单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5354 篇文献，本页显示第 4801 - 4820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4801 | 2024-08-05 |
Time has come to address the spatiotemporal combinatorial model for CCN proteins biological activitites by spatial transcriptomics and genome wide association studies
2023-Mar, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1007/s12079-023-00729-y
PMID:36752900
|
评论 | 本文提出了通过空间转录组学和全基因组关联研究来解决CCN蛋白生物活性的时空组合模型。 | 文章强调了需要通过广泛的协作方法来研究CCN3生物学状态中的开放问题 | 未提供具体的实验数据或研究结果 | 探讨CCN3生物学中的未解问题 | CCN蛋白，特别是CCN3的生物学方向 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学，基因组关联研究 | NA | NA | NA |
| 4802 | 2024-08-08 |
Revealing EXPH5 as a potential diagnostic gene biomarker of the late stage of COPD based on machine learning analysis
2023-03, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.106621
PMID:36746116
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研究论文 | 本研究通过机器学习分析揭示EXPH5基因作为慢性阻塞性肺病（COPD）晚期潜在的诊断基因生物标志物 | 首次识别EXPH5基因作为COPD晚期的诊断生物标志物，并分析了其在不同COPD阶段与免疫细胞浸润的关系 | 研究仅基于两个GEO数据集，样本量和数据多样性可能有限 | 寻找用于早期诊断COPD的关键基因，并分析COPD早期和晚期阶段之间的免疫细胞浸润 | EXPH5基因在COPD诊断中的作用及其与免疫细胞浸润的关系 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺病 | GSEA分析 | LASSO和SVM-RFE | 基因表达数据 | 157个差异表达基因（DEGs） |
| 4803 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome reveals cellular heterogeneity and lineage-specific regulatory changes of fibroblasts in post-traumatic urethral stricture
2023-Mar, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2023.101431
PMID:36748064
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了创伤后尿道狭窄组织中的成纤维细胞异质性和细胞间通讯 | 首次揭示了创伤后尿道狭窄组织中成纤维细胞的亚群及其在纤维化过程中的分子类型，并识别了成纤维细胞与血管内皮细胞间的通讯 | NA | 探索创伤后尿道狭窄组织中成纤维细胞的异质性和细胞间通讯 | 创伤后尿道狭窄组织及其邻近正常组织的成纤维细胞 | 数字病理学 | 尿道狭窄 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13,411个细胞 |
| 4804 | 2024-08-08 |
Cytohesin-4 Upregulation in Glioma-Associated M2 Macrophages Is Correlated with Pyroptosis and Poor Prognosis
2023-Mar, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-023-02104-3
PMID:36749492
|
研究论文 | 本研究探讨了细胞质素-4（CYTH4）在胶质瘤相关M2巨噬细胞中的上调与焦亡及不良预后的关系 | 首次揭示了CYTH4在胶质瘤中的表达与M2巨噬细胞及焦亡的关联 | NA | 研究CYTH4在胶质瘤中的表达及其与预后的关系 | CYTH4在胶质瘤M2巨噬细胞中的表达及其生物标志物潜力 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个胶质瘤单细胞RNA测序数据集及TCGA和CGGA的批量数据 |
| 4805 | 2024-08-08 |
An analysis of classical multidimensional scaling with applications to clustering
2023-Mar, Information and inference : a journal of the IMA
DOI:10.1093/imaiai/iaac004
PMID:36761434
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研究论文 | 本文提供了一个理论框架，用于分析经典多维尺度法产生的嵌入样本的质量，并聚焦于对噪声数据的聚类分析 | 本文首次提供了经典多维尺度法的统计性能理论结果，并确定了信号噪声比的条件，使得该方法结合基于距离的聚类算法能恢复所有样本的聚类标签 | NA | 分析经典多维尺度法的性能，并应用于噪声数据的聚类 | 经典多维尺度法产生的嵌入样本 | 机器学习 | NA | 多维尺度法 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、自然语言数据 | NA |
| 4806 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing identifies differentiation-related markers for molecular classification and recurrence prediction of PitNET
2023-02-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.100934
PMID:36754052
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了PitNET的发源及分化相关标记 | 识别了代表PitNET不同亚型的独特基因，并提出了一种新的分化分类以预测肿瘤复发 | 未提及本文的具体局限性 | 旨在改进PitNET的复发预测，通过理解细胞起源和分化状态 | 来自3个前垂体腺和21个PitNET的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 21个PitNET和3个前垂体腺样本，以及800名患者的独立队列 |
| 4807 | 2024-08-05 |
Self-renewing macrophages in dorsal root ganglia contribute to promote nerve regeneration
