单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5355 篇文献，本页显示第 5301 - 5320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5301 | 2024-08-08 |
Single-cell landscape and clinical outcomes of infiltrating B cells in colorectal cancer
2023-01, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13568
PMID:36082430
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多色免疫荧光染色实验，揭示了结直肠癌中浸润B细胞的五种不同亚型及其在肿瘤微环境中的分布模式和功能特性 | 首次详细描述了结直肠癌中浸润B细胞的亚型及其在肿瘤微环境中的功能，并发现B细胞和三级淋巴结构在免疫治疗中的潜在临床意义 | NA | 探究结直肠癌中浸润B细胞的特征及其临床意义 | 结直肠癌中的浸润B细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 5302 | 2024-08-08 |
TIGER: A Web Portal of Tumor Immunotherapy Gene Expression Resource
2023-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2022.08.004
PMID:36049666
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研究论文 | 本文介绍了TIGER，一个肿瘤免疫治疗基因表达资源门户网站，包含大量转录组数据和单细胞转录组数据，用于分析肿瘤免疫治疗反应和抵抗的有效生物标志物 | TIGER整合了大量和单细胞基因表达数据，提供了多种分析模块，有助于理解抗肿瘤免疫机制和发现有效生物标志物 | NA | 开发新的免疫治疗策略和有效的反应及抵抗生物标志物 | 肿瘤免疫治疗中的基因表达数据 | 数字病理学 | NA | 基因表达谱技术 | NA | 基因表达数据 | 包含1508个肿瘤样本的转录组数据和2,116,945个免疫细胞的单细胞转录组数据 |
| 5303 | 2024-08-08 |
A Clustering Method Unifying Cell-Type Recognition and Subtype Identification for Tumor Heterogeneity Analysis
2023 Mar-Apr, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2022.3203185
PMID:36044493
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研究论文 | 本文提出了一种统一细胞类型识别和亚型鉴定的聚类方法（UCRSI），用于肿瘤异质性分析 | UCRSI方法通过分别计算选择性表达基因的差异和表达水平的差异，并使用共识邻接矩阵进行组合，从而更准确地进行细胞类型和亚型的识别 | NA | 旨在改进肿瘤异质性分析中的细胞类型和亚型识别 | 肿瘤微环境中的不同免疫细胞和肿瘤克隆 | 单细胞技术 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 谱聚类算法 | 基因表达数据 | NA |
| 5304 | 2024-08-08 |
Bioinformatics Analysis Identifies Key Genes in Recurrent Implantation Failure Based on Immune Infiltration
2023-03, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-022-01060-4
PMID:36045247
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研究论文 | 本研究通过数据挖掘探索了与反复植入失败（RIF）相关的免疫相关基因 | 本研究通过综合分析方法（WGCNA、随机森林和LASSO回归）识别了四个关键基因（GJA1、PRKAG2、CPT1A和ICA1），并构建了一个有效的RIF预测模型 | NA | 探索反复植入失败（RIF）中的免疫相关基因 | 反复植入失败（RIF）患者与对照组的内膜表达谱 | 生物信息学 | 生殖障碍 | 单样本基因集富集分析（ssGSEA） | NA | RNA测序数据 | 24例反复植入失败患者和24例对照组 |
| 5305 | 2024-08-08 |
Fc Fragment of IgE Receptor Ig (FCER1G) acts as a key gene involved in cancer immune infiltration and tumour microenvironment
2023-02, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13557
PMID:36054819
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研究论文 | 本研究基于多个数据库探讨了FcεRIγ在多种肿瘤中的表达模式、预后价值及其在肿瘤增殖、转移中的作用，并分析了其基因组改变和DNA甲基化水平，同时评估了FcεRIγ与肿瘤微环境中免疫浸润细胞的关联及其在免疫检查点阻断治疗中的预测作用。 | 首次进行了FcεRIγ作为免疫相关基因的泛癌分析，并验证了其在肿瘤免疫治疗中的潜在价值。 | NA | 探讨FcεRIγ在多种肿瘤中的作用及其在肿瘤免疫学中的潜在价值。 | FcεRIγ基因在肿瘤中的表达及其与肿瘤微环境和免疫治疗的关系。 | 数字病理学 | NA | 免疫组化染色、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种肿瘤类型的多个样本 |
