单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5355 篇文献，本页显示第 5241 - 5260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5241 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of peripheral blood reveals that monocytes with high cathepsin S expression aggravate cerebral ischemia-reperfusion injury
2023-01, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2022.11.001
PMID:36371010
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了外周血中单核细胞的cathepsin S表达在脑缺血-再灌注损伤中的作用 | 首次揭示了cathepsin S在单核细胞中的表达模式及其在脑缺血-再灌注损伤中的关键作用 | NA | 探讨外周免疫细胞如何影响中枢炎症反应及干预措施对缺血-再灌注损伤的影响 | 小鼠外周血中的单核细胞及其在脑缺血-再灌注损伤中的作用 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠外周血样本 |
| 5242 | 2024-08-05 |
Establishment and characterization of adult human gastric epithelial progenitor-like cell lines
2023-Jun, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13355
PMID:36331058
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研究论文 | 本研究建立和表征了成人人体胃上皮前体细胞系 | 提出了一种新型的单层细胞培养系统，以克服3D类器官培养的限制 | 目前未提及该培养系统在体内模型中的应用 | 研究成人人体胃上皮前体细胞系的自我更新与分化潜力 | 成人人体胃上皮前体细胞 | 数字病理学 | 胃相关疾病 | 单细胞转录组测序 | 单层细胞培养 | 转录组数据 | 成人人体胃上皮细胞系 |
| 5243 | 2024-08-08 |
Basal Cell-derived WNT7A Promotes Fibrogenesis at the Fibrotic Niche in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2023-03, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0074OC
PMID:36318668
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研究论文 | 本研究探讨了基底细胞衍生的WNT7A在特发性肺纤维化（IPF）中的促纤维化作用 | 发现基底细胞衍生的WNT7A在IPF进展中起关键作用，并提供了一种新的IPF治疗策略 | NA | 研究基底细胞在特发性肺纤维化中的作用及其机制 | 基底细胞、成纤维细胞和肺泡上皮细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、Luminex分析、三维器官培养 | NA | 基因表达数据、蛋白质分泌数据 | IPF移植组织和健康供体肺组织的基底细胞 |
| 5244 | 2024-08-08 |
C1Q labels a highly aggressive macrophage-like leukemia population indicating extramedullary infiltration and relapse
2023-02-16, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022017046
PMID:36322939
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别并验证了一种表达C1Q的巨噬细胞样白血病亚群，该亚群与急性髓系白血病（AML）的髓外浸润（EMI）和复发有关。 | 首次发现C1Q标记的巨噬细胞样白血病亚群与AML的髓外浸润和复发密切相关，并揭示了其分子机制和潜在的治疗靶点。 | 研究主要基于单个病例和少数患者的数据，需要进一步的大规模临床验证。 | 探讨AML中髓外浸润的分子机制及其与不良预后的关系。 | 急性髓系白血病患者及其骨髓和髓外浸润样本。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 多个AML患者样本 |
| 5245 | 2024-08-05 |
TISCH2: expanded datasets and new tools for single-cell transcriptome analyses of the tumor microenvironment
2023-01-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac959
PMID:36321662
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研究论文 | TISCH2是一个用于肿瘤微环境单细胞转录组分析的资源，包含来自人类和小鼠肿瘤的单细胞RNA测序数据 | 更新后的TISCH2包含190个肿瘤scRNA-seq数据集，涵盖600万个细胞，并增加了多个新功能以优化数据利用 | NA | 提供肿瘤微环境中基因表达的全面特征化 | 人类和小鼠肿瘤的单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | 癌症 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 190个数据集，覆盖600万个细胞 |
| 5246 | 2024-08-05 |
AE-TPGG: a novel autoencoder-based approach for single-cell RNA-seq data imputation and dimensionality reduction
2023, Frontiers of computer science
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s11704-022-2011-y
PMID:36320820
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研究论文 | 本文介绍了一种基于自编码器的新方法AE-TPGG，用于单细胞RNA测序数据的插补和降维 | 提出了一种基于两部分广义伽马分布的自定义自编码器，能够处理单细胞RNA测序数据中的混合离散-连续随机变量 | 未提及 | 旨在改善单细胞RNA测序数据的分析，特别是针对掉落事件的处理 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 自编码器 | 两部分广义伽马分布模型 | RNA测序数据 | 真实数据集 |
| 5247 | 2024-08-08 |
Pleural CD14+ monocytes/macrophages of healthy adolescents show a high expression of metallothionein family genes
2023-01, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202250019
PMID:36321537