2023-02-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2215906120
PMID:36763532
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研究论文 | 这篇文章探讨了背根神经节中的自我更新巨噬细胞在神经再生中的作用 | 本研究揭示了背根神经节巨噬细胞的异质性及其自我更新能力，并介绍了它们在轴突再生中的重要性 | 文章中未提及实验的具体限制或不足之处 | 研究背根神经节巨噬细胞在外周神经损伤后的行为及其对神经再生的贡献 | 背根神经节中的巨噬细胞和神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | 涉及多个带有神经损伤的小鼠样本 |
| 4808 | 2024-08-05 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal aberrant lymphoid developmental programs driving granuloma formation
2023-02-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.01.014
PMID:36750099
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研究论文 | 本研究揭示了异常的淋巴发育程序驱动肉芽肿形成 | 首次通过单细胞转录组学和空间转录组学揭示肉芽肿中与淋巴器官发育相关的转录程序的重塑 | 本研究主要集中在肉芽肿而非其他免疫细胞相关疾病，可能无法全面反映各种疾病的机制 | 旨在更好地理解肉芽肿形成及其与淋巴器官发展的关系 | 以患有肉芽肿病（如类肉瘤病）的患者样本为研究对象 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序和空间转录组学 | NA | NA | 来自多个患者的肉芽肿样本 |
| 4809 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of alveolar rhabdomyosarcoma reveals RAS pathway inhibitors as cell-fate hijackers with therapeutic relevance
2023-02-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ade9238
PMID:36753540
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、质谱流式细胞术和高内涵成像技术，分析了来自患者的原代RMS细胞培养物的肿瘤内异质性，揭示了aRMS亚型的细胞层次结构和驱动肿瘤生长的机制 | 首次揭示了aRMS亚型中具有肌肉干细胞样特征的细胞和增殖祖细胞的存在，并发现了一组RAF和MEK抑制剂组合，能有效诱导肌源性分化并抑制肿瘤生长 | NA | 探究RMS的细胞层次结构和导致发育停滞的机制，并寻找新的治疗策略 | 儿童癌症中的横纹肌肉瘤（RMS）及其亚型aRMS | 数字病理学 | 横纹肌肉瘤 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、高内涵成像 | NA | 细胞 | 来自患者的原代RMS细胞培养物 |
| 4810 | 2024-08-08 |
Publisher Correction: High-throughput and high-sensitivity full-length single-cell RNA-seq analysis on third-generation sequencing platform
2023-Feb-07, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00522-6
PMID:36746930
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4811 | 2024-08-08 |
Dissecting the immune suppressive human prostate tumor microenvironment via integrated single-cell and spatial transcriptomic analyses
2023-02-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36325-2
PMID:36750562
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研究论文 | 本文通过综合单细胞和空间转录组学分析，详细描述了局部前列腺癌的肿瘤微环境及其与邻近正常样本和健康对照的比较 | 本文首次综合单细胞RNA测序和高分辨率空间转录组学分析，揭示了肿瘤微环境中基因表达的肿瘤上下文依赖性变化，并推断了细胞间的相互关系 | NA | 研究局部前列腺癌的肿瘤微环境，并探讨其与免疫逃逸和肿瘤进展的关系 | 局部前列腺癌的肿瘤微环境及其与邻近正常组织和健康对照的比较 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学分析 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 4812 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling of human HSCs during development: new insights into HSC ontogeny
2023-02-06, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-022-01301-7
PMID:36746910
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4813 | 2024-08-08 |
The Evolution of Single-Cell RNA Sequencing Technology and Application: Progress and Perspectives
2023-Feb-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24032943
PMID:36769267
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术（scRNA-Seq）的最新技术进展及其在生命科学和医学研究领域的应用 | scRNA-Seq技术实现了对单个细胞的高通量和多维分析，克服了传统测序技术在检测细胞群体平均转录水平方面的不足 | NA | 探讨scRNA-Seq技术在胚胎学、组织学、肿瘤学和免疫学等前沿研究领域的最新研究成果及其在中医药研究中的创新应用前景 | 单细胞RNA测序技术及其在生命科学和医学研究中的应用 | 基因组学 | NA | scRNA-Seq | NA | RNA | NA |
| 4814 | 2024-08-05 |
Immune-Activated B Cells Are Dominant in Prostate Cancer
2023-Feb-01, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15030920
PMID:36765877
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研究论文 | 研究发现B细胞在前列腺癌患者的免疫反应中占主导地位。 | 首次深入研究了前列腺癌（PCa）中的B细胞亚群及其与临床病理因素的关系 | 样本数量有限，尤其是淋巴结转移的情况 | 探讨B细胞在前列腺癌中的角色和功能 | 中度至高度风险的前列腺癌患者 | 免疫学 | 前列腺癌 | 流式细胞术 | NA | 血液和淋巴结样本 | 25名前列腺癌患者 |
| 4815 | 2024-08-08 |
Chronic developmental hypoxia alters rat lung immune cell transcriptomes during allergic airway inflammation
2023-02, Physiological reports
IF:2.2Q3
DOI:10.14814/phy2.15600
PMID:36750205
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研究论文 | 本研究探讨了慢性发育性缺氧（CDH）对大鼠肺部免疫细胞转录组在过敏性气道炎症中的影响 | 通过单细胞转录组测序分析，揭示了CDH对肺部免疫细胞转录景观的改变 | NA | 研究CDH如何影响肺部过敏性炎症 | 大鼠肺部免疫细胞在过敏性气道炎症中的转录组 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 大鼠在缺氧（15%氧气）或常压室空气（20%氧气）环境下饲养，3周龄时进行卵清蛋白（OVA）或生理盐水（磷酸盐缓冲盐水[PBS]）致敏，6周龄时进行鼻内OVA或PBS处理 |
| 4816 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis of Primary Liver Cancer in Mouse Models
2023-02-01, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12030477
PMID:36766817
|
综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）结合小鼠模型研究原发性肝癌（PLC）的最新进展 | 利用scRNA-seq技术提供了前所未有的分辨率，以深入理解PLC的细胞和分子组成 | 主要基于小鼠模型，可能与人类患者存在差异 | 总结利用小鼠模型和scRNA-seq技术研究PLC的最新成果，探索潜在的治疗靶点 | 原发性肝癌，包括肝细胞癌和肝内胆管癌 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 4817 | 2024-08-08 |
demuxmix: Demultiplexing oligonucleotide-barcoded single-cell RNA sequencing data with regression mixture models
2023-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.27.525961
PMID:36747615
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研究论文 | 本文介绍了一种基于负二项回归混合模型的单细胞RNA测序数据解复用方法demuxmix | demuxmix方法通过概率分类框架提供液滴分配的错误概率，并利用RNA文库中检测到的基因与HTO计数之间的正相关性来解释HTO数据中的部分变异，从而提高液滴分配的准确性 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序数据解复用方法，以提高解复用的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 负二项回归混合模型 | RNA序列数据 | NA |
| 4818 | 2024-08-08 |
The Hidradenitis Suppurativa 'Omics Database (HS-OmicsDB)
2023-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.26.524600
PMID:36747861
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研究论文 | 本文介绍了Hidradenitis Suppurativa（HS）的'Omics数据库（HS-OmicsDB），旨在聚合公开可用的'Omics数据以增强HS研究 | 首次为Hidradenitis Suppurativa（HS）建立了一个纵向的'Omics数据库，包括未治疗HS患者的批量和单细胞RNA测序数据 | NA | 增强Hidradenitis Suppurativa（HS）的研究 | Hidradenitis Suppurativa（HS）患者的'Omics数据 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 包括未治疗HS患者的批量和单细胞RNA测序数据 |
| 4819 | 2024-08-08 |
Investigating the Complexity of Gene Co-expression Estimation for Single-cell Data
2023-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.24.525447
PMID:36747724
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研究论文 | 本研究测试了现有的基因共表达估计方法在具有已知真实共表达网络的模拟数据集上的表现 | 通过使用从实验数据中学习的参数生成新的模拟数据集，这些模拟更好地捕捉了真实世界单细胞数据集的潜在属性 | 所有方法在模拟和实验数据集上的估计结果显示出高假发现率，可能是由于数据中的高稀疏性水平 | 深入测试现有基因共表达估计方法在单细胞数据上的表现 | 基因共表达估计方法在单细胞RNA测序数据上的性能 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因共表达网络 | 数十个模拟数据集和八个实验数据集 |
| 4820 | 2024-08-05 |
Systemically Identifying Triple-Negative Breast Cancer Subtype-Specific Prognosis Signatures, Based on Single-Cell RNA-Seq Data
2023-01-19, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12030367
PMID:36766710
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研究论文 | 本研究提出了一种单细胞RNA测序基础的生物信息学方法来识别三阴性乳腺癌亚型特异性预后标志物。 | 通过单细胞RNA-seq数据识别三阴性乳腺癌亚型相关的生物标志物，以克服传统RNA-seq的局限性。 | 研究主要依赖于生物信息学分析，可能缺乏临床验证。 | 识别三阴性乳腺癌亚型特异性预后标志物，以改善治疗效果。 | 关注三阴性乳腺癌的不同分子亚型及其相关预后标志物。 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 在四个独立验证数据集中进行确认，具体样本数量未提及 |