单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5355 篇文献，本页显示第 4861 - 4880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4861 | 2024-08-05 |
Development and validation of a prognostic model based on a single-cell RNA-seq in Wilms tumor in children
2023-03, Journal of investigative medicine : the official publication of the American Federation for Clinical Research
IF:2.5Q3
DOI:10.1177/10815589221143739
PMID:36718830
|
研究论文 | 本文分析了儿童威尔姆斯肿瘤的不同细胞类型间的异质性，并建立了一个预后模型 | 基于单细胞RNA-seq数据构建了一个综合预后模型并识别了预后生物标志物 | 外部验证集的样本量和多样性可能影响模型的普适性 | 建立儿童威尔姆斯肿瘤的预后模型 | 儿童威尔姆斯肿瘤组织中的恶性肿瘤细胞 | 数字病理学 | 威尔姆斯肿瘤 | 单细胞RNA-seq | COX回归分析和LASSO回归 | 基因表达数据 | 215个恶性肿瘤细胞中筛选出的不同表达基因 |
| 4862 | 2024-08-05 |
Th17.1 cell driven sarcoidosis-like inflammation after anti-BCMA CAR T cells in multiple myeloma
2023-03, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-023-01824-0
PMID:36720972
|
research paper | 本研究展示了一例在多发性骨髓瘤中接受反BCMA CAR T细胞治疗后出现的肺部炎症的案例研究 | 提出了由Th17.1驱动的自身免疫机制作为该现象的生物学基础，并且通过多种影像学跟踪剂与FDG PET成像结合，能够区分免疫介导的变化和真正的疾病复发 | 研究基于单个病例，可能无法代表所有患者的情况 | 探讨抗BCMA CAR T细胞治疗后可能出现的肺部炎症及其诊断挑战 | 接受抗BCMA CAR T细胞治疗的多发性骨髓瘤患者 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单病例研究 |
| 4863 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-Seq reveals CVI-mAb-induced Lyve1+ M2-like macrophages reduce atherosclerotic plaque area in Apoe-/- mice
2023-Mar, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.109794
PMID:36736225
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研究论文 | 本研究揭示了CVI-mAb诱导的Lyve1+ M2样巨噬细胞在Apoe-/-小鼠中减少动脉粥样硬化斑块面积的作用 | 识别出在CVI-mAb治疗下的Apoe-/-小鼠中几乎独占的Lyve1+ M2样巨噬细胞亚群及其在脂质代谢中的特殊功能 | 对于其他巨噬细胞亚群的疗效仍未完全理解 | 研究不同巨噬细胞表型在动脉粥样硬化中的作用及其潜在的治疗益处 | Apoe-/-小鼠中的F4/80+巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了Apoe-/-小鼠的多个组别，包括普通饮食、高脂饮食及CVI-mAb治疗组 |
| 4864 | 2024-08-08 |
GPS2-mediated regulation of the adipocyte secretome modulates adipose tissue remodeling at the onset of diet-induced obesity
2023-03, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2023.101682
PMID:36731652
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研究论文 | 本研究探讨了GPS2在调节脂肪细胞分泌组中的作用，及其在饮食诱导肥胖早期阶段对脂肪组织重塑的影响 | 揭示了GPS2缺失导致脂肪细胞适应高脂饮食引起的代谢压力受损，并通过调节分泌因子影响脂肪组织微环境 | NA | 旨在更好地理解饮食诱导肥胖早期阶段脂肪组织扩张和适应的调控机制 | 脂肪细胞与基质细胞之间的交流 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、半定量蛋白质组学 | NA | RNA、蛋白质 | 野生型和脂肪细胞特异性GPS2敲除（GPS2-AKO）小鼠 |
| 4865 | 2024-08-08 |
A trypanosome-derived immunotherapeutics platform elicits potent high-affinity antibodies, negating the effects of the synthetic opioid fentanyl
2023-02-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112049
PMID:36719797
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研究论文 | 本文开发了一种源自非洲锥虫免疫原性表面外壳的免疫治疗平台，通过sortase标记的VSG-免疫原阵列（VAST），成功诱导了对低免疫原性分子芬太尼的特异性记忆B细胞和抗体 | 本文创新性地结合了VAST技术和基于单细胞RNA测序的计算方法，成功诱导了对低免疫原性分子的特异性抗体 | NA | 开发一种新的免疫治疗平台，以解决低免疫原性小分子在临床有效疫苗和抗体生产中的挑战 | 非洲锥虫的表面外壳、芬太尼分子、记忆B细胞和抗体 | NA | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 4866 | 2024-08-08 |
A program of successive gene expression in mouse one-cell embryos
2023-02-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112023
PMID:36729835
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研究论文 | 本文通过高分辨率单细胞RNA测序技术，研究了小鼠一细胞胚胎中胚胎基因激活（EGA）期间的基因表达程序 | 首次揭示了小鼠一细胞胚胎中胚胎基因表达程序（iEGA）的详细时间和特征，并发现c-Myc等转录因子在调控这一过程中的作用 | NA | 探究小鼠一细胞胚胎中胚胎基因激活（EGA）的时机和特征 | 小鼠一细胞胚胎中的基因表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 精确同步的小鼠一细胞胚胎 |
| 4867 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing and bulk RNA sequencing reveal a cell differentiation-related multigene panel to predict the prognosis and immunotherapy response of hepatocellular carcinoma
2023-02-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000002393
PMID:36723861
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4868 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the suppressive effect of PPP1R15A inhibitor Sephin1 in antitumor immunity
2023-Feb-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.105954
PMID:36718369
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了PPP1R15A抑制剂Sephin1在抗肿瘤免疫中的抑制作用 | 首次揭示了Sephin1通过调节整合应激反应（ISR）活性影响抗肿瘤免疫活动，并识别出特定TCR+巨噬细胞亚型在肿瘤中的关键作用 | NA | 探讨PPP1R15A抑制剂Sephin1在肿瘤发生中的作用及其对抗肿瘤免疫的影响 | 小鼠肿瘤模型中的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | C57BL/6小鼠肿瘤模型 |
| 4869 | 2024-08-08 |
scBGEDA: deep single-cell clustering analysis via a dual denoising autoencoder with bipartite graph ensemble clustering
2023-02-14, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad075
PMID:36734596
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scBGEDA的单细胞深度聚类模型，通过双去噪自编码器与二分图集成聚类来识别单细胞转录组中的特定细胞群体。 | scBGEDA模型通过双去噪自编码器网络将数据投影到压缩的低维空间，并结合二分图集成聚类算法，有效学习特征表示并利用图基共识函数探索细胞间关系，从而在单细胞RNA测序数据分析中表现优异。 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据的细胞类型聚类分析，提高细胞类型识别的准确性。 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型。 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 双去噪自编码器 | 转录组数据 | 20个来自不同测序平台的单细胞RNA测序数据集 |
| 4870 | 2024-08-05 |
Computational Prediction of the Phenotypic Effect of Flavonoids on Adiponectin Biosynthesis
2023-02-13, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.3c00033
PMID:36716271
|
研究论文 | 本文提出了一种机器学习模型来预测类黄酮相关植物化学物质对脂联素生物合成的影响 | 使用随机森林分类器建立了类黄酮相关植物化学物质与其生物活性之间的结构-活性关系 | 尚未明确提及具体的限制因素 | 研究旨在通过计算方法预测类黄酮对脂联素分泌的促进作用 | 研究对象为类黄酮相关植物化学物质 | 机器学习 | 代谢疾病 | 随机森林分类器，单细胞转录组学 | 随机森林 | 生物活性数据 | NA |
