单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 5350 篇文献，本页显示第 4901 - 4920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4901 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics analysis of neoadjuvant cabozantinib and nivolumab in advanced hepatocellular carcinoma identifies independent mechanisms of resistance and recurrence
2023-Jan-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.10.523481
PMID:36712023
|
研究论文 | 这篇文章探讨了在先进的肝细胞癌患者中，新辅助cabozantinib和nivolumab的空间转录组学分析 | 该研究揭示了肝细胞癌肿瘤微环境中的免疫细胞和癌相关成纤维细胞的丰富程度，以及独特的分子和细胞特征，提供了增强系统治疗反应的新靶点 | 研究只涉及了15名患者，样本量较小，且只有5名患者表现出病理反应 | 研究现代系统治疗在肝细胞癌中的反应机制 | 在临床试验中接受新辅助cabozantinib和nivolumab治疗的肝细胞癌患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间转录组学 | NA | 肿瘤样本 | 15名肝细胞癌患者的肿瘤切除标本 | NA | NA | NA | NA |
| 4902 | 2024-08-05 |
Deconfounded Dimension Reduction via Partial Embeddings
2023-Jan-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.10.523448
PMID:36711940
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为部分嵌入（PARE）的框架，可以从基于距离的降维方法中去除混杂因素 | 提出的PARE框架允许对任何降维方法进行混杂因素的去除，扩展了现有降维工具的应用范围 | 具体的限制在摘要中没有明显提及 | 研究旨在提高降维技术在生物模式识别中的效果，减少混杂因素的影响 | 研究对象包括基因组和神经影像数据 | 计算机视觉 | NA | NA | NA | 高维数据 | 单细胞测序数据和神经影像测量数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4903 | 2024-08-08 |
Persistence of foetal testicular features in patients with defective androgen signalling
2023-Jan-10, European journal of endocrinology
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/ejendo/lvad007
PMID:36721956
|
研究论文 | 研究探讨了46,XY个体中由于雄激素信号缺陷导致的性腺组织发育异常，特别是在完全雄激素不敏感综合征（CAIS）患者中的表现 | 发现CAIS患者的性腺组织中HSD17B3在Sertoli细胞中表达，而在Leydig细胞中不表达，这一模式与典型成人睾丸不同，更类似于胎儿期小鼠睾丸 | 研究样本量较小，仅包括五名46,XY个体，可能影响结果的普遍性 | 探究雄激素信号缺陷对46,XY个体性腺发育的影响 | 46,XY个体中由于雄激素合成或作用缺陷导致的性腺组织发育异常 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织切片 | 包括四名CAIS患者、一名CYP17A1缺乏症患者和一名对照 | NA | NA | NA | NA |
| 4904 | 2024-08-05 |
Gene Expression Changes in Cultured Reactive Rat Astrocyte Models and Comparison to Device-Associated Effects in the Brain
2023-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.06.522870
PMID:36712012
|
研究论文 | 研究了对植入微电极阵列反应的反应性星形胶质细胞亚型及其基因表达变化 | 揭示了反应性星形胶质细胞与植入电极之间的基因表达重叠，提供了新型生物标志物的潜在信息 | 未明确指出研究的局限性 | 深入了解反应性星形胶质细胞对植入电极的反应亚型 | 两种反应性星形胶质细胞培养模型及其与大鼠运动皮层设备相关基因表达的比较 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种时间点的24小时、1周和6周大鼠组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4905 | 2024-08-05 |
Computational workflow and interactive analysis of single-cell expression profiling of islets generated by the Human Pancreas Analysis Program
2023-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.03.522578
PMID:36711819
|
研究论文 | 本文介绍了人类胰腺分析计划生成的胰岛单细胞表达谱的计算工作流程和交互式分析 | 提出了一种新的计算工作流程，用于分析由HPAP生成的人类胰腺高质量单细胞RNA-seq数据集 | 研究依赖于来自已故捐赠者的胰腺组织样本，可能无法全面反映活体胰腺的状况 | 了解糖尿病发生过程中的初始分子扰动，特别是胰岛功能障碍的分子病理机制 | 研究对象为67名人类捐赠者的胰腺胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 67名人类捐赠者的258,379个高质量细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4906 | 2024-08-05 |
Identification of the Hub Genes Involved in Stem Cell Treatment for Intervertebral Disc Degeneration: A Conjoint Analysis of Single-Cell and Machine Learning
2023, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2023/7055264
PMID:36733465
|