| 5306 | 2024-08-08 |
Epithelial cell-expressed type II IL-4 receptor mediates eosinophilic esophagitis
2023-02, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.15510
PMID:36070083
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研究论文 | 本文研究了IL-4和IL-13在嗜酸性食管炎（EoE）中的作用，特别是通过IL-13Rα1介导的信号传导 | 首次明确IL-13通过IL-13Rα1在EoE中的作用，并提出II型IL-4R作为未来治疗目标 | NA | 探讨IL-4和IL-13在嗜酸性食管炎中的作用及IL-13Rα1的介导效应 | 嗜酸性食管炎（EoE）及其相关细胞和分子机制 | NA | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括WT、Il13ra1-/-和Krt14Cre/Il13ra1fl/fl小鼠以及人类EoE活检样本 |
| 5307 | 2024-08-08 |
The pleiotropic mode and molecular mechanism of macrophages in promoting tumor progression and metastasis
2023-Jan, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-022-02932-6
PMID:36071369
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综述 | 本文综述了巨噬细胞在促进肿瘤进展和转移中的多效性模式及分子机制 | 利用单细胞RNA测序技术，对肿瘤相关巨噬细胞的起源、分类及功能机制有了新的认识 | 目前对巨噬细胞的了解主要来自体外实验和动物模型，对人类复杂微环境中的巨噬细胞仍知之甚少 | 旨在为制定最佳的巨噬细胞靶向治疗策略提供帮助 | 巨噬细胞在肿瘤进展和转移中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 5308 | 2024-08-08 |
The aryl hydrocarbon receptor directs the differentiation of murine progenitor blastomeres
2023-08, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-022-09755-9
PMID:36029422
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序研究了早期胚胎发育阶段中芳香烃受体（AHR）对胚胎细胞分化的影响 | 首次揭示了AHR在胚胎发育早期作为分化调控因子的作用 | NA | 探讨AHR在哺乳动物胚胎发育中的调控作用及其对胚胎细胞分化的影响 | 早期胚胎发育阶段的2细胞、4细胞和8细胞胚胎 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 5309 | 2024-08-05 |
FOXP4 promotes proliferation of human spermatogonial stem cells
2023 May-Jun, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja202254
PMID:36018067
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研究论文 | 本文研究了FOXP4在促进人类生精干细胞增殖中的作用 | 揭示了FOXP4在调节人类生精干细胞自我更新和分化中的关键作用 | 该研究主要集中在单细胞测序数据分析，缺乏更多体内实验验证 | 探讨人类生精干细胞的调控机制 | 人类生精干细胞及其在生殖中的作用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 人类睾丸组织的单细胞测序数据 |
| 5310 | 2024-08-08 |
AIF1 + CSF1R + MSCs, induced by TNF-α, act to generate an inflammatory microenvironment and promote hepatocarcinogenesis
2023-08-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32738
PMID:35989499
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别了一种与炎症相关的特定MSC亚群，即AIF1+ CSF1R+ MSCs，并探讨了其在肝癌发生中的作用 | 首次揭示了AIF1+ CSF1R+ MSCs在肝癌发生前的微环境中存在，并通过TNF-α刺激通过TNFR1/SIRT1途径诱导 | 研究主要基于大鼠模型，未来需在人体中进一步验证 | 探讨炎症环境下内源性MSC的特性及其在肝癌发生中的作用 | AIF1+ CSF1R+ MSCs及其在肝癌发生中的作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠初级肝癌模型 |
| 5311 | 2024-08-08 |
Epithelial SOX9 drives progression and metastases of gastric adenocarcinoma by promoting immunosuppressive tumour microenvironment
2023-04, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-326581
PMID:36002248
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研究论文 | 研究SOX9在胃腺癌中的作用及其对肿瘤微环境免疫抑制的影响 | 首次揭示SOX9通过调控白血病抑制因子（LIF）影响胃腺癌的癌症干细胞特性和免疫抑制微环境 | NA | 探讨SOX9在胃腺癌进展和转移中的作用及其对免疫抑制肿瘤微环境的影响，以发现新的治疗策略 | 胃腺癌中的SOX9表达及其对肿瘤微环境和免疫反应的影响 | NA | 胃癌 | RNA测序 | NA | RNA | 使用患者来源的细胞和模型进行体外和体内研究 |
| 5312 | 2024-08-05 |
Single-cell profiles reveal distinctive immune response in atopic dermatitis in contrast to psoriasis
2023-02, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.15486
PMID:35986602
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研究论文 | 本研究探讨了特应性皮炎和银屑病患者的免疫反应差异 | 首次通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序揭示特应性皮炎与银屑病在疾病驱动细胞类型及亚型上的不同 | 缺乏对其他类型慢性炎症皮肤疾病的比较分析 | 探讨特应性皮炎与银屑病的炎症特征及其严重程度的关联 | 特应性皮炎和银屑病患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序和TCR测序 | NA | 细胞数据 | 来自特应性皮炎和银屑病患者的皮肤活检和血液样本 |
| 5313 | 2024-08-05 |
Comprehensive Analysis of Fibroblast Activation Protein Expression in Interstitial Lung Diseases
2023-01-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202110-2414OC
PMID:35984444
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研究论文 | 本文全面分析了纤维母细胞激活蛋白在间质性肺疾病中的表达。 | 首次揭示了FAP在低剂量促纤维化细胞因子作用下的早期激活阶段显著上调。 | 虽然应用了多种实验方法，但对于FAP在各种间质性肺疾病中表达模式的定义仍然不足。 | 研究FAP的表达强度能否作为间质性肺疾病中活化纤维母细胞的潜在评估指标。 | 人类原代肺纤维母细胞及临床肺标本。 | 数字病理学 | 间质性肺疾病 | 实时定量PCR（qPCR）、西方印迹、免疫荧光染色、深度学习测量全切片免疫组化、单细胞测序等。 | NA | 临床样本数据 | 多种类型的间质性肺疾病患者 |
| 5314 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics of immune cells in lymph nodes reveals their composition and alterations in functional dynamics during the early stages of bubonic plague
2023-01, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-021-2119-5
PMID:35943690
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研究论文 | 该文章系统地描绘了在鼠疫早期阶段淋巴结中免疫细胞的转录组特点及功能动态变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了鼠疫早期感染中淋巴结免疫细胞的组成和功能抑制 | 本研究仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类免疫反应的复杂性 | 研究在鼠疫早期阶段淋巴结内免疫细胞的动态变化及其功能抑制 | 小鼠淋巴结中的免疫细胞 | 数字病理学 | 鼠疫 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 5315 | 2024-08-08 |
Unique expression of the atypical mitochondrial subunit NDUFA4L2 in cerebral pericytes fine tunes HIF activity in response to hypoxia
2023-01, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X221118236
PMID:35929074
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研究论文 | 本文研究了非典型线粒体亚基NDUFA4L2在大脑周细胞中的独特表达，及其在低氧条件下对HIF活性的精细调控作用 | 发现NDUFA4L2在非低氧条件下在大脑中的持续表达，并揭示了其在周细胞中作为关键的低氧诱导代谢标志物的角色 | NA | 探讨NDUFA4L2在低氧条件下对大脑代谢的调控作用 | NDUFA4L2在大脑周细胞中的表达及其对HIF活性的影响 | 生物学 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq），高分辨率多重荧光RNA原位杂交（RNA F.I.S.H.） | NA | RNA | 小鼠和人类大脑样本，以及体外培养的人类大脑周细胞 |
| 5316 | 2024-08-05 |
A Bayesian multivariate mixture model for high throughput spatial transcriptomics
2023-09, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1111/biom.13727
PMID:35895854
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研究论文 | 本文开发了一种基于贝叶斯的多变量有限混合模型SPRUCE，以识别高通量空间转录组数据中的细胞亚群 | 提出了利用多变量偏态正态分布的贝叶斯空间多变量有限混合模型，并结合了Pólya-Gamma数据增强和空间随机效应 | 依赖于模拟研究来证明忽视偏斜性或空间相关性在HST数据中的推断效应 | 识别组织样本中细胞的亚群以支持生物研究 | 高通量空间转录组数据中的细胞亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 高通量空间转录组技术 | 多变量有限混合模型 | 基因表达数据 | 使用公开的人脑和乳腺癌HST数据集 |
| 5317 | 2024-08-08 |
Cross-platform analysis reveals cellular and molecular landscape of glioblastoma invasion
2023-03-14, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noac186
PMID:35901838
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研究论文 | 本研究通过综合分析组织学和单细胞RNA测序数据，揭示了胶质母细胞瘤侵袭的细胞和分子景观 | 发现了CRYAB和CD44在侵袭性胶质母细胞瘤中的高度共表达，并证实了它们对肿瘤侵袭性的贡献 | NA | 改善胶质母细胞瘤的治疗，特别是针对肿瘤侵袭性这一疾病特征 | 胶质母细胞瘤的侵袭性 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织学样本和RNA测序数据 | 10名胶质母细胞瘤患者 |
| 5318 | 2024-08-05 |
Integration of Computational Analysis and Spatial Transcriptomics in Single-cell Studies
2023-02, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2022.06.006
PMID:35901961
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review | 本文回顾了单细胞转录组学和空间转录组学的技术特点以及计算数据分析的核心概念 | 强调了数据整合方法的应用挑战和研究结果的生物学背景解读 | 缺乏针对具体细胞类型或疾病的详细实例分析 | 探讨单细胞转录组学和空间转录组学在健康和疾病中的基本生物学问题 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 5319 | 2024-08-08 |
A Fc-VEGF chimeric fusion enhances PD-L1 immunotherapy via inducing immune reprogramming and infiltration in the immunosuppressive tumor microenvironment
2023-Feb, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-022-03255-9
PMID:35895109
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研究论文 | 本文研究了Fc-VEGF嵌合抗体药物通过诱导免疫重编程和浸润来增强PD-L1免疫疗法在免疫抑制性肿瘤微环境中的效果 | Fc-VEGF嵌合抗体药物通过血管正常化和肿瘤微环境重编程，增强了免疫细胞的浸润，并抑制了M2巨噬细胞的分化和血管生成相关因子的分泌 | NA | 探索Fc-VEGF嵌合抗体药物如何通过血管正常化和肿瘤微环境重编程来增强免疫疗法的效果 | Fc-VEGF嵌合抗体药物在肿瘤微环境中的作用机制及其对免疫细胞浸润的影响 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 5320 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of peripheral CD8+ T cell responses in patients receiving checkpoint blockade immunotherapy for cancer
2023-Feb, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-022-03263-9
PMID:35907015
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序结合T细胞受体测序技术，分析了接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者外周血中CD8+ T细胞的反应 | 首次详细描述了免疫检查点抑制剂治疗前后，患者外周血中CD8+ T细胞的转录组变化，并发现这些变化与患者的生存期相关 | 研究样本量较小，且结果在更大规模患者群体中的预测能力有待验证 | 探讨免疫检查点抑制剂治疗对癌症患者外周血中CD8+ T细胞反应的影响及其与临床疗效的关系 | 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者外周血中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 53名癌症患者 |