单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5355 篇文献，本页显示第 5101 - 5120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5101 | 2024-08-08 |
A novel molecular classification method for osteosarcoma based on tumor cell differentiation trajectories
2023-Jan-02, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-022-00233-w
PMID:36588108
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序数据，提出了一种新的骨肉瘤分子分类方法，通过分析肿瘤细胞的分化轨迹，将骨肉瘤样本分为三个亚型 | 首次使用单细胞RNA测序技术进行骨肉瘤的分子亚分类，并发现了三种分化轨迹，为精准治疗提供了新的参考 | 研究样本数量有限，需要进一步扩大样本量以验证分类模型的准确性和普适性 | 开发一种新的骨肉瘤分子分类方法，以提高治疗选择和癌症患者的反应率 | 骨肉瘤样本及其肿瘤细胞的分化轨迹 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 分析了六个传统骨肉瘤和九个松质骨样本，并通过IHC染色验证了138个骨肉瘤样本 |
| 5102 | 2024-08-05 |
T cell-related prognostic risk model and tumor immune environment modulation in lung adenocarcinoma based on single-cell and bulk RNA sequencing
2023-01, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.106460
PMID:36565482
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研究论文 | 本研究探讨了T细胞标记基因的表达特征，并基于这些基因构建了肺腺癌的预后风险模型 | 提出了基于T细胞标记基因的新的预后风险模型，能够提出LUAD患者的生存和治疗结果的预测 | 尚未提及模型的外部验证及在更大样本群体中的适用性 | 探索肺腺癌中T细胞标记基因的表达特征及其与免疫治疗反应的关系 | 涉及非小细胞肺癌患者的肺腺癌组织活检样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | NA | 细胞数据 | 包含6个组织活检样本，32,108个细胞 |
| 5103 | 2024-08-05 |
Analysis of Spatial Molecular Data
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2914-7_20
PMID:36587134
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研究论文 | 本文探讨了支持肿瘤异质性和空间分子数据分析的方法 | 提出了一种深度学习管道，能够从整个病理图像中生成有限的空间转录组学数据，及一个用于量化空间肿瘤异质性的算法 | 样本大小和数据集的多样性未在摘要中明确说明 | 旨在分析癌症诊断和治疗中的空间肿瘤异质性 | 重点研究从H&E全切片图像中提取的分子特征和转录组数据 | 数字病理学 | 癌症 | 深度学习 | NA | 图像 | NA |
| 5104 | 2024-08-08 |
Intratumor microbiome features reveal antitumor potentials of intrahepatic cholangiocarcinoma
2023 Jan-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2022.2156255
PMID:36563106
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研究论文 | 本研究旨在分析肝内胆管癌（ICC）组织中的细菌群落特征，并探索其抗肿瘤潜力 | 通过16S rRNA测序和单细胞RNA测序（scRNA-seq）揭示了肿瘤内微生物群的多样性和其在肿瘤微环境中的分布 | 研究样本量有限，且未详细说明所鉴定细菌的具体种类及其在抗肿瘤机制中的确切作用 | 研究肝内胆管癌组织中的微生物组特征及其抗肿瘤潜力 | 肝内胆管癌组织及其微生物群 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 16S rRNA测序, 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 微生物DNA, 组织样本 | 99个组织样本 |
| 5105 | 2024-08-08 |
Altered phenotypic and metabolic characteristics of FOXP3+CD3+CD56+ natural killer T (NKT)-like cells in human malignant pleural effusion
2023, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2160558
PMID:36567801
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研究论文 | 研究了人类恶性胸腔积液中FOXP3+CD3+CD56+自然杀伤T（NKT）样细胞的表型和代谢特征变化 | 首次揭示了FOXP3 NKT样细胞在人类恶性胸腔积液中的表型和代谢特征变化 | NA | 探讨恶性胸腔积液中NKT样细胞的表型和代谢特征变化 | FOXP3+CD3+CD56+自然杀伤T（NKT）样细胞 | 免疫学 | 恶性胸腔积液 | 流式细胞术，免疫荧光染色，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | NA |