研究论文 | 本研究旨在识别与椎间盘退变(IDD)相关的新生物标志物 | 这是首次结合机器学习和单细胞测序数据的研究，发现了椎间盘退变的中心基因LAPTM5 | 本研究未提及样本量和样本来源的具体限制 | 研究的目的是寻找椎间盘退变的诊断生物标志物 | 研究对象为接受干细胞治疗的椎间盘退变样本 | 机器学习 | 脊柱退行性疾病 | 单细胞测序和机器学习 | 支持向量机和LASSO | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4907 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptional Changes in Hypothalamic Corticotropin-Releasing Factor-Expressing Neurons After Early-Life Adversity Inform Enduring Alterations in Vulnerabilities to Stress
2023-Jan, Biological psychiatry global open science
DOI:10.1016/j.bpsgos.2021.12.006
PMID:36712559
|
研究论文 | 这篇文章研究了早期生活逆境对下丘脑促肾上腺皮质激素释放因子(CRF)表达神经元的转录变化及其对压力脆弱性的长期影响 | 文章揭示了不同CRF细胞类型如何受到早期生活逆境的不同影响，导致压力脆弱性增加 | 暂未提到研究的具体局限性 | 探讨早期生活逆境如何影响神经内分泌和行为反应以改善心理健康 | 研究对象为发育中的雄性小鼠的CRF表达神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 发育中的雄性小鼠中CRF表达神经元的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4908 | 2024-08-05 |
MHA, an interactive website for scRNA-seq data of male genitourinary development and disease
2023-09, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13402
PMID:36710661
|
研究论文 | 本研究介绍了一个关于男性生殖系统的单细胞测序数据的互动网站MHA | MHA是第一个专注于男性生殖学和男性生殖的单细胞数据库网站，提供了独特的单细胞测序资源和可访问的工具 | 该研究依赖于已发表的研究数据，可能存在数据质量和完整性的问题 | 旨在为男性生殖系统的单细胞测序数据提供一个共享平台 | 男性特定组织和器官的单细胞测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 57个样本（人类和小鼠） | NA | NA | NA | NA |
| 4909 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics for profiling the tropism of viral vectors in tissues
2023-09, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01648-w
PMID:36702899
|
研究论文 | 该研究开发了一种超灵敏的空间转录组测序方法，用于在完整组织中分析病毒载体的细胞亚型嗜性 | 文章提出了一种结合水凝胶组织清洁、信号增强和多重标记的新方法USeqFISH，能够高通量、高清晰度地分析内源性和病毒RNA | 尚未提及具体的局限性 | 研究工程化腺相关病毒载体在哺乳动物组织中传导特性 | 研究六种系统腺相关病毒（AAV）在小鼠大脑不同区域的转导和细胞亚型嗜性 | 数字病理 | NA | USeqFISH | NA | RNA | 六种系统AAV在小鼠脑部的多个区域 | NA | NA | NA | NA |
| 4910 | 2024-08-08 |
Comparing the adult and pre-pubertal testis: Metabolic transitions and the change in the spermatogonial stem cell metabolic microenvironment
2023-09, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13397
PMID:36690000
|
综述 | 本文综述了生精干细胞在维持和分化过程中的代谢需求，并强调了Sertoli细胞和干细胞微环境成熟对生精干细胞代谢需求在发育过程中的潜在影响 | 提出了生精干细胞成熟的新定义，并根据代谢变化对其进行了修正 | NA | 深入理解生精干细胞的代谢需求及其调控机制，以改善其在实验室中的培养 | 生精干细胞的代谢需求及其在发育过程中的变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4911 | 2024-08-08 |
Growth Hormone Promotes Oocyte Maturation In Vitro by Protecting Mitochondrial Function and Reducing Apoptosis
2023-07, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-022-01147-y
PMID:36694082
|
研究论文 | 本研究探讨了生长激素（GH）在体外成熟（IVM）中对卵母细胞成熟的影响及其机制 | 首次详细阐述了GH通过保护线粒体功能和减少细胞凋亡来促进卵母细胞体外成熟的具体机制 | NA | 研究GH对卵母细胞体外成熟的影响及其机制 | 卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | GH组和对照组的卵母细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 4912 | 2024-08-05 |
Metabolic heterogeneity in early-stage lung adenocarcinoma revealed by RNA-seq and scRNA-seq
2023-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-023-03082-z
PMID:36692643
|
研究论文 | 本研究揭示了早期肺腺癌中的代谢异质性 | 通过RNA-seq和单细胞RNA-seq识别了代谢相关的亚型，为肺腺癌的预后和治疗提供了潜在生物标志物 | 研究主要依赖于TCGA和GEO的数据，可能存在数据源的局限性 | 探讨肺腺癌的代谢重编程及其对预后的影响 | 研究对象为肺腺癌样本，尤其关注其代谢相关的亚型 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因组数据 | TCGA数据集中肺腺癌样本的数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 4913 | 2024-08-08 |
Bioinformatic analysis of single-cell RNA sequencing dataset dissects cellular heterogeneity of triple-negative breast cancer in transcriptional profile, splicing event and crosstalk network
2023-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-023-03083-y
PMID:36692641