| 4871 | 2024-08-05 |
Generation and analysis of context-specific genome-scale metabolic models derived from single-cell RNA-Seq data
2023-02-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2217868120
PMID:36719923
|
研究论文 | 提出了一种从单细胞RNA测序数据生成细胞类型特异性基因组规模代谢模型的方法 | 创新性地开发了一种估计获得稳定模型所需的最小细胞数量的方法，并进行了不同RNA-Seq归一化方法对模型拓扑的影响评估 | 没有提供任何关于模型适用性的进一步验证或应用场景的信息 | 研究单细胞RNA测序和基因组规模代谢模型结合的方法 | 小鼠皮层神经元和肺癌肿瘤微环境中的细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-Seq | NA | 单细胞数据 | 202个单细胞群体的样本，来自19个人体器官 |
| 4872 | 2024-08-05 |
Evolutionary route of nasopharyngeal carcinoma metastasis and its clinical significance
2023-02-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-35995-2
PMID:36739462
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研究论文 | 本研究探讨了鼻咽癌（NPC）转移的演变路线及其临床意义 | 研究确定了两种独特的转移演变路线，阐明了肿瘤转移的不同机制 | 样本量相对较小，仅包括两个患者的11个样本 | 了解鼻咽癌转移相关的因素和机制 | 研究163个匹配的血液和肿瘤样本，包括原发肿瘤、区域淋巴结转移和远处转移 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA-seq、整体基因组分析 | NA | 肿瘤样本、血液样本 | 163个匹配的样本和11个样本来自于两个患者 |
| 4873 | 2024-08-08 |
Cancer Cells Employ the Most Prolific RNA Editors: A Closer Look at the Single-Cell Level
2023-02-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-3537
PMID:36734079
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研究论文 | 本文通过深入分析公开的肺腺癌单细胞转录组数据集，揭示了单个癌细胞中广泛存在的腺苷到肌苷（A-to-I）RNA编辑事件 | 首次系统地确定了A-to-I RNA编辑在单细胞分辨率下的活动和普遍性 | NA | 探究A-to-I RNA编辑在癌症进展和治疗反应中的机制意义 | 肺腺癌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 4874 | 2024-08-08 |
Metformin induces pyroptosis in leptin receptor-defective hepatocytes via overactivation of the AMPK axis
2023-02-03, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-05623-4
PMID:36737598
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研究论文 | 本研究探讨了二甲双胍在瘦素不敏感个体中对非酒精性脂肪肝病（NAFLD）的预防效果，并发现二甲双胍通过过度激活AMPK轴诱导瘦素受体缺陷的肝细胞发生焦亡。 | 首次揭示了二甲双胍在瘦素受体缺陷的肝细胞中通过过度激活AMPK轴诱导焦亡的机制。 | 研究仅限于动物模型，需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 探索二甲双胍在瘦素不敏感个体中对NAFLD的预防效果及其作用机制。 | 使用高脂饮食诱导的Zucker糖尿病肥胖（ZDF）大鼠和瘦素受体（Lepr）敲除大鼠的肝组织、血清外泌体和分离的肝细胞。 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 免疫染色、RT-PCR、单细胞RNA测序 | NA | 组织、外泌体、细胞 | 使用高脂饮食诱导的Zucker糖尿病肥胖（ZDF）大鼠和瘦素受体（Lepr）敲除大鼠 |
| 4875 | 2024-08-08 |
VEGF-A enhances the cytotoxic function of CD4+ cytotoxic T cells via the VEGF-receptor 1/VEGF-receptor 2/AKT/mTOR pathway
2023-02-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-03926-w
PMID:36737819
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研究论文 | 本文研究了VEGF-A通过VEGF受体1/VEGF受体2/AKT/mTOR通路增强CD4+细胞毒性T细胞的细胞毒性功能 | 首次揭示了VEGF-A通过VEGF-R1/R2信号激活AKT/mTOR通路，从而增强CD4 CTLs的细胞毒性 | NA | 探索CD4+细胞毒性T细胞细胞毒性的潜在调控因子 | CD4+细胞毒性T细胞及其在病理条件下的细胞毒性调控 | NA | 自身免疫疾病或病毒感染 | 批量RNA和单细胞RNA测序(scRNA-seq)、酶联免疫吸附试验、流式细胞术、定量PCR以及体外刺激和抑制试验 | NA | RNA | NA |
