单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5355 篇文献，本页显示第 5181 - 5200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5181 | 2024-08-05 |
Meta-Analysis of Human Cancer Single-Cell RNA-Seq Datasets Using the IMMUcan Database
2023-02-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-0074
PMID:36459564
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meta-analysis | 开发了一个专门用于人类癌症的单细胞RNA测序数据库IMMUcan scDB并进行了元分析 | 提供了一个集成化、可公开访问的数据库，涵盖56种不同癌症类型的144个数据集，并具有详细的临床和生物信息注释 | 数据异质性和研究之间的变异性可能对结果造成影响 | 探讨与肿瘤微环境相关的单细胞RNA测序数据并进行元分析 | 涉及56种不同癌症类型的单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 144个数据集 |
| 5182 | 2024-08-08 |
Development of a personalized dendritic cell vaccine and single-cell RNA sequencing-guided assessment of its cell type composition
2023-02, Cytotherapy
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.jcyt.2022.10.013
PMID:36443171
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研究论文 | 本文研究了一种个性化树突状细胞疫苗的细胞类型组成，并通过单细胞RNA测序技术进行评估 | 首次通过单细胞转录组分析方法，详细研究了DC疫苗CUD-002的细胞类型组成，并确认了其安全性 | NA | 旨在评估和解决基于树突状细胞的免疫治疗产品在制造过程中细胞类型异质性的监管考虑 | 个性化树突状细胞疫苗CUD-002的细胞类型组成及其安全性 | 免疫治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 5183 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of Circulating Epithelial Cells in Breast Cancer at Single-Cell Resolution: Identifying Tumor and Hybrid Cells
2023-02, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202200206
PMID:36449636
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析非转移性乳腺癌患者中CD45阴性和CD45阳性循环上皮细胞（CECs）的异质性 | 首次在单细胞分辨率下识别出乳腺癌中的肿瘤细胞和杂交细胞，并发现CD45 CECs中存在大量拷贝数异常，与肿瘤分级正相关 | 需要进一步研究以确定哪些循环肿瘤和杂交细胞亚群对乳腺癌转移有贡献 | 研究循环肿瘤细胞和杂交细胞在乳腺癌中的异质性及其在转移中的作用 | 非转移性乳腺癌患者的循环上皮细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 非转移性乳腺癌患者的循环上皮细胞 |
| 5184 | 2024-08-08 |
Single-cell genomics illustrates heterogeneous phenotypes of myocardial fibroblasts under ischemic insults
2023-02-01, Biochemistry and cell biology = Biochimie et biologie cellulaire
DOI:10.1139/bcb-2022-0229
PMID:36458696
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研究论文 | 本文通过单细胞基因组学研究，揭示了心肌纤维母细胞在缺血损伤下的表型异质性 | 首次在单细胞分辨率下揭示了心肌纤维母细胞在缺血和再灌注条件下的表型异质性 | NA | 探索心肌纤维母细胞在心肌梗死区域的再生/修复反应 | 心肌纤维母细胞的表型异质性 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从心肌梗死区域的Yucatan小型猪中分离的心肌纤维母细胞 |
| 5185 | 2024-08-08 |
Molecular Dissection of Somatic Skeletal Disease in Neurofibromatosis Type 1
2023-02, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1002/jbmr.4755
PMID:36459048
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研究论文 | 本研究通过时间序列单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了神经纤维瘤病1型（NF1）患者来源的假关节样本中的骨基质细胞（BSCs），揭示了NF1相关骨骼疾病的发病机制。 | 首次应用时间序列单细胞RNA测序技术研究NF1患者的骨基质细胞，揭示了Clec11a-Itga11-Wnt信号通路在NF1相关骨骼疾病中的作用。 | 研究主要集中在细胞和分子层面，缺乏对NF1患者骨骼疾病的临床治疗效果的直接评估。 | 探讨NF1患者骨骼疾病的发病机制。 | NF1患者的骨基质细胞和假关节样本。 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 患者匹配的控制组和假关节来源的初级骨基质细胞 |
| 5186 | 2024-08-05 |
Longitudinal single-cell analysis of SARS-CoV-2-reactive B cells uncovers persistence of early-formed, antigen-specific clones
2023-01-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.165299
PMID:36445762
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研究论文 | 研究了COVID-19感染和疫苗接种后B细胞克隆的持久性和演变 | 首次长期跟踪分析了特异性B细胞克隆在COVID-19患者中的持续存在与演变 | 仅针对重症COVID-19患者进行样本收集，样本代表性可能有限 | 预测新兴病毒变种的免疫反应并优化疫苗 | 重症COVID-19患者的抗原特异性B细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、CITE-Seq、B细胞受体测序（BCR-Seq） | NA | 基因组数据 | 重症COVID-19患者的纵向样本 |
| 5187 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals distinct functional heterogeneity of CD34+ cells in anagen wound and diabetic wound