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，全面探讨了三阴性乳腺癌（TNBC）不同亚型上皮细胞的转录组特征、可变剪接事件及上皮与非上皮细胞间的相互作用 | 发现管腔前体亚型表现出最复杂的基因调控网络和剪接事件，并揭示了hnRNPs在管腔前体亚型中对可变剪接事件的负调控作用，以及NOTCH4在TNBC中的关键作用和潜在治疗靶点 | NA | 深入理解三阴性乳腺癌的细胞异质性及其调控网络 | 三阴性乳腺癌（TNBC）的细胞异质性及其调控网络 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 4914 | 2024-08-05 |
Identification of a tumour immune barrier in the HCC microenvironment that determines the efficacy of immunotherapy
2023-04, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2023.01.011
PMID:36708811
|
研究论文 | 本文探讨了肝细胞癌（HCC）微环境中肿瘤免疫屏障的特定结构及其对免疫治疗效果的影响 | 中国首次识别了肿瘤免疫屏障（TIB）结构及其在肿瘤微环境中的作用，揭示其限制免疫细胞浸润的机制 | 研究主要集中在TME中的特定结构，可能未涵盖所有影响免疫疗效的因素 | 研究肝细胞癌（HCC）中肿瘤微环境结构对免疫治疗效果的影响 | 肝细胞癌患者接受抗PD-1治疗的特定肿瘤微环境 | 数字病理 | 肝癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、多重免疫荧光 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4915 | 2024-08-05 |
Stromal regulation of the intestinal barrier
2023-04, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2023.01.006
PMID:36708806
|
review | 本文回顾了间充质细胞在维持肠道屏障中的新兴作用 | 探讨了间充质细胞在肠道发育和稳态中的关键组织者角色 | 对某些机制的理解仍然不完整 | 研究肠道屏障的发育和维持机制 | 间充质细胞及其在肠道中的作用 | NA | 肠道炎症疾病 | 谱系追踪、Cre基因缺失、单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4916 | 2024-08-08 |
Complexities of mammalian transcriptome revealed by targeted RNA enrichment techniques
2023-04, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2022.12.004
PMID:36681580
|
综述 | 本文综述了靶向RNA富集技术在揭示哺乳动物转录组复杂性方面的应用和影响 | 展示了大量未被发现的转录本和复杂的转录模式，揭示了细胞类型特异性转录本的存在 | NA | 探讨靶向RNA富集技术在发现新转录本和理解人类基因组及转录组复杂性方面的应用 | 人类转录组和基因组 | 基因组学 | NA | 靶向RNA富集技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4917 | 2024-08-08 |
Pathological consequences of DNA damage in the kidney
2023-04, Nature reviews. Nephrology
DOI:10.1038/s41581-022-00671-z
PMID:36702905
|
研究论文 | 本文探讨了肾脏中DNA损伤的病理后果及其对肾脏疾病的影响 | 报道了肾脏纤毛病与DNA损伤反应之间的意外联系，并利用肾脏类器官和单细胞RNA测序技术深入研究了特定肾脏细胞类型对DNA损伤的反应 | NA | 研究DNA损伤在肾脏中的病理后果及其对肾脏疾病的影响 | 肾脏中的DNA损伤及其对急性与慢性肾脏损伤、肾细胞癌的影响 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4918 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of pyroptosis-related gene signatures for glioblastoma immune microenvironment and target therapy
2023-Mar, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13376
PMID:36681858
|
研究论文 | 本研究分析了与焦亡相关的基因特征在胶质母细胞瘤免疫微环境中的作用及靶向治疗的潜力 | 首次探讨了焦亡与胶质母细胞瘤亚型及免疫环境的关系，并利用机器学习算法筛选出潜在治疗化合物 | 研究仅基于73个胶质母细胞瘤样本，样本量相对较小 | 探讨焦亡在胶质母细胞瘤进展与免疫反应中的角色 | 73个胶质母细胞瘤样本，具体分类为不同亚型 | 数字病理 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq，机器学习算法 | 无 | 样本数据 | 73个胶质母细胞瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 4919 | 2024-08-08 |
The power of combined spatial transcriptomics and genome wide association studies (GWAS) approaches to heritable prostate cancer
2023-Mar, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1007/s12079-023-00724-3
PMID:36692634
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4920 | 2024-08-08 |
Peripheral blood mononuclear cell tissue factor (F3 gene) transcript levels and circulating extracellular vesicles are elevated in severe coronavirus 2019 (COVID-19) disease
2023-03, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
IF:5.5Q1
DOI:10.1016/j.jtha.2022.11.033
PMID:36696180
|
研究论文 | 研究探讨了严重COVID-19患者中外周血单个核细胞的组织因子（F3基因）转录水平及循环中的细胞外囊泡的升高情况 | 首次揭示了SARS-CoV-2感染导致系统性组织因子（F3）转录水平升高及循环细胞外囊泡的增加，这些可能与疾病相关的凝血、血栓形成及相关的死亡率有关 | NA | 探究COVID-19疾病中过度凝血的机制 | COVID-19患者的血液样本 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 独立队列的COVID-19患者 | NA | NA | NA | NA |