| 5106 | 2024-08-08 |
BCG-activation of leukocytes is sufficient for the generation of donor-independent innate anti-tumor NK and γδ T-cells that can be further expanded in vitro
2023, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2160094
PMID:36567803
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研究论文 | 本文研究了BCG激活白细胞产生非供体依赖性的天然抗肿瘤NK和γδ T细胞，并能在体外进一步扩增 | 首次展示了BCG激活的γδ T细胞具有高IFNγ分泌特征和抗肿瘤功能，且能在体外扩增 | BCG单独不能刺激纯化的γδ T细胞的扩增 | 探讨BCG激活白细胞产生抗肿瘤细胞的机制及其在免疫治疗中的应用 | BCG激活的NK细胞和γδ T细胞 | 免疫学 | 膀胱癌 | scRNA-seq, 流式细胞术, 功能性检测 | NA | 细胞 | 人类外周血单个核细胞 |
| 5107 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals resident progenitor and vascularization-associated cell subpopulations in rat annulus fibrosus
2023-Jan, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2022.11.004
PMID:36568849
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了大鼠纤维环中存在的干细胞前体和血管化相关细胞亚群 | 发现了两个新的功能性纤维环细胞亚群，具有干细胞特性和血管化诱导潜力 | NA | 鉴定纤维环中的功能性细胞亚群，包括干细胞前体和血管化相关细胞 | 大鼠和人类的纤维环细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠和人类的纤维环样本 |
| 5108 | 2024-08-08 |
SOX4 is a novel phenotypic regulator of endothelial cells in atherosclerosis revealed by single-cell analysis
2023-01, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2022.02.017
PMID:36585108
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了动脉粥样硬化中的内皮细胞转录组，揭示了SOX4作为内皮细胞功能障碍的新型表型调节因子 | 发现SOX4是内皮细胞在动脉粥样硬化中的新型表型调节因子，并揭示了高血脂相关细胞因子和振荡血流作为SOX4的内源性诱导因素 | NA | 探究动脉粥样硬化中内皮细胞的转录组特征，识别内皮细胞功能障碍的新型调节因子，并提供动脉粥样硬化进展的机制性见解 | 动脉粥样硬化中的内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用西方饮食喂养的载脂蛋白E缺陷（ApoE-/-）小鼠的主动脉细胞，以及人冠状动脉和肾动脉的动脉粥样硬化组织 |
| 5109 | 2024-08-08 |
Multiplex immunofluorescence and single-cell transcriptomic profiling reveal the spatial cell interaction networks in the non-small cell lung cancer microenvironment
2023-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1155
PMID:36588094
|
研究论文 | 本文通过多重免疫荧光技术和单细胞转录组测序，揭示了非小细胞肺癌微环境中细胞间的空间相互作用网络 | 首次利用多重免疫荧光技术同时检测多个标记物，并结合单细胞RNA测序技术，分析了肿瘤微环境中细胞的空间位置和相互作用 | 研究样本仅限于553例非小细胞肺癌病例，可能无法完全代表所有非小细胞肺癌患者的情况 | 研究非小细胞肺癌微环境中细胞的空间相互作用网络 | 非小细胞肺癌肿瘤切片中的细胞标记物和细胞间的空间关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 多重免疫荧光技术，单细胞RNA测序 | StarDist深度学习模型 | 图像，转录组数据 | 553例非小细胞肺癌肿瘤切片，4例非小细胞肺癌单细胞RNA测序样本 |
| 5110 | 2024-08-05 |
The second heart field: the first 20 years
2023-Jun, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-022-09975-8
PMID:36550326
|
综述 | 本文回顾了第二心场（SHF）在心脏发育中的贡献和信号调控网络 | 文章总结了第二心场研究20年的进展，并提出了单细胞测序和精确谱系追踪的新技术应用 | 需要进一步研究SHF的细胞异质性及其复杂的调控网络和未确定机制 | 探讨第二心场在心脏发育中的作用及其临床应用 | 主要研究对象为第二心场及其在心脏发育中的作用 | NA | 先天性心脏病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 5111 | 2024-08-05 |
Single-cell and spatial multi-omics in the plant sciences: Technical advances, applications, and perspectives
2023-05-08, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2022.100508
PMID:36540021
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综述 | 本文概述了植物科学中单细胞和空间多组学的技术进展、应用和前景. | 提出了将单细胞转录组学、空间转录组学和空间代谢组学结合以分析植物发育的创新方法. | 没有提及具体的实验数据和案例研究来支持论点. | 研究和概述单细胞和空间多组学在植物科学中的应用和未来发展. | 植物组织中的转录组和代谢组. | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | 转录组数据, 代谢组数据 | NA |
| 5112 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq of Lotus japonicus provide insights into identification and function of root cell types of legume
2023-May, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13435
PMID:36537698
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研究论文 | 该文章研究了莲池豆根部不同细胞类型的转录组及其功能 | 首次提供了豆科植物根尖的单细胞分辨率转录组 | 研究主要集中在一种豆科植物，可能无法普遍适用于所有豆科植物 | 探讨豆科植物根部不同细胞类型的转录组和功能 | 莲池豆的根尖单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 超过22000个单细胞 |
| 5113 | 2024-08-05 |
Privacy-preserving integration of multiple institutional data for single-cell type identification with scPrivacy
2023-05, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-022-2224-4
PMID:36543995
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研究论文 | 本研究提出了一个名为scPrivacy的原型，用于在数据隐私保护的情况下实现单细胞类型的自动识别 | 该研究是首个通用的自动化单细胞类型识别原型，能在保护数据隐私的前提下促进单细胞注释 | 该方法的有效性主要依赖于所使用的公共基准数据集 | 研究旨在推动在多机构数据隐私保护下的单细胞类型识别 | 研究对象为来自多个机构的大规模单细胞RNA-seq数据集 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 综合公开可用的基准数据集 |
| 5114 | 2024-08-08 |
scRNA-seq profiling of neonatal and adult thymus-derived CD4+ T cells by a T cell origin-time tracing model
2023-04-20, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjac072
PMID:36542462
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研究论文 | 本研究通过T细胞起源时间追踪模型，对新生和成年胸腺来源的CD4+ T细胞进行单细胞RNA测序分析，揭示了新生胸腺来源的调节T细胞（Treg）在免疫抑制功能上的增强特性。 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细比较了新生和成年胸腺来源CD4+ T细胞的分子特征和功能差异，特别是在免疫稳态维持方面的能力。 | 研究主要依赖于动物模型，且追踪时间有限，可能未能完全反映长期环境影响下的T细胞动态变化。 | 探讨新生和成年胸腺来源CD4+ T细胞在分子水平和功能上的差异，特别是在免疫稳态维持方面的能力。 | 新生和成年胸腺来源的CD4+ T细胞，特别是调节T细胞（Treg）。 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | T细胞起源时间追踪模型 | RNA | 新生和成年胸腺来源的CD4+ T细胞样本，追踪时间为9周和12天 |
| 5115 | 2024-08-05 |
Novel insights into Hodgkin lymphoma biology by single-cell analysis
2023-04-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022017147
PMID:36548960
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研究论文 | 通过单细胞分析对霍奇金淋巴瘤生物学的新见解 | 使用单细胞技术揭示了霍奇金淋巴瘤肿瘤微环境中细胞间相互作用和异质性的独特特点 | 未提及具体的限制因素 | 深入理解霍奇金淋巴瘤中的免疫生物学 | 霍奇金淋巴瘤及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序和多重成像技术 | NA | 血液样本、新鲜组织和福尔马林固定样本 | NA |
