单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5354 篇文献，本页显示第 4841 - 4860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4841 | 2024-08-08 |
Clonal Kinetics and Single-Cell Transcriptional Profiles of T Cells Mobilized to Blood by Acute Exercise
2023-06-01, Medicine and science in sports and exercise
DOI:10.1249/MSS.0000000000003130
PMID:36719647
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研究论文 | 研究急性运动如何影响血液中T细胞的克隆动力学和单细胞转录组特征 | 首次揭示急性运动通过优先动员最主要的克隆群，促进寡克隆T细胞受体谱，并发现这些克隆对已知病毒抗原具有特异性，并显示出细胞毒性、激活和凋亡相关基因的不同表达 | NA | 探究急性运动对T细胞受体谱和转录组变化的影响 | 健康志愿者的外周血单个核细胞 | NA | NA | 深度TCR-β链测序和串联单细胞RNA测序 | NA | DNA和RNA | 健康志愿者完成分级自行车运动实验，采集静息、运动中和运动后1小时的外周血单个核细胞样本 |
| 4842 | 2024-08-05 |
Review of single-cell RNA-seq data clustering for cell-type identification and characterization
2023-05, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.078965.121
PMID:36737104
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综述 | 本文回顾了单细胞RNA-seq数据聚类方法，用于细胞类型的识别和特征化。 | 提供了对现有单细胞RNA-seq数据聚类方法的深入见解和比较，以及聚类方法的优势和局限性。 | 聚类方法的性能可能会受到模拟数据和多种单细胞转录组数据集的限制。 | 探讨和评估单细胞RNA-seq数据聚类方法，以促进细胞类型的识别。 | 现有单细胞RNA-seq数据聚类方法及其相关的处理技术。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 多个单细胞转录组数据集 |
| 4843 | 2024-08-05 |
Deciphering Adult Neural Stem Cells with Single-Cell Sequencing
2023-05, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2022.0234
PMID:36721381
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综述 | 本文综述了关于成体神经干细胞的最新研究进展，特别是在单细胞分析方面 | 介绍了常规和非常规神经干细胞的单细胞分析的异质性和转录改变 | 未提供具体的实验数据和样本分析 | 全面理解成体神经干细胞在生理和病理状态下的作用 | 成体神经干细胞及其在衰老和脑肿瘤中的转录改变 | 数字病理学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 4844 | 2024-08-08 |
Endothelial hyperactivation of mutant MAP3K3 induces cerebral cavernous malformation enhanced by PIK3CA GOF mutation
2023-05, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-023-09866-9
PMID:36719480
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序和液滴数字聚合酶链反应分析了散发性脑洞畸形患者的病变和匹配血液，发现MAP3K3和PIK3CA突变在病变中的共存及其对血管异常的影响。 | 首次揭示了MAP3K3和PIK3CA突变在脑洞畸形中的分子机制，并通过动物模型验证了这些突变对病变形成和维持的影响。 | 研究主要集中在动物模型和体外实验，需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 探讨MAP3K3和PIK3CA突变在脑洞畸形中的分子机制及其对病变的影响。 | 散发性脑洞畸形患者的病变组织和匹配血液，以及小鼠模型。 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 全外显子测序，液滴数字聚合酶链反应，单细胞RNA测序 | NA | 基因序列，RNA | 94例散发性脑洞畸形患者，小鼠模型 |
| 4845 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of solid pseudopapillary neoplasms of the pancreas in children
2023-May, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15744
PMID:36721980
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究儿童胰腺实性假乳头状瘤（SPN）的细胞类型和起源 | 首次描述了SPN内部的异质性，并提出了Wnt/β-catenin途径和上皮间质转化在肿瘤发生和复发中的作用 | NA | 全面揭示儿童胰腺实性假乳头状瘤的特征和发病机制 | 儿童胰腺实性假乳头状瘤的细胞类型和起源 | 数字病理学 | 胰腺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用手术标本进行研究 |
| 4846 | 2024-08-08 |
scRNA-seq data analysis method to improve analysis performance
2023-May, IET nanobiotechnology
IF:3.8Q3
DOI:10.1049/nbt2.12115
PMID:36727937
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综述 | 本文综述了当前常用的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析方法及其上游处理流程 | NA | NA | 探讨和评估单细胞RNA测序数据分析工具及其性能 | 单细胞RNA测序数据分析方法和工具 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 文本 | NA |
| 4847 | 2024-08-08 |
Cardiovascular utility of single cell RNA-Seq
2023-05-01, Current opinion in cardiology
IF:2.0Q3
DOI:10.1097/HCO.0000000000001014
PMID:36728943
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在心血管疾病诊断、风险分层和提供新型治疗靶点方面的应用潜力 | 单细胞RNA测序技术在心血管领域的应用有助于改善患者预后，并可能扩展到其他高影响临床领域 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在心血管疾病中的应用及未来发展方向 | 心血管疾病 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 4848 | 2024-08-08 |
Shear Stress Markedly Alters the Proteomic Response to Hypoxia in Human Pulmonary Endothelial Cells
2023-05, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0340OC
PMID:36730645
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研究论文 | 研究剪切应力对人类肺微血管内皮细胞在低氧条件下蛋白质组响应的影响 | 首次探讨了低氧与剪切应力对肺微血管内皮细胞表型的交互作用，并发现了60种蛋白质在生理剪切应力条件下对低氧的响应，其中55种蛋白质之前未被认为与低氧肺疾病的发展有关 | 研究仅限于人类肺微血管内皮细胞，未涉及其他类型的细胞或组织 | 探讨低氧和剪切应力对肺微血管内皮细胞蛋白质组响应的交互作用及其在低氧性肺血管疾病发展中的重要性 | 人类肺微血管内皮细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 无偏蛋白质组学 | NA | 蛋白质组数据 | 60种蛋白质 |
| 4849 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Immune Reconstitution in Patients with R/R T-ALL/LBL Treated with Donor-Derived CD7 CAR-T Therapy
2023-04-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-2924
PMID:36735547
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研究论文 | 本研究探讨了CD7 CAR-T治疗后复发/refractory T-ALL/LBL患者的免疫重建情况 | 首次通过单细胞转录组学揭示CD7 CAR-T治疗后免疫动态和CD7- T细胞的功能特征 | 研究样本量较小，仅涉及7名患者，且随访时间较短 | 评估CD7 CAR-T细胞在复发/refractory T-ALL/LBL患者中的安全性和疗效 | 7名复发/refractory T-ALL/LBL患者 | 数字病理学 | T细胞急性淋巴细胞白血病/淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本, 流式细胞术数据 | 7名复发/refractory T-ALL/LBL患者 |
| 4850 | 2024-08-05 |
A single-cell RNA-seq analysis of early larval cell-types of the starfish, Patiria pectinifera: Insights into evolution of the chordate body plan
2023-04, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2023.01.009
PMID:36717049
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研究论文 | 这篇文章通过单细胞RNA测序分析了海星Patiria pectinifera早期幼虫细胞类型，探讨了脊椎动物身体结构的演化。 | 针对海星胚胎发育的基因表达特征进行了分类，并将其与脊椎动物胚胎的同源基因表达进行比较，提出了脊椎动物体型从后口动物祖先演化的理论。 | 该研究主要集中在一种海星物种，可能无法代表所有海星或其他相关类群的情况。 | 研究海星胚胎发育的细胞类型及其与脊椎动物身体计划演化的关系。 | 针对海星Patiria pectinifera的原肠胚和双鳍幼虫进行的研究。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了来自原肠胚和双鳍幼虫的多个细胞，构成22个细胞簇 |
| 4851 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics-based multidisease analysis revealing the molecular dynamics of retinal neurovascular units under inflammatory and hypoxic conditions
2023-04, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2023.114345
PMID:36736650
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据构建了炎症和缺氧条件下视网膜神经血管单位的图谱 | 首次在单细胞水平上对视网膜神经血管单位的疾病广泛病因进行了联合分析 | 缺乏对其他类型的视网膜疾病的详细探讨 | 探索视网膜神经血管单位在各种疾病中的分子动态 | 以AireKO和NdpKO小鼠的视网膜为研究对象 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变、青光眼、早产儿视网膜病 | 单细胞转录组 | NA | NA | 野生型、AireKO和NdpKO小鼠的视网膜样本 |
| 4852 | 2024-08-08 |
CCR4+ CD8+ T cells clonally expand to differentiated effectors in murine psoriasis and in human psoriatic arthritis
2023-04, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202149702
PMID:36722608
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研究论文 | 研究通过建立小鼠和人类的银屑病及银屑病关节炎模型，探讨了CCR4+ CD8+ T细胞的克隆扩增及其在疾病中的作用 | 首次在银屑病和银屑病关节炎模型中观察到CCR4+ CD8+ T细胞的克隆扩增，并发现这些细胞在循环和滑液中的扩增与自身反应性T细胞的生成和扩散有关 | NA | 探究银屑病和银屑病关节炎中自身反应性T细胞的机制 | CCR4+ CD8+ T细胞在银屑病和银屑病关节炎中的克隆扩增及其作用 | NA | 银屑病，银屑病关节炎 | scRNA-seq，TCR sequencing | NA | 细胞数据 | 使用K5-mOVA.tg C57BL/6小鼠模型和银屑病关节炎患者的样本 |
| 4853 | 2024-08-05 |
SMURF: embedding single-cell RNA-seq data with matrix factorization preserving self-consistency
2023-03-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad026
PMID:36715274
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研究论文 | 该文章提出了一种名为SMURF的工具，用于从单细胞RNA测序数据中提取低维嵌入。 | SMURF利用矩阵分解和混合的Poisson-Gamma发散作为目标，保持自我一致性，而不是传统的插补方法。 | 该文章没有明确指出局限性 | 研究单细胞RNA测序数据的细胞特异性转录组学，旨在改善细胞嵌入的发现效果。 | 该研究对象为细胞和基因的低维嵌入。 | 数字病理学 | 癌症 | RNA-seq | NA | 细胞数据 | 涉及多个模拟和八个网络实验室的scRNA数据集，无具体样本数量 |
| 4854 | 2024-08-05 |
Denoising adaptive deep clustering with self-attention mechanism on single-cell sequencing data
2023-03-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad021
PMID:36715275
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研究论文 | 本文提出了一种新的自适应模糊聚类模型，旨在利用去噪自编码器和自注意力机制分析单细胞RNA测序数据 | 文章创新性地引入了联合学习和自适应反馈机制，提高了聚类精度和稳定性 | 实验只在16个真实的scRNA-seq数据集上进行了验证，可能缺乏对其他类型数据的普适性 | 研究旨在提高单细胞RNA测序样本的聚类分析能力 | 研究对象为单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 数字病理学 | NA | 去噪自编码器 | 自适应模糊聚类模型 | RNA测序数据 | 16个真实scRNA-seq数据集 |
| 4855 | 2024-08-05 |
scGGAN: single-cell RNA-seq imputation by graph-based generative adversarial network
2023-03-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad040
PMID:36733262
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研究论文 | 本文提出了一种新的模型scGGAN，通过图卷积网络和生成对抗网络对单细胞RNA测序数据进行插补 | 创新之处在于考虑了基因之间的内在关系，并结合图卷积网络和生成对抗网络来处理scRNA-seq数据插补 | 未提到具体的实验限制 | 研究目标是提高单细胞RNA测序数据的插补质量 | 研究对象为单细胞RNA测序数据及其相关的基因序列数据 | 机器学习 | NA | 生成对抗网络（GAN） | 图卷积网络（GCN） | 单细胞RNA测序数据 | 模拟和真实的scRNA-seq数据集 |
| 4856 | 2024-08-05 |
How does neurovascular unit dysfunction contribute to multiple sclerosis?
