单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
4981 2024-08-08
Fecal microbiota transplantation from young mice rejuvenates aged hematopoietic stem cells by suppressing inflammation
2023-04-06, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过将年轻小鼠的粪便微生物移植到老年小鼠中,观察到老年小鼠的淋巴分化增加和髓系分化减少,同时增强了老年造血干细胞的短期和长期造血重建能力 首次提供了直接证据,表明肠道微生物群对衰老造血的直接影响,并通过单细胞RNA测序揭示了其机制 NA 探讨肠道微生物群在造血干细胞衰老中的作用及其机制 老年小鼠的造血干细胞 NA NA 粪便微生物移植 (FMT), 单细胞RNA测序 NA 微生物组, 代谢组 年轻小鼠和老年小鼠
4982 2024-08-05
Targeting Microglial Metabolic Rewiring Synergizes with Immune-Checkpoint Blockade Therapy for Glioblastoma
2023-04-03, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 本研究揭示了微胶质细胞代谢重塑如何与免疫检查点抑制治疗协同作用用于治疗胶质母细胞瘤。 揭示了NR4A2和SQLE在微胶质细胞中的作用,以及它们在改善免疫检查点抑制疗法效能中的新颖机制。 本研究只是在小鼠模型中进行,临床应用的效果尚未进行验证。 探讨微胶质细胞代谢重塑如何影响胶质母细胞瘤的免疫治疗效果。 主要研究微胶质细胞在胶质母细胞瘤中的功能与代谢变化。 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞测序 NA NA NA
4983 2024-08-05
Temporal and spatial stability of the EM/PM molecular subtypes in adult diffuse glioma
2023-Apr, Frontiers of medicine IF:3.9Q2
研究论文 这篇文章探讨了成人弥漫性胶质瘤中EM和PM分子亚型的时间和空间稳定性 提出了一种独立于组织学亚型和等级的EM/PM分类方案,揭示了胶质瘤的发育程序与亚型特异性脆弱性之间的关系 未能识别出与遗传改变相关的特定脆弱性 研究成人胶质瘤中分子亚型的稳定性及其与神经发育的关系 使用多种样本(包括bulk样本、配对原发与复发样本等)来验证EM和PM亚型的稳定性 数字病理学 NA 单细胞RNA-seq NA 样本 多个样本,包括配对样本和单细胞样本
4984 2024-08-08
MARVEL: an integrated alternative splicing analysis platform for single-cell RNA sequencing data
2023-03-21, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 介绍了一个名为MARVEL的综合R包,用于单细胞RNA测序数据的剪接分析 MARVEL是首个适用于板式和液滴式方法生成RNA测序数据的单细胞剪接分析工具 NA 开发和验证一个用于单细胞剪接分析的综合工具 单细胞RNA测序数据中的选择性剪接 生物信息学 NA RNA测序 NA RNA测序数据 多个公开可用的数据集,涵盖多种细胞类型
4985 2024-08-08
Single-cell RNA sequencing reveals gonadal dynamic changes during sex differentiation in hermaphroditic protogynous orange-spotted grouper ( Epinephelus coioides)
2023-03-18, Zoological research IF:4.0Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
4986 2024-08-08
Phagocytosis of Glioma Cells Enhances the Immunosuppressive Phenotype of Bone Marrow-Derived Macrophages
2023-03-02, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和全外显子测序数据,研究了胶质母细胞瘤组织中的肿瘤相关巨噬细胞(TAM),并发现了一种同时表达巨噬细胞和肿瘤特征的TAM亚型,即双阳性TAM 首次揭示了骨髓来源的巨噬细胞通过吞噬胶质瘤细胞形成具有增强免疫抑制表型的双阳性TAM,这一发现有助于理解TAM介导的免疫抑制过程 NA 探讨肿瘤相关巨噬细胞如何转变为免疫抑制表型及其对肿瘤微环境的影响 胶质母细胞瘤组织中的肿瘤相关巨噬细胞 数字病理学 脑瘤 单细胞RNA测序 NA 基因组数据 NA
4987 2024-08-05
scRNA-seq analysis reveals toxicity mechanisms in shrimp hemocytes subjected to nitrite stress
2023-Mar, Chemosphere IF:8.1Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序分析了在亚硝酸盐压力下虾血细胞的毒性机制 识别了9个血细胞群体中394个特定的亚硝酸盐应答基因,揭示了血细胞亚群对亚硝酸盐的响应异质性 未提供对亚硝酸盐暴露下虾血细胞毒性机制的详细和全面的分析 探讨亚硝酸盐对虾血细胞的毒性效应及其机制 对虾血细胞在亚硝酸盐暴露下的反应进行研究 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 细胞 24000个虾血细胞
