皮细胞异质性,包括新型髓质TEC亚群的鉴定 | 单细胞RNA测序数据的拟时序分析仅能提示TEC亚群间的关系,需要实验方法进一步验证 | 研究胸腺上皮细胞的生物学特性和异质性 | 胸腺上皮细胞(TECs),包括皮质TECs和髓质TECs | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,谱系追踪, reaggregate thymic organ culture (RTOC) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 570 | 2025-10-06 |
Expression of Key Steroidogenic Enzymes in Human Placenta and Associated Adverse Pregnancy Outcomes
2023-Jul, Maternal-fetal medicine (Wolters Kluwer Health, Inc.)
DOI:10.1097/FM9.0000000000000167
PMID:40416852
|
综述 | 本文综述了人类胎盘中关键类固醇生成酶的表达及其与不良妊娠结局的关联 | 系统总结了胎盘类固醇生成酶的上游调控机制,并探讨了单细胞测序技术在评估其功能和细胞来源方面的潜力 | 胎盘类固醇生成酶表达与不良妊娠结局的关系仍存在争议 | 探讨胎盘类固醇生成酶在生理和病理状态下的调控机制及其与妊娠结局的关联 | 人类胎盘组织及类固醇生成酶 | 生殖医学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 571 | 2025-10-06 |
Cellular and Molecular Atlas of Peripheral Blood Mononuclear Cells from a Pregnant Woman After Recovery from COVID-19
2023-Apr, Maternal-fetal medicine (Wolters Kluwer Health, Inc.)
DOI:10.1097/FM9.0000000000000190
PMID:40406392
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究一名COVID-19康复孕妇外周血单个核细胞的免疫反应特征 | 首次在单细胞分辨率水平揭示COVID-19康复孕妇PBMCs中CD16单核细胞和MAIT细胞的免疫应答特征 | 仅研究单个病例样本,样本量有限 | 探究COVID-19康复孕妇的免疫反应机制 | 孕妇外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1名COVID-19康复孕妇,与已发表健康孕妇数据对比 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 572 | 2025-10-06 |
Targeting of epigenetic co-dependencies enhances anti-AML efficacy of Menin inhibitor in AML with MLL1-r or mutant NPM1
2023-04-13, Blood cancer journal
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41408-023-00826-6
PMID:37055414
|
研究论文 | 本研究通过表观遗传协同靶向策略增强Menin抑制剂对MLL1重排或NPM1突变AML的抗白血病疗效 | 发现Menin抑制剂与BET、MOZ、LSD1或CBP/p300抑制剂的联合使用可协同消除AML细胞,并首次在体内模型中验证其优越疗效 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探索增强Menin抑制剂在MLL1重排或NPM1突变急性髓系白血病中疗效的联合治疗策略 | 携带MLL1重排或NPM1突变的急性髓系白血病细胞 | 表观遗传学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, ChIP-Seq, ATAC-Seq, RNA-Seq, RPPA, 质谱流式细胞术, CRISPR-Cas9筛选 | 异种移植模型 | 基因组学数据, 蛋白质组学数据, 表观基因组学数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 573 | 2025-10-06 |
Integrated Analysis of Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Combined with Multiple Machine Learning Identified a Novel Immune Signature in Diabetic Nephropathy
2023, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S413569
PMID:37312900
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,结合多种机器学习方法识别糖尿病肾病的新型免疫特征 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据,利用多种机器学习算法识别糖尿病肾病的关键免疫相关基因和潜在药物靶点 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索糖尿病肾病中免疫调节的潜在治疗靶点和分子机制 | 糖尿病肾病患者的基因表达数据和大鼠模型 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习 | 随机森林(RF), 支持向量机(SVM), 自适应增强(AdaBoost), K近邻(KNN) | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个数据集,包括GSE142025 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 574 | 2025-10-06 |
YAP and TAZ couple osteoblast precursor mobilization to angiogenesis and mechanoregulated bone development
2023-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.20.524918
PMID:36711590
|
研究论文 | 本研究揭示了YAP和TAZ信号在胚胎骨骼发育中协调成骨前体细胞动员与血管生成的新机制 | 首次发现YAP/TAZ信号通过调控趋化因子Cxcl12,将成骨前体细胞与血管空间偶联,并调节血管形态发生和机械传导 | 研究主要聚焦于胚胎发育阶段,成年骨骼稳态中的机制仍需进一步探索 | 探究YAP和TAZ在胚胎骨骼发育过程中协调成骨前体细胞动员与血管生成的分子机制 | 小鼠胚胎长骨中的成骨前体细胞、血管系统及人间充质基质细胞 | 发育生物学 | 骨骼发育疾病 | 单细胞RNA测序, 条件性基因敲除, 3D血管网络培养 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞成像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 575 | 2025-10-06 |