| 5116 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis Reveals Transcriptomic Features of Drug-Tolerant Persisters and Stromal Adaptation in a Patient-Derived EGFR-Mutated Lung Adenocarcinoma Xenograft Model
2023-04, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2022.12.003
PMID:36535627
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研究论文 | 本研究使用患者来源的EGFR突变肺腺癌异种移植模型，通过单细胞RNA测序分析了药物耐受持久细胞（DTP）和基质适应的转录组特征。 | 首次在患者来源的肺腺癌异种移植模型中进行单细胞RNA测序，揭示了DTP细胞的转录组特征和基质适应的变化。 | 研究仅限于特定的EGFR突变肺腺癌模型，结果的普遍性有待进一步验证。 | 探讨靶向治疗中断后肿瘤复发的原因，特别是药物耐受持久细胞（DTP）的作用。 | 药物耐受持久细胞（DTP）和癌症相关成纤维细胞（CAF）的转录组特征。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 使用EGFR抑制剂erlotinib治疗5至6周的肿瘤 bearing 小鼠模型 |
| 5117 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing combined with single-cell proteomics identifies the metabolic adaptation of islet cell subpopulations to high-fat diet in mice
2023-04, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-022-05849-5
PMID:36538064
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序结合单细胞蛋白质组学，识别了小鼠胰岛细胞亚群在高脂饮食下的代谢适应性 | 首次结合单细胞RNA测序和蛋白质组学技术，深入解析了胰岛细胞亚群在高脂饮食诱导的葡萄糖不耐受中的代谢适应机制 | NA | 探索肥胖进展和糖尿病发病过程中胰岛细胞亚群的组成变化及其对高脂饮食诱导的胰岛代谢适应机制 | 小鼠胰岛细胞亚群 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 共分析了33,999个细胞 |
| 5118 | 2024-08-08 |
RIPK1 kinase-dependent inflammation and cell death contribute to the pathogenesis of COPD
2023-04, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01506-2022
PMID:36549711
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研究论文 | 本文研究了受体相互作用蛋白激酶1（RIPK1）依赖的细胞死亡和炎症在慢性阻塞性肺病（COPD）发病机制中的作用 | 首次详细探讨了RIPK1激酶抑制在实验性COPD模型中的保护作用，并提出其作为一种新型治疗策略的潜力 | NA | 旨在定义RIPK1激酶依赖的细胞死亡和炎症在COPD发病机制中的贡献 | RIPK1在COPD患者肺组织中的表达及其激酶活性抑制的影响 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 包括人类和鼠类的肺组织样本，以及COPD患者和对照组的肺组织 |
| 5119 | 2024-08-08 |
Protocol to dissociate healthy and infected murine- and hamster-derived lung tissue for single-cell transcriptome analysis
2023-03-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101957
PMID:36542521
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研究论文 | 本文提供了一种将健康和感染的小鼠及仓鼠肺组织转化为具有代表性的多样性、存活的单细胞悬液的协议，用于单细胞转录组分析 | 本文介绍了一种新的肺组织处理方法，包括血管灌注、肺切除、酶消化和机械分离，以及红细胞裂解和分离细胞计数 | 目前仍需进一步提高肺内皮细胞的比例，同时不损害细胞的存活率 | 研究传染病中的宿主-病原体相互作用 | 小鼠和仓鼠的肺组织 | 数字病理学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 5120 | 2024-08-05 |
Stromal Reprogramming through Dual PDGFRα/β Blockade Boosts the Efficacy of Anti-PD-1 Immunotherapy in Fibrotic Tumors
2023-03-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1890
PMID:36543251
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研究论文 | 研究探讨双重PDGFRα/β阻断如何增强抗PD-1免疫疗法在纤维化肿瘤中的疗效 | 揭示了间质重编程在免疫再激活中的影响，并结合免疫疗法提高纤维化癌症患者的治疗潜力 | 未提及具体的临床试验数据和长期效果 | 阐明间质重编程和改进癌症免疫治疗的潜在途径 | 胃癌患者中的间质及其对免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 组织样本 | 涉及胃癌的纤维化肿瘤异种移植模型 |