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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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5201 | 2024-08-08 |
B lymphocytes ameliorate Alzheimer's disease-like neuropathology via interleukin-35
2023-Feb, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2022.11.012
PMID:36427805
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研究论文 | 本研究探讨了B淋巴细胞通过产生白细胞介素-35(IL-35)减轻阿尔茨海默病(AD)样神经病理学的作用 | 首次揭示了B淋巴细胞衍生的IL-35通过抑制前额叶皮质中的Aβ产生,对AD具有潜在治疗作用 | NA | 研究B淋巴细胞在AD病理过程中的作用及其机制 | B淋巴细胞、IL-35、Aβ病理、记忆障碍 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 5×FAD小鼠模型及AD患者血液样本 |
5202 | 2024-08-08 |
Two-sample test with g-modeling and its applications
2023-01-15, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.9603
PMID:36412978
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研究论文 | 本文提出了一种结合g-modeling密度估计和两样本Kolmogorov-Smirnov检验的新型两样本检验方法,并应用于生物统计学中的两个案例 | 本文针对观察数据非同分布但与某些同分布的未观察参数相关的情况,提出了一种新的两样本检验程序 | NA | 解决在某些应用中观察数据非同分布但与某些同分布的未观察参数相关的问题 | 两样本比较问题 | 生物统计学 | NA | g-modeling密度估计,两样本Kolmogorov-Smirnov检验 | NA | 数据 | NA |
5203 | 2024-08-08 |
Human spermatogonial stem cells and their niche in male (in)fertility: novel concepts from single-cell RNA-sequencing
2023-01-05, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deac245
PMID:36409992
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在人类男性生殖领域中的应用,特别是关于睾丸细胞在不同发育阶段和男性不育情况下的转录变化 | 提出了关于精原细胞和体细胞亚型及其相互作用的新概念,并提供了相应的标记基因以促进其识别 | 强调了需要空间信息和其他调控层面的验证,如表观遗传或蛋白质水平 | 探讨单细胞RNA测序技术在男性不育研究中的临床应用潜力 | 人类精原干细胞及其在男性不育中的微环境 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数千个睾丸细胞覆盖人类新生儿、青春期前、青春期和成年期以及不同类型的男性不育 |
5204 | 2024-08-05 |
scRNA-seq for Microcephaly Research [II]: Preparation of Single-Cell cDNA Libraries
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2752-5_9
PMID:36418728
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研究论文 | 本文章介绍了生成带条形码的单细胞RNA测序文库的方法 | 提供了用于生成基于液滴的单细胞RNA测序文库的独特方法 | NA | 探讨微头畸形研究中的单细胞RNA测序技术 | 单细胞RNA-seq文库的制备 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列 | NA |
5205 | 2024-08-05 |
Immune landscape of viral cancers: Insights from single-cell sequencing
2023-01, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28348
PMID:36436921
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综述 | 本文总结了病毒相关癌症中单细胞测序的免疫浸润和抗肿瘤反应的关键发现 | 通过单细胞测序方法深入分析了病毒引起的肿瘤免疫微环境的变化 | 未提及具体的实验数据和样本分析 | 探索病毒性感染对肿瘤免疫微环境的影响及其为癌症治疗提供的新靶点 | 病毒相关癌症的免疫浸润和抗肿瘤反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
5206 | 2024-08-08 |
Molecular profiles of single circulating tumor cells from early breast cancer patients with different lymph node statuses
2023-01, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.14728
PMID:36408679
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研究论文 | 本研究利用免疫磁性纳米球捕获早期乳腺癌患者的循环肿瘤细胞(CTCs),并通过提出的bead-dd-seq方法进行单细胞RNA测序,分析CTCs的分子特征及其与淋巴结转移状态的关系 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了早期乳腺癌CTCs的分子特征,并发现了与淋巴结转移状态显著相关的两种CTCs亚型 | 研究样本量较小,仅涉及八名早期乳腺癌患者,可能影响结果的普遍性 | 解析早期乳腺癌患者循环肿瘤细胞的分子特征,以深入理解乳腺癌转移机制 | 早期乳腺癌患者的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 八名早期乳腺癌患者 |
5207 | 2024-08-08 |
Getting sweeter: new evidence for glucose transporters in specific cell types of the airway?