Single cell RNA-sequencing profiling to improve the translation between human IBD and in vivo models
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1291990
PMID:38179052
|
综述 | 探讨单细胞RNA测序技术如何通过分析人类IBD与小鼠模型的异同来改善临床前研究的转化效果 | 首次系统总结单细胞转录组技术在IBD研究中的应用,强调通过比较人类与小鼠模型的细胞特征来提升临床转化效率 | 该技术尚未在IBD临床前模型中广泛应用,缺乏标准化比较框架 | 提高炎症性肠病临床前研究向临床治疗的转化成功率 | 人类IBD患者与实验小鼠模型的单细胞转录组数据 | 单细胞组学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 576 | 2025-10-06 |
Schlafen4+-MDSC in Helicobacter-induced gastric metaplasia reveals role for GTPases
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1139391
PMID:37334372
|
研究论文 | 本研究揭示了幽门螺杆菌感染胃部中SLFN4+髓源性抑制细胞通过GTPase通路调控免疫抑制功能的新机制 | 首次发现SLFN4在MDSC中调控GTPase通路活性,并阐明其通过抑制ROS产生维持MDSC功能的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明SLFN4+MDSC在幽门螺杆菌诱导的胃黏膜肠化生中的身份特征和功能作用 | 幽门螺杆菌感染小鼠的免疫细胞和胃组织 | 单细胞生物学 | 胃癌前病变 | 单细胞RNA测序, siRNA敲低, GTPase活性检测, ROS定量, 凋亡检测 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质活性数据, 细胞功能数据 | 未感染和6个月幽门螺杆菌感染小鼠的免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 577 | 2025-10-06 |
Single-cell profiling reveals a potent role of quercetin in promoting hair regeneration
2023-06-07, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwac062
PMID:37285263
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了槲皮素通过激活HIF-1α促进毛囊再生和血管新生的分子机制 | 首次构建毛发再生过程中的动态单细胞转录组图谱,发现槲皮素通过激活内皮细胞HIF-1α促进毛囊分化和血管新生 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验中验证 | 探究槲皮素促进毛发再生的分子机制和治疗潜力 | 小鼠毛囊、毛囊角质形成细胞、真皮内皮细胞 | 单细胞生物学 | 脱发症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 578 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-sequencing of stria vascularis cells in the adult Slc26a4-/- mouse
2023-06-15, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01549-0
PMID:37322474
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了成年Slc26a4-/-小鼠耳蜗血管纹细胞,揭示了pendrin表达细胞中pH调节因子的变化 | 首次在单细胞水平鉴定pendrin表达细胞和Kcnj10表达细胞,发现纺锤细胞中细胞外外泌体相关基因下调及膜联蛋白A1表达增加 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床应用需进一步验证 | 鉴定pendrin表达细胞中的pH调节因子,阐明耳蜗内淋巴pH失调的细胞致病机制 | 野生型和Slc26a4-/-小鼠的耳蜗血管纹细胞 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 野生型和Slc26a4-/-小鼠的血管纹细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 579 | 2025-10-06 |
Glioblastoma initiation, migration, and cell types are regulated by core bHLH transcription factors ASCL1 and OLIG2
2023-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.30.560206
PMID:37873200
|
研究论文 | 本研究揭示bHLH转录因子ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤起始、迁移和细胞类型调控中的核心作用 | 首次证明ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤中功能冗余地启动肿瘤形成,并通过动态水平和相互结合调控肿瘤细胞类型与迁移程度 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证有限 | 探究ASCL1和OLIG2转录因子在胶质母细胞瘤异质性和细胞层级调控中的作用机制 | 胶质母细胞瘤肿瘤细胞和胶质瘤干细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠胶质母细胞瘤模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 580 | 2025-10-06 |
Identifying Fibrogenic Cells Following Salivary Gland Obstructive Injury
2023-Mar-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.09.531751
PMID:36945483
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索唾液腺梗阻性损伤后参与纤维化反应的基质细胞类型及其信号通路 | 首次结合单细胞RNA测序和Gli1谱系追踪技术系统分析唾液腺纤维化过程中的细胞动态变化 | 研究仅使用小鼠模型,Gli1信号通路在纤维化中的作用相对有限 | 鉴定唾液腺梗阻性损伤后参与纤维化反应的基质细胞类型和信号通路 | 雌性小鼠颌下唾液腺 | 单细胞生物学 | 唾液腺纤维化 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 导管结扎手术 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 胚胎期16天和成年小鼠唾液腺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |