单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5355 篇文献，本页显示第 5281 - 5300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5281 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Treg
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2647-4_17
PMID:36180638
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析技术研究了调节性T细胞（Treg）的异质性 | NA | NA | 探讨调节性T细胞的异质性及其来源 | 胸腺来源的Treg（tTreg）和外周来源的Treg（pTreg） | 免疫学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 5282 | 2024-08-08 |
High-Dimensional Single-Cell Profiling of Tumor-Infiltrating CD4+ Regulatory T Cells
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2647-4_16
PMID:36180637
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研究论文 | 本文通过高维单细胞技术分析肿瘤浸润性CD4+调节性T细胞的异质性 | 本文利用高维流式细胞术定义了一个与癌症进展正相关的效应Treg亚群，并提供了一个适用于任何白细胞亚群的高维单细胞分析工作流程模板 | NA | 研究肿瘤浸润性CD4+调节性T细胞的异质性及其在疾病中的潜在作用 | 肿瘤浸润性CD4+调节性T细胞 | 数字病理学 | NA | 高维单细胞技术，如单细胞RNA测序、质谱流式细胞术或多色流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 5283 | 2024-08-08 |
Development and validation of a gene model predicting lymph node metastasis and prognosis of oral squamous cell carcinoma based on single-cell and bulk RNA-seq analysis
2023-May, Journal of oral pathology & medicine : official publication of the International Association of Oral Pathologists and the American Academy of Oral Pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1111/jop.13360
PMID:36153671
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研究论文 | 本研究基于单细胞和批量RNA测序分析，开发并验证了一种预测口腔鳞状细胞癌淋巴结转移和预后的基因模型 | 本研究发现了60个与口腔鳞状细胞癌淋巴结转移相关的基因，并构建了一个五基因风险模型，以改善淋巴结转移的预测和临床结果 | NA | 研究口腔鳞状细胞癌中淋巴结转移的遗传和细胞差异，并开发预测模型 | 口腔鳞状细胞癌患者的淋巴结转移和预后 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 五基因风险模型 | RNA测序数据 | 来自癌症基因组图谱和基因表达综合数据库的单细胞RNA测序和批量基因表达数据 |
| 5284 | 2024-08-08 |
Early Wnt Signaling Activation Promotes Inner Ear Differentiation via Cell Caudalization in Mouse Stem Cell-Derived Organoids
2023-01-30, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxac071
PMID:36153788
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研究论文 | 本研究利用干细胞衍生的类器官探讨Wnt信号在早期前感觉外胚层（PPE）分化中的作用 | 发现调节Wnt信号显著提高了内耳类器官诱导的效率和可重复性，并揭示了Wnt信号通路在PPE区域化中的作用 | NA | 探究Wnt信号在内耳发育中的分子动态机制 | 小鼠干细胞衍生的类器官 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 5285 | 2024-08-08 |
Methods for Isolation of Tumor-Associated Endothelial Cells for Surface Protein Analysis and Sorting by Flowcytometry
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2703-7_3
PMID:36161406
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研究论文 | 本文介绍了一种基于流式细胞术的方法，用于分析肿瘤微环境中内皮细胞表面多种蛋白质并同时进行活细胞分选 | 本文提出了一种新的流式细胞术方法，能够同时分析和分选肿瘤微环境中占比小于0.5%的内皮细胞 | NA | 开发一种新的方法来分析和分选肿瘤微环境中的内皮细胞 | 肿瘤微环境中的内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 5286 | 2024-08-08 |
Influenza vaccination features revealed by a single-cell transcriptome atlas
2023-01, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28174
PMID:36163452
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研究论文 | 本文报道了接种灭活流感疫苗后个体外周血单个核细胞的单细胞转录组图谱 | 首次在单细胞分辨率下揭示了流感疫苗接种的免疫学特征 | 未观察到流感疫苗接种后个体中促炎反应基因和关键血栓相关基因的显著上调 | 研究流感疫苗接种后的免疫反应机制 | 接种灭活流感疫苗的个体及其外周血单个核细胞 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 多个接种流感疫苗的个体 |
| 5287 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the adverse effects of cadmium on the trajectory of neuronal maturation
2023-08, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-022-09775-5
PMID:36114956
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析镉对神经元成熟轨迹的不良影响 | 首次揭示了镉通过改变细胞阶段数量和阻碍细胞成熟来影响神经元成熟轨迹的分子机制 | NA | 探讨镉对神经元成熟的影响及其分子机制 | 新生小鼠侧脑室下区神经干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 神经干细胞在镉处理24小时后分化7天得到的神经元谱系细胞 |
| 5288 | 2024-08-08 |
The impact of antidepressants on human neurodevelopment: Brain organoids as experimental tools
2023-07-30, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2022.09.007
PMID:36115764
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研究论文 | 本文探讨了抗抑郁药对人类神经发育的影响，特别是使用脑类器官作为实验工具的研究 | 利用人诱导多能干细胞（hiPSC）生成脑类器官，克服了2D细胞培养和动物模型的局限性，通过单细胞RNA测序和电生理测量评估抗抑郁药对发育中神经元的影响 | 依赖于维度降低方法分析大规模转录组数据，电生理记录依赖于时间数据序列 | 研究抗抑郁药对人类神经发育的影响 | 抗抑郁药对神经发育的影响及脑类器官的应用 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、电生理测量 | 脑类器官 | 转录组数据、电生理数据 | 未具体说明 |
| 5289 | 2024-08-08 |
Thymosin β4 and prothymosin α promote cardiac regeneration post-ischaemic injury in mice
2023-05-02, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvac155
PMID:36125329
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研究论文 | 本研究探讨了成年哺乳动物心脏在心肌缺血后心肌细胞的基因表达模式，并发现胸腺素β4和前胸腺素α能促进心脏再生 | 首次揭示了心肌缺血后心肌细胞的转录组特征，并发现胸腺素β4和前胸腺素α的过表达能促进心肌细胞增殖和心脏功能恢复 | NA | 确定心肌缺血后成年心肌细胞的基因表达谱，并识别促进心脏再生的因子 | 成年哺乳动物心脏在心肌缺血后的心肌细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠和新生大鼠心肌细胞 |
| 5290 | 2024-08-08 |
Role of lymphoid lineage cells aberrantly expressing alarmins S100A8/A9 in determining the severity of COVID-19
2023-03, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-022-01285-2
PMID:36107397
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研究论文 | 本研究探讨了淋巴细胞异常表达S100A8/A9在COVID-19严重程度中的作用 | 发现淋巴细胞过度表达S100A8/A9与COVID-19患者早期感染阶段的先天免疫反应失调有关 | NA | 研究淋巴细胞表达S100A8/A9在COVID-19患者中的特征 | COVID-19患者的淋巴细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 轻度COVID-19患者12例，重度COVID-19患者7例 |
| 5291 | 2024-08-08 |
Transcriptomic Heterogeneity of Skin Across Different Anatomic Sites
2023-03, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.08.053
PMID:36122800
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研究论文 | 本研究通过RNA测序、单细胞RNA测序和表观基因组学等多组学方法，分析了来自不同解剖部位的159个皮肤样本的转录组异质性 | 首次详细描述了人体皮肤在不同解剖部位的转录组异质性，并揭示了这些异质性与生理和发育变异的关系 | 研究主要基于手术治疗中废弃的正常皮肤组织，可能存在样本选择偏倚 | 探究皮肤在不同解剖部位的基因表达差异及其与皮肤病易感部位的关联 | 来自不同解剖部位的皮肤样本 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 159个皮肤样本 |
| 5292 | 2024-08-08 |
Mostly natural sequencing-by-synthesis for scRNA-seq using Ultima sequencing
2023-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01452-6
PMID:36109685
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Ultima基因组平台的单细胞RNA测序（scRNA-seq）的mostly natural sequencing-by-synthesis（mnSBS）方法，并系统地将其与当前的scRNA-seq技术进行比较 | mnSBS方法使用大部分天然、未修饰的核苷酸和少量的荧光标记核苷酸，提高了聚合酶的进程性和降低了成本 | mnSBS方法在读取位置相对于注释基因边界的结果与Illumina测序存在细微差异，因为Ultima的单端读取更接近基因末端 | 开发一种成本效益高的单细胞RNA测序方法 | 单细胞RNA测序技术及其在不同生物和技术类型中的应用 | 基因组学 | NA | mostly natural sequencing-by-synthesis (mnSBS) | NA | RNA | 包括来自单个个体的5'和3' scRNA-seq、人外周血单个核细胞以及Perturb-Seq等多种类型的样本 |
| 5293 | 2024-08-05 |
HTCA: a database with an in-depth characterization of the single-cell human transcriptome
2023-01-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac791
PMID:36130266
|
研究论文 | HTCA是一个数据库，深入表征单细胞人类转录组 | HTCA提供了基于230万个高质量细胞的全面表型轮廓和多种在线分析工具 | 仍缺乏全面的特征化，主要侧重于原始数据和基因表达查询 | 整合和深入探索单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 | 约3000个scRNA-seq样本的2.3百万高质量细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq），空间转录组学 | NA | 多组学数据 | 约3000个scRNA-seq样本，230万高质量细胞 |
| 5294 | 2024-08-08 |
Hypertension Promotes the Proliferation and Migration of ccRCC Cells by Downregulation of TIMP3 in Tumor Endothelial Cells through the miR-21-5p/TGFBR2/P38/EGR1 Axis
2023-01-03, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-22-0089
PMID:36125433
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研究论文 | 本研究探讨了高血压通过下调肿瘤内皮细胞中的TIMP3促进ccRCC细胞增殖和迁移的分子机制 | 首次揭示了高血压通过miR-21-5p/TGFBR2/P38/EGR1轴下调TIMP3表达，进而促进ccRCC细胞增殖和迁移的机制 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型，需要进一步的人体临床试验验证 | 探究高血压与ccRCC肿瘤发生及预后的分子机制 | ccRCC细胞、肿瘤内皮细胞、高血压患者血浆 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA | 包括手术切除的ccRCC样本、NCG小鼠模型、人脐静脉内皮细胞 |
| 5295 | 2024-08-05 |
Single-cell profile of tumor and immune cells in primary breast cancer, sentinel lymph node, and metastatic lymph node
2023-Jan, Breast cancer (Tokyo, Japan)
DOI:10.1007/s12282-022-01400-x
PMID:36129636
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研究论文 | 本研究探讨了三阴性乳腺癌患者淋巴结转移的单细胞序列 | 研究揭示了肿瘤与免疫细胞在淋巴结中的相互作用，尤其是在单细胞水平上的新发现 | 研究仅基于一名患者的样本，可能限制了结果的广泛适用性 | 旨在理解淋巴结区域的肿瘤-宿主相互作用 | 研究对象为三阴性乳腺癌患者的原发肿瘤、哨 lymph 结和转移 lymph 结 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 4个样本 |
| 5296 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome atlas reveals protective characteristics of COVID-19 mRNA vaccine
2023-01, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28161
PMID:36124363
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研究论文 | 本研究通过高分辨率单细胞分析，揭示了基于脂多聚复合物（LPP）的mRNA疫苗SW0123在抑制SARS-CoV-2引起的炎症反应和肺损伤中的保护机制 | 首次详细描述了SW0123疫苗通过抑制促炎巨噬细胞的招募和增加多形核髓源抑制细胞的频率来有效抑制SARS-CoV-2诱导的炎症反应，并显著抑制肺上皮和内皮细胞的凋亡过程 | NA | 探究SW0123 mRNA疫苗在肺部保护中的免疫特征和机制 | SARS-CoV-2感染的小鼠和猕猴模型 | 数字病理学 | 冠状病毒病 | 单细胞分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠和猕猴模型 |
| 5297 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome landscape and antigen receptor dynamic during SARS-CoV-2 vaccination
2023-Jul, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2022.08.020
PMID:36097543
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研究论文 | 本研究系统地描绘了接种前后单细胞转录组、TCR和BCR表达谱，并分析了COVID-19患者的TCR序列 | 首次详细描述了接种SARS-CoV-2疫苗后的单细胞分子免疫反应，并发现了特定的克隆CD8 T细胞群 | NA | 揭示SARS-CoV-2疫苗接种和感染期间的详细免疫反应 | 接种疫苗的候选者的单细胞转录组、TCR和BCR表达谱，以及COVID-19患者的TCR序列 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 5298 | 2024-08-08 |
SLE stratification based on BAFF and IFN-I bioactivity for biologics and implications of BAFF produced by glomeruli in lupus nephritis
2023-05-02, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keac528
PMID:36094336
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研究论文 | 本研究通过分析系统性红斑狼疮（SLE）患者中B细胞激活因子（BAFF）和I型干扰素（IFN-I）的生物活性，探讨了BAFF信号阻断疗法的临床应用及其在狼疮性肾炎（LN）中的作用。 | 首次通过单细胞RNA测序和免疫组化分析，揭示了LN患者肾脏样本中BAFF的表达细胞类型，并提出了基于BAFF和IFN-I生物活性的SLE患者分层方法。 | 研究主要集中在BAFF和IFN-I的生物活性分析，未涉及其他可能影响SLE病程的因素。 | 旨在探索SLE患者中BAFF和IFN-I的生物活性，以及这些活性在临床治疗中的应用。 | SLE患者，特别是LN患者，以及健康对照组和非LN患者。 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 免疫组化分析 | NA | 生物样本 | 包括LN患者、非LN患者和健康对照组的肾脏样本 |
| 5299 | 2024-08-08 |
CD11b + CD43 hi Ly6C lo splenocyte-derived macrophages exacerbate liver fibrosis via spleen-liver axis
2023-05-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32782
PMID:36098707
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research paper | 本文研究了脾脏来源的CD11b+ CD43hi Ly6Clo脾细胞衍生的巨噬细胞通过脾-肝轴加剧肝纤维化的机制 | 首次揭示了脾脏中的CD11b+ CD43hi Ly6Clo脾细胞迁移至肝脏并转化为巨噬细胞，加剧肝纤维化的具体机制 | NA | 探讨脾脏在肝纤维化发病机制中的具体作用 | 脾脏来源的CD11b+ CD43hi Ly6Clo脾细胞及其在肝纤维化中的作用 | NA | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 5300 | 2024-08-08 |
Growth and differentiation of human induced pluripotent stem cell (hiPSC)-derived kidney organoids using fully synthetic peptide hydrogels
2023-Mar, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2022.08.003
PMID:36093324
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研究论文 | 研究使用全合成自组装肽水凝胶（SAPHs）调控人诱导多能干细胞（hiPSCs）衍生的肾脏类器官的生长和分化 | 首次使用具有可调节刚度的全合成自组装肽水凝胶作为微环境，促进肾脏类器官的分化和成熟，减少非目标细胞类型的产生 | 研究中未提及具体的局限性 | 改进肾脏类器官的形成参数，提高其可重复性和成熟度 | 人诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 共分析了13,179个细胞 |