2023-01-08, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.11.080
PMID:36463761
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了正常、生长期和糖尿病伤口中的CD34细胞的表型和功能异质性 | 首次揭示了CD34细胞在不同类型伤口中的功能异质性及其对伤口愈合的影响 | 研究仅限于小鼠模型，未来需在人类样本中验证结果 | 探究CD34细胞在不同类型伤口中的功能异质性及其对伤口愈合的影响 | CD34细胞在正常、生长期和糖尿病伤口中的表型和功能 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从小鼠伤口边缘收集的CD34细胞 |
| 5188 | 2024-08-05 |
SCExecute: custom cell barcode-stratified analyses of scRNA-seq data
2023-01-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac768
PMID:36448703
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研究论文 | 本文介绍了SCExecute工具，用于分析条形码分层的单细胞RNA测序数据 | SCExecute支持用户自定义命令在按条形码分层的单细胞对齐文件上执行，填补了现有工具在细胞特征分析中的不足 | 该工具的效用可能受限于用户对命令行的熟悉程度和可用计算资源 | 研究如何使用现有工具对条形码分层的scRNA-seq数据进行定制的细胞水平分析 | 条形码分层的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 序列数据 | 使用了10X Genomics Chromium系统的droplet scRNA-seq数据进行示例 |
| 5189 | 2024-08-05 |
Targeting CCL5 signaling attenuates neuroinflammation after seizure
2023-01, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14006
PMID:36440924
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研究论文 | 该研究旨在探讨CCL5信号通路在癫痫后神经炎症中的作用 | 本研究首次揭示了CCL5/CCR5信号通路在癫痫模型小鼠中的重要性，并展示了通过Maraviroc干预该信号通路的有效性 | 本研究使用的小鼠模型可能无法完全模拟人类癫痫的复杂性 | 研究CCL5/CCR5信号通路在癫痫后神经炎症中的潜在靶向作用 | 癫痫小鼠模型及其海马区域的转录组特征 | 数字病理学 | 癫痫 | 10× Genomics空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 癫痫小鼠数目不明 |
| 5190 | 2024-08-05 |
CD73-generated extracellular adenosine promotes resolution of neutrophil-mediated tissue injury and restrains metaplasia in pancreatitis
2023-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202201537R
PMID:36468677
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研究论文 | 本研究探讨了CD73生成的细胞外腺苷在胰腺炎中缓解中性粒细胞介导的组织损伤和抑制化生的作用 | 该研究首次揭示了CD73在胰腺炎中的关键作用，并提出CD73增益剂作为潜在治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，结果可能在人类患者中存在差异 | 研究CD73在急性和慢性胰腺炎中的作用及其机制 | CD73敲除小鼠与C57BL/6小鼠（野生型） | 数字病理 | 胰腺炎 | 免疫组化和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 小鼠模型 | 组织样本 | CD73小鼠和C57BL/6小鼠 |
| 5191 | 2024-08-05 |
Comprehensive visualization of cell-cell interactions in single-cell and spatial transcriptomics with NICHES
2023-01-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac775
PMID:36458905
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研究论文 | NICHES是一种工具，用于在单细胞水平上探索细胞之间的外部信号传递。 | NICHES通过嵌入配体-受体信号代理，保留单细胞原始数据的保真性，能够可视化细胞簇内、细胞簇间及不同实验条件下的异质信号类型。 | NA | 研究单细胞和空间转录组数据中细胞间的相互作用。 | 主要关注细胞间的信号传递和微环境传统方法的局限性。 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 转录组数据 | NA |
| 5192 | 2024-08-05 |
Renoprotective anti-CD45RB antibody induces B cell production in systemic lupus erythematosus based on single-cell RNA-seq analysis
2023-01, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2022.102949
PMID:36455384
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研究论文 | 该研究探讨了抗-CD45RB抗体在系统性红斑狼疮中的肾保护作用 | 使用单细胞RNA测序分析揭示了抗-CD45RB抗体诱导B细胞生成的机制 | 在小鼠模型中评估，可能无法完全反映人类的病理机制 | 识别系统性红斑狼疮中肾损伤的机制 | 分析了系统性红斑狼疮患者外周血单核细胞及NZB/WF1小鼠模型 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | 从GEO数据库提取的系统性红斑狼疮患者的外周血单核细胞数据 |
| 5193 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies Brain Endothelium Inflammatory Networks in Experimental Autoimmune Encephalomyelitis
2023-01, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200046
PMID:36446612
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研究论文 | 该文章通过单细胞转录组学描绘了实验性自身免疫性脑脊髓炎中大脑内皮细胞的炎症网络 | 该研究首次揭示了静脉内皮细胞在神经炎症中的重要作用，并提供了神经炎症相关细胞异质性的概貌 | 该研究主要集中在动物模型中，尚需进一步验证在人类疾病中的相关性 | 探索自身免疫性脑脊髓炎模型中的神经炎症过程及其分子机制 | 以实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠为研究对象，鉴定与神经炎症相关的内皮细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠及人类多发性硬化症脑部切片 |
