单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5355 篇文献，本页显示第 5041 - 5060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5041 | 2024-08-05 |
Comparing RNA-sequencing datasets from astrocytes, oligodendrocytes, and microglia in multiple sclerosis identifies novel dysregulated genes relevant to inflammation and myelination
2023-03, WIREs mechanisms of disease
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/wsbm.1594
PMID:36600404
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研究论文 | 本研究整合了多项RNA测序研究，以识别和回顾与多发性硬化症中神经系统胶质细胞相关的差异调控基因及通路的新的模式 | 本研究通过整合多个RNA测序数据集，识别与炎症和髓鞘形成相关的新型失调基因 | 缺乏对个别研究结果之间的报道和对比 | 该研究旨在调查多发性硬化症中神经系统特定胶质细胞中的基因表达变化 | 研究对象包括来自动物模型及初级患者组织的星形胶质细胞、小胶质细胞和少突胶质细胞 | 分子生物学 | 多发性硬化症 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 5042 | 2024-08-05 |
COVID-19 and non-alcoholic fatty liver disease: Biological insights from multi-omics data
2023-03, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.15509
PMID:36593576
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研究论文 | 通过整合多组学数据，我们探讨了COVID-19与非酒精性脂肪肝病（NAFLD）之间的共同病理生理机制 | 本研究通过功能富集分析揭示了COVID-19与NAFLD之间共享的生物疾病机制，特别关注性别特异性的途径 | 该研究可能未涵盖所有潜在的遗传和代谢因素，导致生物机制的理解不够全面 | 研究COVID-19与非酒精性脂肪肝病的共同病理机制及其在性别方面的差异 | 重点研究COVID-19感染和NAFLD在生物学过程中的共同遗传风险因素 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 多组学数据整合 | 单细胞转录组学 | 基因组学和代谢组学数据 | 健康和COVID-19组织标本中的肝细胞和Kupffer细胞 |
| 5043 | 2024-08-08 |
Cell diversity and immune infiltration in the parathyroid tumour microenvironment
2023-03-01, Endocrine-related cancer
IF:4.1Q2
DOI:10.1530/ERC-22-0325
PMID:36602147
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了甲状旁腺腺瘤组织中的细胞多样性和免疫浸润情况 | 首次详细描述了甲状旁腺腺瘤中的八种主要细胞类型及其亚群，并揭示了肿瘤内分泌细胞的静息状态、免疫抑制微环境以及炎症相关的肿瘤相关成纤维细胞 | NA | 探究甲状旁腺肿瘤微环境中的细胞多样性和免疫浸润特征 | 甲状旁腺腺瘤组织中的细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 甲状旁腺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 27,251个细胞来自4个甲状旁腺腺瘤组织样本 |
| 5044 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics dissects epithelial heterogeneity in HPV+ cervical adenocarcinoma
2023-02, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28480
PMID:36609919
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序揭示了HPV阳性宫颈腺癌中上皮细胞的异质性 | 首次系统分析了HPV阳性宫颈腺癌中上皮细胞的内部和肿瘤间异质性 | 研究仅涉及3个患者的样本，可能限制了结果的推广性 | 探究HPV阳性宫颈腺癌中上皮细胞的异质性，以推动个体化治疗 | HPV阳性宫颈腺癌患者的上皮细胞 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 19,229个上皮细胞，来自3名患者的3个肿瘤样本 |
| 5045 | 2024-08-05 |
The functional implication of ATF6α in castration-resistant prostate cancer cells
2023-02, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202201347R
PMID:36607288
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研究论文 | 本文报告了ATF6α与去势耐药性前列腺癌细胞存活的关系 | 发现ATF6α在去势耐药性前列腺癌中的重要功能及其与癌症进展的相关性 | ATF6α抑制剂的特异性和有效性仍需进一步改进和评估 | 研究ATF6α在去势耐药性前列腺癌中的功能及其潜在的治疗靶点 | 去势耐药性前列腺癌细胞及其相关的分子通路 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 人类CRPC肿瘤的bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据集 |
| 5046 | 2024-08-05 |
USP51/ZEB1/ACTA2 axis promotes mesenchymal phenotype in gastric cancer and is associated with low cohesion characteristics
2023-02, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2022.106644
PMID:36603607
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研究论文 | 本研究探讨了USP51/ZEB1/ACTA2轴在促进胃癌转移中的作用 | 揭示了USP51通过维持ZEB1表达促进ACTA2转录，从而激活胃癌细胞的间质表型，推动肿瘤转移的关键机制 | PC-GC的分子机制尚未完全理解，研究范围可能有限 | 研究USP51/ZEB1/ACTA2轴在胃癌转移中的作用 | 胃癌细胞及相关的单细胞群体 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序和转录组分析 | NA | 组织样本 | NA |
| 5047 | 2024-08-08 |
A single-cell map of peripheral alterations after FMT treatment in patients with systemic lupus erythematosus
2023-02, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2022.102989
PMID:36610264
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了系统性红斑狼疮患者在接受粪便微生物移植治疗前后外周血单个核细胞的变化 | 首次揭示了粪便微生物移植治疗后系统性红斑狼疮患者外周T淋巴细胞和NK细胞的变化，并发现了与治疗效果相关的基因表达模式 | 样本量较小，仅包括13名患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨粪便微生物移植对系统性红斑狼疮患者外周免疫细胞的潜在影响 | 系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 30份外周血单个核细胞样本来自13名系统性红斑狼疮患者 |
| 5048 | 2024-08-08 |
Single-cell Transcriptomics Reveal the Importance of Distinct Epithelial Cell Populations in Ileal-specific, Treatment-naïve, and Treated Crohn's Disease Patients
2023-02-01, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izac264
PMID:36610699
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5049 | 2024-08-08 |
Efficient generation of lower induced motor neurons by coupling Ngn2 expression with developmental cues
2023-01-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111896
PMID:36596304
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研究论文 | 本研究通过结合转录因子Neurogenin2（Ngn2）的过表达与小分子模式化，将人类多能干细胞（hPSCs）分化为下位诱导运动神经元（liMoNes/liMNs） | 本研究创新性地结合了Ngn2的过表达与小分子模式化，实现了高效率和高重复性的下位诱导运动神经元生成 | NA | 推动对运动神经元生物学及其在疾病中功能障碍的认知 | 人类多能干细胞分化为下位诱导运动神经元 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 50个人类多能干细胞系 |
| 5050 | 2024-08-08 |
Diverse effector and regulatory functions of fibro/adipogenic progenitors during skeletal muscle fibrosis in muscular dystrophy
2023-Jan-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105775
PMID:36594034
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了Duchenne肌营养不良症中骨骼肌纤维化的细胞机制，特别是纤维/脂肪生成前体细胞（FAPs）在其中的作用 | 首次揭示了FAPs在骨骼肌纤维化中的双重作用，既是细胞外基质（ECM）的主要来源，也是ECM调控基因的主要表达细胞 | 研究仅限于Duchenne肌营养不良症的疾病小鼠模型，未涉及其他模型或人类样本 | 探讨Duchenne肌营养不良症中骨骼肌纤维化的细胞机制 | 纤维/脂肪生成前体细胞（FAPs）及其在骨骼肌纤维化中的作用 | NA | 肌营养不良症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠膈肌和股四头肌的单细胞样本 |
| 5051 | 2024-08-05 |
Systematic benchmarking of statistical methods to assess differential expression of circular RNAs
2023-01-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac612
PMID:36592056
|
研究论文 | 本文比较了38种用于评估环状RNA差异表达的统计方法。 | 首次系统性评估适用于环状RNA表达数据的不同差异表达方法的性能。 | 研究集中于特定的统计方法，未涵盖所有可能的方法或数据类型。 | 评估不同统计方法在环状RNA差异表达分析中的有效性。 | 环状RNA的表达数据，特别是RNA-seq数据。 | 生物统计学 | 肿瘤 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及的数据集数量和类型的具体信息未说明 |
| 5052 | 2024-08-08 |
scGMAAE: Gaussian mixture adversarial autoencoders for diversification analysis of scRNA-seq data
2023-01-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac585
PMID:36592058
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scGMAAE的深度生成模型，用于单细胞RNA测序数据的多样化分析 | scGMAAE模型假设不同类型的细胞的低维嵌入遵循不同的正态分布，结合贝叶斯变分推断和对抗训练，提供了复杂数据的解释性潜在表示，并发现不同类型细胞的统计分布 | NA | 开发一种新的深度生成模型，以提高单细胞RNA测序数据分析的灵活性、可控性和可解释性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 对抗自编码器 | 基因表达数据 | 大量单细胞RNA测序数据 |
| 5053 | 2024-08-08 |
CD8+ T cell-intrinsic IL-6 signaling promotes resistance to anti-PD-L1 immunotherapy
2023-01-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100878
PMID:36599350
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研究论文 | 本文探讨了白细胞介素6（IL-6）在抗PD-L1免疫治疗中的作用，发现IL-6与atezolizumab治疗反应不佳相关，并提出联合阻断PD-L1和IL-6受体（IL6R）可增强抗肿瘤效果 | 首次揭示了IL-6在CD8+ T细胞中的内在信号传导对抗PD-L1免疫治疗抵抗性的影响，并提出联合治疗策略 | NA | 探讨IL-6在抗PD-L1免疫治疗中的作用及改善治疗效果的策略 | 晚期肾癌、乳腺癌和膀胱癌患者以及肿瘤模型中的CD8+ T细胞 | NA | 肾癌、乳腺癌、膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 临床试验涉及大量晚期肾癌、乳腺癌和膀胱癌患者，以及肿瘤模型中的小鼠 |
| 5054 | 2024-08-08 |
SPOCK1 and POSTN are valuable prognostic biomarkers and correlate with tumor immune infiltrates in colorectal cancer
2023-Jan-07, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-022-02621-2
PMID:36611136
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研究论文 | 本研究旨在基于基质和免疫评分筛选结直肠癌（CRC）中的有价值预后生物标志物，并探讨其与肿瘤免疫浸润的关系。 | 本研究首次发现SPOCK1和POSTN作为结直肠癌的关键预后基因，并揭示了它们与肿瘤浸润免疫细胞的关联。 | 研究主要基于TCGA数据库和公共数据集，未来需通过更多临床样本验证这些生物标志物的预后价值。 | 筛选结直肠癌中的有价值预后生物标志物，并探讨其与肿瘤免疫浸润的关系。 | 结直肠癌（CRC）中的免疫细胞和基质细胞及其相关基因。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | ESTIMATE算法, WGCNA, 单因素COX回归分析, scRNA-seq, TIMER, CIBERSORT | NA | 基因表达数据 | 使用了TCGA数据库中的CRC样本，具体数量未在摘要中明确。 |
| 5055 | 2024-08-05 |
A comprehensive single-cell map of T cell exhaustion-associated immune environments in human breast cancer
2023-01-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-35238-w
PMID:36609566
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research paper | 本研究系统地研究了人类乳腺癌中疲惫T细胞相关的免疫环境 | 通过单细胞转录组学和成像质谱细胞术的结合，揭示了乳腺癌中有无疲惫T细胞存在的免疫环境之间的基本差异 | 研究主要集中于乳腺癌的腔型亚型，可能不适用于所有乳腺癌类型 | 深入了解乳腺癌中疲惫T细胞的免疫环境 | 人类乳腺肿瘤样本中疲惫和非疲惫T细胞的免疫环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学，成像质谱细胞术 | NA | 样本 | 研究中涉及了在人类乳腺癌中多种免疫环境的单细胞样本 |
| 5056 | 2024-08-08 |
Enhanced angiogenic properties of umbilical cord blood primed by OP9 stromal cells ameliorates neurological deficits in cerebral infarction mouse model
2023-01-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-27424-7
PMID:36609640
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研究论文 | 研究探讨了OP9基质细胞预处理的脐带血在脑梗死小鼠模型中的血管生成特性及其对神经功能缺陷的影响 | 开发了一种快速且可行的方法，通过使用OP9增强脐带血的M2型、组织保护和促血管生成特性 | NA | 研究OP9预处理的脐带血在脑梗死模型中的血管生成特性和对神经功能缺陷的影响 | 脐带血与OP9基质细胞的共培养及其在脑梗死小鼠模型中的应用 | NA | 脑梗死 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 细胞 | 小鼠模型 |
| 5057 | 2024-08-05 |
Macrophage response mediated by extracellular matrix: recent progress
2023-01-05, Biomedical materials (Bristol, England)
DOI:10.1088/1748-605X/aca946
PMID:36595269
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研究论文 | 本文探讨了ECM支架介导的巨噬细胞反应在组织再生中的作用 | 使用单细胞测序技术识别参与宿主对生物材料反应的不同巨噬细胞表型 | 传统的M1/M2命名法存在局限，尚未形成统一的标准 | 研究ECM支架如何与巨噬细胞相互作用以影响组织再生 | 探讨影响组织再生的高度异质性和可塑性巨噬细胞亚群 | 再生医学 | 组织缺损 | 单细胞测序 | NA | 文献综述 | NA |
| 5058 | 2024-08-05 |
Transcription factors: key regulatory targets of vascular smooth muscle cell in atherosclerosis
2023-01-05, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-022-00586-2
PMID:36604627
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综述 | 这篇文章重点讨论了转录因子在动脉粥样硬化中作为血管平滑肌细胞的关键调控靶点的作用 | 首次系统性地评估了转录因子如何通过多种保守的顺式调控元件和转录因子之间的复杂相互作用调节VSMC基因 | 对VSMCs的理解仍在不断发展，可能需要更多实验数据支持 | 探讨转录因子在血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化过程中的调控作用 | 血管平滑肌细胞及其与转录因子的相互作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 体内单细胞测序技术与CreERT2-loxP系统 | NA | NA | NA |
| 5059 | 2024-08-08 |
Single-cell-led drug repurposing for Alzheimer's disease
2023-01-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-27420-x
PMID:36604493
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研究论文 | 本文介绍了一种基于单细胞的系统生物学流程，用于识别阿尔茨海默病的药物再利用候选物 | 利用单细胞RNA测序数据、全基因组关联研究结果和多种基因注释资源，构建了多细胞的阿尔茨海默病分子网络，以获得细胞特异性的疾病病理生理学见解 | NA | 旨在通过单细胞技术识别阿尔茨海默病的潜在药物再利用候选物 | 阿尔茨海默病患者的脑组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 分子网络 | 基因组数据 | NA |
| 5060 | 2024-08-08 |
A single-cell transcriptome atlas of glial diversity in the human hippocampus across the postnatal lifespan
2023-Jan-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.12.007
PMID:36608676
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |