单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5355 篇文献，本页显示第 5121 - 5140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5121 | 2024-08-05 |
Hepatic TREM2+ macrophages express matrix metalloproteinases to control fibrotic scar formation
2023-03, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12616
PMID:36529983
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研究论文 | 本研究探讨了肝脏TREM2+巨噬细胞通过表达基质金属蛋白酶（MMP）来控制纤维化瘢痕形成的机制 | 首次系统地描述了肝脏巨噬细胞的异质性，特别是TREM2+巨噬细胞在肝纤维化中的作用 | 对异质性SAMac群体的表征仍不够全面，需要进一步研究 | 研究肝脏巨噬细胞在肝纤维化中的作用及其潜在治疗途径 | 主要研究TREM2+巨噬细胞及其在肝纤维化过程中的表达特征 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞转录组学 | NA | 公共数据库的单细胞转录组数据 | 人类肝硬化样本及饮食诱导的非酒精性脂肪性肝炎模型 |
| 5122 | 2024-08-05 |
Immunohistochemical characterization of bipolar cells in four distantly related avian species
2023-03, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25443
PMID:36550622
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研究论文 | 该研究系统性测试了12种抗体在鸟类视网膜中标记双极细胞的能力 | 首次提供了不同鸟类双极细胞的免疫组化标记物目录 | 部分标记物不仅标记双极细胞，还标记了其他细胞类型 | 分析各种鸟类视网膜中双极细胞的特征和标记物 | 家鸡、家鸽、普通秃鹰和欧洲知更鸟等四种远缘鸟类 | 数字病理学 | NA | 免疫组化 | NA | 视网膜样本 | 研究涉及四种鸟类的八种最适合的抗体 |
| 5123 | 2024-08-05 |
RIIβ-PKA in GABAergic Neurons of Dorsal Median Hypothalamus Governs White Adipose Browning
2023-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202205173
PMID:36529950
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研究论文 | 本研究探讨了RIIβ-PKA在背侧中间下丘脑GABA能神经元中对白色脂肪组织变褐的调控作用 | 揭示了RIIβ-PKA在背侧中间下丘脑GABA能神经元中调节白色脂肪组织变褐的机制 | 在该研究中没有直接阐明白色脂肪组织变褐是否导致了体重减少 | 研究RIIβ-PKA对白色脂肪组织变褐的影响及其在肥胖和代谢疾病治疗中的潜在应用 | 研究对象为RIIβ缺失小鼠及其在背侧中间下丘脑GABA能神经元中的表现 | 数字病理学 | 肥胖症 | 单细胞测序，转录组测序，电生理研究 | NA | NA | RIIβ-KO小鼠 |
| 5124 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals the chemotherapy-induced cellular reprogramming and novel therapeutic targets in relapsed/refractory acute myeloid leukemia
2023-02, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-022-01789-6
PMID:36543880
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术分析了原发性难治性或短期复发急性髓系白血病患者的骨髓样本，揭示了化疗诱导的细胞重编程及新的治疗靶点 | 发现了化疗过程中增殖性干细胞/祖细胞样细胞向静止干细胞样细胞的表型转变，并确定了CD52和LGALS1的上调 | NA | 揭示急性髓系白血病化疗耐药机制，开发新的治疗策略 | 急性髓系白血病患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 5125 | 2024-08-08 |
Identification of Cell Types and Transcriptome Landscapes of Porcine Epidemic Diarrhea Virus-Infected Porcine Small Intestine Using Single-Cell RNA Sequencing
2023-02-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2101216
PMID:36548460
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研究论文 | 本研究首次使用单细胞RNA测序技术系统分析了感染猪流行性腹泻病毒（PEDV）的猪空肠细胞类型和转录组景观 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统分析PEDV感染的猪空肠，并鉴定了一种新的绒毛细胞标记物DNAH11 | NA | 研究PEDV感染后猪空肠不同细胞类型的反应，加深对病毒发病机制的理解 | 猪流行性腹泻病毒（PEDV）感染的猪空肠细胞类型和转录组景观 | 数字病理学 | 猪病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 5126 | 2024-08-05 |