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研究论文 | 本文通过腹腔镜技术从健康年轻成人中分离出胸膜单核细胞/巨噬细胞，并进行RNA测序分析，发现这些细胞中金属硫蛋白家族基因的高表达 | 首次在健康年轻成人的胸膜液中发现高表达金属硫蛋白的巨噬细胞亚群 | 需要进一步研究高表达金属硫蛋白的巨噬细胞亚群在肺防御、修复和稳态中的具体作用 | 研究健康年轻成人胸膜单核细胞/巨噬细胞中金属硫蛋白家族基因的表达 | 健康年轻成人的胸膜单核细胞/巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 健康年轻成人的胸膜单核细胞/巨噬细胞 |
| 5248 | 2024-08-08 |
Vaeda computationally annotates doublets in single-cell RNA sequencing data
2023-01-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac720
PMID:36342203
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Vaeda的新方法，用于计算注释单细胞RNA测序数据中的双细胞 | Vaeda结合了变分自编码器和正无标记学习，生成双细胞得分和二进制双细胞调用，表现优于其他基于Python的方法 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中双细胞/多细胞技术伪影的问题 | 单细胞RNA测序数据中的双细胞/多细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器 | RNA测序数据 | 16个基准数据集 |
| 5249 | 2024-08-05 |
Distinct Mechanisms of Mismatch-Repair Deficiency Delineate Two Modes of Response to Anti-PD-1 Immunotherapy in Endometrial Carcinoma
2023-02-06, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-22-0686
PMID:36301137
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研究论文 | 本研究探讨了错配修复缺陷（MMRd）子类型在对抗PD-1免疫治疗中的不同反应机制 | 揭示了突变型与表观遗传型MMRd肿瘤在抗肿瘤免疫方面的不同机制和细胞特征 | 样本量较小，且仅覆盖两种类型的MMRd肿瘤 | 研究MMRd子型在抗PD-1免疫治疗中的反应差异 | 24名MMRd子型的子宫内膜癌患者 | NA | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞、基因组数据 | 24名MMRd子宫内膜癌患者 |
| 5250 | 2024-08-08 |
CellMarker 2.0: an updated database of manually curated cell markers in human/mouse and web tools based on scRNA-seq data
2023-01-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac947
PMID:36300619
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research paper | CellMarker 2.0是一个更新的人类和小鼠不同组织中各种细胞类型的实验支持标记物的手动策划数据库，并提供了基于单细胞测序数据的网络工具 | CellMarker 2.0新增了36,300个组织-细胞类型-标记物条目，474个组织，1901种细胞类型和4566个标记物，并增加了29种类型的细胞标记物，包括蛋白质编码基因、lncRNA和处理过的假基因等 | NA | 更新和扩展CellMarker数据库，并开发用于分析单细胞测序数据的网络工具 | 人类和小鼠不同组织中的细胞类型及其标记物 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 数据库 | 83,361个组织-细胞类型-标记物条目 |
| 5251 | 2024-08-08 |
The regenerative response of cardiac interstitial cells
2023-03-29, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjac059
PMID:36271843
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研究论文 | 研究心脏间质细胞在心脏再生过程中的作用 | 采用单细胞RNA测序技术研究斑马鱼心脏再生过程中的间质细胞行为，并结合免疫组化、化学抑制和转基因动物等方法，揭示了间质细胞在心脏再生中的重要作用 | NA | 理解心脏再生过程，并探索如何在人类中诱导这一过程以逆转心肌梗塞造成的损伤 | 心脏间质细胞在心脏再生中的行为 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 斑马鱼心脏的间质细胞 |
| 5252 | 2024-08-08 |
Functional genomics analysis identifies loss of HNF1B function as a cause of Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser syndrome
2023-03-06, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddac262
PMID:36282544
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研究论文 | 本研究通过功能基因组学分析，确定了HNF1B功能的丧失是Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征的一个原因 | 首次建立了Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征II型的小鼠模型，并揭示了HNF1B功能丧失导致的分子机制 | NA | 探讨Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征的遗传基础及其分子机制 | Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征患者及小鼠模型 | 遗传学 | 生殖系统疾病 | 微阵列分析，单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因组数据，RNA序列数据 | 13名Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征患者及Hnf1b敲除小鼠胚胎的子宫组织 |
| 5253 | 2024-08-05 |
The transcription factor JUN is a major regulator of quiescent pancreatic stellate cell maintenance
2023-Jan-30, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2022.147000
PMID:36283605
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研究论文 | 该研究识别了转录因子JUN在维持胰腺星状细胞静止状态中的关键作用 | 通过整合单细胞测序数据并使用WGCNA和SCENIC算法，首次揭示了JUN作为主要转录因子的作用 | 本研究未详细探讨JUN的其他潜在调控机制 | 探讨胰腺星状细胞从静止状态转化为激活状态的主要机制 | 胰腺星状细胞及其在胰腺损伤相关疾病中的作用 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | RNA测序 | 多个胰腺组织的单细胞样本 |
| 5254 | 2024-08-08 |
OrganoidDB: a comprehensive organoid database for the multi-perspective exploration of bulk and single-cell transcriptomic profiles of organoids
2023-01-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac942
PMID:36271792
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research paper | 介绍了一个名为OrganoidDB的综合性数据库，用于多角度探索组织体的批量和单细胞转录组数据 | OrganoidDB整合了来自人和鼠的16,218个组织体样本的批量和单细胞转录组数据，并允许在不同模式下查询基因表达 | NA | 促进对组织体的更好理解，并帮助改进组织体培养协议 | 组织体的转录组数据 | NA | NA | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 16,218个组织体样本 |
| 5255 | 2024-08-08 |
VISTA Targeting of T-cell Quiescence and Myeloid Suppression Overcomes Adaptive Resistance
2023-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0116
PMID:36260656
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研究论文 | 本研究探讨了VISTA在肿瘤治疗中的作用，特别是在克服适应性免疫检查点抵抗中的应用 | 首次报道了检查点调节剂影响CD8+ T细胞静止状态，并首次表明静止状态可能是T细胞衰竭和癌症治疗中的一个目标 | NA | 研究VISTA在开发抗肿瘤免疫中的作用，并提供重要的机制见解 | VISTA在肿瘤治疗中的作用及其对T细胞和骨髓细胞的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重图像分析、流式细胞术 | NA | 图像、RNA | CT26结直肠癌细胞模型 |
| 5256 | 2024-08-05 |
Computational Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2815-7_12
PMID:36264495
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研究论文 | 文章概述了单细胞RNA测序数据的标准计算工作流程 | 提供了对单细胞RNA测序数据分析标准工作流程的全面理解 | 未具体提及数据集的规模和具体实例 | 探讨单细胞RNA测序数据的计算分析方法 | 单细胞RNA测序(SCNRA-seq)技术 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | NA |
| 5257 | 2024-08-05 |
Unravelling the landscape of skin cancer through single-cell transcriptomics
2023-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2022.101557
PMID:36257209
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综述 | 本论文综述了通过单细胞转录组学深入研究皮肤癌的最新进展 | 创新点在于强调了单细胞转录组学在皮肤癌研究中的应用，特别是在免疫细胞的贡献方面 | 该文献未提及具体的技术局限性或数据缺陷 | 研究旨在利用单细胞转录组学技术明确皮肤癌的细胞类型和状态 | 研究对象为皮肤癌相关的细胞类型及其在疾病演变中的角色 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞转录组学 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 5258 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis revealed cellular and molecular immune profiles in lung squamous cell carcinoma
2023-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2022.101568
PMID:36270103
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了肺鳞状细胞癌（LUSC）微环境的细胞和分子免疫特征 | 发现了高表达的免疫抑制受体TIGIT在调节性T细胞和耗竭的CD8T细胞中的作用，以及肿瘤相关中性粒细胞（TAN）通过表达IL1RN发挥免疫抑制作用，同时观察到SPP1+巨噬细胞在肿瘤微环境中的增加与患者不良生存相关 | NA | 深入了解肺鳞状细胞癌的免疫景观，并为未来的药物发现提供重要资源 | 肺鳞状细胞癌的免疫微环境 | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及7种主要细胞类型 |
| 5259 | 2024-08-08 |
Hepatitis B Virus Utilizes a Retrograde Trafficking Route via the Trans-Golgi Network to Avoid Lysosomal Degradation
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.10.008
PMID:36270602
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了DOCK11在HBV生命周期中的作用及其对cccDNA水平的影响，揭示了HBV通过逆向运输途径避免溶酶体降解的机制。 | 发现DOCK11与HBV衣壳及逆向运输蛋白相互作用，开辟了从早期内体到高尔基体再到内质网的替代逆向运输途径，帮助HBV避免溶酶体降解。 | NA | 探讨DOCK11在HBV生命周期中的作用及其对cccDNA水平的影响，揭示HBV感染的机制。 | DOCK11在HBV生命周期中的作用及HBV的逆向运输途径。 | NA | 肝炎B | 单细胞转录组分析、超分辨率显微镜、邻位连接分析、时间流逝分析、液相色谱-串联质谱、免疫印迹、酶联免疫吸附试验 | NA | 转录组数据 | HBV阳性和HBV阴性的肝细胞癌细胞系 |
| 5260 | 2024-08-08 |
Cell Dissociation Techniques in Salamanders
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2659-7_25
PMID:36272089
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研究论文 | 本文描述了在蝾螈中使用四种不同分离条件（酶解/非酶解）进行细胞解离的技术，并评估了这些方法对细胞表面表型和细胞多样性的影响 | 介绍了不同酶解方法对细胞解离效果的影响，并提供了优化协议的模板 | 文章中提到的酶解方法在某些情况下可能导致细胞表面标记物的丢失 | 研究细胞解离技术对细胞表型和细胞多样性的影响 | 蝾螈的脾脏和再生肢体 | NA | NA | 细胞解离技术 | NA | 细胞 | 使用蝾螈的脾脏和再生肢体进行实验 |