2023-01-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00140.2022
PMID:36409177
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在气道上皮细胞中葡萄糖转运体表达研究中的应用 | 强调了不同细胞类型中葡萄糖转运体表达的差异及其在细胞代谢和免疫功能中的作用 | 分析的研究数量有限,并非所有研究都报道了完整的葡萄糖转运体范围,且新鲜分离的细胞与体外培养的细胞之间存在差异 | 探讨气道上皮细胞中葡萄糖转运体的表达及其功能 | 气道上皮细胞中的葡萄糖转运体 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | RNA | 具体样本数量未提及 |
5208 | 2024-08-08 |
GeoWaVe: geometric median clustering with weighted voting for ensemble clustering of cytometry data
2023-01-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac751
PMID:36413065
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研究论文 | 本文介绍了一种基于几何中位数聚类和加权投票的集成聚类方法GeoWaVe,用于细胞学数据的聚类分析 | GeoWaVe方法在处理高维质谱和流式细胞学数据时表现优于图集成聚类方法,提供了一种更稳健和可重复的细胞学数据分析、可视化和解释方法 | 目前缺乏专门为细胞学数据分析设计的共识聚类算法 | 旨在克服聚类算法选择对结果的显著影响,通过共识方法直接解决不同算法之间的竞争效应 | 高维质谱和流式细胞学数据 | 生物信息学 | NA | 集成聚类 | 几何中位数聚类 | 细胞学数据 | 不同数据集 |
5209 | 2024-08-08 |
Dissociation of Cerebellar Granule Neuron Progenitors for Culture, FACS, Transcriptomics, and Molecular Biology
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2752-5_1
PMID:36418720
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研究论文 | 本文介绍了从小鼠和人类早期新生儿期分离小脑颗粒神经元前体细胞(CGNPs)的方法,并探讨了这些细胞在细胞培养、蛋白质提取、流式细胞术、代谢组分析和单细胞分辨率转录组分析中的应用。 | 本文提供了一种分离CGNPs的方法,这些细胞具有一致的、良好表征的增殖和分化时间模式,便于分析。 | NA | 研究大脑生长与神经前体细胞增殖动力学的关系,并探索这些特定细胞的分子、遗传和功能特性。 | 小脑颗粒神经元前体细胞(CGNPs) | 分子生物学 | NA | 流式细胞术(FACS)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 从小鼠和人类新生儿期大脑中采集的CGNPs |
5210 | 2024-08-08 |
scRNA-seq for Microcephaly Research [I]: Single-Cell Droplet Encapsulation, mRNA Capture, and cDNA Synthesis
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2752-5_8
PMID:36418727
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研究论文 | 本文描述了一种基于Drop-Seq方法的单细胞RNA测序技术,用于小头症研究 | 采用纳米级液滴物理分离细胞并同时引入细胞特异性DNA条形码,提高了样本处理的高通量 | NA | 探索单细胞RNA测序技术在小头症研究中的应用 | 小头症样本组织 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 文本 | 最少150,000个细胞,最多可捕获5000个单细胞转录本 |
5211 | 2024-08-08 |
scRNA-seq for Microcephaly Research [III]: Computational Analysis of scRNA-seq Data
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2752-5_10
PMID:36418729
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研究论文 | 本文专注于单细胞转录组分析(scRNA-seq)数据的计算分析,特别是从Drop-Seq平台生成的大规模scRNA-seq数据中解析生物信号 | 利用scRNA-seq技术同时探索数千个单细胞的基因表达模式 | NA | 解析从大规模scRNA-seq数据中提取的生物信号 | 单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 数千个单细胞 |
5212 | 2024-08-08 |
scRNA-seq for Microcephaly Research [IV]: Dirichlet Regression for Single-Cell Population Differences
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2752-5_11
PMID:36418730
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研究论文 | 本文介绍了使用Dirichlet回归分析单细胞RNA测序数据中细胞组成的差异 | 首次采用Dirichlet回归方法比较不同条件下细胞组成的差异 | 仅限于分析多个生物学重复样本的情况 | 研究微头症中单细胞RNA测序数据的细胞组成变化 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群差异 | 生物信息学 | 微头症 | scRNA-seq | Dirichlet回归 | 单细胞RNA测序数据 | 多个生物学重复样本(三个或更多) |
5213 | 2024-08-05 |
Comparative single-cell analysis of the adult heart and coronary vasculature
2023-Jun, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-022-09968-7
PMID:36401619
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研究论文 | 本文使用单细胞转录组学方法探讨了脊椎动物心脏和冠状血管的差异 | 整合不同物种的多种数据集,识别心脏的种特异性差异和相似性 | 数据整合可能受限于原始研究聚焦的组织类型 | 比较脊椎动物心脏的结构和功能差异 | 常见的几种脊椎动物心脏,包括猕猴、小鼠和斑马鱼 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个物种的心脏数据集,包括猕猴、小鼠和斑马鱼 |
5214 | 2024-08-08 |
The complement receptor C3AR constitutes a novel therapeutic target in NPM1-mutated AML
