单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5355 篇文献，本页显示第 4901 - 4920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4901 | 2024-08-08 |
Comparing the adult and pre-pubertal testis: Metabolic transitions and the change in the spermatogonial stem cell metabolic microenvironment
2023-09, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13397
PMID:36690000
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综述 | 本文综述了生精干细胞在维持和分化过程中的代谢需求，并强调了Sertoli细胞和干细胞微环境成熟对生精干细胞代谢需求在发育过程中的潜在影响 | 提出了生精干细胞成熟的新定义，并根据代谢变化对其进行了修正 | NA | 深入理解生精干细胞的代谢需求及其调控机制，以改善其在实验室中的培养 | 生精干细胞的代谢需求及其在发育过程中的变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 4902 | 2024-08-08 |
Growth Hormone Promotes Oocyte Maturation In Vitro by Protecting Mitochondrial Function and Reducing Apoptosis
2023-07, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-022-01147-y
PMID:36694082
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研究论文 | 本研究探讨了生长激素（GH）在体外成熟（IVM）中对卵母细胞成熟的影响及其机制 | 首次详细阐述了GH通过保护线粒体功能和减少细胞凋亡来促进卵母细胞体外成熟的具体机制 | NA | 研究GH对卵母细胞体外成熟的影响及其机制 | 卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | GH组和对照组的卵母细胞 |
| 4903 | 2024-08-05 |
Metabolic heterogeneity in early-stage lung adenocarcinoma revealed by RNA-seq and scRNA-seq
2023-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-023-03082-z
PMID:36692643
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研究论文 | 本研究揭示了早期肺腺癌中的代谢异质性 | 通过RNA-seq和单细胞RNA-seq识别了代谢相关的亚型，为肺腺癌的预后和治疗提供了潜在生物标志物 | 研究主要依赖于TCGA和GEO的数据，可能存在数据源的局限性 | 探讨肺腺癌的代谢重编程及其对预后的影响 | 研究对象为肺腺癌样本，尤其关注其代谢相关的亚型 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因组数据 | TCGA数据集中肺腺癌样本的数量未具体说明 |
| 4904 | 2024-08-08 |
Bioinformatic analysis of single-cell RNA sequencing dataset dissects cellular heterogeneity of triple-negative breast cancer in transcriptional profile, splicing event and crosstalk network
2023-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-023-03083-y
PMID:36692641
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，全面探讨了三阴性乳腺癌（TNBC）不同亚型上皮细胞的转录组特征、可变剪接事件及上皮与非上皮细胞间的相互作用 | 发现管腔前体亚型表现出最复杂的基因调控网络和剪接事件，并揭示了hnRNPs在管腔前体亚型中对可变剪接事件的负调控作用，以及NOTCH4在TNBC中的关键作用和潜在治疗靶点 | NA | 深入理解三阴性乳腺癌的细胞异质性及其调控网络 | 三阴性乳腺癌（TNBC）的细胞异质性及其调控网络 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 4905 | 2024-08-05 |
Identification of a tumour immune barrier in the HCC microenvironment that determines the efficacy of immunotherapy
2023-04, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2023.01.011
PMID:36708811
|
研究论文 | 本文探讨了肝细胞癌（HCC）微环境中肿瘤免疫屏障的特定结构及其对免疫治疗效果的影响 | 中国首次识别了肿瘤免疫屏障（TIB）结构及其在肿瘤微环境中的作用，揭示其限制免疫细胞浸润的机制 | 研究主要集中在TME中的特定结构，可能未涵盖所有影响免疫疗效的因素 | 研究肝细胞癌（HCC）中肿瘤微环境结构对免疫治疗效果的影响 | 肝细胞癌患者接受抗PD-1治疗的特定肿瘤微环境 | 数字病理 | 肝癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、多重免疫荧光 | NA | NA | NA |
| 4906 | 2024-08-05 |
Stromal regulation of the intestinal barrier
2023-04, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2023.01.006
PMID:36708806
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review | 本文回顾了间充质细胞在维持肠道屏障中的新兴作用 | 探讨了间充质细胞在肠道发育和稳态中的关键组织者角色 | 对某些机制的理解仍然不完整 | 研究肠道屏障的发育和维持机制 | 间充质细胞及其在肠道中的作用 | NA | 肠道炎症疾病 | 谱系追踪、Cre基因缺失、单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 4907 | 2024-08-08 |
Complexities of mammalian transcriptome revealed by targeted RNA enrichment techniques
2023-04, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2022.12.004
PMID:36681580
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综述 | 本文综述了靶向RNA富集技术在揭示哺乳动物转录组复杂性方面的应用和影响 | 展示了大量未被发现的转录本和复杂的转录模式，揭示了细胞类型特异性转录本的存在 | NA | 探讨靶向RNA富集技术在发现新转录本和理解人类基因组及转录组复杂性方面的应用 | 人类转录组和基因组 | 基因组学 | NA | 靶向RNA富集技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 4908 | 2024-08-08 |
Pathological consequences of DNA damage in the kidney
2023-04, Nature reviews. Nephrology
DOI:10.1038/s41581-022-00671-z
PMID:36702905
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研究论文 | 本文探讨了肾脏中DNA损伤的病理后果及其对肾脏疾病的影响 | 报道了肾脏纤毛病与DNA损伤反应之间的意外联系，并利用肾脏类器官和单细胞RNA测序技术深入研究了特定肾脏细胞类型对DNA损伤的反应 | NA | 研究DNA损伤在肾脏中的病理后果及其对肾脏疾病的影响 | 肾脏中的DNA损伤及其对急性与慢性肾脏损伤、肾细胞癌的影响 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 4909 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of pyroptosis-related gene signatures for glioblastoma immune microenvironment and target therapy
2023-Mar, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13376
PMID:36681858
|
研究论文 | 本研究分析了与焦亡相关的基因特征在胶质母细胞瘤免疫微环境中的作用及靶向治疗的潜力 | 首次探讨了焦亡与胶质母细胞瘤亚型及免疫环境的关系，并利用机器学习算法筛选出潜在治疗化合物 | 研究仅基于73个胶质母细胞瘤样本，样本量相对较小 | 探讨焦亡在胶质母细胞瘤进展与免疫反应中的角色 | 73个胶质母细胞瘤样本，具体分类为不同亚型 | 数字病理 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq，机器学习算法 | 无 | 样本数据 | 73个胶质母细胞瘤样本 |
| 4910 | 2024-08-08 |
The power of combined spatial transcriptomics and genome wide association studies (GWAS) approaches to heritable prostate cancer
2023-Mar, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1007/s12079-023-00724-3
PMID:36692634
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4911 | 2024-08-08 |
Peripheral blood mononuclear cell tissue factor (F3 gene) transcript levels and circulating extracellular vesicles are elevated in severe coronavirus 2019 (COVID-19) disease
2023-03, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
IF:5.5Q1
DOI:10.1016/j.jtha.2022.11.033
PMID:36696180
|
研究论文 | 研究探讨了严重COVID-19患者中外周血单个核细胞的组织因子（F3基因）转录水平及循环中的细胞外囊泡的升高情况 | 首次揭示了SARS-CoV-2感染导致系统性组织因子（F3）转录水平升高及循环细胞外囊泡的增加，这些可能与疾病相关的凝血、血栓形成及相关的死亡率有关 | NA | 探究COVID-19疾病中过度凝血的机制 | COVID-19患者的血液样本 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 独立队列的COVID-19患者 |
| 4912 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals homogeneous transcriptome patterns and low variance in a suspension CHO-K1 and an adherent HEK293FT cell line in culture conditions
2023-Feb-20, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2023.01.006
PMID:36708997
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研究论文 | 本研究使用全长覆盖的单细胞RNA测序技术，比较了悬浮CHO-K1和贴壁HEK293FT细胞在标准化和均质培养条件下的转录组多样性 | 首次详细分析了在标准化培养条件下，悬浮CHO-K1和贴壁HEK293FT细胞的单细胞转录组模式和变异 | 研究主要集中在细胞周期对转录组变异的影响，未深入探讨其他潜在的环境因素 | 探究重组哺乳动物宿主细胞系在工业生产治疗性蛋白质中的转录组多样性和变异机制 | 悬浮CHO-K1和贴壁HEK293FT细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 四个96孔板的CHO-K1单细胞 |
| 4913 | 2024-08-08 |
The Transcriptional Response to Lung-Targeting Lipid Nanoparticles in Vivo
2023-02-08, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.2c04479
PMID:36701517
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研究论文 | 研究了带电脂质纳米粒子（LNPs）在肺部递送mRNA时的转录反应 | 首次详细研究了带电LNPs在肺部递送mRNA时的生物学反应，并使用单细胞RNA测序技术进行了转录组分析 | 研究仅限于特定的137种LNPs和19种细胞类型，可能无法完全代表所有LNPs的反应 | 评估带电LNPs在肺部递送mRNA时的细胞反应差异 | 137种LNPs和19种细胞类型 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 835条潜在通路中，27条在肺部上调，其中19条与RNA或蛋白质代谢相关 |
| 4914 | 2024-08-05 |
Endoderm-derived islet1-expressing cells differentiate into endothelial cells to function as the vascular HSPC niche in zebrafish
2023-02-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.12.013
PMID:36693371
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研究论文 | 本研究揭示了内源性islet1表达细胞如何分化为内皮细胞并在斑马鱼中作为血管HSPC生态位的功能 | 发现内源性islet1表达细胞是 venous 内皮细胞的前体，从而揭示了内皮细胞的特殊化与其来源之间的关系 | 研究仅局限于斑马鱼胚胎，尚未验证在其他物种中的普适性 | 探讨内皮细胞如何获得其特定功能及其在血液干细胞生态位中的角色 | 以斑马鱼胚胎中的内源性islet1表达细胞为研究对象 | 数字病理学 | NA | 活体成像、单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 斑马鱼胚胎样本数不明确 |
| 4915 | 2024-08-08 |
BLTSA: pseudotime prediction for single cells by branched local tangent space alignment
2023-02-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad054
PMID:36692140
|
研究论文 | 本文提出了一种名为BLTSA的方法，用于推断多分支轨迹中单细胞的伪时间 | BLTSA方法通过识别轨迹中的尖端和分支细胞，并基于局部欧几里得邻域确定局部坐标，最后通过对齐局部坐标来获得所有单细胞的全局坐标，从而在处理单细胞数据的高噪声水平方面具有优势 | NA | 研究基于基因表达模式的细胞分化轨迹中的细胞伪时间计算推断方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞动态过程 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四个模拟数据集和五个真实数据集 |
| 4916 | 2024-08-05 |
Roadmap of the Early Events of In Vivo Somatic Cell Reprogramming
2023-02, Cellular reprogramming
IF:1.2Q4
DOI:10.1089/cell.2022.0160
PMID:36695734
|
研究论文 | 本研究揭示了小鼠胰腺在部分重编程过程中转录动态的早期事件 | 研究发现胰腺中部分重编程后的转录组特征在多种组织中存在保守途径，指向早期重编程、再生和年轻化的关键过程 | NA | 探讨体内体细胞重编程的早期事件及其转录动态 | 小鼠胰腺及其他组织在OSKM诱导下的转录组特征 | 生物医学 | NA | 单细胞转录组学和成像技术 | NA | 转录组数据 | 小鼠胰腺样本 |
| 4917 | 2024-08-08 |
Increased CYR61 expression activates CCND1/c-Myc pathway to promote nasal epithelial cells proliferation in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2023-02, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109235
PMID:36681101
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研究论文 | 本研究探讨了CYR61、CCND1和c-Myc在慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）中的表达及其作用 | 发现CYR61通过上调CCND1和c-Myc水平促进鼻上皮细胞增殖，并能与ITGA2相互作用 | NA | 探索CYR61、CCND1和c-Myc在CRSwNP中的表达及其对鼻上皮细胞增殖的影响 | CYR61、CCND1、c-Myc以及鼻上皮细胞 | NA | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组织化学、实时PCR、双标记免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 鼻组织样本及人鼻上皮细胞（HNEC） |
| 4918 | 2024-08-05 |
Next-Generation Morphometry for pathomics-data mining in histopathology
2023-01-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36173-0
PMID:36709324
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研究论文 | 本文开发了一个用于历史病理学的形态度量大规模提取框架，利用深度学习进行语义分割及定量特征提取 | 引入了单结构形态度量分析，结合单细胞转录组学技术，揭示了不同的肾小球群体和在疾病进展中的形态表型 | 使用的样本主要集中在肾脏组织，可能不适用于其他器官的病理分析 | 旨在开发用于大规模历史病理学数据挖掘的下一代形态度量概念 | 分析超过1000例肾脏活检和肾切除术样本 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | NA | 组织病理切片 | 超过1000例肾脏活检和肾切除术样本 |
| 4919 | 2024-08-08 |
NF-YAl drives EMT in Claudinlow tumours
2023-01-28, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-05591-9
PMID:36707502
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研究论文 | 本文探讨了NF-YAl在Claudin低表达肿瘤中驱动上皮-间质转化（EMT）的作用 | 定义并验证了与NF-YAr相关的158个基因的预测签名，并确定了与NF-YA异构体相关的特定剪接因子 | NA | 探索NF-YAl和NF-YAs在乳腺癌和胃癌中的作用及其对EMT的影响 | NF-YAl和NF-YAs在乳腺癌（BRCA）和胃癌（STAD）中的表达及其对肿瘤迁移和转移的影响 | 数字病理学 | 乳腺癌, 胃癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及两个Claudin乳腺癌细胞系SUM159PT和BT549的克隆 |
| 4920 | 2024-08-08 |
Improved downstream functional analysis of single-cell RNA-sequence data using DGAN
2023-01-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-28952-y
PMID:36709340
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DGAN的深度生成自编码器网络，用于改进单细胞RNA测序数据的下游功能分析 | DGAN能够有效填补单细胞RNA测序数据中的缺失值，提高下游功能分析的准确性 | NA | 开发一种高效且稳健的单细胞RNA测序数据插补方法，以改善下游功能分析结果 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度生成自编码器网络 | 基因表达矩阵 | 五个公开可用的单细胞RNA测序数据集 |