| 4876 | 2024-08-05 |
Relationships of tumor differentiation and immune infiltration in gastric cancers revealed by single-cell RNA-seq analyses
2023-Feb-02, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-04702-1
PMID:36729271
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研究论文 | 这篇文章揭示了胃癌细胞的分化状态与肿瘤免疫微环境之间的关系 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了不同分化状态胃癌细胞的特征基因及其与免疫微环境的关系 | 本文未深入探讨其他类型的胃癌及其免疫微环境之间的关系 | 研究胃癌的肿瘤分化与免疫浸润之间的关系 | 对来自手术切除的胃癌标本中的正常粘膜组织、分化良好的胃癌组织、分化差的胃癌组织和神经内分泌癌组织进行单细胞RNA测序分析 | 数字病理 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 来自手术切除的胃癌标本的多个样本，包括正常粘膜组织、DGC、PDGC和NEC组织 |
| 4877 | 2024-08-05 |
Estimation of cell lineages in tumors from spatial transcriptomics data
2023-02-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36062-6
PMID:36732531
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法SpaCET，用于从空间转录组学数据中估计肿瘤细胞谱系 | 开发了SpaCET，能够整合基因模式字典并校准局部细胞密度，以更准确地推断肿瘤细胞类型 | 现有方法难以处理含有多种细胞类型的肿瘤ST数据 | 研究如何从空间转录组学数据中推断肿瘤内的细胞身份 | 针对肿瘤组织中的免疫细胞和恶性细胞进行探讨 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 (ST) | 约束回归模型 | 肿瘤组织的基因表达数据 | 通过模拟和真实ST数据进行的验证 |
| 4878 | 2024-08-08 |
Multimodal single-cell analyses of peripheral blood mononuclear cells of COVID-19 patients in Japan
2023-02-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-28696-9
PMID:36732528
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研究论文 | 本研究对来自日本的COVID-19患者的外周血单个核细胞进行了多模态单细胞分析 | 首次对COVID-19患者的外周血单个核细胞进行了单细胞转录组和T细胞受体谱分析，揭示了轻度和重度病例之间的细胞比例和基因表达谱的显著差异 | 研究样本主要来自日本的COVID-19患者，可能限制了结果的普遍性 | 深入理解COVID-19患者的免疫景观和反应多样性，为个性化临床治疗策略提供依据 | COVID-19患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组分析，T细胞受体谱分析 | NA | 单细胞数据 | 多个COVID-19患者的外周血单个核细胞样本 |
| 4879 | 2024-08-08 |
Correction: Construction of transcriptome atlas of white yak hair follicle during anagen and catagen using single-cell RNA sequencing
2023-Feb-02, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09127-5
PMID:36732700
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4880 | 2024-08-05 |
Intestinal fibrosis in aganglionic segment of Hirschsprung's disease revealed by single-cell RNA sequencing
2023-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1193
PMID:36738110
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研究论文 | 这项研究揭示了无神经节段Hirschsprung病中的肠道纤维化及相关调节因子 | 首次通过单细胞RNA测序识别Hirschsprung病无神经节段中的肠道纤维化及其调节因子 | 本研究的样本数量相对较小，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨Hirschsprung病无神经节段的肠道纤维化及其细胞调节机制 | 8个Hirschsprung病的无神经节段和5个正常节段，以及7个健康供体的26个健康节段 | 数字病理学 | Hirschsprung病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共研究了7个Hirschsprung病患者和7个健康供体的样本 |