2023-04-11, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022007682
PMID:36383712
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研究论文 | 本文通过流式细胞术筛选和单细胞RNA测序,发现补体受体C3AR在NPM1突变的急性髓系白血病细胞中特异性表达,并探讨了其作为治疗靶点的潜力 | 首次发现补体受体C3AR在NPM1突变的急性髓系白血病细胞中特异性表达,并验证了其作为治疗靶点的有效性 | NA | 旨在识别NPM1突变急性髓系白血病细胞表面特异性表达的蛋白质,以开发基于抗体的治疗方法 | NPM1突变的急性髓系白血病细胞和正常骨髓细胞 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 细胞表面标记 | 涉及362个细胞表面标记的筛选,以及NPM1突变AML细胞和正常骨髓细胞的比较 |
5215 | 2024-08-05 |
Biomimetic nanoparticles drive the mechanism understanding of shear-wave elasticity stiffness in triple negative breast cancers to predict clinical treatment
2023-Apr, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2022.10.025
PMID:36382024
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研究论文 | 该研究探讨了生物仿生纳米颗粒如何驱动三阴性乳腺癌的剪切波弹性刚度机制理解,以预测临床治疗效果 | 研究首次展示了通过调节肿瘤微环境中的成纤维细胞(CAFs)功能来影响三阴性乳腺癌中的剪切波弹性刚度 | NA | 阐明三阴性乳腺癌中CAF功能与剪切波弹性刚度之间的关系 | 研究对象为三阴性乳腺癌细胞和相应的肿瘤模型 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | PLGA纳米颗粒 | 肿瘤模型(MDA-MB-231和E0771) | 单细胞测序 | NA |
5216 | 2024-08-05 |
Cancer-Associated Fibroblasts in Inflammation and Antitumor Immunity
2023-03-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-1031
PMID:36399325
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综述 | 本文探讨了肿瘤相关成纤维细胞在炎症和抗肿瘤免疫中的角色 | 揭示了不同类型的肿瘤相关成纤维细胞(CAF)在肿瘤微环境中的功能及其在肿瘤促进性炎症和抑制免疫反应中的双重作用 | 研究主要依赖于最近的单细胞测序分析,可能缺乏更广泛的临床验证 | 探索肿瘤相关成纤维细胞在肿瘤炎症和免疫反应中的作用 | 肿瘤相关成纤维细胞及其在不同人类癌症中的表型和功能 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 文献综述 | NA |
5217 | 2024-08-05 |
Dynamic cellular and molecular characteristics of spermatogenesis in the viviparous marine teleost Sebastes schlegelii†
2023-02-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioac203
PMID:36401879
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研究论文 | 本研究探讨了海洋活胎鱼Sebastes schlegelii的精子发生的动态细胞和分子特征 | 该研究结合了细胞组织学和单细胞RNA测序技术,填补了关于活胎鱼精子发生动态变化的研究空白 | 本研究未提及样本的具体数量或外部验证的结果 | 揭示活胎鱼的精子发生过程中的细胞和分子动态变化 | 重点研究海洋鱼类Sebastes schlegelii的精子发生过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq、转录组技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
5218 | 2024-08-08 |
Construction of a novel immune-related prognostic-predicting model of gastric cancer
2023-Feb-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2022.147032
PMID:36403868
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据识别出274个差异表达的免疫相关基因,并构建了一个用于预测胃癌预后的风险评分模型 | 首次通过单细胞RNA测序数据识别出胃癌中的差异表达免疫相关基因,并构建了一个新的免疫相关预后预测模型 | NA | 研究胃癌的预后预测模型 | 胃癌患者的预后 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归分析 | RNA测序数据 | 274个差异表达的免疫相关基因,TCGA-GC训练队列和GSE66229外部数据集 |
5219 | 2024-08-08 |
The heterogeneity of fibrosis and angiogenesis in endometriosis revealed by single-cell RNA-sequencing
2023-02, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2022.166602
PMID:36400338
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索了异位子宫内膜、同位子宫内膜和正常子宫内膜在分泌期的细胞异质性 | 首次在没有激素药物干扰的情况下,通过单细胞RNA测序技术研究了异位和非异位子宫内膜的细胞异质性 | NA | 探索子宫内膜异位症中纤维化、血管生成和慢性炎症的细胞异质性 | 异位子宫内膜、同位子宫内膜和正常子宫内膜的细胞特性 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
5220 | 2024-08-08 |
Combinatorial perturbation sequencing on single cells using microwell-based droplet random pairing
2023-Jan-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2022.114913
PMID:36395729
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研究论文 | 本文介绍了一种基于微孔滴随机配对技术的单细胞组合扰动测序方法(CP-seq),用于组合药物治疗的研究 | CP-seq技术利用寡核苷酸条码标记药物,通过微流控滴操作实现细胞与药物的随机配对,从而完成组合药物处理和细胞条码标记 | NA | 开发一种高通量且全面的组合扰动筛选技术,以减少药物抗性和疾病复发 | 单细胞的转录组和药物条码 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 微孔利用率达到83% |