单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5355 篇文献，本页显示第 5261 - 5280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5261 | 2024-08-08 |
Tetramer-aided sorting and single-cell RNA sequencing facilitate transcriptional profiling of antigen-specific CD8+ T cells
2023-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2022.101559
PMID:36279715
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研究论文 | 本研究探讨了使用四聚体辅助流式细胞术分选抗原特异性CD8+ T细胞进行单细胞分析的可行性，并识别出一个与癌症免疫治疗反应预测相关的抗原特异性反应（ASR）基因特征 | 本研究首次识别出一个具有预测价值的抗原特异性反应（ASR）基因特征，该特征与肺癌患者接受抗PD-L1、抗VEGF和化疗联合治疗的无进展生存期显著相关 | 研究仅使用了HLA-A*02:01限制性的人巨细胞病毒（CMV）pp65肽特异性CD8+ T细胞作为模型，可能限制了结果的普遍性 | 验证使用四聚体辅助流式细胞术分选抗原特异性CD8+ T细胞进行单细胞分析的方法，并识别与癌症免疫治疗反应相关的基因特征 | 抗原特异性CD8+ T细胞的频率和基因表达谱 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及肺癌患者接受抗PD-L1、抗VEGF和化疗联合治疗的样本 |
| 5262 | 2024-08-08 |
Tm4sf1-marked Endothelial Subpopulation Is Dysregulated in Pulmonary Arterial Hypertension
2023-04, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0020OC
PMID:36252184
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研究论文 | 本研究通过单细胞组学分析，探讨了标记为Tm4sf1的肺动脉高压（PAH）中内皮细胞亚群的失调情况 | 发现了一个新的标记为Tm4sf1的肺动脉内皮细胞亚群，该亚群可能具有干细胞/祖细胞潜能，并与PAH相关 | 需要进一步研究以阐明EA2和Tm4sf1在PAH中的具体作用 | 旨在识别可能具有干细胞/祖细胞潜能的肺动脉内皮细胞，并评估其与肺动脉高压的相关性 | 肺动脉内皮细胞及其在肺动脉高压中的作用 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了来自Sugen-低氧、野百合碱和对照大鼠的肺动脉内皮细胞样本，以及来自多个独立的人类PAH模型和患者的血液和肺部转录组数据集 |
| 5263 | 2024-08-05 |
Adenovirus-mediated Overexpression of FcγRIIB Attenuates Pulmonary Inflammation and Fibrosis
2023-02, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0056OC
PMID:36227848
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研究论文 | 该文章研究了FcγRIIB在促进肺炎和纤维化中的保护作用。 | 该研究首次揭示了FcγRIIB在PF-ILDs中的重要作用，并通过腺病毒过表达提供了潜在的治疗策略。 | 研究中未明确探讨FcγRIIB在其他类型肺病中的角色。 | 探讨FcγRIIB在进行性纤维间质肺病中的作用及其作为治疗靶点的潜力。 | 研究对象为人类和小鼠肺中的FcγRIIB的表达及其功能。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞转录组学、腺病毒介导的基因过表达 | 小鼠模型 | 生物样本（肺组织） | 包括三种遗传模型和一个治疗模型的小鼠 |
| 5264 | 2024-08-08 |
Immunomodulatory Biomaterials and Emerging Analytical Techniques for Probing the Immune Micro-Environment
2023-02, Tissue engineering and regenerative medicine
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s13770-022-00491-z
PMID:36241939
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综述 | 本文综述了生物材料植入后对局部免疫微环境的影响及其在组织修复或再生中的应用，特别讨论了单细胞RNA测序技术在软组织再生领域的应用潜力 | 本文首次全面讨论了单细胞RNA测序技术在生物材料诱导的免疫微环境中的应用，为设计免疫调节生物材料提供了参考 | 单细胞RNA测序技术在软组织再生领域的应用尚未得到充分开发 | 探讨生物材料对局部免疫微环境的影响及其在组织修复或再生中的应用 | 生物材料及其诱导的免疫微环境 | 生物材料 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 5265 | 2024-08-08 |
Cntnap2-dependent molecular networks in autism spectrum disorder revealed through an integrative multi-omics analysis
2023-02, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-022-01822-1
PMID:36253443