Class switch toward noninflammatory, spike-specific IgG4 antibodies after repeated SARS-CoV-2 mRNA vaccination
2023-01-27, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.ade2798
PMID:36548397
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研究论文 | 该研究报道了在重复接种SARS-CoV-2 mRNA疫苗后，特异性IgG4抗体的增加. | 该研究发现，在第二次接种几个月后，SARS-CoV-2特异性抗体主要由非炎症性IgG4组成，并且第三次接种进一步增加了IgG4抗体的比例. | 该研究没有探讨亚型IgG4的长期免疫影响及其在不同人群中的表现. | 研究mRNA疫苗接种后特定IgG4抗体的变化及其对疫苗接种策略的影响. | 研究对象为接种SARS-CoV-2 mRNA疫苗后的抗体反应变化. | 免疫学 | NA | 单细胞测序和流式细胞术 | NA | 抗体反应数据 | 在三次免疫接种后分析了与IgG4相关的B细胞频率. |
| 5127 | 2024-08-05 |
spaCI: deciphering spatial cellular communications through adaptive graph model
2023-01-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac563
PMID:36545790
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研究论文 | 本文提出了一种新颖的自适应图模型spaCI，用于解读细胞间的空间通信 | spaCI结合了细胞的空间位置和基因表达特征，通过注意力机制提高了细胞通信的推断能力 | 在研究中可能未能详细探讨模型的计算效率及其在其他类型数据中的适用性 | 阐明细胞间的通信机制，尤其是在复杂疾病中的作用 | 主要研究对象为小鼠皮层的seqFISH+数据和非小细胞肺癌样本的NanoString CosMx SMI数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞空间转录组学（SCST） | 自适应图模型 | 基因表达数据 | 涉及小鼠皮层和非小细胞肺癌样本的seqFISH+和NanoString CosMx SMI数据 |
| 5128 | 2024-08-05 |
Senescence atlas reveals an aged-like inflamed niche that blunts muscle regeneration
2023-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05535-x
PMID:36544018
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研究论文 | 本研究揭示衰老细胞在骨骼肌再生区中的重要性，并阐明其对再生的抑制作用 | 本研究结合单细胞转录组学和衰老细胞富集分选协议，克服了衰老细胞稀缺的技术限制，提供了在体内分离衰老细胞的技术，并定义了肌肉的衰老蓝图 | 衰老细胞的多样性可能影响研究结果的普遍性 | 旨在探讨衰老细胞如何影响肌肉再生及其相关机制 | 年轻和老鼠损伤肌肉中不同类型的衰老细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 年轻和老鼠中不同类型的损伤肌肉样本 |
| 5129 | 2024-08-05 |
scDrug: From single-cell RNA-seq to drug response prediction
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.11.055
PMID:36544472
|
研究论文 | scDrug是一个生物信息学工作流程，用于从单细胞RNA测序数据生成细胞聚类及预测药物治疗 | 提供了一种集成工具，从单细胞RNA测序分析到药物发现的全过程 | 目前的工具可能在精准性和适用范围上存在限制 | 开发一个综合的bioinformatics工具以进行药物反应预测 | 单细胞RNA测序数据及其在肿瘤微环境中的细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 5130 | 2024-08-08 |
The Heterogeneity of Tumour-Associated Macrophages Contributes to the Recurrence and Outcomes of Glioblastoma Patients
2023-Jan, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-022-02081-z
PMID:36542317
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤相关巨噬细胞的异质性对胶质母细胞瘤患者复发和预后的影响 | 通过单细胞RNA测序分析了复发性胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞的异质性，并建立了一个基于差异表达基因的预后标志物 | NA | 探究肿瘤相关巨噬细胞的异质性是否影响胶质母细胞瘤患者的复发和预后 | 胶质母细胞瘤患者的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自医院的胶质母细胞瘤组织样本 |
| 5131 | 2024-08-08 |
Bulk RNA-seq and scRNA-seq analysis reveal an activation of immune response and compromise of secretory function in major salivary glands of obese mice
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.11.054
PMID:36544475
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研究论文 | 本研究通过bulk RNA-seq和scRNA-seq分析，揭示了肥胖小鼠主要唾液腺中免疫反应的激活和分泌功能的损害 | 首次通过bulk RNA-seq和scRNA-seq技术研究肥胖对唾液腺转录组和细胞组成的影响，并首次对舌下腺的细胞类型进行单细胞RNA测序注释 | NA | 探讨肥胖对唾液腺功能的影响及其分子机制 | 肥胖小鼠的主要唾液腺 | 数字病理学 | 肥胖 | RNA-seq | NA | RNA | 肥胖小鼠的主要唾液腺样本 |
| 5132 | 2024-08-05 |
TSPAN4 and migrasomes in atherosclerosis regression correlated to myocardial infarction and pan-cancer progression
2023-12, Cell adhesion & migration
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/19336918.2022.2155337
PMID:36513632
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研究论文 | 本文探讨了TSPAN4在动脉粥样硬化逆转和癌症进展中的作用 | 揭示了TSPAN4在动脉粥样硬化和癌症进展中的关键角色 | 关于TSPAN4对迁移体的生理功能了解较少 | 研究TSPAN4在动脉粥样硬化和癌症进展中的作用 | 聚焦于巨噬细胞中的TSPAN4表达及其在动脉粥样硬化中的相关性 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序，GEO 数据集，TCGA 数据库 | MI小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 5133 | 2024-08-08 |
CT Radiomics to Predict Macrotrabecular-Massive Subtype and Immune Status in Hepatocellular Carcinoma
2023-04, Radiology
IF:12.1Q1
DOI:10.1148/radiol.221291
PMID:36511807
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研究论文 | 本研究构建了一个CT放射组学模型，用于预测肝细胞癌中的大梁状-大量型亚型及其免疫状态 | 利用放射组学方法非侵入性地识别肝细胞癌的大梁状-大量型亚型，并研究其潜在的免疫浸润模式 | 研究基于回顾性和前瞻性数据集，且样本来自三个学术医学中心，可能存在一定的地域和样本选择偏倚 | 构建CT放射组学模型以预测肝细胞癌的大梁状-大量型亚型，并探讨其免疫浸润模式 | 肝细胞癌患者及其肿瘤亚型和免疫状态 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | CT放射组学 | 机器学习模型 | 图像 | 365名接受切除手术的肝细胞癌成年患者，以及58名接受化疗栓塞和抗血管生成治疗的晚期肝细胞癌成年患者 |
| 5134 | 2024-08-08 |
Dissociation and flow cytometric isolation of murine intestinal epithelial cells for multi-omic profiling
2023-03-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101936
PMID:36520632
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用乙二胺四乙酸和TrypLE Express分离高存活率的小鼠肠上皮细胞的逐步协议，这些细胞可用于多组学分析，包括单细胞RNA测序 | 提出了一种新的方法来分离高存活率的肠上皮细胞，适用于多组学分析 | NA | 开发一种新的分离技术，以提高肠上皮细胞的存活率并进行多组学分析 | 小鼠肠上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 5135 | 2024-08-08 |
ACTA2 Expression Predicts Survival and Is Associated with Response to Immune Checkpoint Inhibitors in Gastric Cancer
2023-03-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-1897
PMID:36508166
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研究论文 | 本研究旨在识别预测胃癌患者总体生存率和免疫检查点抑制剂（ICI）反应的生物标志物 | 发现肿瘤ACTA2表达与胃癌患者的生存率和ICI反应相关，特别是在α-SMA阳性癌症相关成纤维细胞（CAF）中的ACTA2表达与ICI反应有关 | 研究为回顾性分析，且样本量有限 | 识别预测胃癌患者总体生存率和免疫检查点抑制剂反应的生物标志物 | 胃癌患者的肿瘤ACTA2表达与生存率和ICI反应的关系 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、数字空间分析 | NA | mRNA序列数据 | 发现队列567名患者，验证队列974名患者，ICI治疗患者108名 |