4988 2024-08-05
Lineage tracing reveals fate bias and transcriptional memory in human B cells
2023-03, Life science alliance IF:3.3Q1
研究论文 这篇文章结合了单细胞转录组和谱系追踪以理解人类B细胞的命运选择 研究揭示了人类B细胞在分化过程中的命运偏向和转录记忆 该研究主要集中于体外分化,未完全模拟体内环境 探讨人类B细胞的分化过程及其命运选择机制 人类B细胞及其克隆 数字病理学 NA 单细胞转录组学 NA 基因序列 IgM+ B细胞及人类骨髓中的浆细胞
4989 2024-08-08
Heterogeneity of Islet Cells during Embryogenesis and Differentiation
2023-03, Diabetes & metabolism journal IF:6.8Q1
综述 本文综述了利用单细胞RNA测序技术研究胚胎发育和分化过程中胰岛细胞异质性的进展,并探讨了其在糖尿病再生医学中的应用前景 利用单细胞RNA测序技术揭示了胰岛素产生细胞的详细转录组,并推断了细胞转换过程中的发育轨迹和基因调控网络 NA 探讨胰岛细胞在胚胎发育和分化过程中的异质性,以及其在糖尿病再生医学中的应用潜力 胰岛细胞在胚胎发育和分化过程中的异质性 干细胞研究 糖尿病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA
4990 2024-08-08
CD161 Characterizes an Inflamed Subset of Cytotoxic T Lymphocytes Associated with Prolonged Survival in Human Papillomavirus-Driven Oropharyngeal Cancer
2023-03-01, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 研究探讨了人乳头瘤病毒(HPV)驱动型口咽癌中细胞毒性T淋巴细胞(CTL)的异质性及其与预后的关系 首次鉴定了CD161作为HPV阳性口咽癌中CTL亚群的潜在标志物,并揭示了其与免疫检查点阻断疗法的协同作用 研究结果需要在更多独立队列中进一步验证 探究HPV驱动型口咽癌中CTL的表型、功能及其与预后的关系 HPV驱动型口咽癌中的细胞毒性T淋巴细胞 免疫学 口咽癌 单细胞RNA测序、流式细胞术、药理学抑制和免疫荧光染色 NA 细胞 两个独立队列的数据
4991 2024-08-08
Highly efficient generation of blastocyst-like structures from spliceosomes-repressed mouse totipotent blastomere-like cells
2023-03, Science China. Life sciences
研究论文 本研究展示了通过剪接体抑制诱导的全能性类似细胞(TBLCs)高效生成类囊胚结构的能力 首次证明了剪接体抑制诱导的TBLCs能够以高效率形成类囊胚结构,并能从单个TBLC开始生成类囊胚 研究主要集中在体外实验,尚未完全验证这些类囊胚结构在体内环境中的发育潜能 探索和优化从全能性类似细胞生成类囊胚结构的方法,以用于早期小鼠胚胎发育的研究 剪接体抑制诱导的全能性类似细胞(TBLCs)及其生成的类囊胚结构 发育生物学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及多个微孔中的TBLCs
4992 2024-08-08
Transcriptional and mutational signatures of the Drosophila ageing germline
2023-03, Nature ecology & evolution IF:13.9Q1
研究论文 研究探讨了果蝇衰老生殖细胞的转录和突变特征 发现老年果蝇的早期生殖细胞与年轻果蝇在进入精子发生时具有相似的突变负荷,但老年果蝇在精子发生过程中清除突变的能力较弱,且突变可能在精子发生过程中增加 NA 探索衰老生殖细胞的转录和突变特征 年轻和老年雄性果蝇的睾丸 生物学 NA 单细胞RNA测序,基因组测序(DNA测序) NA 基因表达数据,突变数据 年轻和老年雄性果蝇的睾丸及体细胞
4993 2024-08-05
Hyperprogression of cutaneous T cell lymphoma after anti-PD-1 treatment
2023-02-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了在抗PD-1治疗后皮肤T细胞淋巴瘤患者的超进展现象 本研究提供了PD-1作为肿瘤抑制因子在恶性T细胞中的作用的新证据 样本仅来自单个患者,缺乏大规模临床验证 揭示抗PD-1治疗导致T细胞恶性肿瘤超进展的机制 来自一名晚期皮肤T细胞淋巴瘤患者的原发恶性T细胞 数字病理学 皮肤癌 单细胞RNA测序、全基因组测序、全外显子测序 NA 基因组数据 1名患者的恶性T细胞
4994 2024-08-08
Skin programming of inflammatory responses to Staphylococcus aureus is compartmentalized according to epidermal keratinocyte differentiation status
2023-02-22, The British journal of dermatology
研究论文 本文探讨了表皮角质形成细胞分化状态对金黄色葡萄球菌炎症反应的皮肤编程的影响 首次详细研究了角质形成细胞分化状态与皮肤微生物群之间的相互作用,并探讨了这些相互作用如何影响抗菌反应 研究主要集中在体外模型上,可能与体内实际情况存在差异 验证皮肤微生物群是否参与调节角质形成细胞分化并影响抗菌反应 表皮模型在共生菌(表皮葡萄球菌)和病原菌(金黄色葡萄球菌)挑战下的反应 NA 皮肤疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 6391个角质形成细胞,来自对照组(2044个细胞)、表皮葡萄球菌挑战组(2028个细胞)和金黄色葡萄球菌挑战组(2319个细胞)
4995 2024-08-08
Single-cell transcriptome analysis identifies Versican(+) myofibroblast as a hallmark for thoracic aortic aneurysm marked by activation of PI3K-AKT signaling pathway
2023-02-05, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,识别出Versican阳性肌成纤维细胞作为胸主动脉瘤的标志,并发现PI3K-AKT信号通路的激活与此相关 首次通过单细胞RNA测序技术识别出Versican阳性肌成纤维细胞作为胸主动脉瘤的典型细胞标志,并揭示了PI3K-AKT信号通路的激活在其中的作用 研究样本量相对较小,可能需要进一步扩大样本以验证结果的普遍性 探究胸主动脉瘤的分子机制,并寻找新的预防和治疗方法 胸主动脉瘤的细胞类型及其分子机制 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 共使用了3个对照组和8个胸主动脉瘤样本,涉及48,128个胸主动脉细胞
4996 2024-08-05
Robust single-cell matching and multimodal analysis using shared and distinct features
2023-02, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为MARIO的细胞匹配算法,用于多模态数据分析 该算法同时考虑了共享特征和独特特征,能够避免亚优匹配 该研究中没有具体提及算法在其他细胞类型匹配上的表现 旨在提高单细胞数据在多种实验来源下的对齐能力 主要研究对象为单细胞蛋白质组和多模态方法的数据 数字病理 COVID-19 单细胞蛋白质组学 NA 多模态数据,包括空间技术 通过对COVID-19肺部尸检的组织巨噬细胞和支气管肺泡灌洗液中恢复的巨噬细胞进行匹配
4997 2024-08-05
SP1 impacts the primordial to primary follicle transition by regulating cholesterol metabolism in granulosa cells
2023-02, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究探讨了转录因子SP1在卵巢原始到初级卵泡转变中的作用 该研究首次揭示了SP1通过调控胆固醇代谢在卵细胞中的重要性 研究主要集中在小鼠模型上,可能无法完全代表其他物种的生物学机制 探索SP1在调控卵巢原始到初级卵泡转变中的作用 主要研究卵巢中颗粒细胞的胆固醇代谢和原始卵泡转变 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因组数据 研究使用了小鼠样本
4998 2024-08-05
Nupr1 Negatively Regulates Endothelial to Hematopoietic Transition in the Aorta-Gonad-Mesonephros Region
2023-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了Nupr1作为内皮到造血转变过程的负调节因子 首次识别出Nupr1为EHT过程的负调节因子 研究中未探讨Nupr1在其他组织或不同发育阶段的作用 探讨Nupr1在内皮到造血转变中的作用 小鼠胚胎中的内皮细胞 数字病理学 NA 单细胞转录组学 NA NA 涉及中期妊娠小鼠胚胎的内皮细胞
4999 2024-08-08
The clinical application of 68Ga-PSMA PET/CT and regulating mechanism of PSMA expression in patients with brain metastases of lung cancer
2023-Feb, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究探讨了68Ga-PSMA PET/CT在肺癌脑转移患者中的临床应用及其PSMA表达调控机制 首次报道了68Ga-PSMA PET/CT在肺癌脑转移患者中的应用及PSMA表达的调控机制 研究样本量较小,仅涉及七名患者 评估68Ga-PSMA PET/CT在肺癌脑转移中的应用及探索PSMA表达的调控机制 肺癌脑转移患者及其PSMA表达 数字病理学 肺癌 68Ga-PSMA PET/CT, 免疫组织化学染色, 单细胞RNA测序 NA 图像, 基因表达数据 七名接受手术治疗的肺癌脑转移患者
5000 2024-08-08
Correction: Single-cell RNA sequencing of human breast tumour-infiltrating immune cells reveals a γδ T-cell subtype associated with good clinical outcome
2023-Feb, Life science alliance IF:3.3Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
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