2023-03, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2023.106028
PMID:36736923
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研究论文 | 本文探讨了神经血管单元功能障碍如何影响多发性硬化症的发展 | 提出神经血管单元功能障碍可能是导致多发性硬化症的主要病理因素，并探讨其作为未来治疗靶点的适宜性 | 当前对多发性硬化症的致病机制仍未明了，进一步研究仍需进行 | 研究多发性硬化症的风险因素和病理生理，并讨论神经血管单元在疾病进展中的作用 | 多发性硬化症患者以及其神经血管单元的细胞组成 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞生物学数据，基因组数据 | NA |
| 4857 | 2024-08-05 |
Molecular characterization of human cytomegalovirus infection with single-cell transcriptomics
2023-03, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-023-01325-x
PMID:36732471
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析人类巨细胞病毒(HCMV)感染的进展 | 揭示了早期病毒基因表达水平及宿主细胞内源性干扰素刺激基因表达在HCMV感染结果中的重要作用 | 未明确分析其他免疫细胞类型在感染中的作用 | 探讨人类巨细胞病毒感染的分子机制 | 单核细胞和巨噬细胞的HCMV感染 | 数字病理 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 4858 | 2024-08-05 |
Current "state of the art" on dendritic cell-based cancer vaccines in melanoma
2023-03-01, Current opinion in oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/CCO.0000000000000926
PMID:36721893
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综述 | 本文回顾了树突细胞在黑色素瘤癌症疫苗中的作用及其最新进展 | 探讨了使用单细胞测序方法重新分类树突细胞，并讨论了如何操控特定的树突细胞亚群以诱导有效和持久的抗肿瘤反应 | 肿瘤内给药限制了疫苗的适用性，仅适用于可达的病变患者 | 阐明树突细胞在癌症免疫中的独特角色及其在疫苗开发中的应用 | 重点研究树突细胞亚群及其在抗肿瘤免疫中的功能 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 4859 | 2024-08-05 |
Low Expression of BRCA1 as a Potential Relapse Predictor in B-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia
2023-03-01, Journal of pediatric hematology/oncology
DOI:10.1097/MPH.0000000000002595
PMID:36730467
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研究论文 | 本研究探讨了BRCA1低表达在B细胞急性淋巴细胞白血病复发预测中的潜在作用 | 确定了BRCA1基因表达的降低与B-ALL复发之间的关联性，并提出其作为一种潜在的分子预后标志物 | 本研究的样本可能不足以全面验证BRCA1作为复发预测标志物的有效性 | 旨在研究BRCA1表达与B细胞急性淋巴细胞白血病复发的关系 | B-ALL患者的BRCA1基因表达及其与复发的相关性 | 数字病理学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 微阵列分析和单细胞RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4860 | 2024-08-05 |
Development and validation of a prognostic model based on a single-cell RNA-seq in Wilms tumor in children
2023-03, Journal of investigative medicine : the official publication of the American Federation for Clinical Research
IF:2.5Q3
DOI:10.1177/10815589221143739
PMID:36718830
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研究论文 | 本文分析了儿童威尔姆斯肿瘤的不同细胞类型间的异质性，并建立了一个预后模型 | 基于单细胞RNA-seq数据构建了一个综合预后模型并识别了预后生物标志物 | 外部验证集的样本量和多样性可能影响模型的普适性 | 建立儿童威尔姆斯肿瘤的预后模型 | 儿童威尔姆斯肿瘤组织中的恶性肿瘤细胞 | 数字病理学 | 威尔姆斯肿瘤 | 单细胞RNA-seq | COX回归分析和LASSO回归 | 基因表达数据 | 215个恶性肿瘤细胞中筛选出的不同表达基因 |