| 5136 | 2024-08-05 |
Recent advances in the molecular understanding of medulloblastoma
2023-Mar, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15691
PMID:36520034
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综述 | 本文总结了关于髓母细胞瘤的最新基因组学研究进展 | 介绍了SHH亚组和4组亚组中涉及的新突变及其相关通路 | 未探讨临床应用或疗法 | 阐明髓母细胞瘤的分子机制 | 髓母细胞瘤的四个分子亚组及其突变 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 测序分析 | NA | 基因组数据 | NA |
| 5137 | 2024-08-05 |
Active eosinophils regulate host defence and immune responses in colitis
2023-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05628-7
PMID:36509106
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研究论文 | 本文对小鼠嗜酸性粒细胞进行了全面的单细胞转录组分析 | 揭示了嗜酸性粒细胞的活性和基态群体的转录组与空间定位差异 | 研究中的样本量较小，可能限制结果的普遍性 | 探索嗜酸性粒细胞在肠道炎症中的作用 | 小鼠嗜酸性粒细胞及其在肠道中的功能 | 数字病理学 | 肠炎 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠样本及小规模人类炎症性肠病患者样本 |
| 5138 | 2024-08-08 |
NF-κB drives epithelial-mesenchymal mechanisms of lung fibrosis in a translational lung cell model
2023-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.154719
PMID:36520540
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研究论文 | 研究探讨了在特发性肺纤维化进展阶段，肺上皮细胞和肺间质细胞在共培养模型中的相互作用及其对纤维化的影响 | 首次揭示了NF-κB信号通路在肺上皮细胞和肺纤维细胞共培养模型中的活性，及其在纤维化过程中的潜在介导作用 | NA | 研究肺上皮细胞和肺间质细胞在特发性肺纤维化中的相互作用及NF-κB信号通路的角色 | 人原代气道上皮细胞和肺纤维细胞的共培养模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及人原代气道上皮细胞和肺纤维细胞的共培养样本 |
| 5139 | 2024-08-05 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Decodes Wharton's Jelly-Derived Mesenchymal Stem Cells Heterogeneity and a Subpopulation with Wound Repair Signatures
2023-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202204786
PMID:36504438
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研究论文 | 本研究系统分析了脐带胶（WJ-MSCs）来源的间充质干细胞的高度异质性 | 通过单细胞转录组学分析，识别出四种WJ-MSC亚群及其独特的愈合特性 | 尚未提及具体的局限性 | 探索WJ-MSC的异质性，建立精准的MSC亚型分类 | 脐带胶来源的间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞和空间转录组测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 5140 | 2024-08-08 |
Manf Enhances the Pyroptosis Inhibition of Bone Marrow-derived Mesenchymal Stem Cells to Relieve Cerebral Infarction Injury
2023-02-01, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 本研究通过构建大脑中动脉闭塞（MCAO）动物模型，利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）比较假手术组和MCAO组的差异表达基因（DEGs），探讨脑梗死中潜在的细胞死亡相关通路，并通过慢病毒将Manf转染到骨髓间充质干细胞（BMSCs）中，评估其对MANF含量、凋亡、细胞焦亡、脑梗死体积和神经功能的影响。 | 本研究首次通过基因修饰的细胞疗法，特别是通过转染Manf到BMSCs中，显著增加了MANF的表达和分泌，从而有效抑制了凋亡和细胞焦亡相关分子的表达，减少了脑梗死体积，改善了神经功能。 | 研究主要集中在动物模型上，尚未在临床试验中验证其疗效和安全性。 | 探讨基因修饰的细胞疗法在脑梗死治疗中的潜在机制和疗效。 | 骨髓间充质干细胞（BMSCs）及其转染Manf后的效果。 | 细胞生物学 | 脑梗死 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及多个细胞集群和动物模型 |