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研究论文 | 本研究通过综合多组学分析，揭示了自闭症谱系障碍中Cntnap2依赖的分子网络 | 首次通过结合Cntnap2敲除小鼠的定量蛋白质组代谢组数据与自闭症患者的多种组学数据，构建了Cntnap2相关的自闭症网络模型 | 研究主要集中在Cntnap2基因上，可能无法全面代表所有自闭症谱系障碍的分子机制 | 阐明自闭症谱系障碍中Cntnap2依赖的分子网络 | Cntnap2敲除小鼠、自闭症患者及前脑类器官 | 生物信息学 | 自闭症谱系障碍 | 质谱分析 | NA | 蛋白质组学、代谢组学、转录组学 | Cntnap2敲除小鼠、自闭症患者及前脑类器官样本 |
| 5266 | 2024-08-05 |
Microfluidic chip with reversible interface for noninvasive remission status monitoring and prognosis prediction of acute myeloid leukemia
2023-Jan-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2022.114803
PMID:36252315
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研究论文 | 本文设计了一种非侵入性的白血病干细胞特异性捕获芯片用于急性髓性白血病的缓解状态监测和预后预测 | 创新点在于设计了一种具有可逆识别界面的芯片，能够高效捕获和释放外周血中的白血病干细胞 | 本研究仅限于32名急性髓性白血病患者的样本，样本量相对较小 | 研究目的在于开发非侵入性的监测工具，以评估急性髓性白血病的缓解状态和预后 | 研究对象为急性髓性白血病患者及健康供体的外周血样本 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 液体活检 | NA | 外周血样本 | 32名急性髓性白血病患者和10名健康供体 |
| 5267 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomic analysis delineates epithelial and mesenchymal subpopulations and transition stages in childhood ependymoma
2023-04-06, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noac219
PMID:36215273
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研究论文 | 利用空间转录组学分析了儿童脑肿瘤神经上皮瘤的细胞亚群和转变阶段 | 揭示了儿童神经上皮瘤的细胞组成及其在肿瘤进展中的相互作用 | 研究未说明样本的具体数量和来源 | 加深对儿童神经上皮瘤微环境的理解 | 儿童神经上皮瘤后脑室亚组A（PFA） | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 5268 | 2024-08-05 |
The heterogeneity of cancer-associated fibroblast subpopulations: Their origins, biomarkers, and roles in the tumor microenvironment
2023-Jan, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15609
PMID:36197901
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研究论文 | 本文探讨了癌症相关成纤维细胞亚群体的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 | 本研究通过单细胞转录组学策略分析CAFs的不同亚群体及其来源和生物标志物 | 未提及具体的实验数据和样本规模，可能影响结论的普适性 | 旨在深入探讨癌症相关成纤维细胞在不同肿瘤中的角色 | 研究癌症相关成纤维细胞的不同亚群体及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 胃癌，结直肠癌，胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 5269 | 2024-08-05 |
Single-cell Transcriptomics Reveals Early Molecular and Immune Alterations Underlying the Serrated Neoplasia Pathway Toward Colorectal Cancer
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.10.001
PMID:36216310
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研究论文 | 本研究揭示了锯齿性肿瘤途径与结直肠癌相关的早期分子和免疫改变 | 首次通过单细胞转录组学描绘了锯齿性病变中的分子和免疫改变 | 研究样本数量有限，可能影响研究结果的广泛性 | 解析锯齿性病变中尚未明确的分子和免疫改变 | 16个锯齿性病变样本与3个正常结肠组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 19个样本（16个锯齿性病变，3个正常结肠组织） |
| 5270 | 2024-08-08 |
Implications of microglial heterogeneity in spinal cord injury progression and therapy
2023-01, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2022.114239
PMID:36216123
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综述 | 本文综述了微胶质细胞在脊髓损伤进展和治疗中的异质性及其作用 | 利用单细胞RNA测序(Sc-RNAseq)等技术，深入研究了微胶质细胞在整个生命周期中的异质性 | NA | 探讨微胶质细胞在脊髓损伤中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 微胶质细胞在脊髓损伤中的异质性及其功能 | NA | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序(Sc-RNAseq) | NA | NA | NA |
| 5271 | 2024-08-08 |
Integrative genomic and transcriptomic profiling reveals distinct molecular subsets in adult mixed phenotype acute leukemia
2023-01, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.26758
PMID:36219502
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研究论文 | 本研究通过综合基因组和转录组分析方法，探索了176名成人混合表型急性白血病患者的分子特征，并定义了八个具有独特突变和基因表达特征的分子亚群 | 首次通过综合基因组和转录组分析方法，定义了混合表型急性白血病的八个分子亚群，并分析了各亚群的基因突变和表达特征 | 研究样本主要集中在成人患者，且样本量相对有限，可能影响结果的普遍性 | 通过综合基因组和转录组分析，揭示混合表型急性白血病的分子特征，以促进更精确的诊断和治疗 | 176名成人混合表型急性白血病患者及其分子特征 | 数字病理学 | 白血病 | 下一代测序, RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 176名成人混合表型急性白血病患者，包括86名T-淋巴/髓系MPAL患者，42名Ph+ MPAL患者，36名B-淋巴/髓系MPAL患者，4名t(v;11q23)患者，8名MPAL, NOS, 罕见类型患者 |
| 5272 | 2024-08-08 |
H3K4me3 as a target of di(2-ethylhexyl) phthalate (DEHP) impairing primordial follicle assembly
2023-Jan, Chemosphere
IF:8.1Q1
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研究论文 | 本研究探讨了邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯(DEHP)对原始卵泡组装的影响及其分子机制，特别是H3K4me3的作用。 | 发现Smyd3-H3K4me3是DEHP对小鼠早期卵泡发生过程中原始卵泡形成的新的有害ER介导效应的目标，并强调表观遗传变化作为DEHP等内分泌干扰物的重要目标。 | NA | 研究DEHP对原始卵泡组装的影响及其分子机制。 | 小鼠卵巢中的原始卵泡和H3K4me3水平。 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 从DEHP暴露的母亲的后代卵巢中获取样本 |
| 5273 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell analysis-based classification of vascular mononuclear phagocytes in mouse and human atherosclerosis
2023-Jul-06, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvac161
PMID:36190844
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研究论文 | 本研究利用集成单细胞分析技术，对小鼠和人类动脉粥样硬化中的血管单核吞噬细胞进行分类，并比较其转录组特征 | 本研究通过集成单细胞RNA测序数据，细化了动脉粥样硬化血管中单核吞噬细胞的命名，并揭示了小鼠和人类中保守的转录组特征 | NA | 旨在细化动脉粥样硬化血管中单核吞噬细胞的命名，并比较小鼠和人类疾病中的转录组特征 | 小鼠和人类动脉粥样硬化中的血管单核吞噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 小鼠数据来自12个单细胞RNA测序数据集，人类数据来自11名患者的4个冠状动脉和7个颈动脉内膜切除术标本 |
| 5274 | 2024-08-08 |
TiO2 nanoparticles abrogate the protective effect of the Crohn's disease-associated variation within the PTPN22 gene locus
2023-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-325911
PMID:36191962
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研究论文 | 研究探讨了二氧化钛（TiO2）纳米颗粒与PTPN22基因变异在炎症性肠病发病机制中的相互作用 | 首次揭示了TiO2纳米颗粒能够消除PTPN22基因变异对克罗恩病的保护作用 | 研究仅在动物模型中进行，需要进一步的人体研究验证 | 探究环境因素与遗传风险变异在炎症性肠病发病机制中的相互作用 | PTPN22基因变异的小鼠模型及TiO2纳米颗粒的影响 | NA | 炎症性肠病 | bulk和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型和PTPN22变异小鼠 |
| 5275 | 2024-08-05 |
A Survey on Methods for Predicting Polyadenylation Sites from DNA Sequences, Bulk RNA-seq, and Single-cell RNA-seq
2023-02, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2022.09.005
PMID:36167284
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研究论文 | 本文全面概述了从DNA序列、整体RNA测序和单细胞RNA测序中预测聚腺苷酸化位点的方法 | 提出了评估不同工具预测的聚腺苷酸化位点可靠性的方法和选择适当方法的实用指南 | 研究中未提及对所讨论工具和方法的具体性能评估结果 | 探讨聚腺苷酸化在基因调控中的机制，及其相关的计算预测工具 | 主要研究对象为基因组数据中的聚腺苷酸化位点 | 计算生物学 | NA | RNA测序 | 机器学习 | 基因组数据 | 来自外周血单核细胞的整体RNA测序和单细胞RNA测序数据 |
| 5276 | 2024-08-08 |
A Novel MIP-1-Expressing Macrophage Subtype in BAL Fluid from Healthy Volunteers
2023-02, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2021-0123OC
PMID:36174229
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了来自健康志愿者的BAL液中的细胞异质性，特别是巨噬细胞的亚型。 | 首次在健康个体的BAL液中鉴定出表达MIP-1的巨噬细胞亚群，并通过RNA杂交和重新分析已发表的肺单细胞数据验证了这一亚群的存在。 | 组织可用性仍然是使用单细胞基因组技术研究人体健康和疾病中细胞异质性的重要限制因素。 | 研究健康个体肺部巨噬细胞的异质性，并为未来研究健康和疾病中的肺部环境提供资源。 | 来自健康志愿者的BAL液中的细胞，特别是巨噬细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从四名健康志愿者的BAL液中分离出超过40,000个细胞 |
| 5277 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals New Basic and Translational Insights in the Cystic Fibrosis Lung
2023-02, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0038TR
PMID:36194688
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在囊性纤维化（CF）肺研究中的应用，揭示了新的细胞和分子机制 | 利用scRNA-seq技术揭示了CF肺病的新细胞和分子叙述，并探讨了未来利用单细胞技术进行临床应用的机会 | NA | 探讨scRNA-seq在CF肺病研究中的应用及未来临床应用的可能性 | 囊性纤维化肺病 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 5278 | 2024-08-08 |
Regional epithelial cell diversity in the small intestine of pigs
2023-Jan-03, Journal of animal science
IF:2.7Q1
DOI:10.1093/jas/skac318
PMID:36183288
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了猪小肠不同区域的黏膜上皮细胞 | 发现了猪特有的EE细胞亚群，以及BEST4肠细胞在猪小肠中的分布与人类不同 | 某些区域特异性表达仅通过单细胞RNA测序检测到，可能存在其他未检测到的差异 | 深入了解猪小肠黏膜上皮细胞的区域分布和特化，以开发控制食欲、压力和营养吸收的方法 | 猪小肠的十二指肠、空肠和回肠的黏膜上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自十二指肠、空肠和回肠的黏膜上皮细胞 |
| 5279 | 2024-08-08 |
Histamine Signaling Is Essential for Tissue Macrophage Differentiation and Suppression of Bacterial Overgrowth in the Stomach
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.09.008
PMID:36167263
|
研究论文 | 本研究探讨了组胺信号在胃组织巨噬细胞分化和维持胃稳态中的重要作用 | 首次揭示了组胺信号在胃组织巨噬细胞分化中的精确作用，并通过抑制胃内细菌过度生长来维持胃稳态 | NA | 旨在揭示组胺在介导巨噬细胞分化和维持胃稳态中的精确作用 | 组胺信号在胃组织巨噬细胞分化中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序分析，流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞术数据 | 使用组氨酸脱羧酶敲除（Hdc-/-）小鼠，无菌Hdc-/-小鼠和骨髓移植的Hdc-/-小鼠进行深入的体内研究 |
| 5280 | 2024-08-08 |
Remodelling landscape of tissue-engineered bladder with porcine small intestine submucosa using single-cell RNA sequencing
2023-Jan, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13343
PMID:36177893
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了使用猪小肠黏膜下层（PSIS）构建的组织工程膀胱的细胞重塑景观 | 首次构建了组织工程膀胱的细胞重塑景观，并识别了驱动膀胱重塑的关键细胞亚群和重要基因 | 需要更多的体内和体外研究来进一步验证这些结果 | 构建细胞重塑景观并识别驱动膀胱重塑的关键细胞亚群和重要基因 | 使用猪小肠黏膜下层（PSIS）构建的组织工程膀胱 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 24个重建的小鼠膀胱 |