| 5194 | 2024-08-08 |
Single-cell atlas reveals a high selection of IgA1- or IgG1-expressing plasma cells in patients with psoriasis
2023-Jan, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2022.11.015
PMID:36459791
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞抗原受体序列分析，探讨了银屑病患者中B细胞介导的体液免疫反应的变化 | 首次揭示了银屑病患者中IgA1和IgG1表达的浆细胞数量显著增加，并发现B细胞受体在CDR和框架区域的强选择压力 | 研究样本仅包括三名健康捐赠者和三名银屑病患者，样本量较小 | 探索银屑病对B细胞介导的体液免疫反应的影响 | 银屑病患者的B细胞及其介导的体液免疫反应 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞抗原受体序列（BCR）测序（scBCR-seq） | NA | 细胞数据 | 三名健康捐赠者和三名银屑病患者的外周血单个核细胞（PBMC） |
| 5195 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing highlights the roles of C1QB and NKG7 in the pancreatic islet immune microenvironment in type 1 diabetes mellitus
2023-01, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2022.106588
PMID:36464147
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨C1QB和NKG7在1型糖尿病胰腺胰岛免疫微环境中的作用机制 | 首次揭示C1QB和NKG7在1型糖尿病胰腺胰岛免疫微环境中对巨噬细胞和T淋巴细胞的关键影响 | 研究主要基于数据库数据和构建的动物模型，未来需进一步在人体样本中验证 | 探讨C1QB和NKG7在1型糖尿病胰腺胰岛免疫微环境中的作用 | C1QB和NKG7基因在1型糖尿病胰腺胰岛免疫微环境中的作用 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA-seq数据 | 大量胰腺胰岛样本，包括14种细胞类型 |
| 5196 | 2024-08-05 |
CD226 knockout reduces the development of CD8+ T by impairing the TCR sensitivity of double-positive thymocytes
2023-05, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13612
PMID:36420662
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研究论文 | 此研究探讨了CD226在胸腺T细胞发育中的作用。 | 揭示了CD226缺失对CD8+ T细胞发育和TCR敏感性的影响，特别是在双阳性胸腺细胞中的作用。 | 未能完全清楚CD226在胸腺内的复杂作用机制。 | 旨在研究CD226在胸腺T细胞发育中的角色及其机制。 | 使用CD226缺失小鼠模型和单细胞测序技术研究胸腺细胞的发育。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 使用CD226缺失小鼠的胸腺细胞 |
| 5197 | 2024-08-05 |
Single-cell-resolution transcriptome map revealed novel genes involved in testicular germ cell progression and somatic cells specification in Chinese tongue sole with sex reversal
2023-05, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-021-2236-4
PMID:36437386
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研究论文 | 本文揭示了与中国舌鳎性别逆转相关的新基因，并描绘了其睾丸中的单细胞转录组图谱 | 首次描绘了中国舌鳎在性别逆转过程中不同生殖细胞和体细胞类型的动态基因表达变化 | 对性别逆转过程中调控机制的解析仍然不够全面 | 研究中国舌鳎性别逆转后生殖细胞发育的调控机制 | 中国舌鳎的生殖细胞和体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自基因型雄性和伪雄性睾丸的细胞样本 |
| 5198 | 2024-08-08 |
Decoding Single-cell Landscape and Intercellular Crosstalk in the Transplanted Liver
2023-04-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004365
PMID:36413145
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研究论文 | 本研究通过建立免疫耐受的原位肝移植小鼠模型，利用单细胞RNA测序和时间飞行流式细胞术，揭示了移植肝的细胞景观和细胞间对话 | 本研究首次详细注释了移植肝的细胞景观，并确定了这些细胞在肝移植过程中的动态变化 | NA | 理解移植肝的生理恢复过程和细胞间对话 | 移植肝的细胞复杂性和细胞间对话 | NA | NA | 单细胞RNA测序，时间飞行流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 5199 | 2024-08-05 |
Identification of chondrocyte subpopulations in osteoarthritis using single-cell sequencing analysis
2023-Feb-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2022.147063
PMID:36427677
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序分析鉴定了骨关节炎中的软骨细胞亚群 | 研究揭示了骨关节炎中软骨细胞亚群的异质性，并识别出不同亚群的潜在功能 | 未提及具体的样本数量和临床信息 | 研究软骨细胞在骨关节炎中异质性的存在及其功能 | 骨关节炎患者的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞测序 | K-均值聚类 | 细胞数据 | NA |
| 5200 | 2024-08-05 |
Transcriptional glucocorticoid effects in the brain: Finding the relevant target genes
2023-02, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.13213
PMID:36426812
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研究论文 | 本文讨论了糖皮质激素在大脑中的转录效应及其相关靶基因 | 探讨了MR和GR受体特异性及确定转录结果的上下文因素 | 未提供有关样本大小和具体实验条件的详细信息 | 阐明糖皮质激素在大脑中的跨细胞类型转录效应 | 涉及矿物皮质激素和糖皮质激素受体的靶基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |